Cinétique Enzymatique

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II.

CINETIQUE ENZYMATIQUE

I. INTRODUCTION :

 La réaction enzymatique peut se diviser en trois principales étapes :


1. L’association de l’enzyme (E) et du substrat (S) :
‐ Elle se produit en une région bien précise de l’enzyme appelée (site actif).
‐ Le site actif est une entité tridimesionnelle correspondant à une petite région de la
protéine.
‐ Cette reconnaissance dynamique est appelée adaptation induite.
L’association enzyme-substrat (ES) est stabilisée par des liaisons de faibles énergie :
liaisons hydrogène, interactions hydrophobes, liaisons ioniques…….
2. Le complexe Es subit un réarrangement interne qui va permettre la transformation du
substrat en produit (P).
3. L’enzyme libère le produit de la réaction et retrouve son état initial.
 L'étude cinétique d'une réaction enzymatique consiste en l'étude de la vitesse de
réaction et de l'influence de différents paramètres susceptibles de la modifier.

II. LA VITESSE D’UNE REACTION ENZYMATIQUE :


 Soit la réaction catalysée par l’enzyme E qui transforme le substrat P en produit
S P
 La vitesse instantanée de réaction est la quantité de S disparue par unité de temps ou la
quantité de P apparue par unité de temps ; elle est proportionnelle à la concentration du
substrat :
V= - ds/dt = dp/dt = K [S].
 Pour des concentrations de [E] et de [S] données, on mesure la quantité de P formé en
fonction du temps :
 La courbe [E]=f(t) est :
‐ D’abord linéaire ascendante : l’enzyme est saturé par son substrat, la vitesse est
constante :
‐ Puis s’infléchit, l’enzyme n’est plus saturée par son substrat, la vitesse décroit.
‐ Et enfin horizontale : l’équilibre de la réaction est atteint et la vitesse est nulle.
 A l’instant t, V=Tg α.
 A l’instant t0 , V est maximale, c’est la vitesse initiale Vi de la réaction : Vi=tgα0.

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 INFLUENCE DE LA CONCENTRATION DU SUBSTRAT SUR LA
VITESSE INITIALE :
 A [E] constant, on répète la mesure de Vi à des concentrations croissantes de S.
 La courbe Vi=f([S]) est une courbe hyperbole qui tend vers une valeur limite, la vitesse
maximale ou Vmax.

III. LA CONSTANTE DE MICHAELIS-MENTEN

En 1913, MICHAELIS et MENTEN ont établi l’équation d’une réaction enzymatique

K1 K3
E+S ES E+P (1)
K2
Cette réaction se décompose en 02 temps :
1- formation du complexe enzyme-substrat :

‐ La transformation du substrat en produit, se fait obligatoirement par le passage un état


intermédiaire : le complexe enzyme substrat.
‐ -étape rapide et réversible.
V1 , k1
E+S ES
V2, k2

V1 et k1 sont les vitesse et constante de formation du complexe ES , v2 et k2 les vitesse et constante


de dissociation du complexe ES.

2- formation du produit P à partir du complexe enzyme-substrat :

‐ La deuxième étape correspond à la formation du produit à partir du complexe activé.

‐ Étape plus lente

V3, k3
ES E+P
V3 et k3 sont la vitesse et constante de formation du produit P.

Suivant la réaction (1), la vitesse de disparition du substrat S (- ds/dt) est égale à la vitesse de
formation des produits de la réaction (dp/dt).

- ds/dt = dp/dt (2)

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D’après la loi d’action des masses on a :

V1 = K1 [E] [S] K1 V1 K3V3


E+S ES E+P
V2= K2 [ES] K2 V2

La vitesse d’apparition des produits des réactions :

dp/dt = V3 = K3 [ES] (3)


Et dp/dt =- ds/dt donc V1 – V2 = V3 V1 = V2 + V3
K1 [E] [S] = K2 [ES] + K3[ES]
K1 [E] [S] = [ES] [K2 + K3]
[E] [S] / [ES] = K2 + K3/ K1 = KM (4)

 KM est la constante de dissociation du complexe [ES], appelée constante de Michaelis-


Menten (exprimée en mole/litre), elle définit l’affinité de l’enzyme pour son substrat :
 Si KM est faible, l’affinité de l’enzyme pour le substrat est grande et réciproquement.

IV. L’EQUATION DE MICHAELIS-MENTEN

L’enzyme est soit sous forme libre E, soit complexé au substrat ES:

[ ET ]= [ E] + [ ES]
 [ ET ] étant la concentration totale de l’enzyme.
 Donc: Km=([ ET ]-[ ES] )[ S]/ [ ES] =[ ET ]-[ S]/ [ ES] -[ S]
 d’où [ ES]= [ ET ][ S]/ km + [ S].

 La vitesse de la réaction Vi est égale à V3, vitesse de la réaction la plus lente:


 Vi = V3=K3[ ES].
 D’où Vi=K3 [ ET ][ S]/ km + [ S].
 Or v max = K3 [ ET ].
 Donc Vi=Vmax [ S]/ km + [ S]. C’est l’équation de Michaelis Menten

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 Vmax est la vitesse maximale que peut atteindre la réaction lorsque l'enzyme est
saturée de substrat
 Km est la concentration de substrat qui sature l'enzyme à moitié.

V. REPRÉSENTATION DE LINE WEAVER ET BURKE :


 Une hyperbole est difficile à tracer manuellement.
 Des erreurs sur l'estimation de la Vmax sont possibles.
 Pour simplifier la représentation graphique de l'équation de MICHALEIS-
MENTEN , on transforme l'hyperbole en droite.
 L’équation de MICHALEIS- MENTEN peut s’écrire sous la forme :

 Cette équation est une équation de droite de la forme :


Y = aX + b ou 1/V = f (1/ [S])
Elle consiste en un tracé de 1/V en fonction de 1/[S].
 La droite qui en résulte coupe l'axe des ordonnées en 1/Vmax et l'axe des abscisses en
- 1/Km

 Cette représentation présente l'avantage d'être plus facile à lire.


 En effet, on définit:
‐ Vmax : par le point d'intersection de la droite avec l'axe des ordonnés
‐ Km : par le point d'intersection de la droite avec l'axe des abscisses.

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