Thèse BEDJAOUI 2019 VF CD Graver
Thèse BEDJAOUI 2019 VF CD Graver
Thèse BEDJAOUI 2019 VF CD Graver
THÈSE
Pour l’obtention du Diplôme de Doctorat En Sciences Agronomiques
Louange à Dieu tout puissant qui a permis que ce travail voie le jour.
L’encadrement scientifique de ce travail a été assuré par Mme BENBOUZA Halima, Professeur
à l’Université de Batna. Je tiens vivement à lui exprimer ma profonde reconnaissance pour ses
apports scientifiques, ses orientations, ses remarques et aussi pour l’intérêt porté à mon sujet
de recherche.
Mes remerciements les plus vifs s'adressent également à tous les membres de jury qui ont
accepté de juger ce travail malgré leurs multiples occupations et responsabilités, qu’ils
trouvent ici l’expression de ma reconnaissance et ma profonde gratitude.
Mes sentiments les plus profonds et remerciements infinis pour Mr. Mehaoua Med Seghir pour
son soutien inconditionnel tout au long de ce doctorat.
ii
J’adresse mes plus vifs remerciements et ma plus chaleureuse et amicale reconnaissance à mes
collègues et amies, Mme Bennaceur Malika, MmeNadia Bouguedoura, Mme Deghnouche
Kahraman, Mme Kessai Abla, Melle Boulelouah Nadia, Melle Boukhalfa Hafida, Melle Farhi
Kamilia, Melle Moussouni Souhila.
Je tiens également à remercier l’ensemble de mes étudiants et phoeniciculteurs qui ont toujours
été là et nos las de me soutenir pour l’accomplissement de ce travail en particulier : Mr. Suiki
Tarzi, Mr. Suiki Larbi.Mr. Khaled Laadjel, Mr. Mezghiche Nour Mr. Hizi Said. Melle Hizi
Halima, Mr. Badache. Melle Badache Sarah, Mme Boutiba Soumia, Melle Tahri Kenza, Melle Atia
Nadjeh, Melle Fadlaoui Soumia.
Mes remerciements les plus vifs pour mon amie de toujours Mme Siham Ait Hamouda.
Il est des personnes que nous ne remercions jamais assez…ma famille et en particulier mon
époux Imed.
iii
Liste des Abréviations
% Pourcentage
ACP Analyse en Composantes Principales
ADN Acide désoxyribonucléique
AFLP Amplified Fragment Length Polymorphism, Polymorphisme de Longueur
des Fragments Amplifiés
AMOVA Analyse de la variance moléculaire
ANOVA Analyse de la variance
°C Degré Celsius
CAH Classification Ascendante Hiérarchique
CGIAR Consultative Group on International Agricultural Research
DL Descriptors Lists
DNTP Désoxyribo-Nucléotide Triphosphate
FAO Food and Agriculture Organization, Organisation des Nations Unies pour
l’Alimentation et l’Agriculture
IPGRI International Plant Genetic Ressources Institue, Institut International des
Ressources Génétiques
ISSR Inter Simple Sequence Repeats
MCPD Multi-Crop Passport Descriptors, Plan National De Développement Agricole
Pb Paire de base
PCR Polymerase Chain Reaction, Technique de polymérisation en chaîne
PNDA et Programme de l’accession à la propriété foncière agricole
APFA
RAPD Random amplified polymorphic DNA, Amplification Aleatoire d’ADN
polymorphe
SNP Single Nucleotide Polymorphism
SSR s Simple Sequence Repeat
UPGMA Unweighted Pair Group Method with Arithmetic averaging
US$ Dollar Américain
iv
Liste des Figures
Figure 1. Evolution des listes des descripteurs : première phase (1977-1994) (Gotor 18
et al., 2008)………………………………………………………………...
Figure 3. Classement des dix plus grands producteurs de dattes au monde en tonnes 32
(FAOSstat, 2018)…………………………………………………………..
Figure 7. Projection des cultivars et des paramètres végétatifs sur le plan 1–2……... 54
Figure 8. Projection des cultivars et des paramètres végétatifs sur le plan 1-3……… 55
Figure 9. Projection des cultivars et des paramètres reproducteurs sur le plan 1–2…. 57
Figure 10. Projection des cultivars et des paramètres reproducteurs sur le plan 1-3…. 58
Figure 11. Classification ascendante hiérarchique (CAH) des cultivars basée sur les 59
caractères végétatifs………………………………………………………..
Figure 12. Classification ascendante hiérarchique (CAH) des cultivars basée sur les 60
caractères reproducteurs……………………………………………………
Figure 16. Taux du phosphore, sodium, zinc et cuivre dans les dattes étudiées………. 86
Figure 17. Projection des cultivars et des paramètres chimiques des dattes sur le plan 89
1–2………………………………………………………………………….
Figure 18. Projection des cultivars et des paramètres chimiques des dattes sur le plan 90
1–3………………………………………………………………………….
Figure 19. Classification ascendante hiérarchique (CAH) des cultivars basée sur les 93
caractères chimiques des dattes…………………………………………….
v
Figure 20. Carte des zones échantillonnées. Les points rouges se référant aux sites 108
d'échantillonnage……………………………………………………………
Figure 21. Fréquences alléliques pour les amorces mpdCIRO50 et DP1600…………. 117
Figure 24. Relations entre les 52 accessions de palmier dattier en utilisant l'analyse 123
UPGMA basée sur le coefficient de similarité de Jaccard des marqueurs
SSR…………………………………………………………………………
Figure 27. Profils génomiques SSR générés par les amorces et mpdCIR050, DP160, 130
DP171 et mpdCIR035………………………………………………………
vi
Liste des Tableaux
Tableau 12. Noms des cultivars et sites de prélèvement d'échantillons (Région des 110
Ziban)……………………………………………………………………...
Tableau 13. Tailles et fréquences des allèles pour les 14 SSRs loci analysés sur 116
l’ensemble des cultivars de palmier dattier……………………………….
Tableau 14. Polymorphisme des SSR et statistiques F dans les cultivars étudiés……... 118
Tableau 15. Diversité allélique, hétérozygotie attendue et indice de fixation dans les 121
populations étudiées………………………………………………………
vii
Tables des matières
Remerciements.......................................................................................................................ii
Liste des abréviations.......................................................................................................... iv
Liste des figures.....................................................................................................................vi
Liste des tableaux.................................................................................................................vii
Introduction générale……………………………………………………………….1
Chapitre 1 : Synthèse bibliographique……………………………………………...5
vii
2.2.3. Polymorphisme moléculaire.................................................................................................. 26
3. Importance économique de la culture du palmier dattier..................................................32
1. Introduction.............................................................................................................................. 35
2. Matériel et méthodes............................................................................................................... 37
2.1. Prospection et choix des cultivars......................................................................................... 37
2.2. Echantillonnage....................................................................................................................... 39
2.3. Descripteurs utilisés................................................................................................................ 39
2.3.1. Descripteurs végétatifs........................................................................................................... 39
2.3.2. Descripteurs reproducteurs.................................................................................................... 40
2.4. Traitement statistique des données........................................................................................ 44
3. Résultats................................................................................................................................... 44
3.1. Analyse de la variance et comparaison des moyennes......................................................44
3.1.1. Caractères végétatifs............................................................................................................... 44
3.1.2. Caractères reproducteurs........................................................................................................ 45
3.2. Matrice de corrélation............................................................................................................. 45
3.2.1. Caractères végétatifs............................................................................................................... 45
3.2.2. Caractères reproducteurs........................................................................................................ 46
3.3. Analyse en composantes principales (ACP)........................................................................ 53
3.3.1. Caractères végétatifs............................................................................................................... 53
3.3.2. Caractères reproducteurs........................................................................................................ 56
3.4. Classification ascendante hiérarchique (CAH).................................................................... 58
3.4.1. Caractères végétatifs............................................................................................................... 58
3.4.2. Caractères reproducteurs........................................................................................................ 59
4. Discussion................................................................................................................................ 61
5. Conclusion............................................................................................................................... 64
1. Introduction.............................................................................................................................. 67
ix
2. Matériel et méthodes.............................................................................................................. 69
2.1. Choix des cultivars................................................................................................................. 69
2.2. Méthode d’échantillonnage.................................................................................................... 71
2.3. Paramètres étudiés et modes opératoires.............................................................................. 73
2.3.1. PH.............................................................................................................................................. 73
2.3.2. Détermination de l’acidité titrable......................................................................................... 73
2.3.3. Teneur en eau…....................................................................................................................... 74
2.3.4. Teneur en sucres.......................................................................................................................74
2.4.4.1.Dosage des sucres totaux........................................................................................................ 74
2.4.4.2.Détermination de la teneur en sucres réducteurs.................................................................. 75
2.4.4.3.Détermination de la teneur en saccharose............................................................................ 76
2.4.5. Indice de qualité....................................................................................................................... 76
2.4.6. Détermination de la teneur en cendres totales...................................................................... 76
2.4.7. Détermination du Taux des Solides Solubles (Girard, 1965).............................................77
2.4.8. Dosage des éléments minéraux (Mvondo et al. 1992) ........................................................77
2.5. Traitement statistique des données........................................................................................ 78
3. Résultats................................................................................................................................... 79
3.1. Analyse descriptive : moyennes et écart types..................................................................... 79
3.1.1. PH et acidité titrable................................................................................................................ 79
3.1.2. Teneur en eau........................................................................................................................... 79
3.1.3. Sucres........................................................................................................................................ 80
3.1.4. Indice de qualité....................................................................................................................... 81
3.1.5. Cendres totales et taux des solides solubles TSS................................................................. 83
3.1.6. Eléments minéraux.................................................................................................................. 83
3.1.6.1. Phosphore................................................................................................................................ 83
3.1.6.2. Sodium..................................................................................................................................... 83
3.1.6.3. Cuivre...................................................................................................................................... 85
3.1.6.4. Zinc.......................................................................................................................................... 85
3.2. Corrélations..............................................................................................................................87
3.3. Analyse en composantes principales (ACP)........................................................................ 88
3.4. Classification ascendante hiérarchique (CAH).................................................................... 91
4. Discussion................................................................................................................................ 94
5. Conclusion............................................................................................................................ 101
x
Chapitre 4: Etude de la diversité moléculaire des principaux cultivars des
Ziban par l’emploi de marqueurs SSRs……………………………………………105
1. Introduction........................................................................................................................... 106
2. Matériel et méthodes............................................................................................................. 107
2.1. Matériel végétal..................................................................................................................... 107
2.2. Extraction d'ADN et caractérisation moléculaire.............................................................. 108
2.3. Analyse des données............................................................................................................. 111
3. Résultats................................................................................................................................. 114
3.1. Diversité génétique et polymorphisme des marqueurs SSR.............................................114
3.2. Profils d'identification des cultivars.................................................................................... 119
3.3. Relations génétiques entre les cultivars étudiés................................................................. 122
3.4. Structure génétique des cultivars de palmiers dattiers......................................................124
4. Discussion.............................................................................................................................. 127
5. Conclusion............................................................................................................................. 132
Conclusion générale……………………………………………………………………...135
Références bibliographiques.............................................................................................141
Annexes................................................................................................................................ 159
Résumé .................................................................................................................................168
Abstract
xi
Introduction générale
INTRODUCTION GENERALE
Le palmier dattier (Phoenix dactylifera L.) est l’une des espèces fruitières les plus anciennement
cultivée par l’homme. Domestiqué depuis 3000 ans av. J.-C. en Mésopotamie (Nixon, 1959),
l'agriculture du palmier dattier s’est répandue, dans un premier temps, dans les zones arides et
semi-aride du Moyen-Orient et Afrique du Nord. Par la suite, et grâce à l'échange de matériel
génétique, elle s'est étendue à l'Australie, à l'Afrique australe, à l'Amérique du Sud, au Mexique
et aux États-Unis d'Amérique.
Depuis l'Antiquité, cette plante majestueuse est reconnue comme « l’arbre de la vie »,
aujourd’hui encore, elle demeure une composante fondatrice de l’agrosystème oasien qui a
permis de maintenir la vie dans le désert pendant des siècles grâces aux nombreuses et variables
utilisations dont ses parties font l’objet. Il s’agit incontestablement d’une espèce qui continue
de jouer un rôle économique, social et environnemental patent. Effectivement, le palmier dattier
sert comme matière première pour la fabrication de logements, de meubles et la confection
d’outils et ustensiles, en plus il fournit des fruits délicieux à consommer frais, séchés ou
transformés d’une valeur nutritive et énergétique très importante et dont les vertus médicinales
sont confirmées. Sur le plan économique, le palmier dattier constitue une source de revenus
majeure pour les phoeniculteurs et les industries associées dans les communautés où il est
cultivé.
Actuellement l’Algérie est comptée parmi les plus importants pays producteurs de dattes dans
le monde et occupe la troisième place avec 1029596 Tonnes (FAOstat ,2016). Depuis quelques
décennies la culture du dattier est passée de la culture traditionnelle dans des agrosystèmes
riches et diversifiés à des monocultures. Une tendance croissante à la plantation du cultivars
d'élite « Deglet Nour » est observée lors de l’installation de nouvelles palmeraies ou le
renouvellement des anciennes ce qui a donné lieu à la création de palmeraie dites « modernes »
caractérisées essentiellement par la monoculture monovariétale dont le composant presque
unique est le cultivar « Deglet Nour ». En parallèle, accroissent une érosion génétique alarmante
et un rétrécissement aigu du pool de gènes qui représentent le fruit d’un long processus
d’adaptation et de survie aux différents évènements environnementaux et anthropiques dans la
longue histoire du dattier.
En termes de production, Biskra est la première wilaya phoenicicole en Algérie, elle produit
plus de 41 % des dattes algériennes et ses palmeraies couvrent plus de 85% de la superficie
totale dédiée à l'arboriculture fruitière dans la wilaya (DSA Biskra, 2016). La région potentielle
1
de culture du dattier est représentée par les palmeraies des Ziban qui peuvent être considérées
comme un cas bien représentatif incarnant l’érosion génétique des ressources phytogénétiques
du palmier dattier.
Les résultats reportés par une étude réalisée par Belguedj (2002) décrivent environ 90% des
cultivars recensés comme rares à peu fréquents renseignant ainsi sur un appauvrissement
irréversible de l'agrobiodiversité du palmier dattier associé à une perte préjudiciable des savoirs
et savoir-faire liés à sa culture. Un autre souci est également à soulever celui de la nomenclature
de quelques cultivars exprimé à travers des cas de synonymie et d’homonymie et dont les
caractéristiques sont fortement influencées par l’environnement en particulier quand il s’agit de
cultivars introduits provenant d’autres oasis Algériennes.
Devant ce déclin de la biodiversité du palmier dattier et l’ambiguïté des appellations, la
conservation et la gestion des ressources génétiques du palmier dattier devient une question
cruciale pour la stabilité des écosystèmes oasiens en zones arides et semi-aride et pour
l’élargissement de la base génétique sur laquelle se dressent les programmes d’amélioration.
L’utilisation rationnelle et durable des ressources génétiques du palmier dattier nécessite une
caractérisation, évaluation et documentation du matériel génétique disponible au niveau local
ou régional (Gotor et al., 2008). A cet égard, localiser et décrire la diversité existante, identifier
les matériaux à conserver, et le développement de méthodes de conservation constituent le
fondement de la conservation et utilisation des ressources génétiques du palmier dattier
(Elshibli et Korpelainen, 2011).
L’estimation de la richesse variétale chez le palmier dattier dans le monde est approximative,
elle se situe entre 3000 (Johnson, 2011) et 5000 (Jaradat et Zaid, 2004) cultivars.
Les oasis Algériennes sont comptées parmi les plus riches au monde du point de vue diversité
génétique avec environ un millier de cultivars (Hannachi et al., 1998 ;Benkhalifa, 1999) qui
ont su doctement s’adapter aux variations pédoclimatiques du grand Sahara Algérien.
Dans l’objectif de fournir des connaissances fondamentales pour la conservation des ressources
phytogénétiques du dattier en Algérie, plusieurs études ont caractérisé et évalué le matériel
génétique existant par l’emploi de marqueurs morphologiques (Belgguedj, 2002 ; Simozrag,
2016, Bedjaoui et Benbouza, 2018), biochimiques (Bennaceur et al., 1992, Acourene et al.,
2014) et moléculaires (Moussouni et al., 2017 ; Guettouchi et al., 2017).
C’est dans cette même optique que ce travail a été mené, il s’agit en l’occurrence d’enrichir la
base de donnée nationale en matière d’informations sur les ressources phytogénétiques du
dattier à travers une caractérisation la plus complète possible des cultivars les plus fréquents
des Ziban moyennant les trois types de marqueurs : morphologiques, chimiques du fruit et
2
moléculaires de type ADN. Ce qui permettra une identification sans ambigüité des cultivars
dont les caractéristiques seront déterminées de manière fiables afin de mettre au services des
sélectionneurs les informations nécessaires pour la valorisation du patrimoine génétique du
dattier. La valorisation constituant une étape indispensable pour la conservation de sa
biodiversité notamment in situ. Egalement, ces informations seront d’une grande utilité dans
l’implémentation de stratégies de sélection en vue d’améliorer, d’une part, la production dattière
en termes de qualité et de quantité, et d’apporter, d’autre part, des solutions aux nombreux
problèmes notamment les stress biotiques et abiotiques que la culture du dattier affronte.
L’étude statistique à laquelle nous allons procéder permettra l’appréciation de l’ampleur de la
diversité génétique existante dans les palmeraies des Ziban tout en dégageant les caractères les
plus discriminants pouvant servir de marqueurs pour la distinction entre les cultivars. Il était
intéressant d’utiliser le même matériel génétique à toutes les techniques de caractérisation que
nous avons appliquées afin de parfaire leur description et dégager d’éventuelles lectures sur la
nature des liaisons entre ces types de marqueurs.
C’est dans la perspective de contribuer à l’amélioration et à la gestion des ressources
phytogénétiques du palmier dattier que notre étude s’inscrit. Notre objectif principal est de
caractériser le plus amplement possible les cultivars de la région des Ziban et ce à travers l’étude
de la diversité:
- morphologique des appareils végétatif et reproducteur afin de connaitre laquelle de ces
deux parties permet une meilleure distinction entre les cultivars, si elles évoluent de la
même manière et lesquels des caractères sont les plus discriminants tout en faisant appel
aux savoirs détenus par la population locale en matière de reconnaissance des cultivars;
- chimique des dattes pour mettre en exergue les composants les plus dominants et
explorer la variation inter et intra cultivar. Egalement, ce chapitre vise à dégager les
corrélations qui lient les différents composants en vue de définir les caractéristiques de
chaque classe de dattes et d’évaluer leur qualité ;
- moléculaire pour le génotypage et l’identification précise des cultivars et la construction
de base de donnée moléculaire tout en explorant les relations inter et intra-cultivars et
l’identification du nombre minimal de marqueurs de SSRs capables de distinguer les
cultivars objet d’étude.
3
pour la caractérisation de l’espèce Phoenix dactylifera. Une synthèse approfondie des
travaux déjà réalisés, à l’échelle internationale et nationale, sur la caractérisation
morphologique, chimique de la datte, et moléculaire des cultivars du palmier dattier.
Vers la fin de ce chapitre, l’importance économique du dattier est présentée brièvement.
- le deuxième chapitre concernera l’étude de la diversité morphologique. Les descripteurs
des parties végétatives et reproductrices seront abordées indépendamment et dont les
résultats sont comparés;
- le troisième chapitre porte sur la diversité chimique des dattes où les composants les
plus importants de la datte sont analysés et utilisés pour la classification des dattes;
- le quatrième chapitre concernera la diversité génétique moléculaire. Il s’appuie sur
l’utilisation de marqueurs de types SSRs et l’analyse génétique des cultivars et de leurs
relations.
Chacun des trois derniers chapitres commencera avec une introduction, des détails seront
donnés sur l’échantillonnage et les méthodes d’analyses, et finit par être discuté et conclu.
Une conclusion générale et des perspectives de travail clôturent ce manuscrit tout en ouvrant
de nouvelles perspectives de recherches en continuité à ce travail.
4
Chapitre 1 : Synthèse bibliographique
Chapitre 1 : Synthèse bibliographique
1.1. Généralités
Le palmier dattier (Phoenix dactylifera L.) est l’une des plus importantes cultures fruitières des
régions arides et désertiques du Moyen-Orient, du sud d'Asie et de l'Afrique du Nord où les
conditions agro-écologiques sont favorables à son développement. Au cours des trois derniers
siècles, les dattes ont également été introduites dans de nouvelles zones de production en
Australie, en Inde, en Pakistan, au Mexique, en Afrique australe, en Amérique du Sud et aux
États-Unis (Tchao et Krueger, 2007). Le dattier est cultivé depuis au moins 5000 ans (Zohary
et Hopf, 2000), ses fruits sont la principale source de revenus et l'aliment de base des
populations locales et jouent un rôle important dans l'économie, la société et l'environnement
de ces pays producteurs de dattes.
Le palmier dattier (Phoenix dactylifera L. ; 2n=36), est une monocotylédonne pérenne dioïque
qui se propage végétativement par rejets produits par la plante mère. La propagation par noyaux
est utilisée dans les projets d’amélioration et l’ornement vu que la pollinisation croisée,
naturelle ou effectuée par l’homme, donne de nouveaux génotypes avec des caractéristiques
non connues (Al-Khayri 2005; Rhouma et al. 2010 and El-Hadrami et al. 2011). Par ailleurs,
environ 50% des pieds francs sont des mâles ne pouvant être identifiés par l’agriculteurs à l’œil
nu avant la floraison vers l’âge de 4 à 5 ans (Chao et Krueger, 2007) sauf par l’emploi de
marqueurs de l’ADN spécifiques du sexe chez le dattier (Cherif et al., 2013). Nonobstant
l’hétérogénéité des issus de semis et la probabilité d’obtention de pieds mâle, et en vue de faire
face à l’érosion génétique ascendante, ces génotypes francs représentent des ressources
génétiques potentielles qui devraient être évaluées pour déterminer les caractères d’intérêt
agronomiques qui méritent d’être étudiés (johnson, 2013) en particulier par l’utilisation de la
biotechnologie moderne qui répond, en particulier aux besoins de la multiplication rapide d’un
grand nombre de cultivars sélectionnés à travers la production des vitroplants (Bouguedoura
et al., 2015).
6
Chapitre 1 : Synthèse bibliographique
1.2. Taxonomie
Le palmier dattier est une plante Angiosperme, Monocotylédone, classé (Asmussen et al.,
2006; Dransfield et al., 2008) dans :
Ordre : Arecales
Famille : Arecaceae
Sous-famille : Coryphoïdeae
Tribu : Phœniceae
Genre : Phœnix
Espèce : dactylifera L.
Le palmier dattier, plante pérenne, dont les caractéristiques morphologiques varient en fonction
du milieu, de l'âge et des conditions culturales (Dawson et Aten, 1963; Bouguedoura, 1991).
Stipe: le palmier dattier est une plante Monocotylédones, dont la tige monopodiale, couverte
des bases des feuilles, porte le nom de stipe. Sa forme est généralement cylindrique ou parfois
conique, recouvert par les bases de palmes anciennes, doté d'un seul bourgeon terminal
(phyllophore) qui assure sa longueur. L’élongation annuelle du tronc est d’environ 20 à 30 cm
(Bouguedoura, 1979).
Palmes : sont des feuilles composées, pennées issues du bourgeon terminal et d’une durée de
vie allant jusqu’à 7 ans. Leur structure change suivant la variété, l’âge et les conditions
7
Chapitre 1 : Synthèse bibliographique
Chez le palmier dattier, trois sortes de feuilles sont produites au cours de sa vie, si le sujet est
issu d’une graine, il produit des feuilles juvéniles, des feuilles semi – juvéniles et des feuilles
adultes ou palmes. Chez les sujets issus de rejets, on ne rencontre que les palmes
(Bouguedoura, 1982).
La disposition des folioles et des épines sur le rachis ainsi que les angles qu'elles forment entre
elle et avec le rachis, constituent des index taxonomiques permettant de différencier les clones
(Munier, 1973).
Inflorescences : Le palmier dattier est une espèce dioïque, chaque individu ne porte que des
inflorescences de même sexe. L’inflorescence se développe dans la région coronaire du stipe,
à partir de bourgeons axillaires situés à l’aisselle des palmes. Elle est munie à sa base d’une
grande bractée, la spathe qui, dans un premier temps, enveloppe les axes inflorescentiels et les
protège de la chaleur et du soleil jusqu'à ce qu'elles soient mûres et prêtes à remplir leur
fonction. Les fleurs sont unisexuées, pratiquement sessiles, leurs pédoncules sont très courts.
Les fleurs mâles donnant du pollen et les fleurs femelles produisant les fruits après fécondation,
sont portées par des palmiers différents (Munier, 1973). Les spathes mâles sont plus courtes et
plus larges que les femelles. Chaque épillet porte un grand nombre de minuscules fleurs pouvant
aller de 8 000 à 10 000 chez les femelles et davantage chez les inflorescences mâles (Chandler,
1958).
Le palmier dattier a une floraison qui se déclenche une seule fois par an. Les sujets issus de
rejets commencent à fleurir dès l'âge de deux à trois ans, ceux issus de graines (noyaux)
fleurissent tardivement.
8
Chapitre 1 : Synthèse bibliographique
La pulpe des dattes se compose principalement d'eau, de sucres réducteurs (glucose et fructose)
et non réducteurs (saccharose) et de autres composés (protéines, lipides, éléments minéraux,
vitamines et enzymes (Estanove, 1990; Barreveld, 1993).
1.4.1. Eau : c’est le deuxième important composant après les sucres, elle détermine la texture
du fruit raison pour laquelle beaucoup de chercheurs ont classé les dattes mûres selon leur
consistance en trois catégories : dattes molles, dattes demi molles et dattes sèches. La teneur en
eau varie avec le degré de maturité et dépend du caractère variétale (Booij et al, 1992; El Arem
et al., 2011).
1.4.2. Sucres : les dattes représentent une très bonne source d'énergie, en particulier en raison
de leur teneur élevée en sucres qui avoisine les 70% fournissant ainsi une valeur énergétique
moyenne de 314 kcal / 100 g. Ces sucres constitués principalement par des sucres invertis ou
réducteurs (glucose et fructose) et non invertis (saccharose) (Al-Farsi et Lee, 2008) sont
présents, dans les dattes, avec des concentrations qui ne sont ni constantes ni uniformes (Ahmed
et al., 1995).
Les sucres réducteurs sont les constituants les plus importants de point de vue nutritionnel
puisqu’ils constituent une source d’énergie disponible et directement assimilable par
l’organisme (Cook et al.,1979). Les dattes molles à humidité importante contiennent des
teneurs très minimes à nulles de saccharose à l'inverse des dattes sèches et demi sèches qui se
caractérisent par une teneur en saccharose importante (Hasnaoui, 2013). Le saccharose
confère aux dattes un gout agréable puisqu’il est de 34% plus sucré que le glucose (Ashmawi
et al., 1956). C’est parmi les raison qui ont fait de Deglet Nour une de datte élite à l’échelle
mondiale bien qu’elle soit de consistance demi-molle. Les teneurs relatives en saccharose,
glucose et fructose dépendent principalement des caractéristiques variétales et sont en relation
9
Chapitre 1 : Synthèse bibliographique
étroite avec la texture du fruit et son stade de développement (Dowson et Aten, 1963 ;
Barreveld ,1993).
1.4.3. Minéraux : les dattes représentent une importante source en éléments minéraux dont
les teneurs très significatives du point de vue nutritionnel, sont fortement influencées par
l'origine géographique et varient en fonction des cultivars et le stade de développement de la
datte (Hasnaoui, 2013). Les pulpes des dattes sont riches en fer, calcium, cobalt, cuivre, fluor,
magnésium, manganèse, potassium, phosphore, sodium, cuivre, soufre, bore, sélénium et zinc
(Al-Farsi et Lee, 2008; Ali Mohamed et Khamis, 2004). La consommation de cent grammes
de dattes peut fournir plus de 15% de l’apport journalier en sélénium, cuivre, potassium et le
magnésium (Al-Farsi et Lee, 2008). Les dattes sont parmi les fruits les plus riches en potassium
dont la concentration peut atteindre 0,9% dans la pulpe et 0,5% dans les noyaux. D’autres
minéraux et sels sont également présents dans diverses proportions incluant le bore, le calcium,
le cobalt, le cuivre, le fluor, le fer, le magnésium, le manganèse, le phosphore, le sodium et le
zinc. De plus, les graines contiennent également de l'aluminium, du cadmium, chlorure, plomb
et soufre dans diverses proportions (Baliga, 2011).
1.4.4. Autres composants : les dattes sont également composées de matière grasse (lipides)
dont la quantité est plus importante au niveau du noyau que de la pulpe (0.2 – 0.5 % selon les
cultivars) (Al Hooti et al, 1998) et de matière azotée (protéines) qui, comme les lipides, se
trouvent en faibles quantités dans la chair dattière (1 à 5%) (Ahmed et al, 1995; Al-Farsi et
Lee, 2008). Par contre, la teneur en fibre est plus importante allant de 3.57 à 10.9 %, elle est
très variable selon les cultivars, les stades de maturité et les méthodes d'extraction et de dosage
(Al-Shahib et Marshall, 2003). Une partie des fibres alimentaires est qualifiée de soluble et
d’autres d’insoluble, cette dernière représentant la plus grande fraction (Al-Farsi et Lee, 2008).
Les acides organiques sont également présents dans la chair en quantités non négligeables au
cours de la maturité des dattes et seraient une composante de la flaveur des dattes, bien que
leurs teneurs diminuent au dernier stade de maturité (Barreveld, 1993)
La présence d’enzymes est primordiale dans les processus de conversion durant la formation et
la maturation des dattes; leurs activités sont particulièrement intéressantes pour la qualité finale
du produit. La connaissance des activités et des fonctions des enzymes est d'une importance
pratique pour le conditionnement et la transformation des dattes (Barreveld, 1993).
L’invertase, par exemple, qui est présente chez les dattes et beaucoup de fruits (Weber, 1974)
invertie le saccharose en glucose et fructose, ce qui influence la texture et la consistance des
dattes.
10
Chapitre 1 : Synthèse bibliographique
Les vitamines, de par leur rôle essentiel dans la nutrition humaine, assurent des fonctions
spécifiques et vitales au maintien de la santé et ce malgré que les besoins quotidiens sont faibles.
La pulpe de dattes contient des vitamines en quantités variables avec les types de dattes, leurs
provenances et leurs stades de développement (Hasnoui, 2013). Les composés aromatiques
sont des composés volatiles responsables de l'arôme spécifique des dattes. De même que les
composés phytochimiques qui contribuent aux propriétés nutritionnelles et organoleptiques des
dattes, ils influent sur la flaveur qui est l'un des plus importants critères de la qualité des dattes.
Le ratio et les concentrations de ces constituants dépendent du cultivar, des type et stade de
récolte des fruits ainsi que la situation géographique et les conditions édapho- climatiques du
palmier dattier (Al-Farsi et al., 2005b; Ahmed et al., 1995; Hulme, 1970).
L'importance des variations génétiques a depuis longtemps été reconnue comme un moyen qui
facilite la sélection des plantes et / ou des stratégies de conservation (Sehgal et Raina 2008).
Le développement d’outils moléculaires a modifié à la fois la manière dont les variétés peuvent
être identifiées et les informations utiles, sur le contrôle génétique de nombreuses
caractéristiques agronomiques, peuvent être analysées. La capacité à appliquer ces outils
moléculaires dépend dans une certaine mesure de la quantité et la disponibilité d’autres
informations d’ordre génomique concernant une espèce spécifique. La technologie des
marqueurs moléculaires remonte à l’utilisation de isoenzymes suivies d'une série de
11
Chapitre 1 : Synthèse bibliographique
technologies de marqueurs d'ADN et plus récemment par possibilités de comparer des génomes
complets (Cullis, 2011).
