Serie Didactica 36 Quimica Biologica

Serie Didctica N 36
Gua terico prctica de Qumica Biolgica
Presentacin
El presente material esta dirigido a los estudiantes de la Facultad de Ciencias Forestales de la Universidad Nacional de Santiago del Estero y corresponde a la programacin de las asignaturas que se dictan en la ctedra de Qumica Orgnica y Biolgica. La organizacin implica guas de problemas y ejercicios relacionados con los conceptos bsicos de Qumica Biolgica. En cada tema se incluyen los conceptos tericos bsicos los cuales simplemente resumen los conceptos previamente desarrollados en las clases tericas. Al igual que la correspondiente serie de problemas relacionados con la Qumica Orgnica, los problemas y ejercicios estn seleccionados con la intencin de facilitar la comprensin y asimilacin de los diferentes temas, abarcando desde las biomolculas hasta llegar a su participacin en el metabolismo celular. En cada tema se incluyen como datos anexos las correspondientes estructuras como as tambin algunos parmetros relacionados con las propiedades de cada biomolculas. Finalmente, solo cabe expresar el deseo de que este material sea til y cumpla con los objetivos propuestos como as tambin dejar una puerta abierta a sugerencias y/o correcciones que desde ya sern agradecidas. La ctedra
Dra. Evangelina Gonzlez. Ing. Adriana Corzo-Facultad de Ciencias Forestales-UNSE
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Tabla de contenidos
Presentacin................................................................................................... 1 Gua N 1 ......................................................................................................... 4 Tema: LIPIDOS............................................................................................... 4 Introduccin terica ...................................................................................... 4 Problemas y ejercicios.................................................................................. 6 Gua N 2 ........................................................................................................11 Tema: HIDRATOS DE CARBONO.................................................................11 Introduccin terica .....................................................................................11 Problemas y ejercicios.................................................................................16 Gua N 3 ........................................................................................................24 Tema: AMINOCIDOS Y PROTENAS..........................................................24 Introduccin terica .....................................................................................24 Problemas y ejercicios.................................................................................29 Gua N 4 ........................................................................................................35 Tema: ENZIMAS............................................................................................36 Introduccin terica .....................................................................................36 Problemas y ejercicios.................................................................................41 Gua N 5 ........................................................................................................51 Tema: CIDOS NUCLEICOS ........................................................................51 Introduccin terica .....................................................................................51 Problemas y ejercicios.................................................................................55 Gua N 6 ........................................................................................................59 Tema: BIOENERGTICA Y METABOLISMOS ..............................................59 Introduccin terica ......................................................................................59 Problemas y ejercicios.................................................................................63 Gua N 7 .......................................................................................................69 Tema: METABOLISMO DE LOS LPIDOS ....................................................69 Problemas y ejercicios.................................................................................69 Bibliografa ....................................................................................................73
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Gua N 1 Tema: LIPIDOS Objetivos: Conocer la estructura, clasificacin y propiedades de los lpidos. Comprender la importancia de los lpidos en la estructura y el metabolismo celular Introduccin terica Los lpidos son un conjunto muy heterogneo de biomolculas cuya caracterstica distintiva aunque no exclusiva ni general es la insolubilidad en agua, siendo por el contrario, solubles en disolventes orgnicos (benceno, cloroformo, ter, hexano, etc.). Su estructura qumica es fundamentalmente hidrocarbonada con gran cantidad de enlaces C-H y CC. La naturaleza de estos enlaces es 100% covalente y su momento dipolar es mnimo. El agua, al ser una molcula muy polar, con gran facilidad para formar puentes de hidrgeno, no es capaz de interaccionar con estas molculas. Son molculas de almacenamiento de energa, usualmente en forma de grasa o aceite. Adems cumplen funciones estructurales, como en el caso de los fosfolpidos, glucolpidos y ceras y algunos desempean papeles principales como "mensajeros" qumicos, tanto dentro de las clulas como entre ellas. Clasificacin Glicridos Lpidos simples
esteres de cidos grasos y un alcohol
Ceras Fosfolpidos Esfingolpidos Glicolipidos
Lpidos compuestos
esteres de cidos grasos, un alcohol y otras sustancias
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cidos Grasos: son cidos carboxlicos, (-COOH) unidos a una larga cadena hidrocarbonada (12-22 tomos de C) normalmente no ramificada. Existen dos tipos de cidos grasos: saturados (solo enlaces simples), insaturados (dos o mas enlaces dobles por molcula, no conjugados) En la nomenclatura IUPAC, los cidos grasos saturados se nombran de la misma manera que los cidos carboxlicos. En la nomenclatura comn se utilizan letras griegas, el carbono adyacente al carbono carboxlico se designa , y el resto en orden alfabtico, la letra omega () se utiliza para especificar el tomo de carbono mas lejano al grupo carboxilo. Para los cidos grasos insaturados las posiciones de los dobles enlaces se indican por el smbolo N donde N seala el tomo de carbono de nmero menor que lleva la doble ligadura. Una forma de identificacin simplificada consiste en utilizar dos nmeros separados por dos puntos: el primer nmero se refiere al nmero total de tomos de carbono y el segundo al nmero de dobles enlaces Propiedades qumicas de los cidos grasos Propiedades que dependen del grupo carboxilo: 1. Acidez: el grupo carboxilo es el responsable del carcter cido. Sin embargo como la mayora son insolubles en agua, no pueden liberara H+ y por lo tanto no manifiestan el carcter cido. Al aumentar el n de tomos de carbono disminuye el carcter cido 2. Formacin de sales: jabones Ejemplo: CH3(CH2)16COOH + NaOH CH3(CH2)16COO- Na+ Ac. Esterico estearato de sodio 3. Formacin de esteres: los cidos grasos por reaccin con alcoholes dan lugar a la formacin de esteres Ejemplo: CH3(CH2)16COOH + CH3CH2OH CH3(CH2)16COOCH2CH3 Ac. Esterico etanol estereato de etilo Propiedades que dependen de la cadena carbonada
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Oxidacin: los cidos grasos insaturados son mas fcilmente oxidables en presencia de oxigeno atmosfrico. La presencia de dobles enlaces en la molcula de los cidos grasos los hace susceptibles del ataque por el oxgeno provocando cambios qumicos complejos. Resumen de la constitucin de los lpidos
Lpidos Clasificacin Lpidos simples Tipo Triglicridos Ceras Fosfolpidos a- Cefalinas b- Lecitinas Lpidos Esfingolpidos Glicerol + cido(s) graso(s) Alcohol + cido graso (ambos de cadena larga) a- Esfingosina + cido graso + HPO42- + etanolamina b- Esfingosina + cido graso + HPO4 + colina
22-
Partes constituyentes
Compuestos (esfingomielina) Glicolpidos a. Cerebrsidos b. Gangliosidos
Esfingosina + acido graso + HPO4 + colina a. esfingosina + cido graso + azcar simple b. esfingosina + cido graso + 2-6 azucares simples
Problemas y ejercicios 1. Cmo definira un lpido? Clasifquelos, indicando las funciones biolgicas de cada categora lipdica. 2. Entre las siguientes molculas orgnicas, indique cuales corresponden a lpidos: a) glucosa d) glucgeno g) triglicrido a) una grasa d) un terpeno b) maltosa e) caroteno h) esteroide. b) un jabn comn e) una cera c) un fosfolpido. f) un esteroide. c) fosfatidilcolina f) quitina
3. Escriba la estructura general para las siguientes sustancias:
4. Seleccione las respuestas correctas: Un aceite esta formado por cidos grasos insaturados de cadena corta. Un aceite contiene cidos grasos saturados de cadena larga. Una grasa contiene cidos grasos insaturados de cadena corta.
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Una grasa esta formada por cidos grasos saturados de cadena larga. Un aceite esta formado por cidos grasos insaturados de cadena larga. 5. Indique si las siguientes afirmaciones son verdaderas o falsas. En un cido graso los dobles enlaces estn conjugados. Los cidos grasos se encuentran, generalmente, en configuracin cis. Los dobles enlaces de los cidos grasos son muy poco reactivos. Los dobles enlaces de los cidos grasos hacen que disminuya el punto de fusin con respecto al homlogo. 6. En la tabla que se muestra debajo se enumeran los puntos de fusin de algunos cidos grasos. Basndose en estos datos explique la caracterstica fsica entre grasas y aceites.
cido cido Linoleico cido Linolenico cido Mirstico cido Oleico cido Palmitito cido Esterico Punto de Fusin - 5.0 -10.0 53.9 13.4 63.1 69.6
7. Nombre los siguientes cidos grasos e indique si son saturados o no saturados Cuales sern slidos y cuales lquidos a temperatura ambiente? a) CH3(CH2)10COOH b) CH3(CH2)4CH=CHCH2CH=CH(CH2)7COOH c) CH3(CH2)14COOH d) CH3(CH2)7CH=CH(CH2)7COOH 8. Escribe en formula de lneas y ngulos las estructuras de los siguientes cidos: a) Acido palmitoleico: (C16:1)9 c) Acido araquidnico (C20:4)5,8,11,14 b) Acido laurico (C12:0) d) Acido miristico (C14:0)
9. Para el hombre los cidos grasos poliinsaturados son esenciales, como el cido linoleico (6) y el linolnico (3). Estos cidos son abundantes en aceites vegetales y de pescados. Qu entiende por cidos grasos esenciales?
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10. Escriba la frmula estructural para las sustancias nombradas a continuacin, indique a qu tipo de lpidos corresponde y prediga cual ser su estado fsico a temperatura ambiente: a) trilaurato de glicerilo a) palmitolaurooleato de glicerilo b) miristato de linolelo d) araquidato de metilo.
11. Las grasas estn constituidas por mezclas de triglicridos que se diferencian por sus cidos grasos. En la tabla que aparece abajo se muestra la composicin de tres lpidos simples. a) A partir de los datos de la tabla: cmo explica los diferentes estados fsicos, a temperatura ambiente; de cada uno e ellos? b) Qu ocurre con el punto e fusin e un aceite si se realiza una hidrogenacin parcial del mismo? Explique.
Porcentaje de cidos grasos Saturados C4-C12 Aceite de Oliva Manteca Grasa <2 11 <2 C14 <2 10 <2 C16 13 26 29 3 11 21 C18 80 40 46 No saturados C16+C18
12. La
trimiristina es una grasa slida que se encuentra en la nuez
moscada. Su hidrlisis alcalina da como productos un equivalente de glicerol y tres equivalentes de c. mirstico. a) Proponga una ecuacin para esta reaccin. b) Cmo se denomina este proceso y a qu debe esa denominacin? 13. Escriba la ecuacin para la saponificacin del trilinoleato de glicerilo. 14. Complete la ecuacin para la siguiente reaccin. Indique el nombre de todos los compuestos involucrados en la misma.
O C15H31CONa+
sodio con: a) Ca 2+
+ HCl
15. Formular ecuaciones que muestren las reacciones del triestearato de b) Mg 2+ c) Fe 3+
16. a) Qu diferencia estructural existe entre un detergente y un jabn?

