Bases Nitrogenadas Enlace Fosfodiéster

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Almacenamiento y expresión de la información genética

BASES NITROGENADAS ENLACE FOSFODIÉSTER

Componente ácido: fosfatos


El fosfato inorgánico (Pi) es resultante de la mezcla química de la disociación
de la molécula de ácido fosfórico:
• Aparece como anión a pH ácido.
• Dianión a pH fisiológico
• Trianión a pH alcalino.
En la célula:
• Compuestos orgánicos (R-P)
• Enlace éster entre fosfórico y un grupo hidroxilo (alcohol)
Las instrucciones necesarias para dirigir sus actividades están contenidas en
los cromosomas
Nucleósidos:
Nucleósido= base nitrogenada + pentosa.
• Producido mediante un enlace covalente denominado N-glucosídico que
se forma entre el C-1’ de la pentosa y el N-1 de las pirimidinas o bien el
N-9 de las purinas.
Base Nitrogenada + Ribosa= Ribonucleósidos
Base Nitrogenada + desoxirribosa= Desoxirribonucleósidos.

Nucleótido:

(ésteres monofosfato, difosfato o trifosfato de nucleósidos)

Los nucleótidos son moléculas ácidas, ya que el grupo fosfato se ioniza en


medio acuoso.
Grupo Fosfato + Nucleósido = Nucleótido o nucleósido monofosfato.
Ejemplo: adenosina monofosfato (AMP).
Los nucleósidos, en su forma de monofosfato, son los componentes de los
ácidos nucleicos; aunque cuando se encuentran libres lo están en su forma
trifosfatada.

• El primer fosfato se une al nucleósido mediante un enlace éster con el


OH del carbono 5’ de la pentosa.
• El segundo y el tercer fosfato se conectan con el nucleótido mediante un
enlace fosfoanhídrido que requiere un gasto de energía para su
formación.
Dos o tres fosfatos + Nucleósido Monofosfato= Nucleósido difosfato (como el
ADP) o bien trifosfato (como el ATP).
Cadenas de ácidos nucleicos o polinucleótidos
Los nucleótidos se unen mediante enlaces fosfodiéster para dar lugar a
cadenas de ácidos nucleicos o polinucleótidos

FOSFODIÉSTER: Cuando un nucleótido se encuentra formando parte de un


ácido nucleico, su grupo fosfato esta esterificado al mismo tiempo con dos
grupos alcohol (formando un enlace fosfodiéster)

El enlace fosfodiéster tiene lugar entre el C-5’-fosfato de un nucleótido y el C-


3’-hidroxilo del siguiente nucleótido. La unión sucesiva de nucleótidos mediante
enlace 3,5-fosfodiéster genera un polinucleótido polarizado; es decir, con
extremos diferentes.

¿Por qué la dirección 5’ → 3’ en la construcción de ácido nucleico?


Los nucleótidos que constituyen las cadenas de ADN contienen las bases A, G,
T y C; mientras que los nucleótidos que forman las cadenas de ARN están
constituidos por las bases nitrogenadas A, G, C y U. Por consenso universal, la
secuencia de nucleótidos en una cadena de polinucleótidos se escribe en
dirección 5’ → 3’.

ESTRUCTURA DE LOS ÁCIDOS NUCLEICOS


Los ácidos nucleicos constituyen el material genético de los organismos y son
necesarios para el almacenamiento y la expresión de la información genética.
Los acido nucleicos son solventes polares e hidrofílicos. Los puntos de
polaridad son los átomos de oxígeno (ADN o ARN). Mientras más Oxigeno
tenga una molécula es más se hidrofílica.

Terminología:
Nt (nucleótidos): Monocatenaria = RNA
Pb (paredes de bases): Bicatenaria =DNA
Tipos: el ácido desoxirribonucleico (ADN) y el ácido ribonucleico (ARN); ambos
se encuentran en todas las células procariotas, eucariotas y virus
Composición de los ácidos nucleicos:
Base nitrogenada: una purina o pirimidina.
Purinas:
• De los ácidos nucleicos son la Adenina (A) y guanina (G), ambas
presentes en los nucleótidos del ADN y del ARN.
• Compuestas por dos anillos condensados.
• Átomos de carbono e hidrogeno del 1 al 6.
• Se sintetizan de novo en el hígado como mononucleótidos unidos con
una molécula de ribosa 5-fosfato.
Pirimidinas:
• De los ácidos nucleicos son la citosina (C), la timina (T) y el uracilo (U).
La C está presente en los nucleótidos que componen el ADN y ARN, la
T sólo forma los nucleótidos que componen al ADN y el U, los
nucleótidos que componen al ARN.
• Compuestas por un anillo condensado.
• Átomos de carbono e hidrogeno del 1 al 9.
• Se sintetizan como bases libres y después se unen a la ribosa 5-fosfato

