Unidad 3-ENZIMAS-2022-FINAL
Unidad 3-ENZIMAS-2022-FINAL
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ENZIMAS
Las reacciones energéticas y control de las
reacciones celulares
Insulina
Reacciones catabólicas
Las reacciones en las cuales sustancias complejas se
degradan para convertirse en sustancias más simples
se llaman reacciones catabólicas.
Degradación de almidón
El control de las reacciones
celulares
El descubrimiento de las enzimas
• La existencia de catalizadores biológicos fue descrita por primera vez
a comienzos del Siglo XIX en estudios acerca de la digestión de la
carne por secreciones del estómago y la conversión del almidón en
azúcar por la saliva.
• En 1835 la primera teoría general sobre la catálisis química publicada
por J.J. Berzelius incluía un ejemplo de lo que hoy conocemos como
un enzima: la diastasa de la malta, señalando que la hidrólisis del
almidón se catalizaba más eficazmente por ésta que por el ácido
sulfúrico.
• En 1860 Louis Pasteur propuso que la fermentación del azúcar para
transformarse en alcohol era inducida por ciertos catalizadores
biológicos, razón por la cual los enzimas fueron llamados inicialmente
"fermentos". Pasteur supuso que dichos catalizadores se hallaban
unidos de modo indisoluble a la estructura de las células de la
levadura por lo que no podían actuar fuera de estas.
• En 1877 se utiliza por primera vez la denominación
"enzima" (etimológicamente "en la levadura").
• En 1897 E. Büchner consiguió extraer de las células
de la levadura los enzimas que catalizan la
fermentación alcohólica, demostrando que éstos
pueden actuar independientemente de la
estructura celular.
• Este hecho permitió estudiar in vitro la actividad y
propiedades de las enzimas, aislarlos en estado
puro y analizar su composición.
• La hipótesis de Buchner consistió en que la
fermentación resulta de la actividad de una enzima,
que él llamó zimasa.
• Actualmente llamamos a este proceso que realmente
se lleva a cabo por 10 enzimas, glucólisis del griego
glycos: dulce + lysis: ruptura.
• Por estas observaciones, Buchner recibió el premio
Nobel de Química en 1907.
Los sistemas vivientes están formados por una enorme
variedad de reacciones bioquímicas, la inmensa mayoría
de las cuales se llevan a cabo por entidades proteicas
con actividad catalítica conocidas como enzimas.
La enzimología, en estudio de las enzimas.
• En 1926 J.B. Sumner aisló una enzima, la ureasa, en forma cristalina
pura y demostró que los cristales estaban formados por proteínas.
• Entre 1930 y 1936 se aislaron en forma cristalina pura diversas
enzimas quedando establecida de modo definitivo la naturaleza
proteica de estos catalizadores biológicos. Desde entonces se han
identificado varios miles de enzimas diferentes, habiéndose aislado
muchos de ellos en forma cristalina.
• En el mismo período J.B.S. Haldane expuso la idea de que los
enzimas establecen interacciones débiles con el sustrato para
distorsionarlo y catalizar así su transformación; esta idea resultó
capital para el moderno conocimiento de la acción enzimática.
• En 1981 se descubrió que determinados tipos de RNA pueden
catalizar su propia síntesis, hecho este que obligó a revisar algunas
de las ideas preexistentes acerca de la naturaleza de los
biocatalizadores.
Las enzimas
• Catalizadores de las reacciones biológicas
• La mayoría son proteínas aunque hay moléculas de
ARN con actividad catalítica (ribozimas)
• Gran poder catalítico
• Alto grado de especificidad
• Actúan en soluciones acuosas a 37°C y pH neutro
• Su actividad puede regularse
• El 25% de los genes humanos codifican enzimas
que catalizan reacciones metabólicas
Como funciona una enzima?
• Mecanismos de acción propuestos:
1. Catálisis desde el punto de vista de los
cambios en energía que ocurren durante la
reacción; las enzimas proveen una vía
alterna, energéticamente favorable que es
diferente de la reacción no catalizada.
2. La segunda describe cómo el sitio activo
facilita químicamente la catálisis de la
enzima.
¿Cuántas enzimas habrá en un organismo?
E+S ES E+P
• Sustrato
– Sitio de unión al sustrato Sitio activo
– Sitio catalítico
• Producto
• Las enzimas (holoenzima) están formadas por:
– Apoenzima: porción proteica
– Para que una enzima se active es necesario:
– Cofactor: orgánico o inorgánico
– Grupo prostético (Coenzima): orgánico
• Cosustrato
• Transportador de grupo
Tipos de enzimas
Según su composición se pueden clasificar en tres grupos:
1. Ribozimas: compuestas por pequeñas moléculas de
ARN con actividad catalítica.
2. Enzimas simples o estrictamente proteicos.
3. Enzimas complejas u holoenzimas: compuestas por
una parte proteica (Apoenzima) y un grupo prostético,
parte no formada por aminoácidos.
