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    Ejericio P1 GPAE 8QM2

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    El documento resume la secuencia del gen y proteína de la subunidad beta de la hemoglobina humana. Describe que el transcrito se conoce como beta-globin (HHB), tiene una longitud de 10,106 pb, un número de acceso RefSeq de NG_059281.1, y la proteína tiene 147 aminoácidos. Compara los resultados de búsquedas en RefSeq y sin filtrar por RefSeq, mostrando que sin el filtro hay más entradas disponibles.

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    Ejericio P1 GPAE 8QM2

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    El documento resume la secuencia del gen y proteína de la subunidad beta de la hemoglobina humana. Describe que el transcrito se conoce como beta-globin (HHB), tiene una longitud de 10,106 pb, un número de acceso RefSeq de NG_059281.1, y la proteína tiene 147 aminoácidos. Compara los resultados de búsquedas en RefSeq y sin filtrar por RefSeq, mostrando que sin el filtro hay más entradas disponibles.

    Descripción original:

    hola

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    Ejericio-P1-GPAE-8QM2

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    El documento resume la secuencia del gen y proteína de la subunidad beta de la hemoglobina humana. Describe que el transcrito se conoce como beta-globin (HHB), tiene una longitud de 10,106 pb, un número de acceso RefSeq de NG_059281.1, y la proteína tiene 147 aminoácidos. Compara los resultados de búsquedas en RefSeq y sin filtrar por RefSeq, mostrando que sin el filtro hay más entradas disponibles.

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    El documento resume la secuencia del gen y proteína de la subunidad beta de la hemoglobina humana. Describe que el transcrito se conoce como beta-globin (HHB), tiene una longitud de 10,106 pb, un número de acceso RefSeq de NG_059281.1, y la proteína tiene 147 aminoácidos. Compara los resultados de búsquedas en RefSeq y sin filtrar por RefSeq, mostrando que sin el filtro hay más entradas disponibles.

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    de 5

    García Pérez Angel Eduardo 8QM2

    Replique los pasos (todos o algunos) vistos en el procedimiento, pero ahora para la secuencia RefSeq del gen y la
    proteína de la hemoglobina subunidad beta y responda las siguientes preguntas:
    a) ¿Cuál es el nombre por el cual también se le conoce al transcrito de la hemoglobina subunidad beta humana?
    Se le conoce como beta-globin

    b) ¿Cuál es la abreviatura del nombre del transcrito de dicha subunidad?


    Es HHB

    c) ¿Cuál es su longitud en pb?


    De 10,106 pb
    d) ¿Cuál es su número de acceso, es RefSeq?
    Sí, es RefSeq: NG_059281.1

    e) ¿Cuál es el intervalo de nucleótidos que corresponden a la 5’-UTR?


    La región 5’-URT es la secuencia de mRNA río arriba antes del inicio del codón de la secuencia codificante de la
    proteína, es decir, antes del codón ATG que codifica para la metionina. Esta fue buscada por la opción de
    “Graphics” y determinando las secuencias correspondientes. La secuencia es la siguiente:

    5’- acatttgctt ctgacacaac tgtgttcact agcaacctca aacagacacc-3’

    f) ¿Cuál es su /protein_id?
    Es NP_000509.1
    g) ¿De cuántos aminoácidos está formada la proteína?
    De 147 aminoácidos.

    h) ¿Cuál es el aminoácido que ocupa la posición 83 de la proteína


    Es lisina (K)

    i) ¿Cuántas entradas RefSeq de la subunidad beta de la hemoglobina humana han sido modificadas desde el inicio
    del año 2020 a la fecha?, ¿y cuántas han sido publicadas con las mismas características?
    Entradas modificadas: 25 entradas
    Entradas publicadas: 0 entradas
    j) Finalmente vuelva a realizar el inciso i sin que las entradas sean RefSeq. Discuta el porqué de dichos resultados
    entre el inciso i y j.
    Entradas modificadas: 44 entradas
    Entradas publicadas: 19 entradas

    Las entradas RefSeq, al no ser redundantes, la cantidad de datos disponibles en el sistema es menor; el sesgo disminuye.
    Por lo anterior, la búsqueda sin el filtro de RefSeq, proporciona una mayor cantidad de datos (ítems) en la página de
    NCBI. En otras palabras, la búsqueda en RefSeq es más puntual y específica.
    k) Construya una tabla donde coloque de manera explícita los criterios de búsqueda y el número de entradas que dan
    como resultados dichas búsquedas.

    Búsqueda sencilla Operador boleano # Resultados

    hemoglobin subunit beta human Ninguno 2234

    Búsqueda avanzada Operador boleano # Resultados

    • All fields: hemoglobin subunit


    beta human
    • Organism: human
    AND 25
    • Modification date: 2020/01/01-
    actually
    • Filters: refseq
    • All fields: hemoglobin subunit
    beta human
    • Organism: human
    AND 0
    • Modification date: 2020/01/01-
    actually
    • Filters: refseq
    • All fields: hemoglobin subunit
    beta human
    • Organism: human AND 44
    • Modification date: 2020/01/01-
    actually
    • All fields: hemoglobin subunit
    beta human
    • Organism: human AND 19
    • Modification date: 2020/01/01-
    actually

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