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b) Qu ventaja funcional presentan los detergentes con respecto a los jabones? c) Realice un esquema que represente a una gotita de aceite emulsificada por el detergente alquilbencenosulfonato de sodio. 17. Dibuje la estructura del lpido intacto que correspondera a cada una de las siguientes mezclas de productos, obtenidos de la hidrlisis completa del mismo. Diga, adems, a qu clase de lpidos pertenece (por ej: glicrido, cera, fosfolpido, etc. ): a) glicerol, cido palmtico, ac. Esterico, fosfato inorgnico. b) glicerol, c. Palmitoleico, ac. Olico, etanolamina, fosfato inorgnico. c) esfingosina, ac. Palmitico, fosfato inorgnico. d) esfingosina, glucosa, ac. Olico. e) (isopreno)40 18. Cul tendr mayor carcter anfiptico, un glucocerebrsido o una esfingomielina? Explique. 19. Por qu las grasas animales y los aceites vegetales se ponen rancios cuando se exponen al aire? 20. Qu sucede qumicamente cuando se hidrogena un aceite? Por qu tiene este proceso una gran importancia comercial? 21. Completa las siguientes reacciones y escribe la frmula de todos los compuestos involucrados en las mismas: a) trioelato de glicerilo + 3H2 + H2 b) dipalmitolilonelato de glicerilo d) c. olico + O2 e) lauromiristolinoleato de glicerilo + O2 f) alcohol laurlico + c. sulfrico + NaOH 22. Escriba la estructura general para los siguientes lpidos complejos a. Fosfoglicerido b. Esfingomielina 23. Indique cual de las siguientes afirmaciones es correcta: a) La lecitina es un derivado del cido fosfatdico con colina. b) La lecitina es un derivado del c. fosfatdico con serina. c) La lecitina es un derivado de la esfingosina. 24. Elija la respuesta correcta. Un cerebrsido es.....
c) estearopalmitooleato de glicerilo + H2O
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a) Ceramida + glucosa o galactosa b)Ceramida + c. fosfrico. b) Una esfingomielina. 25. Consultando en su libro de texto, escriba las estructuras correspondientes a los terpenos que se indican debajo. Indique el nmero de unidades de isopreno y clasifquelos como monoterpeno, diterpeno y exprese, cuando corresponda, la importancia biolgica de los mismos. a) mirceno d) -caroteno biolgica de los mismos. Datos Anexos
Nombre (contenido de carbono) Estructura RCOOH (descritas como frmulas lineales) Acidos completamente saturados Acido Larico (C12) Acido Mirstico (C14) Acido Palmtico (C16) Acido Esterico (C18) Acido Araquidnico (C20) Acidos Insaturadosa
10 9
b) limoneno e) vitamina A
c) mentol f) retinal
26. Esquematice la estructura de los esteroles y enuncie la importancia
COOH COOH COOH COOH COOH
Acido Palmitoleico (C16:1) 9 Acido Oleico (C18:1) 9 Acido Linoleico (C18:2) 9,12 Acido Linolnico (C18:3) 9,12,15 Acido Araquidnico (C20:4) 5,8,11,14
a En
COOH COOH COOH COOH COOH
Cx::y Dz : donde x es el contenido de carbonos; y es el numero dobles enlaces y z la ubicacion de los dobles enlaces, el carbono del grupo COOH es el numero 1
CH2 OH colina + CH2CH2N(CH3)3 + CH2CH2NH3 esfingosina glicerol CH OH CH2 OH CH CH(CH2)12CH3 H C OH H C NH2 CH2OH
etanolamina
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Gua N 2 Tema: HIDRATOS DE CARBONO Objetivos: Conocer las estructuras, propiedades y clasificacin de los hidratos de carbono. Comprender su funcin en el mantenimiento de la vida tanto en vegetales como en animales. Introduccin terica Los carbohidratos o hidratos de carbono constituyen una de las cuatro clases principales de biomolculas o molculas biolgicamente activas. Los carbohidratos son componentes importantes de los seres vivos. Desde el punto de vista qumico son aldehdos o cetonas polihidroxilados, o bien los productos derivados de ellos por oxidacin, reduccin, sustitucin o polimerizacin. El termino carbohidrato deriva de su formula general: Cn(H2O)m. En general, y tal como se muestra a continuacin, los carbohidratos pueden clasificarse de acuerdo a su estructura:
Triosas
3 tomos de C 4 tomos de C 5 tomos de C 6 tomos de C aldehdo cetona
Tamao de la cadena carbonada
Tetrosas Pentosas Hexosas
Localizacin del grupo C=O
Aldosas Cetosas Serie D Serie L
Estereoqumica
Numero de unidades de azcares
Monosacrido s Disacrido s Oligosacridos Polisacridos
Azcar simple Dos unidades de azucares Tres a diez unidades Mas de diez
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Ismeros pticos Son compuestos idnticos en la mayora de las propiedades fsicas y qumicas, pero que difieren en el comportamiento en los sistemas biolgicos y tambin frente a la luz polarizada. Los ismeros pticos tienen, por lo menos, un carbono quiral. Para que una molcula presente isomeria ptica debe contener por lo menos un carbono quiral. (para un mayor detalle de este tema ver la serie didctica Estereoisomeria Bsica) Un carbono es quiral (o tambin llamado asimtrico) cuando est unido a 4 sustituyentes distintos. Los carbonos quirales se denotan en la molcula con un asterisco (*). La disposicin tridimensional de los cuatro sustituyentes en un carbono quiral es lo que se conoce como configuracin. Para una molcula con un carbono quiral es posible escribir dos ordenaciones o configuraciones que generan dos formas isomricas denominadas enantimeros. Estos ismeros son imgenes especulares entre s pero no son superponibles. De manera general es posible predecir el nmero de estreoismeros de una molcula: Si tiene un nico carbono quiral, slo puede existir un par de enantimeros. Si tiene dos carbonos quirales tiene un mximo de cuatro estereoismeros (dos pares de enantimeros). En general, una molcula con n carbonos quirales tiene un nmero mximo de 2n estereoismeros posibles. Una vez obtenidos los estereoisomeros, se podr observar que existen algunas configuraciones que no son imgenes especulares y que se denominan diastereoismeros. Estos ismeros pueden diferir en todas las propiedades fsicas. Representacin de enantimeros Para identificar los enantimeros de forma inequvoca es necesario un sistema que indique la quiralidad de la molcula. La notacin R, S fue desarrollado por Cahn, Ingold y Prelog la cual esta extensamente desarrollada en la serie didctica Estereoisomeria Bsica Ejemplo:
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Br C CH3CH2 H CH3
Br C H3C H CH2CH3
(S)-2-bromobutano
(R)-2-bromobutano
Azucares D y L
El gliceraldehdo, la aldosa ms sencilla, tiene un tomo de carbono quiral y por lo tanto dos ismeros pticos (21= 2). Estos son enantimeros o imgenes especulares.
CH
CH
H C* OH CH2OH
HO C* H CH2OH
Estos ismeros, si bien pueden escribirse utilizando cuas como en el ejemplo anterior, pueden escribirse de una manera mas conveniente mediante una representacin en dos dimensiones. Emil Fischer desarrollo una forma muy til para estas representaciones; las formulas reciben el nombre de proyecciones de Fischer. En este tipo de representaciones se dibuja la molcula en forma de cruz, con el carbono asimtrico en el punto de interseccin. Las lneas horizontales representan enlaces dirigidos hacia el observador; las lneas verticales representan enlaces que se alejan del observador. Grupos hacia atrs
CH=O H C OH H
CH=O OH C H2O H
F o rm u la d e F isch er
Grupos hacia adelante
C H2O H
R - (+ )-g licera ld eh d o
Fischer tambin introdujo una nomenclatura estereoqumica que precedi al sistema R, S y que aun es de uso comn: la nomenclatura D y L. La letra D indica la configuracin del (+)-gliceraldehdo que tiene el grupo hidroxilo hacia la derecha, su enantimero con el grupo hidroxilo hacia la
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izquierda se designa como L. El carbono mas oxidado (CHO) se coloca en la parte superior.
CHO H C OH HO CHO H CH 2 OH
L-(-)-gliceraldehido
CH 2 OH
D - (+)-gliceraldehdo
Los signos (+) y (-) se refieren al sentido de rotacin del plano de la luz polarizada (+: dextrgiro; -: levgiro) El sistema de Fischer se puede utilizar para los otros monosacridos de la siguiente manera: si el carbono quiral mas alejado del grupo aldehdo o cetona tiene la misma configuracin que el D-glicerladehdo el compuesto es un D-azcar; si la configuracin de dicho carbono es la misma que la del L-gliceraldehdo ser un L-azcar.
CHO H H H OH OH OH C H2O H H H HO CHO OH OH H C H2O H H H CH2O H C O OH OH CH2O H H HO CH2O H C O OH H CH2O H
D - a ld o s a
L - a ld o s a
D - c e to s a
L - c e to s a
Estructuras cclicas, hemiacetlicas de los monosacridos

La representacin de la glucosa en proyecciones lineales como la de Fischer no explica todas las caractersticas qumicas de la glucosa. Esto es debido a que los monosacridos se encuentran principalmente en forma cclica, hemiacetalica. En la glucosa y otras aldohexosas, el hemiacetal forma un anillo de 6 tomos (5C+O). Esta estructura recibe el nombre de glucopiranosa por su semejanza al heterociclo pirano. Para las aldopentosas y cetohexosas la ciclacin intramolecular origina anillos de 5 tomos (4C+O). En este caso, se aade al nombre del azcar el sufijo -furanosa, por semejanza con el heterociclo del furano. El qumico britnico W.N. Haworth introdujo una forma muy til para representar la forma cclica de los azucares. En una proyeccin de
Haworth el anillo se representa como si fuera plano, se visualiza con un

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borde, con el oxigeno colocado en la parte de arriba, a la derecha. Los carbonos se acomodan numricamente en el sentido de las agujas del reloj, con el C-1 a la derecha. Los sustituyentes que estn unidos al anillo se encuentran arriba o abajo del plano
Como convertir una proyeccin de Fischer en una de Haworth?

Los grupos hidroxilos que estn hacia la derecha en la proyeccin de Fischer aparecen abajo en la proyeccin de Haworth (y a la inversa). Para los D-azucares el grupo -CH2OH terminal se encuentra arriba en la proyeccin de Haworth, mientras que para los L-azucares se encuentra hacia abajo.
6 CH OH 2
H H C O OH
O H OH
H OH H
H
1
OH
anmero
H C OH HO C H H 4 C OH H C OH
5 6 3 2
6 CH OH 2
CH2OH
H OH
O H OH
H OH H
OH
1
anmero
El enlace hemiacetlico crea un nuevo centro de asimetra en el carbono 1, con lo que cada molcula en forma abierta puede originar dos tipos de formas cerradas. Estos epmeros (difieren nicamente en un centro estereognico) reciben el nombre de anmeros. Se distinguen los anmeros y que tienen configuracin idntica en todos los C excepto en el C-1. El anmero es aquel que presenta el grupo hidroxilo hacia abajo y el es el que lo tiene hacia arriba.
Propiedades qumicas 1. Mutarrotacin

CH2OH H OH H OH H O H OH CH2OH H OH H OH H OH H OH H OH CHO OH CH2OH H H OH H O H OH OH H
anomero de la glucosa
anomero de la glucosa
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1. Esterificacin
CH2OH H OH H OH H CH2OAc O H OH H OH CH3COOCOCH3 Ac = CH3CO H H OAc H O H OAc H OAc
OAc
2. Eterificacin
CH2OH H OH H OH H
CH2OMe O H OH H OH CH3I, Ag2O H H OMe H
O H OMe
H OMe
OMe
3. Reduccin
CHO (CHOH)n CH2OH aldosa H2, catalizador NaBH4 CH2OH (CHOH)n CH2OH alditol
4. Oxidacin
COOH (CHOH)n COOH acido aldrico HNO3 CHO (CHOH)n CH2OH aldosa Br2, H2O Ag+ o Cu+2 COOH (CHOH)n CH2OH acido aldnico
5. Preparacin e hidrlisis de glicsidos

CH2OH H OH H OH H O H OH CH2OH H OH ROH H+ OH H H OH H O H OH CH2OH H OR H2O, H+ H OH H OH H O H OH H + ROH OH
Problemas y ejercicios 1.a) Indique, debajo de cada molcula, cules son glcidos (G), Aldehdos
(A), cidos orgnicos (AO), hidrocarburos (H) y cetonas (C). b) Reconozca las molculas glucdicas entre las formuladas y marque con un recuadro la aldosa y la cetosa.
CH3 CH2 CH3 COOH CH2 CH3 CH3 CH2 C O CH3 CH2OH C O COH CH2OH CHO CH2 CH3 CHO CHOH CH2OH
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2. Segn el nmero de carbonos y grupos funcionales, cmo denomina

los monosacridos que aparecen a continuacin?
CHO CHOH CH2OH CH2OH C O CHOH CHOH CH2OH CHO C O HO CH CHOH CH2OH CH2OH
3. Escriba la formula estructural de: a. una aldotriosa 4.

Ribosa:
b. una cetohexosa
c. una aldopentosa
Seleccione, entre las siguientes alternativas, como definiras a la
Monosacridos de tipo aldohexosa que tiene un grupo aldehdo y 6

carbonos.
Es una cetopentosa que posee un grupo cetona y 5carbonos en su

estructura.
Un monosacrido del tipo aldopentosa con un grupo aldehdo y 5

carbonos
5.a) Entre los siguientes monosacridos, indique cuales de ellos son

formas y cual es b) Indique cuales son hexosas y cuales pentosas
CH2OH H OH H OH H O H OH H OH CH2OH H H OH O OH H OH CH2OH CH2OH H H OH O H H OH H H OH H O H H OH H OH H OH
6. Por qu tienen carcter reductor los Monosacridos? Marque con una

cruz la respuesta correcta.
Por la presencia del grupo carbonilo (aldehdo y cetona). Por la presencia del grupo amino. No tienen carcter reductor.
7. Indique las diferencias que existen entre los trminos constitucin (o

composicin), configuracin y conformacin.
8. Seleccione la respuesta correcta: Cundo se dice que un carbono es

asimtrico?
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Cuando presenta sus cuatro sustituyentes iguales. Cuando presenta sus cuatro sustituyentes iguales dos a dos. Cuando presenta sus cuatro sustituyentes distintos.
9. Cuntos ismeros pticos se espera que tenga el 3-bromo-2-butanol?

Y el 2,3-dibromobutano? Escriba las estructuras correspondientes
10. Cul de las siguientes molculas puede existir como enantimeros?

a. 1,1-dietilciclohexano b. cis-1,2-dibromociclopropano c. 3-bromopentano d. 1,1,2-tribromociclohexano
11. Cual de las siguientes molculas contiene uno o mas centros

quirales? 1-clorociclopentano 2-clorociclopentano
12. Complete en cada recuadro la estereoqumica del estereocentro (R /

S) que se indica (deja el recuadro en blanco si procede):
CHO H Cl NH2
OH F H CH3
13. Complete las siguientes imgenes

OH
Cl HO H H Br
HO Br
Cl Br H
Cl
Cl Cl 14.a) Exprese su concepto acerca de los siguientes trminos:
actividad ptica. dextrgiro. enantimero. rotacin especfica Quiralidad. Levgiro. Diasteremero.