– Cofactor: si es inorgánica también se le denomina activador
inorgánico, Ej. Mg (cinasas), Zn (carboxipeptidasas)
– Coenzima: si es una molécula orgánica
Partes del sistema enzimático
Sustrato (S): molécula sobre la que actúa la enzima y cuya transformación está condicionada por
ella.
Producto (P): molécula resultante de la acción de la enzima sobre el o los sustratos (a menudo se
obtiene varios productos).
Holoenzima: Estructura formada por la apoenzima y la coenzima.
Apoenzima: Enzima propiamente dicha, de naturaleza proteica, con un peso molecular elevado,
no dializable y termolábil. Hay de peso molecular bajo, con una sola cadena polipeptídica, como
la ribonucleasa, papaína, tripsina, y pepsina entre otras. La mayoría son proteínas oligoméricas.
Coenzima: Parte con unión débil y de fácil separación. Con peso molecular bajo, dializable,
termoestable y no proteica. Suelen actuar como transportadores de grupos.
Grupo prostético: Parte adherida más o menos laxa a la apoenzima.
Los grupos prostéticos o las coenzimas actúan cediendo y recibiendo parte de los productos de
la reacción alternativamente. Ejemplo: Los hidrógenos en las reacciones de óxido-reducción. La
mayoría de las coenzimas son formas modificadas de las vitaminas.
Proenzimas o Zimógenos: Son enzimas sintetizadas como precursores no funcionales, suelen
activarse por la eliminación de un fragmento peptídico de su molécula. Ejemplo: Pepsinógeno
gástrico, Pepsina (al perder 44 aminoácidos)
Activadores: Iones que aceleran la velocidad de una reacción. Son cationes: Mg 2+, Mn2+, Ca2+ y K+.
En ocasiones se unen a la apoenzima, pero más común es su combinación con el sustrato o la
coenzima.
Inhibidores: Sustancias que disminuyen la velocidad de las reacciones catalizadas por las enzimas.
Fe2+ 22 10
Catalasa 22 1.7
Importancia de la especificidad
¿Cuántos compuestos habrá en una célula viva y cuántas combinaciones serán posibles?
Carboxilesterasas
Hidrolizan todo tipo de esteres independientemente de
R o R’
Factores que afectan a la actividad
enzimática
• Las propiedades de las enzimas derivan del hecho de ser
proteínas.
• Cambios en la conformación suelen ir asociados en
cambios en la actividad catalítica.
• Los factores que influyen de manera más directa sobre la
actividad de un enzima son:
– pH
– Temperatura
– Concentración de sustrato
– Cofactores
– Inhibidores
pH sobre la actividad enzimática
c) Interconversion Aldosa-Cetosa
d) Interconversión de Cis-Trans
5. Isomerasas
6. Ligasas
Permiten la unión de dos moléculas simultáneamente a la degradación del ATP u
otro enlace químico, con la liberación de la energía necesaria para la unión de dichas
moléculas.
Mecanismo general
•E + S ES E + P
Factores que están relacionados con la eficiencia
catalítica de las enzimas
• Estabilización del estado de transición:
– El sitio activo de la enzima a menudo actúa como un molde molecular
flexible en donde el substrato se une de forma geométricamente
adecuada para transformarse en el estado de transición de la molécula.
– Al estabilizar al substrato en el estado de transición, la enzima aumenta
de manera considerable la concentración de este intermediario
reactivo que puede ser transformado en el producto(s) y, por tanto,
acelerar la reacción.
• Otros factores.
– El sitio activo posee grupos catalíticos que incrementan la probabilidad
de que se forme el estado de transición. En algunas enzimas, estos
grupos pueden participar en una catálisis tipo ácido-base en la cual
algunos residuos de aminoácidos proveen o aceptan protones.
– En otras enzimas, la catálisis involucra la formación temporal de un
complejo covalente enzima-substrato
Modelos enzimáticos
Modelo de acción enzimática llave-cerradura de Fisher
Estado estacionario en la
cinética enzimática
• Para una concentración baja de sustrato, la
velocidad de la reacción es directamente
proporcional a la concentración del sustrato
(relación lineal), la cinética es de primer orden.
• Para una concentración alta de sustrato, la
velocidad de la reacción se hace prácticamente
constante e independiente de la concentración de
sustrato, la cinética se considera de orden cero.
• Para concentraciones de sustrato intermedias la
velocidad del proceso deja de ser lineal, y a esta
zona se la denomina de cinética mixta.
Velocidad de reacción
• Las moléculas que reaccionarán en un evento químico, deben
contener suficiente energía para sobrepasar la energía de
activación del estado de transición en su camino para
transformase en los productos.
• En ausencia de la enzima, solo una pequeña porción de la
población de estas moléculas posee la energía suficiente para
realizar la transición hacia los productos.
• La velocidad de la reacción estará determinada por el número
de moléculas que se encuentren en ese estado energético
particular.
