Cours Pédologie 2017-18
Cours Pédologie 2017-18
Cours Pédologie 2017-18
Agnès Richaume-Jolion
UMR CNRS 5557 Ecologie Microbienne
Bât. Mendel, 4ème étage
agnes.richaume@univ-lyon1.fr
Bibliographie
http://www.afes.fr/videotheque/
Les objectifs
Le sol est un volume qui s’étend depuis la surface de la Terre jusqu’à une
profondeur marquée par l’apparition d’une roche dure ou meuble, peu
altérée, ou peu marquée par la pédogenèse. L’épaisseur du sol peut varier
de quelques centimètres à quelques dizaines de mètres, ou plus. Il constitue,
localement, une partie de la couverture pédologique qui s'étend à
l'ensemble de la surface de la Terre. Il comporte le plus souvent plusieurs
horizons correspondant à une organisation des constituants organiques
et/ou minéraux (la terre). Cette organisation est le résultat de la pédogenèse
et de l'altération du matériau parental. Il est le lieu d’une intense activité
biologique (racines, faune et micro organismes).
Action de
l’homme
climat
+
topographie
Organismes
vivants
roche mère
temps
Un horizon est une couche apparemment
homogène de sol
- micas (feuillets)
SiO2 + Al2O3 + (MgO, Fe2O3, FeO, K2O…)
vermiculites
Carbonates :
- de calcium (calcite) calcite
-mixtes Ca et Mg
-ex : dolomite CaMg (CO3)2
+ apatite (P), pyrite (S)
Les roches
Eruptives = ignées
- grenues ou granitiques
- porphyriques ou microlithiques
Métamorphiques
- gneiss
- micaschistes
(durcissement +/- cristallisation de roches silicatées)
Sédimentaires
- clastiques (riches en silice et silicates)
- calcaires (craies, calcaires fins ou durs)
- mixtes
3-2) Les étapes de la formation du sol
3-2-1) Désagrégation
- dynamique
- statique
Squelette du sol:
Cailloux, graviers, sables…
Sol squelettique
Le Cairn du Rousset - Ste Victoire (13)
flickr.com/photos/jardindemarandon/3486591752/
3-2-3) Colonisation par les végétaux et enrichissement en matière
organique
litière
Complexe argilo-
humique
Sol jeune
uuuuuuuuuuuuuuu
Lessivage
Evaporation
uuuuuuuuuuuuuu litière
A Horizons riches en M.O
Horizons lessivés ou
B d’accumulation (argile, oxydes
de fer…)
C Roche-
mère
Sol mûr
3 km from Braemore, Highland, Great Britain
www.geograph.org.uk/photo/218892
Exemple de sol très lessivé:
Podzol
Ao peu décomposé
A2 lessivé cendreux
• La classification “internationale”
WRB (World Reference Base for Soil Resources) en 1982
4) Les grands types de sols en France métropolitaine
et leur localisation
La texture du sol
SOLIDES
ESPACE PORAL
5-1 Granulométrie
• Classification par grosseur (diamètre)
• Indépendant de la nature minéralogique
• Réalisée sur la terre fine ( < 2mm)
Analyse granulométrique
(cf TP)
• Stratégie d’échantillonnage
– Choix de l’horizon
– Nombre de prélèvements
– Hétérogénéité de la parcelle
• Appréciation au toucher: Test du
boudin
Terre fine
La représentativité pondérale
des différents constituants
minéraux permet d’apprécier
la texture du sol
Classification des textures
Exemple:
%S = 50%
%L = 35%
%A =15%
Trouble permanent
dans l’eau
Dépôt d’argile
Eau limpide
Propriétés des argiles
KAOLINITE
SMECTITE
6) La fraction organique
• Fraction peu importante quantitativement: rarement >10%
• Rôle primordial
• 4 classes selon le degré d’évolution
- êtres vivants = Biodiversité
-Matière Organique Fraîche: matière première de
l’humus
- produits transitoires = « Humus jeune »
(cellulose, lignine, protéines, sucres…)
- humus stable: synthétisés au cours de l’humification
6-1) Biomasse et biodiversité dans les sols
<10%
65 106 à 108
Arthropodes
inférieurs
Autres insectes
20%
200 g de terre
=
0,5 g de matière
vivante invisible
Erika Micheli
La biomasse dans les sols
1 ha de prairie
= 2000 moutons
La biomasse microbienne dépend
de l’usage des sols
Les fonctions attribuées aux (micro)organismes du sol
matière
organique
Rôle fondamental
Devenir de la Matière Organique Fraîche
Minéralisation
NH3 CO2
primaire
PO43- SO42-…
matière
organique Réorganisation
NH4+ CO2
Humification HUMUS NO3- PO43-
