Biochimie cellulaire et

fonctionnelle

Licence Biochimie
Dr. Bouridane Hamida

2024/2025
Objectifs de l’enseignement

donner les bases de:

la compartimentation intracellulaire et son intégration dans la
fonction cellulaire,

la dynamique membranaire,

la transmission des signaux intracellulaires à partir de ligands

hydrophiles.

Initiation à la génomique biochimique

Pré-requis

L’étudiant devra avoir les bases en Biologie cellulaire, biochimie,

Immunologie, microbiologie et génétique
 Contenu de la matière:

• Chapitre 01: comprtimentation fonctionnelle de la cellule

• Chapitre 02: Biomembranes

• Chapitre 03: Relation structu-fonction de la cellule

• Chapitre 04: La glycosylation des macromolécules et rôle biologique

• Chapitre 05: Transducion du signale et régulation de l fonction cellulaire

• Chapitre 06: Anomalies de signalisation et pathologie

Chapitre 1:Compartimentation
fonctionnelle de la cellule
 Introduction
Les être vivants sont constitués de cellules.
Quelques uns ne sont constitués que par une seule
cellule. Le plus souvent les organismes sont
construits à partir de milliard de cellules groupées
en tissus, ayant des fonctions différentes et
complémentaires, et reliées par des systèmes de
communication.

La cellule est l’unité structurale, fonctionnelle et

reproductrice constituant les organismes vivants
a. Généralités
Les virus ne constituent qu’une exception apparente:
Organismes acellulaires simples.
Parasites intracellulaires obligatoires.
Comparaison entre virus et organismes cellulaires
Virus Organismes cellulaires
 Organisation simple et acellulaire. Organisation complexe.
Contiennent soit de l’ADN ou de Contiennent de l’ADN et de
l’ARN mais pas les deux (il existe des l’ARN.
exceptions). Effectuent la division cellulaire
Ne peuvent se multiplier et se pour se multiplier et se diviser.
diviser indépendamment des cellules Certains sont des parasites
vivantes. intracellulaires obligatoires.
Ce sont tous des parasites
intracellulaires obligatoires.
On peut distinguer deux types de virus:

Les virus a capside: l’acide nucléique est entouré seulement par une
capside (coque) protéique.

Les virus a enveloppe : en plus de la capside possède une enveloppe

ayant plus ou moins la structure d’une membrane plasmique.

Fig1. Organisation des virus

les cellules existent sous une variété extraordinaire de taille et
de forme telle que les bactéries, les globules rouges, les
Algues, les cellules végétales, etc

On peut classifier les cellules selon l’organisation du matériel

génétique et on peut distinguer les cellules procaryotes et
les cellules eucaryotes.(fig.2)

b. Les variétés cellulaires

1. Les cellules procaryotes: ( pro, primatif, Karuon, noyau):
Telles les bactéries et les Algues bleu-vert sont constituées
d’un compartiment unique entouré d’une membrane
plasmique, ne possèdent pas de noyau bien définit et ont une
organisation interne simple. Ces cellules contiennent un
chromosome unique formé d’une molécule d’ADN circulaire
ou linéaire libre ( nucléoide) situé dans le cytoplasme.
1. Les cellules eucaryotes: (vrai noyau en latin)
se caractérisent par une enveloppe nucléaire qui divise la cellule en
deux compartiments; le noyau et le cytoplasme. ce dernier est délimité
par la membrane plasmique.

Dans la cellule végétale (Fig.3), la membrane plasmique est

recouverte et protégée extérieurement par une paroi cellulaire plus
épaisse percée de canalicules, les plasmodesmes, sites de
communications avec les cellules voisines grâce à de fins prolongements
cytoplasmiques.

Dans les cellules animales (Fig.3), certaines régions de la membrane

plasmique sont recouvertes par une mince couche de matériel que l’on
désigne habituellement sous le nom d’enveloppe externe.
Il peuvent être classés en deux groupes principaux:
Les eucaryotes unicellulaire: ex: les levures, les algues unicellulaires,
etc
Les eucaryotes pluricellulaire: son les plus nombreux constitués de mallions
de milliards de cellules.