• Al disminuir la energía de activación, la mayoría de las
moléculas tienen energía suficiente para pasar sobre el estado
de transición y por tanto aumenten la velocidad de la
reacción.
Vía de reacción alterna
• Una enzima permite que una reacción se lleve
a cabo rápidamente bajo las condiciones que
reinan en la célula.
• Lo anterior se realiza al disminuir la energía de
activación.
• La enzima no modifica la energía contenida
en los reactivos o producto; de la misma
forma, no altera el equilibrio de la reacción.
Michaelis y Menten propusieron un modelo simple
para explicar la mayoría de las reacciones catalizadas
por enzimas.
En este modelo la enzima se combina reversiblemente
con su substrato para formar el complejo enzima-
sustrato (ES) que subsecuentemente se rompe para
formar el producto, hecho que regenera a la enzima.
k1 k2
ES ES EP
k 1
Consideraciones
1. Concentraciones relativas de E y S: la concentración de substrato S, es
mucho mayor que la de E, de tal manera que la cantidad de substrato unido a
la enzima en cualquier momento es muy pequeña.
• Inhibición permanente
• Unión irreversible por medio de enlaces covalentes.
• Modificaciones químicas de los grupos catalíticos.
• Modificada la enzima, está siempre inhibida.
Acetilcolina
Acetilcolinesterasa
Acetato + Colina
Inhibidor Irreversible
Fluorofosfato de diisopropilo
(DFP)
Acetilcolinesterasa
Tripsina
Elastasa
Fosfoglucomutasa
Cocoonasa (larvas de
gusanos de seda
Malatión
La aspirina es un inhibidor irreversible de las
ciclooxigenasas
αKm= Km aparente
α depende de la
concentración del
inhibidor y de la
afinidad del inhibidor
por el enzima.
α = 1 + [I] / KI
Inhibición competitiva
Inhibidores Competitivos
Fluoruracilo Cáncer
• Captopril: Enzima convertidora de Angiotensina
• Sulfas: inhibidor competitivo y selectivo de la dihidrofolato
reductasa microbiana.
• Alopurinol: metabolismo de las purinas
• Fluorouracilo: Antimetabolito, funciona matando las
células de crecimiento rápido como las células anormales
en las queratosis actínicas y en el carcinoma de células
basales.
• Malonato: El malonato es un inhibidor competitivo de la
reacción de la succinato deshidrogenasa y bloquea la
transformación del succinato a fumarato. Bloquea el flujo
de metabolitos a través del ciclo, deteniendo
completamente la oxidación del piruvato.
Inhibición no competitiva
+ Inhibidor
Unión del Inhibidor a un sitio
del enzima distinto del centro
activo: no compite con S
• No cambia Km
• Disminuye Vmax
Inhibición acompetitiva
• El inhibidor se une a un sitio
diferente al centro activo
• El inhibidor solamente se une
cuando el centro activo está
ocupado por el sustrato.
• La unión afecta a la velocidad
máxima.
• Aunque la unión del inhibidor no
afecta a la afinidad del E por el
sustrato, la concentración de
sustrato necesaria para alcanzar
la vmax aumenta y por lo tanto
la Km también resulta
modificada.
La inhibición acompetitiva modifica tanto la Km
como la velocidad máxima
α’ = 1 + [I] / KI’
Inhibición mixta
El inhibidor se fija tanto al
enzima como al complejo ES.
Está afectado por las dos
constantes: KI y KI’
Cinética de una inhibición mixta
Regulación de las rutas metabólicas
A B C D E F
H
Reacciones multisustrato
• Utilizan dos sustratos S1 y S2 y se obtienen dos
productos P1 y P2.
a) Unión ordenada de los sustratos: en este caso un sustrato
debe unirse antes de que el segundo sustrato pueda unirse.
b) Unión aleatoria de los sustratos: en este caso cualquiera de
los dos sustratos puede ser el primero en unirse a la
enzima.
c) Mecanismo “ping-pong”: en este caso primero se une un
sustrato, se libera el primer producto, y a continuación se
une el segundo sustrato para así liberar el segundo
producto.
Regulación enzimática
a) Nivel de síntesis: que haya más o menos
moléculas de la enzima.
b) Nivel de actividad: que las moléculas de
enzima existentes estén más o menos
activas.
a) Factores extrínsecos: pH, T°, [S, [I.
b) Factores intrísecos: Enzimas reguladoras tienen
mecanismos especiales.
a) Enzimas alostéricas
b) Enzimas interconvertibles
Principales estrategias de regulación
enzimática*
Enzimas alostéricos (Los moduladores se unen a “otros sitios” de
regulación diferentes del centro activo y cambian la actividad del
enzima)
• Modificación covalente que cambia la estructura y la actividad de
la enzima
• Isoenzimas (diferentes tejidos poseen diferentes formas del
enzima y así se regulan de forma diferente)
• Rotura proteolítica de precursores inactivos