SO42-…
Minéralisation
secondaire
2) Transformation de la matière organique: humification
Lampe
Mésofaune
h variable
Appareil L variable Entonnoir
de Berlèse
Grille sur laquelle
on pose l’échantillon
Chaleur et lumière Récipient
avec
Produit
mouillant
Les différentes formes d’humus MOR
MULL MODER
+
pH -
Vitesse de dégradation
Cf pdf « types d’humus »
En anaérobiose
Types pH C/N Taux Conditions Décomposition Humification Minéralisation
saturation formation MOF humus
Tourbe 3,5 30- <10 Saturé d’eau Moyenne Très lente Très difficile
acide -4 40 acide
Tourbe 7- 15- Presque Saturé d’eau Lente (accumul.) Très lente Très difficile
calcique 7,5 30 saturé calcaire Peu faune
champ acidoph
6-4 Le sol en tant que puit de carbone
0,8 an
4 ans 0,2 an
0,4 an
40 ans
>4000 ans
Pédologie
Constitution, formation et
fonctionnement du sol en conditions
non perturbées
Agnès Richaume-Jolion
Laboratoire d’Ecologie Microbienne,
UMR CNRS 5557
Université Claude Bernard Lyon 1
agnes.richaume@univ-lyon1.fr
Source ADEME, GIS Sol
Cf Pdf
https://youtu.be/CM2KcNUUEcQ
7) Propriétés physiques
Origine biologique
Structure massive
Types de structures
construites
fragmentaires
Structures construites en
agrégats
• Agrégats fins (1mm)
• Structure grumeleuse (1mm à 1cm)
Structures fragmentaires
• Structures par fissuration
Structures fragmentaires
• Structures polyhédrique, prismatique, lamellaire,
Structures polyédriques sub-anguleuses
Stabilité structurale:
facteurs de variation
Test simple de la
stabilité
structurale du sol
L’eau retenue dans le sol échappe à la gravité et son énergie libre est plus faible
que celle de l’eau non retenue. Cette diminution d’énergie libre est appelée
POTENTIEL MATRICIEL (qui est donc une valeur négative!). En pratique il est
exprimé par le log décimal de la force de succion (exprimée en cm de hauteur
d’eau retenue par capillarité)
pF 4,2 pF 2,7
Saturation en eau
Capacité au champ
Méthodes de mesures
• Sol saturé
• Appliquer une pression (ou dépression)
• Elimination de l’eau non retenue
• Mesure du % humidité
WHC: méthode Bouyoucos
Water Holding Capacity
Éponge
humide
joint
Saturation
(12H) 25 cm Hg =
1/3 atm
WHC: autres méthodes
• Pression (cf presse à membrane)
2.6E-04
Evolution saisonnière
20 cm
en trois phases avec
60 cm
2.1E-04
100 cm baisse du gradient de
[CO2] (mol/l)
180 cm
1.6E-04 200 cm
CO2 atm
concentration
1.1E-04
6.0E-05
enfouissement
Production de CO2
résidus
1.0E-05 après enfouissement
19/10/01 18/11/01 18/12/01 17/01/02 16/02/02 18/03/02 17/04/02
60
des résidus
50
40
Pics de concentrations
P (mm)
30
20
après les pluies :
10
blocage à la diffusion
0
et activité
19/10/01 18/11/01 18/12/01 17/01/02 16/02/02 18/03/02 17/04/02
Date
microbienne
Propriétés chimiques
9) Les propriétés chimiques du sol
Modification possible de la
biodisponibilité de certains
éléments
• 2 types d’ions sur le complexe:
- ions acides: H+ et Al3+
- ions basiques: Ca2+, Mg2+, K+, Na+,
(NH4+, Mn2+, Cu2+, Zn2+ )
= bases échangeables
T-S S basiques
acides
Sol alcalin
Chernozem T = 30 cmol+/kg , sol saturé
T =40 cmol+/kg S/T=80 à 90% pH 9
pH 7,5 - 8,5
Ca
Mg+K
Ca
Al
Mg+K
H
Al
H
Podzol
Sol brun T=10 cmol+/kg S/T < 20%
T=20 cmol+/kg, S/T=40 à 50% pH 4-5,5
pH 6,5-7,5
pH et pouvoir tampon
• Acidité actuelle = ions libres en solution
• Acidité potentielle = ions échangeables
Sol-H Sol + H+
Sol-Al Sol + 3H+ + Al(OH)3
Le pH du sol conditionne:
- la disponibilité en nutriments pour les plantes
- la mobilité et la biodisponibilité des métaux lourds
- ….
Mg2+ K
K+
+ K+
Mg2+ K+
H+ H+ H+ H+
NH4 + NH4 +
NH4 + NH4 +
K+ H+
H+ Ca2+ Na +
Ca2+ NH4 Na
+
+
NH 4
+
H+
K+ H+ K+ Mg2+ HH
++
Mg2+ H+ NH4 +
H+ Na+ NH4 + H+ Na+ Mg2+
Mg2+ Mg 2+
H+ Mg
2+
NH4
+
NH4 +
2+ NH4
+ H+ +
Mg2+ H+ Ca2+NH4 + Mg2+ Ca 2+ H + Ca
H +Ca 2+
Ca2+ H+ Ca2+
K+ Mg2+ H
+
K+ Mg2+ H+ K+
K+ Na + K+ K+ Na +
KNa
+ K+
Mg2+
K + K+
Na + Mg2+ K+ +
H+
H+
H+ K+
H+
Mesures
Eau KCl
sol sol
1
CaCO3 + CO2 + H2O (CO3H)2Ca
2