La guía de estudio aborda las generalidades de los ácidos nucleicos y nucleótidos, incluyendo definiciones, características, y diferencias entre ribonucleótidos y deoxirribonucleótidos. Se evalúan conceptos como la estructura del ADN, su orientación, conformaciones, funciones, y experimentos históricos que contribuyeron a su comprensión. Además, se incluyen preguntas sobre ARN, desnaturalización, renaturalización, y aplicaciones de híbridos de ácidos nucleicos.
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La guía de estudio aborda las generalidades de los ácidos nucleicos y nucleótidos, incluyendo definiciones, características, y diferencias entre ribonucleótidos y deoxirribonucleótidos. Se evalúan conceptos como la estructura del ADN, su orientación, conformaciones, funciones, y experimentos históricos que contribuyeron a su comprensión. Además, se incluyen preguntas sobre ARN, desnaturalización, renaturalización, y aplicaciones de híbridos de ácidos nucleicos.
La guía de estudio aborda las generalidades de los ácidos nucleicos y nucleótidos, incluyendo definiciones, características, y diferencias entre ribonucleótidos y deoxirribonucleótidos. Se evalúan conceptos como la estructura del ADN, su orientación, conformaciones, funciones, y experimentos históricos que contribuyeron a su comprensión. Además, se incluyen preguntas sobre ARN, desnaturalización, renaturalización, y aplicaciones de híbridos de ácidos nucleicos.
La guía de estudio aborda las generalidades de los ácidos nucleicos y nucleótidos, incluyendo definiciones, características, y diferencias entre ribonucleótidos y deoxirribonucleótidos. Se evalúan conceptos como la estructura del ADN, su orientación, conformaciones, funciones, y experimentos históricos que contribuyeron a su comprensión. Además, se incluyen preguntas sobre ARN, desnaturalización, renaturalización, y aplicaciones de híbridos de ácidos nucleicos.
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Universidad de San Carlos de Guatemala
Facultad de Ciencias Químicas y Farmacia
Escuela de Química Biológica Departamento de Bioquímica Biología Molecular
Guía de estudio No.1
Generalidades de ácidos nucleicos
Instrucciones La presente guía no debe ser entregada resuelta, servirá como material de apoyo para el estudio del tema correspondiente.
El contenido de la presente guía de estudio será evaluado en un examen corto el
viernes 24 de enero durante el período de clase, así como en el primer parcial y el examen final del curso.
Preguntas 1. Defina que son nucleótidos, indique sus características químicas, componentes, diferencias entre tipos de nucleótidos (ribonucleótidos y deoxirribonucleótidos), ¿cuáles se encuentran presentes en ambos tipos de ácidos nucleicos? ¿Cuáles se encuentran presentes solo en un tipo de ácido nucleico? Escriba las diferencias entre nucleótido y nucleósido. 2. ¿Cuáles son los compuestos parentales de los cuales derivan las bases nitrogenadas? 3. Ácidos nucleicos (polímero de nucleótidos): indique sus características, la forma en que se organizan los elementos del nucleótido en la cadena, tipos de ácidos nucleicos. 4. Explique cómo se determina la orientación de las hebras de ADN. Dibuje una secuencia de ADN e identifique los extremos 5´ y 3´. ¿En base a que características de su estructura se definen dichos “extremos”? ¿Entre cuales carbonos se encuentran los enlaces fosfodiéster? Identifíquelos en la cadena. Se sugiere revisar la figura 8-7 de Nelson & Cox, 2018. 5. Explique en qué consiste el modelo estructural del ADN propuesto por Watson y Crick en 1953. Explique los términos “complementario” y “antiparalelo”. 6. Con respecto a la conformación del ADN, ¿cuáles son las diferencias entre las conformaciones A, B y Z? ¿Son estas conformaciones intercambiables en el ambiente celular? Explique. 