Rapport de Chimie Computationnelle
Rapport de Chimie Computationnelle
Rapport de Chimie Computationnelle
OH O
4. Leucine dans sa 5. (Be)5
forme
zwitterionique
HO O
6. 5,7-Dihydroxy-chromen-4-one
Figure 4. Modification des angles de liaison O-C-O et C-O-H dans l’acide acétique
3
c) Orbitales moléculaires
10 orbitales moléculaires (OM) ont été calculées en accord avec la théorie des OM. En effet,
selon cette théorie, chaque orbitale atomique (OA) de chaque atomique se combine
linéairement à l’orbitale atomique (OA) de même symétrie et d’énergie proche de l’autre
atome pour donner deux OM. La configuration électronique d’un atome de N à l’état
fondamental étant 1s 2 2s 2 2 px1 2 p y1 2 pz1 , 5 OAs y figurent. Leur combinaison permet ainsi
d’orbitales 10 OMs dont 7 sont occupées (par 14 électrons de N2) et 3 sont vides.
5
2σg 1πu
1σg 1σu 2σu
e) Input file
6
1è
2 pz1 3 1 1 5PGTOs 5PGTOs
1) f1s2 12PGTOs
Or, selon la basis set pour une orbitale de cœur : 6PGTOs 1CGTO
D’où 12PGTOs 2CGTOs
2) f2s2 10PGTOs
3PGTOs 1CGTO
Or, selon la basis set pour une orbitale de valence : 1PGTO 1CGTO
1PGTO 1CGTO
Donc 5PGTOs 3CGTOs
D’où 10PGTOs 6CGTOs
f 2 p 1 5PGTOs 3CGTOs
x
f 2 p 1 5PGTOs 3CGTOs
y
f 2 p 1 5PGTOs 3CGTOs
z
3) f d 6 PGTOs 1CGTO
31 32 33
34 35 36
La distance d’équilibre est R0=1,07 A° avec une énergie correspondant à E0=-108,971947 u.a
-108,9695
Energie(u.a)
-108,97
-108,9705
-108,971
-108,9715
-108,972
-108,9725
Distance (A°)
Figure 8. Energie totale en fonction de la distance internucléaire N-N calculée avec HF/6-
311G(d)
10
E
22,9104 R 2 56,156 R 33,859
R
E
0 22,9104 R 2 56,156 R 33,859 0
R
50, 6034
R0 1,0703 A
2E
45,8208 R 56,156
R 2
2 E
7,1136 0 . Il s’agit bien d’un minimum
R 2 R0 1,0703
2 E
k 7,1136 HaA 2
R 2
Conversion de HaA 2 en Nm 1
7,1136 4,35975.1018 Nm
k 7,1136 HaA2
10 m
10 2
k 3101,35 Nm1
d) Fréquence de vibration ω
1 k 1 3101,35kgs 2
2 2 3,14 1,1622.1026 kg
8, 2257.1013 s 1
c 3.1017 nms 1
3647, 08nm
8, 2257.1013 s 1
8, 2257.1013 s 1
10 1
2741,9cm1
c 3.10 cms
Domaine du spectre électromagnétique : Infrarouge
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e) Calcul d’optimisation de N2
E 108,97194736u.a
R0 1,07025 A
Rexp 1, 098 A
1,098 1,07025
L’erreur relative du calcul de Hartree Fock : Er 100 2,52%
1,098
Pour réduire cette erreur, nous suggérons d’augmenter le niveau de théorie en passant de
HF/6-311G(d) à MP2/6-311G(d) ou à la DFT/6-311G(d) en gardant la même base. En effet,
l’inconvénient majeur de la méthode de Hartree Fock est de ne tenir compte que
partiellement de l’énergie de corrélation électronique. Pour un système à 14 électrons cette
énergie est non négligeable. La deuxième manière de réduire l’erreur est d’élargir davantage
la base de calcul.
g) Fréquence de vibration calculée
2740,09cm1
Le résultat calculé pour la fréquence de vibration se rapproche de celui obtenu par la
procédure de fitting avec une erreur de Er 0, 06% .
E 16389, 4 Jmol 1
N Ahc 6,023.1023 mol 1 6,626.1034 Js 3.1010 cms 1
1368,9cm1
En utilisant la formule précédemment démontrée, nous obtenons :
1 1
EZPE N A h 6, 023.1023 mol 1 6, 626.1034 Js 1 8, 2257.1013 s 1
2 2
EZPE 16413, 72 J / mol
L’énergie est de même ordre de grandeur que la valeur trouvée dans le fichier .log.
12
exp 2360cm1
2740, 09 2360
L’erreur relative de HF est de : Er 100 16,10%
2360
En supprimant l’erreur systématique grâce au facteur d’échelle (scaling factor), on obtient :
Gauche -157,29689525
ET syn -157,28854197
ET +120 -157,29258979
Conformation Angle dièdre (°) Distance C1- Distance C2-C3 Distance C3-C4
C2(A°) (A°) (A°)
Anti 180,00000 1,52811 1,52962 1,52811
Gauche 65,39990 1,52971 1,53290 1,52971
ET syn -0,01306 1,53121 1,55483 1,53120
ET +120 119,21797 1,52921 1,54639 1,52921
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Comme on pouvait s’attendre sur les états de transition, il y a une fréquence imaginaire pour
chaque état.
e) Fréquences de vibrations
Les fréquences de vibration de ces molécules sont séparées en deux groupes, celles autour
de 1700 cm-1 et celles autour de 3000 cm-1.
