Bioquímica humana

Tema 7: Nucleótidos y ácidos nucleicos

1. Clasificación y función biológica de los ácidos nucleicos

Los nucleótidos participan en numerosas funciones en el metabolismo:

• Reacciones de oxidación-reducción: NAD+, NADP+, FAD

• Transferencia de energía: ATP
• Actúan como señales químicas de los sistemas celulares en respuesta a las hormonas y otros estímulos
extracelulares: AMPc
• Reacciones de biosíntesis
• Funciones estructurales
• Funciones catalíticas: ribozimas
• Almacenamiento y transmisión de la información genética: ácidos nucleicos: ADN
(desoxirribonucleótidos) y ARN (ribonucleótidos).

2. Nucleótidos

Nucleósidos y nucleótidos
Los nucleótidos están constituidos por tres componentes característicos:

• Una base nitrogenada heterocíclica

Nucleósido
• Una pentosa (azúcar) Nucleótido
• Al menos un grupo fosfato.
Los azúcares habituales son:

• Β-D- ribofuranosa (forma parte ARN)

• Β-D-2-desoxirribofuranosa (ADN)

Bases nitrogenadas:

• Púricas (derivadas de la purina)

• Pirimidínicas (derivadas de la pirimidina)

La base de un nucleótido está unida covalentemente a través de un enlace N-β-glucosídico con el C-1’ del azúcar:

• Por el N-9 en las púricas

• Por el N-1 en las pirimidinas

El fosfato está esterificado con el C-5’ del azúcar.

Bases nitrogenadas
Bases púricas: derivadas de la purina

• Adenina (6-aminopurina)
• Guanina (2-amino-6-oxo-purina)

Bases pirimidínicas: derivadas de la pirimidina

• Citosina (4-amino-2-oxo-pirimidina)
• Timina (5-metil-2,4-dioxopirimidina)
• Uracilo (2,4-dioxopirimidina)

Tanto DNA como RNA contienen dos bases púricas y dos pirimidínicas

• ADN: adenina (A), guanina (G), citosina (C), timina (T)

• RNA: adenina (A), guanina (G), citosina (C), uracilo (U)

Existes otras bases llamadas bases raras o menores. Aparecen en pequeñas cantidades. Son derivadas
metiladas , hidroxi-metiladas o glicosiladas de las bases principales. ADN: señales específicas para la
regulación o protección de la información genética.

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Azúcar
Los desoxirribonucleótidos del DNA contienen 2´-desoxi-D-ribosa. Y los
ribonucleótidos del RNA contienen D-ribosa

En ambos la pentosa se encuentra en forma β-furanosa (anillo pentagonal

cerrado).

El anillo de la pentosa no es plano, sino que presenta diversas conformaciones

distorsionadas, designadas genéricamente como formas “ahuecadas”.

Nomenclatura de los nucleótidos y los ácidos nucleicos

Base Nucleósido Nucleótido Ácido nucleico
Purinas
Adenina Adenosina Adenilato ARN
Desoxiadenosina Desoxiadenilato ADN
Guanina Guanosina Guanilato ARN
Desoxiguanosina Desoxiguanilato ADN
Pirimidinas
Citosina Citidina Citidilato ARN
Desoxicitidina Desoxicitidilato ADN
Timina Timidina o Timidilato o ADN
desoxitimidina desoxitimidilato
Uracilo Uridina Uridilato ARN

Estructuras y nombres de desoxirribonucleótidos

Estructuras y nombres de ribonucleótidos

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Nucleótidos con grupos fosfato en posiciones diferentes del C-5’
En las células aparecen nucleótidos con grupos fosfato en posiciones diferentes al carbono 5’ de la ribosa

• Ribonucleósidos 2’,3’-fosfato cíclicos: Son intermedios aislables de la hidrólisis de RNA

• Ribonucleósidos 2’-monofosfato y 3’-monofosfato: Productos finales de la hidrólisis del RNA por ciertas
ribonucleasas

Otros ejemplos: 3’,5’-monofosfato cíclico (cAMP)

Unión de nucleótidos por enlaces fosfodiéster

En los nucleótidos sucesivos del ADN y el ARN están unidos
covalentemente mediante “puentes” de grupos fosfato

• El grupo hidroxilo en 5’ de un nucleótido está unido al

grupo hidroxilo en 3’ del nucleótido siguiente mediante
un enlace fosfodiéster

Los esqueletos covalentes del ADN y ARN son hidrófilos

• Los –OH forman enlaces de H

• Los grupos fosfato están totalmente inonizados a pH
7.0, y sus cargas negativas estabilizadas por
interacciones iónicas con cargas positivas de proteínas,
iones metálicos o poliaminas.

