Guia de Prácticas 2024-2
Guia de Prácticas 2024-2
Guia de Prácticas 2024-2
de la enfermedad
Guía de Practicas 2024-2
Profesores:
Cruzate Cabrejos, Vicente
Sullcahuaman Allende, Yasser
Torres Loarte, Mariela
Trubnykova, Milana
Genética Humana
Genética Humana
Código genético, errores y
mecanismos de enfermedad
Profesores:
1. Información genética
Los seres vivos comparten un código genético que se encuentra en el ADN el cual contiene toda la
información transmitida de generación en generación. En este código están contenidos todas las
características de un ser vivo: sus órganos, tejidos, células, moléculas de señalizamos con todo detalle,
no existe tejido que no esté sujeto a la expresión de los genes, incluso está determinado sus mecanismos
de respuesta al medio ambiente.
Toda la información genética está al interior de cada una de las células y está distribuida en dos
espacios:
• ADN nuclear
• ADN mitocondrial
Las variantes patogénicas (mutaciones) que producen enfermedades genéticas pueden tener
diferentes patrones de herencia llamados: Autosómico Dominante, Autosómico Recesivo, Ligado a X,
Mitocondrial, etc.
• Germinal: estas variantes se originan el ovulo o el espermatozoide y dan origen a las típicas
enfermedades genéticas hereditarias
• Somático: las alteraciones se originan luego de la fecundación, y generalmente solo afectan
parte de un tejido específico como es el caso del cáncer, en el cual existen múltiples
variaciones genéticas en el tejido tumoral.
• Mosaico: las alteraciones se originan luego de la fecundación y generalmente afectan una
línea celular o parte de un tejido especifico y podrían producir malformaciones congénitas,
por ejemplo, síndrome Down Mosaico.
Patrones de herencia
• Mendelianos o clásicos:
o Dominante a afecta a varias generaciones, es suficiente con la presencia de
una variante genética patogénica para desarrollar la enfermedad, puede
subclasificarse en:
▪ Autosómico dominante
▪ Ligado a X dominante
o Recesivo, generalmente solo afecta a una generación, puede existir
consanguinidad y se requiere la presencia de dos variantes patogénicas del
mismo gen en los dos alelos, las cuales pueden ser iguales(homocigoto) o
diferentes (heterocigoto compuesto), también pueden subclasificarse como:
▪ Autosómico recesivo
▪ Ligado a X recesivo
GARD: www.rarediseases.info.nih.gov
Esta página provee información para personal
de salud y también para pacientes, la
información es muy resumida y concreta para
salir de cualquier duda. Sobre enfermedades
genéticas
ClinVar: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/clinvar/
Esta página contiene información sobre las variantes genéticas y su clasificación para establecer
su relación con enfermedades genéticas, es muy útil cuando tenemos un resultado de estudio
genético y necesitamos saber si la variante encontrada tiene relación con la enfermedad que
estamos estudiando, cuáles son los artículos que permiten hacer esta aseveración.
Caso clínico 1:
Manuel es un niño de 1 año, tiene talla corta desde el nacimiento, incluso intra-utero. ¿Cuál podría ser
su diagnóstico?
• OMIM. https://omim.org/ : buscar: Short stature. Luego las características Clínicas # 269880
• LGR. https://www.lrg-sequence.org/ : buscar el gen PIK3R1, los alias del gen y su función
• Clinvar. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/clinvar/ :Variantes del gen y enfermedad relacionada a
PIK3R1:c.893G>A (p.Trp298Ter)
• Gene Reviews. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK1116: Buscar la enfermedad y gen,
mencione los diagnósticos diferenciales y manejo
• Decipher. https://decipher.sanger.ac.uk/ Mencionar que otras enfermedades se relacionan
con este gen.
• GARD. https://rarediseases.info.nih.gov/espanol/12948/sindrome-short
• OrphaNet. https://www.orpha.net/consor/cgi-bin/OC_Exp.php?Lng=GB&Expert=3163
Practica 03
Los diferentes defectos
congénitos requieren una rápida y adecuada intervención, siendo clave la sospecha o
diagnóstico temprano, en esta práctica el alumno revisa los con ceptos y clínicos y
diagnósticos aplicados frecuentemente.
Al momento de nacer se pueden observar las características físicas del recién nacido, las cuales deben
de estar dentro de los parámetros comunes para considerarse normal o sano, sin embargo, un 4 a 8% de
los recién nacidos presenta defectos morfológicos y pueden ser clasificados según:
Efecto en la salud
• Defectos Mayores: si comprometen la vida del RN como es el caso de los problemas
cardiacos, del cerebro, etc.