Une panoplie de méthodes a été développée et largement appliquée pour détecter la variabilité
au niveau de l'ADN. Les marqueurs moléculaires sont des séquences codantes ou non qui
présentent un polymorphisme et ils ne sont pas influencés par l’environnement. Ce sont de bons
indicateurs de distances génétiques entre les accessions, car les marqueurs couramment utilisés
sont neutre face à la sélection. Cependant, chacun de ces marqueurs présente des propriétés
différentes (Tab. 1). Les propriétés, par exemple, en ce qui concerne le type de données générées
sont de deux types: marqueurs codominants et dominants, où les informations qui peuvent être
fournies par eux et les outils numériques utilisés dans l’analyse des données sont différents. Les
SSR sont des marqueurs codominants, ce qui signifie qu’il est possible d’identifier les deux
allèles présents à un locus particulier d'un organisme diploïde et que hétérozygotes peuvent être
distingués des homozygotes, ce qui permet d’estimer le fréquences d'allèles et niveaux de
consanguinité dans les études génétiques de population. Les données de marqueur peuvent être
considérées comme des fréquences alléliques ou comme des données discrètes sous une forme
binaire, c'est-à-dire la présence ou l’absence d’un fragment d’ADN d’une longueur spécifique,
pour générer des matrices génétiques de distance et effectuer d'autres analyses. Les marqueurs
RAPD, ISSR et AFLP ségréguent en tant que marqueurs dominants et doit toujours être traités
comme des caractères binaires (données de présence / absence). Ces données sont généralement
converties en matrices de similarité pour le calcul des distances génétiques (Escudero et al.,
2003).
12
Chapitre 1 : Synthèse bibliographique
leur taille sur gel d'agarose, dénaturés et transférés par capillarité sur une membrane de nylon.
La position relative des fragments d'ADN est conservée durant le transfert. La dernière étape
consiste en l'hybridation moléculaire avec une sonde d'ADN marquée préalablement. La sonde
employée permet de détecter une région du génome où la digestion donne des fragments de
restriction identiques pour les deux individus. Les deux profils révélés après électrophorèse ne
permettent donc pas de les distinguer. Avec le couple enzyme/sonde, aucun polymorphisme
n'est mis en évidence entre ces deux individus. En revanche, pour l'enzyme, un individu
présente une mutation au niveau d'un site de restriction, entraînant la perte de ce site. Ainsi,
dans un second cas de figure, la digestion avec cette enzyme et l'emploi de la même sonde met
en évidence un fragment plus petit chez un individu que chez l'autre. Dans ce cas, le couple
enzyme/sonde permet ainsi de mettre à jour le polymorphisme existant au niveau des sites de
restriction dans cette région du génome.
Cette technique développée par Williams et al., (1990) repose sur l'amplification par PCR de
fragments de l'ADN génomique en utilisant des amorces arbitraires de taille courte (10 pb). Une
amorce RAPD permet généralement l'amplification d'une dizaine de fragments. Les fragments
produits par cette amplification sont séparés par électrophorèse sur un gel d'agarose. Pour deux
individus, si deux sites d'hybridation sont proches et sur deux brins complémentaires d'ADN, il
y aura amplification. En revanche, si ces deux sites sont trop éloignés, il ne peut y avoir
amplification. Le polymorphisme décelé est dû à des mutations soit dans les régions amplifiées
soit au niveau des sites de fixation des amorces. Le polymorphisme révélé est un
polymorphisme de sites d'hybridation d'amorce traduit par la présence ou l'absence de la bande.
Développée par Vos et al., (1995), cette technique fait appel à la fois aux enzymes de restriction
et à l'amplification par PCR. Après la digestion de l'ADN génomique par deux enzymes de
restriction, des adaptateurs de séquence connue et spécifiques des deux sites de restriction sont
ajoutés aux extrémités des fragments de restriction. Une fois que les fragments de restriction
sont ainsi bordés de séquences connues, il devient possible de les amplifier par PCR. Grâce à
l'emploi d'amorces sélectives qui ne peuvent amplifier qu'une petite portion des milliers de
fragments de restriction obtenus, seule une centaine de fragments est amplifiée. Ces fragments
sont séparés par électrophorèse sur gel de polyacrylamide dénaturant. Le polymorphisme révélé
13
Chapitre 1 : Synthèse bibliographique
(de type présence ou absence de bandes) est provoqué par des changements dans les sites de
restriction ou les régions bordantes.
Les minisatellites hypervariables (Jeffreys et al., 1985) sont des marqueurs moléculaires
polymorphes découverts au niveau du génome. Ces marqueurs sont constitués des répétitions
en chaîne d’un motif formé de 15 à 70 nucléotides. Les minisatellites appartiennent à la classe
des VNTR (Variable Number Tandem Repeat), et présentent un polymorphisme de taille dû à
la variation d’unités de répétition qui les constituent.
Ce sont de petites portions d’ADN, constituées d’un motif variant d’un à six nucléotides, répété
plusieurs fois en tandem telles que (CT)n, (AAT) n, (GT)n. Les termes microsatellite et SSR
sont souvent utilisés de manière interchangeable, bien que les microsatellites soient
généralement plus long que l’unité de 2 à 3 pb (Cullis, 2011). Ces régions sont particulièrement
intéressantes car elles évoluent plus rapidement que d’autres portions du génome (10 -2 à 10-6
mutation par locus par génération) (Li et al., 2002 ; Selkoe et Toonen, 2006). Les SSRs
présentent un taux de polymorphisme extrêmement élevé qui repose sur la variation du nombre
d'unités de répétition (n) constituant le microsatellite. On décrit généralement un microsatellite
sous la forme (X)n, avec X le motif, et n le nombre de répétitions. Les microsatellites sont des
marqueurs codominants, extrêmement polymorphes, faciles à manipuler. Ils requièrent très peu
d'ADN (quelques nanogrammes) et sont bien répartis dans le génome. Ces marqueurs sont très
reproductibles et moins lourds d'utilisation que les RFLP ou AFLP avec une bonne résolution
analytique. Les SSR sont utiles pour l'identification des cultivars, l'analyse des arbres
généalogiques, la caractérisation de la diversité du matériel génétique et les études de
cartographie génétique (Billotte et al., 1999)
Une modification des marqueurs SSR est la répétition inter-simple séquence (ISSR)
polymorphismes. Les marqueurs ISSR est un terme général désignant une région du génome
entre des loci microsatellites (Cullis, 2011).
14
Chapitre 1 : Synthèse bibliographique
Les SNP sont des marqueurs moléculaires constituant la forme la plus abondante de variations
génétiques dans les génomes. C’est un type de polymorphisme de l’ADN dans lequel deux
chromosomes diffèrent sur un segment donné par une seule paire de bases. L’inconvénient des
SNP est leur faible degré de polymorphisme par rapport aux microsatellites, ce qui implique de
tester plus de SNP que de microsatellites pour avoir la même information.
Qualité requise de
Elevé Faible Faible Moyen Faible
l’DNA
Coût de développement Elevé Faible Moyen Moyen Moyen
15
Chapitre 1 : Synthèse bibliographique
La diversité génétique chez le palmier dattier n'est pas distribuée de manière aléatoire ou
uniforme dans l'espace ou dans le temps. L’ampleur de la diversité génétique diffère entre les
oasis et les populations ou entre les régions et les localités, et plusieurs facteurs clés historiques,
géographiques, écologiques et anthropiques déterminent sa distribution spatio-temporelle.
L'impact de ces facteurs et de leur interaction se reflète sur le niveau de différenciation de la
population et en particulier sur les caractères qualitatifs du fruit (Alkhalifah et al., 2012;
Battesti, 2013).
L’utilisation rationnelle et durable des ressources génétiques du palmier dattier nécessite une
caractérisation, évaluation et documentation du matériel génétique disponible au niveau local
et/ou régional. La caractérisation est définie comme une estimation de la présence, l’absence
ou le degré de traits spécifiques dont l’expression est peu influencée par les conditions
environnementales variables, alors que l’évaluation est l’estimation des génotypes à différents
niveaux d’organisation pour les traits génétiques potentiellement utiles, dont beaucoup peut
varier en fonction des changements dans le micro ou le macro-environnement (IPGRI, 2005 ;
Gotor et al., 2008;).
Le pool génétique du dattier compte environ 5000 cultivars plus ou moins caractérisés selon les
pays. Leurs appellations sont strictement locales et proviennent le plus souvent du lieu de
plantation, la couleur ou la forme du fruit (Ould Mohamed Ahmed et al., 2011).
Ces cultivars ont été développés par une sélection continue de la part des producteurs de
palmiers dattiers du monde entier, principalement pour améliorer le rendement et la qualité des
dattes, au même temps la sélection naturelle, où des génotypes qui tolèrent différents types
d’environnement, est également en cours. En général, la sélection, le clonage et la distribution
des cultivars sont principalement des activités de phoeniciculteurs (Elshibli et Korpelainen,
2011). Pourtant, les spécialistes du palmier dattier ont tenté d’énumérer et décrire
botaniquement ces cultivars dans leurs pays (Zaid et de Wet, 2002). Il existe jusqu'à 5 000
cultivars de dattiers dans le monde entier (Jaradat et Zaid, 2004). D'après les descriptions
botaniques, il y a environ 400 cultivars en Iran, 370 en Irak, 250 en Tunisie, 244 au Maroc
(Zaid et de Wet, 2002), 300 en Mauritanie (Munier, 1955) et 400 au Soudan (Osman, 1984),
ainsi que de nombreux cultivars supplémentaires dans les autres grands pays producteurs de
palmiers dattiers. En Algérie, il existe environ un millier de cultivars, les premiers travaux ont
avancé 800 cultivars (Benkhalifa, 1996), un nombre qui s’est élevé à 940 après l’élaboration
du premier catalogue des cultivars en Algérie (Hannachi et al., 1998).
16
Chapitre 1 : Synthèse bibliographique
La diversité génétique est exprimée par les différences génétiques entre les espèces, les sous-
espèces, les cultivars, les populations ou les clones individuels et peut être mesurée aux niveaux
morphologique, physiologique, biochimique ou moléculaire. L’ensemble des descripteurs du
palmier dattier constitue la base d’un système standard de caractérisation qui fournit un format
convenu internationalement et un « langage » universel des bases de données des ressources
génétiques du palmier dattier (IPGRI, 2005; Gotor et al., 2008). Une liste de descripteurs
inclut la gestion, l’environnement, la caractérisation et les descripteurs d’évaluation de l’arbre
et de ses différentes parties.
La valeur des ressources phytogénétiques conservées dépend des informations utilisées pour
promouvoir leur utilisation. L’élaboration de descripteurs standardisés et normalisés a
commencé en 1976, lorsqu'il est devenu évident qu'un système universel était essentiel pour les
efforts mondiaux en matière de conservation des ressources phytogénétiques et pour le
fonctionnement effectif des réseaux de banques de gènes. Le concept de « liste de descripteurs »
(en anglais descriptors lists) « DL » de culture a évolué avec le temps en réponse à l’évolution
des besoins des utilisateurs. Au départ, les DL fournissaient un ensemble minimal de
caractéristiques pour décrire des cultures particulières. L'idée de listes minimales a été revisité
en 1990 pour produire des listes comprenant tous les descripteurs de caractérisation et
d’évaluation. Une deuxième révision a eu lieu 1994 pour fournir des listes complètes contenant
un ensemble minimal de descripteurs très discriminants. Depuis 1995, de nouvelles sections
normalisées sur la conservation in vitro, la cryoconservation, le sol et l’environnement qui
étaient communs à différentes cultures et fourni aux utilisateurs différentes options, ont été
intégrées. En 1999, les informations ethnobotaniques ont également été incluses (Fig. 1) (Gotor
et al., 2008).
17
Chapitre 1 : Synthèse bibliographique
18
Chapitre 1 : Synthèse bibliographique
La discrimination ou la distinction entre les cultivars se fait de manière intuitive de la part des
phoeniciculteurs ou de la population locale. Ces derniers se basant sur des caractères végétatifs
ou reproducteurs de nature quantitative ou qualitative.
De nombreuses études ont traité de la diversité phénotypique des cultivars du dattier pour
l’identification ou la différenciation entre cultivars. L’objectif final étant l’association de
cultivars aux traits d’intérêt agronomique à la recherche d’indice en perspective de sélection.
19
Chapitre 1 : Synthèse bibliographique
Parmi les premiers travaux qui ont traité de la description morphologique du dattier ceux
effectués par Mason (1915) qui visait à systématiser l’ensemble des caractères permettant la
description des cultivars du palmier dattier introduits aux USA. Ces caractères étant perçus
intuitivement par les phoeniciculteurs dans les oasis. Cet auteur avait exprimé le besoin de
méthodes permettant la description et la distinction entre les différents cultivars importés en
Amérique (USA) en dehors de la période de fructification et indépendamment des
caractéristiques des fruits. Ceci dans l’objectif de, non seulement l’identification et
comparaison des cultivars qu’ils soient importés où originaires de la région mais aussi l’étude
des issus de semis provenant des hybridations entres cultivars.
Une étude sur 26 cultivars marocains a été conduite en utilisant des descripteurs de la parties
végétative (palmes, pennes, épines) dont les plus discriminants seront utilisés pour
l’identification des cultivars en dehors de la période de fructification. Les résultats ont révélé
une grande diversité génétique et une forte ressemblance entre quelques cultivars notamment
ceux sélectionnés pour leur résistance au bayoud (Elhoumaizi et al., 2002). D’autre part, six
traits qualitatifs ont fait l’objet d’une étude menée par évaluant 203 cultivars provenant de 20
régions écogéographiques dans six pays de la péninsule arabe. La caractérisation a concerné
des descripteurs de fruit permettant aussi bien l’appréciation de sa qualité que sa valeur
économique (Jaradat et Zaid, 2004). Une importante diversité a été observée à l’intérieur d’un
même pays et entre les pays et de grandes différences ont été notées dans les préférences des
consommateurs de dattes. Les différences de caractères morphologiques d'un cultivar sont
toujours accompagnées par des différences prononcées dans les caractères des fruits et le long
processus de sélection pour des trais qualitatifs spécifiques appliqué par les populations locales
intra et inter pays, explique en partie le polymorphisme trouvé. Sur la base des caractéristiques
qualitatives et quantitatives du fruit, dix cultivars parmi les plus dominants en raison de leur
valeur commerciale ont été analysés pour révéler la grande diversité phénotypique existante en
Sultanate de Oman (Al-Yahyai et Al-Khanjari, 2008). L’emploi de 18 marqueurs
20
Chapitre 1 : Synthèse bibliographique
En Algérie, les premiers travaux sur l’exploration des ressources phytogénétiques du palmier
dattier ont commencé par des prospections dont l’objectif principal était de cerner l’ampleur de
la biodiversité du dattier en inventoriant les cultivars rencontrés (Maatallah, 1969).
Les missions de prospections des ressources phytogénétiques du dattier ont été lancées
initialement dans l’objectifs d’identifier les cultivars présentant des résistances au Bayoud.
Dans le Sud-Ouest Algérien 352 cultivars locaux ont été recensés dont 74% étaient endémiques
à une seule zone d’échantillonnage et seulement vingt étaient omniprésents et abondants. Des
variations entre les cultivars ont été notées par rapport à leur sensibilité à la fusariose. Des cas
d’homonymies et de synonymies ont été soulignés et l’accent a été mis sur la classification des
dattes selon leur consistance (molles, demi molles et sèches) en rapport avec les différents
usages qui en découlent (Brac de la Perrière et Benkhalifa, 1989). Ils ont montré que les
caractéristiques morphologiques du fruit et du noyau ont permis la distinction pas uniquement
entre quelques cultivars du Sud-ouest algérien mais aussi à l’intérieur d’un même cultivar
(variation intra-cultivar) qui semble être génétique. Il existe en effet une variabilité intra-
cultivar due à l’influence environnementale qui affecte la morphologie du fruit. Pas loin dans
la région de Touat (Wilaya d’Adrar), renommée par la grande diversité du dattier, 193 cultivars
ont été inventoriés dont 88 ont fait l’objet d’une caractérisation phénologique et 75
morphologique des organes de fructification (Zaki, 2001).
21
Chapitre 1 : Synthèse bibliographique
En Algérie, les premiers travaux sur l’exploration des ressources phytogénétiques du palmier
dattier ont commencé par des prospections dont l’objectif principal était de cerner l’ampleur de
la biodiversité du dattier en inventoriant les cultivars rencontrés (Maatallah, 1969).
Les missions de prospections des ressources phytogénétiques du dattier ont été lancées
initialement dans l’objectifs d’identifier les cultivars présentant des résistances au Bayoud.
Dans le Sud-Ouest Algérien 352 cultivars locaux ont été recensés dont 74% étaient endémiques
à une seule zone d’échantillonnage et seulement vingt étaient omniprésents et abondants. Des
variations entre les cultivars ont été notées par rapport à leur sensibilité à la fusariose. Des cas
d’homonymies et de synonymies ont été soulignés et l’accent a été mis sur la classification des
dattes selon leur consistance (molles, demi molles et sèches) en rapport avec les différents
usages qui en découlent (Brac de la Perrière et Benkhalifa, 1989). Ils ont montré que les
caractéristiques morphologiques du fruit et du noyau ont permis la distinction pas uniquement
entre quelques cultivars du Sud-ouest algérien mais aussi à l’intérieur d’un même cultivar
(variation intra-cultivar) qui semble être génétique. Il existe en effet une variabilité intra-
cultivar due à l’influence environnementale qui affecte la morphologie du fruit. Pas loin dans
la région de Touat (Wilaya d’Adrar), renommée par la grande diversité du dattier, 193 cultivars
ont été inventoriés dont 88 ont fait l’objet d’une caractérisation phénologique et 75
morphologique des organes de fructification (Zaki, 2001).
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Chapitre 1 : Synthèse bibliographique
de caractères stables qui permettent d'identifier facilement les pieds mâles ou qui marquent des
ressemblances entre les pollinisateurs et les femelles de même nom (Babahani, 2011).
Les Ziban où le nombre de cultivars a été estimé à 307 (Belhadi et al., 2008) et dont une grande
partie est menacée d’érosion génétique (annexe 2) ont également fait l’objet d’étude de
diversité morphologique du palmier dattier à travers une approche descriptive sur la base de
caractères morphologiques et biochimiques du fruit. Au total 145 cultivars de palmier dattier
ont été décrits. Les dattes de 91% cultivars étaient de consistance molle à demi-molle
(Belguedj, 2002). Des travaux plus récents sur la caractérisation des cultivars réalisés sur 89
cultivars de la région de Biskra ont fait appel à 17 paramètres physiques dont 4 relatifs aux
palmes et 13 aux dattes. L’accent a été mis sur les caractères les plus discriminants pouvant être
utilisés dans les études ultérieures de diversité génétique du palmier dattier (Simozrag, 2016).
Au niveau de la même région, 52 descripteurs morphologiques traitant séparément les parties
végétative et reproductrice ont servi à l’étude de 26 cultivars en faisant appel à l’analyse
multivariée. D’importantes corrélations ont décrit l’architecture harmonieuse observée dans
l’expression de certains caractères morphologiques, tel qu’entre la palme et le rachis ou les
pennes et les épines et dont le développement et/ou le nombre étaient fortement corrélés. Un
fort pouvoir discriminant a été révélé par 10 paramètres végétatifs et 12 reproducteurs, parmi
lesquels ceux explorés pour la première fois. Les résultats concordent avec la caractérisation
intuitive des agriculteurs (Bedjaoui et Benbouza, 2018).
La composition chimique des dattes a fait l'objet de plusieurs études (Acourene et Tama,
1997 ; Al-Shahib et Marshall, 2003 ; Ismail et al. 2006 ; Al-Farsi et al., 2008 ; Saafi et al.,
2008 ; El-Sohaimy et Hafez, 2010 ; Baliga et al.2011 ; El Arem et al., 2011 ; Hasnaoui et
al., 2011 ; Ben Ismail et al., 2013 ; Acourene et al., 2014). Dans cette partie, nous
considérerons uniquement la composition chimique des dattes sans aborder la phytochimie.
Les teneurs en composants chimiques des dattes varient largement selon l'origine des cultivars,
les stades de développement, les conditions environnantes, la conduite culturale adoptée par les
phoeniciculteurs et aussi les objectifs recherchés.
Les premiers travaux qui ont investi la composition chimique des dattes se sont intéressés à
deux aspects fondamentaux qui influent directement sur la qualité des dattes qui sont l’évolution
23
Chapitre 1 : Synthèse bibliographique
des composants durant les différents stades de maturation de la datte où les sucres totaux, pH,
et cendres augment au moment où la teneur en eau diminue simultanément avec l’accélération
de la conversion du saccharose et la détermination des conditions d’action de l’enzyme
invertase (Cook, et Furr, 1953 ; Ashmawi et al., 1956). Dès lors, plusieurs classifications de
dattes ont été proposées sur la base de leur composition chimique notamment la teneur en eau
et les sucres. Les travaux de Cook et Furr (1953), ont permis la classification des dattes en
trois groupes sur la base de la présence de l’enzyme invertase (responsable de la conversion du
saccharose en sucres réducteurs) : le premier désigne les « dattes avec invertase » correspondant
aux dates molles, le second est celui des « dattes avec une petite quantité d'invertase »
représentant les dattes demi-molles et le dernier concerne les « dattes sans invertase »
correspondant aux dattes sèches. Les cultivars riches en invertase contiennent surtout des sucres
réducteurs, alors que les dattes sèches contiennent une quantité importante de saccharose et une
faible quantité de sucres réducteurs. Dawson et Aten (1963) ont distingué entre deux catégories
de dattes : celle à saccharose (dattes sèches) et celles à sucres réducteurs (dattes molles).
L’indice de qualité ‘r’ proposé par Munier (1961) est souvent utilisé pour la répartition des
dattes en trois classes : molle, demi-molle et sèche. Une autre approche plus détaillée dans la
classification des dattes a été élaborée par Estanov (1988) et qui prend en considération les
proportions de sucres réducteurs et non réducteurs. La première classe contient 40 à 65% de
saccharose, 20 à 40% de glucose et fructose et 15 à 25% d'eau. La seconde classe renferme
entre 10 et 35% de saccharose, 40 et 75% de glucose et de fructose et entre 10 et 30% d'eau. La
troisième classe, les dattes sont constituées de 0 à 10% de saccharose, 65 à 90% de glucose et
de fructose et 10 à 35% d'eau. La dernière classe contenant 0% de saccharose, 35 à 75% de
glucose et de fructose et 35-65% d'eau.
En parallèle, plusieurs travaux dans différents pays ont été réalisés sur un nombre de cultivars
plus ou moins important en vue d’étudier la diversité chimique des dattes et l’appréciation de
leur valeur nutritionnelle.
Cinq cultivars provenant de différents pays ont été concernés par une étude dont l’objectif était
de montrer l’effet de l’origine géographique sur la composition chimique des dattes et de
rechercher des marqueurs pour la caractérisation variétale chez le palmier dattier (Booij et al.,
1992). Les auteurs ont conclu, avec prudence, vu le petit nombre de cultivars étudiés, que les
teneurs en sucres, en vitamines et en éléments minéraux ne peuvent être considérées comme
paramètres discriminants. Aux Emirats arabes unis, l’analyse physicochimique des dattes de 12
24
Chapitre 1 : Synthèse bibliographique
des composants durant les différents stades de maturation de la datte où les sucres totaux, pH,
et cendres augment au moment où la teneur en eau diminue simultanément avec l’accélération
de la conversion du saccharose et la détermination des conditions d’action de l’enzyme
invertase (Cook, et Furr, 1953 ; Ashmawi et al., 1956). Dès lors, plusieurs classifications de
dattes ont été proposées sur la base de leur composition chimique notamment la teneur en eau
et les sucres. Les travaux de Cook et Furr (1953), ont permis la classification des dattes en
trois groupes sur la base de la présence de l’enzyme invertase (responsable de la conversion du
saccharose en sucres réducteurs) : le premier désigne les « dattes avec invertase » correspondant
aux dates molles, le second est celui des « dattes avec une petite quantité d'invertase »
représentant les dattes demi-molles et le dernier concerne les « dattes sans invertase »
correspondant aux dattes sèches. Les cultivars riches en invertase contiennent surtout des sucres
réducteurs, alors que les dattes sèches contiennent une quantité importante de saccharose et une
faible quantité de sucres réducteurs. Dawson et Aten (1963) ont distingué entre deux catégories
de dattes : celle à saccharose (dattes sèches) et celles à sucres réducteurs (dattes molles).
L’indice de qualité ‘r’ proposé par Munier (1961) est souvent utilisé pour la répartition des
dattes en trois classes : molle, demi-molle et sèche. Une autre approche plus détaillée dans la
classification des dattes a été élaborée par Estanov (1988) et qui prend en considération les
proportions de sucres réducteurs et non réducteurs. La première classe contient 40 à 65% de
saccharose, 20 à 40% de glucose et fructose et 15 à 25% d'eau. La seconde classe renferme
entre 10 et 35% de saccharose, 40 et 75% de glucose et de fructose et entre 10 et 30% d'eau. La
troisième classe, les dattes sont constituées de 0 à 10% de saccharose, 65 à 90% de glucose et
de fructose et 10 à 35% d'eau. La dernière classe contenant 0% de saccharose, 35 à 75% de
glucose et de fructose et 35-65% d'eau.
En parallèle, plusieurs travaux dans différents pays ont été réalisés sur un nombre de cultivars
plus ou moins important en vue d’étudier la diversité chimique des dattes et l’appréciation de
leur valeur nutritionnelle.
Cinq cultivars provenant de différents pays ont été concernés par une étude dont l’objectif était
de montrer l’effet de l’origine géographique sur la composition chimique des dattes et de
rechercher des marqueurs pour la caractérisation variétale chez le palmier dattier (Booij et al.,
1992). Les auteurs ont conclu, avec prudence, vu le petit nombre de cultivars étudiés, que les
teneurs en sucres, en vitamines et en éléments minéraux ne peuvent être considérées comme
paramètres discriminants. Aux Emirats arabes unis, l’analyse physicochimique des dattes de 12
25
Chapitre 1 : Synthèse bibliographique
Les travaux sur l'étude de la composition chimique des dattes en Algérie se sont orientés vers
la description, la caractérisation variétale et l’évaluation de la qualité des dattes des cultivars
les plus importants (Acourene et Tama, 1997 ; Acourene et al., 2001, Belguedj, 2002 ;
Acourene et al.,2014) en associant des paramètres physiques du fruit (Chibane et al., 2007) et
l’analyse sensorielle (Gourchala et al., 2015). D’autres travaux (Noui et al., 2014) se sont
intéressés, à côté de la composition chimique des dattes, à l’étude de l’activité antioxydante de
trois cultivars. Néanmoins, les données disponibles demeurent descriptives et peu nombreuses
au regard de l’étendue de la diversité de dattes existante en Algérie.
26
Chapitre 1 : Synthèse bibliographique
Mohamed Ahmed et al., 2011). Cependant, les traits morphologiques ne sont pas des
indicateurs fiables du génotype de la plante, car ils sont fortement influencés par les conditions
environnementales et varient avec le stade de développement de la plante. De plus, la
caractérisation des cultivars est une procédure de longue haleine qui nécessite un grand nombre
de données phénotypiques très difficile à collecter principalement pour des cultivars rares.
Les marqueurs moléculaires de l’ADN sont plus précis et peuvent identifier avec précision les
cultivars et quantifier leur diversité génétique et leurs relations phylogéniques; ces marqueurs
ont été largement utilisés pour étudier la variation génétique des cultivars de palmiers dattiers
(Jaradat, 2014). Ils sont également utilisés comme approche directe pour détecter la variation
génétique des cultivars de palmiers dattiers. Ils sont considérés comme extrêmement utiles, car
ils peuvent être étudiés à tout stade du développement de la plante à travers des méthodes non
destructives où de petits échantillons de feuilles suffisent (Elshibli et Korpelainen, 2011).
Parallèlement à l’intérêt croissant porté à l’étude de la biodiversité du palmier dattier dans le
contexte de l’exploration et de l’utilisation de ses ressources à tous les niveaux et de la
résolution du problème d’identification des cultivars aux premiers stades du développement,
divers types de marqueurs moléculaires ont été élaborés les dernières décennies. Des marqueurs
moléculaires de type RAPD ont été utilisés pour étudier la diversité génétique parmi 43
accessions de palmiers dattiers, dont 37 proviennent du Maroc et 6 cultivars d'Irak et de Tunisie
(Sedra et al., 1998). Dans cette étude, 123 amorces (primers) RAPD ont été présélectionnées,
parmi lesquelles 19 ont révélé un polymorphisme inter-cultivars. En employant le même type
de marqueurs, au Royaume d'Arabie Saoudite, une étude de la phylogénie moléculaire de 13
cultivars de palmiers dattiers a été réalisée. Au total, 37 des 140 amorces RAPD ont révélé un
polymorphisme. Le nombre de bandes polymorphes par primer a été compris entre 2 et 17 (Al-
Khalifah et Askari, 2003). Les auteurs ont confirmé que la variation détectée entre les
génotypes étroitement apparentés indique l'efficacité des marqueurs RAPD par rapport aux
marqueurs morphologiques et biochimiques (isoenzymes) pour l'identification et la
construction de cartes de liaison génétique. Toutefois, le faible polymorphisme des marqueurs
RAPD et le manque d'organisation évidente observé parmi les cultivars analysés seraient dû à
27
Chapitre 1 : Synthèse bibliographique
domestication du palmier dattier puisque les cultivars introduits en Tunisie ne divergeaient pas
significativement des locaux, elle représente également l’emploi des RAMPOs comme une
méthode puissante pour discriminer les génotypes du palmier dattier et l’évaluation de sa
biodiversité génétique.
Les deux derniers marqueurs ont également été utilisés séparément pour étudier la phylogénie
moléculaire de quatre cultivars importants en Royaume d’Arabie Saoudite à l'aide de cinq
marqueurs RAPD et cinq marqueurs ISSR (Abdulla et Gamal, 2010). La plupart des
marqueurs étudiés présentaient un polymorphisme inter-variétal et la similarité moyenne entre
les quatre cultivars avoisinait les 55%. Le même type de marqueurs a permis d'évaluer les
relations phylogénétiques entre 18 cultivars et cinq pieds mâles en Syrie (Haider et al., 2012).
Cela a permis d'explorer le polymorphisme de l'ADN dans la collection de génotypes analysés
et de générer de nombreux marqueurs polymorphes assurant une bonne couverture du génome
(vu que les RAPD et ISSR amplifient différentes parties du génome, les données générées à
partir des deux analyses ont été combinées).. D’autre part, les marqueurs ISSRs ont également
été associés aux AFLP pour l’étude de 10 cultivars de palmiers dattiers saoudiens (Sabir et al.,
2014). Les 13 amorces ISSR et six combinaisons ISSR et AFLP ont révélé des niveaux de
polymorphisme différents parmi les cultivars (ISSR avec une moyenne de 85% et AFLP avec
une moyenne de 76%). La comparaison des résultats fait apparaitre que les marqueurs ISSR
étaient moins fiables pour la détection des liens génétiques entre les cultivars de palmiers
dattiers. Ce même constat a été fait en comparant RAPD et ISSR (Abdulla et Gamal, 2010).
L’utilisation des marqueurs moléculaires tels que RAPD, RFLP, AFLP, ISSR et SSR connait
beaucoup de limites liées à leur coût, leur facilité d'utilisation, leur robustesse, leur
dominance/co-dominance et leur niveau de polymorphisme. Les marqueurs microsatellites
(SSRs) semblent répondre à la plupart des exigences en matière d'analyse précise d'empreintes
digitales et de phylogénie du palmier dattier (Khanam et al., 2012). En effet, les attributs de
codominance, de reproductibilité et de haute résolution ont tous contribué à la popularité des
microsatellites nucléaires en tant qu'instruments puissants pour les analyses génétiques de
population et l'identification génotypique intra-espèce (Elshibli et Korpelainen, 2011).
Les marqueurs SSRs ont été développés pour la première fois sur palmier dattier en 2004 par
Billote et al. (2004). Les 16 amorces SSRs utilisées ont amplifié avec un nombre total moyen
d'allèles de 14 par locus. L’hétérozygotie attendue a révélé un important taux moyen de
polymorphisme (0,76), ce qui favorise leur utilité pour évaluer la diversité génétique ainsi que
28
Chapitre 1 : Synthèse bibliographique
domestication du palmier dattier puisque les cultivars introduits en Tunisie ne divergeaient pas
significativement des locaux, elle représente également l’emploi des RAMPOs comme une
méthode puissante pour discriminer les génotypes du palmier dattier et l’évaluation de sa
biodiversité génétique.
Les deux derniers marqueurs ont également été utilisés séparément pour étudier la phylogénie
moléculaire de quatre cultivars importants en Royaume d’Arabie Saoudite à l'aide de cinq
marqueurs RAPD et cinq marqueurs ISSR (Abdulla et Gamal, 2010). La plupart des
marqueurs étudiés présentaient un polymorphisme inter-variétal et la similarité moyenne entre
les quatre cultivars avoisinait les 55%. Le même type de marqueurs a permis d'évaluer les
relations phylogénétiques entre 18 cultivars et cinq pieds mâles en Syrie (Haider et al., 2012).