Todos los enlaces fosfodiéster tienen la misma orientación

• Extremo 5’: no nucleótido en posición 5’

• Extremo 3’: no nucleótido en posición 3’
• La orientación 5’ a 3’ se refiere a los extremos de la
cadena.

Los grupos fosfato se representan por el símbolo

Las desoxirribosas por una línea vertical.

• C-1’: en la parte superior (unido a la base nitrogenada)

• C-5’ en la parte inferior (unido al fosfato)
• Las líneas que conectan los nucleótidos (que pasan a través de se dibujan uniendo en diagonal el
punto medio (C-3’) de la desoxirribosa de un nucleótido con el extremo inferior (C-5’) del siguiente.

Otras representaciones de este pentanucleótido:

La secuencia de una cadena sencilla de
• pA-C-G-T-A ácido nucleico se escribe siempre con el
• pApCpGpTpA extremo 5’ a la izquierda y el 3´a la
• pACGTA derecha, es decir, dirección 5’ → 3’

Oligonucleótido: hasta 50 nucleótidos

Polinucleótidos: ácidos nucleicos de mayor longitud

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Análogos de bases o nucleósidos como agentes terapéuticos
Compuestos análogos estructurales de bases o nucleósidos son inhibidores relativamente específicos de enzimas
implicadas en el metabolismo de los nucleótidos y se emplean para el tratamiento de diferentes patologías:

Aciclovir (análogo base púrica) y AZT (análogo pirimidina) (3’-axido-3’-desoxitimidina): permiten controlar,
aunque no curar, las infecciones de los virus del herpesvirus (HSV) y del virus de inmunodeficiencia humana
(HIV), respectivamente.
6-mercaptopurina y 6-tioguanina: tratamiento de cáncer,
leucemia aguda

Azotiopurina: inmunosupresión en pacientes con

trasplantes de órganos.

3. Estructura y función del ácido desoxirribonucleico

Reglas de Chargaff
A finales de la década de 1940, Erwin Chargaff y sus colaboradores encontraron que las cantidades relativas
de ciertas bases de nucleótidos del ADN variaban según el organismo y que las cantidades relativas de ciertas
bases estaban muy relacionadas. La proporción cuantitativa de las bases en una macromolécula se adapta en
ocasiones a las denominadas Reglas de Chargaff.

Reglas de Chargaff
1. La composición de las bases del DNA generalmente varía de una especie a otra
2. Las muestras de DNA aisladas de los diferentes tejidos de la misma especie se componen de las
mismas bases
3. La composición de bases del DNA de una determinada especie no varía con la edad del organismo,
ni con su estado nutricional, ni con las variaciones ambientales.
4. En todos los DNA de diferentes especies:
• A=T
• G=C
• La suma de purinas es al igual a la suma de pirimidinas (A+G = T + C)
• A + T ≠ C+G

El ADN es una doble hélice

Rosalin Franklin y Mauri Wilkins

Utilizaron la difracción de rayos X para analizar fibras de ADN a principios de 1950 y demostraron que el ADN
produce un patrón de difracción característico que permitió deducir que tenían estructura helicoidal y que sus
bases forman un apilamiento paralelo al eje de la fibra.

James D. Watson y Francis H.C. Crick

En 1953, postularon un modelo tridimensional para el ADN.

Modelo de Watson y Crick

1. Existen dos cadenas de polinucleótidos enrolladas alrededor de un eje común, formando una doble hélice
dextrógira.

Las cadenas hidrofílicas formadas por la desoxirribosa y los grupos fosfato alternados se encuentra en
el exterior de la doble hélice (en contacto con el agua)

El anillo de furanosa de la desoxirribosa adopta la conformación C-2’ endo

Las bases purínicas y pirimidínicas de ambas cadenas están apiladas en el interior de la doble hélice
sus estructuras en anillo, hidrofóbicas y prácticamente planas, situadas a muy corta distancia unas de
otras y en posición perpendicular al eje longitudinal de la hélice

El diámetro de la hélice es de 20 Å. La separación entre bases es de 3,4 Å y están desplazadas por una
rotación de 36º. Posee 10,5 pares de bases por vuelta de hélice (36 Å).

