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    Dr A.

    Aouiche
    Science du vivant microscopique

    Vivant microscopique = micro-organisme


    Micro-organisme = Bactérie, algues microscopiques,
    champignons microscopiques, virus…
    Micro-organisme = Bactérie, algues microscopiques, champignons
    microscopiques, virus…

    Bactériologie
    Algologie
    Mycologie
    Virologie
    Parasitologie
    Protozoologie

    - Ces Microorganismes peuvent être procaryotes (Bactéries, cyanobactéries)


    ou eucaryotes (algues, champignons)

    - Les virus sont des particules (considérées comme non vivantes)


    Historique et introduction / 1 séance

    Chapitre 1 : Structure de la cellule procaryote / 3 séances

    Chapitre 2 : Diversité et classification des microorganismes / 2 séances

    Chapitre 3 : La nutrition et la croissance bactérienne / 2 à 3 séances

    Chapitre 4 : Maîtrise des micro-organismes par les agents chimiques / 2 séances

    Chapitre 5 : La microbiologie alimentaire et industrielle / 2 séances

    Chapitre 6 : Virologie générale / 1 séance


    Travaux dirigés
    TD N°1: Les microorganismes agents de toxi-infection
    TD N°2 : Les méthodes de désinfection et de stérilisation et les agents
    physico-chimiques antimicrobiens
    TD N°3 : Les milieux de culture et l’isolement
    TD N°4 : Les méthodes de mesure de la croissance microbienne

    Travaux pratiques
    TP N° 1 : Introduction à la microbiologie
    TP N° 2 : Techniques d’ensemencement sur milieux de culture
    TP N° 3 : Isolement, repiquage et étude macroscopique
    TP N° 4 : Examen microscopique des bactéries et colorations
    Echéancier des TD TP
    (à partir du 27/01/2019)
    Tp / TD Durée

    TP 1 15 jours

    TD 1 + TD 2 15 jours

    TP 2 15 jours

    TP 3 15 jours

    TD 3 + TD 4 15 jours

    TP 4 15 jours
    Commerçant hollandais

    Précurseur de la biologie
    cellulaire et la microbiologie

    Découverte du monde microbien


    Antonie Van Leeuwenhoek
    1632-1723
    Antonie Van Leeuwenhoek

    Construisait des microscopes pour


    les vendre
    (Loupe : grossissement 200 -300 fois)
    Il observait les objets

    Découverte fortuite du monde


    microbien Antonie Van Leeuwenhoek
    1632-1723
    Loupe de Van Leeuwenhoek
    Très curieux, il observa des gouttes de pluie, de la salive, du
    tartre de ses dents …et découvrit les microorganismes qu’il
    appela à l’époque ANIMALCULES.
    Animalcules représentés par:

    Bactéries

    Spermatozoïdes (animalcules spermatiques)

    Champignons microscopiques

    Algues microscopiques , etc..

    Ce sont les membres du monde


    microbien
    La question de l’origine des Animalcules

    Polémique (débat, discussion, désaccord)

    Théorie de la
    génération
    Biogénèse
    spontanée
    (Abiogenèse)
    La génération spontanée est une théorie selon laquelle la vie
    provient du non-vivant c.à.d.. que les êtres vivants se forment
    spontanément à partir de la matière inanimée (morte).

    La biogénèse est une hypothèse qui suppose la présence


    de <<graines des animalcules>> omniprésents dans la
    nature, toujours prêts à se développer dans un milieu
    favorable . Van Leeuwenhoek était parmi les partisans
    de cette théorie.
    En 1749, Needham porte un bouillon de viande à
    ébullition, le laisse refroidir à l’air, et le voit fermenter. Il
    conclut que les microorganismes naissent spontanément
    de la viande.
    Vers la même période, un italien Spallanzani, tentait de réfuter la
    théorie de la génération spontanée. Il fit la même expérience que la
    précédente mais scella hermétiquement les flacons. Aucun
    microorganisme n’apparut. Il démontra ainsi la présence de
    microorganismes dans l’atmosphère et leur destruction par la chaleur.
    Ces résultats ne purent convaincre Needham qui prétendit
    simplement que l’air était essentiel pour l’abiogenèse des microbes.
    80-90 ans plus tard, Schulze et Schwan refirent
    l’expérience en faisant passer l’air à travers de fortes
    solutions d’acides (Schulze) ou en faisant passer l’air
    dans un serpentin chauffé à rouge (Schwann) avant de
    l’envoyer dans le bouillon de viande. Aucun microbe n’y
    apparut.
    La destruction définitive de la théorie de la génération spontanée.

    Ce fut Pasteur (1822-1895), chimiste, qui apporta la preuve définitive.


    Pasteur prépara des
    solutions nutritives dans
    des flacons à col de cygne.
    Sans empêcher le passage
    de l’air qui était ni filtré ni
    traité, il chauffa les
    bouillons et les laissa
    reposer.
    Aucun microorganisme n’y
    apparut. Les poussières
    qui transportent les
    microorganismes ne
    pouvaient entrer en
    contact avec la solution
    nutritive car elles se
    déposaient dans la partie
    en U des tubes à col de
    cygne.
    Avant la découverte du monde microbien

    Règne Animal Règne Végétal


    Découverte du monde microbien

    Bactéries

    Algues microscopiques

    Champignons microscopiques

    Protozoaires
    Après la découverte du monde microbien

    Où placer ces microorganismes ?

