Les

virus
 Plan
1. Définition
2. Structure du virus

A. L’acide nucléique.
B. La capside virale :
 Capside à symétrie icosaédrique.
 Capside à symétrie hélicoïdale.
C. L’enveloppe virale.

3. Classification du virus

 Virus à ARN.
 Virus à ADN.
 Historique
1-19 eme siècle sur des caractères négatifs :
 Invisibles en microscopie
 Non cultivables
 Non arrêtés par les filtres

2-1898 : notion de virus filtrants : découverte du virus de la mosaïque du tabac : VMT/TMV ( sève
de tabac malade ) .

 premiers virus :
 Animal : virus de la fièvre aphteuse
 Humain : virus de la fièvre jaune
 Bactérien : bactériophage

3- Années 1940 de l’invisible au moléculaire :

 Apport de la microscopie électronique : le virus se voit !
 Le phage du colibacille contient de l’ADN
4-Années 1950 : les cultures cellulaires
 culture des virus
 premiers vaccins , microscopie électronique : capsides à symétrie hélicoïdale ou cubique

5- Définition de ANDRE Lwoff en 1957 : compréhension de l’interaction entre virus et cellules .

 INTRODUCTION

• La virologie est la science qui étudie les virus. Elle est

étudiée par des virologues ou virologistes.

• Le mot virus est issu du latin virus, qui signifie

« poison ». Se terminant par un s, il ne prend pas de
marque particulière au pluriel en français.
• Les virus sont encore l'un des plus grand réservoir sur
la Terre de diversité génétique inexplorée.
 Nature du virus ??
• Les virus possèdent des constituants en commun avec
les cellules vivantes, comme un acide nucléique (ADN
ou ARN) et des protéines.
Cependant, selon la définition du biochimiste Wendell
Stanley, les virus sont de « simples » associations de
molécules biologiques.
 Ils sont le fruit d’une auto-organisation de molécules
organiques
 Le débat entre le caractère vivant ou inerte des virus
reste encore aujourd’hui ouvert.
 Virologie et intérêt médical en quelques chiffres…
Maladies infectieuses : 17 millions de décès par an soit 1/3 de la mortalité humaine
6 maladies représentent 90% des décès par infection dans le monde :
Maladies respiratoires bactériennes 3 millions de décès / an
(pneumocoque) et virales (grippe, virus respiratoire Depuis décembre 2019 ( covid 19) : plus de 3 million
syncitial)

Syndrome d’immunodéficience humaine acquise 3 millions de décès / an

(SIDA dû au HIV)
Diarrhées bactériennes (shigellose, colilose, 2,5 millions de décès / an
choléra, fièvre typhoïde) ou virales (rotavirus)
Tuberculose (Mycobacterium tubertulosis) ~ 2 millions de décès / an

Paludisme (Plasmodium falciparum) ~ 1 million de décès / an (300 à 500 millions de cas

annuels)

Rougeole ~ 900 000 de décès / an (alors qu’il existe un vaccin

efficace!)

Au moins 16% des cancers sont d’origine infectieuse : bactérienne (Helicobacter

pylori…) ou virale (virus des hépatites, virus d’Epstein Barr, papillomavirus…)
 1- Définition

• Le virus : agent infectieux par leur capacité à pénétrer,

à diffuser et à se multiplier dans l’organisme hôte.
Grâce à leur particularité d’infecter les cellules, les virus
constituent un important groupe d’agents pathogènes.

Pour l’homme + autres vertébrés.

Virus ou virion = particule virale mature = une unité

infectieuse.
 Les caractéristiques biologiques communes :
Le virus ne contient qu’un seul type d’acide nucléique :
ARN ou ADN ===== le génome viral.

Le virus se produit à partir de son matériel génétique (AN)

par réplication : il ne se divise pas (les bactéries), pas de
mitose (cellule eucaryote).