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2. Las dos cadenas de DNA son antiparalelas
Los enlaces 5’,3’-fosfodiéster tienen direcciones opuestas.
Cada una de las cadenas forma una hélice dextrógira.

3. El apareamiento compensado de las dos cadenas da lugar a un surco mayor y un

surco menor.

4. Las cadenas de la doble hélice no son idénticas ni en secuencia ni en composición

de bases: Son complementarias
Cada base de una cadena está apareada en el mismo plano con una base de
la otra cadena.
Pares de bases unidad por enlaces de H
• G ≡ C (tres enlaces de H)
• A = T (dos enlaces de H)
Mayor dificultad para separar las hebras apareadas del DNA cuanto mayor
sea la relación de bases G ≡ C con respecto a los A = T.
Otros apareamientos diferentes tienden, en mayor o menor medida, a
desestabilizar la estructura en doble hélice.

La complementariedad de las dos hebras del ADN permitió deducir antes de disponer de pruebas
experimentales, que la replicación de la estructura podría tener lugar a través de la separación de las dos
hebras y la síntesis de hebras complementarias de cada una de ellas. Cada hebra hace de molde para dirigir la
síntesis de la hebra complementaria.

Fusión reversible del ADN

Las hebras del DNA pueden separase. Han de escindirse los enlaces de H. Se consigue calentando una
disolución de DNA o bien añadiendo ácidos o bases para ionizar sus bases. El desenrollamiento de la doble
hélice se denomina fusión (melting).
La temperatura de fusión (Tm): temperatura a la que se ha deshecho la mitad de la estructura helicoidal.
Depende de su composición en bases. Moléculas ricas en G, C, Tm elevadas.
Las hebras complementarias de ADN separadas se reasocian espontáneamente cuando T < Tm. El proceso de
renaturalización se llama annealing o templado.

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4 Estructura del ácido ribonucleico

ARN
El ADN se transcribe a ARN, y la secuencia de ARN se traduce a la secuencia de aminoácidos correspondiente,
formando una proteína. El ARN transporta la información genética desde el ADN hasta los ribosomas, donde
se sintetizan las proteínas.

Esta transferencia de información biológica se resume en el llamado dogma central de la biología, formulado
por Crick en 1958, y modificado posteriormente (el comportamiento de algunos virus, en rojo en la figura).

ARN ADN
Los nucleótidos se unen entre sí mediante enlaces fosfodiéster Los
enlaces fosfodiéster se forman entre el fosfato de un nucleótido con el
Aspectos comunes OH del C3’ de otro nucleótido Los ácidos nucleicos son siempre
cadenas lineales (no ramificadas) con dos extremos diferenciados:
extremo 5´P y extremo 3’OH

Formado por ribonucleótidos Formado por

(ribosa) desoxirribonucleótidos (2’-
desoxirribosa)
Nunca contiene timina como base Nunca contiene uracilo como base
Principales diferencias nitrogenada nitrogenada
Son moléculas de cadena simple Son moléculas de cadena doble
(una única cadena de (dos cadenas de desoxinucleótidos
ribonucleótidos) asociadas entre sí por enlaces de
H)

Tipos de ARN

• ARN ribosómico (rRNA): son componentes de los ribosomas

• ARN mensajero (mRNA): actúan como transportadores de la información desde un gen hasta los
ribosomas donde se sintetizan las proteínas
• ARN de transferencia (tRNA): Traduce la información genética contenida en el mRNA a secuencias
específicas de aminoácidos
• ARN nuclear pequeño (snRNA): se encuentra en el núcleo

Además, existen diversas moléculas de ARN que desempeñan funciones específicas. Por ejemplo, ribozimas.

ARN ribosómico (rRNA)

Es el componente principal de los ribosomas. Constituye hasta un 65% de su peso. Tiene función catalítica y
estructural en la síntesis de proteínas.

Un ribosoma consta de dos subunidades una grande y otra pequeña. Para

la separación de los ribosomas, RNA y proteínas se utiliza una técnica
denominada centrifugación analítica. El movimiento de una partícula en
esta técnica se denomina coeficiente de sedimentación expresado en
unidades Sverdberg (S). El valor S aumenta con el peso de la partícula en
la sedimentación, pero no de forma directamente proporcional, ya que la
forma de la partícula afecta.