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b)
Escribe la estructura, de los dos ismeros posibles para el
gliceraldehdo. Indica qu tipo de ismeros pticos son y como se denominan.
15. Las siguientes estructuras muestran las frmulas de proyeccin de

Fischer de varios monosacridos.
a. Identifquelos segn la serie D o L b. Clasifquelos segn la naturaleza de su grupo carbonilo y su nmero de

tomos de carbono.
c. Indique su nombre d. Indique cuales son sus carbonos quirales e. Formule y nombre su correspondiente enantimero, si ste existe.
A CHO OH OH OH CH2OH D CHO HO OH HO HO CH2OH HO HO OH OH CH2OH HO HO OH CH2OH HO OH OH CH2OH E CHO F CHO OH B CHO C CHO OH OH CH2OH
16. Escriba la formula de proyeccin de Fischer de: a. L-eritrosa b. L-treosa c. L-glucosa 17.a) Cmo determina la cantidad de ismeros pticos que puede
presentar un compuesto? b) Cuntos ismeros pticos presenta la glucosa? Escribe la estructura sus ismeros D y L
18. Indicar si cada uno de los siguientes pares de azcares son, entre s,
anmeros, epmeros o parejas aldosa - cetosa: a. D - gliceraldehdo y D - dihidroxiacetona.
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b. D - glucosa y D - fructosa. c. D - glucosa y D - manosa. d. - D - glucosa y - D - glucosa. e. D - ribosa y D - ribulosa. f. D- galactosa y D glucosa
19. Consultando el cuadro anexo diga cules

pentosas que son epmericas en C-3?
son los pares de D-
20. Complete las siguientes reacciones y escriba la estructura de todos

los compuestos involucrados:
a. glucosa + ........... c. ............. + ........... d. fructosa
c. glucrico. ............. ribitol.
b. galactosa + Br2 + H2O
+ Cu++ o Ag+ ..............
21. La hidrlisis del polisacrido pectina (de frutas y bayas) d

principalmente cido D- galacturnico; la hidrlisis del polisacrido algina (de algas) da cido D- manurnico. Escriba la estructura de estos cidos urnicos.
22. El D-manitol, que se encuentra en la naturaleza en las aceitunas,

cebollas y hongos se puede obtener mediante la reduccin de la Dmanosa con NaBH4. Dibuje su estructura
23. Escriba una ecuacin para la reaccin de D-manosa con el reactivo

de Fehling (Cu2+) para formar el cido D-mannico
24. A continuacin se representa la ciclacin de la D glucosa en las

formas y .
H H
1C 2 6
CH2OH H OH H
O H OH
H
1
OH
OH
H C OH HO C H H 4 C OH H C OH
5 6 3 6
CH2OH H OH H
CH2OH
H OH
O H OH
OH
1
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a. Indique el enlace hemiacetal y explique cmo se form. b. Reconozca la forma y . c. Puede transformarse la D-glucosa en D-glucosa? 25.a) Cicle la molcula de fructosa en su forma : los carbonos que
reaccionan son el 2 y el 5.
b) Identifique el carbono anomrico y el enlace hemiacetal.

CH2OH C O HO C H H C OH H C OH CH2OH 26. El siguiente monosacrido es la xilosa. Obtener de ella los derivados
ciclados en configuracin D y L, indicando el nombre del compuesto formado y el tipo de enlace formado. Indica los carbonos quirales y anomricos.
CH2OH OH HO OH CH2OH
27. Dibuje la proyeccin de Haworth para la estructura cclica de seis
miembros de la D-manosa
28. Dibuje las proyecciones de Haworth de las formas y de la alosa 29. Escriba una ecuacin para la reaccin, catalizada por cido, de la -Dgalactosa con metanol.
30. a) Qu entiende por enlace glicosdico b) Cul es la importancia biolgica de los enlaces glicosdicos? c) Cuntos tipos de enlaces glicoscos conoce? Explique, y muestre en
una frmula, como se forma cada uno de ellos.
31. Complete, llenando los espacios en blanco, cada una de las

siguientes afirmaciones:
a. la maltosa es un ............ compuesto por dos molculas de ..............

unidas mediante enlaces glicosdicos ............
21
Serie Didctica N 36
b. la .............. es un disacrido constituido por ...... molculas glucosa

unidas por enlaces glicosdicos (14)
c. La isomaltosa es un ................ formado por la unin de ....... molculas

de ..............., unidas mediante un enlace glicosdico ................
d. La ................... resulta de la unin de una molcula de glucosa y una

de fructosa a travs de un enlace glicosdico ..............
32. Indique cuales de los oligosacridos nombrados en el ejercicio

anterior son reductores y cuales no. En cada caso justifique su respuesta.
33. Cul es la frmula molecular de la (+)- sacarosa que resultara si el

C-1 de la glucosa estuviera unido al C-4 de la fructosa, por ejemplo, y el C-2 de la fructosa estuviera unido al C-4 de la glucosa? Sera reductor el azcar as formado?
34. Si tanto la celulosa cono el almidn se encuentran constituidos por

glucosa, qu es lo que determina que sean dos polisacridos estructural y funcionalmente tan diferentes?
35. Considrese una cadena de amilosa de 4000 unidades de glucosa.

En cuantos lugares se debe producir una ruptura para reducir la longitud promedio a:
a. 2000 unidades? b.1000 unidades? c. 400 unidades? d. Qu porcentaje del total de uniones glicosdicas se hidroliza en cada
caso?
22
Serie Didctica N 36
Datos anexos
Estructura de la familia de D-azucares
aldotriosa
D-gliceraldehdo
aldotetrosas
D-eritrosa
D- treosa
aldopentosas
D-ribosa
D- Arabinosa
D-Xilosa
D-Lixosa
aldohexosas
D-Allosa
D- Altrosa D-Glucosa D-Manosa
D-Gulosa
D-Idosa
D-Galactosa D-Talosa
23
Serie Didctica N 36
Gua N 3 Tema: AMINOCIDOS Y PROTENAS

Objetivos Que el estudiante comprenda la qumica de los compuestos orgnicos polifuncionales, particularmente de los aminocidos y protenas.
Introduccin terica
Los aminocidos (aac) son compuestos que contienen un grupo carboxilo y un grupo amino unidos al mismo tomo de carbono.
COOH H2 N R H
De los 20 aminocidos que constituyen las protenas todos son -
aminocidos puesto que la amina est en el carbono vecino al grupo

carboxlico (carbono ). La diferencia entre un aminocido y otro se basa en las diferencias en sus cadenas o grupos laterales (grupo R), los cuales pueden variar tanto en estructura, tamao, carga elctrica. Todos los aminocidos, excepto glicina, tienen unido al tomo de carbono
cuatro grupos diferentes, por lo tanto este carbono es un centro quiral

y presenta estereoismeros. De la misma manera que para los
azcares, para los aminocidos es posible hablar de L-aminocidos y D-aminocidos.

Los L-aminocidos son aquellos que presentan el grupo amino a la izquierda y los de la serie D son los que lo presentan a la derecha, por analoga con el gliceraldehdo. Los aminocidos constituyentes de las protenas son exclusivamente ismeros L.
Clasificacin de aminocidos de acuerdo al grupo R

Los aminocidos se pueden agrupar en cinco clases de acuerdo a las propiedades del grupo R
1- No polares: grupos R alifticos (hidrofbicos) 2- Aromticos: grupos R (hidrofbicos)

3- Polares (Grupos R sin carga)
4- Cargados Positivamente (Grupos R Bsicos)

24
Serie Didctica N 36
5- Cargados Negativamente (Grupos R cidos)

Propiedades cido-base de los aminocidos
Dado que todos los aminocidos poseen un grupo cido (-COOH) y un grupo bsico (-NH2), todos los aminocidos libres presentan caractersticas cido-base. En disolucin acuosa, los grupos ionizables de los aminocidos permiten que la molcula ceda o capte iones protones, segn el pH del medio, al igual que ocurre con todos los cidos y bases dbiles. En medio acido (pH acido), la molcula del aminocido tiende a captar H+, y queda cargada positivamente. A pH bsico el aminocido tiende a libera H+ y queda cargado negativamente. Para cada aminocido existe un pH en el cual las cargas positiva y negativa estn exactamente equilibradas, por lo que la carga
neta de la molcula es cero. Este pH se le llama isoelctrico o punto isoelctrico (pI) del aminocido.
Cada grupo disociable de un aminocido tiene un pK caracterstico. Al final de esta gua se presenta una tabla con los valores de pK de los aminocidos constituyentes de las protenas. Conocido el pK, se puede estimar la proporcin de molculas disociadas y no disociadas a un pH cualquiera. Ejemplo: equilibrios de ionizacin de glicina
NH3+ HOOC C H H catinico carga neta = +1 pKa1 aprox.= 2 - H+ + H+
- OOC
NH3+ C H H neutro carga neta = 0
pKa2 aprox.= 9-10 - H+ + H+

- OOC
NH2 C H H
aninico carga neta = -1
Se puede calcular un valor aproximado de pI tomando como promedio los valores de pK al pasar de la forma 0 a la +1 y el pK al ir de la forma 0 a la -1.
pI = pK ( +10) + pK ( +01) 2
Pptidos
Los aminocidos se unen entre si para formar polmeros que alcanzan grandes dimensiones. Si estos polmeros contienen menos de 100
25
Serie Didctica N 36
aminocidos se denominan pptidos aminocidos se denominan protenas.
si contienen entre 200-300
Los aminocidos se encuentran unidos linealmente por medio de uniones
peptdicas (enlaces covalentes). Estas uniones se forman por la reaccin

de sntesis (va deshidratacin) entre el grupo carboxilo del primer aminocido con el grupo amino del segundo aminocido.
R1 H2N C C OH H O H R2
H N C C OH H O
H2O H2O R1 amino H N C C 2 terminal H O H R2 N C C OH carboxilo terminal H O enlace peptidico Dipeptido: dos aminoacidos
Pptidos: el enlace disulfuro

Adems del enlace peptdico, el otro nico tipo de enlace covalente entre los aminocidos en los pptidos y las protenas es el enlace disulfuro. No es comn a todas las protenas.
cistena COO+ H3N CH CH2 SH SH cistena + CH NH3 COOCH2 2 H+ + 2 e2 H+ + 2 eCOOH3N CH CH2 S S CH2 CH NH3 COOpuente disulfuro Cistina
Pptidos: nomenclatura
1- Cada posicin en un pptido se denomina residuo de aminocido 2- Dependiendo del nmero de residuos de aminocidos tendremos:
Dipptido, tripeptido, polipeptido (+ de 10 residuos)
26
Serie Didctica N 36
3- Los pptidos lineales de secuencia conocida se nombran comenzando por el N-terminal (amino terminal) y utilizando las abreviaturas o letras de cdigos que identifican los aminocidos
N-terminal
C-terminal
Arg-Ala-Gly-Arg-Glu-Ala-Met-Lys
La secuencia de residuos es el factor que determina la forma tridimensional global de la molcula y a su vez es la caracterstica estructural que determina como funcionara esa molcula
Electroforesis de aminocidos y pptidos

Puesto que los aminocidos tienen cargas a ciertos valores de pH se mueven si se aplica un campo elctrico, es decir polos o electrodos elctricos, (+) y (), a la solucin. La forma cationica (+) se mueve al polo negativo y viceversa. La forma neutra no se mueve en absoluto.
+
polo
polo
aa1 carga neta (-)
aa2 carga neta (0)
aa3 carga neta (+)
El proceso de someter aminocidos y protenas o cualquier especie con carga a un campo elctrico se conoce como electroforesis. Para poder predecir la direccin del movimiento de un aminocido o pptido en un aparato de electroforesis capilar lo primero que debe hacerse es calcular el valor de pI del mismo, a pH inferiores a pI casi todas las molculas se encuentran en forma cationica (+) y migraran al electrodo negativo. A pH
superiores al pI las molculas sern aninicas (-) y migraran al

electrodo positivo.
Reacciones de los aminocidos
27
Serie Didctica N 36
1. Reaccin con ninhidrina: Es un reactivo til para detectar aminocidos

y determinar la concentracin de sus soluciones
O OH OH O ninhidrina H O O N O O
R C COONH3+
RCHO + CO2 + 3H2O + H+
anin violeta
2.
Reaccin
con
FDNB
(1-fluoro-2,4-dinitrobenceno):
marca
cuantitativamente los grupos amino en los aminocidos y pptidos

NO2 H NO2 F FDNB NO2
R C COOH NH2 N H H C R COOH NO2
HF
2,4-dinitrofenilaminoacido
Protenas: estructura
Las protenas existen en diferentes niveles de estructura. Comnmente se definen cuatro niveles de estructura:
Estructura primaria:
Se refiere a: La Identidad de los aminocidos La cantidad relativa de cada aminocido La secuencia aminoacidica
Estructura secundaria:
Se refiere a la orientacin geomtrica de la cadena (hlice alfa o lamina beta).
Estructura terciaria:
Se refiere a la arquitectura tridimensional de la protena, incluyendo la orientacin de cualquier grupo prosttico (protenas globulares o fibrosas).
Estructura cuaternaria:
Se refiere al la agregacin no covalente de dos o mas cadenas polipeptdicas
Secuenciacin de aminocidos de una protena