Importante: el recambio de ácidos nucleicos da lugar a la liberación de bases


libres, tanto de purinas como pirimidinas; estas bases se reciclan y se unen a
una pentosa y un grupo fosfato para generar de nuevo el nucleótido.
Pentosa:
Los carbonos de la pentosa se identifican en los nucleótidos mediante números
del 1 al 5, con una comilla, y se denominan primos.
• El nucleótido es la D-ribosa para el ARN, denominado ribonucleótidos.
• El nucleótido es D-desoxirribosa para ADN, denominado
desoxirribonucleótidos
Diferencia: la ribosa posee un grupo OH en el carbono dos, mientras que la
desoxirribosa sólo cuenta con un hidrógeno.
Grupo fosfato: causante de las cargas negativas de los ácidos nucleicos y que
le brinda características ácidas.

GENERALIDADES DEL NÚCLEO CELULAR

EL ADN en la célula:
• Almacenamiento de información genética
• Se localiza en los cromosomas del núcleo, las mitocondrias y los
cloroplastos de las células eucariotas.
• En las células procariotas el ADN se encuentra en su único cromosoma
y, de manera extra cromosómica, en forma de plásmidos
EL ARN en la célula:
• Interviene en la transferencia de la información contenida en el ADN hacia
los compartimientos celulares.
Se encuentra en el núcleo, el citoplasma, la matriz mitocondrial y el estroma de
cloroplastos de células eucariotas y en el citosol de células procariotas

ESTRUCTURA Y FUNCIÓN DEL MATERIAL GENETICO

ESTRUCTURA PRIMARIA DE ACIDO NUCLEICO

• Enlace fosfodiéster, ribosa, desoxirribosa y base. Hasta llegar al extremo


3´prima ácido nucleico. - Se llama 5´prima por que el carbono 5 es el ultima
azúcar que está en el extremo, de donde se ancla al grupo fosfato.

Corresponde a la secuencia de nucleótidos del polinucleótido linealizado:


• La información genética está contenida en el orden exacto de las bases
nitrogenadas que componen los nucleótidos, y si se modifica alguna de
estas bases o su orden se alterará la información.

ESTRUCTURA SECUNDARIA DEL B-DN

En células eucariotas el ADN (desoxirribosa-fosfato) se encuentra como una


cadena doble de polidesoxirribonucleótidos.

Características:

• Las dos cadenas del ADN giran alrededor de un eje de simetría imaginario y
forman una estructura helicoidal (doble hélice del ADN).
• La columna hidrofílica de cada cadena está en el exterior de la molécula,
mientras que las bases nitrogenadas hidrófobas se orientan hacia el interior.
• Forma un giro helicoidal dextrógiro o levógiro. La relación espacial que se
genera por el giro entre las dos cadenas de la hélice crea un surco mayor
(ancho) y uno menor (estrecho)
• Es antiparalela. El extremo 5´ de una se asocia con el extremo 3’
• Es complementaria. Las bases nitrogenadas de una de las cadenas del
ADN se unen mediante puentes de hidrógeno a las bases nitrogenadas de
la otra cadena, de manera que A siempre se une a T, y G a C.

