TD de Génétique
TD de Génétique
TD de Génétique
Dfinition :
Cest lensemble de modifications quune cellule subit entre sa formation
par division de la cellule mre et le moment o cette cellule a fini de se
diviser en 2 cellules filles (dure de vie dune cellule).
Le cycle cellulaire comprend 2 priodes principales : lInterphase pendant
laquelle la cellule croit et poursuit la majeur partie de ces activits
(synthse denzymes et dhormones).
Et la phase de division cellulaire (mitose) pendant laquelle elle se divise en
2.
LInterphase :
Elle constitue la plus grande partie du cycle cellulaire, cest la priode
entre la fin dune division et le dbut de la suivante, le noyau est
mcaniquement inactif.
La dure de cette phase varie dun type cellulaire un autre, elle tre de
quelques heures, quelques mois, ou plusieurs annes. Par ex : la cellule
intestinale se divise deux fois par jour, la cellule hpatique se divise 2 ou 1
fois par an.
Il est plus juste dappeler cette phase par la phase mtabolique ou phase
de croissance (le noyau en ralit est actif).
Linterphase se divise en trois tapes :
A- La phase G1 (GAP 1) :
Sa dure varie selon la nature de la cellule ex : 1H pour les cellules
embryonnaires, 6mois pour les cellules hpatiques, et elle peut atteindre
plusieurs annes (dans ce cas la cellule entre en phase G0) ex : la cellule
nerveuse.
La variabilit de la dure de linterphase de chaque type cellulaire dpend
en fait de la phase G1.
A la fin de la phase G1, la cellule peut soit entrer en phase G0 ou bien en
phase S puis atteindre une mitose car il existe un point de retour (point de
restriction) au-del duquel les cellules entrent obligatoirement dans la
succession des phases : S, G2 et M quelques soient les conditions du
milieu. Ce point de restriction se situe au stade tardif de la phase G1.
La cellule noforme contient la quantit dADN caractristique de
lespce (2n chromosomes), cette quantit reste fixe pendant toute la
dure de la phase G1 car il n ya pas de synthse dADN.
La synthse des diffrents ARN dans le noyau (transcription), et des
protines dans le cytoplasme (traduction) est trs active. La cellule
effectue sa croissance et sa diffrenciation et sa diffrenciation, elle rpare
les anomalies qui peuvent apparatre dans lADN.
B- La phase S (SYNTHESE) :
Elle prcise (facteurs de croissance, association cyclines, CDK)
Elle correspond la synthse dADN dont la quantit va doubler, la fin de
la phase S (22n chromosomes). A cot de la rplication de lADN, il ya
synthse accrue des protines histones. La synthse des protines et des
ARN se poursuit.
C- La phase G2 (GAP 2) :
Cest une phase pratiquement constante, dune dure allant de 4-5 H, elle
dbute ds que la rplication dADN est acheve, cette phase prpare la
mitose, un certain nombre de facteurs est synthtis en particulier : les
facteurs de condensation, des chromosomes, et la synthse de certains
protines qui participent la formation du fuseau mitotique, la synthse
dARN et des protines continue.
La division cellulaire :
A- La Mitose :
Cest la phase de division cellulaire qui va donner 2 cellules filles,
identiques la cellule mre avec une quantit de 2n chromosomes. La
Mitose intresse touts les lments nuclaires (cest la caryodirse) et
touts les lments cytoplasmiques (cest la cytodirse)
Elle est caractrise par : - une spiralisation des chromosomes qui se
regroupent puis se sparent en nombres gaux pour se rpartir en 2
cellules filles. Lapparition dans le cytoplasme du fuseau mitotique qui
guidera le mouvement des chromosomes.
- une reconstitution du noyau de chacune des
cellules filles la fin de la mitose.
1- La Prophase (10_ 15 min) :
- Condensation des chromosomes en 2 chromatides.
- Fragmentation de lenveloppe nuclaire.
- Apparition des microtubules du fuseau mitotique et
les centrioles atteignent les ples cellulaires.
A la fin de la prophase, il ya une Pr mtaphase : apparition des
Kintochores, et migration des chromosomes vers la Plaque quatoriale.
2- Mtaphase :
Le chromosome est condens au maximum, il est dispos sur la plaque
quatoriale. Le fuseau mitotique est form de microtubules polaires et
kintochoriens.
3- Anaphase (5_8 min) :
- Sparation des chromatides surs par fissuration
du centromre.
- Migration de chaque chromatide vers un pole
cellulaire.