28
Serie Didctica N 36
Pasos: 1- La protena es cortada en fragmentos especficos ya sea por mtodos qumicos o enzimticos. (la ruptura de los enlaces peptdicos debe ocurrir con cierto grado de especificidad) 2- Si estn presentes enlaces disulfuros deben romperse ya que interfieren en la secuenciacin. 3- Cada fragmento se purifica y se determina la secuencia por el mtodo de Edman (marca y separa nicamente el residuo amino-terminal dejando el resto del pptido intacto). 4- Finalmente se determina el orden de los fragmentos en la protena original y se localizan los enlaces disulfuro.
Problemas y ejercicios 1. Marque con una cruz la respuesta correcta para la siguiente afirmacin:
Las protenas son macromolculas constituidas bsicamente por:
a) C, H, O, P. b) C, H, O, N. c) C, H, O, Fe. 2. Los -L- aminocidos se caracterizan por:
a) la disposicin del grupo carboxilo a la izquierda del carbono . b) la disposicin del grupo amino a la derecha del carbono . c) la disposicin del grupo amino a la izquierda del carbono .
3. El comportamiento anftero de los aminocidos se refiere a que:
a) El pH de una solucin acuosa determina su ionizacin. b) El pH de una solucin acuosa determina su actividad ptica. c) El pH impide que se solubilicen en una disolucin acuosa
4. D una definicin o ilustre cada uno de los siguientes trminos: a- enlace peptdico c- configuracin L de los aminocidos e- aminocido con grupo R no polar g- punto isolelctrico b- ion bipolar d- dipptido f- compuesto anfoterito h- ninhidrina
29
Serie Didctica N 36
5. Clasifique cada uno de los siguientes -aminocidos como polares o

apolares:
A NH2 HOOC C H CH2 CH2 NH2 B NH2 HOOC C H CH2 CH2 CH2 CH2 CH2 CH3
3
C NH2 HOOC C H CH2 C CH CH3 COOH
D NH2 HOOC C CH CH3 H NH2 CH2
F NH2 COOH NH2 HOOC C H CH2 CH2 CH CH CH3
6. Formule la L- serina y L- cistena e indique:

a. Carbono . b. Grupo carboxilo. c. Grupo amino. d. Radical R.
7. Escriba la formula de cada uno de los siguientes aminocidos en su

forma inica bipolar: a- valina b- serina c- prolina d-triptofano
8. Calcular el pI de la Histidina sabiendo que:

pK1 = 1,82; pK2 = 6,00; pK3 = 9,17
9. Escriba la estructura de la leucina:

a) en el pI b) a pH alto c) a pH bajo
10. Usando los valores de los pI, provistos en la hoja anexa, indique la
direccin de migracin de cada uno de los componentes de una mezcla de asparagina, histidina y cido asprtico a pH = 6 en un aparato de electroforesis.
11. Cul de los grupos carboxilo es mas fuerte como cido en la forma
totalmente protonada del cido asprtico?
30
Serie Didctica N 36
12. En solucin muy alcalina, un aminocido contiene dos grupos bsicos:

-NH2 y COO Cul es el ms bsico? A qu grupo se unir preferentemente un protn si a la solucin se le agrega cido? Cul es el producto?
13. Dibuje todas las formas estereoismeras posibles para el aminocido

treonina. La treonina natural deriva su nombre de su relacin con la tetrosa treosa. Basndose en esto, cul es la configuracin correcta para la treonina natural?
14. Indique la direccin de migracin (electrodo positivo o negativo) en un

aparato de electroforesis de: a) alanina a pH = 5. b) glicinia y lisina a pH = 7 c) fenilalanina, leucina y prolina a pH = 10
15. Escriba la estructura predominante de cada uno de los siguientes

aminocidos al pH que se indica. Si se colocaran en un campo elctrico: hacia cual de los electrodos (+ o -) migrara cada aminocido a- metionina a su pI b- serina a pH bajo c- fenilalanina a pH alto
16. Escriba las estructuras de los dipptidos que se pueden formar al unir
alanina y glicina mediante un enlace peptdico. Que estructura se espera a pH = 3 y a pH= 9?
17. Escriba la formula estructural completa para: Gly-Ala-Ser 18. Usando las abreviaturas de tres letras, enumere todos los tripptidos
que pueden formarse con los aminocidos: alanina, metionina y asparagina.
19. Escriba las ecuaciones para eliminar el pptido alanilglicilcalina por el

mtodo de Edman. Cul es el nombre del dipptido que queda?
20. La tripsina es una enzima proteoltica que hidroliza los enlaces

peptdicos cuando el grupo carboxilo lo aporta la lisina o la arginina. Indique en el polipptido formulado a continuacin: a. Con un crculo, el grupo amino terminal y el grupo carboxilo terminal. b. Con un recuadro, los enlaces peptdicos. c. Con una flecha los puntos de hidrlisis cuando el pptido es tratado con tripsina. d. Por cuntos aminocidos est formado este polipptido?
31
Serie Didctica N 36

CH3 CH CH3
+ H3N
CH2OH C H C O
H N CH2 CH2 CH2 CH2 + NH3
O CH C N H
CH3 C H C O
H N CH2 CH2 CH2
O CH C N H
CH2 C H COO-
C + NH2 NH2
21. Escriba los fragmentos formados por la accin de la tripsina sobre los
siguientes pptidos: a. Lys-Phe-Glu-Ala-Ala-Glu-Ser-Glu b. Ala-Ala-His-Arg-Glu-Lys-Phe-Ile-Gly-Gly-Gly-Glu c. Tyr-Cys-Lys-Ala-Arg-Arg-Gly Cada uno de los fragmentos producidos por el tratamiento con tripsina se hacen reaccionar a continuacin de 2,4-dinitrofluorobenceno, seguido de la hidrlisis de los enlaces peptdicos. Escriba los correspondientes aminocidos 2,4-dinitrofenilados formados a partir de cada uno de los pptidos
22. El aspartame (Nutrasweet) es un ster dipeptdico con un sabor muy

dulce. La hidrlisis completa del aspartame produce fenilalanina, cido asprtico y metanol. Una incubacin suave con carboxipeptidasa no tiene efectos sobre este ster. El tratamiento con fenil isotiocianato seguido por hidrlisis suave produce la feniltiohidantona del cido asprtico. Proponer una estructura para el aspartame.
23. El anlisis de los productos de la hidrlisis de la salmina, un

polipptido del semen del salmn, dio los resultados siguientes:
Aminocido Isoleucina Alanina Valina Glicina Serina Prolina Arginina 1,28 0,89 3,68 3,01 7,29 6,90 86,40 salmina g/100g
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Serie Didctica N 36
Cules son los nmeros relativos de los diversos residuos de aminocido en salmina, es decir, cual es su formula emprica? Por qu los pesos suman ms de 100 gr?
24. Los cidos, bases, metales pesados, solventes, entre otros, son
agentes desnaturalizantes.
a. Explique para dos de ellos que fuerzas estabilizadoras de la protena

afectan.
b. Qu diferencia hay entre hidrlisis y desnaturalizacin? 25. La adicin de etanol u otros disolventes orgnicos a una solucin
acuosa de una protena globular produce su desnaturalizacin. Dicho tratamiento tambin tiende a deshacer las micelas de jabn, por ejemplo. Qu proceso fundamental opera en ambos casos?
26. Elija la respuesta correcta para la siguiente afirmacin: El termino

configuracin o lmina plegada, de una protena se refiere a:
a) su estructura primaria. b) su estructura secundaria. c) su estructura terciaria. 27. Elija la respuesta correcta. La forma tridimensional total de una
protena y, por lo tanto su funcin, depende de:
a) la cantidad relativa de cada uno de los aminocidos que la componen. b) de la secuencia de los aminocidos constituyentes. c) la identidad de los aminocidos que la forman. 28. Si la mioglobina es una protena formada por un nico polipptido,
puede tener estructura cuaternaria?
a) nunca b) si c) a veces 29. Marca con una cruz la(s) respuesta(s) correcta(s) para la siguiente
aseveracin: Cuando una protena se desnaturaliza.....
a) las cadenas polipeptdicas que la forman se separan total o

parcialmente.
b) los aminocidos que la forman quedan libres. c) recupera su conformacin nativa. d) pierde su conformacin original.
33
Serie Didctica N 36
e) la(s) cadena(s) polipeptidica(s) que la forman de despliega(n). 30. Una pequea muestra de cierta sustancia fue sometida a
cromatografa en capa delgada. Despus del secado, la placa se roci con solucin de ninhidrina y se someti al calor. El aspecto de la placa, despus de calentarla, es el que se muestra en la figura. Cul es el valor del Rf de este material, en el sistema de solventes que se emple?
Distancia hasta donde migro el solvente
muestras
siembra
Datos anexos Tabla: Propiedades y convenciones asociadas con los aminocidos comunes
Abreviatura Smbolo Valores pKa pK1 pK2
(-COOH)
+
pKR
grupo R
(-NH3 )
Glicina Gly G Alanina Ala A Prolina Pro P Valina Val V Leucina Leu L Isoleucina Ile I Metionina Met M Grupos R aromticos Fenilalanina Phe F Tirosina Tyr Y Triptofano Trp W Grupos R polares sin carga Serina Ser S Treonina Thr T Cisteina Cys C Asparagina Asn N Glutamina Gln Q Grupos R cargados positivamente Lisina Lys K Histidina His H
2.34 2.34 1.99 2.32 2.36 2.36 2.28 1.83 2.20 2.38 2.21 2.11 1.96 2.02 2.17 2.18 1.82
9.60 9.69 10.96 9.62 9.60 9.68 9.21 9.13 9.11 9.39 9.15 9.62 10.28 8.80 9.13 8.95 9.17
10.07
8.18
10.53 6.00 34
Serie Didctica N 36
Arginina Arg R Grupos R cargados negativamente Aspartato Asp D Glutamato Glu E
2.17 1.88 2.19
9.04 9.60 9.67
12.48 3.65 4.25
Grupos R alifticos
Glicina
Alanina
Prolina
Leucina
Isoleucina
Grupos R polares sin carga Grupos R aromticos
Serina
Treonina
Fenilalanina
Tirosina
Asparagina
Grupos R cargados positivamente
Grupos R cargados negativamente
Aspartato Lisina Arginina 35
Serie Didctica N 36
Gua N 4 Tema: ENZIMAS Objetivos

Que el estudiante conozca las protenas con actividades enzimticas y su importancia en las diversas reacciones bioqumicas.
Introduccin terica
Las enzimas son biocatalizadores de naturaleza proteica (catalizan reacciones bioqumicas que de otro modo se llevaran a cabo a velocidades extremadamente lentas). Desde el punto de vista qumico son protenas globulares, tienen pesos moleculares que oscilan entre 12.000 y un milln.
Nomenclatura
Antiguamente las enzimas fueron nombradas atendiendo al compuesto
sobre el que actuaban, aadindole el sufijo -asa o haciendo referencia

a la reaccin catalizada. As tenemos:
ureasa, cataliza la hidrlisis de la urea amilasa, la hidrlisis del almidn lipasa, la hidrlisis de lpidos ADNasa, la hidrlisis del ADN ATPasa, la hidrlisis del ATP, etc.
En la actualidad, se ha adoptado una clasificacin y nomenclatura sistemtica, en la que cada enzima tiene un nmero de clasificacin que la identifica.
Clasificacin de las enzimas de acuerdo a su complejidad

De acuerdo a su complejidad las enzimas se clasifican como:
enzimas
formadas por una o mas cadenas polipetidicas
simples s
conjugadas
contienen por lo menos un grupo no proteico enlazado a la cadena polipeptidica polipetidicas 36
Serie Didctica N 36
En las protenas conjugadas podemos distinguir dos partes:

Apoenzima: Es la parte polipeptdica de la enzima. Cofactor: Es la parte no proteica de la enzima.
La combinacin de la apoenzima y el cofactor forman la holoenzima. Los cofactores pueden ser: * Iones metlicos: Favorecen la actividad cataltica general de la enzima, si no estn presentes, la enzima no acta. Estos iones metlicos se denominan activadores. Ejemplos: Fe2+, Mg2+, Cu2+, K+, Na+ y Zn2+
* La mayora de los otros cofactores son coenzimas las cuales

generalmente son compuestos orgnicos de bajo peso molecular, por ejemplo, las vitaminas del complejo B son coenzimas que se requieren para una respiracin celular adecuada.
Clasificacin de las enzimas segn su actividad

Tipo de enzimas Hidrolasas Isomerasas Ligasas Liasas Oxidorreductasas Transferasas Actividad Catalizan reacciones de hidrlisis. Catalizan las reacciones en las cuales un ismero se transforma en otro, es decir, reacciones de isomerizacin. Catalizan la unin de molculas. Catalizan las reacciones de adicin de enlaces o eliminacin, para producir dobles enlaces. Catalizan reacciones de xido-reduccin. Facilitan la transferencia de electrones de una molcula a otra. Catalizan la transferencia de un grupo de una sustancia a otra.
Las propiedades de las enzimas derivan del hecho de ser protenas y de actuar como catalizadores. Como protenas, poseen una conformacin natural ms estable que las dems conformaciones posibles. As, cambios en la conformacin suelen ir asociados en cambios en la actividad cataltica. Los factores que influyen de manera ms directa sobre la actividad de un enzima son:
pH: (asociados a la protonacin o deprotonacin de los grupo

carboxilos -COOH; amino -NH2; tiol -SH, etc.).
Temperatura: asociados desnaturalizacin de las protenas (perdida

de la conformacin) por el calor.
Presencia o ausencia de cofactores

37
Serie Didctica N 36
Modo de accin de las enzimas

La enzima (E), se combina con el substrato (S) formando el complejo de transicin, enzima-substrato (E-S), mediante una reaccin reversible, cuya energa de activacin es menor que la de la reaccin no catalizada. Cuando se forma el producto de la reaccin (P), se regenera de nuevo la enzima (E) de forma libre, la que puede combinarse de nuevo con otra molcula de substrato (S).
E+S
ES E + P
Cintica de las reacciones enzimticas