La secuencia de nucleótidos de una cadena define y complementa la secuencia


de nucleótidos en la otra. El apareamiento específico de bases entre las
cadenas de ADN sustenta las llamadas reglas de Chargaff :

Reglas de Chargaff: En cualquier muestra de ADN de cadena doble, la


cantidad de A es igual a la cantidad de T, la cantidad de G es igual a la de C, y
la cantidad de purinas es igual a la de pirimidinas.
Variantes de la doble cadena de ADN
La molécula de ADN toma una estructura diferente según el microambiente en el que
se encuentre, con ello el número de bases por giro, la inclinación y el giro de la
molécula varía; estas características influyen en su disponibilidad como fuente de
información genética

• La Forma B (Watson y Crick): Estructura predominante en el ADN


cromosómico
• La Forma A: se produce in vitro con la deshidratación moderada de la
forma B
Es probable que la conformación de los híbridos ADN-ARN y del ARN de
doble cadena se asemeje a la forma A.
• La Forma Z (ADN-Z): regiones donde se encuentra una secuencia de
purinas y pirimidinas alternadas (por ejemplo, zonas de repetición de
GC).
Poco comprendida, pero puede estar relacionada con la regulación de
la expresión génica.
ADN circular
El ADN mitocondrial y de células procariotas se encuentra en forma de molécula
circular, sin extremos, donde no hay interrupción de los enlaces fosfodiéster.
Al ADN circular se lo puede encontrar como una estructura relajada o como una
estructura superenrollada y más compacta, donde la hélice del ADN (ya
enrollada) gira sobre sí misma (superenrollada) y genera una superhélice

Superenrollamiento:
-Se encuentra regulado por la acción de topoisomerasa.
• Las dos hebras sufren enrollamiento
• La doble hélice sufre un superenrollamiento
-Regula la accesibilidad a la información genética y la expresión génica, al -
mantenerse inaccesible para los factores de transcripción.
-Permite:
• La compactación del ADN para que ocupe menor espacio en las células
• Que posiciones lejanas en la secuencia se aproximen
-Se produce debido a la acción de las enzimas topoisomerasas, que mediante
el corte transitorio de una o ambas hebras introducen un aumento o una
disminución (superenrollamiento positivo o negativo) en el número de vueltas
de hélice.

Superenrollamiento Negativo:
• Si la doble hélice se desenrolla parcialmente (hélice infraenrollada,
con menos vueltas de hélice, la forma B)
• Relajado más paredes bases
• La superhélice formada tiene sentido hacia la derecha (Dextrorso).

Superenrollamiento Positivo:
• Si la doble hélice se enrolla más apretadamente (hélice sobreenrollada,
con más vueltas de hélice, la forma B)
• Menos pares de base (más condensado)
• La superhélice formada tiene sentido hacia la izquierda (Sinastroso).
Ambos superenrollamientos, a pesar de ser diferentes (enantioméricos), tienen como
resultado la recuperación de la conformación local más estable y la compactación de
la molécula de DNA, reduciendo su longitud efectiva.

Niveles de empaquetamiento del ADN

Debido a la longitud del ADN genómico en las células eucariotas


(alrededor de 2 metros/célula) es necesaria su compactación, de manera
que permita ocupar menos espacio y quepa dentro del núcleo de la
célula.

El ADN se asocia con nucleoproteínas (histonas y no-histonas) para formar la


cromatina y dar origen a los cromosomas; por ello, en el empaquetamiento del
ADN se distinguen diferentes niveles de organización:
HISTONAS:

Son proteínas con carga positiva a pH fisiológico, debido a su alto contenido en


aminoácidos básicos, como la lisina y la arginina. Esta propiedad les permite asociarse
a la molécula de ADN de carga negativa (conferida por los grupos fosfato).

• Existen cinco tipos de histonas: H1, H2A, H2B, H3 y H4. Dos moléculas de
histona H2A, H2B, H3 y H4 se asocian para formar un octámero de histonas.

Nucleosoma

Un segmento de ADN de doble cadena de aproximadamente 146 pb se enrolla


dando 1.6 vueltas al octámero para formar una estructura llamada
nucleosoma.

Los diferentes fragmentos de ADN presentes en el núcleo se asocian a


diversos octámeros y forman una cadena de nucleosomas conocida como
“cuentas de rosario” o “cuentas de collar”.

La función del nucleosoma es condensar el ADN en una fibra de 11 nm de


ancho que se asemeja al mencionado collar de perlas, donde cada nucleosoma
sería una perla y el ADN de enlace, el cordón con el cual están unidas estas
perlas.

Entre cada nucleosoma queda un segmento de ADN de aproximadamente 55


pb denominado ADN enlace o linker.. Este se asocia, con otra histona
denominada H1 y ayuda al empaquetamiento del ADN, lo que facilita la
formación de otra estructura, llamada solenoide.