Cela a permis d'explorer le polymorphisme de l'ADN dans la collection de génotypes analysés
et de générer de nombreux marqueurs polymorphes assurant une bonne couverture du génome
(vu que les RAPD et ISSR amplifient différentes parties du génome, les données générées à
partir des deux analyses ont été combinées).. D’autre part, les marqueurs ISSRs ont également
été associés aux AFLP pour l’étude de 10 cultivars de palmiers dattiers saoudiens (Sabir et al.,
2014). Les 13 amorces ISSR et six combinaisons ISSR et AFLP ont révélé des niveaux de
polymorphisme différents parmi les cultivars (ISSR avec une moyenne de 85% et AFLP avec
une moyenne de 76%). La comparaison des résultats fait apparaitre que les marqueurs ISSR
étaient moins fiables pour la détection des liens génétiques entre les cultivars de palmiers
dattiers. Ce même constat a été fait en comparant RAPD et ISSR (Abdulla et Gamal, 2010).
L’utilisation des marqueurs moléculaires tels que RAPD, RFLP, AFLP, ISSR et SSR connait
beaucoup de limites liées à leur coût, leur facilité d'utilisation, leur robustesse, leur
dominance/co-dominance et leur niveau de polymorphisme. Les marqueurs microsatellites
(SSRs) semblent répondre à la plupart des exigences en matière d'analyse précise d'empreintes
digitales et de phylogénie du palmier dattier (Khanam et al., 2012). En effet, les attributs de
codominance, de reproductibilité et de haute résolution ont tous contribué à la popularité des
microsatellites nucléaires en tant qu'instruments puissants pour les analyses génétiques de
population et l'identification génotypique intra-espèce (Elshibli et Korpelainen, 2011).
Les marqueurs SSRs ont été développés pour la première fois sur palmier dattier en 2004 par
Billote et al. (2004). Les 16 amorces SSRs utilisées ont amplifié avec un nombre total moyen
d'allèles de 14 par locus. L’hétérozygotie attendue a révélé un important taux moyen de
polymorphisme (0,76), ce qui favorise leur utilité pour évaluer la diversité génétique ainsi que
29
Chapitre 1 : Synthèse bibliographique
l'identification des cultivars dans de nombreux pays producteurs. De nombreuses études ont
suivi dans différents pays phoenicicoles pour l’investigation des ressources phystogénétiques
du palmier dattier par les SSRs. En Tunisie, 49 accessions de palmiers dattiers provenant de
trois oasis en Tunisie ont été étudiées. Seulement 14 des 16 primers ont réussi à établir les
génotypes des accessions considérées (Zehdi et al., 2004). Des cultivars (45) et des accessions
(23) mâles originaires du Soudan et du Maroc ont été investis. Une moyenne de 7,14 et 21,4
allèles par locus a été observée pour les deux types de matériel génétique respectivement. Des
niveaux élevés d'hétérozygotie attendue ont été détectés indiquant une importante diversité
génétique (Elshibli et Korpelainen, 2008). Au Qatar, l’utilisation du même set de primers a
révélé la plus basse moyenne du nombre d'allèles par locus qui était de quatre (Ahmed et Al-
Qaradawi, 2009).
Un nombre plus élevé de cultivars femelles (74) et de cultivars mâles (27) en Tunisie a fait
l’objet d’une étude par les SSRs (Zehdi et al., 2012). Au total, 136 allèles et 311 génotypes
ont été détectés sur la base de 14 loci microsatellites. Le nombre moyen d’allèles par locus était
de 9,71 et la valeur de l'hétérozygotie attendue était de 0,731 renseignant sur un niveau élevé
de polymorphisme au niveau de l'ADN. Il était intéressant de trouver que l'utilisation de
seulement cinq locus était suffisante pour distinguer facilement 72 génotypes des 101 cultivars
considérés. Egalement, d’autres marqueurs moléculaires neutres puissants adaptés à
l'identification des cultivars ont été mis en évidence.
De nombreuses études ont été réalisées par l’emploi des SSRs, qui se sont révélés être les plus
fiables, pour l’étude de la diversité génétique du palmier dattier, l’identification des rejets à
grande échelle, des plantules in vitro et d’autres matériel végétal à un stade précoce de
croissance (Al-Ruqaishi et al., 2008 ; Bodian et al., 2012 ; Racchi et al., 2013 ; Babaei et
Shabanimofrad, 2018) et le déterminisme du sexe (Cherif et al., 2013 ; Inthaa et
Chaiprasart, 2018).
Par ailleurs, l’établissement d’autres sets de SSRs est une conséquence logique au succès qu’a
connu ces marqueurs (Akkak et al., 2009; Arabnezhad et al., 2011 ; Elmeer et al., 2011 ;
Aberlenc-Bertossi, 2014 ; Al-Fai et al., 2016).
L’emploi des SSRs nucléaires a également permis de fournir de nouvelles informations sur
l'influence des origines géographiques et de l'activité humaine sur la structure génétique du
palmier dattier dans l'Ancien Monde. Apres analyses de 295 accessions de palmier dattier et
30
Chapitre 1 : Synthèse bibliographique
couvrant l’aire phenicicole allant de la Mauritanie au Pakistan, des travaux ont confirmé
l'existence de deux pools distincts de germoplasme de palmier dattier dits Oriental et Occidental
et la forte différenciation observée confirme l'existence d'au moins deux événements de
domestication. (Zehdi-Azouzi et al., 2015). Également, des données significatives ont été
révélées sur la taxonomie du genre Phoenix après la prospection par le biais de 17 primers SSRs
de 308 accessions de Phoenix représentant 12 espèces. Les individus de la même espèce se sont
regroupés ensemble, appuyant ainsi la taxonomie existante et l’efficacité des SSRs dans la
délimitation des espèces dans le genre Phoenix (Arecaceae) (Pintaud et al., 2010)
En Algérie, une étude a été réalisée couvrant 10 oasis pour comprendre la structure de la
diversité du palmier dattier. Au total, 18 marqueurs microsatellites et un mini-satellite
chloroplastique ont été utilisés pour caractériser 414 individus correspondant à 114 cultivars
connus. Un coefficient de consanguinité négatif significatif a été observé ce qui suggère la
sélection active des agriculteurs pour les individus hétérozygotes. La clé de détermination
moléculaire des cultivars algériens a été aussi établie. Trois groupes génétiquement distincts
ont été identifiés, le premier omniprésent trouvé dans les différentes oasis, et l’un des deux
autres groupes était spécifique au nord alors que l’autre à l’extrême sud. La diversité nucléaire
algérienne n'était pas d'origine orientale alors que la diversité chloroplastique particulière,
conservée par les agriculteurs, pourrait provenir de palmiers dattiers introduits depuis le
Moyen-Orient depuis longtemps. Cette étude illustre la structure complexe de la diversité des
palmiers dattiers dans les oasis algériennes et le rôle des agriculteurs dans la formation de telles
données cryptiques (Moussouni et al., 2017). Des cultivars de palmiers dattiers recueillis dans
l'oasis de Bou-Saada, situés à la base l'Atlas saharien d'Algérie ont fait l’objet d’une étude par
des marqueurs ISSRs et RAPD. Les deux marqueurs ont entraîné des niveaux élevés et
comparables de polymorphismes; environ 75% de locus polymorphes ont été détectés parmi
151 allèles ISSR et 198 allèles RAPD.. Au niveau des groupes, les types de cultivars de dattes
molles, sèches et demi-molles sont caractérisés par la présence d'allèles uniques à chaque
groupe, ce qui se traduit par des différences considérables en termes de diversité génétique. En
règle générale, les marqueurs RAPD et ISSR ont donné lieu à des schémas de regroupement
très différents (Guettouchi et al., 2017a)
D’autre part, l’évaluation de 21 cultivars algériens de palmiers dattiers (20 femelles et un mâle)
ainsi que 6 génotypes de Deglet Nour pour la résistance (R) et la sensibilité (S) à la maladie de
Bayond à l'aide de marqueurs moléculaires de type plasmides circulaires (plasmides R et S) a
31
Chapitre 1 : Synthèse bibliographique
permis de détecter le cultivar ‘’Baâret ljmal’’ comme étant un cultivar résistant (Guettouchi et
al., 2017 b).
L’Algérie occupe la troisième place, après l’Egypte et l’Iran, en terme de production avec
1029596 tonnes (FAOSTAT, 2018) (Fig. 3).
Tunisia 241000
Oman 348642
Sudan 439120
Pakistan 494601
Iraq 615211
United Arab Emirates 671891
Saudi Arabia 964536
Algeria 1029596
Iran 1065704
Egypt 1694813
0 500000 1000000 1500000 2000000
Figure 3 : Classement des dix plus grands producteurs de dattes au monde en tonnes
(FAOSTAT, 2018)
32
Chapitre 1 : Synthèse bibliographique
et de 35.02% en production ont été enregistrés dans la période qui s’étale de 1996 à 2016 (Fig.
4).
1029596
990377
934377
848199
789357
724894
644741
600696
552765
526921
516293
492217
492188
442600
437332
427583
418427
387313
365616
360637
302993
166893
167279
164695
165378
163985
162033
162134
159871
160867
161091
154372
147906
136774
128800
120830
104390
101820
100120
97990
96560
96520
1996 1997 1998 1999 2000 2001 2002 2003 2004 2005 2006 2007 2008 2009 2010 2011 2012 2013 2014 2015 2016
La plus grande aire de production de dattes en Algérie est située dans le Sud-Est où se trouve
Biskra, la première wilaya phoenicicole. A l’échelle nationale, Biskra produit 4284890 tonnes
soit 41.61% de la production nationale, couvre 43105 ha ce qui représente 27.7% de la
superficie globale destinée à la culture du dattier du pays et contient 4336358 palmiers soit
23.2% du nombre total de pieds.
En termes d’exportation des dattes algériennes, un accroissement de 37% a été observé dans la
période comprise entre 1961-2017. En 2016, la quantité exportée a été de 31109 tonnes
rapportant au pays 37502 000 US$ (FAOSTAT, 2018).
33
Chapitre 2 : Etude de la diversité morphologique des
parties végétative et reproductrice des principaux
cultivars des Ziban
Chapitre 2 : Etude de la diversité morphologique des parties végétative et
reproductrice des principaux cultivars des Ziban
1. Introduction
L'importance du palmier dattier (Phoenix dactylifera L.) dans les régions arides et désertiques,
où les conditions agro-écologiques sont favorables à son développement, est connue depuis fort
longtemps. Cette espèce représente l'une des espèces fruitières les plus anciennes en Algérie,
ayant une grande importance écologique et socioéconomique.
La région des Ziban est connue pour être l’une des principales aires phoenicicoles en Algérie.
Elle est classée première à l’échelle nationale, en termes de nombre de palmiers (23% de
l’effectif national) et de production de dattes (41,61% de la production nationale) dont 65%
concernent le cultivar Deglet Nour (M.A.D.R., 2016).
Les oasis Algériennes sont comptées parmi les plus riches au monde du point de vue diversité
génétique avec plus de 940 cultivars (Hannachi et al., 1998) qui ont su doctement s’adapter
aux variations pédoclimatiques du grand Sahara Algérien. La localisation et la description de
la diversité existante du palmier dattier, l’identification du matériel génétique à conserver et
l’implémentation des méthodes de conservation constituent le fondement des stratégies de
conservation et utilisation de ses ressources génétiques (Elshibli et Korpelainen, 2011). La
méconnaissance de ces dernières réduisant l’utilité du potentiel génétique présent au niveau de
nos palmeraies et les bénéfices que les utilisateurs notamment les scientifiques peuvent en tirer.
Dans la région des Ziban (wilaya de Biskra) Belguedj (2002) a dénombré 111 cultivars dont
90% sont rares à peu fréquents (selon une échelle d’évaluation qu’il avait établie sur la base de
la fréquence des cultivars) renseignant ainsi sur une érosion génétique sévère due en grande
partie à la dominance de l’élite Deglet Nour dont la qualité n’est égalée nulle part ailleurs. Le
constat est tel que la quasi-totalité des cultivars sont abandonnés et /ou substitués même ceux
dont les dattes sont fortement appréciées par la population locale (dattes molles en majorité).
De même, Guettouchi et al. (2015) avaient mis l’accent, dans leur étude, sur le dernier rempart
de la biodiversité du dattier dans l’oasis la plus proche du littoral méditerranéen (Alger ; 250
Km), l’oasis de Bou-Sâada. La moitié des 23 cultivars recensés était originaire de cette région
et le nombre de pieds a été réduit à 2147 alors qu’il était de 6000 palmiers en 2002.
Devant ce déclin de la biodiversité du palmier dattier il s’avère impératif de renforcer les efforts
visant à de meilleures conservation et gestion de ses ressources phytogénétiques afin d’élargir
la base génétique sur laquelle se dressent les programmes d’amélioration. La caractérisation
35
Chapitre 2 : Etude de la diversité morphologique des parties végétative et
reproductrice des principaux cultivars des Ziban
Les Ziban, de par leur importance, ont fait l’objet de plusieurs études qui ont traité de la diversité
génétique du dattier qu’ils renferment. Des paramètres physiques ont été utilisés pour la
distinction de 89 cultivars de la région. Cette distinction était basée plutôt sur les caractères
reproducteurs liés aux fruits que végétatifs (Simozrag et al., 2016). Auprès des oasis d’Oued-
Righ et Oued-Souf, les palmeraies des Ziban ont été concernées par une étude descriptive des
caractères morphologiques du palmier et biochimiques du fruit de 145 cultivars où 91% des
dattes ont été de consistance molles à demi-molles (Belguedj, 2002). De même, les caractères
végétatifs ont été associés aux caractères chimiques du fruit pour la caractérisation
phénotypique des cultivars en vue d’évaluer et de valoriser le patrimoine phoenicicole des
Ziban (Djoudi, 2013 ; Retima 2015 ). Ces paramètres ont été également utilisés dans
l’identification des ressemblances morphologiques entres les pieds mâles et femelles d’un
même cultivar (Babahani, 2011 ; Ben Ouamane, 2015) afin de développer la notion de type
variétal couramment utilisée en moyen orient.
C’est dans ce contexte que nous avons réalisé ce travail qui contribue à l’identification et
l’évaluation de la diversité génétique de vingt-six principaux cultivars de palmier dattier
présents dans la région des Ziban par l’emploi d’un nombre plus important de descripteurs
IPGRI (2005). Nous avons réalisé une étude détaillée de cinquante-deux paramètres
morphologiques des appareils, végétatif (27) et reproducteur (25), que nous avons traités
séparément afin d’aboutir à une caractérisation aussi globale que précise. Les données ont été
soumises à une analyse multivariée (analyse en composantes principales et classification
hiérarchique ascendante). Les objectifs que nous avons visés étaient essentiellement
l’identification de nouveaux caractères discriminants à utiliser en qualité de descripteurs sur
terrain facilitant la reconnaissance et/ou distinction entre des cultivars notamment en dehors de
36
Chapitre 2 : Etude de la diversité morphologique des parties végétative et
reproductrice des principaux cultivars des Ziban
2. Matériel et méthodes
2.1. Prospection et choix des cultivars
37
Chapitre 2 : Etude de la diversité morphologique des parties végétative et
reproductrice des principaux cultivars des Ziban
Nous avons rencontré lors du choix du matériel végétal deux contraintes majeures : la vieillesse
et la raréfaction des cultivars. Notre choix a été dicté par la disponibilité des pieds d’un même
cultivar en nombre suffisant pour réaliser les répétitions. Néanmoins, nous avons veillé lors de
la sélection du matériel végétal à ce qu’il soit le plus homogène possible. Nous avons considéré
dans cette étude morphologique 26 cultivars de palmier dattier femelles (Tab. 2) dont les pieds
étaient adultes (plus de 25 ans), sains, ne présentant aucune anomalie, n’ayant subi aucun stress
et entretenus dans les conditions normales de production. Les cultivars en question résultent
d’une sélection empirique de longue haleine faite par les agriculteurs de la région qui les
reconnaissent grâce à l’emploi de quelques caractères localisés au niveau de nombreuses parties
qui forment le dattier.
38
Chapitre 2 : Etude de la diversité morphologique des parties végétative et
reproductrice des principaux cultivars des Ziban
2.2. Echantillonnage
Nous avons déterminé le nombre de répétitions pour toutes les mesures effectuées suivant le
descripteur IPGRI (2005). Le nombre de pieds par cultivar a varié de 3-5 ce qui nous donne au
total 108 pieds étudiés appartenant à 26 cultivars. Les contraintes précitées (raréfaction, état
rendant le pied non représentatif du cultivar) ont été préjudiciables pour bien mener notre
échantillonnage qui a été échelonné dans le temps suivant la phénologie de l’arbre (Tab. 3).
Nous avons mesuré vingt-sept caractères décrivant les plus importants organes de la partie
végétative à savoir : le stipe et la palme en considérant ses composantes : pétiole, rachis, épines
et pennes. Les détails sur les mesures des paramètres sont reportés dans le Tableau 4.
La palme a été prélevée de la couronne moyenne. Les mesures de largeur et d’épaisseur ont été
effectuées au milieu de l’organe mesuré. Pour le calcul de l’indice d’espacement de la base des
pennes (Fig. 6), nous avons appliqué la formule suivante : IEP = a + b + c / d (IPGRI, 2005).
39
Chapitre 2 : Etude de la diversité morphologique des parties végétative et
reproductrice des principaux cultivars des Ziban
Les vingt-cinq caractères de l’appareil reproducteur du dattier (Tab. 5) que nous avons
considérés décrivent la spathe et le régime (comprenant l’épillet, les fruits et les graines). Les
mesures de largeur et d’épaisseur ont été prises en considérant le milieu de l’organe objet de
mesure.
40
Chapitre 2 : Etude de la diversité morphologique des parties végétative et
reproductrice des principaux cultivars des Ziban
Des illustrations de quelques paramètres végétatifs et reproducteurs étudiés sont données dans
la Figure 6.
Pour la mesure des paramètres biométriques, nous avons utilisé le pied à coulisse, le mètre
ruban et la balance de précision.
41
Chapitre 2 : Etude de la diversité morphologique des parties végétative et
reproductrice des principaux cultivars des Ziban
V14
V5
V6
V3
V2 V4 V7
42
Chapitre 2 : Etude de la diversité morphologique des parties végétative et
reproductrice des principaux cultivars des Ziban
b R22
R21
R16
R2 R17
R6 R4 R18
9
R9
R1
R15
L'étude de la variabilité des caractères morphologiques a fait l’objet d’une analyse de variance
(ANOVA) et les différences entre les moyennes ont été vérifiées par le test post-hoc Tukey
(HSD) au seuil de 5%. Les valeurs moyennes des paramètres mesurés ont été utilisées pour
effectuer une analyse en composantes principales (ACP) qui a permis le regroupement, dans un
même plan, des cultivars sur la base de caractéristiques morphologiques proches. Le même set
de valeurs a été utilisé pour l’analyse des corrélations afin de déceler quelles variables sont
reliées entre elles (Taylor, 1990 et Jolliffe, 2002). La classification hiérarchique ascendante
(CAH) basée sur la méthode de Ward qui est comptée parmi les méthodes les plus efficaces et
les plus communément employée permettant ainsi de répartir en cluster les différents cultivars
concernés par cette étude (Saracli et al., 2013). L’objectif est de trouver un assemblage optimal
dans lequel les observations (cultivars) à l’intérieur de chaque cluster sont similaires mais les
clusters seront dissemblables les uns des autres (Rencher, 2002). Cette analyse permettra de
classer les cultivars étudiés dans des groupes homogènes mais distincts. Toutes les analyses ont
été réalisées en utilisant le logiciel XLSTAT version 2016.02.
3. Résultats
L’analyse statistique des caractères quantitatifs utilisés a révélé la présence d’une importante
diversité au sein des cultivars collectés dans la région des Ziban. Les résultats de l’analyse de
la variance (ANOVA) ont montré une différence très hautement significative pour l’ensemble
des paramètres étudiés, végétatifs ou reproducteurs, considérés séparément.
44
Chapitre 2 : Etude de la diversité morphologique des parties végétative et
reproductrice des principaux cultivars des Ziban
Des différences significatives dans la morphologie de la partie reproductrice existent entre les
cultivars et ce pour toutes les variables étudiées (p < 0.001). Le nombre de groupes homogènes
obtenus par le test HSD rendait compte de la variabilité contenue dans notre échantillon.
D’après ce test, le cultivar Degla Baidha (DGB), formant à lui seul un groupe, possède l’épillet
le plus long (R12). Les cultivars Tantboucht (TNT) et Tichtat (TCH) appartiennent à un autre
groupe où l’on note la longueur la plus réduite du fruit (R15).
Les valeurs moyennes des paramètres végétatifs et reproducteurs mesurés ont été analysées et
reportées dans les tableaux 6 et 7. Le test de corrélation de Pearson à deux niveaux de
signification (0.05 et 0.01) a montré d’importantes corrélations, positives en majorité, liant les
paramètres aussi bien végétatifs que reproducteurs.
La matrice de corrélation entre les différents paramètres mesurés montre, dans l’ensemble,
l’existence de corrélations positives en majorité (Tab. 8). La longueur de la palme (V2) est
corrélée positivement à celle de la partie épineuse (V4), l’épaisseur du rachis (V6), la largeur
(V9) et l’épaisseur de l’épine du milieu (V9), le nombre de pennes (V14) et des pennes antroses
(V24) et aussi la longueur de la penne au milieu (V20). Ce dernier paramètre est corrélé
positivement à la largeur de la palme (V3). La longueur de la partie épineuse (V4) est liée
positivement au nombre total d’épines (V7) et à leur groupement en deux (V12). Egalement, la
largeur du rachis (V6) a une corrélation positive avec son épaisseur (V5), la largeur de la palme
(V3), le nombre d’épines (V7), l’épaisseur (V8) et la largeur (V9) de l’épine au milieu, la
longueur (V20) et la largeur (V21) de la penne au milieu. Le nombre d’épines (V7), les
dimensions de l’épine au milieu (V8, V9, V10), le nombre d’épines groupées en deux et en trois
(V12, V13) sont hautement inter corrélés. Le nombre d’épines solitaires (V11) est corrélé avec
celui des épines solitaires (V15) qui est à son tour corrélé à la largeur de la penne au milieu
(V21). La matrice de corrélation a aussi révélé une corrélation significative entre le nombre
total de pennes (V14), celui des pennes groupées en deux (V16) et en trois (V17) et des pennes
introses et antroses (V22, V24). La variable (V21) est positivement corrélée avec le nombre de
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Chapitre 2 : Etude de la diversité morphologique des parties végétative et
reproductrice des principaux cultivars des Ziban
pennes antroses (V24) de même que la largeur de la penne terminale (V26). Des corrélations
positives sont observées, d’une part, en le nombre de pennes groupées en 3 (V17) et retroses
(V23) et d’autre part entre et les groupements de pennes en 4 et en 5 (V19, V18).
La majorité des descripteurs relatifs à la partie reproductrice ont montré des corrélations
positives (Tab. 9). En effet, la longueur de la spathe (R1) est corrélée positivement à celles de
la partie ramifiée (R4), de la partie de l’épillet sans fruits aux trois niveaux du régime (R6 ; R7 ;
R8), de l’épillet le plus long (R12) et le poids du noyau (R20). Ce dernier descripteur est corrélé
avec la longueur de la partie ramifiée (R4) qui est à son tour corrélé avec l’épillet le plus long
(R12) et le rapport longueur graine/fruit (R24). Les largeurs de la spathe (R2) et du pédoncule
(R3) sont positivement liées. Des inter-corrélations positives importantes sont observées entre
les deux groupes suivants de variables : les longueurs de la partie de l’épillet sans fruits à la
base, au milieu et au sommet du régime (R6 ; R7 et R8) et les longueurs de la partie de l’épillet
avec fruits aux mêmes emplacements (R9 ; R10 et R11), les deux groupes étant corrélés avec
aussi bien avec l’épillet le plus long (R12) que le plus court (R13). D’autre part les paramètres
du poids (R14) et longueur du fruit (R15), longueur de la cavité (R16), épaisseur de la chair
(R18) et longueur de la graine (R22) ont exprimé des inter-corrélations positives très fortes
entre eux. Egalement, les variables de l’épaisseur de la chair (R18), le diamètre du calice (R19),
la largeur (R21) et l’épaisseur de la graine (R23) sont hautement corrélées. Toutefois, quelques
corrélations négatives sont notées entre le rapport longueur graine/fruit (R24) d’un cote et les
longueurs de la partie ramifiée (R4) et du fruit (R15) en plus du poids du fruit (R14).
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Chapitre 2 : Etude de la diversité morphologique des parties végétative et
reproductrice des principaux cultivars des Ziban
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Chapitre 2 : Etude de la diversité morphologique des parties végétative et
reproductrice des principaux cultivars des Ziban
Cv V15 V16 V17 V18 V19 V20 V21 V22 V23 V24 V25 V26 V27
AFS 8,8df 55,4ab 24,4a 2,6c 0,4ab 48,72cf 1,08g 67ad 79a 59,2cf 24,2cf 1,08fh 0,49ab
ART 33,2ac 63a 17,6ac 3,4ac 0,4ab 54,26bd 2,42be 80ab 70,4a 77,2ac 27,42bf 0,7h 0,55ab
BHL 6,8ef 29,8d 17,6ac 6,4ac 1,8ab 47,9cf 1,4eg 50,6bd 72a 31,2f 22,32cf 1,32dg 0,47ab
DGA 6,2f 44,6ad 16,6ac 5,4ac 3,6a 64,98ab 2,32bf 53bd 76,6a 55,2cf 24,86cf 1,68be 0,46ab
DGB 29ad 47,4ad 22,6a 6,8ac 1,4ab 55,02bd 2,76ac 83,2a 62ab 80,6ac 27,72bf 1,32dg 0,33b
DGD 9,4df 38,8bd 18,4ac 5,8ac 1,6ab 44,76df 1,62cg 65,2ad 73a 35,2df 30,8ae 2,2ab 0,53ab
DGN 20af 35cd 21ab 3,33ac 0b 67,33ab 3,28ab 61ad 61ab 44,33df 34ac 1,77be 0,5ab
DGZ 14,6cf 48,8ac 16ac 4,2ac 0,4ab 45,58df 3,08ab 59ac 59,6ac 60,4cf 26,72bf 1,68be 0,56ab
FER 6,33ef 38bd 25,67ac 4,33ac 0b 36,93f 0,97g 66,33ad 58,33ab 52cf 20,07cf 1,87bd 0,31b
GHS 25af 47,67ad 21,33a 2,33a 1ab 52,23be 3,77a 55,7ad 48ad 94,97ab 15,9f 1,4cg 0,58ab
GHZ 22,75af 37,5bd 16,25ac 3,75ac 0,25ab 49,68cf 2,6ac 62,5ad 26,25cd 74bc 25,15bf 1,13eh 0,3b
HAL 20bf 35,8cd 13ac 5,2ac 1,4ab 40,7dfa 2,76ac 60,8ad 35bd 62,6ce 23,94cf 1,5cf 0,37ab
HAM 15,33bf 40,33bd 19,33ab 3,67ac 0b 49,17cf 1,73cg 49ce 69a 50,67cf 22,43cf 1,93bd 0,4ab
HRR 14,6cf 50,8ac 14,4ac 6,2ac 0,6ab 36,98f 3,18ab 80,4ac 33bd 73,8bc 23,04cf 2,16ab 0,4ab
ITM 42a 51,4ac 13ac 2,8a 0,6ab 73,62a 2,6ac 73,4ad 63,6ab 77,4ac 19,88df 0,74h 0,54ab
KSB 17,6bf 44,4ad 11,6ac 5,6ac 0,8ab 54,92bd 2,94ab 69,2ad 28,2cd 70,2cd 38ab 1,68be 0,41ab
LMS 10,75cf 45ad 21a 11ab 1,75ab 43,55df 3,18ab 88a 52ad 76,5ac 18,43ef 1,38dg 0,36ab
MDG 9,67cf 41,67bd 14,33ac 1,67a 0,33ab 49,33cf 3,13ab 37de 56ac 51,33cf 22,67cf 1,4cg 0,38ab
SAF 4,25f 41,25bd 12,25ac 7,5ac 1,75ab 59,63bc 0,88g 58,75ad 51,5ac 52cf 23,63cf 0,69h 0,43ab
SBL 7,67df 35,67cd 20,67ab 4,67ac 0b 38,2ef 1,2fg 56,67ad 59,67ab 43,33df 16f 1,6bf 0,37ab
TCH 3,8f 43,4bd 12,8ac 3bc 0b 48,56cf 1,14g 51,80bd 48,4ad 40,8df 32,72ac 1,96bc 0,45ab
THW 28ae 34,4cd 6,8bc 0,6a 0,2b 46,03df 3,75a 47,75ce 23,1d 49,75cf 40,33a 2,73a 0,5ab
TJR 5,75f 43,5ad 19,5ab 3,75ac 10ab 53,05be 1,55cg 47,25ce 65,5ab 58,5cf 22,57cf 1,5cf 0,36ab
TNS 8,2df 34,2cd 18,8ab 7,4ac 3,6a 55,02bd 1,58cg 58,8ad 67,8a 54cf 20,36cf 1,32dg 0,45ab
TNT 37,8ab 52,6ac 5,8c 2a 0b 59,98bc 2,66ac 57bd 54,4ac 57cf 31,74ad 1,66be 0,58a
ZMM 9,5cf 35,5cd 22,5a 12a 2,5ab 55,5bd 3ab 35e 65ab 108,5a 39,5ab 1,66bf 0,3b
En indices les groupes homogènes révélés par HSD test à p<0.05.
Cvs: cultivars.
V: Paramètres végétatifs.
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Chapitre 2 : Etude de la diversité morphologique des parties végétative et
reproductrice des principaux cultivars des Ziban
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Chapitre 2 : Etude de la diversité morphologique des parties végétative et
reproductrice des principaux cultivars des Ziban
Cv R14 R15 R16 R17 R18 R219 R20 R21 R22 R23 R24 R25
AFS 13,21ab 45,05ac 37,85ac 9,82be 4,86ab 9,18ab 1,25ej 8,72ab 23,49be 7,48ad 0,52c 0,09g
ART 13,69a 45,66ab 39,83ab 11,25ac 4,9a 9,51ab 1,44df 9,52ab 26,73ac 7,81ac 0,59bc 0,1fg
BHL 5,46fh 27,3hi 23,33eg 6e 1,67c 5,33di 0,8kl 4,33f 18,67ef 2,33j 0,68ab 0,15cf
DGA 7,98dg 38bf 34ae 9,67be 1,67c 3i 1,37dg 5,33ef 27ac 3,33ij 0,71a 0,17ce
DGB 5,78fh 37,82cf 31,89af 11,42ac 2,79ac 9,72a 1,36dg 9,24ab 24,15bd 7,9ac 0,64ac 0,24c
DGD 7,84a 33,53fi 31,78eg 11,56ac 4ac 4,67ah 1,26fk 6cf 23,78be 4,22gi 0,71a 0,16cf
DNR 11,89ac 43,53ad 35,8ae 9,21be 4,32ac 7,8af 2,25b 7,44be 23,84be 6,11bg 0,55bc 0,19cd
DGZ 6,2eh 32,42fi 29,38bg 8,42ce 3,27ac 7,73af 0,51l 6,5cf 22,43ce 5,02ei 0,69ab 0,08g
FER 7,33dh 35dh 30,33ag 10,67bd 3,67ac 8,67ae 1,41dg 10a 24,67ad 7ae 0,7a 0,19cd
GHS 7,03eh 41,79ae 36,53ad 8,28ce 3,46ac 6,5ai 2,43b 5,81df 23,66be 5,67dg 0,57bc 0,35b
GHZ 5,55fh 33fi 28,4cg 6,37e 2,33ac 6,33ai 1,13fk 4,33f 21,03df 3,33ij 0,64ac 0,2cd
HAL 5,21gh 32,59fi 26,69dg 8,9ce 3,12ac 8,1af 1,02hk 8,51ac 22,43ce 7,5ad 0,69ab 0,19cd
HAM 7,21eh 36,4dg 29,6ag 7e 3,6ac 4,2hi 0,9k 5,37ef 23,33be 4,82fi 0,64ac 0,12dg
HRR 10,16bd 41,5ae 36ae 7,5ce 4ac 7,5ag 1,13gk 8ad 23,75be 7ae 0,57bc 0,11eg
ITM 7,93dg 34,62eh 29,21cg 10,43bd 3,03ac 9,03ab 1,26eh 9,47ab 21,68de 8,42a 0,63ac 0,16cf
KSB 8,81cf 36,7cg 31ag 11ad 4,33ac 9,33ab 1,58cd 9,67ab 25,33ad 8,33a 0,69ab 0,18ce
LMS 6,25eh 36,31dg 30,37ag 11,16ad 3,03ac 8,11af 1,11gk 8,62ac 21,97ce 7,86ac 0,6bc 0,18ce
MDG 4,17h 31,06fi 26,51dg 9,2be 2,33bc 6,92ai 2,82a 7,48be 20,46df 6,82af 0,66ac 0,68a
SAF 10,34bd 38,7bf 34,33ae 10,33bd 2,33bc 4,67fi 1,82c 6df 28ab 5ei 0,72a 0,18cd
SBL 8,62df 48,3a 40,63a 9,08ce 3,08ac 4,25gi 1,26ei 4,83f 29,7a 3,5hj 0,61bc 0,15cf
TCH 4,77h 26i 20fg 7,4de 2,33bc 7,83af 0,95ik 5,83df 16f 4,67fi 0,62ac 0,2cd
THW 6,74eh 33,18fi 26,81dg 10,26bd 3,38ac 8,86ac 1hk 8,89ab 20,21df 8,12ab 0,61bc 0,15cf
TJR 8,93ce 33,3ei 29,67ag 13ab 1,67c 6bi 1,49ce 8ad 24,33bd 6cg 0,73a 0,17ce
TNS 6,6eh 29,3gi 26,67dg 12ac 1,67c 5ei 0,9jk 4,67f 20df 3,33ij 0,68ab 0,14cg
TNT 8,08dg 26,54i 19,89g 14,46a 3,5ac 8,75ad 0,99ik 9,3ab 16,87f 8,3a 0,64ac 0,12dg
ZMM 8,67cf 39,7bf 26,33dg 8,67ce 2,33bc 6,33ai 1,08gk 4,67f 22,67be 3,83gj 0,57bc 0,12dg
En indices les groupes homogènes révélés par HSD test à p<0.05.
