Lipasa
Lipasa
Lipasa
Liasas, transferasas
e isomerasas
K. Faber,
Biotransformations in Organic Chemistry, 5th ed, 2004
LIPASAS
Lipasas (acilglicerolhidrolasas E.C.3.1.1.3): actúan como catalizadores en reacciones lipolíticas (catabolismo
de grasas y aceites) a través de la hidrólisis de los enlaces éster de acilgliceroles.
Son activas únicamente adsorbidas sobre una interfase oleo-acuosa, “activación interfacial.”
2. Hueco oxianiónico: estabiliza el intermedio tetraédrico formado durante la catálisis enzimática a través de
la formación de puentes de hidrógeno.
1
LIPASAS E.C. 3.1.1.1
Lipasas no específicas.- hidrolizan todas las posiciones del triglicérido: Staphilococcus aureus,
Candida rugosa
TIPO DE LIPASA
K. Faber,
Biotransformations in Organic Chemistry, 5th ed, 2004
OH O O
HO OH R1 O O R3
2 2
1 3 O 1 3 O
sn-glicerol sn-Triglicérido
HO H
m
Regla de Kazlauskas L
(J. Org. Chem., 1991, 56, 2656)
Alcoholes secundarios
2
ENANTIÓMERO RECONOCIDO
K. Faber,
Biotransformations in Organic Chemistry, 5th ed, 2004
Secuencia de consenso
cercana de la Ser Asp/Glu Hueco
Lipasa His catalítica
nucleofila Catalítico Oxianiónico
Gly-X-Ser-X-Gly
-Gly85-His86-Ser87-Gln88-
CVL, PCL -His285-Leu286- -Asp263- -Gly16-Leu17-
Gly89-
-Gly142-His143-Ser144-
RML -His257-Leu258- -Asp203- -Gly81-Ser82-
Leu145-Gly146-
-Gly144-His145-Ser146-
HLL -His258-Leu259-
His258 Leu259 Asp201
-Asp201- -Gly82-Ser83-
Gly82 Ser83
L 147 Gl 148
Leu147-Gly148-
-Gly143-His144-Ser145-
PcamL -His259-Ile260- -Asp199- -Gly83-Ser84-
Leu146-Gly147-
-Gly143-His144-Ser145-
ROL -His257-Leu258- -Asp204- -Gly82-Thr83-
Leu146-Gly147-
-Gly150-His151-Ser152-
PPL -His263-Leu264- -Asp176- -Gly76-Phe77-
Leu153-Gly154-
Thr103-Trp104-Ser105-
CAL-B -His224-Ala225- -Asp187- -Gly39-Thr40-
Gln106-Gly107-
-Gly207-Glu208-Ser209-
CRL (lip1) -His449-Ser450-c -Glu341- -Gly123-Gly124-
Ala210-Gly211-
-Gly215-Glu216-Ser217-
GCL (lip II) -His463-Gly464- -Glu354- -Gly131-Ala132-
Ala218-Gly219-
O
O
H H
N N
N N
H H
NH HN NH HN
His O His O
O O
O O Ser O O H Ser
H O O
N Asp N N H
Asp H N
HN
- O
R2O C O
HN O (Glu)
(Glu) HN O
HN O
R2O INTERMEDIO
O C O O
TETRAÉDRICO #1
R1
HN
R1 HN
HO H2O
C O
R2O O
C O
O
R1 R OH
2
R1
O
O
H
N H
N N
H N
NH HN H
NH HN
His O
His O
O
O
O O H Ser
O O Ser
O
Asp N N H O
Asp H N N
- HN O
HO C O
(Glu) HN
HN O (Glu) O
HN O C O
O R1 H O
O
HN
R1
INTERMEDIO H HN
3
3. Tapadera:
Elemento estructural diferenciador de las lipasas.
Formada por una porción helicoidal anfipática.
Se coloca sobre el centro activo de la enzima cuando está inactiva.
Existen dos conformaciones:
Conformación cerrada o inactiva (medio acuoso)
Estructura 3D de la RML Conformación abierta (en interfase o medio orgánico)
Excepciones:
Lipasas de Pseudomonas glumae, Pseudomonas
aeruginosa y Candida antarctica B, fosfolipasas
pancreáticas A2, y la cutinasa de Fusarium solani
carecen de tapadera.
Lipasas pancreáticas de nutria y de cobaya:
tapadera sin activación interfacial.
Lipasa de Staphylococcus hycius: activación
interfacial sólo con algunos sustratos.
