Materia 1S
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CARRERA DE MEDICINA
ASIGNATURA: BIOQUÍMICA I
INTRODUCCIÓN
OBJETIVO DE LA BIOQUÍMICA
La Bioquímica es una ciencia que, basada en múltiples observaciones e investigaciones que han
avanzado junto con el desarrollo de la humanidad y la medicina, a través de la historia, ha dado
lugar a conclusiones que han generado el conocimiento respecto de las bases moleculares que
subyacen a los procesos biológicos, tanto en la salud como en la enfermedad.
ORIGEN DE LA VIDA
“Hace menos de mil millones de años, tras la formación de la Tierra hace unos 4600 millones de
años, comenzaron a aparecer las formas más primitivas de vida, los microorganismos
unicelulares. • En la Tierra primitiva tuvo lugar un proceso de evolución química gradual, que
condujo progresivamente desde los sencillos gases existentes hasta la generación de vida
primordial, en etapas de complejidad creciente, no de forma repentina como defendían los
partidarios de la generación espontánea. No es descartable el aporte extraterrestre de moléculas
precursoras. • En experiencias de laboratorio, intentando reproducir las condiciones prebióticas,
se han obtenido numerosas biomoléculas, algunas de ellas bastantes complejas, así como se han
observado diversos modelos de autoorganización en entidades de tipo protocelular. En la
evolución prebiótica parece que jugaron importantes papeles los minerales y las rocas, así como
las moléculas de ARN para conformar las vías informativas y replicativas. • Los primeros
organismos primitivos eran anaerobios y para replicarse tendrían que captar del entorno la
materia y energía necesarias. El perfeccionamiento evolutivo de las vías metabólicas condujo
hace más de 3000 millones de años a la aparición de los organismos fotosintéticos, capaces de
usar H2S como dador de electrones. • En el curso de la evolución biológica, tras unos quinientos
millones de años, algunos organismos fotosintéticos dieron un salto evolutivo, al poder realizar
la fotólisis del agua. La consecuencia era el enriquecimiento de la atmósfera en oxígeno,
oxidante y tóxico. Tras, aproximadamente, otros quinientos millones de años, hace unos dos mil
millones de años, se alcanzó la solución evolutiva de los seres aerobios con el desarrollo de
cadenas respiratorias consumidoras del oxígeno y productoras de energía. • La endosimbiosis de
mitocondrias y cloroplastos, cuyos precursores fueron células procarióticas, permitió que hace
unos 1500 millones de años apareciesen los primeros organismos eucarióticos. • De acuerdo con
las ideas de Darwin, la microevolución, es decir, la suma de procesos tales como mutaciones,
duplicaciones génicas, transferencia de material genético, etcétera, junto con otros factores,
entre los que destaca la selección natural, es la responsable de la macroevolución o
cladogénesis. • Las técnicas bioinformáticas y de Biología Molecular de análisis de las
secuencias y estructuras de las macromoléculas permiten hacer estudios comparativos entre
moléculas homólogas de los diferentes linajes, remontándose a la existencia de ancestros
comunes y deduciendo los mecanismos de aparición de las nuevas variantes genéticas. Todo
ello, junto a los registros paleontológicos, permite la elaboración de los dendrogramas, o árboles
genealógicos evolutivos. • Los conocimientos existentes, aplicados a aspectos concretos de
grandes vías metabólicas o de procesos bioquímicos individuales, nos están comenzando a
proporcionar una información valiosísima sobre el origen de los variados, sofisticados y
precisos mecanismos de regulación y control que encontramos a lo largo de toda la gran
variedad de los seres vivos”
(Lozano, Teruel, José Antonio, et al. Bioquímica y biología molecular: para ciencias de la
salud (3a. ed.), McGraw-Hill España, 2005. ProQuest Ebook Central,
http://ebookcentral.proquest.com/lib/unachlibsp/detail.action?docID=3195243.
Created from unachlibsp on 2018-04-02 14:11:08.)
PROBLEMAS
CARRERA DE MEDICINA
ASIGNATURA: BIOQUÍMICA I
LA CÉLULA
10-20% proteínas
2-3% lípidos
1% carbohidratos
COMPOSICIÓN DE LA CÉLULA
LÍPIDOS IONES
PROTEÍNAS
CARBOHIDRATOS
AGUA
MACROMOLÉCULAS BIOLÓGICAS
Ácidos nucleicos: Los monómeros o precursores son los nucleótidos. El DNA y RNA
son ácidos nucleicos.
Lípidos: Son ésteres de ácidos grasos con diversos alcoholes. Ej: triglicéridos,
esfingomielina, colesterol, glucolípidos, gangliósidos.
GRUPOS FUNCIONALES
Son las partes de las macromoléculas que les confieren características funcionales, es
decir las propiedades de reacción. Ej: El grupo carboxilo o amino de los aminoácidos,
la cadena lateral de los aminoácidos, el grupo prostético de las enzimas, etc.
Enlaces covalentes.- Son uniones fuertes que se dan entre las unidades que conforman
las macromoléculas. Por ejemplo, los enlaces peptídicos que forman la estructura
primaria de las proteínas.
Enlaces disulfuro.- Son un tipo de unión covalente, que se da entre los grupos –SH de
dos residuos de cisteína. Estabilizan la estructura terciaria de las proteínas.
Interacciones de Van der Waals.- Se da entre átomos muy cercanos, por fluctuación
de cargas, con producción de dipolos. Participa en la estructura secundaria de las
proteínas.
ISÓMEROS
Son moléculas que poseen la misma fórmula global, pero que difieren en la orientación
de los átomos o grupos de átomos. Ejemplo: Isómeros cis-trans de los ácidos grasos,
isómeros D o L de los carbohidratos.
ESTRUCTURA TRIDIMENSIONAL
ORGANIZACIÓN SUPRAMOLECULAR
Bibliografía:
- Bioquímica de Harper
- Biología celular y molecular de Robertis
PROBLEMAS
ASIGNATURA DE BIOQÍMICA I
UNIDAD No. 6
MACROMOLÉCULAS INFORMACIONALES: ÁCIDOS NUCLEICOS
Los ácidos nucleicos son moléculas biológicas formadas por cadenas de polinucleótidos
en los cuales radica la base bioquímica de la herencia.