Parasite cellulaire obligatoire : manifeste un parasitisme

intracellulaire absolue.
La structure des virus, sans système enzymatique ou
énergétique, le conduit à ne pouvoir se reproduire qu’au sein
d’une cellule vivante.

Le virus donc détourne à son profit l’ensemble des systèmes

de biosynthèse de la cellule qu’il parasite (ribosomes,
enzymes…) pour la synthèse de ses propres métabolites.
  Le virus présente une structure spécifique : il est
constitué obligatoirement de (02) deux éléments de
structure :
 Le génome (An) = porteur de l’information générique
 La capside : membrane externe.
Pour certains virus, la capside est entourée d’une
enveloppe
.
 Le virus possède une spécificité d’hôte contrôlée par
un récepteur à la surface de la cellule, auquel
correspond un site d’attachement à la surface du virus.
C’est grâce à la reconnaissance de ces récepteurs que
le virus pénètre et infecte la cellule hôte = provoque la
maladie.
• En résumé, les 5 caractères de définition du virion
sont les suivants :

1. un seul type d'acide nucléique (ADN ou ARN)

qui constitue le génome viral

2. une reproduction par réplication du génome

3. un parasitisme intracellulaire absolu

4. une structure particulaire

5. une spécificité d’hôte

 2- Structure du virus
A. L’acide nucléique : Génome viral

 Constituée d’un seul type d’acide nucléique : acide

désoxyribonucléique (ADN) ou acide ribonucléique
(ARN), il constitue le premier critère de classification
des virus.

 Pauvreté génétique des virus : Le nombre restreint de

gènes empêche les virus de coder la synthèse des
différentes enzymes du métabolisme, le virus trouve
dans la cellule hôte qu’il parasite les éléments
indispensables à toutes biosynthèse.
 La longueur et le poids moléculaires : variables selon
la nature de l’AN.
– Génome à ADN : PM= 03 à 160 M d
ADN viraux sont généralement bi caténaires, parfois
monocaténaires
– Génome à ARN : PM= 2.5 à 15 M d
ARN viraux sont généralement monocaténaires, parfois
bi caténaires.

Sont linéaires, circulaires ou segmentés

• Virus grippe (segmenté)
• Virus réoviridae (linéaire)
• Virus hépatite B (circulaire).
A: virus nu
B: virus enveloppé

1: capsid
2: nucleic acid
3: capsomer
4: nucleocapsid
5: virion
6: envelope
7: spike (envelope glycoproteins)

ADN ou ARN

Virus enveloppé
B. La capside virale :
 Structure polymérisée à base de sous –unités protéiques
(Capsomères), qui entoure le génome viral.

 Joue le rôle de protection du génome viral dans le milieu

extracellulaire et porte les structures antigéniques et le site
d’attachement au récepteur cellulaire.

 Elle protège l’information génétique et facilite le transfert

de cette information à la cellule.

 La structure compacte fermée par l’assemblage de la

capside autour du génome s’appelle : nucléocapside.

 Au ME : la structure externe des virus, (02) deux types de

capsides virales (02 type principaux de symétrie) :
  Capside à symétrie cubique : « capside icosaédrique »

 C’est un polyèdre régulier constitué de 20 faces

triangulaires, 12 sommets. Les unités de structure sont
généralement regroupées en oligomères appelées
capsomères, régulièrement disposés.

 La plupart des virus icosaédriques ont :

- Capsomère à 05 unités de structure ou ponton sur
chacun des 12 sommets de l’icosaèdre.
- Capsomère à 06 unités de structure ou héxons sur
les faces .