    Règne Animal Règne Végétal

    Rapprochement des Rapprochement des


    Protozoaires (mobiles , non Algues (photosynthèse)
    photosynthétiques) Champignons (immobiles)
    Où est la place des Bactéries ?
    1886, un zoologiste allemand : Haeckel

    Proposition de création d’un 3eme règne


    pour ces formes microscopiques

    Règne : Protistes
    1950, grâce au microscope électronique

    Règne : Protistes

    Protistes supérieurs Protistes inférieurs


    Eucaryotes Procaryotes
    >>>>>Algues >>>>>Bactéries
    >>>>>Protozoaires >>>>>Cyanobactéries
    >>>>>Champignons
    Actuellement

    >Deux domaines : Prokaryota et Eukaryota


    >Six Règnes
    Chapitre I
    Structure de la cellule procaryote
    I. Organisation cellulaire des procaryotes et
    différences procaryotes/eucaryotes
    STRUCTURE DE LA CELLULE PROCARYOTE (BACTERIE)

    + Spore
    Vacuole
    Inclusions de réserves
    Organite cellulaire Présence Fonction / Rôle
    Flagelle (ou cils) Présence facultative Locomotion
    Pili (ou fimbriae) Présence facultative Adhésion aux surfaces (pili commun) et transfert de matériel
    génétique entre cellules (pili sexuel)

    Capsule Présence facultative Protection de la cellule bactérienne


    Paroi cellulaire Présence obligatoire Protège la cellule et lui donne la forme
    Membrane cytoplasmique Présence obligatoire C’est le siège de la respiration, de la biosynthèse de plusieurs
    molécules. Contrôle les échanges.
    Mésosome Présence obligatoire Intervient dans la réplication du nucléoïde
    Nucléoïde Présence obligatoire Siège de l’information génétique
    Cytosol Présence obligatoire Siège de beaucoup de réactions chimiques
    Ribosome Présence obligatoire Siège de la synthèse protéique
    Plasmide Présence facultative Confère des caractères et aptitudes supplémentaires aux
    bactéries
    Spore Présence facultative Forme de résistance et/ou moyen de reproduction pour
    certaines bactéries
    Chromatophores Présence facultative Siège de la photosynthèse pour les bactéries photosynthétiques

    Vésicules à pigments Présence facultative Contiennent des pigments dont le rôle varie selon sa nature et
    l’espèce qui l’abrite
    Granules de réserves Présence facultative Contiennent des réserves nutritives
    Vacuole à gaz Présence facultative Sert au déplacement vertical dans l’eau pour les bactéries qui en
    possèdent
    Caractères Cellule eucaryote Cellule procaryote
    ► Beaucoup plus grand et organisé en ► Beaucoup plus petit et organisé en un
    Matériel génétique plusieurs chromosomes qui forment un seul chromosome (haploïde).
    noyau diploïde.
    ► Diffus dans le cytoplasme et pas de
    ► Entouré d’une double membrane membrane qui l’entoure.
    nucléaire.
    ► Le chromosome est circulaire et il est
    ► Les chromosomes sont linéaires et se en relation avec la membrane
    terminent aux extrémités par des régions cytoplasmique.
    d’ADN répétitives appelées télomères.
    ► Absence des histones. Ils sont
    ► L’acide phosphorique de l’ADN est remplacés par des polyamines et des
    associé à des protéines (Histones). cations de Mg2+
    Cytosquelette Présent Absent
    Système Présent Absent
    endomembranaire
    Organites semi Présents Absents
    autonomes
    La chaine respiratoire se trouve au niveau La chaine respiratoire se trouve au niveau
    Différences entre Respiration de la membrane interne mitochondriale. de la membrane cytoplasmique.

    procaryotes et La photosynthèse Le siège : plastes Le siège : les chromatophores


    Ribosomes 80 S* 70 S
    eucaryotes Stérols dans la membrane Présents Absents (sauf chez les mycoplasmes et les
    plasmique cyanobactéries)
    Les types d’échanges :
    Transport passif Présent Présent
    Transport facilité Présent Présent
    Transport actif Présent Présent
    Exocytose Présent Absents
    Endocytose Présent Absents
    Capsule Absente Présente
    Pili Absent Présent
    Flagelle Présent Présent
    La paroi Présente Présente
    Mésosome Absent Présent
    Spore Présente Présente
    Plasmide Absent Présent
    Vacuole Présente Présente
    II. La morphologie de la cellule bactérienne

    micromorphologie
    Unité de mesure en microbiologie est µm (micromètre)
    1 µm = 10-6 m = 0,000 001 m
    1 µm = 10-3 mm = 0,001 mm
    Longueur moyenne : 1 – 5 µm

    Largeur
    moyenne
    Bactérie (diamètre):
    0,1 – 2 µm
    Unité de mesure en microbiologie est µm (micromètre)
    1 µm = 10-6 m = 0,000 001 m
    1 µm = 10-3 mm = 0,001 mm

    Exceptions :
    >>>> 100 µm à 500 µm de longueur, 1 – 2 µm de largeur

    >>>> 0,1- 0,2 µm de diamètre


    Sphérique = (Cocci) COQUES Bâtonnet = BACILLE Spiralée

    Filamenteuse. Exp: Actinomycètes


    Les formes bactériennes
    L’arrangement ou regroupement cellulaire

    En grappe ex. : Staphylococcus aureus

    En sarcine
    II. La morphologie de la cellule bactérienne

    macromorphologie
    Milieu de culture liquide
    Milieu de culture solide (gélose)

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