La cintica enzimtica estudia la velocidad de las reacciones catalizadas por enzimas. Estos estudios proporcionan informacin directa acerca del mecanismo de la reaccin cataltica y de la especificidad de la enzima La primera clave en cuanto al comportamiento enzimtico lo aportaron Henri y Michaelis y Menten. Durante su trabajo observaron que cuando mantenan constante [E] y variaban la [S] obtenan una relacin hiperblica entre la velocidad y la [S]
velocidad de reaccin
concentracin de sustrato La expresin matemtica de esta curva viene dada por la denominada
ecuacin de Michaelis-Menten, donde se muestra la relacin entre la

velocidad inicial (Vo) y la concentracin de sustrato, S.
Los trminos Vmax (velocidad mxima) y Km (constante de Michaelis) son dos parmetros cinticos caractersticos de cada enzima, que pueden determinarse experimentalmente.
38
Serie Didctica N 36
La velocidad mxima (Vmax) es la expresin de la eficiencia del funcionamiento enzimtico. La constante de Michaelis (Km) indica la concentracin de sustrato a la cul la velocidad de reaccin es la mitad de la velocidad mxima. Este parmetro es independiente de la concentracin de enzima, y es caracterstico de cada enzima segn el sustrato utilizado (si tiene varios). La Km tambin indica la afinidad que posee la enzima por el sustrato, siendo sta mayor, cuanto menor es la
Km.
Hay enzimas que no obedecen la ecuacin de Michaelis-Menten. Se dice que su cintica no es Michaeliana. Esto ocurre con los enzimas
alostricos (enzimas que contienen centros de unin para el sustrato y el

metabolito regulador), cuya grfica v frente a [S] no es una hiprbola, sino una sigmoide.
Clculo de la Km y Vmax
Para determinar grficamente los valores de Km y Vmax es ms sencillo utilizar la representacin doble recproca (1/v0 frente a 1/[S]0), ya que es una lnea recta. Esta representacin doble recproca recibe el nombre de
representacin de Lineweaver-Burk. En la recta que se obtiene de este

grafico: La pendiente es Km / Vmax La abscisa en el origen (1/v0 = 0) es -1/ Km La ordenada al origen (1/[S]0 = 0) es 1/Vmax
pendiente = Km / Vmax
K 1 1 1 = M + v o Vmax [S ] 0 Vmax
ordenada al origen = 1/Vmax
39
Serie Didctica N 36
Inhibicin enzimtica
Existen sustancias que pueden impedir que la enzima desarrolle su actividad cataltica, ralentizando o paralizando la reaccin enzimtica. A estas sustancias se las denomina inhibidores enzimticos. Se conocen dos tipos principales de inhibicin: la reversible y a la
irreversible. La primera implica una unin no covalente del inhibidor y,

por lo tanto, siempre puede revertirse. En la inhibicin irreversible, el inhibidor se une al enzima de forma covalente y permanente.
Inhibicin reversible: los distintos modelos de inhibicin reversible

implican la inhibicin competitiva la no competitiva. El inhibidor competitivo, es una sustancia similar en estructura al sustrato, con quien compite por el sitio activo de la enzima. Como consecuencia, aunque la velocidad mxima no se altera, para alcanzarla sera necesario poner ms cantidad de sustrato en el medio de reaccin, lo que se refleja, en la correspondiente curva de Michaelis, como un aparente aumento de la Km. La representacin de dobles inversos permite observar claramente este tipo de inhibicin. El inhibidor no competitivo puede combinarse tanto con la enzima libre como con el complejo enzima-sustrato, sin afectar al sitio activo de la enzima. Al no unirse el inhibidor al sitio activo, no se afecta la afinidad de la enzima por el sustrato y en este caso la Km no se altera y la Vmax disminuye, como puede observarse en la representacin de dobles inversos el punto de corte de las rectas ahora esta sobre el eje X, (cuando y=0), mientras que hay distintos punto de corte con el eje Y, como se aprecia la Vmax disminuye con el inhibidor.
40
Serie Didctica N 36
Problemas y ejercicios 1. Indique cual o cuales de las siguientes afirmaciones son correctas:
a) Las enzimas estn compuestas primariamente de polipptidos, que son

polmeros de aminocidos.
b) Las enzimas estn constituidas por glcidos simples unidos mediante

enlaces glicosdicos.
c) las enzimas estn constituidas por cidos grasos unidos por unin
estrica a un polialcohol
2) Indique cuales de las siguientes alternativas son correctas:
a) Apoenzima = Holoenzima + coenzima o cofactor. b) Holoenzima= cido graso + alcohol polihidroxilado + base nitrogenada. c) Holoenzima = Apoenzima + coenzima o cofactor. d) La apoenzima le asigna especificidad sobre el sustrato. e) La coenzima aporta especificidad de funcin. f) La apoenzima aporta especificidad de funcin. g) La coenzima asigna especificidad sobre el sustrato.
3. Cmo se clasifican las enzimas y qu funciones cumplen? 4. En cada una de las siguientes reacciones identifique la enzima como
oxidorreductasa, transferasa, hidrolasa, liasa, isomerasa o ligasa (CoE
significa coenzima).
O a) H2N C NH2
H2O
CO2 + 2 NH3
b)
HOOC CH CH COOH O
+ NH3
HOOC CH2 C COOH NH2 O CH3 C H + CO2
c)
CH3 C O
CH3
E CoE
d)
CH3 C
H + NADH
CH3CH2OH + NAD+
41
Serie Didctica N 36
5. Defina los siguientes trminos: a) ES b) cofactor. c) coenzima. d) deshidrogenasa. e) oxidorreductasa. f) estreoespacificidad. g) sitio activo. h) teora del acoplamiento inducido.
6. Marque la respuesta correcta: Para sobrepasar la barrera energtica

entre reactivos y productos, se debe proveer energa para que la reaccin comience. Esta energa se denomina: a) Energa de activacin b) Energa de iniciacin c) Energa de reaccin d) Energa cintica e) Energa potencial
7. Indique cual, o cuales, de las afirmaciones presentadas son correctas

para completar la siguiente expresin: La actividad biolgica de los
enzimas: a) No se ve afectada por cambios de pH b) Vara con los cambios de temperatura c) No se ve afectada por cambios de temperatura d) Es alterada por cambios de pH
8. Indique cual ecuacin, entre las propuestas, representa a las

reacciones catalizadas por enzimas:
a) - A b) - E c) - E d) - E
E e) - S P 9. Describa la teora llave-cerradura y el modelo de ajuste inducido
+B +R + S + S
C E ES
+D +P
E E
EP
+ +
10. La grfica muestra los resultados de la velocidad de reaccin frente a

la concentracin del sustrato para:
a. una enzima en presencia de un inhibidor competitivo b. una enzima en presencia de un inhibidor no-competitivo c. una enzima alostrica
42
Serie Didctica N 36
d. una enzima en presencia de un inhibidor acompetitivo e. dos enzimas compitiendo por el mismo sustrato
11. La grfica que se muestra a continuacin representa la variacin de la
velocidad de reaccin frente a la concentracin del sustrato.
Analizando la misma, responda: la razn por la que la curva alcanza una
meseta
la
velocidad
no
sigue
aumentando
para
mayores
concentraciones de sustrato es porque
a. El centro activo del enzima est saturado de sustrato. b. Hay un inhibidor competitivo presente. c. Hay un inhibidor no competitivo presente. d. La enzima alostrica est bloqueada en una conformacin inactiva. e. Todo el sustrato ha sido convertido en producto. 12. Si dos enzimas tienen la misma Vmax, para una cantidad dada de
enzimas, cual de ellas tendr mayor afinidad por los sustratos de la reaccin, la de mayor o la de menor KM ?
13. En la determinacin experimental del valor de la Vmax para una

determinada enzima (PM= 20000) se hallo que era 28 moles por minuto para 10 g de muestra del enzima. Calcule el nmero de recambio.
14. En presencia de una cantidad saturante de sustrato, 1.4 mg de una

enzima dan una velocidad de 6.2 milimoles de producto formado por
43
Serie Didctica N 36
minuto. Si el PM de la enzima es 52500 g/mol Cul es la actividad de la enzima?
15. En el estudio de la actividad cataltica de una enzima se obtuvieron los

siguientes datos experimentales, a partir de los cuales deben determinarse los valores de KM y Vmax
S (mM) 1.5 2.0 3.0 4.0 8.0 16 Producto formado (mg/min) 0.21 0.24 0.28 0.33 0.40 0.45
16. La tabla a continuacin muestra los resultados obtenidos de la cintica

de una enzima en funcin de la concentracin del sustrato y en presencia y ausencia de un inhibidor (I) de concentracin 2mM (1 mM = 1 x 10-3 M)
S (M) 1 2 5 10 20 Velocidad (M/min) Sin inhibidor Con inhibidor 2.5 0.77 4.0 1.25 6.3 2.00 7.6 2.50 9.0 2.86
a) Cules son los valores de KM y Vmax en ausencia de inhibidor? b) De que tipo de inhibicin se trata?
17. A partir de los siguientes datos de una reaccin enzimtica

determnese si el inhibidor se comporta de modo competitivo o no competitivo.
S (mM) 2.0 3.0 4.0 10.0 15.0 Velocidad (M/h) Sin inhibidor Con inhibidor 13.9 8.8 17.9 12.1 21.3 14.9 31.3 25.7 37.0 31.3
44
Serie Didctica N 36
18. La siguiente tabla contiene 3 conjuntos de datos para una reaccin

catalizada por 10 pg (picogramos) de enzima. El primer conjunto pertenece a la reaccin enzima-sustrato solamente y los otros dos corresponden a la reacci6n en presencia de dos inhibidores diferentes. Representar los datos segn Michaelis (v en funcin de [S]) y las inversas (1/v en funcin 1/[S]
a) Indicar K M de la enzima y para cada inhibidor. b) Indicar que tipo de inhibiciones son. c) Calcular Vmax. para cada caso.
S (mM) 1 2 5 10 20 Velocidad (pmoles/min) Inhibidor (A) 1.17 2.10 4.00 5.70 7.20
Sin inhibidor 2.5 4.0 6.3 7.6 9.0
Inhibidor (B) 0.77 1.25 2.00 2.50 2.86
19. Se ha purificado una enzima a partir de hgado de rata. En la

purificacin se parti de 500 ml de extracto crudo que contena 2.000 mg de protena. 50 l de ese extracto crudo catalizaban, en condiciones ptimas de ensayo, la produccin de 1 nmol de producto en 1 segundo. Tras varios pasos de purificacin se obtuvieron 2 ml de una preparacin de enzima pura que contena 3 mg de protena por mililitro y presentaba una actividad total de 120 U. a) Calcular la concentracin de la enzima en el extracto crudo en U/ml y katales/ml. b) Determinar la actividad especfica, en U/mg de protena, en el extracto crudo. c) Calcular la recuperacin del proceso de purificacin y el nmero de veces que se ha purificado la enzima.
20. La descarboxilacin enzimtica de un -cetocido, ensayada en 1 ml

de mezcla de reaccin, procede con las siguientes velocidades iniciales a las concentraciones de sustrato que se citan. A partir de estos datos calcular Vmx y KM de esta reaccin enzimtica.
45
Serie Didctica N 36
[cetocido] (M) 2.50 x 10-3 1.00 x 10-3 0.71 x 10-3 0.53 x 10-3 0.25 x 10-3
vo (moles CO2/min) 0.588 0.500 0.417 0.370 0.252
21. La velocidad inicial de una reaccin enzimtica se determin a

distintas concentraciones de sustrato. Calcular KM y Vmax por los distintos mtodos grficos a partir de los datos que se relacionan a continuacin:
[S] (M) 2.3 x 10-3 3.0 x 10-3 4.5 x 10-3 12.0 x 10-3 38.0 x 10-3 vo (mmol/l min) 0,95 1,13 1,42 2,14 2,64
22. Para estimar los parmetros cinticos de una determinada enzima se

realizaron una serie de ensayos utilizando 20 l de una preparacin de la misma y distintas concentraciones de su sustrato. Los valores de vo obtenidos se recogen en la tabla siguiente:
[S] (M) 3.15 4.16 8.30 12.50 vo (nmol/ml min) 10.0 12.5 20.0 25.0
Calcular las actividades total y especfica de la preparacin enzimtica, sabiendo que su volumen total era de 10 ml y su contenido en protena de 200 g/ml.
23. Se dispone de una preparacin de una enzima de la que se quiere

conocer sus parmetros cinticos. Para ello se realizan varios ensayos en los que se cambia la concentracin del sustrato y se obtienen los siguientes resultados:
[S] (mM) 0,33 0,50 1,00 2,00 vo (nmoles. ml-1. min-1) 24,98 33,33 50,00 66,67 46
Serie Didctica N 36
Cules son la KM y la Vmx de la enzima? Si para los ensayos se haba utilizado 20 l de la preparacin enzimtica y se sabe que sta tiene una concentracin de protena de 5 mg/ml, cul es la actividad especfica de dicha preparacin? qu volumen de ella se habr de aadir a 1 ml de mezcla de reaccin con [S] = 0,2 M para que se formen 4,5 moles de producto en 10 min?
24. La KM de cierta enzima para su sustrato es 75 M. Cuando se ensaya

con una concentracin inicial de sustrato de 50 mM, se observa que al cabo de 15 minutos se ha transformado el 30% de sustrato. a) Calcular la velocidad mxima de la reaccin b) Cuando se ensaya la actividad con distintas concentraciones de sustrato, en presencia de un cierto inhibidor a una concentracin de 50 M, y se representan grficamente los resultados mediante la representacin de dobles inversos, la pendiente de la recta obtenida es la misma que cuando el experimento se hace en ausencia del inhibidor, pero la ordenada en el origen aumenta al doble. Qu tipo de inhibicin se ha producido? Calcular la Ki.
c) Calcular el grado de inhibicin cuando el ensayo se hace con una

concentracin de sustrato de 150 M, en presencia de 100 M del inhibidor anterior.
25. Una reaccin enzimtica se lleva a cabo, a distintas [S], en ausencia

y presencia de dos inhibidores diferentes (Ia e Ib. Decir qu tipo de inhibidor es cada uno y hallar todos los parmetros cinticos.
[S] (mM) 0.2 0.4 0.8 1.6 3.2 v0 (mol/l min) 1.67 2.86 4.44 6.15 7.62 va' (+ Ia = 1,5 mM) (mol/l min) 0.62 1.18 2.11 3.48 5.16 vb' (+ Ib = 1,5 mM) (mol/l min) 0.83 1.43 2.22 3.08 3.81
26. Una enzima se ensay a distintas concentraciones de su sustrato