(a) (b)
Fig 02: Représentation schématique (3D) des cellules Eucarytes (b) et procaryotes (a)
Tableau 01: Principales différences entre les cellules procaryotes et eucaryotes
Tableau 02: Comparaison entre la cellule animale et végétale
Fig 03: Représentation schématique d’une cellules Eucaryte Animale et Végétale
C. Descriptions et fonction des constituants de la cellule:
La cellule est délimitée par une membrane plasmique qui constitue une
surface d’échange permettant la mise en place du flux. Elles est
composée par des organites intra-cellulaire (Fig 2, 3) .

Les cellules est donc constitué d’un système complexe de membranes

délimitant des compartiments au sein desquels vont se dérouler les
réactions biochimiques bien définies.

1. Le Cytoplasme: une phase liquide d’une émulsion colloïdale est

composé du cytosol et des organites cytoplasmiques qui y sont en
suspension.
2. Le Cytosol: (hyaloplasme):il s’agit d’une fraction liquide du
cytoplasme, obtenue après centrifugation et élimination des
organites.ces derniers représentent une fraction du volume
intracellulaire très variable comme le montre le tableau 03. Il
représente le site de la synthèse des protéines et du métabolisme
cellulaire intermédiaire.
 Tableau 03: Volume relatif des principaux compartiments intracellulaire d’une cellule du
foie (hépatocyte).

Ces chiffres peuvent varier de manière importante suivant le type

cellulaire et l’activité de la cellule.
Le cytosol est également riche en ions notamment en Na +, K+, Cl-, Mg 2+,
Ca2+. Il comporte certains gaz dissous comme l’O2 et CO2.

Le tableau ci-après illustre la composition du cytosol des mammmifères

Tableau 04: composition ionique du cytosol des

mammifères
Les différents fonctions du cytosol: principalement 3 fonctions
a. Reserve de matériaux:
Réserve de matériaux pour de nombreuses fonctions cellulaires; il
participe à la régulation des pH intra et extracellulaire grâce à sa grande
quantité d’eau et d’ions.

réserve énergétique grâce aux vacuoles lipidique et glycogénique.

Permet le transit de molécules protéiques et de macromolécules.

b. Carrefour de voies métaboliques:
Permettant le déroulement de nombreuses réactions enzymatiques
et l’échange de métabolites et produits de réaction avec les autres
compartiments.
 le milieu de réaction anabolique et catabolique des glucides, des
acides aminés, des acides gras et des nucléotides.
 c. Transduction du signal:
Transmettre des signaux à partir de la membrane plasmique vers les
organites et le noyau il s’agit de transduction du signal qui fait appel à
nombreuses protéines notamment des enzymes fixées sous la
membrane plasmique ou en solution.

3. Les inclusion:
Ne sont pas des éléments fonctionnels mais des substances chimiques
qui peuvent etre présentes ou non, selon le type de celule considéré.
par exemple:
Les granules de glycogène qui se trouvent en abondance dans les
cellules du foie et des muscles,

Les gouttelettes de lipides communs dans les cellules adipeuses,

Les granules de pigments (mélanine) présentes dans certaines

cellules de la peau et dans les poils, ainsi que divers types de cristaux.
4. Noyau:
Le noyau est l’organite qui a donné son nom aux eucaryotes(eu= vrai ,
caros= noyau), bien que quelque-uns puissent en étre dépourvus à
certains stades de leur existence (les globules rouges chez les
mammifères).il est séparé du cytosol par une enveloppe nucléaire
comprenant des pores (Fig.4).
On peut observez, chez les Eucaryotes, du coté interne de l’enveloppe
nucléaire l’existence d’une couche de protéines appelée lamina
nucléaire, qui a pour role de stabiliser la membrane nucléaire et qui
permet aussi l’ancrage des chromosomes.