Cvs: Cultivars.
R: Paramètres reproducteurs.
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Chapitre 2 : Etude de la diversité morphologique des parties végétative et
reproductrice des principaux cultivars des Ziban
V2 0,28
V3 0,38 0,36
V12 0,15 0,26 0,03 0,49* -0,01 0,41 0,91 0,60 0,64 0,60 0,09
V13 0,16 0,33 0,14 0,31 -0,14 0,33 0,72 0,52 0,35 0,43* 0,04 0,63
V14 0,23 0,49 0,01 0,27 0,47* 0,42* 0,19 0,27 0,12 0,08 0,29 0,14 0,05
V15 0,20 0,30 0,21 -0,02 0,61 0,36 0,19 0,25 0,48* -0,03 0,55 0,10 -0,13 0,29
V16 0,36 0,44* 0,13 0,02 0,42* 0,15 -0,14 0,17 0,13 -0,17 0,30 -0,20 -0,27 0,60 0,45*
V17 -0,07 0,13 -0,34 0,02 -0,14 0,12 0,15 0,11 -0,19 0,38 -0,12 0,18 0,29 0,52 -0,38 -0,07
V18 -0,03 -0,07 -0,03 0,38 0,01 0,18 0,10 -0,02 -0,14 0,06 -0,23 0,18 0,08 0,40 -0,39 -0,25 0,35
V19 0,07 0,15 0,32 0,30 0,10 0,20 0,04 0,00 -0,13 -0,15 -0,18 0,02 0,28 0,26 -0,33 -0,24 0,15 0,65
V20 0,25 0,67 0,59 0,23 0,37 0,53 0,46 0,51 0,51 0,02 0,47* 0,26 0,36 0,25 0,40 0,20 -0,18 -0,08 0,24
V21 0,30 0,15 0,24 -0,11 0,37 0,52 0,17 0,26 0,46* 0,14 0,18 0,25 -0,06 0,12 0,55 0,14 -0,26 -0,07 -0,06 0,14
V22 0,46* -0,04 -0,09 0,00 0,34 0,17 0,17 0,10 0,01 0,03 0,27 0,13 -0,06 0,60 0,34 0,51 0,15 0,19 -0,07 -0,07 0,08
V23 -0,15 0,27 0,00 0,09 0,00 0,08 0,03 0,18 -0,10 -0,08 0,14 -0,15 0,22 0,42* -0,24 0,16 0,54 0,14 0,31 0,28 -0,47* -0,08
V24 0,14 0,51 0,09 0,32 0,45* 0,42* 0,13 0,17 0,26 0,17 0,11 0,25 -0,07 0,68 0,40 0,39 0,19 0,34 0,16 0,18 0,54 0,23 -0,19
V25 0,06 -0,07 0,40 -0,32 0,36 0,44* -0,11 0,09 0,30 -0,06 -0,21 -0,05 -0,14 -0,24 0,17 -0,09 -0,39 -0,01 -0,08 0,21 0,30 -0,22 -0,26 0,04
V26 0,10 -0,26 0,12 -0,29 0,27 0,32 -0,03 0,00 0,25 0,12 -0,06 0,10 -0,21 -0,25 0,33 -0,10 -0,38 -0,11 -0,25 -0,19 0,80 -0,04 -0,63 0,22 0,55
V27 0,21 0,27 0,39 -0,14 0,40 0,17 0,00 0,15 0,13 -0,34 0,43 -0,20 0,11 0,04 0,41 0,42 -0,34 -0,47 -0,11 0,35 0,16 0,06 0,22 -0,18 0,09 0,044
* Corrélation significative à un niveau de probabilité de 0.05. En gras Corrélation significative à un niveau de probabilité de 0.01.
51
Chapitre 2 : Etude de la diversité morphologique des parties végétative et
reproductrice des principaux cultivars des Ziban
R1 R2 R3 R4 R5 R6 R7 R8 R9 R10 R11 R12 R13 R14 R15 R16 R17 R18 R19 R20 R21 R22 R23 R24
R2 0,08
R3 0,27 0,55
R4 0,47 0,05 0,25
R5 -0,35 0,28 0,24 0,10
R6 0,42 0,21 0,14 0,10 -0,30
R7 0,48* 0,17 0,03 0,34 0,08 0,73
R8 0,48* 0,15 0,18 0,36 0,13 0,47* 0,71
R9 0,38 0,06 0,19 0,18 -0,18 0,45* 0,48* 0,34
R10 0,08 -0,01 0,33 0,00 -0,10 0,28 0,21 0,11 0,61
R11 0,16 0,06 0,33 0,23 -0,11 0,37 0,32 0,20 0,69 0,90
R12 0,51 0,19 0,36 0,43* -0,07 0,49 0,61 0,80 0,53 0,47 0,57
R13 0,34 0,19 0,17 0,01 -0,28 0,84 0,62 0,31 0,67 0,53 0,59 0,49
R14 0,28 0,14 -0,01 0,19 -0,13 0,52 0,42* 0,49* -0,12 -0,27 -0,12 0,27 0,20
R15 0,33 0,23 -0,03 0,19 -0,22 0,27 0,27 0,40 -0,07 -0,39 -0,22 0,27 0,00 0,72
R16 0,34 0,16 0,02 0,06 -0,32 0,35 0,22 0,37 -0,08 -0,32 -0,24 0,26 -0,02 0,65 0,91
R17 0,06 0,18 0,33 -0,03 0,02 0,22 0,06 0,11 0,19 0,49* 0,42 0,23 0,27 0,26 -0,06 0,00
R18 -0,07 0,21 -0,15 0,14 -0,13 0,19 0,10 0,09 -0,16 -0,28 -0,23 0,06 0,00 0,60 0,52 0,42* 0,12
R19 -0,25 0,41* 0,13 0,19 0,31 0,10 0,08 0,01 0,12 0,02 0,04 -0,02 0,18 0,14 0,01 -0,15 0,27 0,54
R20 0,67 0,33 0,31 0,57 -0,09 -0,03 0,15 0,19 0,03 -0,22 -0,11 0,25 -0,16 0,15 0,32 0,34 0,08 0,10 0,01
R21 -0,11 0,38 0,12 0,07 0,05 0,24 0,11 0,14 0,12 0,11 0,06 0,08 0,23 0,27 0,09 0,05 0,56 0,55 0,83 0,13
R22 0,33 0,13 -0,05 -0,13 -0,35 0,26 0,17 0,35 -0,01 -0,29 -0,24 0,22 -0,01 0,53 0,80 0,87 0,09 0,24 -0,26 0,28 0,03
R23 -0,08 0,40 0,08 0,10 0,09 0,14 0,13 0,16 0,16 0,12 0,08 0,13 0,20 0,22 0,11 0,02 0,49 0,57 0,84 0,19 0,95 -0,03
R24 -0,05 -0,23 -0,01 -0,49 -0,17 -0,06 -0,24 -0,18 0,10 0,24 0,03 -0,15 0,00 -0,40 -0,52 -0,25 0,23 -0,50 -0,39 -0,13 -0,10 0,10 -0,25
R25 0,29 0,32 0,33 0,37 0,11 -0,36 -0,19 -0,16 -0,05 -0,12 -0,10 0,00 -0,29 -0,43 -0,15 -0,11 -0,09 -0,22 -0,02 0,77 0,01 -0,13 0,09 0,06
*Corrélation significative à un niveau de probabilité de 0.05. En gras corrélation significative à un niveau de probabilité de 0.01.
52
Chapitre 2 : Etude de la diversité morphologique des parties végétative et
reproductrice des principaux cultivars des Ziban
Les variables qui ont contribué le plus à la formation de l’axe 1 composant ainsi un groupe
homogène à son extrémité positive sont : longueur de la palme (V2), largeur (V5) et épaisseur
du rachis (V6), nombre total des épines (V7), largeur (V8) et épaisseur de l’épine au milieu
(V9), nombre d’épines solitaires et celles groupées en deux (V11; V12) et longueur de la penne
au milieu (V20.
La représentation graphique des variables qui ont formé l’axe 2 montre l’existence de deux
groupes opposés de variables négativement corrélés entre eux. Le premier a défini les
paramètres de longueur de la partie épineuse (V4), nombre d’épines groupées en 3 (V13) et
groupements des pennes en 3 (V17). Le second est formé par les variables qui comprennent le
nombre de pennes solitaires (V15), largeur de la penne du milieu (V21), longueur (V25) et
largeur (V26) de la penne apicale. L’axe 3 a associé les caractères relatifs au nombre total de
pennes (V14) dont la majorité est groupée en deux (V16) en disposition retrose (V23). Ces
variables sont interdépendantes (Fig.7) et corrélées négativement à la longueur de l’épine du
milieu (V10).
53
Chapitre 2 : Etude de la diversité morphologique des parties végétative et
reproductrice des principaux cultivars des Ziban
La représentation graphique des cultivars étudiés sur les plans (F1-F2) et (F1-F3) est montrée
dans les Figures 7 et 8. La projection des cultivars sur le premier axe a distingué entre deux
groupes homogènes de cultivars qui s’opposent, le premier situé sur l’extrémité positive de
l’axe et est formé par Deglet Nour (DGN), Ghars (GHS) et Itima (ITM), le second comprend
quatre cultivars : Bouhlas (BHL), Halwa (HAL), Sbaa Laaroussa (SBL), Feraounia (FER),
Mech Degla (MDG) et Tichtat (TCH). Cette distinction met en relief un développement
végétatif plus important chez les cultivars du premier groupe décrit en particulier par les
descripteurs suivants : longueur de la palme (V2), largeur et l’épaisseur du rachis (V5 et V6),
nombre d’épines (V7), largeur (V8) et de l’épine au milieu (V9), nombre d’épine solitaires et
celles groupées en deux (V11 ; V12) et longueur de la penne au milieu (V20).
GHZ ITM
MDG V22
-0,5 TCH V6 DNR
V11V1
HRR
HAL KSBV16 V9
V27 ART
-1 V3 V5
V25 V21
-1,5 DGZ
V26 V15
-2
TNT
-2,5
THW
-3
-3,5 -3 -2,5 -2 -1,5 -1 -0,5 0 0,5 1 1,5 2 2,5 3
F1 (25,02 %)
Figure 7 : Projection des cultivars et des paramètres végétatifs sur le plan 1–2
(Abréviations en Tab. 2 et 4)
54
Chapitre 2 : Etude de la diversité morphologique des parties végétative et
reproductrice des principaux cultivars des Ziban
KSB V12
-1,5 GHZ V10
HAM
THW DNR
-2
-3 -2,5 -2 -1,5 -1 -0,5 0 0,5 1 1,5 2 2,5 3
F1 (25,02 %)
Figure 8 : Projection des cultivars et des paramètres végétatifs sur le plan 1-3
(Abréviations en Tab. 2 et 4).
De même, l’axe 3 définit deux groupes de cultivars distincts, Arechti (ART) et Ain Al Fas
(AFS) qui se caractérisent par un grand nombre de pennes (V14), de pennes groupées en deux
(V16) en disposition retroses (V23) à Ghazi (GHZ) et Kseba (KSB) où une longueur importante
des épines du milieu a été enregistrée (V10).
55
Chapitre 2 : Etude de la diversité morphologique des parties végétative et
reproductrice des principaux cultivars des Ziban
Les trois premiers axes de l’ACP totalisent 56.45 % de la variabilité existante. Ceci témoigne
d’un spectre de variation phénotypique appréciable des 25 descripteurs considérés de l’appareil
reproducteur des 26 cultivars objet d’étude.
Les variables qui ont contribué le plus à la formation du premier axe sont : longueur de la spathe
(R1), longueur de la partie de l’épillet sans fruits à la base (R6), au milieu (R7) et au sommet
du régime (R8), longueurs de l’épillet le plus long (R12) et le plus court (R13) ainsi que le poids
du fruit (R14). Selon leur représentation graphique sur le plan (axes 1-2) (Fig.9), ces variables
positivement corrélées entre elles forment un groupe homogène. Les caractères qui ont permis
l’explication de l’information portée par l’axe 2 se répartissent sur deux groupes homogènes
qui s’opposent. Le premier, positivement corrélé à l’axe 2, comprend les variables suivantes :
longueur de la partie de l’épillet avec fruits à la base (R9), au milieu (R10) et au sommet du
régime (R11). Alors que le second groupe, négativement corrélé à l’axe 2, est formé par les
paramètres des longueurs du fruit (R15) et de sa cavité (R16), l’épaisseur de la chair (R18) et
la longueur de la graine (R22). Les variables relatives aux diamètre du calice (R19), largeur
(R21) et épaisseur de la graine (R23) sont corrélées entre elles (Fig.10) et participent à la
formation du 3ème axe.
La projection des cultivars sur les plans (1–2) et (1–3) est donnée dans les Figures 9 et 10. Selon
le premier axe, une opposition entre Deglet Nour (DGN), Itima (ITM), Degla Baidha (DGB) et
Horra (HRR) et Bouhlas (BHL), à Deglet Ziane (DGZ), et TINIcine (TNC) a été notée sur la
base des caractères suivants : les longueurs de la spathe (R1), de la partie sans fruits de l’épillet
à différents niveaux du régime (R6, R7 et R8), de l’épillet le plus long (R12), de l’épillet le plus
court (R13) et le poids du fruit (R14).
56
Chapitre 2 : Etude de la diversité morphologique des parties végétative et
reproductrice des principaux cultivars des Ziban
TjR
2 R10
R11
DGB
TCH TNT R9
R13
1 TNS HAL
DGD
F2 (17,63 %)
ITM
R24 R3R17 R12
R6
R5 GHZ THW R21R23 R7
DGZ LMS R19
0
BHL ZMM R4 R2 R1 R8 DNR
R25 DGA
MDG
HAM R14
KSB GHS SAFR20
-1 HRR
R22
FER R18 R16
SBL
AFS R15 ART
-2
-3 -2 -1 0 1 2 3 4
F1 (24,56 %)
Figure 9 : Projection des cultivars et des paramètres reproducteurs sur le plan 1–2
(Abréviations en Tab. 2 et 5)
La deuxième composante principale a isolé Tijaaranit (TJR) dont la partie de l’épillet avec fruits
est la plus longue aussi bien à la base (R9), qu’au milieu (R10) et au sommet (R11) du régime
des cultivars, Ain El Fas (AFS), Arechti (ART), Feraounia (FER) et Sbaa Laroussa (SBL)
caractérisés par des fruits longs (R15) telles leurs cavités (R16) et les graines qu’ils contiennent
(R22), aussi une chair épaisse (R18). Le troisième axe a distingué un premier groupe composé
de Lemsaref (LMS), Kseba (KSB), Tantboucht (TNT) et Thawri (THW) dont les dattes ont un
calice de diamètre important (R19) et des noyaux épais (R23) et larges (R21) comme celui
caractéristique des dattes de Tantboucht (TNT) vu leur forme sphérique. Et un deuxième groupe
de cultivars comprenant Deglet Abdalla (DGA), Deglet Debbab (DGD) et Hamraya (HAM).
57
Chapitre 2 : Etude de la diversité morphologique des parties végétative et
reproductrice des principaux cultivars des Ziban
TCH
R25 HAL R3 R4
FF (14,27 %)
DGZ
HRR
0
R14
R10 R20
R13 R8
R11 R7
GHS
R24 SBL ZMM R9 R15 R6
R16
BHL R12 DNR
TNSGHZ R22
-1
R1
HAM
TjR
DGD
SAF
DGA
-2
-3 -2 -1 0 1 2 3
F1 (24,56 %)
Figure 10 : Projection des cultivars et des paramètres reproducteurs sur le plan 1-3
(Abréviations en Tabs. 2 et 5)
Cette méthode permet de regrouper les différents cultivars, objets de la présente étude, selon
leurs caractéristiques morphologiques végétatives et reproductrices, traitées séparément, dans
des classes ou clusters. Il se forme donc des groupes (ou classes) qui divergent tout en
contenant, chacun, des cultivars proches phénotypiquement.
Les cultivars restant forment le dernier cluster et partagent quelques traits qui renseignent sur
une largeur considérable de la palme (V3), un nombre réduit d’épines (V7) qui étaient en
majorité courtes (V10) et, tout comme les pennes, éparses (groupements des épine en 2 ;V12 et
en 3 ;V13, des pennes en 4 ;V17 et en 5 ;V18) ce qui a conduit à un indice d’espacement
important (V27). Soulignons que les cultivars ayant les niveaux de dissimilarité les plus bas ont
également été caractérisés par l’ACP et répartis dans des groupes homogènes.
1,4
1,2
1
Niveau de dissimilarité
0,8
0,6
0,4
0,2
0
ZMM
MDG
HAM
THW
TJR
DGD
DGA
TCH
DNR
DGB
HRR
KSB
FER
GHZ
BHL
SBL
DGZ
HAL
TNT
GHS
LMS
TNS
ART
SAF
AFS
ITM
Figure 11 : Classification ascendante hiérarchique (CAH) des cultivars basée sur les caractères
végétatifs (Abréviations en Tab. 2)
59
Chapitre 2 : Etude de la diversité morphologique des parties végétative et
reproductrice des principaux cultivars des Ziban
développé avec de longue spathe (R1), de grand régime contenant un nombre élevé d’épillets
(R5) et de longueurs importantes de la partie ramifiée (R4) et des parties sans fruits d’épillets
aux trois niveaux (R6, R7, R8). D’autre part, des caractéristiques intéressantes des dattes à
savoir le poids (R14), la longueur (R15) et l’épaisseur de la pulpe (R18) ont été observées
conduisant ainsi à un faible ratio de longueur noyau/ longueur fruit (R24).
Une grande variabilité a été notée au sein du deuxième cluster qui a comporté trois subclusters
dont un est monophylétique composé uniquement par le cultivar MECH DEGLA (MDG). Les
douze cultivars inclus expriment quelques traits similaires renseignant ainsi sur de courtes
parties avec fruits à différents emplacements sur les épillets (R9, R10, R11) et d’important ratio
de longueur du noyau/longueur du fruit (R24) et de poids (R25). Enfin, les principales
caractéristiques du dernier cluster, qui était le plus homogènes, étaient une longueur réduite de
la partie ramifiée du régime (R6, R7, R11, R12) contenant un faible nombre d’épillets (R5) et
relativement de petites dattes en considérant certaines dimensions des fruits et noyaux (R15,
R16, R22). Au sein de ce groupe le plus faible indice de dissimilarité a lié entre Feraounia
(FER) et Kseba (KSB) avec d=0,036 et Lemsaref (LMS) et Thawri (TWR) avec d=0.047. La
répartition de tous les cultivars en clusters concorde avec celle établie par l’ACP réalisée
précédemment.
1,2
1
Niveau de dissimilarité
0,8
0,6
0,4
0,2
0
ZMM
MDG
HAM
THW
DGA
DGD
DGB
DNR
HRR
DGZ
HAL
GHZ
LMS
BHL
TCH
ART
GHS
KSB
TNT
TNS
SBL
FER
AFS
SAF
ITM
TjR
Figure 12 : Classification ascendante hiérarchique (CAH) des cultivars basée sur les caractères
reproducteurs (Abréviations en Tab. 2)
60
Chapitre 2 : Etude de la diversité morphologique des parties végétative et
reproductrice des principaux cultivars des Ziban
4. Discussion
Nos résultats ont mis de la lumière sur des variations d’ordre phénotypique liées aussi bien à la
partie végétative qu’à la partie reproductrice des cultivars étudiés. Ces variations ont comme
origines la grande hétérogénéité génotypique et les conditions environnementales qui varient
entre les sites de collecte. En effet, de nombreux auteurs ont rapporté l'influence de
l'environnement sur la croissance du palmier dattier, en particulier sur les caractéristiques du
fruit (Al Noimi et Al-Amir, 1980 ; El Arem et al., 2011; Hasnaoui et al., 2011). Des études
antérieures ont été réalisées en faisant appel à des marqueurs morphologiques quantitatifs et
qualitatifs (Mason, 1915; Elhoumaizi et al., 2002; Rizk et al., 2007; Ould Mohamed Salem
et al., 2008; Rhouma et al., 2010 ; Ould Mohamed Ahmed et al., 2011; Hannachi, 2012
Simozrag et al., 2016 ; Bedjaoui et Benbouza, 2018).
De très fortes corrélations entre les caractères impliqués dans l’expression de la vigueur de la
plante ont été trouvées. La longueur de la palme définie par la longueur de sa partie épineuse a
besoin d’un fort rachis, dont la largeur et l'épaisseur étaient fortement corrélées, pour porter le
nombre important de pennes trouvé. La longueur de la palme était associée à la longueur de la
foliole. Les pennes tout comme les épines se sont comportées de la même manière de sorte
qu’en augmentant de nombre, les groupements de deux (qui sont les plus fréquents) ou de trois
ou plus deviennent également plus nombreux. Aussi, les paramètres liés à la partie épineuse
exprimaient la même tendance. Ainsi, le nombre et la densité des épines renseignent sur leur
puissante exprimée à travers d’importantes valeurs d’épaisseur et de largeur. De plus, la
présence des pennes solitaires a été étroitement liée à celle des épines solitaires. Les différents
organes, entre autres la partie ramifiée, qui forment la spathe ont des dimensions
proportionnelles à la sienne. Les longueurs des épillets aux différents niveaux du régime
(sommet, milieu et à la base) étaient proportionnelles à leurs positions sur ce dernier. De ce fait,
l’épillet le plus long a été localisé au sommet au moment où le plus court à la base. Le même
constat a été fait pour les caractéristiques du fruit de sorte que les dattes lourdes d’un poids
61
Chapitre 2 : Etude de la diversité morphologique des parties végétative et
reproductrice des principaux cultivars des Ziban
élevé (R14) avaient des longueur et largeur importantes de même que leurs cavités et chairs qui
étaient épaisses. C’est le cas des dattes des cultivars ARECHTI (ART) et AIN EL FAS (AFS)
connus comme des fruits de gros calibre par la population locale. En se référant à nos résultats
ces dattes se trouvent souvent sur des épillets dont la partie avec fruits est très courte.
Les résultats de l’analyse en composantes principales ont montré que parmi les 27 traits
végétatifs utilisés dans cette étude dix se sont révélés très discriminants. Ces paramètres
concernaient la longueur de la palme (V2), l’épaisseur du rachis (V6), le nombre d’épines (V7),
la largeur de l’épine du milieu (V8) et son épaisseur (V9), la longueur de la penne du milieu
(V20), la largeur de la penne apicale (V26), le nombre de pennes (V14) et leurs groupements
(en 2 ; V16 et 3 ; V17).
En se basant sur les 25 descripteurs de l’appareil reproducteur traités, douze caractères des fruits
et régimes ont permis une meilleure différentiation des cultivars à savoir : les longueurs des
parties de l’épillet avec et sans fruits à la base, au milieu et au sommet du régime (R6, R7, R8,
R10, R11), de l’épillet le plus long (R12), des poids (R14) et longueur (R15) du fruit et de sa
cavité (R16), du diamètre du calice (R19), de la largeur (R 21) et de l’épaisseur du noyau (R23).
Des résultats similaires ont été obtenus dans des études sur la diversité génétique des collections
de palmier dattier aux Maroc et Mauritanie (El-Houmaizi et al., 2002 ; Ould Mohamed Salem
et al., 2008 ; Ould Mohamed Ahmed et al., 2011).
Il faut souligner, toutefois, l’existence d’autres traits tels que les groupements des épines (en
2 ;V12 et en 3 ;V13) et ceux des pennes (en 2 ;V16 et en 3 ;V17), longueur de l’épillet le plus
long et celle de l’épillet le plus court (R12, R13), longueurs des parties de l’épillet avec et sans
fruits aux différents niveaux du régime (R6, R7, R8, R9, R10 and R11), qui se sont également
révélés, dans cette étude, des descripteurs discriminants pouvant être employés pour une
caractérisation plus précise des cultivars.
Par l’emploi de la classification hiérarchique ascendante, les cultivars seront regroupés sur la
base de leur similitude. Dans cette présente étude, le dendrogramme établi en tenant compte
des caractéristiques reproductrices révélait des distances relativement plus importantes entre les
cultivars (intervalle du niveau de dissimilarité plus large) renseignant ainsi sur une diversité
génétique plus importante dans cette partie de la plante. En effet, les agriculteurs font appel plus
fréquemment aux dattes pour distinguer entre les cultivars qu’aux palmes.
62
Chapitre 2 : Etude de la diversité morphologique des parties végétative et
reproductrice des principaux cultivars des Ziban
Comme il peut être constaté à travers nos résultats, certains cultivars appartenaient au même
cluster en considérant aussi bien l’appareil végétatif que reproducteur ce qui exprime une très
grande ressemblance phénotypique entre eux. Ainsi, Halwa (HAL) et Deglet Ziane (DGZ)
étaient les cultivars les plus similaires dans l’échantillon étudié vu leur groupement dans les
mêmes clusters avec des niveaux de dissimilarité parmi les plus bas pour l’appareil végétatif
(d=0.087) et reproducteur (d=0.085). Le même cas a été noté pour les cultivars Degla Baidha
(DGB), Deglet Nour (DGN), Itima (ITM) et Horra (HRR) répartis dans les mêmes groupes. Ces
résultats permettent de mettre en relief la relation existante entre les deux parties précitées, de
sorte que les palmes longues et denses nécessitent un rachis épais pour porter de grands régimes
et dattes de caractéristiques très intéressantes. Par ailleurs, lors de la sélection de génotypes
pour l’utilisation dans un programme d’amélioration, ces derniers cultivars pourraient être
exploités directement comme des cultivars potentiellement productifs ou en qualité de géniteur
dans de croisements en vue de créer ou d’améliorer de nouveaux cultivars renfermant des
caractères désirables.
En outre, il faut noter que la répartition des cultivars en groupes homogènes s’est faite
indépendamment de la classe de leurs dattes. Degla Baidha (DGB) et Itima (ITM) partageaient
plusieurs caractéristiques relatives aux palmes et dattes malgré leurs différences en termes de
couleur et de consistance. En effet, les dattes de Itima (ITM) sont molles de couleur dorée
marron alors que celle de Degla Baidha (DGB) sont sèches et beiges. Ceci n’exclut pas le fait
que beaucoup d’autres cultivars dont les dattes ont la même consistance étaient groupés par les
deux dendrogrammes élaborés.
63
Chapitre 2 : Etude de la diversité morphologique des parties végétative et
reproductrice des principaux cultivars des Ziban
palmes de Ghars (GHS) et Itima (ITM) comme étant les plus longues leur conférant ainsi un
aspect retombant facilement reconnaissables par les phoeniciculteurs. Egalement, les palmes
courtes et le faible nombre d’épines majoritairement solitaires distinguent Mech Degla (MDG)
des autres cultivars. D’habitude, les descripteurs végétatifs sont les premiers perçus par les
phoeniciculteurs puisqu’ils concernent l’aspect général de la plante, ils permettent, en
particulier, la distinction entre les différents cultivars en dehors de la période de fructification.
Bien entendu, les caractères reproducteurs sont, à leur tour, utilisés pour la différenciation entre
les cultivars notamment ceux correspondants à la spathe et au fruit. Ils sont généralement plus
facilement détectables. Deglet Nour (DGN) possède, en se référant à nos données, la spathe la
plus longue avec 101.33cm qui est une caractéristique de ce cultivar sur laquelle se basent les
agriculteurs pour le distinguer et identifier les pieds mâles correspondant à ce même cultivar.
Dans les palmeraies, le fruit est l’organe le plus utilisé dans la reconnaissance des différents
cultivars puisqu’il renferme le plus grand spectre de variations morphologiques perceptibles de
la part des agriculteurs. Parmi ses plus importants descripteurs nous citons la taille des dattes.
Le cultivar Tijaaranit (TJR) dont la partie de l’épillet avec fruits est la plus importante générant
ainsi de petits fruits s’oppose à Sbaa Laroussa (SBL) avec ses dattes élancées et très longues
comme l’indique son nom où “SBAA” (en arabe) signifie ”doigt”. Ce dernier cultivar est groupé
avec Ain El Fas (AFS), Arechti (ART) et Feraounia (FER) dont les dattes sont comptées parmi
les plus volumineuses dans cette zone. Aussi, de petites dattes sont observées chez Tichtat
(TCH) vu, entre autres, la charge de son régime qui contient le plus grand nombre d’épillets
avec une longueur importante de la partie ramifiée.
5. Conclusion
Outre les différences très significatives dans l’expression des caractères, l’analyse multivariée
a permis une caractérisation plus détaillée des cultivars en mettant en évidence des descripteurs
révélés, par la présente étude, très discriminants et qui peuvent servir dans la reconnaissance
des cultivars. Cette reconnaissance qui décline suite à la perte des savoirs et savoir faires locaux
tissés pendant des siècles autour du palmier dattier et aussi à l’extinction progressive de la
64
Chapitre 2 : Etude de la diversité morphologique des parties végétative et
reproductrice des principaux cultivars des Ziban
majorité des cultivars considérés par les agriculteurs comme étant de « seconde importance». Il
est également question de perte de matériel végétal portant des caractéristiques non explorées
et encore moins exploitées par la recherche et qui peuvent s’avérer, dans certains cas,
intéressantes. Bien qu’on considère souvent comme ambitieux les travaux qui visent à dresser
des programmes d’amélioration sur la base de traits végétatifs chez le palmier dattier vu son
long cycle de vie et sa dioïcie. Mais cela n’exclut en aucun cas l’intérêt d’avoir par exemple
une palme moins dense sans léser le rendement photosynthétique et moins épineuse pour ne pas
peiner le grimpeur. De même pour les caractères reproducteurs, il serait intéressant d’avoir un
régime porté par un long pédoncule pour y faciliter l’accès et qui contient un nombre important
d’épillets avec une partie avec fruits bien développée sans pénaliser pour autant la qualité des
dattes produites. Pourtant des progrès sur d’autres arbres fruitiers visant l’amélioration de
l’architecture de l’arbre méritent d’être mentionnés à l’image des pêchers nains et demi-nains
dont les fleurs se situent vers l’extérieur des branches. Il y a aussi lieu de souligner les tentatives
de mécanisation comme solution pour contourner la complexité de la conduite du dattier mais
qui font encore leurs premiers pas en raison de la méfiance des phoeniciculteurs, le degré de
fiabilité de l’outil, la praticabilité à l’intérieur des palmeraies, le prix de revient…etc
Par ailleurs, il est illusoire de parler d’une diversité génétique durable en raison de la faible
fréquence des cultivars à l’exception de DEGLET NOUR, GHARS, MECH DEGLA et
DEGLA BAIDHA. Ce qui rend urgent l’élaboration de stratégies pour la création de banques
de gènes et le recours à la conservation in situ à travers l’établissement de collections renfermant
la biodiversité existante et faire appel aux méthodes in vitro pour la production de rejets des
cultivars rares et vieux. En outre, les phoeniciculteurs devraient être encouragés, à leur tour, par
les autorités politiques à créer un peu de biodiversité dans leurs propres palmeraies par
l’épanouissement du marché des dattes autres que DEGLET NOUR à travers la recherche de
nouvelles voies de valorisation.