PRECURSORES
NOMENCLATURA
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UNIVERSIDAD NACIONAL DE CHIMBORAZO
FACULTAD DE CIENCIAS DE LA SALUD
CARRERA DE MEDICINA
Síntesis de proteínas
Síntesis de ácidos nucleicos
Cascada reguladoras
Vías intra y extracelulares
Los nucleósidos trifosfatados, proveen 7 Kcal/mol al hidrolizarse
Entre las propiedades de los nucleótidos se señala que éstos absorben la luz ultravioleta,
la cual es un potente mutágeno.
El DNA está formado por cadenas de polinucleótidos. Las unidades de monómeros que
conforman estas cadenas son los cuatro desoxinucleótidos: desoxiadenilato,
desoxiguanilato, desoxicitidilato, timidilato.
Los nucleótidos de cada cadena se unen entre sí mediante enlaces fosfodiéster en una
secuencia específica.
2
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FACULTAD DE CIENCIAS DE LA SALUD
CARRERA DE MEDICINA
interior (grupos hidrófobos de las bases), de tal forma que el apareamiento entre ellas
se da de esta forma:
Las dos cadenas de o hebras son complementarias y antiparalelas, es decir que corren
en sentido opuesto. Una cadena va del extremo 3’ (-OH o hidroxilo) al extremo 5’ (-P o
fosfato), esta es la cadena discontinua o retrógrada. La otra hebra va en sentido 5’ a 3’,
siendo la cadena continua o directriz. La información genética se encuentra en la
cadena patrón o templete. Esta es la cadena que se transcribe durante la síntesis de
RNA. La otra hebra o cadena de codificación, coincide con la cadena del RNA
transcrito que va a codificar las cadenas de las proteínas.
En la parte exterior de las cadenas se ubican los grupos fosfato de cargas negativas y los
azúcares polares que le confieren un carácter polianiónico a la molécula.
Las hendiduras entre los giros de las cadenas, que permiten a las proteínas interactuar en
forma específica con átomos que quedan expuestos, se denominan surcos mayores y
menores.
3
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https://es.khanacademy.org/science/biology/gene-expression-central-
dogma/transcription-of-dna-into-rna/a/overview-of-transcription
DNA RNA
El azúcar es una D-desoxirribosa El azúcar es una D-ribosa
Contiene timina Contiene uracilo en lugar de timina
Doble cadena helicoidal Una sola cadena, aunque puede doblarse
sobre sí mismo
El contenido de G es igual a C y el de A El contenido de G no es igual a C
es igual a T, porque las bases son necesariamente, ni el de A no es igual al
complementarias en las dos cadenas de U, porque posee una sola cadena
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CARRERA DE MEDICINA
El RNA mensajero que se sintetiza a partir del molde de DNA, sirve como molde para
la síntesis de proteínas. El RNA transfiere la información del DNA hasta los ribosomas,
donde radica la “maquinaria” de síntesis de proteínas.
TIPOS DE RNA
NUCLEASAS
REFERENCIAS
- Bioquímica de Harper
- Bioquímica de Laguna
PREGUNTAS
1. ¿Cuál es la importancia biomédica de los ácidos nucleicos?
2. ¿Cuáles son los 4 desoxinucleótidos del DNA?
3. Describa el modelo de cadena de doble hélice del DNA?
4. ¿Qué son los surcos mayores y menores del DNA y para qué sirven?
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CARRERA DE MEDICINA
6
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ASIGNATURA DE BIOQUÍMICA I
UNIDAD No.3
AMINOÁCIDOS, PÉPTIDOS Y PROTEÍNAS
LAS PROTEÍNAS
IMPORTANCIA BIOMÉDICA
Estructurales
Cinética y
Otros como catalítica
contracción muscular
FUNCIONES DE
LAS PROTEÍNAS
Señalamiento
Transporte
Acarreadores de
vitaminas, oxígeno
y bióxido de
carbono, otros
“La enfermedad por priones puede ser de causa genética, infecciosa o esporádica. En los
seres humanos, se denomina enfermedad de Creutzfeldt-Jakob, en las cabras y ovejas se
conoce como Scrapie, y en las vacas se llama encefalopatía espongiforme bovina
(‘enfermedad de las vacas locas’). Los cambios neurales consisten en la deposición de
proteínas insolubles compuestas de hojas ß y puentes de hidrógeno continuos, que
llevan a la destrucción neuronal” (Bioquímica de Harper).
1
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FACULTAD DE CIENCIAS DE LA SALUD
CARRERA DE MEDICINA
CLASIFICACIÓN Y PROPIEDADES
“Proteínas fibrosas: las proteínas fibrosas tienen una estructura alargada, formada
por largos filamentos de proteínas, de forma cilíndrica. No son solubles en agua. Un
ejemplo de proteína fibrosa es el colágeno.
Proteínas globulares: estas proteínas tienen una naturaleza más o menos esférica.
Debido a su distribución de aminoácidos (hidrófobo en su interior e hidrófilo en su
exterior) que son muy solubles en las soluciones acuosas. La mioglobina es un claro
ejemplo de las proteínas globulares.
Proteínas de membrana: son proteínas que se encuentran en asociación con las
membranas lipídicas. Esas proteínas de membrana que están embebidas en la
bicapa lipídica, poseen grandes aminoácidos hidrófobos que interactúan con el
entorno no polar de la bicapa interior. Las proteínas de membrana no son solubles en
soluciones acuosas. Un ejemplo de proteína de membrana es la rodopsina.
………….” https://proteinas.org.es/clasificacion-proteinas
ESTRUCTURA PRIMARIA
Características
ESTRUCTURA SECUNDARIA
Enlaces
Los enlaces peptídicos de los polipéptidos, por ser átomos coplanares, poseen una
rotación restringida. Las rotaciones se dan entre Cα – Co (ángulo psi ψ) y Cα –N
(ángulo phi ϕ).
Los tipos de estructura secundaria responden al carácter parcial de doble enlace de las
uniones peptídicas y del tamaño, forma y característica de las cadenas laterales (R).
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Hélices α
CONFORMACIONES
Hojas ß plegadas
REGULARES
ESTRUCTURA Plegamientos o
SECUNDARIA dobleces ß
CONFORMACIONES
Asas o espirales
IRREGULARES
HELICES α
Las hélices se forman al girar el esqueleto peptídico en la misma proporción sobre cada
carbono α. Los residuos aminoacilos que más comúnmente participan en cada vuelta de
una hélice α son: Ala, Glu, Leu, Met.
