Taller de Web MO #1

ABRIL 3 DE 2019
FÍSICO-QUÍMICA
TUTORIAL – TALLER FÍSICO-QUÍMICA COMPUTACIONAL
WEBMO
Dr. Aldo F. Combariza
Estudiante. Yan carlos ozuna diaz codigo. 1421005677797
1: Como ingresar a WebMO
2. Crear estructuras de compuestos químicos en WebMO (Como ejemplo, crea
la molécula de agua H2O.)
3. Una vez terminada la molécula de agua, experimenta con el editor de

moléculas creando algunas moléculas.
Usa el editor de WebMO para crear las siguientes especies químicas:
● ciclohexano C6H12
● bromoeteno, CH2CHBr
● ácido acetico, CH3COOH
● benceno, C6H6
● el dímero de agua (H2O)2
● Aminoácido (x)
Bromo eteno,
CH2CHBr ciclohexano C6H12
ácido acético, benceno, C6H6

CH COOH
3
ALANINA Dímero de agua (H2O)2

Taller 2 and 3: Cálculos a nivel Semi-Empirico, HF, DFT y MP2
2. Análisis de los resultados
Para visualizar los resultados oprime sobre el nombre del trabajo (Taller-WebMO-
H2O, en este caso). Esto abre la ventana “View Job”. Para el ejemplo del agua se
tiene:
❖ Oprimiendo sobre un átomo y luego manteniendo la tecla “Shift” y oprimiendo

sobre otro átomo , tendrá como efecto el mostrar la distancia entre esos
átomos (en Å), por ejemplo, la distancia entre los átomos de H en la molécula
de H2O es de 1.508 Å, tal como aparece en la parte inferior de la pantalla de
la ventana “Molecule Viewer”.
Oprimiendo en el icono de la lupa, , frente a “IR Spectrum” en la sección
“Vibrational Modes”, se puede generar el espectro de IR que se predice para el H2O.
Los modos vibracionales pueden animarse, utilizando el icono, , ubicado frente a

cada una de las frecuencias calculadas.
Puedes inicializar un cálculo posterior a partir de la geometría ya optimizada

utilizando el botón “New Job Using This Geometry” en la ventana del “Molecule
Viewer”. Automáticamente se seleccionarán tanto la máquina de cálculo como
todaslas otras opciones. Cambia estas opciones si es necesario. Para una
molécula determinada, siempre empieza con el nivel de teoría mas simple
(normalmente será el mas rápido) y usa la geometría optimizada para el cálculo
subsiguiente, aumentando el nivel de teoría de acuerdo a los requerimientos del
trabajo.
Copia los orbitales HOMO y LUMO abajo y describe la naturaleza de la
transición HOMO-LUMO:
ANEXOS.
moleculas Longitudes de en lace C-C en A° Datos encontrados en la literatura

datos de web MO
Benceno Bond length :1.386 A° cada enlace CC que tiene una

longitud de 1,39 Å
( William Reusch, profesor emérito

( Michigan State U. libro de texto
virtual de química orgánica)
ácido acético Bond length:1.502 A° CC 1.54 A° ± 0.04
( ablas de Distancias y
Configuración Interatómicas en
Moléculas e Iones , LE Sutton, ed.,
Londres: The Chemical Society,
1958)
Agua Bond length:0.947A° Enlace C-H Las longitudes de

unión dan alguna indicación de la
fuerza de unión. Un enlace
covalente normal es de 0.96
Angstroms.
Bromo eteno Bond length:1.311A° Enlace C=C de la molécula
Molécula de agua. Distancia y ángulo de enlace.

El átomo de oxígeno está enlazado a dos átomos de hidrógeno formando una
molécula de agua con distancia de enlace H-O de 0,95 Å y ángulo H-O-H de 105º,
aproximadamente, como se muestra en la Figura.
dímero del agua
La orientación de las moléculas de agua adyacente es tal que sólo un átomo de

hidrógeno yace a lo largo del eje oxígeno-oxígeno. La distancia de separación
O···O es aproximadamente de 2.76 Å, como se muestra la Figura
4. Distribución tetraédrica espacial de las moléculas de agua en el hielo Ih.
En este arreglo espacial, la distancia entre el hidrógeno y el oxígeno de la misma

molécula es de 1,00 Å, mientras que esa distancia es de 1,76 Å con el oxígeno de
la molécula de agua vecina más cercana, tal y como se muestra en la Figura
bibliografia
1.G.A. Jeffrey y W. Saenger, Hydrogen bonding in biological structures. Cap. 1, 2,

14, 19 y 21. Springer-Verlag Berlin-Alemania, 1994.
2. T.S. Moore y T.F. Winmill, J. Am. Chem. Soc. 101 (1912) 1635
3. a) W.M. Latimer y N.M. Rodebush, J. Am. Chem. Soc. 42 (1920) 1419. b) M.L.
Huggins, Angew. Chem. Int. Ed. Engl. 10 (1922) 147.
4. L. Pauling, J. Am. Chem. Soc. 57 (1935) 2680.

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3. Una vez terminada la molécula de agua, experimenta con el editor de

ácido acético, benceno, C6H6

ALANINA Dímero de agua (H2O)2

2. Análisis de los resultados

❖ Oprimiendo sobre un átomo y luego manteniendo la tecla “Shift” y oprimiendo

Los modos vibracionales pueden animarse, utilizando el icono, , ubicado frente a

Puedes inicializar un cálculo posterior a partir de la geometría ya optimizada

moleculas Longitudes de en lace C-C en A° Datos encontrados en la literatura

Benceno Bond length :1.386 A° cada enlace CC que tiene una

( William Reusch, profesor emérito

ácido acético Bond length:1.502 A° CC 1.54 A° ± 0.04

Agua Bond length:0.947A° Enlace C-H Las longitudes de

Bromo eteno Bond length:1.311A° Enlace C=C de la molécula

Molécula de agua. Distancia y ángulo de enlace.

dímero del agua

La orientación de las moléculas de agua adyacente es tal que sólo un átomo de

4. Distribución tetraédrica espacial de las moléculas de agua en el hielo Ih.

En este arreglo espacial, la distancia entre el hidrógeno y el oxígeno de la misma

1.G.A. Jeffrey y W. Saenger, Hydrogen bonding in biological structures. Cap. 1, 2,

4. L. Pauling, J. Am. Chem. Soc. 57 (1935) 2680.

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