• Defectos menores cuando afectan los aspectos estéticos de las personas.
Mecanismo de aparición
• Malformación
• Deformación
• Displasia
• Disrupción
• Genéticas: pueden ser por alteraciones en la secuencia del ADN que afecta desde una base
nucleotídica hasta de millones de pares de bases y según sea el caso y el método para su
detección pueden ser clasificadas como:
o Mutación puntal cambios son muy pequeños que apenas afectan de uno a algunos (10
a 100) pares de bases, el método ideal para detectar estas variantes es el
Secuencimaiento.
o CNVS: son variaciones en el número de copias de una determinada región cromosómica
y por lo general afecta decenas y centenas de pares de bases, la cual generalmente
puede ser detectada mediante una técnica conocida como CGH Array
o Cromosómicas debido a cambios del ADN que afectan secuencias de millones de pares
de bases llegando incluso a producir ganancia o pérdida de cromosomas enteros, según
la alteración se pueden clasificar como:
▪ Alteraciones estructurales
▪ Alteraciones Numéricas
Estas alteraciones pueden detectarse mediante el microscopio de luz natural o mediante
el empleo de un método llamado FISH que utiliza un microscopio de luz polarizada para
detectar alteraciones cromosómicas muy específicas mediante el uso de sondas
fluorescentes dirigidas a la región que se sospecha esta alterada.
• Multifactoriales: son el resultado de cambios en múltiples genes con efecto aditivo asociado
a la combinación con factores medioambientales que da origen a diferentes tipos de
manifestaciones clínicas y grados de severidad dependiendo de la cantidad de genes y los
factores medioambientales, generalmente en este grupo se encuentran las llamadas
enfermedades comunes como Diabetes, Hipertensión arterial, asma, etc., también está un
grupo muy importante de defectos congénitos como las cardiopatías no sindrómicas, fisura
labio palatina, trastornos de la mente, etc. Hasta la fecha no existe un método de laboratorio
para poder determinar estas variantes y el efecto medio ambiental, en este caso no se
recomienda ninguna prueba genética para su diagnóstico.
• Medioambientales: son factores medioambientales claramente identificados como por
ejemplo las infecciones maternas (TORCHS), el consumo de sustancias toxicas como el
alcohol o fármacos que alteren el desarrollo embrionario y fetal.
Caso clínico:
1. Paciente mujer de 6 años con discapacidad intelectual leve, microcefalia, retraso del desarrollo
psicomotor, retraso lenguaje, convulsiones febriles, fue estudiada a través de examen de
Microarray, con el resultado: arr[GRCh38] 22q11.21(18929330_21110475)x1.
a. Ingrese a https://www.deciphergenomics.org/ y coloque coordinadas para búsqueda en siguiente
forma: 22:18,929,330-21,110,475
b. Revise pestaña CNV syndrome variants y opine cual es el diagnóstico de la paciente, utilice
página de Home OMIM.
c. ¿Cuál es el gen más relevante dentro de CNV?
d. ¿Qué manejo propone al paciente? Utilice link de Gene Reviews.
Practica 04
El estudiante describe y
reconoce los principales síndromes relacionados trastornos de la diferenciación sexual
y plantea los estudios genéticos más pertinentes
Caso clínico:
Una familia no consanguínea sin antecedentes tiene dos hijos (6 y 8 años) con micropene, testículos
pequeños, cariotipo 46,XY. Estudio de PCR para detección del gen SRY (+). La hija no presenta ningún hallazgo
de importancia. En estudio de WES (secuenciación exómica) se reporta siguiente variante en el gen AR:
NM_000044.6 exon8:c.2667C>T:p.(Ser889Ser).
a. Revise en OMIM la información sobre el gen y entidad clínica.
b. Ubique variante en ClinVar, ¿qué opina?
c. ¿Qué asesoría va a brindar a la familia?
d. ¿Qué tratamiento propone?
Practica 05
Errores Innatos del Metabolismo
Presentación del Paciente: Pedrito es un niño de 4 años que es llevado al departamento de urgencias por
convulsiones recurrentes que han ocurrido durante el último mes. Los padres notaron que las convulsiones
se producen principalmente después de las comidas y son más frecuentes por la mañana. Además de las
convulsiones, los padres han notado retraso en el desarrollo de su hijo y que también muestra un
comportamiento inusual, como irritabilidad y dificultad para comunicarse. Los padres refieren que al nacer le
hicieron tamizaje para enfermedad metabólica, resultados que nunca recogieron, también le guardaron
sangre de cordón umbilical.
Evaluación Clínica: El niño es sometido a una evaluación médica exhaustiva, que incluye un examen físico,
análisis de sangre y estudios de imágenes cerebrales. Los resultados de los análisis de sangre revelan niveles
elevados de amonio en sangre y niveles bajos de citrulina.