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http://www.biologia.edu.ar/macromoleculas/figacro/ahelix1.gif
HOJAS ß
Hojas ß Hojas ß
paralelas Los grupos amino y antiparalelas
carboxilo terminales de Los segmentos amino y
la estructura carboxilo terminales
secundaria alineados están alternados
hacia el mismo lado
Los puentes de
Los puentes de
hidrógeno son
hidrógeno no son
prácticamente
perpendiculares al
perpendiculares a las
esqueleto polipeptídico
cadenas polipeptídicas
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CARRERA DE MEDICINA
https://www.manualmoderno.com/apoyos_electronicos/9786074482911/imagenes/cap_8/34.jpg
DOBLECES ß
https://i2.wp.com/upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/b/ba/Beta_hairpin.png
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CARRERA DE MEDICINA
REGIONES EN ASA
Regiones en asa
https://i2.wp.com/upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/6/6f/Calmodulin.png
PARTES DESORDENADAS
Existen zonas desordenadas en las cadenas peptídicas, que tienen gran importancia
biológica, por ejemplo en las enzimas, donde estas zonas se ordenan una vez que se han
unido a los ligandos.
β–α-β
Meandros, Horquillas ß (hojas ß conectadas por dobleces ß o asas)
Hojas ß no secuenciales llamadas guardas grecas
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CARRERA DE MEDICINA
http://www.biorom.uma.es/contenido/av_biomo/FigT3/Fig3_17.gif
La estructura terciaria comprende las relaciones entre los dominios estructurales y los
residuos en posiciones distantes. Los dominios son unidades compactas relativamente
independientes, pero conectadas por el esqueleto peptídico que realizan funciones
específicas, ya que constituyen sitios de unión de ligandos. Los aminoácidos
hidrófobos se ubican hacia el interior de las moléculas, quedando empaquetados en el
interior de la molécula, mientras los aminoácidos hidrófilos se ubican hacia el exterior
de la misma, tal como ocurre en las proteínas globulares.
http://revistapesquisa.fapesp.br/wp-content/uploads/2015/11/066-069_Smolbnet_esp501.jpg
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CARRERA DE MEDICINA
Dímero (dos
subunidades o
protómeros)
Heterodímeros Proteínas
Heterotetrámeros
(subunidades o
con Tetrámero (cuatro
subunidades o
protómeros estructura protómeros)
diferentes)
cuaternaria
Homodímeros
Homotetrámeros
(subunidades o
protómeros
iguales)
Proteínas oligoméricas:
Cadenas polipeptídicas
múltiples
Complejo proteico:
Grupo de dos o más
proteínas
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CARRERA DE MEDICINA
MOLÉCULA DE HEMOGLOBINA
https://encrypted-tbn0.gstatic.com/images?q=tbn:ANd9GcSSmPatcCdaFcpV3VuYiOa7_KSzwL-
nBQwchyz2cugPU9TtwyOj
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FACULTAD DE CIENCIAS DE LA SALUD
CARRERA DE MEDICINA
Referencias
Bioquímica de Harper
Bioquímica de Laguna
PREGUNTAS
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CARRERA DE MEDICINA
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CARRERA DE MEDICINA
ASIGNATURA: BIOQUÍMICA I
LA CÉLULA
La teoría celular.- La palabra célula proviene del griego kytos y del latín cella, que
significa espacio vacío. Este nombre fue introducido por Robert Hooke en 1665. En
1674 Leewenhoek descubrió la existencia de células libres, a diferencia de las células
“empotradas” descritas por Hooke.
“La célula es la unidad morfológica y fisiológica en la estructura de los seres vivos, así
como el átomo lo es en la estructura química” (De Robertis)
Los organismos o células procariotas comprenden las bacterias, algunas algas azules
y los micoplasmas. Se comprende que desde el punto de vista evolutivo, las células
procariotas son los precursores de las células eucarióticas. Las células eucariotas
pueden constituir organismos multicelulares. Los metazoarios, las células vegetales, las
demás algas y los protozoarios son organismos eucariontes.
Las semejanzas existentes entre las células eucarióticas y procarióticas, han permitido
que el estudio de las bacterias, en especial la Escherichia coli, sirvan de fundamento
para el estudio de las células eucariotas.
- Bioquímica de Harper
- Biología celular y molecular de Robertis
PROBLEMAS
CARRERA DE MEDICINA
ASIGNATURA: BIOQUÍMICA I
10-20% proteínas
2-3% lípidos
1% carbohidratos
SALES E IONES
Las sales se encuentran disociadas en iones. Los iones son importantes para conservar la
presión osmótica, como activadores en las reacciones enzimáticas, en el mantenimiento del
equilibrio ácido-base, en la transmisión de los impulsos nervioso y como componentes
estructurales.
BIBLIOGRAFÍA
- Bioquímica de Harper
- Bioquímica de Laguna
PREGUNTAS
CARRERA DE MEDICINA
ASIGNATURA: BIOQUÍMICA I
La molécula de agua está compuesta por un átomo de oxígeno y dos de hidrógeno. Forma la
mayor parte de la célula eucariota y de los seres vivos, y es el medio en el cual se dan todos sus
procesos vitales y reacciones metabólicas, haciendo posible la vida. Es el solvente en el cual se
realizan todas las funciones, lo que es factible gracias a las fuerzas de cohesión entre sus
moléculas y a las características estructurales que éstas tienen.
“El oxígeno se une con el hidrógeno mediante enlaces covalentes formados por dos pares de
electrones. La carga neta de una molécula de agua es cero, pero la distribución de electrones en
la molécula presenta cierto desequilibrio, debido a la diferente electronegatividad del hidrógeno
y del oxígeno, esto hace que la molécula sea eléctricamente asimétrica y se cree un dipolo
eléctrico”.
(Teijón, Rivera, José María, et al. Bioquímica estructural: conceptos y tests (2a. ed.), Editorial Tébar Flores, 2009.
ProQuest Ebook Central, http://ebookcentral.proquest.com/lib/unachlibsp/detail.action?docID=3194252.
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“La polaridad del enlace O H tiene una consecuencia importante: los dipolos permanentes de
este enlace se atraen entre ellos y la interacción entre el átomo de hidrógeno ligeramente
positivo de una molécula de agua y el átomo de oxígeno ligeramente negativo de otra molécula
de agua produce una atracción dipolo-dipolo denominada enlace de hidrógeno o puente de
hidrógeno”. En el agua líquida las moléculas se encuentran en constante reorganización.