- A la fin de cette phase, il ya le dbut de la
cytodirse par apparition sur la membrane
cellulaire dun sillon de division.
4- Tlophase (20 min) :
-Reconstitution des 2 noyaux filles (dcondensation des
chromosomes).
-Apparition de la membrane nuclaire+ le nuclole.
Aprs accomplissement de la cytodirse il en rsulte 2 cellules filles.
B- La Miose :
Cest un mode de division cellulaire particulier, il se droule seulement
dans les cellules germinales afin dobtenir des cellules n chromosomes
Dfinitions :
AG
1
C T
Proprits physico-chimiques :
A- effet des acides :
Dans un acide fort ex lacide perchlorique HClO4, une temprature
T=100C, les acides nucliques sont compltement hydrolyss en leurs
constituants : base, sucre,phosphate.
Dans un acide plus dilu un PH=3 ou4, les liaisons glucosidiques fixes
entre la base purique et sucre shydrolysent : lacide devient apurinique.
B- effet de lalcalinit :
Llvation du PH au dessus du PH physiologique (7et 8) affecte les
liaisons hydrogne entre les bases. Il en rsulte une dnaturation de la
molcule dADN (lADN double hlice va donner 2 brins dADN spars).
LARN shydrolyse un PH lev par clivage intra molculaire du squelette
phospho diester
C- dnaturation chimique :
un PH neutre, plusieurs produits chimiques peuvent dnaturer lADN ou
lARN ex : lure (H2N_CO_NH2 : produit naturel qui rsulte du catabolisme
des protines et qui est limin par les urines), le Formamide (CO_NH3 :
produit utilis dans le squenage de lADN).
D- viscosit :
LADN dun chromosome est long et mince. Son diamtre est de 2nm et sa
longueur varie du m jusquau mm voire cm. Chez les eucaryotes (si elle
est dgrade de ces histones).
Si lADN possdait un mme diamtre que les spaghettis, le chromosome
de E.Coli aurait une longueur dun kilomtre : lADN est une molcule
relativement rigide.
A- absorption des UV :
LADN absorbe les rayons UV grce la nature aromatique (cyclique) des
bases.
La longueur donde de labsorption maximale dun rayon par lADN et
lARN est de 260 nm
max=260 nm alors que max des protines est gale 280nm.
Les proprits dabsorption de lADN peuvent tre utilises pour :
- La dtection.
- La quantification.
- Lvaluation de la puret de lADN dans un
chantillon donn.
B- puret de lADN :
A260
A280
1,8
A280
A280
A260
A280
1,8 :
A280
1,8 : il est
LADN mitochondrial :
Dfinition :
Les mitochondries possdent un gnome autonome, mais trs largement
insuffisant pour coder pour toutes les protines dont elles ont besoin. Ces
protines sont majoritairement importes du cytosol (donc codes par
lADN nuclaire).
Bien que lADN mitochondrial soit court, il reprsente une quantit dADN
non ngligeable puisquon retrouve plusieurs copies par mitochondrie (2
10), et quune seule cellule possde plusieurs milliers de mitochondries.
Ce gnome a la particularit dtre transmis par la mre.
Structure :
Le gnome mitochondrial des mammifres est petit et compacte, il est
circulaire, lun des 2 brins est appel Heavy (H) et lautre est appel
Light (L).
Le gnome mitochondrial humain a t totalement squenc, il a une
longueur de 16569 Pb, il code pour 13chaines polypeptidiques, 22 ARNt et
pour les ARNr : 12S, 16S.
La plupart des gnes sont situs dans le brin H.
A lexception de lorigine de rplication, tout le gnome est codant il ya
mme quelques gnes chevauchants.
Les gnes ne possdent pas de promoteurs individualiss.
Touts les gnes sauf 2 : ATPase 6, CO3 sont spars par des gnes dARNt,
ces ARNt constituent ainsi de signaux de ponctuation mutation
ponctuelle
Touts les gnes transcrits sont dans le mme sens sauf le gne ND6 qui
est le seul gne du brin L qui code pour le polypeptide.
Une partie des chanes polypeptidiques appartenaient des enzymes de la
membrane interne de la mitochondrie est code par lADN nuclaire. Ces
polypeptides sont synthtiss dans le cytoplasme et pntrent dans la
mitochondrie o ils sassocient aux polypeptides cods par lADN
mitochondrial pour former lenzyme actif qui sinsert dans la membrane.