El extremo aminoterminal de las histonas puede unirse de manera reversible a


grupos acetilo, metilo o fosfato, lo que se conoce como modificaciones
epigenéticas; la adición de estos grupos modifica la unión de las histonas al
ADN y, por tanto, regula la disponibilidad de la información génica.
Solenoide
Su estructura se basa en que los nucleosomas se compactan para formar un
polinucleosoma de seis unidades mediante interacciones entre las H1 de cada
nucleosoma, generando una estructura más compacta.

Forma una hebra de 30 nm, conocida como cromatina, en este nivel el ADN
está compactado unas 100 veces. La cromatina puede encontrarse activa de
forma transcripcional, por lo que se descompacta y entonces recibe el nombre
de eucromatina. La cromatina inactiva se encuentra en su forma
compacta y se la conoce como heterocromatina.

Cromatina -> ADN muy enrollado


Asas cromáticas
La fibra de 30 nm se pliega y condensa aún más, formando estructuras de asas
amplias superenrolladas, las cuales se anclan sobre proteínas de andamiaje y
dan lugar una hebra de 300 nm de grosor.

Cromosoma condensado
Las asas cromáticas se compactan y forman un cromosoma condensado de
700 nm de espesor visible durante la interfase.

ADN descondensado: Se puede Expresar (está abierto)


ADN condensado: No se expresa (está cerrado)

Cromosomas mitóticos
Las cromátides hermanas visibles en la mitosis representan la última etapa de
la organización del ADN y llegan a medir 1 400 nm de grosor.

Esquema de los niveles de empaquetamiento del ADN


GENOMA HUMANO:

Hay mas Timinas y Adenimas en relación a las Guaninas y Citocinas.


El genoma Humano es redundante.
EMPAQUETAMIENTO DEL GENOMA HETEROCROMATINA Y
EUCROMATINA
Según el nivel de compactación, las cromatinas se clasifican en dos formas
primarias: eucromatina y heterocromatina.
• Eucromatina: Región menos densa de la cromatina y se tiñe más claro.
La eucromatina contiene histona H3 ampliamente acetilada en lisina en la novena
posición de la región de la cola de la histona

Se puede encontrar dispersa por todo el núcleo celular. Se replica durante toda la
duración de la fase S de la división celular.

• Heterocromatina: Bajo el microscopio, las regiones densamente


compactadas que absorben más tinte

Heterocromatina constitutiva: es una región de cromatina muy compacta que se


concentra principalmente en el centrómero y el telómero. A diferencia de la
eucromatina, el aminoácido de la novena posición en la cola de las histonas H3 está
di- o tri-metilado. Esto atrae una proteína no histona especializada llamada proteína
heterocromatina 1 (HP1) al sitio metilado.

Heterocromatina facultativa: esta región es más densa que la eucromatina, pero, a


diferencia de la heterocromatina constitutiva, la lisina en la posición 27 de la cola de la
histona H3 está di- o trimetilada (H3K27me3). Estas regiones se caracterizan por la
unión de complejos represivos de Polycomb: PRC1 y PRC2.

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Replicación cromosómica

Antes de que una célula pueda dividirse, debe replicar con precisión todos sus
cromosomas, incluido el ADN y sus proteínas histonas y no histonas
asociadas.

Este proceso comienza en numerosos orígenes de replicación durante la fase


S del ciclo celular en cada uno de los cromosomas de una célula
simultáneamente.

Ciertos nucleótidos pueden actuar como orígenes de replicación, pero estas


secuencias no están bien definidas, especialmente en especies eucariotas
complejas, multicelulares.

Mientras progresa la replicación del ADN, se sintetizan nuevas proteínas de


histonas y se forman nuevas partículas de núcleo de histonas. Estas proteínas
son tan importantes para la función cromosómica como el ADN, ya que las
histonas son fundamentales para la estructura física del cromosoma.

Replicación de histonas

Las histonas son proteínas que se encargan de empaquetar el ADN en


cromatina y luego en cromosomas. Por tanto, las histonas son fundamentales
para la estructura física y la función del cromosoma eucariota.

Replicación y reparación del DNA


Biología molecular Fundamentos y aplicaciones para las ciencias de la salud
Capítulo 4 Replicación

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