(Teijón, Rivera, José María, et al. Bioquímica estructural: conceptos y tests (2a. ed.), Editorial Tébar Flores, 2009.
ProQuest Ebook Central, http://ebookcentral.proquest.com/lib/unachlibsp/detail.action?docID=3194252.
Created from unachlibsp on 2018-04-11 14:50:32).
El agua es un buen solvente, por ser un dipolo. Las moléculas polares y aquellas que, a
pesar de no ser iones, poseen cargas débiles, se disuelven con gran facilidad en el agua
(moléculas hidrófilas).
Las moléculas apolares (como aquellas que tienen cadenas hidrocarbonadas largas),
interaccionan entre sí para repeler a las moléculas de agua, las cuales rodean a los
compuestos apolares (moléculas hidrófobas), obligándolos a agruparse.
Disociación del agua.- El agua puede disociarse en sus iones y generar soluciones
ácidas o básicas, por lo que el agua se considera una sustancia anfótera:
REFERENCIAS BIBLIOGRÁFICAS
Teijón, Rivera, José María, et al. Bioquímica estructural: conceptos y tests (2a. ed.),
Editorial Tébar Flores, 2009. ProQuest Ebook Central,
http://ebookcentral.proquest.com/lib/unachlibsp/detail.action?docID=3194252.
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https://www.asturnatura.com/bioelementos-biomoleculas-inorganicas/agua.html
Líquido extracelular: 20% del peso corporal. Corresponde el 15% al líquido intersticial y el
5% al plasma sanguíneo.
El agua del espacio intracelular puede ser de dos tipos: Agua ligada (4-5%) y agua libre (95%).
Como se señaló previamente, el agua es un dipolo, lo que permite que se ligue a las proteínas.
FUNCIONES DEL AGUA: Las funciones del agua son las siguientes:
IMPORTANCIA BIOMÉDICA
REFERENCIAS
- Bioquímica de Harper
- Bioquímica de Laguna
PREGUNTAS
CARRERA DE MEDICINA
ASIGNATURA: BIOQUÍMICA I
EQUILIBRIO ÁCIDO-BASE
CONCEPTOS GENERALES
Una base es una sustancia o compuesto que tiene la capacidad de captar hidrogeniones y dar
lugar a la formación de sales.
Se puede determinar si un ácido o base es fuerte o débil a través del valor de la constante de
equilibrio; cuanto más fuerte es un ácido más abundante es la donación de protones, así mismo
cuanto más fuerte es una base mayor será la absorción de protones.
pág. 1
La pKa es la constante de disociación de un ácido, es decir la constante de equilibrio de la
reacción anterior.
El agua actúa como solvente natural de las células, por lo cual existe un aporte de H+ y OH- que
pueden competir con la reacción de acidez o basicidad que se analice. Esto es debido a la
reacción de autoionización del agua:
H2O(l) H+(ac)+OH−(ac)
Por lo tanto en el agua pura (destilada), en que no existe afectación del equilibrio inicial de
autoionización, hay:
[H +] = [OH−] = 10−7
pK = −log10 (K)
Entonces, una solución ácida es aquella cuyo pH es menor que 7 y el pOH mayor a 7.
Muchas sustancias degradadas en el organismo como producto del metabolismo celular dan
lugar a CO2, el cual constituye el principal producto final del metabolismo intermediario, el cual
se combina con el agua y forma ácido carbónico, H2CO3, en grandes cantidades que son de 20
moles al día o más, lo que equivale a 2 L de HCL concentrado. El ácido carbónico puede
eliminarse fácilmente en forma de CO2, a través de la respiración, lo que contribuye a mantener
pág. 2
el equilibrio ácido-base. Existen otros ácidos fijos, no volátiles, que son producidos en el
metabolismo, tales como el ácido úrico, el ácido fosfórico y el ácido β-hidroxibutírico; los H+
provenientes de estos ácidos son neutralizados por el bicarbonato HCO3-, formándose ácido
carbónico y degradándose finalmente en CO2 y H2O. Esta reacción causa una disminución de la
cantidad de HCO3- disponible. Como consecuencia disminuye la capacidad de amortiguación de
la célula; esta capacidad amortiguadora es de 15 mEq por kilogramo de peso corporal. La
“reserva alcalina” se refiere a la cantidad de bicarbonato disponible. (Laguna, Piña, 2007).
Los amortiguadores son todas las sustancias capaces de fijar o liberar H+.
H Hb = H+ + Hb +
H Prot = H+ + Prot -
H2PO4- = H+ + HPO42-
H2CO3 = H+ + HCO3-
Hemoglobina del glóbulo rojo, que es cuantitativamente uno de los amortiguadores más
importantes de la sangre.
Proteínas plasmáticas y celulares
Fosfatos intra y extracelulares (PO42-)
El sistema amortiguador más importante y efectivo del organismo es el integrado por
H2CO3/ HCO3- ; esto se da porque en el organismo la cantidad de H2CO3 es casi
ilimitada, tomando en cuenta que el mismo proviene de la hidratación del CO2 que se
forma como resultado del metabolismo celular. La condición de que uno de los pares de
este sistema, el H2CO3 se forme a partir de un gas (CO2), hace más adaptable el sistema
amortiguador a diferentes eventos que alteren el pH. En el caso de este sistema de
amortiguación, si se agrega hidrogeniones (H+) a la solución se forma más ácido
carbónico (ya que el bicarbonato capta hidrogeniones), el cual se degrada en agua y
CO2, siendo este último excretado por los pulmones; si se agrega OH-, se disocia el gas
carbónico y los H+ se unen al OH-,, formándose agua y bicarbonato. (Laguna, Piña,
2007).
pág. 3
donde:
- 6.10 corresponde a la constante de disociación pK, que es la tendencia que tienen los
ácidos, en este caso el gas carbónico a ionizarse.
HCO3- es una base débil, H2CO3 es su ácido conjugado.
- El ácido carbónico (H2CO3) corresponde a: ácido carbónico + CO2
(DuBose, 2012)
donde:
Los aniones totales de las sales amortiguadoras combinables con H+, son el primer nivel de
protección contra una alteración por exceso de acidez. Para calcular la suma de todos los
amortiguadores corporales intra y extracelulares y hasta de los huesos, se lo realiza en base al
pH de la sangre, el valor de CO2 total de la sangre completa o del plasma, y el hematocrito.