 Caractéristiques des virus icosaèdres : même diamètre

de la capside et le nombre fixe de capsomères
Exemple : Adénovirus, Entérovirus, Herpes virus.
  Capside à symétrie hélicoïdale :

 Capsides tubulaires, les unités de structure sont disposées en

hélice autour du génome= le génome est enroulé en spirale.
 Capside flexible, s’enroule sur elle-même = morphologie
sphérique.
 Elle est décrite quantitativement par le nombre d’unité par tour
d’hélice.
Exemple : Orthomyxoviridae

 Capside à symétrie mixte :

Exemple : Bactériophage.
Schéma d’une capside hélicoïdale

1:Nucleic acid, 2: capsomer

3: capsid

Schéma d’un virion icosaédrique

Schéma d’un bactériophage

C. L’enveloppe virale :

 De composition lipido – glucido- protéine, les unités

structurales sont des peplomères.

 Elément propre à certains virus seulement : les virus

enveloppés par opposition aux virus nus dépourvu
d’enveloppe.

 Constitue un 3éme critère de la classification des virus

(virus enveloppé).
• L’acquisition de l’enveloppe par le virus se fait dans la
dernière phase du cycle de réplication virale, en général par
bourgeonnement de la nucléocapside à travers l’une des
membranes cellulaires :mb cytoplasmique, nucléaire, Retic
endoplasmique.
• Au moment du bourgeonnement, la MB subira une
modification par les protéines spécifiques virales,
synthétisées dans les phases précédentes de la
multiplication
 Les protéines de l’enveloppe peuvent avoir une ou plusieurs
fonctions différentes dans la biologie du virus : morphologique,
antigénique, hemagglutinante, enzymatique ou site d’attachement
au récepteur cellulaire.
 Chez certains virus, une matrice protéine (Protéine M) d’origine
virale double l’enveloppe à l’intérieur, séparant celle-ci de la
nucléocapside et lui confère une certaine rigidité.

 L’enveloppe ne constitue pas un élément de protection virale, au

contraire c’est un élément de fragilité : par son contenu lipidique,
elle confère au virus sa sensibilité aux TRT par les solvants
organiques, ainsi le TRT des virus enveloppés par l’éther conduit a
la perte de leur infecsiosité.

Donc: Les virus enveloppés sont plus fragiles que les virus nus
Virus enveloppé:
HIV
Covid-19
Virus enveloppé: HIV
 3- Classification du virus
En familles :

 Depuis 1960, un système de classification dit LHT (Lwoff, Horne

et Tournier) retient les caractères objectifs de classification des
virus :

1) La nature de l’acide nucléique : permettant de distinguer les

virus à ADN des virus à ARN.

2) La symétrie de la nucléocapside, hélicoïdale, cubique ou

mixte.

3) La présence ou l’absence d’une enveloppe : virus enveloppé

ou nu.
4) Le nombre des capsomères, dans le cas des virus
cubique ou le diamètre de la nucléocapside : si elle est
hélicoïdale.

 Depuis 1975, un comité international de taxonomie des

virus a adressé une classification des virus en :

 Famille (viridae)
 Sous – famille (virinae)
 Genre (virus)

5) Il existe une classification basée sur des critères

épidémiologiques, selon le mode de transmission :
Exemple :

• Virus entériques : infection par ingestion : rotovirus,

réovirus, picornavirus.

• Virus respiratoires : transmis par inhalation ou par aérosol,

paramyxovirus.

• Virus oncogènes : transmis par contact direct : herpès

virus, papovavirus.

• Les arbovirus : transmis par piqûre d’insecte ou morsure,

rhabdovirus.
 VIRUS A ARN
Enveloppé Togaviridae
Flavividae
Cubique
NU Picornaviridae
Reoviridae
Caliciviridae
•
ARN Hélicoïdale Enveloppé
• Paramyxovorodae
• Orthomyxovorodae
Rhabdovaradae
Bunyaviridae
Coronaviridae
Filoviridae

• Complexe Enveloppé Retroviridae

Arenaviridae
 VIRUS A ADN
Herpesviridae
• Cubique Enveloppe Hepadnaviridae
•
• Nu Adenoviridae
• Parvoviridae
• Papovaviridae
ADN• Iridoviridae

•
•
• Complexe Enveloppé Poxviridae