Los ribosomas eucariotas:

• Coeficiente de sedimentación de 80 S
• Unidad menor: 40 S (1 rRNA (18 S) + 33 proteínas)
• Unidad mayor; 60 S (3 rRNA ( 5 S, 28 S y 5,8S)) + 49 proteínas)
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ARN de transferencia (tRNA)
Consta de unos 75 nucleótidos:

• Polinucleótido de una sola cadena

• Peso molecular 25.000 daltons

Función: transporta aminoácidos en forma activada al ribosoma para la

formación de enlaces peptídicos a partir de la secuencia codificada por el
mRNA molde.

Al menos un tipo de tRNA para cada uno de los 20 aminoácidos. En el tRNA

se establecen enlaces de hidrógeno intracatenarios entre las bases A-U y C-
G. Las porciones de la molécula unidas por enlaces de H se denomina tallos
y los otros bucles. Algunos de estos bucles poseen bases modificadas.

Tiene estructura de trébol:

• Residuo de guanilato (pG) en extremo 5’ y secuencia CCA en

extremo 3’
• Brazo del aminoácido: aminoácido específico unido por su grupo
carboxilo al grupo hidroxilo 2’ ó 3’ del residuo A del extremo 3’
• Brazo anticodón
• Brazo D: contiene dihidrouridina (D)
• Brazo TyC: contiene ribotimina (T) y pseudouridina (y)

ARN mensajero (mRNA)

Constituye el 5-10% de todo el RNA celular (el menos abundante de los ARN).

Función: molde para la síntesis de proteínas o traducción.

Contiene información para la síntesis de un solo polipéptido:
mRNA monocistrónico (la mayoría). Codifica dos o más
polipéptidos diferentes: mRNA policistrónico

La secuencia de nucleótidos del mRNA es complementaria al

mensaje genético contenido en un segmento específico de DNA.

En eucariotas el mRNA formado inicialmente es una molécula

más grande llamada RNA nuclear heterogéneo (hnRNA) que
contiene largas porciones de secuencias intermedias llamadas
intrones que no codifican proteína y que se eliminan durante las
modificaciones postranscripcionales.

ARN nuclear pequeño (snRNA)

Se encuentra en el núcleo de células eucariotas. Contiene entre 100-200 nucleotidos. Está unido a proteínas
para formar partículas nucleares pequeñas de ribonucleoproteínas (snRNP): 5 snRNP: forman un espliceosoma.

Función: participa en el procesamiento del mRNA inicial que se transcribe del DNA, para dar una forma
madura que pueda exportarse del núcleo al citosol.

5. Nucleótidos con otras funciones

ATP: Moneda de intercambio energético en las células

El ATP es un ribonucleótido constituido por una ribosa
+ adenosina + tres grupos fosfato, el primero unido por
un enlace fosfoéster y los otros dos por enlaces
fosfoanhídrido.

La gran importancia del ATP radica en la gran cantidad

de energía libre que acompaña a la hidrólisis de los
enlaces fosfoanhídrido.

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AMPc: actúa como segundo mensajero

El AMPc se produce a partir de ATP por acción de la enzima adenilato quinasa.

Funciones del AMPc:

• Transducción de señales en las células. Ej. Respuesta a hormonas como

el glucagón y la adrenalina
• AMPc es indispensable para la actividad de la enzima proteinasa quinasa
A (PKA), que fosforila residuos de Ser o Thr de numerosas proteínas
celulares.

NAD+ y NADO+
NAD+: dinucleótido de nicotinamida y adenina

NADP+: dinucleótido fosfato de nicotinamida y

adenina
Son moléculas transportadoras de electrones. Los
anillos de NAD y NADP provienen de la vitamina
niacina que se sintetiza a partir del triptófano. La
carencia de la niacina provoca la pelagra.

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FAD y FMN
Son moléculas transportadoras de
electrones. Provienen de la rivoflavina o
vitamina B2

FAD: dinucleótido de flavina y adenina

FMN: mononucleótido de flavina

Coenzima A (Co A)
Importante en la activación de los ácidos grasos (catabolismo: oxidación, anabolismo (síntesis de lípidos).
Su función es transportadora de grupos acilo. El centro reactivo es el grupo sulfhidrilo terminal del CoA. Los
grupos acilos se unen a la CoA mediante un enlace tióester, formándose un derivado denominado acil-CoA.