(Laguna, Piña, 2007).
Como ya se conoce, los hidrogeniones (H+) se originan del metabolismo. Los ácidos se disocian
(PO4H-, PO42-, SO4H-, SO42-) y los hidrogeniones son rápidamente neutralizados y excretados
por los riñones. Existen ácidos que se acumulan como el ácido pirúvico y el ácido láctico,
produciendo alteraciones fisiológicas. Las sales acidificantes como el cloruro de amonio
(NH4Cl) o el CaCl2 adicionan HCl al organismo disminuyendo el pH (Laguna, Piña, 2007). Las
frutas suministran sales, que dan aniones (bases débiles) que absorben protones y dan como
resultado NaHCO3, KHCO3 y CO2. Los pulmones excretan CO2.
Este sistema se ejemplifica claramente por el intercambio de iones entre el glóbulo rojo y el
plasma. Cuando aumenta el CO2 en el plasma y se combina con el agua, originando ácido
carbónico H2CO3 , aumenta la acidez; la anhidrasa carbónica de los glóbulos rojos cataliza la
unión entre el CO2 y el H2O, por lo cual el ácido carbónico se acumula y se disocia en H+ y
HCO3-; por su efecto amortiguador las proteínas captan los H+, mientras el HCO3- se difunde
hacia el exterior del glóbulo rojo, intercambiándose por una cantidad igual de Cl- que ingresan y
mantienen la neutralidad eléctrica. Las moléculas de HCO3- que salen al plasma aumentan la
alcalinidad del mismo y contrarrestan la mayor acidez causada por el ascenso de H2CO3,
originada a su vez por el alza inicial de la tensión de CO2 en el plasma.
pág. 4
organismo depende de la liberación de cationes óseos y musculares a cambio del ingreso de H +;
en otras circunstancias, a cambio del Na+ que penetra a las células del hueso y los músculos,
salen hidrogeniones H+ para combinarse con los abundantes iones de HCO3- extracelulares; el
H2CO3 generado se elimina como CO2. En forma opuesta, cuando existe un exceso de H+, éste
es introducido a las células a cambio de Na+, el cual sale de ellas y es equilibrado con el HCO3-
que proviene del H2CO3-.
En la regulación del pH a partir de la respiración, participan factores fisiológicos como son los
volúmenes y frecuencia de la respiración, lo que influye en el transporte de oxígeno en la
sangre, el efecto amortiguador de la hemoglobina y la excreción de ácido carbónico, en forma
de CO2, a través de los pulmones.
Los ácidos fijos, es decir los H+ que se producen en el metabolismo son cerca de 100 mEq
diarios; el riñón los elimina al mismo tiempo que reabsorbe HCO3-, recobrando la reserva
alcalina para preservar la capacidad amortiguadora del organismo. (Laguna, Piña, 2007)
pág. 5
Es decir que los riñones regulan la concentración de HCO3- plasmático mediante tres acciones:
1) Reabsorción de HCO3- filtrado, 2) formación de ácido valorable y 3) eliminación de NH4 por
la orina. Los riñones excretan 4000 mmol de HCO3- diariamente, para recuperarlo, los túbulos
renales deben secretar, por tanto, 4000 mmol de H+. El 80 a 90% del HCO3- se resorbe en el
túbulo proximal. La nefrona distal resorbe el porcentaje restante, secretando H+ para mantener el
pH del organismo. Los hidrogeniones excretados evitan que se produzca una acumulación de
H+, así como la reducción del pH (acidosis). En la orina esta cantidad de protones se refleja
como ácido valorable (orina ácida) y NH4+ (DuBose, 2012). En estos casos, se excreta fosfato
monovalente alcalino (HPO4-), perdiéndose solo un Na+ para mantener el equilibrio eléctrico. Se
eliminan así los H+, sin pérdidas excesivas de Na+ extracelular y con disminución muy discreta
del HCO3-. (Laguna, Piña, 2007).
En el caso contrario, cuando el pH del plasma se desvía hacia la alcalinidad, se elimina menos
hidrogeniones a nivel renal y el fosfato se excreta como fosfato ácido divalente (HPO42-), con lo
cual se requiere perder dos Na+. Cada hidrogenión retenido a cambio de Na+ eliminado, se une
al HCO3-, formándose H2CO3, el cual finalmente se transforma en H2O + CO2; reduciéndose así
la reserva alcalina, es decir el HCO3- del plasma. (Laguna, Piña, 2007).
Las alteraciones clínicas más frecuentes son los trastornos acidobásicos simples, que son la
acidosis o alcalosis metabólicas y la acidosis o alcalosis respiratorias. En estos casos la
compensación no es completa, por lo cual el pH está alterado. Existen situaciones clínicas más
complejas que producen trastornos acidobásicos mixtos. (DuBose, 2012)
Si la pCO2 aumenta, disminuye la relación por debajo de 20 y hay acidosis. Por el contrario, si
la pCO2 disminuye, aumenta la relación por encima de 20 y hay alcalosis. En estos casos
estamos hablando de acidosis y alcalosis respiratorias, causadas por una alteración en la
respiración y trastorno de la excreción de CO2 en los pulmones. (Laguna, Piña, 2007).
En la clínica, para diagnosticar una posible alteración del pH nos basamos en la medición del
pH de la sangre arterial y el contenido de CO2 en sangre venosa y la presión de CO2 en sangre
arterial (p CO2). (Murray, 2013).
pág. 6
HCO3-); asimismo, los trastornos metabólicos primarios ocasionan mecanismos de
compensación respiratorias. (DuBose, 2012).
REFERENCIAS BIBLIOGRÁFICAS
Murray, R., (2013). Bioquímica de Harper Ilustrada 29ª ed, México, DF: Editorial Manual
Moderno.
Saínz, B.,(2006).Alteraciones del equiibrio ácido-base, Rev Cubana Cir v.45 n.1 Ciudad de
la Habana, versión On-line ISSN 1561-2945. Recuperado de
http://scielo.sld.cu/scielo.php?pid=S0034-
74932006000100011&script=sci_arttext&tlng=pt#cargo
DuBose T D. Jr., (2012). Acidosis y alcalosis. Capítulo 47. En D. L. Longo, A. S. Fauci, y
otros. Harrison Principios de Medicina interna (p. 363-373). México: Mc Graw Hill,
interamericana editores, S.A. de C.V.
