Introduction à

l’identification des
moisissures
Laboratoire de Biotechnologie
Fac. Sciences Dhar El-Mehrez, Fès
Le 28 février 2014
A. TANTAOUI ELARAKI
 Introduction à l’identification des
moisissures

1- Généralités sur les champignons microscopiques

2- Caractéristiques particulières des moisissures

3- Principes généraux d’identification

4- Présentation des principaux genres
1- Généralités sur les champignons
microscopiques

1.1- Place dans le Monde vivant

1.2- Caractères distinctifs par rapport aux autres
protistes supérieurs
1.3- Caractères distinctifs par rapport aux
bactéries
1.4- Structure

3
1.1- Place dans le monde vivant

Champignons (latin: fungi ; grec: mykes)

Étude des champignons: mycologie
Traditionnellement: la mycologie était (à tort)
considérée comme partie de la botanique
Dans la classification de Langeron (1945),
les fungi sont des Protistes supérieurs
(cellules eucaryotes)
Se distinguent de tous les autres micro-
organismes
4
 Classification du Monde Vivant
(d’après Langeron, 1945)

Monde vivant

Métaphytes Protistes Métazoaires

Protophytes

Algues Autres
bleu Fungi
Bactéries algues
vert unicellulaires (Champignons) Protozoaires

Protistes Inférieurs Protistes Supérieurs 5

 Place des micromycètes dans
ine nde le monde microbien
rte
Mo

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et oba Microorganismes
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Métaphytes
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Pro Schizomycètes
to
aire zo Protistes inférieurs
s
Ensemble des Protistes
Mét Ensemble des microbes
azo
aire
s
6
1.2- Caractères distinctifs par rapport aux autres
protistes supérieurs

Hétérotrophes pour le C (comme animaux)

Nutrition azotée simple: NH4+ ou NO3- (comme
végétaux)
Saprophytes (le plus souvent); mais aussi
espèces parasites (mycoses de l’Homme et
des animaux et maladies cryptogamiques
des végétaux) ou symbiotiques (lichens)
Structure filamenteuse ou mycélienne (sauf
levures)

7
1.3- Caractères distinctifs par rapport aux bactéries

Champignons Bactéries
microscopiques
Volume cellulaire Levure: 20-50 1-5
(en µm3) Moisissure: plus grand
(difficile à déterminer)
Noyau Eucaryote Procaryote
Membrane cytoplasmique Stérols Pas de stérols (sauf Mycoplasma)
Paroi Glucane, mannane, chitine, mucocomplexe
protéines
Métabolisme Toujours hétérotrophe, Hétéro- ou autotrophe,
jamais anaérobie strict aérobie ou anaérobie
Agents chimiothérapiques Antifongiques: + Antibiotiques: +
Antibiotiques: - Antifongiques: -
Dimorphisme Présent Inconnu
Virus (parasites) Mycovirus (1974) Bactériophages (1915-17)

8
 1.4- Structure

Structure type: structure filamenteuse, cénocytique

L’ensemble des filaments: mycélium, « thalle » ou
appareil végétatif
Le mycélium porte les « organes fructifères » qui
assurent la formation des spores pour la
reproduction
La structure permet de définir trois catégories:
- Les champignons macroscopiques (charnus)
- Les moisissures: filaments non soudés
- Les levures: forme unicellulaire dominante

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 Les 3 catégories de
Champignons champignons

(Fungi, Mycètes)
(du latin (du grec
Fungus) Mykes)

Champignons Champignons microscopiques

macroscopiques (micromycètes;
microorganismes fongiques)

Moisissures Levures

(Mycéliennes) (Unicellulaires)

10
 2- Caractères particuliers des
moisissures

2.1- Généralités
2.2- Morphologie et structure
2.3- Croissance et reproduction

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2.1- Généralités

Très répandues dans les milieux naturels (sol, air,

déchets organiques, etc.)
Agents d’altération très actifs, surtout sur produits
alimentaires au stockage (moitié des pertes
après récolte)
Certaines espèces produisent des mycotoxines
(très dangereuses)
Quelques espèces utiles dans l’alimentation
(fromages, sauces fermentées, etc.)
Espèces pathogènes (plantes, animaux, Homme)

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2.2- Morphologie et structure

Structure filamenteuse, mycélienne typique

L’ensemble des filaments (hyphes) plus ou moins
enchevêtrés forme le mycélium
Mycélium visible à l’œil nu à la surface des
supports: masse laineuse, cotonneuse ou
veloutée et souvent pigmentée
Au microscope, on distingue la structure intime des
filaments et la présence de « fructifications »
produisant les spores de la reproduction

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Diverses moisissures sur fruits Rhizoctonia violacea
sur carottes

Cultures
en boîte
de Petri

Penicillium Aspergillus
14
Structure filamenteuse (mycélienne)
des moisissures 15
 Filaments non cloisonnés
(champignons inférieurs)

Filaments cloisonnés
(champignons supérieurs)

Structure filamenteuse
des moisissures 16
2.3- Croissance et reproduction

Croissance du mycélium
. Élongation des filaments
. Ramification des filaments
Reproduction asexuée
. Formation de sporangiospores
. Formation de conidies ou conidiospores
. Autres types de spores
Reproduction sexuée Voir § 4
. Cas des Ascomycètes
. Cas des Basidiomycètes
. Cas des Phycomycètes
3- Principes généraux d’identification

Observation macroscopique
- in situ
- Culture sur milieu gélosé (taille du thalle, aspect, couleur, revers, etc.)