especfico en ausencia y presencia de un inhibidor ([I]= 1 mM), obtenindose los resultados que se presentan en la tabla. Calcular la KM y la Vmx en ambos casos y la Ki para el inhibidor.
47
Serie Didctica N 36
[S] (mM) 0,02 0,05 0,10 0,50 0,80
v0 sin Inhibidor (mol/ min) 8,33 16,67 25,00 41,67 44,44
v'0 con Inhibidor (mol/ min) 6,25 10,00 12,50 15,62 16,00
27. Al ensayar la actividad de una enzima con concentraciones saturantes

de sustrato se obtuvo una velocidad de catlisis de 300 mol/l. min en ausencia de inhibidores, y de 160 mol/l min en presencia de 10 M de un cierto inhibidor no competitivo. Para [S] = 10 mM y en ausencia del inhibidor se obtuvo una velocidad de 125 mol/l min. Calcular KM y Vmx,
K'M, Ki y el grado de inhibicin para [I] = 10 M y [S] = 10 mM. Qu

concentracin de inhibidor conseguira un grado de inhibicin de 0,9 para la misma [S]?
28. Se ha estudiado cinticamente la reaccin catalizada por la

muermasa. Tras llevar a cabo una serie de ensayos enzimticos los datos de concentracin de sustrato y vo fueron analizados mediante una representacin de dobles inversos y se obtuvo una recta que cortaba al eje Y en el valor 0,8 (M/min)-1 y al eje X en el valor -0,02 (M)-1. Se ha estudiado igualmente el efecto del -muermol y la muermirulina, sustancias supuestamente inhibidoras, sobre el transcurso de la reaccin. En ambos casos la representacin de los datos por el mtodo de dobles inversos daba como resultado una recta que cortaba al eje Y en el valor 1,6 (M/min)-1. Las rectas se diferenciaban en el valor de sus pendientes, que era de 40 min para el -muermol y de 80 min para la muermirulina. a) Cules son la KM y la Vmx de la reaccin sin inhibidor? b) Qu tipo de inhibidores son la muermirulina y el -muermol? c) Si para los ensayos con inhibidor la concentracin de stos era de 5 mM (en ambos casos) cules son los valores de las Ki de estos inhibidores? d) Calcula el grado de inhibicin a una concentracin de sustrato de 0,1 mM para el caso del -muermol.
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Serie Didctica N 36
29. Un extracto enzimtico crudo contiene 20 mg de protena/ml. 20 l de

ese extracto crudo catalizan la produccin de 3 moles de producto en 1 min, en condiciones ptimas de ensayo. Calcular a) la concentracin de la enzima en el extracto crudo en U/ml b) la actividad especfica de esta enzima en el extracto en U/mg de protena c) la actividad total del extracto si tenemos 100 ml del mismo.
30. Se dispone de dos preparaciones distintas de una enzima cuyo PM=

40.000. Una de las preparaciones constituye un extracto crudo celular y en ella la actividad especfica que se detecta es de 0,4 U/mg de protena. La otra constituye una preparacin de la enzima pura y su actividad especfica es de 65 U/mg protena. Cul de las dos preparaciones utilizaras para calcular el nmero de recambio de la enzima? Justifica tu respuesta. Calcula el valor del mismo.
31. Una preparacin enzimtica de glutamato deshidrogenasa (P.M.=

60.000) contiene 10 mg de protena por ml. Si 20 l de esta preparacin se ensayan en condiciones estndar ptimas, pero variando la concentracin de sustrato, se obtienen las velocidades que se indican en la tabla para los casos de ausencia y presencia de un inhibidor ([I] = 2 mM).
[S] (mM) 0,25 0,33 0,50 1,00 2,00 vo (mol/ml min) Con Inhibidor Sin Inhibidor (2 mM) 2,00 0,47 2,48 0,63 3,33 0,91 5,00 1,67 6,67 2,8
a) Determinar la Vmx y la KM de la enzima en presencia y ausencia del

inhibidor. Decir de qu tipo de inhibicin se trata.
b) Calcular la actividad enzimtica de la preparacin de glutamato

deshidrogenasa, expresada como U/ml.
c) Cul es la actividad especfica de la glutamato deshidrogenasa en la

preparacin enzimtica?
49
Serie Didctica N 36
d) Considerando que la preparacin enzimtica es pura, calcular el

nmero de recambio de la glutamato deshidrogenasa.
e) Se llevan a ensayo 50 l de la preparacin enzimtica, en presencia de

0,5 M de sustrato. Calcular la cantidad de sustrato desaparecido en 3 min (el volumen estndar de reaccin es de 1 ml).
50
Serie Didctica N 36
Gua N 5 Tema: CIDOS NUCLEICOS Objetivos

Que el estudiante conozca la estructura y funciones de los cidos nucleicos para comprender el mecanismo de la herencia en los seres vivos.
Introduccin terica
Los
cidos
nucleicos,
cido
desoxirribonucleico
ADN
cido
ribonucleico ARN, son las molculas encargadas de almacenar y transferir la informacin gentica. Ambos cidos son polmeros de unidades denominadas nucletidos. Los nucletidos o mononucletidos contienen tres componentes caractersticos:
1) Una base nitrogenada 2) Un azcar de cinco tomos de

carbono: ribosa (ARN) o desoxiribosa
(ADN) 3) Un grupo fosfato

La molcula sin el grupo fosfato se denomina nuclesido.
Componentes de los nucleotidos Bases nitrogenadas: se encuentran dos clases de bases nitrogenadas:
las bases pricas (adenina: y guanina) y las bases pirimidnicas
(citosina, timina, uracilo)
Azucares componentes: se encuentran presentes solo dos azucares de

cinco tomos de carbono o pentosas:
D-Ribosa: presente en los mononucletidos derivados del ARN
51
Serie Didctica N 36
2-Desoxi-D-Ribosa: mononucletidos derivados del ADN

5' 5'
CH2OH
4'
O H
2'
OH
1' 4'
CH2OH H H OH
3'
O H
2'
OH
1'
H
3'
OH
OH
-D-ribosa
4 H C 3 2 4
-2-Desoxi-D-Ribosa
6
N HC N
1
CH
H C
1 2
7 5
N HC N
3
N CH 8 N H
9
CH 6
4 4C
Pirimidina Bases Pricas NH2 C N HC N Adenina C C N CH N H H2N C HN
Purina
O C C C N Guanina Bases Pirimidinicas N CH N H
NH2 C N O C N H Citosina CH CH HN O C
O C C CH N H Timina CH3 HN O C
O C CH CH N H Uracilo
Nuclesidos: la unin entre la base nitrogenada y el azcar ocurre en N1 de las de las pirimidinas o el N-9 de las purinas con el tomo de C-1 de la pentosa. Todos los nuclesidos derivados de los cidos nucleicos son anmeros
Nucleotidos: Son esteres fosfricos de los nuclesidos en los que el

cido fosfrico esterifica a uno de los grupos hidroxilos libres de la pentosa. Puesto que en las pentosas existen dos o mas grupos hidroxilos libres, el grupo fosfato puede hallarse en mas de una posicin:
52
Serie Didctica N 36
Ribonucletidos: existen tres posiciones: 2, 3, 5. En las celulas

predominan los grupos en posicion 5.
Desoxirribonucletidos: solo dos posiciones: 3 y 5. Ambas existen

biolgicamente.
Acidos nucleicos (polinucleotidos)

Los polinucletidos son mononucletidos unidos covalentemente mediante una unin fosfodiester. Los grupos 5-monofosfato se unen al grupo hidroxilo en posicin C-3 del nucletido vecino.
NH2 extremo 5' O
5'
N Adenina
-O
P O
O CH2
4'
O H
2'
N
1'
N NH2 N Citosina O H N
1'
H
3'
enlace fosfodiester
O
5'
H O CH2
4'
-O
P O
O O N NH NH2 O H3C NH O
1' 2'
H O
3' 5'
H
2'
H O CH2
4'
-O
P O
O H
N
1'
H
3'
H
2'
O
5'
-O
P O
O CH2
4'
O H
H OH
3'
extremo 3
Por convencin la estructura de una porcin de acido nucleico se escribe
desde el extremo 5 hacia el extremo 3.

Algunas representaciones simples de polinucleotidos son:
pA-C-G-T-AOH, pApCpGpTpA, pACGTA ADN: Apareamiento de las bases

En las hebras enfrentadas adenina (A) se complementa con timina (T), y guanina (G) se complementa con citosia (C). A menudo los pares de
53
Serie Didctica N 36
bases son mencionados como A-T o G-C, adenina a timina y guanina a citosina. A-T estn unidas por dos puentes Hidrgeno y C-G por tres.
Se aparean una base prica con una pirimdinica
ARN: tipos
ARN mensajero (ARNm)
Se sintetiza sobre un molde de ADN en el ncleo, por el proceso de trascripcin, y pasa al citoplasma sirviendo de pauta para la sntesis de protenas (traduccin).
ARN de transferencia (ARNt):

Participa en la sntesis de protenas transportando los aminocidos libres del citoplasma hacia el lugar de ensamblado de protenas. Existen ARNt especficos para cada uno de los aminocidos. Son los mas pequeos ARN ribosomal (ARNr) Est presente en los ribosomas, orgnulos intracelulares implicados en la sntesis de protenas. Su funcin es leer los ARNm y formar la protena correspondiente.
54
Serie Didctica N 36
El cdigo gentico y la biosntesis de protenas Cdigo gentico: relacin entre la secuencia de bases del ADN o su
trascripcin en el ARN y la secuencia de aminocidos de una protena Una secuencia de tres bases, denominada codon, corresponde a un aminocido Cada codon corresponde a un aminocido, hay 4 bases entonces hay 64 posibilidades de combinacin, pero solo hay 20 aminocidos, por lo tanto el cdigo esta degenerado, (algunos codones diferentes pueden corresponder a un mismo aminocido). De los 64 codones, tres codifican para la terminacion (UAA, UAG, UGA). El codon AUG tiene una funcin doble, es el codon iniciador y codifica para el aminoacido Met,
Tabla: El cdigo gentico; conversin de los codones en aminocidos

Primera base (extremo 5) Segunda base U C A G U C A G U C A G U C A G Tercera base (extremo 3) U Phe Ser Tyr Cys Leu Pro His Arg Ile Thr Asn Ser Val Ala Asp Gly C Phe Ser Tyr Cys Leu Pro His Arg Ile Thr Asn Ser Val Ala Asp Gly A Leu Ser Final Final Leu Pro Gln Arg Ile Thr Lys Arg Val Ala Glu Gly G Leu Ser Final Trp Leu Pro Gln Arg Met (inicio) Thr Lys Arg Val Ala Glu Gly
Problemas y ejercicios 1. Dibuje la formula estructural de cada uno de los siguientes nuclesidos a) citidina b) desoxiadenosina c) uridina d) desoxigaunosina
Indique: tipo de nucletido y tipo de base nitrogenada
2. Escriba la estructura de 5-monofosfato de guanosina 3. Escriba la estructura para dCMP y dGMP

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Serie Didctica N 36
4. Dibuje la estructura de los siguientes nucletidos derivados del ADN: a. A-T b. G-T c. A-C 5. Suponga la siguiente secuencia de bases, para una de las ramas del
ADN: AGCCATGT (descritas desde 5 hasta 3) Cul ser la secuencia de bases de la otra rama?
6. Como se unen los cordones en el ADN, segn Watson y Crick? 7. lndicar que uniones contribuyen a la formacin de un cido nucleico. 8. En que se diferencian el ADN y el ARN? 9. Que significa "bases complementarias"? 10. Escribir la secuencia complementaria de: a) GATCAA b) ACGCGT c) TCGAAC d) TACCAT 11. Que es el cdigo gentico? 12. Que es una mutacin? 13.a) Nombre las bases pricas y pirimidnicas que forman parte del DNA.
b) Indique la principal diferencia entre los tipos de bases pricas y pirimidnicas.
14. En la figura se presenta una hebra simple de DNA: a. Identifique un nucletido. b. Cmo reconoce que la hebra es de DNA? c. Indique los extremos 3' y 5' y los grupos de cada extremo.
NH2 extremo 5' O
5'
N Adenina
-O
P O
O CH2
4'
O H
2'
N
1'
N NH2 N Citosina O H N
1'
H
3'
O
5'
H O CH2
4'
-O
P O
O O N NH NH2 O H3C NH O
1'
H O
3' 5'
2'
H O CH2
4'
Guanina
-O
P O
O H
3' 2'
N
1'
O
5'
-O
P O
O CH2
4'
O H
3' 2'
Timina
H OH
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Serie Didctica N 36
d. Seale un enlace fosfodister. 15. Cules son las fuerzas estabilizadoras de la doble hlice? 16. Si el contenido en C de un DNA doble hebra es de 15%, cul ser el
contenido de A?
17. La composicin (en unidades de fraccin molar) de una de las

cadenas de ADN de doble hlice es: A = 0.30 y G= 0.24. Qu puede decirse de las bases T y C de la misma cadena?
18. Con los datos del % C-G y A-T, ordene las molculas de DNA segn
su Tm (temperatura media de fusin) de menor a mayor. Indique en que se bas para ordenarlas DNA 1. Contenido C-G 80% DNA 2. Contenido A-T 40% DNA 3. Contenido A-T 20% DNA 4. Contenido G-C 40%
19.
Dado
el
siguiente
oligonucletido
de
RNA,
Qu
tipo
de
rompimiento(si lo hay) ocurrira en este segmento si el RNA es tratado con:
a) NaOH d) Nucleasa S1
b) ribonucleasa pancretica A
c) Ribonucleasa T1
e) exonucleasa III.
pGpGpCpUpApCpGpUpApGpApUpCpA
20. Se preparo un polirribonulceotido a partir del tetranucleotido UAUC.