Laguna, J., Piña, E., (2007). Bioquímica de Laguna, Sexta Edición. México: Editorial El
Manual Moderno, S.A. de C.V.
Fundamentos de Química, Grado en Física. Equilibrio ácido-base Enero–Mayo, 2011 6 /
49) Constates de equilibrio en reacciones de ácidos y bases. Disponible en
http://www.qfa.uam.es/labqui/presentaciones/Tema8.pdf
PREGUNTAS ESPECÍFICAS:
pág. 7
b) Describir los mecanismos secundarios compensatorios de tipo renal que se generan ante
alteraciones del equilibrio ácido-base respiratorias.
c) Describir los mecanismos compensatorios de tipo respiratorio o renal que se generan
ante alteraciones del equilibrio ácido-base metabólicas.
pág. 8
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CARRERA DE MEDICINA
ASIGNATURA DE BIOQUÍMICA I
UNIDAD No.3
AMINOÁCIDOS, PÉPTIDOS Y PROTEÍNAS
AMINOÁCIDOS
Los aminoácidos son los precursores y unidades estructurales de las proteínas, que
además determinan su función.
IMPORTANCIA BIOMÉDICA
Los defectos genéticos que afectan al metabolismo de los aminoácidos son muy graves,
por ejemplo la fenilcetonuria o las aminoacidurias.
ESTRUCTURA
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http://2.bp.blogspot.com/_FZe5zyi_mHA/SZyDFaz6AmI/AAAAAAAAAFk/CNH3YCYL_6c/s400/For
mula+general+de+los+amino%C3%A1cidos.png
https://image.slidesharecdn.com/5aayproteinas-131022040746-phpapp02/95/5-aa-y-proteinas-12-
638.jpg?cb=1422544344
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Los aminoácidos no absorben la luz visible, son incoloros. Absorben la luz ultravioleta
(< 240 nm). Los aminoácidos que son aromáticos como el triptófano y la tirosina
abosrben la luz de 250-290 nm.
El grupo amino y carboxilo son débilmente ácidos (el grupo carboxilo actúa como un
ácido más fuerte que el grupo amino). Pueden existir otros grupos funcionales
débilmente ácidos como (- OH, - SH), que van a determinar la carga neta del
aminoácido según el pH del medio. La carga neta de los aminoácidos es la suma
algebraica de las cargas positivas y negativas. Por esta razón, los aminoácidos son
anfolitos. El pI (punto isoléctrico) es el pH al cual el aminoácido no posee carga neta.
A los aminoácidos que no poseen cargan neta, es decir que la suma algebraica de cargas
positivas y negativas es 0, se los denomina zwitteriones. Los zwitteriones poseen igual
número de grupos ionizables de cargas opuestas. Todas estas características dependen
de la constante de disociación pK de cada aminoácido.
http://gmein.uib.es/moleculas/aaestructurajmol/aa.gif
3
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Como los aminoácidos son iones, son solubles en solventes polares como el agua o
insolubles en solventes no polares como el benceno. Estas propiedades se extienden a
las estructuras formadas por aminoácidos.
Las reacciones químicas de los aminoácidos están en relación de los grupos funcionales
que los estructuran. La reacción química más importante de los aminoácidos es el
enlace peptídico, enlace covalente que se da entre el grupo α-amino de un aminoácido y
el grupo α-carboxilo de un segundo aminoácido. Al formarse el enlace peptídico se
elimina 1 mol de agua entre los grupos funcionales y requiere del ATP para su
activación. Los enlaces peptídicos solo pueden ser disueltos mediante procesos de
hidrólisis.
CLASIFICACIÓN
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PÉPTIDOS
IMPORTANCIA BIOMÉDICA
ESTRUCTURA Y NOMENCLATURA
El grupo amino del primer aminoácido de un péptido siempre se ubica hacia el extremo
izquierdo y el grupo carboxilo del último aminoácido se coloca en el extremo derecho
de la cadena peptídica.
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Como opción adicional, se puede usar la abreviatura de una letra para representar al
péptido, sin colocar líneas intermedias:
SGYAL
PROPIEDADES
Los péptidos son polielectrolitos. En el enlace peptídico se pierde una carga + y una
carga - , por lo cual carece de carga. Son los grupos terminales y cadenas laterales los
que le confieren las características de ser polielectrolitos a los péptidos. Por estar
constituidos por aminoácidos, también los péptidos dependen del pK y el pH para
adquirir cargas positivas y/o negativas.
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CLASIFICACIÓN
Referencias
Bioquímica de Harper
Bioquímica de Laguna
Problemas:
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ASIGNATURA DE BIOQÍMICA I
UNIDAD No.5
CARBOHIDRATOS Y LÍPIDOS
LÍPIDOS
CLASIFICACIÓN
Lípidos simples: Constituyen ésteres de ácidos grasos con diversos alcoholes. A su vez
se dividen en grasas (ésteres de ácidos grasos con glicerol, una grasa en estado líquido
es un aceite) y ceras (ésteres de ácidos grasos con alcoholes monohídricos de peso
molecular alto); los lípidos neutros o apolares son los que no presentan ninguna carga
ni una polaridad apreciable, tales como los acilgliceroles (glicéridos), ácidos grasos,
esteroles como el colesterol y ésteres de colesterilo, tocoferoles, carotenoides y ceras;
(http://biomodel.uah.es/model2/lip/clasif-polar.htm)
Los triglicéridos, los cuales son triacilgliceroles, son la grasa de almacenamiento del
tejido adiposo. Se componen de tres moléculas de ácidos grasos y una de glicerol. Al
catabolizarse se degradan en sus componentes y los ácidos grasos libres pueden dar
lugar a energía por medio de la vía de la β-oxidación de los ácidos grasos.
Lípidos complejos: Son ésteres de ácidos grasos, que contienen grupos adicionales al
alcohol y al ácido graso. Los más comunes son los fosfolípidos (contienen un residuo de
ácido fosfórico adicional, constituyentes estructurales de la membrana plasmástica);
glucolípidos o glucoesfingolípidos; otros lípidos complejos son los sulfolípidos, los
aminolípidos y lipoproteínas como la VLDL, LDL, IDL y HDL.