Observation microscopique
- Filaments cloisonnés ou non
- Structure de fructification (sporulation asexuée)
- Présence et type de reproduction sexuée

Caractères biochimiques et génétiques
4- Présentation des principaux genres

Cette présentation se fera essentiellement sur la base des

modes de reproduction:
Reproduction asexuée
La reproduction asexuée se fait par formation de
spores, qui germent pour donner un nouveau
mycélium:
. Sporangiospores (chez les champignons inférieurs)
. Conidiospores (chez les champignons supérieurs)
. Autres types de spores

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. Formation de sporangiospores

Se forment dans un sac

(sporange ou sporocyste) porté Exemples:
par un filament spécialisé
- Mucor
(sporangiophore).
- Rhizopus (avec
A maturité, le sporange éclate
des rhizoïdes)
et libère les sporangiospores 20
 Sporangiospores

Sporocyste
entier

columelle

Mucor sp.
Comparaison Rhizopus - Absidia
 Sporocystes ouvert
Sporocystes avec à maturité pour
sporangiospores à libérer les spores
l’intérieur
23
 Mucor

Mucor pusillus

Mucor globosus

Mucor mucedo Mucor hiemalis

 Mucor indicus
en boîte de Petri

Mucor mucedo
sur fruit d’agrume
 Rhizopus

Rhizopus sp. Rhizopus sur tomate

Rhizopus nigricans
 Absidia

Absidia
corymbifera

Absidia sp.
Absidia
parricida
. Formation de conidies

Se forment à l’air libre (pas de sac)

Sur filament spécialisé: conidiophore
Conidies unicellulaires, bicellulaires ou
pluricellulaires
Parfois chez même espèce, microconidies
unicellulaires et macroconidies pluricellulaires
(Fusarium)
Souvent tête conidienne caractéristique
(Penicillium, Aspergillus, etc.)

29
 Penicillium

Stipe = conidiophore

Têtes conidiennes:
a & b: monoverticillé; c: polyverticillé symétrique; d: polyverticillé asymétrique

30
 Pourritures verte et bleue des fruits d’agrumes

Penicillium digitatum
(pourriture verte)

Penicillium italicum
(pourriture bleue)
Penicillium notatum

Penicillium chrysogenum
Fromage Roquefort

surface

Culture sur CYA

revers

Penicillium roqueforti
 Fromage
Camembert
Penicillium
camemberti en culture

Tête
conidienne
de P.
camemberti
Penicillium cyclopium
 Aspergillus

Aspergillus sp.
Têtes conidiennes
d’Aspergillus
a: monsériée
b: bisériée
36
Aspergillus ochraceus
Aspergillus niger
Aspergillus flavus
Aspergillus parasiticus
Aspergillus fumigatus
 Fusarium

Macroconidies

Microconidies

Macroconidies et
microconidies de
Fusarium
42
Fusarium oxysporum

macroconidies

microconidies
Fusarium graminearum
Fusarium moniliforme
Alternaria

Alternaria: conidiophore,
microconidies et
macroconidies
46
Alternaria alternata
Alternaria dauci
Alternaria citri
Cladosporium
Cladosporium
cladosporioides

Cladosporium
sphaerospermum
 Trichoderma

Trichoderma
viride
Monilia

Monilia fructigena
 Ulocladium

Ulocladium cucurbitae

Ulocladium chartarum

Ulocladium sp.
 Colletotrichum

Colletotrichum Colletotrichum Colletotrichum

cereale graminicola gloesporioides
 Paciclomyces

Paecilomyces variotii

Paecilomyces
ramosus

Paecilomyces lilacinus
. Autres types de spores
Chlamydospores
(Rôle de
résistance)

Fusarium oxysporum Phytophtora sp.

Arthrospores

Geotrichum sp. Geotrichum candidum

57
Reproduction sexuée

Champignons supérieurs (filaments cloisonnés)

. Cas des Ascomycètes
. Cas des Basidiomycètes
Champignons inférieurs ou Phycomycètes
(filaments non cloisonnés)
. Formation de zygospores

58
Ascospores

ascospores

asque

59
Basidiospores

60
Zygospores
zygospore

61
Zygospore de Mucor à
pleine maturité

Zygospore de
Zygorhynchus
 Récapitulation- Classification des moisissures
moisissure

Mycélium
cloisonné non cloisonné

Champ. supér. Champ. infér.

Rep. sexuée

Non Oui

Asco- Basidio-

spores spores

Fungi imperfecti Ascomycètes Basidiomycètes Phycomycètes

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Champignons parfaits
 Classification sommaire des mycètes
Classes Sous-classes Spores Importance en alimentation
sexuées
Zygomycètes Zygospores Genres importants: Mucor,
Phycomycètes Rhizopus
Oömycètes Oöspores Aucune
Nombreuses formes
Ascomycètes - Ascospores parfaites des levures et
moisissures des aliments
La plupart des champignons
Basidiomycètes - Basidiospores macroscopiques
(comestibles ou vénéneux)
Nombreuses levures et
Deutéromycètes - Inconnues moisissures des aliments

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