Triada Catalítica:
HO
m H OH
H
m
Alcoholes primarios
L
L
4
Reconocimiento de ácidos quirales
Clasificación de las lipasas según la geometría del centro activo (Pleiss, Chem. Phys. Lipids, 1998, 93, 67):
A B C
Representación del centro activo de las lipasas de Rhizomucor miehei y Candida CRL: 22 Å de largo con un diámetro
rugosa. (A) Orientación lateral donde los residuos se encuentran perpendiculares a la
figura y se indican por una línea continua; (B) Forma del centro activo desde una visión de aproximadamente 4 Å.
frontal; (C) Forma del centro activo visto desde arriba.
5
Phe296
Phe296
Phe296
=E
6
Reacciones catalizadas por lipasas
HIDRÓLISIS DE ESTERES
O O
lipasa, H2O SÍNTESIS DE AMIDAS
R1 OR2 + HOR2
R1 OH O O
lipasa
+ H2NR3 + HOR2
ESTERIFICACIÓN R1 OR2 R1 NHR3
O O
lipasa
+ HOR2 SÍNTESIS DE TIOESTERES
R1 OH R1 OR2
O O
TRANSESTERIFICACIÓN lipasa
+ HSR3 + HOR2
((ALCOHOLISIS)) R1 OR2 R1 SR3
O O
lipasa
+ HOR3 + HOR2 SÍNTESIS DE PEROXIESTERES
R1 OR2 R1 OR3
O O
lipasa
ACIDOLISIS + HOOR3 + HOR2
O O O O R1 OR2 R1 OOR3
lipasa
R1 OR2 + R3 OH R3 OR2
+
R1 OH
INTERESTERIFICACIÓN
O O O O
lipasa
R1 OR2 + R3 OR4 R1 OR4
+
R3 OR2
R1 O O
lipasa, H2O R1 R2
R2 C O R3 R2 C OH + R3 C O R3
H H H
Hidrólisis de ésteres racémicos con el estereocentro en el grupo ácido (sustratos tipo II).
R1 R3 R3
lipasa, H2O R1 R2
O OH + R C C O
R2 C C R2 C C 1
O O H O
H H
R2 R3
lipasa HO R3 R2 R1
OH OH R C C O
R1 C C R1 C C + 1
H O O O
disolv.orgánico H H
APLICACIONES
lipasa de O
Rh. miehei
OH R
3
O Lipozyme IM20
OH O R3 HO
R1 R2
+ 4 1 2 + 1 2 +
O R disolvente orgánico R R R R R4
(R,S) (S) (R)
R1= Ph-, Bn-, 1-naftil, 2-naftil.
R2= Me-, Et-, Pr-.
R3= Me-, Et-, Pr-, Ph-, O
4
R = H-,
H Me-
M R4
lipasa de O
Rh. miehei
OH Me O OH O Me
Lipozyme IM20
Ph Me
+ i
+
O H Pr2O Ph Me Ph Me
(R,S) (S) (R)
REACCIÓN TEST
A. R. Alcántara y cols I. E. De Fuentes
Chem. Phys. Lipids, 1998, 93, 169 Tesis Doctoral, UCM, 2002
7
FACTORES QUE DEBEN CONTROLARSE
1. VARIABLES CONTÍNUAS
1
R OH DISOLVENTE
R2 (logP)
RELACIÓN AW
MOLAR
O
TEMPERATURA
R3 Nu
AGITACIÓN
2. VARIABLES DISCRETAS
ESTRUCTURA DEL ALCOHOL, DEL DONADOR DE
ACILO, PUREZA DE LA PREPARACIÓN ENZIMÁTICA,
NATURALEZA DEL SOPORTE
ESTRUCTURA DE LA Lip1
CERRADA ABIERTA
TAPADERA
8
INHIBICIÓN DE LA PRODUCCIÓN DE
LIPASAS POR EFECTO DEL GLICEROL
Candida rugosa:
fermentación con aceite
de oliva
Isoformas
Inductor/ Fuente
Lipasa Procedencia
de Carbono Lip1 Lip2 Lip3
Sigma Comercial ¿? 73 ± 5 8 ± 1 19 ± 2
Roche Comercial ¿? 66 ± 5 13 ± 2 21 ± 2
UAB-II Fed-Batch Q baja Ácido Oleico --- 56 ± 5 44 ± 5
UAB-III Fed-batch Q baja Ácido Oleico --- 56 ± 5 44 ± 5
UAB-IV Fed-batch Q alta Ácido Oleico 33 ± 3 40 ± 4 27 ± 3
9
ELECTROFORESIS SDS
SDS--PAGE
ANÁLISIS DENSITOMÉTRICO
Lip1
1.00
Lip1
0.80 0.80
Lip3
Lip3
Proporción (%)
Proporción (%)
0.60 0.60
60.1 58.4 53.3 48.6 45.9 60.1 58.4 53.3 48.6 45.9
0.00 0.00
Peso Molecular (kDa) Peso Molecular (kDa)
10
APLICACIÓN PRÁCTICA
Los beta-bloqueantes constituyen el grupo más importante dentro de los fármacos adrenérgicos.
utilizados en el tratamiento de: hipertensión
arritmias
angina de pecho
ciertos tipos de ansiedad.
Una familia de estos compuestos, muy vendidos, presentan estructura de ariloxiamino-propanol,
v.g.:Sumial, atenolol etc.
OH H
O
N
Ar
con un centro estereogénico, de forma que la actividad biológica en los tratamientos mencionados
reside fundamentalmente en el enantiómero S presentando el isómero R efectos secundarios
indeseables en algunas ocasiones.
Dentro de este grupo de fármacos, el propranolol (1-isopropilamino-3(1-naftoxi)-2-
propanol) se considera el compuesto de referencia. Se ha comprobado que la actividad beta-
bloqueante de su isómero S es 100 veces superior a la del isómero R. Es más, el isómero R presenta
un efecto secundario como contraceptivo masculino.
OBJETIVO:
OH H Optimizar un proceso quimioenzimático de obtención
O N de sintones quirales para obtener estos compuestos
Ar
enantioméricamente puros.
METODOLOGÍA:
Ar nombre
1.- Síntesis de los intermedios racémicos de estructura de
halohidrina.
propranolol O
1) OH
Cl ,
N O Cl
Ar-OH Ar
2) HCl (1h, 0-5ºC)
atenolol
2.- Resolución cinética de los racematos empleando
una lipasa OH
R2 O
pindolol O (R) Cl
OH Ar
O R1
N O Cl R-1
H Ar lipasa +
1 disolvente orgánico O
Ar = 1-naftilo,1a
oxprenolol O R1
2-naftilo,1b
o-tolilo, 1c O (S) Cl
O Ar
p-tolilo, 1d
S-2
I. Borreguero.Tesis Doctoral, UCM, 1999. R1 = Me, Et, Pr, -CH2Cl, -(CH2)10CH3
R2 = H, Me
O N OH O
Ar-OH + Cl O Cl + Ar O
a Ar
b
HCl (0-5ºC)
(0 5ºC)
11
2.- Resolución cinética de los racematos de 1 empleando una lipasa
O
O
1
OH OH O R
O +
O Cl O Cl O Cl
(R) (S)
lipasa
1 disolv. orgánico R-1 S-2
Conversion (%)
60
CONDICIONES ESTANDAR: SUSTRATO 1a,
AGENTE ACILANTE = ACETATO DE VINILO 50
(R1 = Me, R2 = H), RELACIÓN MOLAR 1/3, Lipozyme IM20
DISOLVENTE = iso-OCTANO, 40
HLL
T = 30ºC PPL
30
X Pto.1 ee1 ee3
CAT. mg t (h) Pto.1 Eb EFc
(%) 3 (%) (%)
20
R-(-
HLL 106 547 30 S-(+) >99 32 >100 0.73
) 10
R-(-
PPL 106 817 8 S-(+) 65 3 5 0.36
) 0
R-(- 0 100 200 300 400 500 600 700 800 900
IM20 15 340 53 S-(+) >99 78 >100 0.71 Tiempo (h)
)
O
O
OH OH O
O O Cl +
O Cl (R) O Cl
(S)
Lipozyme IM20
1a isooctano R-1a S-2a
T = 37ºC, t = 4 h
conversión = 55%, ee1 > 99%, E = 27
OH OH H
O Cl O N
(R) (S)
NH2 PROPRANOLOL
R-1a
CH3 CH3
O O
N N NH
NH
H 3C N
N N NH 2 N NH 2
HO O
O O O
H H H H
H H H H
OH OH OH OH
Vinyl acetate
Candida antarct ica lipase
99% yield
12
Reacciones catalizadas por lipasas
HIDRÓLISIS DE ESTERES
O O
lipasa, H2O SÍNTESIS DE AMIDAS
R1 OR2 + HOR2
R1 OH O O
lipasa
+ H2NR3 + HOR2
ESTERIFICACIÓN R1 OR2 R1 NHR3
O O
lipasa
+ HOR2 SÍNTESIS DE TIOESTERES
R1 OH R1 OR2
O O
TRANSESTERIFICACIÓN lipasa
+ HSR3 + HOR2