Pathologies mitochondriales :
1
2
3
LARNm est initialement transcrit sous forme dun prcurseur appel PRE
ARNm qui contient des squences non codantes (Introns) qui seront
limins lors de lepissage puis 2 types de modification touchent les
extrmits 3 et 5 qui sont respectivement : la coiffe et la queue
Epissage diffrentiel :
*Le gne de la Globine est situ sur le bras court du chromosome 11, et
occupe 1,6 KB.
* code pour un poly peptide de 164 acides amins.
* contient 2 introns et 3exons.
* ce gne + les autres gnes plus complexes des globines sont transcrits
du centromre vers le tlomre.
* les introns + les exons+ les squences flanquantes (boite TATA, boite
CAT), le tout stend sur 2Kb (donc ces 2 KB englobent la totalit des
squences requises pour coder et rguler lexpression du gne).
1-Dbut de la transcription :
Le promoteur est constitu dune srie dlments courts et fonctionnels
qui interagissent avec des protines spcifiques qui rgulent la
transcription :
La boite TATA : elle est localise 25 du dbut de transcription, elle
permet de dterminer le dpart de la transcription.
La boite CAT : situe -70 du dbut de transcription.
Squence CACCC : situe -9 de la boite CAT (rgion rgulatrice).
Une mutation ces 3 niveaux entrane une rduction du niveau de
transcription.
En amont du cite de traduction (50 bases transcrites mais non traduites).
Il existe dautres squences ( part du promoteur) qui permettent de
modifier de faon relle lefficacit de transcription : les activateurs qui
peuvent agir de trs grandes distances (quelques kilo bases) du gne
pour stimuler la transcription dans le gne : Activateur spcifique (3 en
aval du cite de poly adnylation) qui agit avec les protines spcifiques et
entranent la stimulation de la transcription.
2- Epissage de lARNm :
La traduction :
Le syndrome de lX fragile :
Les mutations :
Les mutations ponctuelles :
Plusieurs catgories mais diffrentes par les consquences sur la protine
code par le gne mut :
1- Les mutations faux-sens :
Altration dune seule base de faon modifier le codon donc lacide
amin sera lui aussi modifi. Gnralement cest la premire ou la
dernire base, si elle touche des rgions importantes de protine pour sa
structure ou sa fonction (effet dlteur et production un phnotype
mutant).
2- Les mutations non-sens :
Change le codon dun acide amin ou un codon stop qui entrane un arrt
prmatur de la traduction, la protine qui apparat est plus courte en sa
rgion C terminale (phnotype mut).
3- Les mutations Frame shift :
Insertion ou la dltion dune base existant dans la squence. La phase de
lecture est modifie et le ribosome lira un ensemble de codons diffrents
en aval de la mutation.
4- Les mutations silencieuses :
Se produisent au niveau de la 3e base mais pas de changement de lacide
amin, ces mutations nont pas deffets sur la protine code (pas de
phnotype mut).
Sang
groupage
A
B
AB
O
Anti A
+
+
-
SERUM
Anti B
+
+
-
CONCENTRE GLOBULAIRE
AG A AG B AG
Rh
AB
+
+
+/+
+
+/+/+
+
+
+/-
Gntique :
Il ya 4 allles au locus ABO : A1, A2, B, O, lallle A et B du systme ABO
sont reconnus conjointement ltat htrozygote, ils sont donc
codominants.
Lallle O tant rcessif par rapport aux allles A et B, les gnes codant
pour les anti-gnes ABO sont situs sur le chromosome 9. Ils sont transmis
selon le mode autosomique dominant.
Les gnes A et B produisent des enzymes qui dclenchent la formation des
anti-gnes A etB.
On a 6 gnotypes qui sont :
1- A/A, A/O (tous 2 du phnotype A).
2- B/B, B/O (tous 2 du phnotype B).
3- A/B (codominance).
4- O/O (phnotype O).
Le systme Rhsus :
Lanti-gne D : si un sujet possde des AG D donc il est rhsus +, sinon
cest un rhsus -.
Si un patient a un Rh + on peut le transfuser du Rh+ et du Rh-.
Si un patient a un Rh- , il est fortement conseill de lui transfuser du Rh-,
sinon on le transfuse du Rh+ mais il faut limmuniser contre lAG D.
Lcriture
ORh
est fausse puisque les 2 caractres sont ports sur 2
ORh
Introduction :
Tabac 24%
Alcool 11%
Alimentation 35%
Infections 15%
Hormones de la reproduction 12%
Radiations (UV, Radon) 5%
Expositions professionnelles 2%
Pollution 2%
Inactivit physique 1%
Pratiques mdicales 1%