Nella stagione 2006-2007 la Ternana disputa il girone B del campionato di Serie C1, con 39 punti ha ottenuto il dodicesimo posto. Una stagione complessa quella delle fere, già a fine ottobre, dopo la sconfitta (1-0) subita a Manfredonia, salta la prima panchina rossoverde, Giancarlo Favarin viene sostituito dalla coppia formata da Maurizio Raggi e Salvatore D'Urso che resta in sella fino a fine febbraio, poi fino al termine al timone c'è Raimondo Marino. La Ternana ha evitato i Play-out solo grazie ad un finale discreto, battendo il Perugia (2-1) nella terz'ultima giornata, raccogliendo un fondamentale pareggio (1-1) a Martina Franca nella penultima giornata, contro una diretta concorrente, e con la vittoria ottenuta nell'ultima giornata (2-0) contro il Teramo. Miglior realizzatore delle fere il romano Romano Tozzi Borsoi, preso dalla Torres Sassari, con 12 reti in campionato. Nella Coppa Italia nazionale subito fuori per mano del Rimini, che si è imposto (2-0) nei tempi supplementari. Anche nella Coppa Italia di Serie C la Ternana entra ed esce subito negli ottavi, superata nel doppio confronto dal Foggia.
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