65
Chapitre 3 : Etude de la diversité chimique des dattes
des principaux cultivars des Ziban
Chapitre 3 : Etude de la diversité chimique des dattes des
principaux cultivars des Ziban
1. Introduction
Depuis plus de 6000 ans, les dattes nourrissent les populations du désert (Amer, 1994) qui
trouvaient dans les dattes un aliment disponible, d’une très grande valeur énergétique, qui se
conserve et dont les vertus alimentaires et thérapeutiques sont innombrables et continuent
encore de faire l’objet de plusieurs études et de découvertes (Lambiote, 1982 ; Duke, 1992);
Vayalil, 2002 ; Miller et al., 2003).
La composition chimique des dattes est bien documentée (Sawaya et al., 1983; Ahmed et
al.,1995; Al-Hooti et al., 1995; Al-Shahib et Marshall, 2003; Ismail et al., 2006 ; El-Arem
et al., 2011) ). La pulpe de la datte est constituée de sucres facilement digestibles (56.8-
88.6%), formés principalement de glucose, fructose et saccharose, de lipides (0.1-1.4%), de
fibres (3.57-10.9%), de vitamines, de minéraux et de protéines (Al-Farsi et Lee, 2008). Selon
ces mêmes auteurs, la consommation de cent grammes de dattes peut fournir plus de 15% des
besoins journaliers en sélénium, cuivre, potassium et magnésium. Les dattes contiennent vingt-
trois acides aminés dont quelques-uns ne se trouvent pas chez les autres fruits couramment
consommés (Al-Shahib et Marshall, 2003). Comparés au pulpe, le noyau renferme des
quantités de protéine, lipide et fibre supérieures, son contenu en éléments minéraux n’étant pas
négligeable (Al-Farsi et al., 2005a; Al-Farsi et Lee, 2008).
L’Algérie est parmi les pays les plus riches en termes de diversité génétique du palmier dattier.
Mais nous assistons aujourd’hui, d’une part, au déplacement voire l’abandon des autres
cultivars qualifiés ‘d’importance secondaire’ et dont les dattes sont dites ‘communes’ et d’autre
part, à la disparition des savoirs et savoirs faires liés à la culture du palmier dattier et l’utilisation
de ses différents organes. Donc, au vue de ce qui précède, la valorisation des dattes locales non
commercialisées à grande échelle est parmi les moyens qui pourraient aider à atténuer l’impact
de l’érosion génétique constatée chez le palmier dattier et qui ne peut être envisagée sans une
étude préalable de leurs caractéristiques notamment chimiques.
En Algérie, les travaux sur l'étude de la composition chimique des dattes se sont orientés, en
partie, vers la description, la caractérisation variétale et l’évaluation de la qualité des dattes des
67
Chapitre 3 : Etude de la diversité chimique des dattes des
principaux cultivars des Ziban
cultivars (Acourene et Tama, 1997 ; Acourene et al., 2001, Belguedj, 2002 ; Chibane et al.,
2007 ; Acourene et al.,2014 ; Noui et al., 2014; Gourchala et al., 2015).
La diversité génétique au sein des palmeraies est généralement détectée à deux niveaux : entre
les cultivars (intervariétale) ou à l’intérieur d’un même cultivar (intraclonale), elle a des origines
génétiques et/ou environnementales. Les caractéristiques chimiques des dattes peuvent varier
largement d’une oasis à une autre selon le cultivar, le type de sol, le climat, les pratiques
culturales…etc. En effet, le concept de l’origine géographique a été évoqué par Booij (1992)
pour expliquer les différences existantes dans la composition chimique des dattes de quelques
cultivars récoltés de plusieurs pays dont Deglet Nour. La connaissance des changements d’ordre
quantitatif et qualitatif qui affectent les caractéristiques chimiques des dattes en réponse aux
variations de facteurs extrinsèques permet de mieux gérer les paramètres de leurs productions
et conditionnement.
D’autre part, la caractérisation variétale sur la base de la composition chimique des dattes
permet non seulement d’optimiser les processus de leurs transformation et valorisation, mais
aussi le recueil d’informations pour des utilisations ultérieures notamment en ce qui a trait aux
procèdes biotechnologiques et l’élaboration de nouveaux produits. Ces variables utilisations
seront facilitées par un regroupement des cultivars de caractéristiques proches en classes bien
définies.
C’est dans ce contexte que nous avons tracé l’objectif de notre étude qui a porté sur 63
échantillons de dattes dont 40 cultivars, trois cultivars dérivés, trois issus de graines apparentés
à des cultivars bien connus, et un cas de synonymie, provenant de sept communes différentes
de la wilaya de Biskra. Il s’agit en l’occurrence de mettre en exergue la diversité chimique des
dattes de ces cultivars qui sont comptés parmi les plus répandus dans la région des Ziban à
travers la caractérisation chimique de leurs dattes permettant ainsi de les distinguer et de les
classer dans des catégories dont les caractéristiques de chacune d’entre elles seront définies.
Cette étape de caractérisation pourrait constituer un outil d’aide à la prise de décision en ce qui
concerne la valorisation et l’élaboration de programmes de sélection et de sauvegarde du
patrimoine phoenicicole national.
68
Chapitre 3 : Etude de la diversité chimique des dattes des
principaux cultivars des Ziban
2. Matériel et méthodes
2.1. Choix des cultivars
Notre étude a porté sur les dattes de cultivars de palmier dattier (Phoenix dactylifera L) comptés
parmi les plus fréquents dans la wilaya de Biskra. Au total 63 échantillons de dattes (Tabl.10)
ont fait l’objet de cette étude comprenant les dattes de 40 cultivars parmi lesquels les dattes de
13 cultivars sont récoltées sur 2 à 3 pieds (les dattes de chaque pied étant considérées comme
une répétition) provenant de communes différentes ; trois cultivars « dérivés » de cultivars
connus (Kseba et Ksebet Mira, ajoute le 3 noms ) ; trois cultivars « issus de noyaux » (Deglet
Nour, Noyet Deglet Nour et …..) et un cas de synonymie (Deglet Abdalla et Rotbet Abdalla).
Notons que nous nous sommes basés sur le savoir des agriculteurs pour l’appellation et
l’identification des cultivars étudiés qu’eux-mêmes cultivent au sein de leurs palmeraies. Les
noms des cultivars « dérivés » et « issus de noyaux » sont donnés par les phoeniciculteurs sur
la base de rapprochement de leurs caractéristiques morphologiques à celles de cultivars connus.
Ces attributs décrivent les caractères les plus apparents. Ainsi, les dérivés représentent des pieds
qui associent des caractéristiques intermédiaires entre deux cultivars connus, par exemple le
cultivar Helwayett- Deglet Nour produit des dattes dont le gout et consistante ressemblent à
celles de Deglet Nour mais leurs tailles et formes sont celles caractéristiques des dattes du
cultivar Helwa (petites et ovoïde). Ces mêmes caractéristiques décrivent les dattes de Helway
et Hamra qui sont de couleur rougeâtre en concordance avec les dattes du cultivar Hamraya.
Pour les issus de noyaux, il s’agit de pieds présentant une vigueur prononcée en particulier en
ce qui concerne l’appareil végétatif (en comparaison au cultivar multiplié par rejet) mais dont
les dattes sont de qualité inférieure (plus petite généralement). C’est le cas de Noyet Deglet
Nour dont les dattes sont plus petites et un peu plus sèches.
Ces échantillons de dattes ont été prélevés de sept communes différentes : Ain Naga (1), Ain
Zaâtout (2), Chetma (3), Féliache (4), Foughala (5), Leghrous (6) et Sidi Okba (7). Nous avons
retenu les noms des cultivars tels qu’ils sont nommés par les phoeniciculteurs de chaque région
(par exemple Halwa, Halwaï, Helwaya). Dans le Tableau10 sont donnés les noms, codes,
communes de prélèvement des cultivars étudiés avec une abréviation en indice indiquant la
nature du matériel végétal qu’il s’agisse, selon le cas, de répétition, dérivé, issu de noyau ou
synonyme (Annexe 5).
69
Chapitre 3 : Etude de la diversité chimique des dattes des
principaux cultivars des Ziban
Figure 13: Exemple de dattes de cultivars étudiés dans la région de Ziban (Atia et Djenane,
2012).
70
Chapitre 3 : Etude de la diversité chimique des dattes des
principaux cultivars des Ziban
Les dattes étudiées ont été récoltées durant deux campagnes phoenicicoles 2012 et 2014 en
fonction de la disponibilité des échantillons à analyser. Pour chaque cultivar, une quarantaine
de fruits dépourvus de calice par régime, à diverses hauteurs et directions, ont été cueillis aux
stades de maturité ‘’Tamar’’. Les dattes ont été collectées, selon la disponibilité, sur 3 à 5
palmiers homogènes de la même parcelle. Elles ont été triées, nettoyées puis emballées dans
des sacs alimentaires en polyéthylène et stockées au congélateur à 0°C ± 1°C. De chaque
échantillon collecté par cultivar, trois cents grammes de fruits ont été prélevés pour la
préparation des échantillons à analyser (pâte).
71
Chapitre 3 : Etude de la diversité chimique des dattes des
principaux cultivars des Ziban
72
Chapitre 3 : Etude de la diversité chimique des dattes des
principaux cultivars des Ziban
Les paramètres concernés par cette étude sont : le pH, acidité titrable (AT), teneur en eau (H%),
sucres totaux (ST), sucres réducteurs (SR), saccharose (Sc), Cendres totales (Cd), taux des
solides solubles (TSS), éléments minéraux : Phosphore (P), sodium (Na), zinc (Zn) et cuivre
(Cu).
2.3.1. PH
Le pH de la pulpe des dattes est mesuré suivant la norme NF V05-108, 1970 suivant les
étapes citées ci-après :
Le titrage volumétrique se fait en prélevant 100 ml de l’échantillon pour essai et les verser dans
un bécher de 250 ml. Ajouter 0.5 ml de phénolphtaléine, tout agitant, verser la solution de
NaOH (0.1N) jusqu’à obtention d’une couleur rose persistant pendant 30 sd.
/ / /
73
Chapitre 3 : Etude de la diversité chimique des dattes des
principaux cultivars des Ziban
Elle est déterminée par la méthode Audigie et al., (1978) sur une partie aliquote de 5 g
d’échantillon étalé dans une capsule en porcelaine puis séché dans une étuve, à la pression
atmosphérique, à une température de 103± 2°C. La démarche est la suivante :
La teneur en eau est égale à la perte de masse subie dans les conditions de la mesure. Elle est
calculée par la formule suivant :
( / )
Le sucre total a été déterminé par la méthode réfractomètrique décrite dans AFNOR (1986)
selon le mode opératoire suivant :
74
Chapitre 3 : Etude de la diversité chimique des dattes des
principaux cultivars des Ziban
Pour la détermination de la teneur en sucre total, il faut appliquer une petite goutte de la prise
d’essai qui couvre uniformément aux instructions opératoires de l’appareil.
La méthode de Navarre (1974) est basée sur la réduction de la liqueur de Fehling par les sucres
réducteurs contenus dans l’échantillon.
Dans une première étape, étalonner la liqueur de Fehling à l’aide d’une solution de glucose à 5
%. Ensuite, par comparaison, on détermine la quantité des sucres contenue dans l’extrait de
datte.
75
Chapitre 3 : Etude de la diversité chimique des dattes des
principaux cultivars des Ziban
R=5 X N/ N’X F
La teneur en saccharose est obtenue par la différence entre la teneur en sucres totaux et les
sucres réducteurs présents dans l’échantillon.
I= ST/H%
Est égale au rapport de la teneur en sucres sur la teneur en eau des dattes. Le calcul de l'indice
"r" proposé par Munier (1961) permet d'estimer le degré de stabilité du fruit, jugé optimal si le
rapport "r" est égal à 2, et d'apprécier son aptitude à la conservation. Il conduit à classer les
dattes qui sont alors qualifiées de molles pour un rapport "r" inférieur à 2, demi molles pour "r"
compris entre 2 et 3.5 et sèches pour "r" supérieur à 3.5 (Reynes et al., 1994).
La détermination de la teneur en cendres par la méthode de Linden (1981) est basée sur la
destruction de toute matière organique sous l’effet de température élevée qui est de : 500°C.
Pour ce faire, il faut :
76
Chapitre 3 : Etude de la diversité chimique des dattes des
principaux cultivars des Ziban
Le chiffre obtenu est multiplié par 3. Notons que le réfractomètre doit être réglé au 0 avec de
l’eau distillée.
77
Chapitre 3 : Etude de la diversité chimique des dattes des
principaux cultivars des Ziban
- transférer les cendres dans un bécher de 100 ml et ajouter 5 ml Hcl (2N), couvrir d’un
verre de montre ;
- digérer à ébouillir doucement sur une plaque chauffante pendant 10 mn ;
- après refroidissement, ajouter 25 ml d’eau distillée, puis filtrer dans une fiole de 50 ml
et avec un papier filtre, ajuster avec l’eau distillée à 50 ml ;
- P : colorimétrie ;
- Na : photomètre à flamme ;
- Zn et Cu : spectrophotomètre d’absorption atomique.
2.4. Traitement statistique des données
Les valeurs représentées pour les différents paramètres étudiés constituent la moyenne de deux
répétitions. Les moyennes ont fait l’objet d’une étude des corrélations afin de comprendre la
nature des relations qui lient les paramètres et d’une analyse en composantes principales
(Taylor, 1990 et Jolliffe, 2002) dont l’objectif était de dégager les caractéristiques principales
des dattes sur le plan chimique, de déterminer les caractères les plus discriminants et de voir le
degré de convergence des cultivars génétiquement proches.
La répartition des cultivars en clusters sur la base de la composition chimique de leurs dattes a
été effectuée par l’emploi de la méthode de classification hiérarchique ascendante (CAH)
utilisant la méthode de Ward (Saracli et al. 2013). L’objectif étant de vérifier la proximité des
cultivars d’origine génétique proche et de définir les différentes classes auxquelles
appartiennent les dattes des cultivars étudiés. L’ensemble des analyses a été réalisé en utilisant
le logiciel XLSTAT version 2016.02.
78
Chapitre 3 : Etude de la diversité chimique des dattes des
principaux cultivars des Ziban
3. Résultats
L’ensemble des résultats de l’analyse chimique des dattes étudiées est présenté dans l’annexe
6.
Les valeurs du pH des dattes concernées par cette étude sont comprises entre 4.13 à 6.40
observées respectivement chez les cultivars Safraya (SAF3) et Ksebet Mira (KBM5) avec une
moyenne de 5.61±0.52 pour la totalité des échantillons. Les cultivars ayant les pHs les plus bas
sont : Hamraya (HAM1) et Halwa (HAL1) où des valeurs de 4.48 et 4.5 ont été enregistrées
selon le même ordre, (Fig. 14) les dattes de ces mêmes cultivars sont caractérisées par de très
faibles teneurs en eau et sont donc classées comme étant des dattes sèches. Alors que les dattes
représentant le pH le plus élevé a été relevé chez Rotbet Mâtoug (RTM7) avec une valeur de
6.33. Ces dattes contiennent une importante teneur en eau et classées comme étant des dattes
molles.
L'acidité titrable a varié entre les échantillons de dattes analysés (Fig.14) de 1.40 meq/100g
pour Mokh El Begri (MEB7) et 12.47 meq/100g pour Deglet Debbab (DGD3) avec une
moyenne de 4.8±2.33 meq/100g. Les plus faibles valeurs sont observées chez les dattes de
Noyet Dglet Nour (NDN7) avec une valeur de 2 meq/100g meq/100g, Sersara (SRS1) avec 2.3,
Sbaa Laaroussa (SBL7) avec 2.38 meq/100g et Elghazia (ELG5) avec 2.5 meq/100g. Les dattes
de ces derniers cultivars sont considérées en majorité comme des dattes molles. Le constat est
que quand l’acidité titrable a augmenté, selon nos résultats, en particulier chez Kseba (KSB6)
(10.49 meq/100g) et Helway (HEL7) (10.2 meq/100g), de faibles teneurs en eau ont été notées.
La teneur en eau contenue dans les dattes échantillonnées est comprise entre 9,6% et 38.6%
enregistrées chez les cultivars Halwa (HAL1) et Deglet Abdallah (DGA3) respectivement avec
une moyenne de 18.81±6.46 (Fig. 14). Les teneurs en eau maximales ont été notées chez
d’autres dattes à l’image de Ghars (GHS6 et GHS7) avec des taux de 33.6 et 33.7%. Les dattes
qui contiennent le moins d’humidité sont celles des cultivars Deglet Debbab (DGD3) avec
10.8% et Om Kentichi (OMK7) avec 11.2%.
79
Chapitre 3 : Etude de la diversité chimique des dattes des
principaux cultivars des Ziban
3.1.3. Sucres
La pulpe des dattes étudiées contient des teneurs importantes en sucres. Le taux des sucres
totaux, exprimé en pourcentage de la matière sèche, a varié entre 46.5% (Kseba ; KSB6) et
75.9% (Sokria ; SOK1) avec une moyenne de l’ensemble estimée à 64.25%±7.88 (Fig. 14). La
présence des sucres réducteurs (moyenne : 32.06±16,41%) était en équilibre avec celle du
saccharose (moyenne : 32.38±14.86%) dans l’ensemble de l’échantillon. Les dattes qui
contenaient le plus grand taux de sucres réducteurs étaient celles des cultivars Ghars (GHS1) et
Sarsara (SRS1) avec respectivement 68.61% et 67.44%. Ces mêmes dattes contenaient les
teneurs les plus basses en saccharose, enregistrées dans l’ensemble de l’échantillon, avec 1.39%
et 2 % respectivement. Les teneurs en sucres réducteurs ont baissé jusqu’à 4.6% dans les dattes
de Mech Degla (MDG5) et 4.7% dans les dattes de Horra (HRR3) qui sont comptées parmi les
dattes sèches riches en saccharose.
80
Chapitre 3 : Etude de la diversité chimique des dattes des
principaux cultivars des Ziban
L’estimation de l’indice de qualité "r", appelé aussi indice de dureté, permet de qualifier les
dattes étudiées de dattes molles ("r" < 2), demi-molles (2 < "r" < 3.5) et sèches ("r" > 3.5). La
moyenne de cet indice était de 3.76±1.36 dans notre échantillon. Selon nos résultats les dattes
de six cultivars ont été classées à texture molle à savoir : Deglet Abdallah (DGA3) : 1.30, Ghars
(GHS6) : 1.46, Itima (ITM3) 1.6 et Safraya (SAF3) 1.96 (Fig.14).
Notons toutefois, que des dattes déjà connues pour être molles ont enregistré des valeurs de
« r » légèrement supérieures à 2, à titre d’exemple nous citons Feraounia (FER6), Ghars (GHS7
et GHS1) et Hamraya (HAM5) avec des valeurs, données selon le même ordre, de 2.11, 2.13,
2.26, 2.27 et de 2.24.
Concernant la dernière catégorie à laquelle appartiennent les « dattes sèches », les valeurs
maximales de « r » sont relevées chez les cultivars Halwaï (HAL1), Mech Degla (MDG7) et
Degla Baidha (DGB1) avec des valeurs, données suivant le même ordre, de 7.65, 6.1 et 6.08.
Notons que notre étude a classé certaines dattes, considérées habituellement molles, comme
étant des dattes demi-molles avec des valeurs de « r » supérieures à 2 à l’image de Rotbet
Mâtoug (RTM7), Rotbet Abdalla (RTA7).
81
Chapitre 3 : Etude de la diversité chimique des dattes des
principaux cultivars des Ziban
La moyenne des teneurs en cendres des dattes étudiées était de 2.16±0.95g/100g de MS. Les
dattes renfermant des teneurs élevées sont, par ordre décroissant, celles de Tichtat (TCH5) avec
3.88g / 100 g de MS, et Deglet Ziane (DGZ5) avec 3.59g / 100 g de MS suivi par, Timdjouhart
(TMJ3) Deglet Nour (DGN5), Deglet Debbab (DGD3) avec des valeurs de 3.59, 3.57 et
3.56g/100g de MS respectivement (Fig.15). Les teneurs les plus faibles ont été enregistrées
pour Mokh El Begri (MBG7) avec 0.7g / 100 g de MS et Bouzerrou (BZR2) avec 0.82g / 100 g
de MS.
La valeur maximale du taux des solides solubles qui a été enregistrée dans les différentes dattes
est de l’ordre de 89.4% trouvée chez Degla Baidha (DGB1), suivi par Arechti (ART4) avec un
taux de 86.21%. Les dattes du cultivar Tinicine (TNC3) contenaient le plus faible TSS avec
23.4%. La moyenne estimée pour l’ensemble des cultivars était de 54.07±18.46% (Fig.15).
3.1.6.2. Sodium
La teneur en sodium exprimée en pourcentage par rapport à la matière sèche est comprise entre
12.59 mg/100g de MS pour les dattes de Lemsaref (LMS5) et de 41.16 mg/100g de MS pour
celles de Bouhlass (BHL1) avec une teneur moyenne de 22.01±7.41 mg/100g de MS toutes
dattes confondues (Fig.16). Globalement, le taux de sodium était relativement faible en
particulier pour Mech Degla (MDG5) avec13.21% et Tichtat (TCH5) avec 13.83%. Les cultivars
Helwaye (HEL7) et Safraya (SAF1) sont également comptés parmi les plus riches en sodium
avec 36.27 et 32 mg/100g de MS respectivement.
83
Chapitre 3 : Etude de la diversité chimique des dattes des
principaux cultivars des Ziban
84
Figure 15 : Taux des sucres totaux, sucres réducteurs, saccharose, teneur en cendres
et TSS
Chapitre 3 : Etude de la diversité chimique des dattes des
principaux cultivars des Ziban
3.1.6.3. Cuivre
Les teneurs en cuivre les plus élevées ont été observées dans les dattes de Tinicine (TNC3) avec
0.8 mg/100g de MS, suivi par Mech Degla (MDG5) et Horra (HRR3) avec 0.52 et 0.51%
respectivement. Des teneurs très faibles de l’ordre de 0.01 et de 0.02 % ont été enregistrées chez
une grande partie des cultivars, la moyenne de l’ensemble étant de 0.23±0.17% (Fig. 16).
3.1.6.4. Zinc
La moyenne de la teneur en zinc était de 0.28±0.21%. Des teneurs relativement faibles ont
caractérisé les dattes échantillonnées avec une limite inférieure égale à 0.01% observée chez
Helwayet Hamra (HHM1) (Fig. 16). Les cultivars Tantboucht (TNT5), Rotbet Mâtoug (RTM7),
Rotbet Abdalla (RTA7) et Kahlay (KHL1) ont également renfermé des taux très faibles en zinc
(0.03%) au moment où les dattes les plus riches en cet élément étaient celles de Bouhlass
(BHL7) et Degla Baidha (DGB1) avec 0.8%.
Notons que les valeurs mesurées, pour l’ensemble des paramètres étudiés, au sein d’un même
cultivar ont largement varié d’un individu échantillonné à un autre.
85
Chapitre 3 : Etude de la diversité chimique des dattes des
principaux cultivars des Ziban
86
Figure 16 : Taux de phosphore, sodium, zinc et cuivre dans les dattes étudiées
Chapitre 3 : Etude de la diversité chimique des dattes des
principaux cultivars des Ziban
3.2. Corrélations
En se référant au Tableau 11, nous observons des corrélations positives qui avaient lié l’acidité
titrable (AT) au saccharose (SC) et aux cendre (CD), le pH à l’humidité (H%), les sucres totaux
(ST) à l’indice de qualité (r), le saccharose (Sc) au TTS. Toutefois, les corrélations négatives
ont été plus observées notamment entre l’acidité titrable (AT) et les sucres réducteurs (SR), le
pH et l’indice de qualité (r), la teneur en eau (TE) et le saccharose (SC), le TSS ainsi que l’indice
de qualité (r). Une très forte corrélation négative a été observée entre le saccharose (SC) et les
sucres réducteurs (SR) avec r = - 0,866 (p < 0,0001). Ce dernier composant d’une part et le
sodium (Na) d’une autre part, sont inversement corrélés aussi bien aux cendres (Cd) qu’au taux
de cuivre (Cu) présent dans les dattes.
Param AT pH TE ST SC SR r TSS CD Na P Cu
-ètres
pH -0,287
TE -0,371 0,482
ST -0,087 -0,212 -0,301
SC 0,436 -0,132 -0,456 0,152
SR -0,454 0,006 0,263 0,354 -0,865
r 0,303 -0,541 -0,870 0,565 0,395 -0,074
TSS 0,279 -0,298 -0,398 0,298 0,641 -0,457 0,417
CD 0,323 -0,109 0,133 -0,107 0,305 -0,353 -0,117 0,173
Na -0,127 -0,164 -0,285 0,215 -0,140 0,254 0,238 -0,078 -0,439
P 0,069 -0,158 -0,290 0,152 -0,005 0,084 0,294 0,239 -0,195 0,184
Cu 0,185 0,179 0,211 -0,502 0,173 -0,416 -0,284 -0,042 0,364 -0,483 -0,205
Zn 0,194 0,119 0,056 -0,170 0,013 -0,109 -0,035 -0,093 -0,009 -0,332 0,248 0,192
En gras corrélation significative à un niveau de probabilité de 0.01.
87
Chapitre 3 : Etude de la diversité chimique des dattes des
principaux cultivars des Ziban
L’objectif de cette analyse est l’exploration de la variabilité inter et intra cultivars des dattes
récoltées de cultivars choisis parmi les plus fréquents, à partir de la diversité variétale existante
dans les différentes régions des Ziban sur la base de quelques caractéristiques chimiques des
dattes.
La projection des cultivars sur les plans 1-2 et 1-3 concerne les cultivars les plus contributifs
aux 3 premiers axes factoriels (Annexe 8). La variation observée dans l’axe 1 est expliquée par
la contribution positive de deux variables : pH et teneur en eau (TE) qui s’opposent par rapport
à ce même axe, aux variables de l’acidité titrable (AT), le taux de saccharose (SC), l’indice de
qualité (r) et le taux des solides solubles (TSS). Deux groupes de variables contribuent
inversement à la formation de la CP2, le premier situé sur son extrémité positive représenté par
les taux de cendre (Cd) et de cuivre (Cu), le deuxième est formé par les sucres totaux (ST) et
réducteurs (SR), et le taux sodium (Na). Les variables les plus contributives au troisième axe
factoriel se situent sur la même extrémité positive et sont le phosphore (P) et le Zinc (Zn).
A travers les Figures 17 et 18 qui permettent une visualisation synchrone des caractéristiques
chimiques des dattes et des cultivars leur correspondant, nous observons la dispersion de ces
derniers sur les plans ce qui renseigne sur une importante diversité existante du fait de leur
distance dans l’espace.
88
Chapitre 3 : Etude de la diversité chimique des dattes des
principaux cultivars des Ziban
Figure 17 : Projection des cultivars et des paramètres chimiques des dattes sur le
plan 1–2 (Abréviations en tableau 10)
résultats de L’ACP que nous avons obtenus ont permis la caractérisation chimique des dattes
de cinquante cultivars des soixante-trois étudiés en se basant sur treize paramètres.
Les cultivars les plus contributifs à la première composante principale sont répartis sur deux
groupes distincts, le premier situé sur l’extrémité positive et renferme Deglet Abdalla (DGA3),
Elghazia (ELG5), Ghars (GHS1 et GHS7), Itima (ITM3), Mokh El Begri (MEB7), Safraya
(SAF3), Sbaâ Lâroussa (SBL7), Tantboucht (TNT6) et Zommeret Mimoune (ZMM6). Les fruits
de ces cultivars sont de consistance molle contenant de grandes quantités d’eau et leur pH est
important. Par opposition à ce groupe, Bouhlass (BHL3), Degla Baidha (DGB1), Deglet Debbab
(DGD3), Ghazi (GHZ7), Halwaï (HAL1), Halwaya (HAL7), Helwayet Hamra (HHM1), Horra
(HRR7), Ksebet Mira (KSM5), Mech Degla (MDG 7), Sokria (SOK1 et SOK7) et Tichtat (TCH5)
forment un groupe homogène dont les principales caractéristiques sont la richesse en saccharose
89
Chapitre 3 : Etude de la diversité chimique des dattes des
principaux cultivars des Ziban
(Sc) et l’acidité titrable (AT) élevée en plus d’un indice de qualité (r) et important taux des
solides solubles (TSS) importants.
4
ELZ5
BHL7
HAL7
2 Zn
F3 (10,38 %)
DGB1 P
DGB4 GHS1
HEL7
1 NIT7
KSB6
DGD3 BHL3
AT
HRR3 LMS5THW5DGN5ELG5 GHS7
BHL1 BZR2 SBL7 ITM3
rHAL1 MDG5GHZ7Cu SRpH GHS 6
HAM5
NGH7
0 FER6
ART4 DGA3
DEG1 HDN7
OMK7 MEB7
TNS3TNT6 SAF3ZMM6
TSS TCH5 NaKSB7 H%
SCKBM5STDGZ5 SRS1TMJ3
NDN7CDITM7
HAM7 KHL1
HRR7 RTM7
-1 THW5
SAF1
MDG7 SOK1TMJ7
TJR3 RTA7
GHZ7 HAM1 TNT5
SOK7
HHM1
TCH5
-2
-4 -3 -2 -1 0 1 2 3 4 5
F1 (28,13 %)
Figure 18 : Projection des cultivars et des paramètres chimiques des dattes sur le
plan 1–3 (Abréviations en tableaux 10)
90
Chapitre 3 : Etude de la diversité chimique des dattes des
principaux cultivars des Ziban
La troisième composante principale est représentée par Bouhlass (BHL7), Elazouzia (ELZ5) et
Lemsaref (LMS5) caractérisés par des dattes très riches en phosphore (P) et Zinc (Zn)
contrairement à celles de Rotbet Abdalla (RTA7), Tichtat (TCH5) et Tantboucht (TNT5).
La classification ascendante hiérarchique des soixante-trois cultivars réalisée sur la base des
caractéristiques chimiques de leurs dattes (Fig.19) a permis la formation de quatre groupes
homogènes (troncature à 0.52%) selon la méthode de Ward et le critère d’agrégation de la
distance euclidienne. Nos résultats ont montré un important niveau de dissimilarité qui a varié
de 0.014 à 1.27 % et une variance intraclasse, de l’ordre de 60.31%, plus importante que la
variance entre les classes qui avoisine les 39.69%.
Le premier cluster (C1) comprend dix cultivars dont les caractéristiques principales sont la forte
teneur en eau (28.73% en moyenne), la dominance des sucres réducteurs (50% en moyenne), le
pH important et les plus faibles valeurs de l’indice de qualité ‘r’ et de l’acidité titrable. Les
cultivars les plus étroitement liés sont Deglet Abdalla (DGA3) et Itima (ITM3) avec d=0.0255
et Ghars (GHS1) et Ghars (GHS7) avec d= 0.0263.
Le second cluster (C2), comprenant dix-huit cultivars partage avec son précédent une
caractéristique qui est la faible quantité de sucres totaux contenues dans les dattes. Des taux
réduits de TSS ont également été observés dans ce groupe au moment où le saccharose (Sc)
était dominant. L’acidité titrable (AT) et le taux de cendre (Cd) sont les plus importants tout
comme la composition des éléments cuivre (Cu) et zinc (Zn). Les cultivars les plus proches
dans ce groupe sont Thawri (THW5) et Deglet Nour (DGN5) Mech Degla (MDG5) et Arechti
(ART4) avec une distance de 0.014 et 0.0144 respectivement.
Le troisième cluster est le plus grand avec ses vingt-huit individus parmi lesquels sont
enregistrés les plus bas niveaux de dissimilarité (d= 0.012 ; TNT5 et TCH5 et d= 0.018 ; ITM7
et HAM7), la teneur en eau moyenne des dattes est de 17.61% et est très proche du groupe
précédent. La présence des sucres réducteurs (SR) est plus marquée que celle du saccharose
(Sc), les cendres (Cd) et le zinc (Zn) ont enregistrés les moyennes les plus basses alors que le
sodium (Na) a été le plus important.