Los lípidos polares o anfipáticos, son los que poseen polaridad o incluso carga
eléctrica, tienen características hidrófilas e hidrófobas, como los fosfolípidos,
esfingolípidos.
PROPIEDADES
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FUNCIONES GENERALES
Como fuente directa y eficiente de energía potencial, cuando se almacenan en
el tejido adiposo.
Como aislantes térmicos en el tejido subcutáneo y alrededor de ciertos órganos.
Como aislantes eléctricos en los nervios mielinizados, permitiendo la
trasmisión rápida de los impulsos eléctricos.
Como estructurantes de la membrana plasmática
Como medio de transporte en la sangre
El colesterol libre puede existir en los tejidos, además puede formar parte de las
lipoproteínas plasmáticas. Puede formar ésteres de colesterilo, al combinarse con ácidos
graos de cadena larga.
2
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La muerte por inanición ocurre cuando se han gastado todas las reservas energéticas
disponibles.
REFERENCIAS
Bioquímica de Harper
Bioquímica de Laguna
PROBLEMAS
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ASIGNATURA DE BIOQÍMICA I
UNIDAD No.4
ENZIMAS
CINÉTICA ENZIMÁTICA
MEDIDAS DE LA
ACTIVIDAD
ENZIMÁTICA
"Como 1 mol son 106 µmoles y 1 minuto son "Cuando se conoce el peso molecular del
60 segundos, resulta que 1 katal equivale a enzima puro y el número de centros activos por
molécula de enzima, las medidas de actividad
60 x 106U. Esta unidad es muy grande, de
enzimática permiten calcular el número de
forma que se utilizan frecuentemente los recambio del enzima, o sea, el número de
submúltiplos como el microkatal (µkat, 10- reacciones elementales que realiza el enzima
6 kat) o el nanokatal (nkat, 10-9 kat)".
por cada centro activo y por unidad de tiempo".
http://www.ehu.eus/biomoleculas/enzimas/enz3.htm#e
1
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http://www.ehu.eus/biomoleculas/enzimas/jpg/dosetapas.gif
La desaparición del sustrato por acción de la enzima se da en función lineal del tiempo,
hasta alcanzar un límite, que está condicionado por la naturaleza misma de la enzima y
la disponibilidad de sustrato.
2
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Existe un pH óptimo para las reacciones catalizadas por enzimas. A mayor o menor pH
la actividad decrece. A veces las cifras óptimas para la actividad de una determinada
enzima no son las fisiológicas, como es el caso de la pepsina gástrica.
CINÈTICA ALOSTÉRICA
Con enzimas oligoméricas, constituidas por uno o más tipos de monómeros, es posible
la cooperatividad funcional y la cinética alostérica. Generalmente, este tipo de enzimas
tienen un papel clave en las vías metabólicas. Son enzimas que pueden ser reguladas por
moduladores positivos o negativos, que se unen a los sitios alostéricos de las moléculas
de las enzimas, los cuales son partes específicas de la cadena polipeptídica diferentes de
los sitios activos.
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Acción de los inhibidores.- Las sustancias que impiden la acción de las enzimas se
conocen como inhibidores. Pueden ser específicos, como los productos de la reacción,
o inespecíficos, como los metales pesados (Zn2+, que es un agente desnaturalizante,
Pb2+, Ag+, -SH, etc).
Ciertos agentes patógenos externos pueden dar lugar a mutaciones genéticas, dando
lugar a enfermedades como el cáncer, diabetes, fibrosis quística, enfermedad de
Alzheimer. Las enzimas juegan un papel importante en la producción de la salud y la
enfermedad.
Algunos agentes patógenos externos pueden introducir enzimas que sobrepasan los
mecanismos de regulación normales o bloquean ciertos elementos del sistema
enzimático.
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REFERENCIAS
- Bioquímica de Harper
- Bioquímica de Laguna
- Curso de biomoléculas, Universidad del País Vasco, CSIC-UPV/EHU. Disponible en
http://www.ehu.eus/biomoleculas/enzimas/enz3.htm#kv
PREGUNTAS
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UNIDAD No.4
ENZIMAS
Las enzimas son moléculas proteicas que tienen funciones de catalizadores biológicos,
que aceleran la velocidad de una reacción sin consumirse durante la misma. Hacen
posible la vida tal como la conocemos. (Laguna).
Todas las reacciones químicas de las células son catalizadas por enzimas.
Existen varios miles de enzimas, para varios miles de reacciones químicas.
Las enzimas se encargan de actividades vitales: síntesis, degradación, oxidación.
Las enzimas son específicas, sólo catalizan un tipo de reacción o una reacción
determinada (actúan sobre sustancias que tienen una configuración precisa, Ej: C
α con orientación L, no actúa sobre la estructura D, son estereoespecíficas.
La actividad de las enzimas puede ser regulada de acuerdo a las necesidades
biológicas.
Las enzimas aumentan millones de veces la velocidad de la reacción, siempre
que estas reacciones puedan darse espontáneamente, es decir que sean
termodinámicamente posibles.
Las enzimas no desvían la reacción, sólo acortan el tiempo de reacción.
Disminuyen la energía de activación necesaria para determinada reacción
química.
Durante las reacciones químicas catalizadas por enzimas se desprende energía.
Se diferencian de los catalizadores químicos en que las enzimas actúan en
condiciones muy estables, a temperaturas por debajo de 70 grados C, a un pH
alrededor de 7 y a una presión de una atmósfera.
NOMENCLATURA
El nombre sistemático de una enzima corresponde al nombre del o los sustratos que
intervienen en la reacción química que cataliza, seguido del nombre de dicha reacción y
se añade el sufijo “asa”. Ejemplo: fosfotransferasa, aminotransferasa, descarboxilasas,
esterasas, lipasas. Entre paréntesis puede ir la información adicional que sea necesaria.
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1. •Enzima específica
Sustrato (s): Constituyen la molécula o moléculas sobre las cuales actúa la enzima. El
número máximo de sustratos para una determinada enzima es de 3. La transformación
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Coenzima: Es el componente del sistema enzimático que tiene peso molecular bajo,
dializable, no proteica. Está unida débilmente a la apoenzima, pudiendo separarse
fácilmente de ella. Ejemplo: NAD+ (nicotinamida adenin dinucleótido), NADP+
(nicotinamida adenin dinucleótido fosfato), FMN (mononucleótido de riboflavina),
FAD (dinucleótido de flavina y adenina), CoA (Coenzima A), etc.
Proenzima (zimógeno): Son los precursores de las enzimas, que carecen de actividad
catalítica. Para activarse deben eliminar un péptido de su molécula. Ej: el pepsinógeno
gástrico, precursor de la pepsina.
Activadores: Los activadores habitualmente son iones como Mg2+, Mn2+, Ca2+, K+,
Na+). Aceleran la actividad de la enzima y la velocidad de la reacción y a veces son
indispensables para iniciarla. Para actuar en la reacción, generalmente se unen a los
sustratos o la coenzima, pero también se pueden unir a la apoenzima.
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ACTIVIDAD ENZIMÁTICA.-
Centro o sitio activo: Es el lugar donde el sustrato se liga a la enzima (de éste
dependerá la especificidad). Desde el punto de vista estructural, una parte del centro
activo es la cadena polipeptídica y la otra es el grupo prostético o la coenzima. Los
sitios activos de las enzimas son grupos de varios aminoácidos, de 2nm, a veces
distantes, por lo cual es necesario el arreglo tridimensional de la molécula de la enzima.
Sitio alostérico: Son los lugares sobre las cuales actúan los moduladores (1 ó más).
Provocan un cambio en la conformación estructural de la enzima que afecta el sitio
activo, influyendo en la velocidad de la actividad de la enzima.
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Estereoespecificidad: Adhesión geométrica del sitio activo de la enzima con los sustratos. La
unión solo se puede dar en una posición. Además, a parte de la estructura o forma, también
influyen en la especificidad la carga eléctrica y las propiedades hidrofílicas o hidrofóbicas de los
aminoácidos que conforman la enzima.
Cualquier alteración en la función de una enzima puede dar lugar a una enfermedad genética o a
un error del metabolismo. Aunque existan miles de enzimas en el organismo, la falla de una de
ellas puede dar lugar a una patología letal.
Existen enzimas en el plasma sanguíneo, algunas de ellas son enzimas séricas funcionales,
mientras otras son enzimas séricas no funcionales, las cuales pasan al suero porque existe
destrucción celular. Si la destrucción de las células aumenta más de lo normal por causas
patológicas o traumáticas, los valores de las enzimas no funcionales en el suero aumentan. Esto
permite la detección de enfermedades y ha dado lugar a la enzimología clínica.
SGPT:
7-56 U/L
Amilasa Pancreatitis aguda < 53 U/L
Lipasa Pancreatitis aguda o Adultos: 13 - 60 U/l
crónica (37º C)
Creatina cinasa (CC) Trastornos CK TOTAL:
(CPK) (CK) musculares e infarto Mujeres: 39 - 238
de miocardio U/L (0,66 - 4,0
µkat/L)
Varones: 51 - 294
U/L (0,87 - 5,0
µkat/L)
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CK –MB: 10-50
UI/L a 30ºC
Deshidrogenasa láctica (isozimas) (LDH) Infarto de miocardio 115 - 221
La LDH1 del corazón, músculos, y hematíes Anemia hemolítica U/L (0,51 - 0,73
La LDH2 del sistema retículo endotelial y ukat/L)
leucocitos
La LDH3 de los pulmones
La LDH4 de los riñones, placenta y páncreas.
La LDH5 del hígado y músculo
(https://www.tuotromedico.com/temas/isoenzimas_ldh.htm)
γ-glutamil transpeptidasa Varias enfermedades 9 - 58 U/L (0,15 -
(γ-glutamil-transferasa, γ-GT, GGT, GGTP) hepáticas 0,99 µkat/L)
soft-PACP:
0 – 3,5 UI/L
Fosfatasa alcalina Varios trastornos 33 - 96 U/L (0,56
óseos, enfermedades - 1,63 kat/L)
hepáticas obstructivas
REFERENCIAS:
1. Bioquímica de Laguna.
2. Bioquímica de Harper.
3. www.wiener-lab.com.ar
4. www.esgentside.com
5. chemocare.com
6. labtestsonline.es
7. www.red-gdl.com
8. www.hepato.com
9. www.google.com.ec
10. www.geosalud.com
11. http://www.valoresnormales.com/
12. https://www.tuotromedico.com/temas/isoenzimas_ldh.htm
13. http://www.labinlab.com/pruebas-de-laboratorio/fosfatasa-acida-fraccion-prostatica
PREGUNTAS:
1. ¿Qué son las enzimas y cuáles son las propiedades generales de las enzimas?
2. ¿En qué consiste la nomenclatura sistemática de las enzimas?
3. ¿Cómo se clasifican actualmente las enzimas?
4. ¿Qué es el sistema enzimático?
5. ¿Qué papel desempeñan cada uno de los componentes del sistema enzimático?
6. ¿Cuál es la importancia de las vitaminas en la actividad enzimática?
7. ¿En qué se diferencian las coenzimas, grupos prostéticos y cosustratos?
8. ¿Qué significado tiene la estereoespecificidad?
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UNIDAD No.5
CARBOHIDRATOS Y LÍPIDOS
CARBOHIDRATOS
Los carbohidratos son biomoléculas cuya fórmula empírica es Cn (H2O)n. En algunos
casos poseen N y S. Se encuentran en todos los seres vivientes. Los animales obtienen
los carbohidratos de los vegetales, los cuales pueden sintetizar glucosa y los almacenan
como almidón o forman celulosa. Los hidratos de carbono están compuestos de C, H, O
y en algunos casos contienen N y S.
Monosacáridos: Son los precursores de los carbohidratos, por tal motivo no pueden
hidrolizarse en carbohidratos más simples. De acuerdo al número de carbonos se
dividen en:
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ESTEREREOISÓMEROS
GLUCÓSIDOS
Los glucósidos se forman por la condensación entre los grupos hidroxilo del carbono
anomérico y otro compuesto de diferente naturaleza, monosacárido o no. Este enlace se
denomina glucosídico.
Cuando el segundo grupo es una amida, se dan los enlaces N-glucosídico, por ejemplo
entre adenina y ribosa. La unión entre una amida y un carbohidrato origina los
aminoazúcares (Ej: hexosaminas), componentes de las glucoproteínas, gangliósidos,
glucosaminoglucanos. La eritromicina es un antibiótico que posee aminoazúcares.
Los nucleósidos, nucleótidos y ATP se forman por la unión entre las bases nitrogenadas
y la ribosa.
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