Nella stagione 2006-2007 la Lucchese ha partecipato al trentaquattresimo campionato di terza serie della sua storia, nel girone A della Serie C1. Inizia il torneo nel migliore dei modi, con quattro vittorie nelle prime cinque partite, al termine del girone di andata è ancora terza con 28 punti, poi qualcosa si inceppa nei meccanismi di squadra e perde posizioni, a fine gennaio 2007 dopo tre pari di fila, il tecnico Paolo Stringara subentra al posto di Fulvio Pea alla guida della squadra rossonera[1]. ma il bel gioco della prima parte di stagione, resta solo un bel ricordo. Il torneo si chiude all'ottavo posto con 45 punti, ma a nove lunghezze dai Play-off. Miglior marcatore stagionale ancora il pugliese Eupremio Carruezzo con 1 centro in Coppa Italia ed 11 reti in campionato, nella sesta stagione a Lucca. Nella Coppa Italia Nazionale la Lucchese esce nel primo turno, superata dal Cesena (0-1) dopo i tempi supplementari. Mentre nella Coppa Italia di Serie C i rossoneri fanno davvero bene, entrano in scena nel secondo turno, avendo disputato la Coppa Italia dei grandi, dove superano nel doppio confronto il Ravenna. Poi nel terzo turno viene eliminato il San Marino, a gennaio si giocano gli ottavi, e la Lucchese supera la Sanremese, nei quarti di finale a febbraio con grande fatica viene superato anche l'ostacolo Cremonese, ma poi nella Semifinale contro il Cuneo, si ferma il lungo e virtuoso percorso lucchese.
^Giornata rinviata all'11 marzo 2007, a seguito dei gravi fatti di Catania del 2 febbraio 2007, nel dopo gara di Catania-Palermo, che hanno causato la morte dell'ispettore di Polizia Filippo Raciti.
^Sulla panchina toscana il nuovo tecnico Paolo Stringara, che ha rilevato Fulvio Pea.