Evaluación Genética: en hospitalización le solicitaron un estudio de panel para epilepsias y resultó Negativo.
Luego fue evaluado por genetista a quien le indicaron que su primer hijo (6 años) también presentó las
mismas manifestaciones y por esta razón decidieron darle una dieta especial, incluso el niño rechaza comer
carnes y leches, por estas razones el médico solicitó panel para enfermedades metabólicas y se encontró:
NM_000531.6(OTC):c.119G>A (p.Arg40His) y NM_000531.6(OTC):c.608C>T (p.Ser203Phe)
A continuación, realice:
- Heredograma
- Presunción diagnostica
- Interpretación de estudio genético
- Diagnóstico definitivo
- Manejo del paciente
Practica 06
Genética de la
discapacidad intelectual, trastorno de espectro autista, trastornos de conducta.
Diagnóstico, test genéticos en discapacidad intelectual
Paciente de 6 años fue traído por sus padres por no rendir en estudios regulares. Al evaluarlo en Servicio de
Salud Mental, le diagnostican Discapacidad Intelectual moderada y Retraso de Lenguaje. Al examinarlo
usted encuentra conducta agresiva, clinodactilia bilateral y pies planos. Estudio de cariotipo muestra 46,XY.
Usted solicita Microarray CGH con resultado: arr[hg38] 22q13.31q13.33(46,315,752-50,784,097)x1.
Paciente de 4 años es traído a la consulta por el abuelo por retraso de lenguaje (recién tiene 10 palabras) y
retraso motor, hace un mes que inició deambulación independiente. Al examen le impresiona atrofia de los
músculos de miembros inferiores, pero CPK está normal. En microarray solicitado se encontró siguiente
CNV: arr[hg38] 15q14(34,297,177-34,371,894)x1.
Caso 01.
Lactante de tres meses de edad, controles prenatales normales, parto eutócico, APGAR 8, sin antecedentes
familiares de enfermedades crónicas o genéticas. Fallece súbitamente en casa, se le realizo autopsia y se
encontró miocardiopatía hipertrófica.
Resultados:
- Cariotipo: no realizado
- CGH array: no realizado
- FISH: no realizado
- Exoma: 4813 genes (exoma clínico)
o Variante patogénica en el gen ELAC2, (c.210_222 del p.Gly71ThrfsTer26)
o Variante probablemente patogénica en el mismo gen ELAC2 (c.1177C>T p.His393Tyr)
o Variante patogénica en el exón 358 del gen TTN, (c.104515C>T, het p.Arg34839X)
o VUS (variante de significado incierto) en el gen MYPN (c.2428C>T, p.Arg810Cys)
o Polimorfismo en el exón 16 en el gen LRP8, (c.2066G>A, het, p.R689Q).
Practica 09
Reproducción Humana e Infertilidad
Zacarias de 35 años y su pareja de 32 años viven juntos hace 5 años, y hace 3 años han intentado tener un
bebé, pero que los dos embarazos que lograron culminaron en abortos espontáneos tempranos.
Actualmente han buscado asesoramiento genético y como parte de las evaluaciones se le ha solicitado
estudio de citogenética a ambos, con resultados:
Zacarias: 46, XY
Indicar:
Casi clínico
María, una mujer de 22 años. Ha sufrido numerosos episodios de sinusitis, otitis media, neumonía y
gastroenteritis. Su historial médico incluye múltiples cursos de antibióticos y tratamientos sin mejoría
duradera. Durante la consulta de genética se observan niveles bajos de inmunoglobulinas, especialmente
IgG, IgA e IgM y está pendiente la evaluación por inmunología para descartar otras causas de
inmunodeficiencia secundaria.
Maria es la tercera hermana, su hermano mayor falleció a los 3 años por neumonía luego de que el médico
le diera antibióticos y no respondiera, también tiene una hermana de 24 años que no refiere ninguna
enfermedad, sus padres y abuelos son sanos.
Resolver:
1. patrón de herencia
2. Probable síndrome
3. Estudio molecular por solicitar y posible gen mutado
4. Tratamiento
Practica 11
Genética del cáncer
Practica oncogenetica
Historia del paciente: Un niño de 8 años es llevado por sus padres a la consulta médica debido a una historia
de infecciones recurrentes y retraso en el desarrollo. La madre refiere que el niño ha experimentado
dificultades para mantener el equilibrio desde una edad temprana y que a menudo se cae. Además, ha notado
pequeños capilares dilatados en la piel y áreas telangiectasias, especialmente en la región ocular.