((ALCOHOLISIS)) R1 OR2 R1 SR3
O O
lipasa
+ HOR3 + HOR2 SÍNTESIS DE PEROXIESTERES
R1 OR2 R1 OR3
O O
lipasa
ACIDOLISIS + HOOR3 + HOR2
O O O O R1 OR2 R1 OOR3
lipasa
R1 OR2 + R3 OH R3 OR2
+
R1 OH
INTERESTERIFICACIÓN
O O O O
lipasa
R1 OR2 + R3 OR4 R1 OR4
+
R3 OR2
Proceso regioselectivo
13
14
Reconocimiento de alcoholes quirales
R2
OH O O
HO OH R1 O O R3
2 2
1 3 O 1 3 O
sn-glicerol sn-Triglicérido
HO H
m
Regla de Kazlauskas L
(J. Org. Chem., 1991, 56, 2656)
Alcoholes secundarios
F F
F F
E>100
O
O
OH O R'
OH CALB-B O
R'COOR" R' CAL-B
+
10eq H 2 O N
N N N
Organic solvent Org. solvent R
R R
R
(3R,4S) (3S,4R)
O O
N
H
(-) Paroxetine
15
Chemoenzymatic synthesis of the analgesic U-50,488
CH3
O
1.- CAL-B, EtOAc NH NHcBZ
NH 2 NH 2
+ +
N N N
N
2- Cbz-Cl
(1S,2S) trans
Trans
(1R,2R) trans
CH2 Cl
O
NH Cl
N
U-50,488
16
Lipase-catalyzed aminolysis & ammonolysis
Regioselective process
Chemoselective process
17
Lipase-catalyzed aminolysis & ammonolysis: Resolution of chiral amines
Application to the synthesis of both enantiomers of Amphetamines
The synthesis is performed with ethyl acetate as acyl donor and as solvent
Trans- antidepresant
Gonzalez-sabin et al. Terahedron:Asymmetry 15,481-488(2004)
Azamacrocycles
18
Lipase-catalyzed aminolysis & ammonolysis: Resolution of diamines
E= 170
19
RESOLUCIÓN DE ÉSTERES
RACÉMICOS
O O
lipasa
O H2N NH
(R,S) R oS
O
(R,S)
R
NH2
H
CH3
O NH2
20
21
KR OPTIMISATION
CHANGING FROM VYNIL ACETATE TO VINYL BUTYRATE:
Better work up (better separation) but the oposite enantiopreference was observed
O
OH O OH
TEMPERATURE EFFECTS:
O R
Lipase
+ R O
THF +
O O O
Hoyos, P.; Hernandez, M.; Sinisterra, J. V.; Alcantara, A. R., Dynamic kinetic resolution of benzoins by lipase-metal combo
catalysis. Journal of Organic Chemistry 2006, 71, (20), 7632-7637.
64
OH
Ar
Ar
O O
?
Ar DYNAMIC KINETIC RESOLUTION
Ar Max. Theoretical yield = 50%
O O
OH O R
Ar Ar 100%
Ar Ar
( R) ( S)
O O
65
Activation
by temperature
22
Sequential Dynamic Kinetic Resolution
1. Vinyl butyrate evaporation
2. Add: thrifluoroethyl butyrate New enzyme
OH
Shvo’s catalyst addition
Lipase
O
100
O
KR
90
O 90
step 1
80
O 80 step 3
OH
+ O step 2 70
70
Concentration ((mM)
O
( )
O
Conversion
C i 92%
60
60
O
DKR CF 3 50
40
O
t = 48h
40
O 30
30
20
O 20
10 10
0 0
Hoyos, et al. Journal of Organic Chemistry
0 6 12 18 24 30 36 42
2006, 71, (20), 7632-7637. t (h)
68
23
De castro et al. Tetrahedron: Asymmetry 1997,8, pp 857-8
HIDRÓLISIS DE DIHIDROPIRIDINAS
PROQUIRALES EMPLEANDO LA LIPASA B DE C.
antarctica
Z Z
O O O O O O O 8 X = H, Z = H
C. antarctica 9 X = H, Z = NO
2
HO O O 20 X = CH
2OCH3, Z = H
O O O O
21 X = CH
2OCH3, Z = NO
N N Z = H, NO2
X X
R
24