7. ¿Cuáles son las funciones conocidas del ADN? 8. Explique en qué consisten las secuencias palindrómicas, de imagen especular y cruciformes. Ejemplifique, por medio de secuencias de 15 a 20 nucleótidos una secuencia palindrómica y una imagen especular, compare. 9. Explique que son las posiciones y el apareamiento de Hoogsteen. ¿Hacen posible la formación de hebras triples y cuádruples de ADN? ¿Qué funciones fisiológicas pueden tener las hebras triples de ADN? 10. Explique en qué consiste la desnaturalización y la renaturalización del ADN. ¿Qué agentes producen estos cambios en la estructura de la molécula? ¿Qué es un dúplex híbrido? ¿Qué es el Tm? 11. Reglas de Chargaff, ¿cuáles son?, ¿cuál es su importancia en el entendimiento de la estructura del ADN? 12. Describa, brevemente, los aportes de Rosalind Franklin y Maurice Wilkins en el entendimiento de la estructura del ADN. 13. Investigue los experimentos de a) Griffith (1928), b) Avery O., MacLeod C., & McCarty M. (1944); y c) Hershey A.D. & Chase M. (1952). ¿Cuál fue el principal aporte de estos experimentos? (Se recomienda revisar la cuarta edición de la Bioquímica de Lehninger [2005]). Nota: En la sección de anexos podrá encontrar algunos enlaces que presentan una descripción breve de cada tema. 14. Enumere las principales clases de ARN existentes y sus funciones. 15. Explique cómo se determina la orientación de las hebras de ARN. 16. ¿Qué conformación tiende a asumir el ARN después de la transcripción? 17. Identifique en un dibujo las principales estructuras secundarias del ARN: protuberancias, horquillas, bucles internos, estructuras helicoidales con apareamiento de bases. 18. ¿Cuáles son los apareamientos de bases que se dan entre cadenas sencillas de ARN con segmentos autocomplementarios? 19. ¿Es posible que un ARN forme estructuras terciarias? 20. Cite algunas otras funciones de los nucleótidos 21. Explique en qué consiste la desnaturalización parcial y total del ADN. ¿Implica rotura de los enlaces covalentes de las hélices? ¿En cuáles situaciones ocurre? Explique. 22. ¿Cuáles son las fases de renaturalización del ADN en solución? 23. ¿En qué consiste el efecto hipocrómico? 24. ¿En qué consiste la formación de híbridos de ácidos nucleicos? 25. ¿Qué híbridos de ácidos nucleicos pueden formarse en el laboratorio? Mencione sus aplicaciones.
Razonamiento En su laboratorio está haciendo el análisis de dos secuencias de ADN pertenecientes a dos especies bacterianas no identificadas, P y Q. Al secuenciar, nota que la bacteria P tiene un 35% de la base nucleotídica A (adenina), mientras que la bacteria Q tiene un 10% de la misma base (A), del total de sus bases. a. Indique que porcentajes de G, C y T se encontrarán en la secuencia de ADN de P y en la de Q
Bact P % Bact Q % A 35% A 10% T T G G C C
b. ¿Cuál de las dos especies tiene el Tm (punto de fusión, temperatura de
desnaturalización) más alto? Explique cómo llegó a su respuesta. c. Si el ADN de ambas especies se somete a un proceso de calentamiento que va de 25 a 95°C, ¿cuál de las dos especies sería la primera en desnaturalizar su ADN? Explique su razonamiento. d. ¿Cuál de las dos bacterias tendrá su hábitat natural en las aguas termales del volcán Pacaya? Explique por qué. Anexos A continuación, encontrará enlaces a videos o animaciones que presentan una visión general de los experimentos indicados en la pregunta 13.
Experimento de Griffith: https://youtu.be/QtkQf3ISZ0c?si=OyvhVrd91gpATHmP
Experimento de Avery, MacLeod y McCarthy: https://dnalc.cshl.edu/view/16375-Animation- 17-A-gene-is-made-of-DNA-.html Experimento de Hershey y Chase: https://dnalc.cshl.edu/view/16020-Alfred-Hershey-and- Martha-Chase-1952.html
Referencia Capítulo 8: Nucleótidos y ácidos nucleicos. Nelson, D.L. & Cox, M.M. (2018). Lehninger Principios de Bioquímica (7ma ed). Barcelona, España.: Ediciones Omega.
Conformación de Un Banco de Hongos Filamentosos y Levaduras en El Laboratorio de Investigaciones en Microbiología Avanzada de La Universidad Francisco de Paula Santander