91
Chapitre 3 : Etude de la diversité chimique des dattes des
principaux cultivars des Ziban
Le dernier groupe est le plus petit et s’oppose au premier cluster par rapport à la majorité des
caractéristiques. En effet, les dattes des sept cultivars qui forment ce groupe sont les plus sèches
(teneur en eau %= 12.75%) avec un pH très faible (4.7) et contenant le plus grand taux de sucres
totaux (ST) avec une moyenne de 72.54% ce qui conduit à d’importantes valeurs observées de
l’indice de qualité ‘r’ et des TSS. Egalement le taux du phosphore (P) enregistré était le plus
grand. Les plus bas niveaux de dissimilarité ont été enregistrés entre Halway (HAL7) et Degla
Baidha (DGB1) et Halwaia (HAL1) et Horra (HRR7) avec 0.042 et 0.057 respectivement.
Les résultats de la classification ascendante hiérarchique ont permis la répartition les dattes des
cultivars en quatre classes différentes qui ont été définies sur la base des paramètres chimiques
suivants : la teneur en eau, l’indice de qualité ‘r’ et la balance entre saccharose et sucre
réducteurs. Ces classes se distinguent du point de vue consistance : dattes sèches, demi-sèches.
demi-molles et molles (Fig.19).
92
Chapitre 3 : Etude de la diversité chimique des dattes des
principaux cultivars des Ziban
GHS7
GHS1
SBL7
MEB7 C1 : Dattes molles
KHL1
ZMM6
GHS 6
ITM3
DGA3
SAF3
HRR3
BHL3
DGD3
TJR3
GHZ7
TCH'5
DGZ5
HAM5 C2: Dattes demi-sèches
FER6
MDG5
ART4
DGB4
TNC3
THW'5
DGN5
LMS5
TNT6
TMJ3
KSB6
HEL7
KSB7
HAM1
SRS1
OMK7
DEG1
BHL1
THW5
GHZ7
NGH7
ELG5
NIT7
BZR2
BHL7
RTM7
HDN7
ITM7
HAM7
SAF1 C3 : Dattes demi-molles
TNT5
TCH5
RTA7
TMJ7
SOK7
HHM1
SOK1
ELZ5
HRR7
HAL1
NDN7
MDG7 C4 : Dattes sèches
KBM5
HAL7
DGB1
Figure 19 : Classification ascendante hiérarchique (CAH) des cultivars basée sur les caractères
chimiques des dattes
93
Chapitre 3 : Etude de la diversité chimique des dattes des
principaux cultivars des Ziban
4. Discussion
Ce travail a été entrepris afin d’étudier la diversité chimique des plus importants cultivars de
palmier dattier dans différentes communes de la région des Ziban. Treize paramètres chimiques
ont été utilisés pour la caractérisation des dattes de soixante-trois échantillons dont 40 cultivars,
trois dérivés, trois issus de noyaux et un cas de synonymie. L’objectif principal étant la
contribution à une meilleure connaissance de la composition chimique des dattes dans la région
des Ziban tout en déterminant les paramètres les plus discriminants pour leur distinction et
valorisation.
Un très large spectre de variation dans la composition chimique des dattes étudiées a été mis en
évidence à travers les résultats que nous avons obtenus et dont les valeurs correspondent
globalement à celles trouvées dans les différentes études menées auparavant (Acourene et
Tama, 1997 ; Al-Shahib et Marshall, 2003 ; Ismail et al., 2006 ; Al-Farsi et al., 2008 ; Saafi
et al., 2008 ; El-Sohaimy et Hafez, 2010 Hasnaoui et al., 2011 ; El Arem et al., 2011 ; Ben
Ismail et al., 2013 ; Acourene et al., 2014). Ces études qui traitent de la caractérisation et
l’évaluation de la qualité des dattes, le plus souvent, dans une optique de valorisation des
ressources phytoénétiques du palmier dattier.
Nos résultats ont montré que les dattes sèches ont enregistré les pH les plus bas. De même, les
dattes molles ont observé les valeurs les plus faibles de l’acidité titrable (AT) qui a été maximale
au niveau des dattes sèches de Deglet Debbab (DGD31) avec une valeur de 12.47 meq/100g.
Des valeurs importantes d’acidité titrable (AT) ont été observées également chez les dattes des
cultivars Ahmar 2 (14 meq/100g) (Lemine et al., 2014) et Gargoda (12.4 meq/100g) (Elshibli
et Korpelainen, 2009).
Les dattes analysées ont montré une richesse en sucres totaux, en particulier chez les dattes de
consistance sèche, supérieures à celles trouvées chez certaines dattes de Tunisie (Ben Ismaïl et
al., 2013), du Bengladesh (Parvin et al., 2015). Pour le contenu en sucres totaux (maximum :
75.0%), les maximas que nous avons observés demeurent relativement faibles en comparaison
à ceux trouvés par d’autres travaux effectués en Algérie à savoir Bousdira (2007) (maximum :
93%) et Acourene (2014) (maximum : 89.34%). Toutefois, il est à souligner, que dans notre
étude, les dattes qui contenaient le plus grand taux de sucres totaux sont celles de Sokria (SOK)
et de Halwa (HAL), ce qui est en adéquation parfaite avec les appellations locales de ces
cultivars. L’appellation de Sokria (SOK) qui signifie ‘’sucré’’ indique l’importance du savoir
94
Chapitre 3 : Etude de la diversité chimique des dattes des
principaux cultivars des Ziban
local en terme d’appréciation du gout des dattes et comment les populations locales ont pu
spécifier les dattes de tels cultivars par un gout plus sucré par rapport aux autres dattes, qui sont,
généralement, toutes sucrées aux regards des autres personnes qui n’habitent pas les oasis. De
même, le cultivar Halwa (HAL) est assimilé vu son gout sucré, sa forme ovoïde et sa taille
petite à un bonbon (Halwa en arabe désigne un bonbon). Un cas similaire a été constaté chez
les dattes du cultivar Mauritanien ‘’Bou Seker’’ (sucré) qui contient un taux élevé en sucres
totaux estimé à 84% (Lemine et al., 2014).
Plus que la moitié des dattes analysées ont un indice de qualité (Munier, 1973) supérieur à 3.5
et sont ainsi de consistance sèche alors que seulement cinq sont des dattes molles ayant une
valeur du ‘r’ inférieure à 2. Au sein d’un même cultivar, les dattes des palmiers échantillonnés
de différentes oasis avaient majoritairement la même consistance (CV. Hamraya : HAM 1,
HAM5 et HAM7). Cependant, pour d’autres cultivars, une variation dans les valeurs du ‘r’
calculées répartis leurs échantillons dans deux classes différentes mais voisines, le ‘r’ ayant
selon le cas des valeurs très proches (cv. Ghars : GHS1, GHS6 et GHS7) ou très loin les unes des
autres (Degla Baidha : DGB1 et DGB4).
Les quantités de cendres (Cd) contenues dans notre échantillon sont de même ordre que celles
trouvées dans d’autres cultivars Algériens (Acourene, 20014 et Bousdira, 2007), Saoudiens
(Sawaya et al., 1983), Tunisiens (El Arem et al., 2011), Marocains (Hasnaoui et al., 2011) et
Iraniens (Sahari et al., 2007) et Soudanais (Sulieman et al., 2012).
Le taux de solides solubles (TSS) renseigne sur la richesse des dattes étudiées en matières
glucidiques. Au stade ‘tamr’ la datte contient le maximum de solides solubles (Sawaya et al.,
1983). Nos résultats ont révélé une étendue plus importante des valeurs des taux de solides
solubles (TSS) observées en comparaison avec les données bibliographiques (Mohamed et al.,
1983; Bousdira, 2007, Acourene et al., 2001).
Les dattes sont considérées comme une importante source d’éléments minéraux pour les
consommateurs. Les minéraux sont généralement importants en tant que constituants de
l'hémoglobine, des tissus mous, des os, des dents, des muscles et des cellules nerveuses (O'Dell
et Sunde, 1997). La consommation de 100 grammes de dattes fournit plus de 15% de l’apport
journalier recommandé pour le sélénium, le magnésium, le cuivre et le potassium et plus de 7%
de manganèse, de fer, de phosphore et de calcium (Al-Farsi et Lee, 2008).
95
Chapitre 3 : Etude de la diversité chimique des dattes des
principaux cultivars des Ziban
Les résultats de la composition minérale de notre échantillon de dattes ont montré une légère
variation en comparaison aux études précédentes. Leurs contenus en sodium bien qu’il soit de
même ordre que celui enregistré par Sawaya et al., (1983), Sahari et al., (2007) et Hasnaoui,
(2013), il reste inférieur aux maxima rapportés par Al-Farsi et Lee (2008).
Les quantités des éléments phosphore (P), zinc (Zn) et cuivre (Cu) des dattes étudiée²s sont
compatibles avec certaines données bibliographiques (Al-Farsi et Lee, 2008 ; Parvin et al.,
2015). Toutefois, le taux de phosphore (P) était plus faible que celui trouvé par Sawaya et al.,
(1983) et plus important que celui des dattes analysées par Hasnaoui (2013). Egalement, les
teneurs en cuivre (Cu) et zinc (Zn) étaient inférieures à celles observées par Sawaya et al.
(1983), Harrak et Boujnah (2012), Hasnaoui (2013) et Al-Shahib et Marshall (2003).
Notons que pour les cultivars où plusieurs pieds ont été échantillonnés de différentes oasis, des
variations notables dans la composition chimique ont été mises en évidences par nos résultats
et ce concernant la majorité des paramètres étudiés y compris ceux qui sont déterminants pour
la classification des dattes et l’évaluation de leur qualité (Hasnaoui, 2013 ; Lemine et al.,
2014). Ces différences ont concerné aussi bien les différents types de sucres que le pH et acidité
et aussi les éléments minéraux. Les travaux de Booij et al., (1992) ont montré la présence d’une
variation intraclonale significative en ce qui concerne les éléments minéraux contrairement aux
différents sucres (invertis et non invertis) contenus dans les dattes dont la variation était non
significative.
Le test de Pearson a révélé l’existence de corrélations très significatives entre les paramètres
chimiques étudiés. La diminution du pH a été associée à une augmentation de l'acidité titrable;
ces deux paramètres sont considérés par de nombreux auteurs comme des indicateurs de qualité
(Elshibli et Korpelainen, 2009 ; Harrak et Boujnah, 2012). En effet, Rygg (1948a) a indiqué
que les dattes ayant des valeurs de pH proches du neutre avaient une bonne qualité commerciale
alors que celles ayant une acidité élevée avaient une qualité de fruits médiocres. De sa part,
Hulme (1970), considère que l'acidité titrable permet et de manière pratique l'évaluation
commerciale des fruits. De plus, les dattes contiennent un certain nombre d'acides organiques
considérés comme contribuant à la saveur (Barreveled, 1993).
Egalement, la faible teneur en eau des dattes qualifiées de sèches sont caractérisées par un pH
acide (Rygg, 1948b) et une grande richesse en saccharose (Cook et Furr, 1953). Une forte
corrélation négative a été observée entre les teneurs en saccharose et de sucre réducteur dont la
96
Chapitre 3 : Etude de la diversité chimique des dattes des
principaux cultivars des Ziban
quantité est importante dans les dattes molles (teneur en eau supérieure à 35%) à faibles valeurs
d’acidité titrable. Ceci a été attribué à l'activité croissante de l'enzyme invertase qui hydrolyse
le saccharose en glucose et en fructose jusqu'à achèvement ou presque dans les cultivars à dattes
molles, mais l'hydrolyse n'est atteinte que partiellement chez les cultivars à dattes semi-sèches
/ sèches (Cook et Furr, 1953 ; Sawaya et al., 1983). En effet, Les dattes molles à humidité
importante contiennent des teneurs très minimes à nulles de saccharose à l'inverse des dattes
sèches et demi sèches qui se caractérisent par une teneur en saccharose importante (Hasnaoui,
2013). Nos résultats s’alignent avec ceux obtenus par Elshibli et Korpelainen (2009), El Arem
et al. (2011) et Hasnaoui, (2011).
L’analyse en composantes principales a permis de faire ressortir (en fonction de leurs valeurs
propres) les constituants chimiques des dattes les plus discriminants à savoir les éléments
suivants : phosphore (P), zinc (Zn) et cuivre (Cu), la teneur en eau (TE), le taux des sucres
réducteurs(SR) et non réducteurs (saccharose : Sc), l’indice de qualité (r), le taux des sucres
totaux (ST), le TSS, le pH et l’acidité titrable (AT). Cette forte discrimination justifie l’emploi
des composants en particulier ceux liés à la teneur en eau (TE) et aux sucres (ST, SR et Sc)
comme éléments de base dans la classification des dattes selon leurs consistances en dattes
molles, sèches et demi-molles (Munier, 1961 ; Mohamed et al., 1983 ; Estanove, 1990 ;
Reynes et al., 1994 ; Acourene et Tama, 1997 ; Cook et Furr, 1953).
97
Chapitre 3 : Etude de la diversité chimique des dattes des
principaux cultivars des Ziban
L’opposition des dattes de consistance molle et sèche a été mise en évidence par l’ACP. La
distinction a été basée sur les paramètres suivants : teneur en eau (TE), taux du saccharose (Sc),
le pH et l’acidité titrable. Ainsi, les dattes molles sont caractérisées par une teneur en eau très
importante de l’ordre de 38.6%, enregistrée chez Deglet Abdalla (DGA3), et une acidité titrable
(1.4 méq/100g), la plus faible dans cette étude, observée chez Mokh El Begri (MEB7) où le pH
le plus élevé a été enregistré (pH=6.1). De même, un taux de saccharose très réduit (1.39%) a
été noté dans les dattes Ghars (GHS1). Les cultivars avec des dattes molles sont les plus précoces
et les plus appréciées par la population locale, elles sont conservées sous forme de pâte (b’tana),
transformées en rob (confiture à base de dattes mais sans ajout de sucres) ou utilisées
ultérieurement (préparation de gâteaux ou traitements de certaines maladies comme la toux par
exemple et l’anémie). Les dattes des cultivars sèches ont également des vertus médicales non
négligeables, en plus du rob, elles sont broyées pour en produire de la poudre (rouina)
consommée directement (avec un liquide qu’il soit eau ou lait) ou indirectement en complément
pour la préparation de gâteaux ou de mélanges destinés aux femmes ayant des besoins
spécifiques (enceinte, allaitent etc.). Parmi les cultivars les plus représentatifs de cette classe
nous citerons Mech Degla (MDG7), Bouhlass (BHL3), Degla Baidha (DGB1), Halwaï (HAL1)
et Halwaya (HAL7). Ces résultats sont compatibles avec ceux obtenus par Elshibli et
Korpelainen (2009), qui expliquent la nette séparation des dattes molles et sèches, après une
ACP effectuée sur quinze cultivars du Soudan, par la discrimination liée aux taux de saccharose
et de matière sèche. D’autre part, Hannachi (2012) a souligné l’importance de la consistance
des dattes comme descripteur pour la discrimination entre les cultivars Algériens.
Par ailleurs et contrairement à d’autres études réalisées par Elshibli et Korpelainen (2009),
l’ACP n’a pas montré une opposition nette entre la présence, dans les dattes, de sucres
réducteurs et du saccharose ce qui nous amène à déduire, à la lumière de nos résultats, que ces
deux types de sucre seuls ne permettent pas de déterminer la consistance des dattes. D’autre
part, des quantités importantes de sucres réducteurs ont été observées chez les dattes de Kahlay
(KHL1) et Sersara (SRS1) avec des taux de 69.16 et 67.44%, respectivement, pourtant leurs
dattes contiennent des teneurs en eau qui ne dépassent pas les 18%. Des constats pareils ont été
98
Chapitre 3 : Etude de la diversité chimique des dattes des
principaux cultivars des Ziban
relevés par Acourene et Tama (1997), Hasnaoui et al. (2011) et Parvin et al. (2015). Aussi,
des travaux effectués en Mauritanie (Lemine et al., 2014) ont révélé des taux très élevés de
sucres réducteurs, allant jusqu’à 72.17% dans des dattes sèches du cultivar local Amsakhsi et
en Iran (Khan et al., 2008), les cultivars Rabee et Janshoor dont les dattes renferment des taux
d’humidité de 12.5% et 13.5%, respectivement, contenaient des taux de sucres réducteurs de
78.8% et 77% suivant le même ordre.
La variation intraclonale a été très marquée, exprimée à travers les différences importantes
observées dans les valeurs mesurées des paramètres étudiés, les cultivars ont été répartis par
l’ACP en différents groupes homogènes qui ne s’opposaient pas. C’est le cas observé, entre
autres, chez le cultivar Bouhlass dont les trois échantillons (BHL1, BHL3 et BHL7) de
provenance des communes de Ain Naga, Chetma et Sidi Okba, appartenaient à trois axes
différents renfermant ainsi des caractéristiques distinctes. Ceci n’a pas exclu l’appartenance aux
mêmes groupes homogènes, des échantillons de quelques cultivars à savoir Ghars (GHS1 et
GHS7), Sokria (SOK1 et SOK7) et Halwa (HAL1 et HAL7) où Halway et Hamraya (HHM7),
dérivé du cultivar Halwa était également compris. Beaucoup de facteurs sont responsables de
cette variation observée à l’échelle intra cultivar qui résulte, entre autres, du fait que ces
échantillons ont été prélevés de différentes communes dont les conditions pédoclimatiques
varient largement au même titre que l’entretien et la conduite technique appliquée dans les
palmeraies. En plus, de l’hétérogénéité de l’échantillonnage, le protocole et les erreurs de
manipulation ou de la fiabilité des appareils et produits utilisés peuvent être également à
l’origine de la variation observée.
Les résultats de la classification hiérarchique sont en concordance avec ceux de l’ACP. Ils ont
permis de répartir les cultivars étudiés et dont les dattes ont été récoltées de différentes
communes en quatre clusters. Les caractéristiques de ces derniers correspondent relativement
aux quatre classes proposées par Estanov (1990) qui a été essentiellement basée sur la teneur
en eau et le type de sucres dominants dans les dattes. Nos résultats ont eu la même tendance
sans pour autant révéler une absence totale de saccharose chez la catégorie de dattes molles
(C1) définie, selon ce même auteur, par un taux d’humidité compris entre à 35-65%. Les dattes
des deux classes intermédiaires de notre étude contiennent des taux d’humidité très proches
mais la tendance des teneurs en sucres était plus vers les sucres réducteurs pour les dattes demi-
molles (C3) et le saccharose pour les dattes demi-sèches (C2). Pour ces deux dernières classes
comme pour la classe des dattes sèches les limites inférieures de la teneur moyenne en eau que
99
Chapitre 3 : Etude de la diversité chimique des dattes des
principaux cultivars des Ziban
nous avons obtenues restent un peu plus faibles aux minima établis par Estanov (1990). Aussi,
le rapprochement observé dans le dendrogramme (Fig. 18) entre les catégories des dattes molles
(C1) et demi-sèches (C2) pourrait être dû aux taux très proches du contenu en sucres totaux.
La composition chimique des dattes peut varier en fonction du cultivar, des conditions du sol,
des pratiques agronomiques et des stades de maturation (Barreveld, 1993; Ahmed et al., 1995;
Al-Hooti, 1997; Myhara et al., 1999; Al-Farsi et al., 2005b; Ismail et al., 2006).
Pour certains cultivars tel que Ghars, les trois pieds échantillonnés (GHS1, GHS6 et GHS7) de
différentes communes ont été compris dans le même cluster (dattes molles ; C1) ce qui soutient
les résultats obtenus par Booij et al. (1992) qui n’ont observé aucune variation significative
dans les teneurs en sucres des échantillons de dattes appartenant à un même cultivar et
provenant de plusieurs sites. Pourtant une variation intraclonale importante a été observée pour
d’autres cultivars où des échantillons d’un même cultivar ont été groupés dans deux clusters
différents mais proches se répartissant ainsi sur deux catégories. Il s’agit en particulier des
catégories intermédiaires (dattes demi-sèches ; C2 et demi-molles ; C3) groupées par Munier
(1973) en une seule (dattes molles). C’est le cas par exemple des échantillons de Bouhlas
(BHL1, BHL3 et BHL7). Chez d’autres cultivars comme Degla Baidha (DGB1 et DGB4), les
échantillons ont été répartis sur les classes de dattes sèches (C4) et demi-sèches (C2) et ceux de
Safraya (SAF1 et SAF3) sur les clusters des dattes molles (C1) et demi-molles (C3). Un seul
cas a été enregistré chez Halwa (HAL1, HEL7 et HAL7) où les dattes des différents pieds
appartenaient à des classes éloignées à savoir celles des dattes sèches (C4) et demi-molles (C3).
Le même constat a été fait pour ce qui est du dérivé Helwayet Hamraya (HHM1), des
homonymes : Deglet Abdalla (DGA3) et Rotbet Abdalla (RTA7) et des issus de graines : Noyet
Deglet Nour (NDN7), Noyet Itima (NIT7) et Noyet Ghars (NGH7).
L’étude de la variation intraclonale à partir de la composition chimique a déjà été abordée par
d’autres études (Booij et al., 1992 ; Hasnaoui, 2013 ; Lemine et al., 2014) pour mettre en
relief les variations qui peuvent survenir dans la composition chimique des dattes d’un même
cultivar. Cette variation qui est en grande partie d’origine extrinsèque comprenant aussi bien
l’environnement que les techniques culturales adoptées et est aussi génétique, a été observée
dans les dattes issues d’un même cultivar provenant de différentes oasis. Elle n’a pas été
observée chez tous les cultivars. Ainsi, le changement de classes pour les dattes récoltées sur
plusieurs pieds au sein d’un même cultivar, mais de différentes oasis, n’a pas été observé chez
100
Chapitre 3 : Etude de la diversité chimique des dattes des
principaux cultivars des Ziban
le cultivar Boufeggous, mais s’est manifesté chez d’autres cultivars comme Assiane, Aziza
bouzid, Mejhoul et Deglet Nour qui a été récolté en Algérie et en Tunisie (Hasnaoui, 2013).
De même, le dendrogramme a regroupé, les deux répétitions du cultivar Lemdina dans le même
cluster contrairement aux trois pieds du cultivar Ahmar (Lemine et al., 2014). Soulignons que
pour ce dernier cultivar, les travaux de Ould Mohamed Salem et al., (2007) et (2008) ont
révélé l’existence de variations intraclonales moléculaires et morphologiques. Le cas des dattes
de cultivars connus comme Deglet Nour, Horra, Thoory, Hamra dont la composition chimique
a fait l’objet de plusieurs études (Mrabet et al., 2008 ; El Arem et al., 2011 ; Hasnaoui et al.,
2011 ; Ben Ismail et al., 2013) appuie indubitablement ce constat.
Ainsi, la classification des dattes selon la consistance dépend en premier lieu de la teneur en
eau, puisque l'inversion du saccharose en sucre réducteur (glucose et fructose) est en relation
avec la teneur en eau, la température ambiante et le type de cultivar. En fait, Elshibli et
Korpelainen (2009) et El Arem et al. (2011) expliquent que ces caractères sont fortement
affectés par l'environnement, le stade de maturation et le cultivar lui-même, ou par l'interaction
de ces facteurs qui peuvent affecter la composition qualitative et quantitative de la fraction
sucrée en altérant l'activité des enzymes responsables du processus de synthèse et de
décomposition. Pour la variation intraclonale exprimée par la composition minérale des dattes
d’un cultivar donné, nos résultats ont montré des différences très importantes au sein d’un
même cultivar, à titre d’exemple, les teneurs : en sodium (Na) chez Bouhlass (BHL1 et BHL3),
en cuivre (Cu) chez Ghars (GHS1 et GHS6) et en Zinc (Zn) chez le cultivar Tichtat (TCH5 et
TCH’5). Des résultats pareils ont été obtenus par Hasnaoui (2013) et Booij et al. (1992) qui
ont mis en évidence l’influence de l’origine géographique sur les teneurs des dattes en différents
éléments minéraux et considèrent ainsi que ces derniers ne peuvent constitués des marqueurs
fiables pour la caractérisation variétale chez le dattier. En outre, ils expliquent que cette
variation intraclonale est due à la nature des sols où les palmiers sont cultivés, la composition
de l’eau d’irrigation et l’hétérogénéité de l’échantillonnage.
5. Conclusion
La composition chimique des dattes détermine de manière directe le devenir du cultivar. Elle
influe notablement sur les critères de qualité gustative et commerciale et de conservation par
conséquent l’importance économique d’un cultivar donné.
101
Chapitre 3 : Etude de la diversité chimique des dattes des
principaux cultivars des Ziban
Pour cette étude, une diversité génétique très importante a été observée dans la composition
chimique de 63 échantillons de dattes qui appartiennent à la fois à des cultivars connus (40), et
d’autres dont l’origine génétique est proche à savoir des dérivés (3), des issus de noyaux (3) et
un cas de synonymie prélevés de sept communes de la wilaya de Biskra.
Nos résultats ont permis d’associer certains paramètres chimiques des dattes. De très faibles
valeurs de pH et d’acidité titrable ont caractérisé respectivement les dattes sèches, contenant de
faibles teneurs en eau, et les dattes molles, ayant de très forts taux d’humidité. Comme il a
d’ores et déjà été montré, toutes les dattes étaient riches en sucres dont la fraction était composée
presque équitablement de sucres invertis et non invertis. Aussi, en concordance avec leurs
noms, les dattes de ‘’ Sokria’’ et ‘’Helwa’’ contenaient les plus forts taux de sucres. En outre,
la majorité des échantillons ont été classés comme étant de consistance demi molle et sèche
selon l’indice de qualité. Il faut noter toutefois que la classification des dattes sur la base de leur
consistance n’a pas groupé les différentes répétitions d’un même cultivar (récoltées de plusieurs
pieds et provenant de différentes régions) dans une seule catégorie.
Les paramètres chimiques les plus discriminants sont principalement les éléments minéraux, vu
que leur absorption est largement influencée par l’environnement et les itinéraires techniques
adoptés par les agriculteurs notamment en matière de fertilisation et amendement organique.
Suivis par la teneur en eau, le taux des sucres réducteurs (SR) et non réducteurs (saccharose :
Sc), le taux des sucres totaux (ST) ce qui justifie et renforce leur emploi comme critères de
caractérisation et de distinction entre les classes des dattes des différents cultivars. En effet,
nous sommes arrivés, par le biais d’une analyse en composantes principales, à une définition
de deux classes à caractéristiques opposées qui sont celles des dattes sèches et des dattes molles
en se basant sur les paramètres des taux de saccharose et l’acidité titrable (élevés chez la
première classe) et la teneur en eau et le pH (élevés chez la seconde classe). Ce qui confirme
l’absence d’une nette opposition entre sucres réducteurs et saccharose et donne lieu à
l’existence de classes intermédiaires mises en évidence par la classification hiérarchique que
nous avons réalisée. Les classes en question sont celles des dattes demi-sèches et demi-molles
qui sont de teneurs en eau proches mais dont la balance des sucres vire vers le saccharose pour
les dattes de consistance demi-sèches et vers les sucres invertis pour les dattes dites demi-
molles.
Une grande part de la variation observée est due à ces facteurs. En effet, l’échantillonnage que
nous avons réalisé provenait majoritairement, de palmeraies anciennes se localisant en
102
Chapitre 3 : Etude de la diversité chimique des dattes des
principaux cultivars des Ziban
particulier dans les communes de Chetma, Féliache et de Sidi Okba. Ces palmeraies abritent
encore une panoplie d’anciens cultivars dont les dattes sont dites ‘’communes’’ et qui sont
souvent délaissées vu la faible valeur marchande de leurs dattes et plus rarement lorsqu’il est
question d’héritage. Ce qui représente incontestablement un signe d’une érosion génétique très
sévère qui sévit dans les oasis des Ziban depuis quelques décennies. En contrepartie, et dans
d’autres communes à aires phoenicicoles récentes à l’image de Leghrous, Foughala et Ain
Naga, les palmeraies sont mieux entretenues voire renouvelées dans certains cas bien que sur
le plan richesse variétale elles restent très pauvres.
D’autre part, la variation intraclonale a été mise en évidence par la présente étude en raison de
l’observation de quelques cas de répartition des pieds d’un même cultivar dans des groupes et
clusters différents. Elle a confirmé le changement des caractéristiques chimiques des dattes en
milieux variables. L’étude plus approfondie de cette variation, permet de comprendre la réponse
du dattier aux facteurs extrinsèques et d’appréhender son comportement ainsi que la qualité des
dattes dans des environnements bien distincts.
103
Chapitre 3 : Etude de la diversité chimique des dattes des
principaux cultivars des Ziban
des nombreuses vertus des dattes. Les recherches dans ce sens seront plus efficaces si elles font
appel aux savoirs et savoir-faire des populations locales qui détiennent un héritage bien riche
et diversifié en termes d’utilisations notamment thérapeutiques des dattes.
104
Chapitre 4 : Etude de la diversité moléculaire des
principaux cultivars des Ziban par l’emploi de
marqueurs SSRs
Chapitre 4 : Étude de la diversité moléculaire des
principaux cultivars des Ziban utilisant les marqueurs SSRs
1. Introduction
Le palmier dattier (phoenix dactylifera L.) est l'élément essentiel de l’agro-écosystème oasien.
Ses fruits représentent un aliment traditionnel de base qui joue un rôle crucial pour la sécurité
alimentaire de la population locale dans les zones désertiques et arides.
Étant donné que la productivité et la qualité du fruit sont des facteurs inhérents à une variété,
une collection de matériel génétique est extrêmement importante, principalement pour les
arbres fruitiers dont la multiplication est assurée exclusivement par voie végétative. Ainsi, la
caractérisation et l'évaluation de la diversité génétique des cultivars de palmier dattier sont
nécessaires pour tout programme de sélection ainsi que pour une meilleure gestion de la
conservation de l'agro diversité. La caractérisation qu’elle soit d’ordre morphologique ou
biochimique a été utilisée pour l'identification de cultivars de palmiers dattiers (Baaziz et
Saaidi, 1988; Ould Mohamed Salem et al., 2001; Ould Mohamed Ahmed et al., 2011).
Néanmoins, la variation engendrée par l'environnement rend difficile une identification correcte
des cultivars avant les stades de reproduction et de fructification. Par conséquent, des marqueurs
d'ADN moléculaires ont été utilisés dans le but de distinguer les cultivars de palmiers dattiers
et pour étudier sa biodiversité (Boyang et al., 2002; Al-Khalifah et Askari, 2003; Sabir et
al., 2014). Les séquences répétées simples (SSR) sont les plus utilisées pour le génotypage de
palmiers dattiers (Billote et al., 2004; El-Ruqishi et al., 2008 ; Elshibli et Korpelainen 2008;
Pintaud et al., 2010; Elshibli et Korpelainen, 2011; Elmeer et al., 2011; Arabezhad et al.,
2012; Bodian et al., 2012; Khanam et al., 2012; Racchi et al., 2013; Zehdi-Azouzi et al.,
2016).
En Algérie, en dépit de la richesse variétal du dattier, plus de 900 cultivars, seuls quelques
travaux ont été consacrés à l'étude de la diversité génétique par l’emploi des marqueurs de types
ISSR et RAPD (Guettouchi et al., 2017a). En ce qui concerne les marqueurs microsatellites
(SSR), une étude de la diversité moléculaire en Algérie a été réalisée dans le cadre d'une étude
globale sur la structure génétique de population (Zehdi-Azzouzi et al., 2015) et les résultats
obtenus à partir d’un seul cultivar (Chaluvadi et al., 2014). Récemment, Moussouni et al.
(2017) ont caractérisé l'agro-biodiversité du palmier dattier algérien en utilisant les marqueurs
SSR et un minisatellite chloroplastique.
Les tendances dans l’établissement de nouvelles palmeraies sont davantage basées sur des
cultivars commerciaux. Par conséquent, la nécessité de conserver les ressources génétiques
locales est moins forte en raison de considérations économiques, ce qui contribuerait à l'avenir
à l'érosion de la diversité génétique locale si la conservation du matériel génétique n'était pas
106
Chapitre 4 : Étude de la diversité moléculaire des
principaux cultivars des Ziban utilisant les marqueurs SSRs
affirmée de manière fiable. En outre, le manque d'informations sur la diversité génétique des
cultivars les plus cultivés rend plus difficile la création d'une collection de base ou la mise en
place de programmes de sélection qui répondent aux besoins des producteurs locaux,
principalement à la résistance à la maladie de Bayoudh provoquée par Fusarium. oxysporum f.
sp. Albédini et autres insectes. Dans ce contexte, nous avons sélectionné la plus grande région
productrice de palmiers dattiers en Algérie pour étudier la diversité génétique de 26 cultivars
endémiques algériens en utilisant des marqueurs microsatellites. Les objectifs de cette
recherche sont en premier lieu d’évaluer la diversité génétique et les relations inter et intra-
cultivars et en deuxième lieu, d’identifier le nombre minimal de marqueurs de SSR capables de
distinguer les cultivars objet de cette étude.
2. Matériel et méthodes
2.1. Matériel végétal
107
Chapitre 4 : Étude de la diversité moléculaire des
principaux cultivars des Ziban utilisant les marqueurs SSRs
Figure 20 : Carte des zones échantillonnées. Les points rouges se référant aux sites
d'échantillonnage.
L'ADN génomique a été extrait à partir de 100 mg de jeunes folioles séchées utilisant la
méthode CTAB modifiée en suivant la procédure décrite par Benbouza et al. (2006). La qualité
et la concentration de l'ADN ont été vérifiées à l'aide d'un Nanodrop 2000c (Thermo Scientific,
Willington, USA) et d'une électrophorèse sur gels d'agarose à 1% (p/v). L'ADN génomique
isolé a été dilué à 25 ng / L et conservé à -20 ° C jusqu'à utilisation.
Un nombre total de 14 marqueurs SSR développés pour Phoenix dactylifera L. ont été utilisés
dans notre étude (Bilotte et al., 2004 et Elmeer et al., 2011). Les réactions d'amplification ont
été réalisées dans un thermocycleur VERITI 96 Well Fast (Applied Biosystems, USA) avec un
volume total de 25 l selon la composition suivante: 25 ng d'ADN génomique, 1X de tampon
PCR fourni (Sigma P2 192-1VL), 0,2 mM de chaque dNTP (Qiagen, Venlo, Pays-Bas), 1,25
unité de Taq polymerase (Promega, Madison, USA) et 0,2 uM de chaque amorce.
108
Chapitre 4 : Étude de la diversité moléculaire des
principaux cultivars des Ziban utilisant les marqueurs SSRs
Les conditions d'amplification PCR-SSR pour les paires d'amorces mPdCIR010, mPdCIR025,
mPdCIR050, mPdCIR093, mPdCIR057, mPdCIR032, mPdCIR035 sont les suivantes : une
première étape de dénaturation à 94°C pendant 180s est suivie de :
Pour les amorces DP159, DP160, DP168, DP169, DP170, DP171, les conditions
d'amplification sont passées par le même programme que les amorces mPdCIR0 à l'exception
de l'application de la température d’hybridation à 58°C pendant 30s pour les 25 cycles.
L'électrophorèse a été réalisée sur une unité d'électrophorèse verticale (Apelex "H Vertigel 2").
Après addition de 20 l de tampon de charge (formamide à 95%, EDTA 10 mM, bleu de
bromophénol à 0,1% (p/v), xylène cyanol), les mélanges sont dénaturés à 95°C pendant 5min
et 5 l de chaque échantillon chargé sur un gel de polyacrylamide à 6% à 1000v pendant 2
heures. Une méthode de coloration à l'argent non radioactive a été utilisée pour révéler les
profils de bandes d'ADN comme décrit dans Benbouza et al. (2006b). L'échelle de 10 pb
(Invitrogen) est chargée trois fois sur chaque gel comme référence pour déterminer la taille des
produits d'amplification.
Le système de documentation du gel BioRadGel DOc TMXR + a été utilisé pour visualiser les
modèles de bandes et son logiciel Image lab 5.1. a été utilisé pour marquer et mesurer la taille
précise des bandes amplifiées pour chaque génotype. Toutes les PCR ont été répliquées deux
fois et seules les bandes reproductibles ont été considérées.
109
Chapitre 4 : Étude de la diversité moléculaire des
principaux cultivars des Ziban utilisant les marqueurs SSRs
Tableau 12 : Noms des cultivars et sites de prélèvement d'échantillons (Région des Ziban)
Cultivar Code Site de collecte Classe
Arechti C1 Chetma Demi- Molle
Bouhlass C2 Chetma Sèche
Degla Baidha C3 Chetma Sèche
Deglet Abdallah C4 Chetma Molle
Deglet Debbab C5 Chetma Sèche
Deglet Noor C6 Ourlel Demi- Molle
Deglet-Ziane C7 Ourlel Demi- Molle
Feraounia C8 EL Ghrous Demi- Molle
Ghars C9 Ourlel Molle
Ghazi C10 Ourlel Demi- Molle
Halwa C11 Ourlel Sèche
Hamraya C12 Ourlel Molle
Horra C13 Foughala Sèche
Itima C14 Ourlel Molle
Kseba C15 Ourlel Demi- Molle
Lemsaref C16 Lichana Sèche
Mech Degla C17 Chetma Sèche
Safraya C18 Ourlel Molle
Sbaa Laroussa C19 Foughala Molle
Tantboucht C20 Ourlel Molle
Thawri C21 Ourlel Demi- Molle
Tichtate C22 Foughala Demi- Molle
Tijaaranite C23 Chetma Demi- Molle
Tinicine C24 Chetma Molle
Zomret Mimoun C25 Ourlel Demi- Molle
Ain El Fes C26 Ourlel Molle
110
Chapitre 4 : Étude de la diversité moléculaire des
principaux cultivars des Ziban utilisant les marqueurs SSRs
La diversité génétique est la mesure qui quantifie la variation constatée au sein d'une population
d'une espèce donnée, elle reflète la présence de différents allèles dans le pool de gènes, et donc
différents génotypes au sein des populations (Poczai et al., 2012). L’objectif de mesurer la
diversité génétique se situe à deux niveau, entre des populations (inter population) ou encore
entre divers individus ou au sein d'une même population (intra population).
Pour étudier l'informativité potentielle des SSRs, des paramètres génétiques ont été calculés
pour les 52 accessions sur les 14 loci microsatellites. Les fragments amplifiés de tailles
différentes ont été notés comme présents (1) ou absents (0) et considérés comme des allèles
différents. Les paramètres génétiques en question incluent :
111
Chapitre 4 : Étude de la diversité moléculaire des
principaux cultivars des Ziban utilisant les marqueurs SSRs
Fst= Ht – Hs*/Ht
Avec
Les valeurs de cette mesure sont comprises entre 0 et 1. Il faut noter que la signification
statistique des estimateurs Fst a été évaluée en utilisant 10.000 permutations.
Afin de déterminer l'utilité des SSRs utilisés dans ce travail, pour chaque paire d'amorces, les
deux paramètres suivants sont calculés :
112
Chapitre 4 : Étude de la diversité moléculaire des
principaux cultivars des Ziban utilisant les marqueurs SSRs
Les cultivars montrant un seul allèle amplifié sont classiquement considérés comme
homozygotes au locus. Par conséquent, la diversité génétique pourrait être sous-estimée si des
allèles nuls se produisaient. Ainsi, les loci avec des fréquences élevées d'allèles nuls sont
identifiés à travers l’estimation de la fréquence de l'allèle nul (r) pour chaque locus et chaque
population, en utilisant IDENTITY1.0 (Wagner et Sefc, 1999).
Les cultivars présentant trois produits amplifiés différents ou plus n'ont pas été pris en compte,
car l'attribution d'allèles à n'importe quel locus n'est pas possible en l'absence de données de
ségrégation. Les profils polymorphes SSR ont été utilisés pour créer des matrices binaires, une
pour chaque amorce.
L'analyse de la variance moléculaire (AMOVA) a été réalisée à l'aide de Nei distance (1978)
pour estimer et répartir la variance moléculaire totale entre et parmi les cultivars (Excoffier et
al., 1992).
Les relations entre les accessions sont réalisées avec une analyse des coordonnées principales
(ACoP) et un dendrogramme. La similarité génétique a été calculée en utilisant l'indice de
similarité de Jaccard et les accessions ont été regroupées par la méthode du groupe de paires
non pondérées avec la moyenne arithmétique (UPGMA) en utilisant le logiciel NTSYS (version
2.2). Les valeurs du Bootstrap ont été obtenues à partir de 2000 répétitions avec le logiciel
TREECON 1.3b (Van de Peer et De Wachter, 1994).
113
Chapitre 4 : Étude de la diversité moléculaire des
principaux cultivars des Ziban utilisant les marqueurs SSRs
Ensuite, le programme Structure Harvester (Earl et Vonholdt, 2012) a été utilisé pour
sélectionner le K optimal, en utilisant K, selon Evanno et al. (2005). Sur la base des résultats
du premier passage, nous avons opté pour ré- exécuter STRUCTURE sur base des clusters
identifiés dans le premier passage par UPGMA afin de détecter une éventuelle sous-structure.
Nous avons utilisé la version 1.1 de CLUMPP pour trouver des alignements optimaux
d'analyses de clusters R (Jakobsson et Rosenberg, 2007) avec algorithme Greedy. Pour
visualiser les tracés de barres (bar plots) de STRUCTURE, en utilisant la matrice Q
individuelle, le logiciel STRCTURE PLOT a été utilisé (Ramasamy et al., 2014).
3. Résultats
3.1. Diversité génétique et polymorphisme des marqueurs SSR
Les 14 amorces microsatellites utilisées dans notre étude ont montré un polymorphisme élevé
et des fragments reproductibles sur les 26 cultivars. Dans l'ensemble des accessions, le nombre
total d'allèles détectés est de 221. Le nombre d'allèles amplifiés a varié considérablement par
locus de 2 (DP160) à 32 (mPdCIR050), avec une moyenne de 15,78 (Tableau 13). La taille
allélique a varié de 106 pb (mPdCIR085) à 321 pb (mPdCIR050). Ce dernier allèle n'était
présent qu'en une seule copie, chez Horra (C13) (Fig. 20), dans l'ensemble des cultivars étudiés
à l'état hétérozygote. En concomitance avec le nombre élevé d'allèles, une forte variation
allélique a été observée entre les locus marqueurs reflétés par des valeurs PIC élevées, allant de
0,305 (DP160) à 0,910 (mPdCIR050), avec une valeur moyenne de PIC de 0,755, indiquant le
fort potentiel d'informativité des marqueurs SSR utilisés. La fréquence allélique la plus faible
114
Chapitre 4 : Étude de la diversité moléculaire des
principaux cultivars des Ziban utilisant les marqueurs SSRs
parmi les loci est de 0,010, à l'exception des loci DP160, DP169 et DP170. Alors que la plus
forte valeur est de 0,750 pour l'allèle 120 pb au locus DP160 (Tableau 14).
Sur les 221 allèles présents dans les cultivars, l'analyse a révélé que 50 sont des allèles privés.
Ce type d’allèles résulte d’un isolement suffisant entre les populations qui aurait permis
l’émergence, par mutation, de nouveaux allèles, sans que ceux-ci soient répartis entre les
différentes populations par l’action des flux de gènes. Ainsi, plus le nombre d’allèles privés
dans une population est élevé plus cette population est isolée des autres. Le locus mPdCIR050
a montré le nombre le plus élevé d'allèles privés (11) (Fig. 22) Le nombre d'allèles notés sur les
génotypes a varié de 31, pour Halwa (C11), à 43 pour Lemsaref (C16) (Tableau 15). D’après
les résultats de l’analyse, le cultivar Arechti (C1) a le plus grand nombre d'allèles uniques ou
‘’allèles privés’’ (5) alors que 4 cultivars (Deglet Debbab, Feraounia, Kseba et Zomret
Mimoun) n'ont révélé aucun allèle unique (Tableau 15).
115
Chapitre 4 : Étude de la diversité moléculaire des
principaux cultivars des Ziban utilisant les marqueurs SSRs
Tableau 13: Tailles et fréquences des allèles pour les 14 SSRs loci analysés sur l’ensemble des cultivars de palmier dattier
116
Chapitre 4 : Étude de la diversité moléculaire des
principaux cultivars des Ziban utilisant les marqueurs SSRs
La moyenne de l'hétérozygotie attendue He est de 0,530, ses valeurs sont comprises entre 0,163
(DP171) et 0,716 (mPdCIR085) (Fig. 22). Considérant que, le PD indique l'efficacité d'une
paire d'amorces à distinguer entre les cultivars, il a varié de 0,500 (DP160) à 0,960 (DP168)
avec une valeur moyenne de 0,836 (Tableau 14). Il est intéressant de noter que les valeurs
élevées du PD ne correspondent pas automatiquement à une valeur NDC élevée ni à un nombre
plus élevé d'allèles détectés par un marqueur SSR. Dans l'ensemble, un nombre élevé de
génotypes est souvent associé à une valeur PIC élevée, sauf pour le DP171.
0,600
0,500
Frequence
0,400
0,300
0,200
0,100
0,000
118 127 141 143 151 153 156 158 162 164 167 170 172 175 178 180 184 186 189 198 200 207 210 216 219 222 225 231 254 321
Locus MPdCIRO 50
CV1 CV2 CV3 CV4 CV5 CV6 CV7 CV8 CV9 CV10 CV11 CV12 CV13
CV14 CV15 CV16 CV17 CV18 CV19 CV20 CV21 CV22 CV23 CV24 CV25 CV29
0,800
0,700
0,600
Frequence
0,500
0,400
0,300
0,200
0,100
0,000
112 Locus 120
DP160
CV1 CV2 CV3 CV4 CV5 CV6 CV7 CV8 CV9 CV10 CV11 CV12 CV13
CV14 CV15 CV16 CV17 CV18 CV19 CV20 CV21 CV22 CV23 CV24 CV25 CV29
Les valeurs les plus faibles de He (0,096) et Ho (0,163) sont révélées par les loci DP169 et
DP171, respectivement. L’hétérozygotie observée, Ho, est inférieure à 0,500 pour cinq loci
(mPdCIR057, mfPdCIRO35, DP169, DP170 et D171). Alors que pour les loci restants, les
valeurs de Ho ont varié de 0,500 (DP160) à 0,962 (DP159) indiquant une diversité moyenne a
élevée des cultivars étudiés. En effet, des valeurs plus importantes de Ho comparées aux valeurs
de He ont été notées pour tous les marqueurs SSR à l'exception de cinq loci (mPdCIR057,
117
Chapitre 4 : Étude de la diversité moléculaire des
principaux cultivars des Ziban utilisant les marqueurs SSRs
mPdCIR035, mPdCIR032, DP169 et DP171), ce qui est reflété par les valeurs négatives de Fis.
De plus, ces valeurs négatives suggèrent un excès d'hétérozygotes. La valeur 0.20 de la
fréquence allélique nulle (R) a été considérée comme la valeur seuil sur laquelle on peut trouver
une signification sous-estimée de He en raison d'allèles nuls (non visualisés) (Chapuis et
Estoup 2007). Pour les locus mPdCIR035, mPdCIR057, DP169 et DP170, une valeur R
supérieure au seuil a été observée (Tableau 14).
Tableau 14: Polymorphisme des SSR et statistiques F dans les cultivars étudiés
118
Chapitre 4 : Étude de la diversité moléculaire des
principaux cultivars des Ziban utilisant les marqueurs SSRs
L'analyse et la combinaison des 221 allèles amplifiés par les 14 SSR ont permis de différencier
les 26 cultivars étudiés. Les résultats montrent que la combinaison des modèles alléliques
trouvés avec les quatorze SSR est capable d'identifier toutes les accessions, puisque chaque
cultivar est caractérisé par un profil génétique unique. Aucun marqueur SSR unique n'a été
capable de distinguer tous les échantillons. Les paires d’amorces permettant de distinguer le
nombre le plus élevé de cultivars étudiés sont mPdCIR035, mPdCIR025 et mPdCIR050
discriminant 6 cultivars (Tableau 14). Au total, la combinaison de ces trois paires d'amorces a
révélé 26 allèles privés qui séparent efficacement 14 cultivars (Arechti, Bouhlass, Degla
Baidha, Deglet Abdalla, Deglet-Ziane, Ghazi, Halwa, Horra, Itima, Lemsaref,, Safraya,
Tijaaranite et Tinicine).
119
Chapitre 4 : Étude de la diversité moléculaire des
principaux cultivars des Ziban utilisant les marqueurs SSRs
3,500 0,700
3,000 0,600
Heterozygositie
2,500 0,500
Moyenne
2,000 0,400
1,500 0,300
1,000 0,200
0,500 0,100
0,000 0,000
Populations
Na Na Freq. >= 5% Ne I No. Private Alleles No. LComm Alleles (<=25%) No. LComm Alleles (<=50%) He
120
Chapitre 4 : Étude de la diversité moléculaire des
principaux cultivars des Ziban utilisant les marqueurs SSRs
Les résultats des profils SSR montrent qu'un nombre relativement élevé de profils uniques est
observé à l'exception des loci DP171 et DP169, avec seulement deux profils uniques, et sans
profil unique pour le locus DP160.
En ce qui concerne l'efficacité des paires d'amorces testées sur les cultivars étudiés, le nombre
d'allèles amplifiés pour le locus DP160 est très faible comparé aux autres paires d'amorces, car
les produits d'amplification pour les cultivars entiers étaient seulement deux allèles (Fig. 21).
Fait intéressant, toutes les accessions ont le même profil (112-120) au locus DP160. Parmi les
26 cultivars, un taux de polymorphisme élevé a été observé avec un maximum de 100% pour
les cultivars Areheti, Itima, Thawri, Lemsaref et Tichtate et Ein el Fes et de 71,43% pour Halwa,
avec une moyenne de 90,11% (Fig. 23).
121
Chapitre 4 : Étude de la diversité moléculaire des
principaux cultivars des Ziban utilisant les marqueurs SSRs
Arechti
Ain El100,00%
Fes Bouhlass
Zomeret Mimoune Degla Baidha
Tinicine 80,00% Deglet Abdallah
Tijaaranite 60,00% Deglet Debbab
Tichtate 40,00% Deglet Noor
20,00%
Thawri Deglet-Ziane
0,00%
Tantboucht Feraounia
Sbaa Laroussa Ghars
Safraya Ghazi
Mech Degla Haloua
Lemsaref Hamraya
Kseba Horra
Itima
Le dendrogramme UPGMA (Fig. 24), représente la relation génétique entre les 52 génomes
analysés. La valeur la plus élevée du coefficient de corrélation cophénétique est de r = 0,84 (P
<0,001) et est interprétée comme un bon ajustement pour les analyse de clustering. Dans
l'ensemble, il parait qu'il n'y ait pas de regroupement clair de cultivars en relation avec
l'échantillonnage de leurs sites. Globalement, le clustering UPGMA a mis en évidence de faibles
relations de clustering (Valeur bootstrap faible). Néanmoins, six cultivars présentaient des
valeurs élevées de bootstrap, Bouhlass (C2) et Deglet Baidha (C3) (valeur bootstrap 88%) et
Feraounia (C8) et Ghazi (C10) (valeur bootstrap 76%), Lemsaref (C16) et Mech degla (C17)
(valeur f 56%). Les accessions ont été organisées en deux groupes principaux (avec des valeurs
bootstrap de 56% et 55%) (Fig. 24) montrant des niveaux relativement faibles de similarité au
niveau moléculaire parmi elles allant de 0,100 à 0,64,
Le premier groupe comprend deux sous-groupes principaux (IA et IB). Le premier sous-groupe
est représenté par 14 cultivars, tandis que le second est formé par 12. Dans le premier principal
sous-cluster, le cultivar le plus divergent est Halwa (C11), tandis que dans le deuxième principal
sous-cluster, le cultivar Itima (C14) est le plus éloigné. Le deuxième groupe principal comprend
également deux sous-groupes principaux (IIA et IIB), le premier renferme 20 cultivars et le
second sous-groupe contient six. Le cultivar Ghars (C9) est le plus divergent parmi les cultivars
inclus dans les deux sous-groupes principaux. Il est intéressant de noter que les deux cultivars
Hamraya (C16 ') et Horra (C17') sont similaires sur le plan génétique (Fig. 24).
122
Chapitre 4 : Étude de la diversité moléculaire des
principaux cultivars des Ziban utilisant les marqueurs SSRs
Le dendrogramme UPGMA (Fig. 24), représente la relation génétique entre les 52 génomes
analysés. La valeur la plus élevée du coefficient de corrélation cophénétique est de r = 0,84 (P
<0,001) et est interprétée comme un bon ajustement pour les analyse de clustering. Dans
l'ensemble, il parait qu'il n'y ait pas de regroupement clair de cultivars en relation avec
l'échantillonnage de leurs sites. Globalement, le clustering UPGMA a mis en évidence de faibles
relations de clustering (Valeur bootstrap faible). Néanmoins, six cultivars présentaient des
valeurs élevées de bootstrap, Bouhlass (C2) et Deglet Baidha (C3) (valeur bootstrap 88%) et
Feraounia (C8) et Ghazi (C10) (valeur bootstrap 76%), Lemsaref (C16) et Mech degla (C17)
(valeur f 56%). Les accessions ont été organisées en deux groupes principaux (avec des valeurs
bootstrap de 56% et 55%) (Fig. 24) montrant des niveaux relativement faibles de similarité au
niveau moléculaire parmi elles allant de 0,100 à 0,64,
Le premier groupe comprend deux sous-groupes principaux (IA et IB). Le premier sous-groupe
est représenté par 14 cultivars, tandis que le second est formé par 12. Dans le premier principal
sous-cluster, le cultivar le plus divergent est Halwa (C11), tandis que dans le deuxième principal
sous-cluster, le cultivar Itima (C14) est le plus éloigné. Le deuxième groupe principal comprend
également deux sous-groupes principaux (IIA et IIB), le premier renferme 20 cultivars et le
second sous-groupe contient six. Le cultivar Ghars (C9) est le plus divergent parmi les cultivars
inclus dans les deux sous-groupes principaux. Il est intéressant de noter que les deux cultivars
Hamraya (C16 ') et Horra (C17') sont similaires sur le plan génétique (Fig. 24).
123
Chapitre 4 : Étude de la diversité moléculaire des
principaux cultivars des Ziban utilisant les marqueurs SSRs
L’analyse des coordonnées principales (l’ACoP) (Fig. 25) a expliqué ~ 50% de la variation
(Annexe 9) ou les deux premiers axes ont expliqué 42% de la variation . Les axes ont distribué
les 52 accessions en groupes principaux suivant le clustering UPGMA et présentant des
relations faibles. Nous avons observé, dans chaque groupe principal, des clusters dispersés
selon le type de fruit.
Coord. 1 (28,76%)
En utilisant le logiciel STRUCTURE, basé sur une méthode biaisée qui permet d’associer le
profil génétique avec une distribution spatiale, ou à des caractères morphologiques communs.
Les estimations de la log-vraisemblance des données ont été obtenues pour chacune des 10
séries indépendantes pour chaque valeur K, allant de 1 à 10. Pour la première série, aucune
information préalable n'a été utilisée pour définir les groupes. Le nombre le plus probable de
clusters (K) des accessions de dattier a été évalué en tenant compte du critère de plateau
(Pritchard) et de la distribution de k (méthode Evanno, Evanno et al., 2005). La courbe log-
vraisemblance moyenne a atteint une valeur maximale autour de K= 2, la cohérence entre
différentes simulations au sein de chaque K (parmi 10 séries) est évaluée et visualisée à travers
le coefficient de similarité (Fig. 26). Les accessions du palmier dattier sont regroupées en deux
groupes de pools génétques distincts (K = 2), en appliquant STRUCTURE sans information
124
Chapitre 4 : Étude de la diversité moléculaire des
principaux cultivars des Ziban utilisant les marqueurs SSRs
préalable. Il est surprenant de noter que même avec une information préalable basée sur le
clustering UPGMA, la valeur K optimale n'a pas changée. L'AMOVA a été calculée parmi les
2 pools génétiques, ce qui a donné des résultats statistiquement différents (Fst = 0,196; P
<0,001). En fait, il semble que la plus grande partie de la variabilité générique s'explique par
les différences au sein des populations (80%), alors que 20% de la variance totale est observée
entre les populations (Annexe 10). La distance génétique du Nei entre les deux groupes
génétiques est de 0,857. En outre, l'analyse montre des niveaux moyens de Ho dans chaque
groupe génétique identifié et a varié de 0,531 (groupe 1) à 0,551 (groupe 2). Pour les deux
groupes génétiques, les indices de fixation sont positifs, indiquant un excès d'homozygotes ou
d'allèles indétectables (Annexe 11). Pour chaque population inférée, la sous-structuration sous
la hiérarchie supérieure est détectée en utilisant une approche similaire. Lorsque des
informations préalables basées sur le cluster UPGMA ont été ajoutées, pour chaque groupe
principal, la structure génétique de chaque groupe principal a généré 7 clusters génétiques
distincts (K = 7) (Fig. 26).
125
Chapitre 4 : Étude de la diversité moléculaire des
principaux cultivars des Ziban utilisant les marqueurs SSRs
a)
b)
126
Chapitre 4 : Étude de la diversité moléculaire des
principaux cultivars des Ziban utilisant les marqueurs SSRs
4. Discussion
Une variété de facteurs évolutifs, y compris le mode de reproduction, la dispersion des graines,
le flux génétique, la sélection naturelle, l'aire géographique et le centre de diversité affectent la
diversité génétique d'une population d'une espèce (Hamrick et Godt, 1989). Les résultats de
recherche présentés ici constituent une contribution à l'étude de la diversité génétique et à la
caractérisation des cultivars de palmier dattier cultivés dans la première région productrice du
palmier dattier en Algérie. Les 14 marqueurs SSRs utilisés dans cette étude ont déjà été utilisés
sur différents cultivars de palmiers dattiers de différents pays. Une variabilité génétique élevée
a été observée dans cette étude. Le nombre moyen d'allèles (15,78) est élevé en comparaison à
d'autres études (Racchi et al., 2013 ; Yusuf et al., 2015 ; Azouzi et al., 2016 ; Al-Faifi et al.,
2016 ; Moussouni et al. 2017) mais reste faible de celui obtenu par Elshibli et Korpelainen
(2008), Elmeer et al. (2011) et Chaluvadi et al. (2014). L'hétérozygotie pour les loci SSRs
(Ho = 0,545, He = 0,532) est assez proche de celle trouvée dans d'autres études déjà
mentionnées. Cependant, malgré le nombre de cultivars étudiés, la moyenne de la valeur du
contenu de l'information polymorphique (PIC) (0.755) est assez similaire à celle obtenue par
Elmeer et al. (2011) mais elle est relativement importante par rapport à d'autres études
similaires incluant un nombre important (Azouzi et al., 2016, Moussouni et al., 2017) ou réduit
d'accessions (Al-Faifi et al., 2016). Dans tous les cas, la valeur du PIC reste impactée par
l'apparition de variant par locus et allèles. Il est important de souligner que la comparaison faite
avec d'autres études doit être faite avec prudence car les loci et le nombre de cultivars et leur
origine sont le plus souvent totalement différents.
Aussi, la fréquence allélique a varié de 0,01 à 0,0750 (Tableau 13), elle a été la plus élevée pour
l'allèle 120 bp au locus DP169. Soulignons qu’à ce locus toutes les accessions ont amplifié les
mêmes allèles (120-112) soit à l'état homozygote ou hétérozygote. Ceci pourrait indiquer la
bonne conservation de la région flanquante du SSR parmi les cultivars, et la présence d’un
ancêtre commun, en dépit du fait de la propagation végétative des accessions et de la mutation
putative qui pourrait se produire.
127
Chapitre 4 : Étude de la diversité moléculaire des
principaux cultivars des Ziban utilisant les marqueurs SSRs
grande variabilité génétique et une efficacité de discrimination parmi les génotypes. Cependant,
DP169 présente le plus petit nombre d'allèles, la plus faible valeur de NDC et la plus faible
valeur de PD (0,500). En effet, des valeurs plus élevées de Ho comparées à He ont été observées
pour huit marqueurs SSRs (Tableau 14), ce qui est reflété par les valeurs négatives de Fis. De
plus, ces valeurs négatives, 9/14 loci, suggèrent un excès d'hétérozygotes dû soit une association
négative ou aléatoire ou encore à une sélection au aléatoire (Hartel et Clarck, 1997). Ces
derniers auteurs affirment que la multiplication végétative permet aux deux allèles de chaque
locus d'accumuler indépendamment des mutations et donc de diverger à l'intérieur des individus
et d'entraîner, par conséquent, des valeurs Fis négatives.
Des études antérieures ont révélé des valeurs plus élevées de Ho comparées à He pour le palmier
dattier et d'autres espèces pérennes (Diaz et al., 2006 ; Chaluvadi et al., 2014 ; Al-Faifi et al.,
2016). Ces derniers auteurs attestent que la majorité des espèces allogames, multipliées par
clonage, semblent être caractérisées par des niveaux moyens d'hétérozygotie. Ces résultats ont
mis en évidence la différenciation génétique significative au sein des cultivars génotypés.
Parmi les 14 marqueurs, six amorces SSRs ont amplifié des motifs multilocus probablement à
cause de l'amplification simultanée de deux motifs différents (Fig. 27). Les modèles multi locus
mPdCIR010 et DP171 ont amplifié sur un seul cultivar, Arecheti (C1) et Ferraounia (C8)
respectivement. Tandis que les SSRs, mPdCIR050, mPdCIR035, mPdCIR025 et DP159 ont
amplifié des motifs multilocus sur différents cultivars. Cependant, pour plusieurs locus, les
allèles "nuls" ont également été observés principalement pour les loci mPdCIR035 et DP169.
Pour ces deux loci, des valeurs positives élevées de Fis renseignent sur un excès possible
d'homozygotes ou d'allèles nuls indétectables (Tableau 14) indiquant une consanguinité
considérable. Un déficit d'hétérozygotes peut être provoqué par la présence d'allèles nuls, ce
qui implique l'élimination des loci, et cet excès d'homozygotie peut biaiser les analyses de
structure de population. Cependant, le nombre d'allèles et d'hétérozygotie observés pour les
locus SSRs sont relativement élevés et pourrait s’expliquer, en partie, par les SSRs provenant
d’ADN non codant, qui sont moins sujets à une pression sélective du fait que le palmier dattier
est une espèce allogame. En fait, le palmier dattier peut être pollinisé par le vent, mais la
pollinisation artificielle est largement pratiquée et l'incompatibilité ou l'incompatibilité partielle
entre les différents cultivars mâles et femelles est commune mais pas bien comprise (Chao et
Krueger, 2007), ainsi l'hétérozygotie et le polymorphisme de l'ADN pourraient augmenter
considérablement. De ce fait, il a été signalé que lors de la multiplication végétative, des grande
128
Chapitre 4 : Étude de la diversité moléculaire des
principaux cultivars des Ziban utilisant les marqueurs SSRs
variabilité génétique et une efficacité de discrimination parmi les génotypes. Cependant, DP169
présente le plus petit nombre d'allèles, la plus faible valeur de NDC et la plus faible valeur de
PD (0,500). En effet, des valeurs plus élevées de Ho comparées à He ont été observées pour
huit marqueurs SSRs (Tableau 14), ce qui est reflété par les valeurs négatives de Fis. De plus,
ces valeurs négatives, 9/14 loci, suggèrent un excès d'hétérozygotes dû soit une association
négative ou aléatoire ou encore à une sélection au aléatoire (Hartel et Clarck, 1997). Ces
derniers auteurs affirment que la multiplication végétative permet aux deux allèles de chaque
locus d'accumuler indépendamment des mutations et donc de diverger à l'intérieur des individus
et d'entraîner, par conséquent, des valeurs Fis négatives.
Des études antérieures ont révélé des valeurs plus élevées de Ho comparées à He pour le palmier
dattier et d'autres espèces pérennes (Diaz et al., 2006 ; Chaluvadi et al., 2014 ; Al-Faifi et al.,
2016). Ces derniers auteurs attestent que la majorité des espèces allogames, multipliées par
clonage, semblent être caractérisées par des niveaux moyens d'hétérozygotie. Ces résultats ont
mis en évidence la différenciation génétique significative au sein des cultivars génotypés.
Parmi les 14 marqueurs, six amorces SSRs ont amplifié des motifs multilocus probablement à
cause de l'amplification simultanée de deux motifs différents (Fig. 27). Les modèles multi locus
mPdCIR010 et DP171 ont amplifié sur un seul cultivar, Arecheti (C1) et Ferraounia (C8)
respectivement. Tandis que les SSRs, mPdCIR050, mPdCIR035, mPdCIR025 et DP159 ont
amplifié des motifs multilocus sur différents cultivars. Cependant, pour plusieurs locus, les
allèles "nuls" ont également été observés principalement pour les loci mPdCIR035 et DP169.
Pour ces deux loci, des valeurs positives élevées de Fis renseignent sur un excès possible
d'homozygotes ou d'allèles nuls indétectables (Tableau 14) indiquant une consanguinité
considérable. Un déficit d'hétérozygotes peut être provoqué par la présence d'allèles nuls, ce
qui implique l'élimination des loci, et cet excès d'homozygotie peut biaiser les analyses de
structure de population. Cependant, le nombre d'allèles et d'hétérozygotie observés pour les
locus SSRs sont relativement élevés et pourrait s’expliquer, en partie, par les SSRs provenant
d’ADN non codant, qui sont moins sujets à une pression sélective du fait que le palmier dattier
est une espèce allogame. En fait, le palmier dattier peut être pollinisé par le vent, mais la
pollinisation artificielle est largement pratiquée et l'incompatibilité ou l'incompatibilité partielle
entre les différents cultivars mâles et femelles est commune mais pas bien comprise (Chao et
Krueger, 2007), ainsi l'hétérozygotie et le polymorphisme de l'ADN pourraient augmenter
considérablement. De ce fait, il a été signalé que lors de la multiplication végétative, des
129
Chapitre 4 : Étude de la diversité moléculaire des
principaux cultivars des Ziban utilisant les marqueurs SSRs
a b
c d
Figure 27 : Profils génomiques SSR générés par les amorces (a) mpdCIR050, (b)DP160,
(c) DP171 et (d) mpdCIR035
Phoenix dactylifera se multiplie aussi bien par rejets que par noyaux, les deux formes coexistent
encore dans la plupart des palmeraies algériennes. Selon les cultivateurs, la nomenclature des
cultivars est basée sur l'origine du cultivar ou sur les caractéristiques des fruits et pourrait
changer d'une oasis à une autre pour le même cultivar, à l'exception des cultivars bien connus
ayant souvent une importance commerciale. Selon Chao et Krueger (2007), la nomenclature
des cultivars de dattes est source de confusion en raison de la longue histoire de la culture, des
échanges importants de matériel génétique, de la dioécie et de la multiplication par semis. En
fait, des sources potentielles d'erreurs de classement des types de fruits, et donc de la
nomenclature des cultivars, pourraient survenir en raison de l'absence de critères communs
précis pour classer les cultivars sur la base du type de fruit. De plus, la consistance des fruits du
palmier dattier est influencée par la source de pollen et l’effet de qualité « métaxénie »
(influençant les tissus à l’extérieur de l’embryon et de l’endosperme) (Nixon, 1934, 136), le
microenvironnement local, des facteurs physiologiques et pathologiques ainsi que les
conditions de récolte (Chao et Krueger, 2007) , notent que la production et la qualité des dattes
130
Chapitre 4 : Étude de la diversité moléculaire des
principaux cultivars des Ziban utilisant les marqueurs SSRs
131
Chapitre 4 : Étude de la diversité moléculaire des
principaux cultivars des Ziban utilisant les marqueurs SSRs
5. Conclusion
Une diversité génétique très importante intra et inter cultivars a été observée dans la présente
étude. Les résultats obtenus représentent l’une des premières contributions à l'étude de la
132
Chapitre 4 : Étude de la diversité moléculaire des
principaux cultivars des Ziban utilisant les marqueurs SSRs
Un important pouvoir discriminant a été révélé par les SSRs. Le nombre d'allèles et
l'hétérozygotie observés sont relativement élevés ainsi que des valeurs négatives de Fis ont été
relevées. La fréquence allélique la plus élevée a été enregistrée pour l'allèle 120 bp au locus
DP169 que toutes les accessions ont amplifié soit à l'état homozygote ou hétérozygote.
Au total, 50 allèles privés amplifiés dont 26 allèles par la combinaison de trois paires d'amorces
qui ont efficacement séparé 14 cultivars. Parmi les 14 marqueurs, six amorces SSRs ont
amplifié des profils multilocus. Le niveau de similarité obtenu par le dendrogramme UPGMA
était compris entre 0,10 et 0,64.
Les résultats n’ont pas révélé la présence d’'accessions identiques à 100% dans tous les loci
testés. Les profils génétiques de trois cultivars étaient complètement différents de (Itima,
Lemsaref et Tinicine). Cependant, seules deux accessions (Bouhlass et Deglet Nour) ont
amplifié les mêmes profils génétiques sur 7 loci des 14 SSRs.
La variabilité intra population (80%) était importante par rapport à la variabilité inter-
population (20%). Globalement, une structure génétique faible a été révélée par cette étude.
L’analyse moléculaire faite par STRUCTURE a permis la séparation des 52 accessions (26
cultivars) de palmier dattier en sept pools génétiques. Les accessions semblent être regroupées
selon le type de fruit qu’elles produisent. Les groupes de cultivars dont les dattes sont de
consistances molle et sèche étant les plus homogènes.
Les résultats de cette étude doivent être élargis par le génotypage supplémentaire de cultivars
et d’accessions de palmier dattier cultivés dans cette région et dans toutes l’Algérie tout en
développant davantage de microsatellites présélectionnés. Enfin, l’approche moléculaire est
indispensable pour compléter et affiner la description morphologique traditionnelle des
cultivars.
133
Conclusion générale
CONCLUSION GENERALE
La culture des palmiers dattiers en Algérie remonte à des milliers d'années pendant lesquels sa
diversité génétique a été modelée par les rudes conditions du désert, fait qui lui a conféré une
grande importance socioéconomique essentiellement pour la valeur nutritionnelle de ses dattes.
Beaucoup de travaux se sont intéressés à travers le monde et en Algérie à la richesse variétale
du dattier en particulier avec l’accentuation du phénomène de l’érosion génétique qui est une
suite logique au développement de cultivars élites.
Le devenir d’un cultivar de palmier dattier dépend en une large mesure de la valeur commerciale
de ses dattes. Une valeur appréciée à travers un ensemble de critères liés à sa qualité qui répond,
elle-même, à des normes d’ordre morphologique (longueur, poids…etc) ou biochimique (taux
de sucres, teneur en eau, composés aromatiques…etc).
L’objectif de ce présent travail est d’améliorer les connaissances sur les ressources
phytogénétiques du palmier dattier à travers la caractérisation morphologique, chimique du fruit
et moléculaire des cultivars les plus fréquents aux Ziban. Cette région, qui représente le premier
pôle phoenicicole en Algérie, où les variétés locales encourent le danger de disparition à cause
de la dominance du cultivar « Deglet Nour ».
La caractérisation morphologique de la partie végétative et reproductrice traitées de manière
séparée a considéré plus de 50 marqueurs quantitatifs révélant une importante diversité
morphologique parmi les 26 cultivars étudiés. L’étude des corrélations a renseigné sur une
architecture bien développée et harmonieuse des différentes parties du dattier en ce qui
concerne les caractères impliqués dans l’expression de la vigueur. Egalement, le comportement
des pennes était similaire à celui des épines de sorte que leur organisation en groupes
concordaient largement. Une grande proportionnalité a été observée quant aux dimensions de
la spathe qui influaient directement sur celles des épillets à l’intérieur et qui dépendait aussi et
de manière directe de leur position sur la partie ramifiée de la spathe. De même, les caractères
biométriques et pondéraux du fruit exprimaient de fortes corrélations et ont été en étroite liaison
avec la longueur de la partie avec fruits des épillets.
Un nombre important de traits végétatifs et reproducteurs ont été révélés très discriminants
parmi lesquels ceux explorés pour la première fois par la présente étude et qui peuvent être
employés pour une caractérisation plus précise des cultivars. Ces caractères étant déjà utilisés
par les agriculteurs.
Le regroupement des cultivars sur la base de leurs caractéristiques reproductrices a montré des
distances relativement plus importantes entre les cultivars, comparé au regroupement sur la base
135
des traits végétatifs. Ce fait renseigne sur une diversité génétique plus large dans la première
partie et appuie le choix des agriculteurs qui font appel plus fréquemment aux dattes pour la
distinction entre les cultivars plutôt qu’aux palmes.
Par ailleurs, le clustering des cultivars a été fait indépendamment de la classe des dattes
puisqu’il a été question d’un rapprochement phénotypique sur la bases de paramètres
morphologiques et reproducteurs qui évoluaient ensemble pour certains cultivars où la vigueur
prononcée de l’appareil végétatif accompagnait celle de l’appareil reproducteur.
Les dattes analysées représentent incontestablement une source sure et riche de sucres, mais les
plus riches étaient celles des cultivars dont les noms, attribués par les phoeniciculteurs,
dévoilaient déjà le gout « Sokria » qui signifie « gout sucré » et « Halwa » qui veut dire
« bonbon ».
L’association de certains composants de la datte a été confirmée par ce travail. Les dattes
sèches, par opposition aux dattes molles, sont des dattes qui contiennent une faible teneur en
eau, à pH faible et d’une richesse marquée en saccharose. La plus grande partie des dattes
analysées ont une consistance qui varie entre demi-molle et sèche.
Les paramètres chimiques les plus discriminants sont principalement les éléments minéraux
dont les teneurs dans les dattes sont largement influencées par les facteurs extrinsèques. En
outre, d’autres composants tels que la teneur en eau, les taux des sucres (totaux, réducteurs et
non réducteurs), l’indice de qualité ont montré un fort pouvoir discriminant ce qui justifie leur
emploi comme critères de caractérisation des dattes. Deux classes bien distinctes dont les
caractéristiques s’opposent ont été mises en évidence, celles de consistances sèche et molle en
se basant sur les paramètres des taux de saccharose et l’acidité titrable (élevés chez la première
classe) et la teneur en eau et le pH (élevés chez la seconde classe). Par ailleurs, contrairement à
d’autres études précédentes aucune opposition nette entre sucres réducteurs et saccharose n’a
été observée. La description de deux classes intermédiaires à savoir « demi-sèches » et « demi-
molles » est faite par rapport à leurs contenus proches en termes de teneurs en eau où la balance
des sucres analysés vire vers le saccharose pour les dattes de consistance demi-sèche et vers les
sucres invertis pour les dattes dites demi-molles. La variation intra-cultivar observée chez les
136
dattes d’un même cultivar récoltées de différents sites a été mise en exergue à travers le
changement de leurs caractéristiques en milieux variables. Ces informations de base sur les
réponses du dattier aux variations extrinsèques permettent d’appréhender son comportement en
fonction du milieu de culture où il est installé.
Une variabilité moléculaire élevée a été observée dans cette étude par l’emploi de 14 marqueurs
SSRs. Les valeurs He et PD ont révélé pour chaque amorce une grande variabilité génétique et
une efficacité de discrimination parmi les génotypes. Au total, 26 allèles privés amplifiés par la
combinaison de trois paires d'amorces ont efficacement séparé 14 cultivars. Le nombre d'allèles
et l'hétérozygotie observés pour les locus SSRs sont relativement élevés, en effet, des valeurs
négatives de Fis ont été notées. Parmi les 14 marqueurs, six amorces SSRs ont amplifié des
profils multilocus. Les allèles "nuls" ont également été observés.
137
de contribuer à l’explication de la structure génétique cryptique des cultivars de palmiers
dattiers en Algérie et dans d’autres pays producteurs de dattes. Le manque d’informations sur
le patrimoine génétique du palmier dattier, comparé à son immense richesse, et à l'absence de
normes de référence ainsi qu'à un système de nomenclature bien défini, compliquent la création
d'une collection de matériel génétique utilisable dépourvue d'homonymie, de synonymie et de
mauvais étiquetage. Ainsi, une classification fiable de tous les cultivars doit être réalisée.
Enfin, nous soulignons encore que le présent travail témoigne de la richesse de la biodiversité
du palmier dattier dans la région des Ziban et en Algérie. Un polymorphisme important d’ordre
morphologique, chimique et moléculaire a été mis en évidence permettant ainsi de mettre au
service des sélectionneurs une base de données d’une grande valeur pour l’amélioration et la
gestion de cette importante culture. En effet, lors de la sélection, les cultivars contenant une
combinaison entre descripteurs intéressants pourraient être exploités directement comme des
cultivars potentiels en qualité de géniteur dans de croisements.
Pour ce faire, une attention particulière devrait être portée aux savoirs et savoir-faire
traditionnels des agriculteurs. Cet héritage de connaissances pratiques tissé à travers des
générations autours des cultivars locaux dans les oasis concrétise le fruit d’expériences
cumulées pendant des siècles de pratique de la phoeniciculture. Il orientera le choix du matériel
génétique pour la sélection et aussi celui des procédés de transformation pour la valorisation
notamment en ce qui a trait aux usages thérapeutiques et cosmétiques.
138
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pp. 666.
157
Annexes
Annexe 1: Aires phoenicicoles en Algérie (en rouge palmiers infestés par le bayoud)
(Bouguedourea el al., 2015).
159
Annexe 2 : Estimation de la fréquence des cultivars du palmier dattier aux Ziban
160
Annexe 3: Valeurs propres des paramètres végétatifs et pourcentage de variance des trois
premiers axes
Axes 1 2 3
Valeurs propres 6,756 4,308 3,319
Variabilité (%) 25,022 15,956 12,293
Cumulée (%) 25,022 40,978 53,271
Valeurs propres des V2 (0,277) V4 (0,252) V10 (-0,260)
paramètres végétatifs V5 (0,229) V13 (0,268) V14 (0,361)
V6 (0,315) V15 (-0,281) V16 (0,371)
V7 (0,263) V17 (0,335) V23 (0,304)
V8 (0,302) V21 (-0,248)
V9 (0,309) V25 (-0,250)
V12 (0,231) V26 (-0,307)
V20 (0,267)
Seules les variables ayant de fortes Valeurs propres sont considérées
Annexe 4: Valeurs propres des paramètres reproducteurs et pourcentage de variance des trois
premiers axes
Axes 1 2 3
Valeurs propres 6,210 4,435 3,665
Variabilité (%) 23,884 17,057 14,095
Cumulée (%) 23,884 40,940 55,035
Valeurs propres des R1 (0,242) R10 (0,322) R20 (0,417)
paramètres végétatifs R7 (0,246) R11 (0,409) R22 (0,354)
R8 (0,289) R12 (0,370) R24 (0,373)
R9 (0,287) R16 (-0,331)
R13 (0,302) R17 (-0,302)
R14 (0,232) R19 (-0,271)
R15 (0,263) R23 (-0,251)
161
Annexe 5 : Composition chimique des dattes analysées
Cultivars AT pH H% ST SC SR H% r TSS CD Na P Cu Zn
ART4 4,65 5,56 17,2 49,5 46,5 3 17,2 2,88 86,9 2,98 19,42 31,70 0,36 0,42
BHL3 6,53 5,88 12,2 58,5 42,5 16 12,2 4,80 78,9 2,85 18,93 42,50 0,44 0,26
BHL1 4,90 4,99 13,8 61,48 35,3 26,18 13,8 4,46 62,7 1 41,16 37,49 0,14 0,3
BHL7 3,60 5,57 14 71,19 18,62 52,57 14 5,09 33,7 1 29,65 39,49 0,15 0,8
BZR2 3,00 5,92 15,2 71,41 28,9 42,51 15,2 4,70 38,7 0,82 29,87 30,62 0,16 0,4
DEG1 4,30 5,12 12,2 65,89 28,1 50,55 12,2 5,40 47,7 1 30,47 36,15 0,16 0,1
DGA3 2,67 5,91 38,6 50 15 35 38,6 1,30 31 2,43 20,35 30,40 0,31 0,36
DGB4 7,72 6,05 13,8 46,5 38 8,5 13,8 3,37 26,4 1,08 15,69 34,00 0,29 0,43
DGB1 7,50 5,1 11,8 71,75 43,39 28,36 11,8 6,08 89,4 2 15 36,97 0,14 0,8
DGD3 12,47 5,19 10,8 65 56,95 8,05 10,8 6,02 81 3,56 15,69 34,90 0,48 0,44
DGN5 5,64 6 22,4 51,5 27,7 23,8 22,4 2,30 37,5 3,57 14,14 35,80 0,22 0,4
DGZ5 9,11 5,98 20,2 72,5 51,46 21,04 20,2 3,59 68 3,59 15,38 31,90 0,31 0,33
ELG5 2,50 5,56 19 51,39 12,39 39 19 2,70 43,8 1 27,59 34,57 0,13 0,3
ELZ5 2,90 6,16 17,2 65,76 26,48 39,28 17,2 3,82 58 1 26,97 70,00 0,16 0,7
FER6 5,45 5,83 23 64 48,25 15,75 23 2,78 69 1,84 16,94 33,00 0,27 0,37
GHS 6 5,64 6,01 33,6 49 17,95 31,05 33,6 1,46 48,3 3,11 13,83 32,20 0,73 0,3
GHS1 3,00 6,16 31 70,35 1,39 68,61 31 2,27 31,7 1 13 30,67 0,11 0,7
GHS7 4,00 5,98 33,7 71,9 9,65 61,25 33,7 2,13 33,9 1 18,74 32,47 0,11 0,4
GHZ7 4,46 5,62 16,6 67,5 50,95 16,55 16,6 4,07 75 3,8 16,94 29,50 0,1 0,24
GHZ7 4,40 5,59 17,4 63,94 27,92 36,02 17,4 3,67 45 1 30,06 32,19 0,13 0,3
HAL1 5,20 4,5 9,6 73,4 32,12 41,28 9,6 7,65 60 2,8 21,01 41,00 0,15 0,2
HAL7 10,20 5,28 13,6 66,51 21,22 45,29 13,6 4,89 49,8 2 36,27 40,00 0,15 0,5
HEL7 4,50 5,28 13,4 72,44 49,53 22,91 13,4 5,41 77 2 16 49,31 0,11 0,6
HAM5 4,95 6,1 23,4 52,5 42,9 9,6 23,4 2,24 50,7 1,77 14,76 31,70 0,44 0,32
HAM1 3,80 4,48 22,8 61,65 30,52 31,13 22,8 2,70 63,6 2 30,06 32,63 0,13 0,05
HAM7 4,10 5,66 20,6 64,16 32,51 31,65 20,6 3,11 57 2 27,59 36,28 0,12 0,12
HDN7 5,90 5,73 21 65,69 26,79 38,9 21 3,13 44,4 2 16,83 36,47 0,13 0,11
162
HHM1 4,00 5,08 15,6 70,01 48,56 21,45 15,6 4,49 81,6 2 30,1 33,35 0,23 0,01
HRR3 7,33 5,23 12,8 62 57,3 4,7 12,8 4,84 71 3,26 15,69 35,60 0,51 0,42
HRR7 6,00 4,86 12,4 74,59 46,84 27,75 12,4 6,02 68,4 2 14,96 33,11 0,12 0,11
ITM3 2,67 6 31 49,5 13,25 36,25 31 1,60 29,1 2,42 15,69 30,10 0,49 0,37
ITM7 3,20 5,65 17,8 66,71 37,26 29,45 17,8 3,75 54 3 28,62 39,74 0,17 0,13
KBM5 6,30 4,13 18,2 71,24 38,9 32,34 18,2 3,91 81,6 3,41 13,67 41,84 0,2 0,13
KHL1 2,80 6,05 17,2 71,16 2 69,16 17,2 4,14 42,9 1 27,18 31,77 0,17 0,03
KSB6 10,49 5,07 15,2 49 23,4 25,6 15,2 3,22 26,4 2,36 28,33 34,30 0,11 0,31
KSB7 7,10 4,87 20,2 66,35 15,9 50,45 20,2 3,28 48,9 3 29,44 40,32 0,17 0,06
LMS5 7,43 5,3 14 57 29,3 27,7 14 4,07 53 2,3 12,59 31,20 0,36 0,35
MDG5 4,55 5,55 16,2 49,5 44,9 4,6 16,2 3,06 74,6 2,36 13,21 30,40 0,52 0,42
MDG7 5,20 4,84 11,4 69,53 54,03 15,5 11,4 6,10 38,1 3 27,8 30,93 0,11 0,14
MEB7 1,40 6,1 20,4 61,69 5,96 55,73 20,4 3,02 52 0,7 16,48 36,46 0,19 0,05
NDN7 2,00 4,75 12,4 74,83 27,1 47,73 12,4 6,03 68,1 1 18,97 34,90 0,13 0,09
NGH7 4,00 6,04 18,8 62,5 20,5 42 18,8 3,32 52,8 1 29,65 36,32 0,3 0,17
NIT7 2,90 5,88 17,8 67,12 41,81 25,31 17,8 3,77 42 1 26,15 34,91 0,16 0,6
OMK7 4,00 6,02 11,2 61,47 34,97 26,5 11,2 5,49 61,8 1 27,59 36,35 0,15 0,11
RTA7 3,50 6,13 19,5 67 28,1 38,9 19,5 3,44 51,3 2,6 17,51 29,90 0,17 0,03
RTM7 3,80 6,33 25,6 66,61 35,96 30,65 25,6 2,60 71,4 2 23,27 40,36 0,15 0,03
SAF3 3,47 6,4 28,6 56 24,45 31,55 28,6 1,96 37,8 2,18 16,94 30,60 0,14 0,31
SAF1 3,10 6,01 17 72,6 31,6 41 17 4,27 42,3 2 32 34,83 0,14 0,04
SBL7 2,38 5,82 24,8 69,5 5,25 64,25 24,8 2,80 25,8 2,72 16,94 33,00 0,17 0,39
SOK1 5,20 5,96 17,4 75,9 46,02 29,88 17,4 4,36 72,6 1 28,42 31,95 0,12 0,05
SOK7 5,90 5,72 16,4 72,06 46,13 25,93 16,4 4,39 68,8 3,01 28,04 33,98 0,17 0,04
SRS1 2,30 4,35 16,6 69,44 2 67,44 16,6 4,18 48,6 2 28,83 36,76 0,13 0,05
TCH5 3,10 6,15 22,6 66,32 27,96 38,36 22,6 2,93 41,6 3 25,93 27,00 0,11 0,06
TCH5 6,24 5,77 16,8 74 47,05 26,95 16,8 4,40 76 3,88 13,83 33,00 0,22 0,4
THW5 4,30 5,64 16,4 61,18 34 27,18 16,4 3,73 51,9 1 29,24 29,67 0,16 0,05
THW’5 5,25 5,61 16,6 55 32,6 22,4 16,6 3,31 34,5 3,17 15,07 34,00 0,27 0,41
TJR3 3,96 6,1 25,4 68 56,95 11,05 25,4 2,68 84,7 3,53 15,38 29,80 0,3 0,33
163
TMJ3 4,00 5,49 23,4 62,5 34,7 27,8 23,4 2,67 38,7 3,59 15,38 27,00 0,34 0,44
TMJ7 4,10 5,87 18 67,44 47,63 19,81 18 3,75 65 2 28,83 34,69 0,16 0,05
TNC3 4,55 5,91 18,2 63,5 50,75 12,75 18,2 3,49 23,4 2,1 15,69 28,90 0,8 0,29
TNT5 3,14 6,11 20,4 70,56 26,2 44,36 20,4 3,46 41,8 2,6 29,03 27,18 0,14 0,03
TNT6 2,97 5,89 21,8 66,5 25,25 41,25 21,8 3,05 40,5 2,4 15,69 31,60 0,31 0,31
ZMM6 2,61 5,91 28,4 54 6 48 28,4 1,90 24,9 4,51 16,32 30,40 0,52 0,35
Annexe 6 : Valeurs propres et variabilité données pour les trois premières composantes
principales
Axe 1 2 3
Valeur propre 3,657 3,090 1,350
Variation (%) 28,127 23,770 10,384
Cumul (%) 28,127 51,897 62,281
Vecteurs propres AT (-0,282) ST (-0,315) P (0,556) Zn (0,711)
pH (0,303) SR (-0,427)
H% (0,440) CD (0,356)
SC (-0,383) Na (-0,382)
r (-0,439) Cu (0,432)
TSS (-0,377)
164
Annexe 7 : Cosinus carrés et coordonnées des cultivars retenus par l’ACP
Cultivars Cosinus carrés Coordonnées
F1 F2 F3 F1 F2 F3
ART4 0,050 0,587 0,000 -0,836 2,877 -0,052
BHL3 0,339 0,269 0,049 -1,946 1,734 0,742
BHL1 0,192 0,244 0,009 -1,565 -1,766 0,345
BHL7 0,000 0,349 0,425 0,060 -2,443 2,697
BZR2 0,007 0,478 0,009 0,241 -2,001 0,271
DEG1 0,095 0,659 0,001 -0,953 -2,510 -0,114
DGA3 0,793 0,065 0,000 4,223 1,208 -0,026
DGB4 0,008 0,227 0,164 0,359 1,915 1,626
DGB1 0,504 0,004 0,200 -3,289 0,304 2,069
DGD3 0,526 0,309 0,017 -4,146 3,177 0,754
DGN5 0,225 0,407 0,046 1,486 1,996 0,673
DGZ5 0,146 0,404 0,016 -1,342 2,234 -0,448
ELG5 0,331 0,162 0,036 1,753 -1,229 0,576
ELZ5 0,004 0,094 0,552 -0,410 -2,013 4,870
FER6 0,007 0,451 0,000 -0,198 1,546 -0,006
GHS 6 0,373 0,431 0,002 3,202 3,444 0,227
GHS1 0,533 0,072 0,095 3,819 -1,404 1,614
GHS7 0,566 0,129 0,013 3,260 -1,555 0,487
GHZ7 0,247 0,162 0,216 -1,517 1,227 -1,419
GHZ’7 0,020 0,476 0,003 0,286 -1,381 0,103
HAL1 0,524 0,149 0,003 -3,253 -1,735 0,240
HAL7 0,457 0,006 0,267 -1,525 -1,465 1,770
HAM5 0,120 0,635 0,003 1,146 2,636 0,171
HHM1 0,469 0,033 0,282 -0,143 -0,907 -1,375
HRR3 0,419 0,513 0,012 -2,641 2,922 0,451
HRR7 0,654 0,023 0,057 -2,885 -0,544 -0,848
ITM3 0,776 0,157 0,005 3,904 1,754 0,318
KBM5 0,328 0,005 0,010 -2,392 0,295 -0,427
KHL1 0,167 0,603 0,026 1,652 -3,141 -0,655
LMS5 0,045 0,340 0,050 -0,544 1,496 0,571
MDG5 0,011 0,702 0,005 -0,403 3,275 0,268
MDG7 0,469 0,013 0,104 -2,626 -0,443 -1,238
MEB7 0,378 0,233 0,000 2,263 -1,777 -0,075
165
NDN7 0,171 0,424 0,024 -1,630 -2,564 -0,612
RTA7 0,159 0,009 0,444 0,861 -0,209 -1,439
SAF3 0,738 0,051 0,002 2,792 0,737 -0,146
SAF1 0,001 0,522 0,161 0,089 -1,941 -1,077
SBL7 0,558 0,113 0,007 2,835 -1,274 0,316
SOK1 0,185 0,168 0,179 -1,329 -1,269 -1,309
SOK7 0,421 0,005 0,331 -1,676 -0,178 -1,487
SRS1 0,005 0,576 0,017 0,323 -3,395 -0,576
TCH5 0,286 0,034 0,462 1,474 -0,506 -1,876
TCH5’ 0,280 0,187 0,012 -1,689 1,381 -0,354
THW5 0,036 0,433 0,069 0,455 1,571 0,627
TJR3 0,009 0,458 0,111 -0,366 2,570 -1,266
TMJ3 0,179 0,408 0,023 1,195 1,803 -0,424
TNS3 0,019 0,377 0,001 0,647 2,882 -0,151
TNT5 0,157 0,196 0,444 1,124 -1,256 -1,889
TNT6 0,593 0,013 0,005 1,539 0,227 -0,145
ZMM6 0,573 0,128 0,001 3,764 1,780 -0,153
Annexe 8 : Pourcentage de variation expliqué par les trosi premiers axes de ACoP
Axes 1 2 3
% 28,76 13,19 7,36
Cumul 28,76 41,95 49,31
Annexe 9 : Résultats de l’AMOVA au sein des clusters de palmier dattier obtenus après
analyse par STRUCTURE.
Source df SS MS Est. Var. %
parmi Pops 1 67,317 67,317 1,200 20%
dans Pops 102 500,635 4,908 4,908 80%
Total 103 567,952 6,108 100%
Annexe 10 : Paramètres génétiques des clusters générés par STRUCTURE. Pour chaque
cluster ; hétérozygotie observée (Ho), attendue (He) et l’indice de fixation (Fis)
Ho He F
cluster1 0,558 0,747 0,254
cluster2 0,531 0,619 0,180
166
Résumé
Résumé
La diversité génétique du palmier dattier (Phoenix dactylifera L.) est très riche en Algérie
pourtant elle n’est pas étudiée et est menacée d’une érosion génétique sévère ce qui rend urgent
sa valorisation pour l’amélioration et la restauration du patrimoine génétique national.
L’objectif de ce travail est l’analyse de la diversité génétique du dattier. Dans cette étude 26
cultivars, parmi les plus fréquents aux Ziban, ont été caractérisés moyennant 53 descripteurs
morphologiques quantitatifs des appareils végétatif et reproducteur, 13 composants chimiques
de la datte et 14 marqueurs moléculaires de type SSRs. Au total, 22 paramètres morphologiques
de la palme, du régime et du fruit ont révélé un fort pouvoir discriminant permettant ainsi la
distinction entre les différents cultivars. Une architecture harmonieuse a été observée dans
l’expression de certains caractères morphologiques, tel qu’entre la palme et le rachis ou les
pennes et les épines, dont le développement et/ou le nombre étaient fortement corrélés. Sur la
base de composants chimiques discriminants : la teneur en eau, teneurs en sucres (totaux,
réducteurs et saccharose), pH et acidité titrable, quatre classes de dattes ont été décrites en
fonction de leur consistance. Une variation intraclonale notable dans la composition chimique
des dattes a été observée. Les 14 SSR ont révélé une diversité moléculaire élevée avec une
structure génétique faible séparant les 52 accessions (26 cultivars) de palmier dattier en sept
pools génétiques ayant une variabilité intra-population élevée. Le nombre moyen d'allèles
amplifiés (15,78) est élevé avec une hétérozygotie moyenne des loci SSRs (Ho = 0,545, He =
0,532). Sur les 14 SSR utilisés, la combinaison de trois paires d'amorces mPdCIR035,
mPdCIR025 et mPdCIR050 ont efficacement séparé 14 cultivars. Les cultivars étudiés ont été
regroupés en fonction du type de fruit où les groupes dont les dattes sont de consistances molle
et sèche étaient les plus homogènes. Le niveau de similarité obtenu par le dendrogramme
UPGMA était compris entre 0,10 et 0,64 révélant des groupements d’accessions souvent
inattendus. La complémentarité des trois techniques de caractérisation utilisées dans cette étude
est très efficace pour valoriser davantage nos ressources phytogénétiques.
Mots clefs : palmier dattier, diversité génétique, descripteurs morphologiques,
composants chimiques des dattes, microsatellites, UPGMA, STRUCTURE, Ziban.
168
Abstract
Date palm (Phoenix dactylifera L.) genetic diversity is very rich in Algeria. However, it is not
studied and is threatened by severe genetic erosion that makes it urgently needed for the
improvement and restoration of the national genetic patrimoy. The objective of this work is the
analyses of the date palm genetic diversity. In this study, 26 cultivars, among the most common
in the Ziban, were characterized using 53 quantitative morphological descriptors of the
vegetative and reproductive parts, 13 chemical components of the date and 14 SSRs molecular
markers. In total, 22 morphological parameters of the palm, the bunch and the fruit revealed a
high discriminating power allowing the distinction between different cultivars. Harmonious
architecture was observed in the expression of some morphological characters, as between palm
and rachis or the pinnae and spine, whose component development and or the number was
highly correlated.
Based on discriminating chemical components: water content, sugar content (total, reducing
and sucrose), pH and titratable acidity, four classes of dates have been described according to
their consistence. Significant intraclonal variation in the date’s chemical composition was
observed. The 14 SSRs revealed high molecular diversity with a weak genetic structure
separating the 52 accessions date palm (26 cultivars) into seven genetic pools with high intra-
population variability. The mean number of amplified alleles (15.78) is high with medium
heterozygosity of the SSRs loci (Ho = 0.545, He = 0.532). Out f the 14 SSRs used, the
combination of three primer pairs mPdCIR035, mPdCIR025 and mPdCIR050 effectively
separated 14 cultivars. The cultivars studied were grouped according to fruit type where the
groups whose dates with soft and dry consistence were the most homogeneous. The level of
similarity obtained by the UPGMA dendrogram was between 0.10 and 0.64, revealing groups
of accessions that were, often, unexpected. The complementarity of the three characterization
techniques used in this study is very effective in enhancing the value of our phytogenetic
resources.
Key words: date palm, genetic diversity, morphological descriptors, chemical components
of dates, microsatellites, UPGMA, STRUCTURE, Ziban
169
( Phoenix dactylifera L.)
. .
53 26
22 . 14 13
.
: .
. ( )
SSR .
. ( 26) 52
14 .(Ho = 0,545, He = 0,532) (15.78)
. 14 mPdCIR050 mPdCIR025 mPdCIR035
.
. 0.64 0.10 UPGMA
.
. :
. ,UPGMA, STRUCTURE
170