Les différences en énergie entre ces deux groupes de fréquences réside dans les modes de
vibration qu’elles représentent. En effet, les fréquences situées autour de 1700 cm-1 sont des
déformations angulaires δ impliquant les liaisons C-H avec ou sans modification de l’angle
dièdre, tandis que les fréquences autour de 3000 cm-1 représentent des élongations ν des
liaisons C-H. Il est généralement admis que les élongations sont plus énergétiques que les
déformations angulaires.
f) Energies et correction de l’Energie du Point Zéro
g) Energies relatives
Note : (*) La valeur expérimentale de la conformation syn a été remise en question par un
calcul théorique très précise (avec 810 fonctions de base et la meilleure méthode ab initio
pour évaluer la corrélation). C’est ainsi que nous utilisons le résultat obtenu dans cette
étude comme référence pour la conformation syn.
Les résultats présentés par le Tableau précédent mettent en exergue la prise en compte de
l’énergie de corrélation électronique dans la méthode MP2. En effet, les erreurs relatives par
rapport aux résultats expérimentaux ont tendance à baisser significativement. C’est le cas
notamment pour la conformation gauche dont l’erreur passe de 57% (HF) à 7% (MP2).
i) Temps et symétrie (MP2 uniquement)
C H d 1, 09485 A
C O d 1,17855 A
Angles de liaison
H C O 122, 075
H C H 115,814
1746 1706,12
Erreur relative : Er 100 2, 28%
1746
e) Symetry type de l’état fondamental
f) Orientation des axes
g) Orbitales moléculaires
a1 b2
a1 a1 a1
a1 b2
b1 b1
h) Orbitales HOMO-LUMO
HOMO HOMO
LUMO LUMO
Figure 13. Formes des orbitales HOMO et LUMO des è α et β de l’état excité du
formaldéhyde
b) Energie relative de l’état excité par rapport à l’état fondamental
E 113, 79599640 113,89915400
E 0,1031576u.a
Cette énergie est plus basse que l’énergie électronique de l’état fondamental.
b) Structure optimisée : vrai minimum ?
Le groupe de symétrie de ce calcul : Cs
La structure optimisée correspond à un minimum sur la courbe d’énergie potentielle, car il
n’y a pas de fréquence imaginaire.
c) Distances et angles de liaison
1269,16cm1
RHF CISD
Distance (A°) 0,73374 0,74145
Energie (u.a) -1,1334998 -1,16656884
Fréquence (cm-1) 4409,37 4582,04
HF CISD
Energie (u.a) -0,74029189 -1,29487790
3) Atome de H : Energie
UHF
Energie (u.a) -0,49994557
UHF
Distance (A°) 1,05735
Energie (u.a) -0,60252088
Fréquence (cm-1) 2322,36
5) Energie d’atomisation D0
Le calcul de l’énergie d’atomisation peut se faire des deux manières :
a) D0 EH EH2 eq
2 10 A
b) D0 2 EH EH 2 eq
On a ainsi :
I e EH EH 2
2
I e 14, 45eV
HF CISD
Valeur Valeur exp. Erreur rel. Valeur th. Valeur exp. Erreur rel.
th. (%) (%)
Distance 0,73374 0,741 0,97 0,74145 0,741 0,06
(A°)
Fréquence 4409,37 4401 0,19 4582,04 4401 4,1
(cm-1)
D0 246,74 103,4 138,62 - 103,4 -
(kcal/mol)
Méthode 1
D0 83,84 103,4 18,91 104,59 103,4 1,15
(kcal/mol)
Méthode 2
Ie (eV) 14,45 15,426 6,32 - 15,426 -
8) Questions :
a) L’effet de la corrélation électronique sur la distance d’équilibre H-H et la fréquence
augmente la force de la liaison, car nous constatons que la fréquence de vibration
augmente lorsque l’on monte de niveau de HF à CISD, ce qui suppose une
augmentation de la constante de force de la liaison selon le modèle de l’oscillateur
harmonique. La même tendance n’est pas observée pour H2+, car cette espèce
chimique ne possède qu’un seul électron, il n’y a donc pas de corrélation
électronique.
b) Les deux valeurs d’énergie d’atomisation D0 obtenus avec HF avec les deux méthodes
suggérées sont fort éloignées. La première est trop élevée, car la distance de 10 A°
est trop élevée pour un calcul précis de l’énergie de H2. En effet, à cette distance l’on
peut considérer qu’il n’y a plus aucune liaison et qu’il serait mieux de calculer les
énergies des deux atomes séparément tel que le suggère la seconde méthode pour
un résultat un peu plus réaliste. Nous estimons que cette erreur peut être également
attendue pour les plus grosses molécules.
c) L’énergie d’ionisation de H2 est sous-estimée par rapport à la valeur expérimentale
au niveau de théorie HF. Cela peut être expliqué par le fait que HF ne considère que
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