Cuando se someti a las condiciones de sntesis de pptidos, se obtuvo el polipptidos (Tyr-Leu-Ser-Ile) Cules son los codones para estos cuatro aminocidos?
21. Una rama de ADN tiene la siguiente secuencia:

5 Cul es el pptido que producir? 3 -CCAUGCAGGAUGCCAAACUAAUUAACUAGC-
(no olvide los codones de iniciacin y terminacin)
22. La cadena polipeptidica de la mioglobina contiene 153 residuos de

aminocidos; entonces cuantos pares de bases estarn presentes en el gen que especifica la configuracin de este polipptido?
23. Escriba la secuencia de nucletidos, dentro de un gen de ADN, que

especificar la siguiente secuencia de aminocidos en el polipptido codificado por el gen:
57
Serie Didctica N 36
.ala-asp-trp-gli-pro Qu sucedera si se borrase la primera U de la secuencia?
58
Serie Didctica N 36
Gua N 6 Tema: BIOENERGTICA Y METABOLISMO DE CARBOHIDRATOS Objetivos:

Que el estudiante:
Conozca los principios que rigen el metabolismo celular. Interprete la manera como ocurre la distribucin, asimilacin y
almacenamiento de los productos de la fotosntesis
Introduccin terica
La bioenergetica es el estudio cuantitativo de las transformaciones de energa que permite mantener los organismos vivos, o sea los cambios energticos que ocurren en el ambiente celular. La bioenergtica utiliza los conceptos de la termodinmica, especialmente la energia libre de Gibbs G. La energa libre representa la cantidad de energa libre capaz de realizar un trabajo a temperatura y presin constante.
Reactivos
estado inicial
Productos
estado final
Gi Gf G= Gf - Gi
G y espontaneidad de las reacciones

De acuerdo al signo de G es posible predecir si una reaccin podr ocurrir espontneamente o no:
G < 0: reaccin exergnica, libera energa, termodinmicamente favorable
(espontneas)
G > 0: reaccin endergnica, necesita energa, termodinmicamente

desfavorables (no espontneas)
G = 0: sistema esta en equilibrio, no hay tendencia a experimentar ningn

cambio neto posterior.
Cambios de energa libre estndar: G0

El smbolo G0 se refiere al cambio de energa libre estndar, donde las concentraciones de los reactivos y productos son 1M y solo depende de los cambios en temperatura y presin.
59
Serie Didctica N 36
G0 y la constante de equilibrio de una reaccin estn relacionadas segn

las ecuacin:
G = G 0 + RT ln
[C ]c [D]d [A]a [B]b
donde R: constante universal de los gases (0.082 l.atm/K.mol) y T temperatura en grados kelvin. Si G = 0 (en el equilibrio): G = -RT ln Keq
Para las reacciones de oxido-reduccin: G0 = -nF 0 G0 = -nF0

Donde : potencial de celda (V), n: numero de elctrones, F: constante de Faraday. Muchas reacciones, especialmente las bioqumicas, implican la presencia de iones H+ en estos casos se define G0 que corresponde a soluciones de pH=7.
Acoplamiento energetico
Si una reaccin exergnica ocurre en presencia de una reaccin endergnica la produccin de energa de la primera sirve para llevar a cabo la segunda, este hecho se conoce como acoplamiento energetico En las celulas existen compuestos de alto contenido energtico, que se caracterizan por tener enlaces que al romperse liberan una alta cantidad de energa la cual sirve para que se lleven a cabo otras reacciones que la precisan. Dichos compuestos se conocen como
molculas de alta
energa: Adenosin trifosfato (ATP): conocida como la moneda energtica de la

clula. Molcula transportadora de grupos fosfato. Al formar ATP las clulas conservan la energa qumica liberada en las reacciones qumica que la producen y luego, por degradacin del ATP utilizan esta bioenergia para mantener los eventos de sntesis y otros procesos celulares.
Nicotinamida adenin dinucleotido (NADH): molcula transportadora de

electrones, rica en energa y tomos de hidrgeno, participa en muchas reacciones en el citoplasma
60
Serie Didctica N 36
Flavin-adenin-dinucletido (FADH2): Transportador de electrones, rico

en energa e hidrgeno, participa en reacciones que se llevan a cabo en la mitocondria.
Metabolismo
Se denomina metabolismo a la suma total de todas las reacciones que tienen lugar en las clulas. El metabolismo tiene lugar a travs de secuencias de reacciones consecutivas catalizadas enzimticamente utilizando muchos intermediarios qumicos
Caractersticas
Las reacciones enzimticas estn organizadas en las rutas metablicas Un precursor se convierte en producto a travs de intermediarios: metabolitos. Cada reaccin ocasiona un pequeo cambio especfico en la estructura qumica.
Funciones:
Degradar molculas nutrientes para obtener energa qumica y para convertirlas en molculas propias de la clula. Polimerizar biopolmeros. Sintetizar y degradar biomolculas con funciones especializadas y necesarias para la clula precursores monomricos en macromolculas tipo
Clasificacin de los procesos metablicos

El metabolismo puede clasificarse en:
Procesos catablicos (exergnicos): Son todos lo que degradan, en el

caso de los humanos, alimentos: carbohidratos, protenas y lpidos.
Procesos anablicos (endergonicos): toman molculas pequeas y

sintetizan macromolculas. Ambos son interdependientes y sus actividades estn coordinadas, tal como lo muestra el siguiente esquema:
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Serie Didctica N 36
Nutrientes conteniendo energa Carbohidratos Anabolism Lpidos o Protenas
METABOLISM O
Catabolismo
Productos finales sencillos
Catabolismo
CO2 H2 O NH3
energa qumica
Macromoleculas Protenas Polisacridos Lpidos cidos Nucleicos Molculas precursoras
Anabolismo
Aminocidos Carbohidratos cidos grasos Bases nitrogenadas
Rutas metablicas
En el esquema siguiente se resumen las vas principales del catabolismo y el anabolismo en la clula.
62
Serie Didctica N 36
Problemas y ejercicios 1. Explique el termino Reacciones Acopladas. Cul es su utilidad? 2. a) A que se denominan compuestos ricos en energa o de Alta
energa. Ejemplos.
b) Que papel desempean en el metabolismo?
3.a) En la molcula de ATP indique los enlaces de alta energa.

b) La hidrlisis del ATP en AMP + 2Pi cuntas Kcal. libera?
c) Por qu el AMP no es usado como fuente de energa? 4. Qu significa que una reaccin tenga G negativo (G < 0) o G
positivo (G > 0)?
5. Calcular las variaciones de energa libre estndar de las siguientes

reacciones catalizadas por enzimas metablicamente importantes, a 25C y pH 7, a partir de las constantes de equilibrio dadas.
a) Glutamato + oxalaceto
Aspartato aminotransferasa Triosafosfato isomerasa
aspartato + -cetoglutarato Keq= 6.8
b) Dihidroxiacetona fosfato
gliceraldehdo-3-fosfato Keq= 0.0475
c) Fructosa-6-fosfato + ATP
fosfofructo quinasa
fructosa-1,6-bifosfato + ADP Keq= 254
6. Resuma las caractersticas del NAD y FAD e indique que funciones

cumplen
7. En las reacciones siguientes se representa la sntesis e hidrlisis del

ATP. a. Complete en cada caso el signo de G. b. Cul es el valor en Kcal. de G de cada reaccin?
ADP + P ATP + H2O
ATP + H2O ADP + P
G G
8. Al sintetizar ATP las clulas conservan parte de la energa qumica

obtenida de reacciones de degradacin que liberan energa. Al hidrolizar el ATP se obtendr energa que ser usada en diversos procesos celulares. D ejemplos de dos procesos biolgicos de este tipo.
63
Serie Didctica N 36
9. Cul de las siguientes afirmaciones en relacin con el ATP NO es

cierta?
a) El ATP es la moneda energtica que enlaza procesos biolgicos

productores de energa (catabolismo) y consumidores de energa (anabolismo)
b) La variacin de energa libre en la hidrlisis de ATP es grande y

positiva (G=30kJ/mol)
c) Otros compuestos con energa de hidrlisis elevada son: 1,3bifosfoglicerato (1,3BPG); fosfoenol piruvato (PEP); tiosteres (acetil-CoA, succinil-CoA)
d) La transferencia de un grupo fosfato desde un compuesto de alta

energa para sintetizar ATP se denomina fosforilacin a nivel de sustrato
e) En la fosforilacin oxidativa se produce la transferencia de electrones al

O2 acoplado a la biosntesis de ATP en la membrana mitocondrial
10. Defina metabolismo e indique las diferencias entre anabolismo y

catabolismo desde el punto de vista de la variacin de energa libre.
11. En la gliclisis hay dos reacciones que precisan una molcula de ATP
y otras dos que producen una molcula de ATP. Siendo esto as cmo puede la gliclisis ofrecer, en la degradacin de glucosa a lactato, una produccin neta de dos molculas de ATP por cada una de glucosa?
12. En cierto proceso metablico se producen seis molculas de

gliceraldehido tres fosfato que se incorporan a la glucolisis. Cuntas molculas de piruvato se forman?
13. Dos molculas de maltosa son hidrolizadas y los productos

resultantes se incorporan a la glucolisis. Cuntas molculas de piruvato se originan?
14. Cunto ATP se produce en la oxidacin completa de tres molculas

de acetil-CoA?
15 A continuacin se muestra un esquema simplificado de la gliclisis: a) Identificar los enzimas que catalizan cada una de las reacciones de la
gliclisis;
b) Qu reacciones requieren energa en forma de ATP? c) Cules son fosforilaciones a nivel de sustrato? d) Cuales reducen NAD+?
64
Serie Didctica N 36
e) Cuales son irreversibles? f) Cules estn catalizadas por enzimas reguladoras?

glucosa glucosa-6-fosfato fructosa-6-fosfato fructosa-1,6-bisfosfato gliceradehdo-3-fosfato 1,3-bisfosfoglicerato 3-fosfoglicerato 2-fosfoglicerato fosfoenolpiruvato piruvato dihidroxiacetona fosfato
16. En la siguiente reaccin qumica:
O CH3C COOH + XH2
OH CH3CH COOH + X
a. Qu reactivo pierde electrones y quin los gana? b. Qu tipo de reaccin es? 17. Escribe la reaccin de formacin de la glucosa-1-fosfato a partir de
glucosa y ATP. De qu tipo de reaccin qumica se trata?
18. Que localizacin intracelular tiene el ciclo de Krebs? 19. Que reacciones del ciclo del cido ctrico (o ciclo de Krebs) se
corresponden con la secuencia lineal siguiente:
compuesto saturado compuesto insaturado alcohol cetona

Ilustrar con formulas.
65
Serie Didctica N 36
20. La reaccin de abastecimiento ms importante del Ciclo de Krebs, si bien no la nica, es la condensacin de la acetil-CoA con el oxalacetato
(OAA), un cido dicarboxlico de 4C. En el siguiente esquema del Ciclo de Krebs:
a. Identifique con un recuadro, sobre la molcula de citrato, los carbonos

provenientes de la acetil CoA.
b. Identifique las reacciones catalizadas por deshidrogenasas. c. Las coenzimas reducidas por las deshidrogenasa identificadas en b.
cmo se reoxidan?
d. Indique cuntos ATP se forman como consecuencia de la actividad de

las deshidrogenasas?
e. Se produce fosforilacin en el ciclo de Krebs? (a nivel sustrato)
Acetil CH3COSCoA COOHSCoA

COOHO CH CH2 COO-
C O CH2
COOCH2 HO C COOCH2 COOcitrato COOCH2 HC COOHO CH COOisocitrato
NADH.H COONAD oxalacetato
COOCH HC
malato
COOfumarato FADH.H
FAD
COOCH2 CH2 COO-
NAD NADH.H HSCoA

COOCH2
COO-
CO2
succinato GTP GDP
NADH.H
NAD
CH2 CH2 C O
CH2 C SCoA O
CO2
HSCoA
COO-
succinil-CoA
-cetoglutarato
21. Qu funcin tiene la cadena de transporte electrnico en la

mitocondria? En que lugar se localiza?
66
Serie Didctica N 36
22. Teniendo en cuenta el esquema de la cadena respiratorial que se

tiene en cuenta la diferencia de potencial entre sus componentes. Indique:
a. Por qu los electrones pasan a travs de los transportadores en el

orden representado en el esquema?
b. Cual es el aceptor final de electrones? c. El consumo de O2 vara segn el dador de electrones sea NAD o
FAD? Explique.
2 H+ (fp) cit b
NADH(H )
-0.32
0
FMN
-0.12
CoQH2
+0.10
Fe
3+
cit c1
cit c
Fe
2+
Fe
3+
cit a,a3
Fe
2+
O2
+0.82
+0.04
+0.22
+0.25
+0.29
NAD
FMNH2
CoQ
2 H+
Fe
2+
Fe
3+
Fe
2+
Fe
3+
H 2O
FAD
FADH2
23. Realice el balance de la degradacin total de la molcula de glucosa.