Antecedentes Familiares: La madre menciona que un hermano mayor del niño murió a una edad temprana
debido a un cáncer infantil no especificado, también señalo que su madre tubo cáncer de mama. El padre del
niño refiere haber sido diagnosticado de cáncer de páncreas y su abuela materna de cáncer de mama
Hallazgos Clínicos: Examen físico revela:
Evaluación Adicional:
1. Radiografía de tórax: Muestra signos de bronquiectasias.
2. Análisis de sangre: Se encuentra anemia, linfopenia y niveles elevados de alfa-fetoproteína (AFP).
3. Pruebas genéticas: Se identifica dos mutaciones en el gen ATM:c.6100>T (p.R3024*) y ATM:
c.5825C>T (p.Ala1942Val)
Resolver
1. Patrón de herencia
2. Diagnostico más probable y estudio genético a solicitar en los padres
3. Plan de control y seguimiento para la familia
4. asesoría genética y riesgos
Practica 12
Síndromes Genéticos
frecuentes en la práctica clínica
1. Usted atiende a la paciente Adriana de 7 meses de edad, que presenta hipotonía axial, retraso del
crecimiento y desarrollo, le llama atención mandíbula pequeña y soplo sistólico. No hay ningún
antecedente relevante en la familia. Usted solicita microarray, con el resultado: arr[GRCh38]
7q11.23(73236087_74740069)x1.
a. Ingrese coordinadas en DECIPHER, ¿qué opina de la variante a simple vista?
b. ¿Con que síndrome se relaciona?
c. ¿En el fragmento delecionado se encuentra el gen NCF1? ¿Qué significa esto para la paciente?
d. ¿Qué estudios quisiera completar a la paciente en este caso?
2. A la consulta pediátrica acude recién nacido por retraso del crecimiento y soplo cardiaco. Usted nota
implantación baja de orejas, pliegue de esfinge en el niño y en su madre, con talla de 1.40 m.
Estudio ecocardiográfico confirma su sospecha, detectando estenosis pulmonar. Como resultado de
estudio panel NGS para rasopatías, ud. recibe informe: NM_002834.5(PTPN11): c.215C>G
(p.Ala72Gly).
a. Ubique la variante en ClinVar, interprete
b. Usando DECIPHER, ubique el dominio donde se encuentra variante, describe dominio.
c. ¿Qué estudio puede solicitar a la madre, a hermana sana?
d. ¿Qué manejo va a proponer al niño?
Practica 13
Asesoría Genética:
Prevención de Enfermedades genéticas
Introducción: Las enfermedades genéticas suelen ser discapacitantes, no son curables y sus
posibilidades de tratamiento son limitadas. Es por eso la importancia de prevenirlas. Hay diferentes
estrategias de prevención, dependiendo del tipo de anomalía genética, forma de herencia, ubicación
del interesado dentro de la genealogía y otros parámetros. Toda forma de prevención empieza con
una adecuada asesoría genética.
Objetivos:
3. Evaluar casos que presentan posible riesgo genético y calcular éste.
4. Discutir los diferentes elementos que intervienen en la percepción de riesgo.
5. Redactar informes dirigidos a pacientes y familias, tomando en cuenta las variantes socioculturales
y éticas
Metodología
Paso 1: Revisión de la bibliografía referentes a distrofia miotónica y elaborar una genealogía con los
datos que se indican. https://www.omim.org/entry/160900?search=dm1&highlight=dm1
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK1165/
Caso 01:
El caso índice (IV-3) es una recién nacida con hipotonía y graves problemas respiratorios. La madre (III-2) tiene
24 años. Su primera hija (IV-1) tenía síntomas similares a IV-3, y falleció a los dos días de edad, sin un
diagnóstico específico. Del segundo embarazo nació un varón sano (IV-2), que tiene ahora 2 años. El
neurólogo a quien se consulta por el caso de IV-3 sospecha que ella puede tener DM1 y realiza los análisis
moleculares que confirman el diagnóstico. El examen clínico de III-2 indica una leve miotonía (desapercibida
para la paciente y su entorno) y el examen molecular indica la presencia de un alelo expandido. III-2 tiene tres
hermanos, todos aparentemente sanos: III-3 varón soltero, III-4 varón cuya novia está gestando y III- 6 mujer
de 18 años. El padre de ellos (II- 2), sano, falleció en un accidente a los 46 años; tenía solo un hermano mayor
del que no se tienen datos. La madre de III-2 y sus hermanos es II-3, de 49 años, sana y sin antecedentes de
patología neurológica en ella ni en sus 6 hermanos.
Practica 14
Perspectivas de
tratamiento de enfermedades genéticas
Actividad: