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Biochimie – Les molécules de la vie

Portail Louis Pasteur - Année universitaire 2019-2020 (Session 1)
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Durée 2 heures
Important : indiquez votre numéro de groupe sur votre copie

Question n°1 (4 points - 25 min.)

On veut séparer 3 protéines, A, B et C par chromatographie sur une résine substituée par des groupements
sulfonate (SO3-). Les points isoélectriques de A, B et C sont respectivement 7,3 ; 6,2 et 9,7 à 25°C. On dépose
un mélange de ces trois protéines sur la colonne équilibrée à pH 5, puis on élue en amenant progressivement le
pH à 7,5.
a) Quel est le type de chromatographie utilisé dans cette expérience ? Décrivez le principe général de la
chromatographie. (2 points)
b) Quelle(s) est(sont) les protéines qui sont retenues sur la colonne ? Pourquoi ? (0,5 point)
c) Quelles protéines sont éluées par augmentation du pH et dans quel ordre ? Pourquoi ? (1 point)
d) Par quel autre moyen aurait-on pu éluer les protéines ? (0,5 point)

Question n°2 (6 points - 40 min.)

a) Quel est le rôle biologique du glucose et de ses polymères, amidon, glycogène, cellulose ? (1,5 point)
Le disaccharide X est composé de D-allose et de D-galactose, deux épimères du D-glucose, respectivement
en C3 et en C4.
b) Définissez le terme « épimère ». (0,5 point)
c) Dessinez le D-glucose, le D-galactose et le D-allose en projection de Fischer. (2 points)
d) Représentez le disaccharide X en projection de Haworth sachant que son nom complet est
D-allopyranosido (β1→4) D-galactopyranose. (1 point)
e) Définissez le phénomène de mutarotation. Ce phénomène sera-t-il observé pour le disaccharide X ? (1
point)

Question n°3 (4 points - 20 min.)

a) Soit un triglycéride composé de glycérol estérifié par les acides gras C16 :0 et C16 :1(9). Expliquez le
symbole Cn :n’(x) et donnez le nom des 2 acides gras. Lequel d’entre eux aura le point de fusion le plus
faible ? Justifiez. (1,5 point)
b) Quelle est la fonction biologique principale des triglycérides ? (0,5 point)
c) On considère maintenant une phosphatidylcholine (ou lécithine) PC sur laquelle le carbone 1 du glycérol
est estérifié par l’acide linolénique (C18 :3(9 ;12 ;15)) et le carbone 2 par l’acide palmitique. Donner la
formule topologique ou la formule semi-développée de ce composé. Quelle est la charge de la molécule au pH
physiologique ? Peut-on dire de cette molécule qu’elle est amphiphile ? Justifier. (1,5 point)
d) A quelle classe de lipide appartient cette molécule ? Où peut-on la trouver dans une cellule ? (0,5 point)

Question n°4 (6 points - 35 min.)

a) Nommez les molécules ci-dessous précisément. (1 point)

b) A partir de ces molécules, construisez un simple brin d’ADN de séquence 5’-ATGG-3’, en précisant où
se situent les extrémités 3’ et 5’. (Nous vous conseillons de dessiner le brin d’ADN verticalement sur votre
feuille pour avoir assez de place). (1 point)
c) Ce brin est copié par l’ADN polymérase pour former un ADN double brin. Comment s’appelle ce
mécanisme ? (1 point)
d) Quelle sera la séquence du brin synthétisé à partir du brin 5’-ATGGATCCATG-3’ ? Sur votre copie,
vous indiquerez avec une flèche le sens de progression de l’ADN polymérase pendant la synthèse de ce
nouveau brin. (1 point)
e) Quel(s) type(s) de liaisons permet(tent) la formation de la structure double brin d’ADN ? Développez
votre réponse le plus précisément possible. (1 point)
f) L’amplification d’un brin d’ADN double brin en laboratoire par la technique de PCR (polymerase chain
reaction) nécessite de chauffer l’ADN à une température de 98°C. Quelle est la conséquence structurale de
l’augmentation de température sur l’ADN ? Comment s’appelle ce phénomène ? (Précision : à cette
température, les acides nucléiques ne sont pas détruits). (1 point)
 -3- -4-
O

O O
N+
O P O

CORRIGE
O
tête polaire queues apolaires
O-
c) HYDROPHILE HYDROPHOBE

÷÷÷÷÷÷÷÷ Molécule neutre, avec une partie hydrophile et une partie hydrophobe = amphiphile
d) Classe des glycérophospholipides ; les PC sont les constituants majeurs des membranes biologiques.
Question n°1 (4 points - 25 min.)
a) Chromatographie par échange d'ions (de cations). Question n°4 (6 points - 40 min.)
La chromatographie est un principe général d'analyse qui assure, par des procédés divers, la séparation des a) Il s’agit de :la désoxyadénosine triphosphate, la désoxythymidine triphosphate et la désoxyguanosine triphosphate
constituants d'un mélange grâce à l'utilisation de 2 phases non miscibles. On appelle soluté l'échantillon à analyser. Il est b)
en général mis en solution dans un solvant approprié. La phase stationnaire est liquide (eau, solvants organiques) ou 5’ A
solide (composés minéraux: alumines, silices; produits naturels: cellulose, dextrane, agarose; produits de synthèse:
résines). La phase mobile est constituée par un liquide (eau, solutions salines, solvants organiques) dans la
chromatographie en phase liquide ou bien un gaz dans la chromatographie en phase gazeuse (CPG). En progressant avec T
la phase mobile, le soluté abandonne sur la phase stationnaire divers constituants plus ou moins solidement fixés.
L'élution, dernière étape de la chromatographie sur colonne, consistera à décrocher ces constituants en changeant les G
propriétés de la phase mobile, afin de les recueillir et de les doser séparément.
b) Les trois protéines ayant un pHi supérieur au pH de la colonne (pH=5), sont donc chargées positivement. Elles G
seront donc toutes les trois retenues sur la colonne.
c) Lorsqu'on passe de pH=5 à pH=7,5 pour l'élution, on atteint d'abord le pHi de B (6,2) puis celui de A (7,3). On élue H
donc d'abord B puis A, mais pas C qui reste chargée positivement donc retenue sur la colonne. 3’
d) Par un gradient croissant de [NaCl].
c) L’ADN simple brin est copié par l’ADN polymerase lors de la réplication.
d) 3’TACCTAGGTAC5’
Question n°2 (6 points - 35 min.) ß
a) Le glucose est une source d’énergie pour la plupart des organismes vivant. Sa dégradation par le métabolisme e) Les deux brins d’ADN s’associent par des liaisons hydrogènes entre les bases complémentaires présentes sur les 2
permet la synthèse d’ATP. L’amidon et le glycogène sont des formes de stockage du glucose, chez les végétaux et les brins (2 liaisons entre les bases A et T, 3 liaisons entre les bases G et C).
animaux respectivement, et servent donc de réserves énergétiques. La cellulose a un rôle structural au niveau de la paroi f) L’augmentation de la température va provoquer la rupture des liaisons hydrogènes, ce qui va provoquer la
des cellules végétales. séparation des 2 brins d’ADN. C’est la fusion ou dénaturation de l’ADN.
b) Les épimères sont des oses stéréoisomères qui ne diffèrent que par la configuration d’un seul carbone asymétrique.
c)

d)

e) La mutarotation désigne la modification de pouvoir rotatoire au cours du temps, observée lorsqu’il y a un

changement dans l’équilibre des formes anomères d’un ose. Le disaccharide X présentera bien un phénomène de
mutarotation, le carbone anomérique du résidu galactose étant libre.

Question n°3 (4 points - 15 min.)

a) Cn indique le nombre d’atomes de C dans la molécule et n’ le nombre de doubles-liaisons éthyléniques (C=C). On
indique entre parenthèses (x) la position des doubles-liaisons en précisant le numéro du premier carbone doublement lié.
C16 :0 = acide palmitique
C16 :1 (9) = acide palmitoléique
Point de fusion le plus faible : acide palmitoléique ; la double liaison cis engendre un écart à la linéarité des chaines
carbonées et empêche donc l’arrangement des AG. Plus il y a de doubles liaisons, plus le point de fusion est bas.
b) Réserve d’énergie à long terme, stockage au niveau des cellules adipeuses pour les animaux, dans des inclusions
huileuses pour les graines des plantes oléagineuses.