Fundamente el balance.
24. Completa el siguiente esquema con las frmulas de las especies

qumicas que corresponden a lo expresado dentro de cada recuadro.
Reactivos de los organismos fotosintticos ( ...... + ........)
Se convierten en
Productos de los organismos aerobios no fotosintticos (....... + .......)
Energa solar
CICLO DEL CARBONO Y OXGENO
Energa metablica
Productos de los organismos fotosintticos (.............+ ........ ) Se convierten en
Reactivos de los organismos aerobios no fotosintticos ( .............. + ..... )
67
Serie Didctica N 36
25. Resume, por medio de un esquema los acontecimientos que ocurren

en la etapa luminosa de la fotosntesis.
26. Indique las semejanzas y diferencias entre los procesos de

fotosntesis y respiracin
27. Escriba en los cuadros en blanco las especies qumicas faltantes.

Clorofila (estado oxidado)
+
ATP
transferencia de electrones
transferencia de electrones
NADP
Clorofila* (estado excitado de alta energa)
Absorcin de energa
O2
Clorofila (estado original de baja energa)
28. Indica a que etapa de la fotosntesis corresponden las siguientes

ecuaciones, compltalas e indica como se denomina el proceso que representa cada una de ellas: a. b. c. H2O (.......+ 2e) + O2 ........... + 2H+ + 2e NADPH + ....... ADP + ......... ATP
29. Indica cual de las siguientes expresiones simboliza la reaccin de

inicio del Ciclo de Calvin. Nombra y escribe la estructura del aceptor inicial del CO2 y del producto inmediato resultante, en la opcin correcta: a. C2 + CO2 C3 b. C5 + CO2 2C3
68
Serie Didctica N 36
Gua N 7 Tema: METABOLISMO DE LOS LPIDOS Objetivos:

Comprender las vias metabolicas que conducen a la degradacion y sntesis de acidos grasos
Problemas y ejercicios 1. El cido graso activado una vez en

la matriz mitocondrial puede sufrir oxidacin, representada. va que aparece
R C H2 H2 C O C H2 S CoA
acil CoA FAD oxidacin FADH2 R H C O C H S CoA
a. Identifique en el acil-CoA el carbono
y el carbono .
b. Qu molculas se obtienen como
consecuencia de una vuelta de oxidacin?.
C H2
trans-N-enoil CoA H2O hidratacin
c. Cuntas vueltas de -oxidacin

deben ocurrir para oxidar al cido palmtico (16C)?.
R HO C H2 C H
O S CoA
d. Identifique las reacciones donde

participan oxidoreductasas e indique cuntas coenzimas reducidas (FADH2 y NADH.H) se generan por vuelta y cuntas en total para un cido graso de 16 C?
C H2
L-3-hidroxiacil CoA NAD+ oxidacin NADH + H+
O R C H2 C C H2
O S CoA
e. Cuntas molculas de acetilCoA

se forman a partir de ese cido graso?
3-cetoacil CoA HS-CoA tiolosis O R C H2 S CoA + C H3 O S CoA
f. Qu destino tendrn las molculas

de acetilCoA en condiciones de demanda energtica?
g. Ahora puede expresar el balance

en ATP de la oxidacin total del
acil CoA (-2C)
acetil CoA
palmtico. Complete el cuadro al final de la pregunta que le ayudar a reconocer que procesos debe considerar para realizar este clculo.
69
Serie Didctica N 36
2. En condiciones de bajo nivel de ATP celular los cidos grasos se usan

para obtener ATP a travs de un proceso metablico denominado -
oxidacin.
a. Los cidos grasos antes de la -oxidacin deben sufrir un proceso denominado activacin. Esquematice la reaccin de activacin de un cido graso e indique la localizacin celular de dicho proceso. b. La activacin y la -oxidacin ocurren en compartimentos separados. Identifique los compartimentos celulares y la molcula clave en el pasaje de los cidos grasos activados de un compartimento a otro.
3. En la oxidacin del cido palmtico, cuntas molculas de acetil-Co A

se incorporan al ciclo de Krebbs? El palmtico tiene 16 carbonos.
4. En que caso la produccin de ATP es mayor: para un acido graso

saturado o para uno insaturado de igual numero de carbonos? Fundamente su respuesta
5. Qu productos se obtendrn da la beta oxidacin del acido

nonanoico?
6. Cul ser la ecuacin total del proceso de beta oxidacin del cido
miristico a acetil CoA?
7. Cul ser el balance energtico (rendimiento de ATP) correspondiente

a la oxidacin del acido miristico a CO2 y H2O?
8.a) Describa la reaccin que a aparece a continuacin e indique su

importancia en la sntesis de cidos grasos.
ATP CH3C O HCO3ADP + Pi -OOC CH2 C O
~ SCoA
~ SCoA
b) La acetil CoA se produce principalmente en la matriz mitocondrial.

Realice un esquema del mecanismo que permite la salida de los grupos
70
Serie Didctica N 36
acetilo (-OOC-CH3) al citosol para formar la acetil CoA citoslica. (Puede encontrar este mecanismo con el nombre de lanzadera del citrato).
9. La va de sntesis de los cidos grasos se inicia con la reaccin de

unin de la acetil CoA y la malonil CoA a un complejo multienzimtico. Las
1 O CH3C Acetil-ACP
~S
ACP O
CH2 C
~S
ACP Malonil-ACP
unidades del complejo son incapaces de actuar por separado: estn unidas a la protena, portadora se unen ACP de al (protena acilos). La
-cetoacetil ACP
sintasa
COOACP, CO2 S-ACP
-cetoacetil-ACP
NADPH + H+ 2
-cetoacetil-ACP
reductasa NADP+ H CH3 C OH CH2 O C
acetill CoA y la malonil CoA complejo formando un compuesto de 4 carbonos con liberacin de 2 molculas de H2SCoA (Coenzima A) y CO2. Analice indique: el esquema e
H CH3 C C H O C 3
~S
ACP
3-hidroxiacil-ACP 3-hidroxiacil-ACP deshidratasa H2O
~S
ACP
a. Compuesto que se forma

la reaccin
trans-2-enoil-ACP NADPH + H+ 4 enoil-ACP reductasa
(recuadro
vaco).
~NADP
O CH3 CH2 CH2 C butiril-ACP S
b. Qu molcula se une al
compuesto de 4C resultante
ACP
de la reaccin 4 para formar un cido graso de mayor nmero de C?
c. Cuntas veces deben repetirse estas reacciones para formar el cido

palmtico (16 C)?
d. Las reacciones donde participan oxidoreductasas e indique qu va

metablica suministra dicho poder reductor.
e. La enzima clave en la regulacin de la sntesis es la acetil CoA

carboxilasa Cules son los moduladores positivos de esta enzima?
71
Serie Didctica N 36
10. La glucosa y el cido caproico son compuestos de seis tomos de

carbono Cul de estas dos molculas producir mas ATP al ser oxidados completamente a CO2 y H2O? Fundamente su respuesta. Realice un esquema entre las diferencias entre la oxidacin y la sntesis de cidos grasos
11. Completa la siguiente secuencia de pasos, a travs de los cuales se

lleva a cabo el Catabolismo de los cidos grasos, por medio de la oxidacin:
(A) DESHIDROG. (dependiente de FAD) (B) ............... (C) DESHIDROG. (dependiente de NAD) (D)........... (E) RECICLAJE REPETITIVO DE LA ACIL-SCoA (acortada por los pasos A y D). 12.a) Escriba la ecuacin balanceada para la degradacin del cido
esterico por -oxidacin. b. Porqu la conversin de este cido en nueve unidades de AcetilScoA requiere nueve unidades de Coenzina A, en vez de ocho?
13. Calcule el nmero de moles de ATP producidas durante la oxidacin

del cido caprlico (6 C). A qu se debe que la produccin en ATP por cada seis carbonos de cido graso sea superior al de los seis carbonos de una hexosa? (Considere, por supuesto, que en ambos casos el catabolismo es completo hasta CO2).
14. Realice el balance energtico para la degradacin, por -oxidacin, de

una molcula de cido lurico y comprelo con el correspondiente a la oxidacin de dos molculas de glucosa.
15. En base a los datos provistos a continuacin calcule el rendimiento

energtico (o eficiencia) de la oxidacin del cido caprilico (6 C). Realice el mismo clculo para la glucosa. Qu opinin o conclusin le sugieren los resultados obtenidos?
Datos: a. Energa liberada en la combustin completa de una molcula de

cido caprilico en una bomba calorimtrica = 1.170Kcal/mol b. Energa producida por la combustin completa de una molcula de glucosa en una bomba calorimtrica = 686 Kcal/mol
72
Serie Didctica N 36
Bibliografa
HART, H. HART, D., CRAINE, L. Qumica Orgnica. Novena Edicin. Mc Graw-Hill. 1995. WADE, L.G. Jr. Qumica Orgnica. Segunda Edicin. Prentice-Hall Hispanoamericana. 1993. MORRISON y BOYD. Qumica Orgnica. Quinta Edicin, Addison-Wesley Iberoamericana, 1990. MEISLICH, H; NECKAMKIN, H; SHAREFKIN, J. Quimica Organica. Segunda Edicion. Mac Graw-Hill BLANCO, A. Qumica Biolgica. Tercera Edicin. Editorial Gonzlez Truccone. 1986. LEHNINGER, A. Curso Breve de Bioqumica. Ediciones Omega. 1983. BOHINSKY, R. Bioqumica. Addison Wesley. Iberoamericana S.A. Quinta Edicin. 1991 STRYER, L. Bioqumica. Tercera Edicin. Tomo 1. Editorial Revert. 1990
HORTON, H. R.; MORAN, L. A.; OCHS, R.; RAWN, J. D.; SCRIMGEOUR, K. Bioqumica. Editorial Prentice-Hall Hispanoamericana. 1993 FERNANDEZ CIRELLI, A.; DELUCA, M. E.; DU MORTIER, C. Aprendiendo Qumica Orgnica. Segunda Edicion. Editorial Eudeba. 2005. GARRIDO PERTIERRA, A.; TIEJON RIVERA, J. M.; GAITAN, D. B.; VILLAVERDE GUTIERREZ, C.; MENDOZA OLTRAS, C.; RAMIREZ RODRIGO, J. Fundamentos de Qumica Metablica. Primera Edicin. Editorial Alfaomega grupo editor. 2005. CORZO A. G. Gua de estudio y ejercitacin sobre nomenclatura organica. Serie Didctica N 18. Ctedra de Qumica Orgnica y Biolgica. Facultad de Ciencias Forestales. Universidad Nacional de Santiago del Estero. 2005.
73

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Gua terico prctica de Qumica Biolgica

Dra. Evangelina Gonzlez. Ing. Adriana Corzo-Facultad de Ciencias Forestales-UNSE

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Ceras Fosfolpidos Esfingolpidos Glicolipidos

Dra. Evangelina Gonzlez. Ing. Adriana Corzo-Facultad de Ciencias Forestales-UNSE

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Dra. Evangelina Gonzlez. Ing. Adriana Corzo-Facultad de Ciencias Forestales-UNSE

Gua terico prctica de Qumica Biolgica

Compuestos (esfingomielina) Glicolpidos a. Cerebrsidos b. Gangliosidos

3. Escriba la estructura general para las siguientes sustancias:

Gua terico prctica de Qumica Biolgica

Gua terico prctica de Qumica Biolgica

trimiristina es una grasa slida que se encuentra en la nuez

15. Formular ecuaciones que muestren las reacciones del triestearato de b) Mg 2+ c) Fe 3+

16. a) Qu diferencia estructural existe entre un detergente y un jabn?

Gua terico prctica de Qumica Biolgica

c) estearopalmitooleato de glicerilo + H2O

Gua terico prctica de Qumica Biolgica

26. Esquematice la estructura de los esteroles y enuncie la importancia

COOH COOH COOH COOH COOH

COOH COOH COOH COOH COOH

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Tamao de la cadena carbonada

Tetrosas Pentosas Hexosas

Localizacin del grupo C=O

Aldosas Cetosas Serie D Serie L

Numero de unidades de azcares

Monosacrido s Disacrido s Oligosacridos Polisacridos

Dra. Evangelina Gonzlez. Ing. Adriana Corzo-Facultad de Ciencias Forestales-UNSE

Gua terico prctica de Qumica Biolgica

Gua terico prctica de Qumica Biolgica

Grupos hacia adelante

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Estructuras cclicas, hemiacetlicas de los monosacridos

Haworth el anillo se representa como si fuera plano, se visualiza con un

Gua terico prctica de Qumica Biolgica

Como convertir una proyeccin de Fischer en una de Haworth?

Propiedades qumicas 1. Mutarrotacin

Dra. Evangelina Gonzlez. Ing. Adriana Corzo-Facultad de Ciencias Forestales-UNSE

Gua terico prctica de Qumica Biolgica

CH2OMe O H OH H OH CH3I, Ag2O H H OMe H

5. Preparacin e hidrlisis de glicsidos

Dra. Evangelina Gonzlez. Ing. Adriana Corzo-Facultad de Ciencias Forestales-UNSE

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2. Segn el nmero de carbonos y grupos funcionales, cmo denomina

3. Escriba la formula estructural de: a. una aldotriosa 4.

Seleccione, entre las siguientes alternativas, como definiras a la

Monosacridos de tipo aldohexosa que tiene un grupo aldehdo y 6

Es una cetopentosa que posee un grupo cetona y 5carbonos en su

Un monosacrido del tipo aldopentosa con un grupo aldehdo y 5

5.a) Entre los siguientes monosacridos, indique cuales de ellos son

6. Por qu tienen carcter reductor los Monosacridos? Marque con una

7. Indique las diferencias que existen entre los trminos constitucin (o

8. Seleccione la respuesta correcta: Cundo se dice que un carbono es

Gua terico prctica de Qumica Biolgica

9. Cuntos ismeros pticos se espera que tenga el 3-bromo-2-butanol?

10. Cul de las siguientes molculas puede existir como enantimeros?