Fig 04: Structure 3D du noyau

5. Le matériel génétique:
Toute cellule contient de l’ADN. Chez les organismes les plus simples , les
procaryotes, la majeur partie du matériel génétique réside dans un seul
double brin, circulaire, d’ADN, situé dans la zone centrale de la cellule
appelée nucléoïde.

L’ADN des eucaryotes entouré d’une enveloppe nucléaire. Dans les deux
types d’organismes, l’ADN codent pour les protéines que la cellule
synthétise.

Nucléole:
Petit corps sphérique du noyau cellulaire contenant les acides
nucléiques (ARN) et des protéines et qui est le lieu de la synthèse de
l’ARN ribosomale.
Domaine nucléaire dynamique, son activité reflète un équilibre entre le
niveau de synthèse des ARN ribosomiques (ARNr),
directement lié à la croissance et à la prolifération cellulaires, l’efficacité
de la maturation des ARNr, et le transport des sous-unités ribosomiques
vers le cytoplasme (Fig.4)..

6. Membrane plasmique
La membrane plasmique, également appelée membrane
cellulaire, membrane cytoplasmique, est une membrane
biologique séparant l'intérieur d'une cellule, appelé cytoplasme, de
son environnement extérieur, c'est-à-dire du milieu extracellulaire. Cette
membrane joue un rôle biologique fondamental en isolant la cellule de
son environnement (Fig.05).

Elle est constituée d'une bicouche lipidique comprenant

des phospholipides et du cholestérol permettant d'ajuster la fluidité
de l'ensemble en fonction de la température, ainsi que des protéines
membranaires intégrales ou périphériques, les premières jouant
généralement le rôle de transporteurs membranaires tandis que les
secondes interviennent souvent dans les processus intercellulaires,
l'interaction avec l'environnement, voire les changements de forme de
la cellule.

Fig 05: Eléments structuraux de la membrane plasmique.

7. Paroi cellulosique:
Elle entoure toute cellule végétale elle est essentiellement composé de
polysaccharides; cellulose et pectine, elle est composée de trois parties
(Fig.6)

Fig.06

Paroi primaire: de nature pecto-cellulosique.

Paroi secondaire: elle est constituée de cellulose et d’hémicellulose et enrichie en
composés phénoliques.
Lamelle moyenne: c’est la partie la plus externe de la paroi elle est constituée de
matières pectiques seulement.
8. Cytosquelette
Le cytosquelette est un réseau filamenteux à
l'intérieur d'une cellule, lui conférant ses
propriétés mécaniques. il est composé de
plusieurs types de filaments (Fig. 07) :
• des filaments souples d’actine polymérisée ;
• des petits filaments dits intermédiaires (au rôle
mal connu) ;
• des microtubules rigides.
Fonction du cytosquelette
Le cytosquelette assure une certaine rigidité à la
cellule et sert à la fixation des organites .

Le cytosquelette se réorganise en permanence et

gouverne ainsi les mouvements internes
(déplacement des chromosome par exemple) et
les déformations de sa membrane (production de
protubérances, d'invaginations, de sites
d'adhésions...).
Fig 07: Structure cytosquelette
9. Réticulum endoplasmique :
• Réseau de membranes internes interconnectées tubules et sacs
(cisternae ou citernes) issues des membranes nucléaires.

• Un des plus grands organites de la majorité des cellules eucaryotes ( ≥

50% des membranes, 10% du volume). (Fig 8)
Définitions: REL et REG
2 types de réticulum sont définis:
• Le Réticulum Endoplasmique Lisse (REL)

• Le Réticulum Endoplasmique Granuleux (REG) qui comporte des

ribosomes

Fig 08: Structure 3D de réticulum endoplasmique

Fonctions du réticulum
• Le Réticulum Endoplasmique a de nombreuses fonctions, mais il est
particulièrement important pour la synthèse des protéines et des
lipides.
•Assemblage des bicouches lipidiques dans le RE avec synthèse de
toutes les classes majeures de lipides, phospholipides et cholestérol du
coté cytosolique
•Synthèse et assemblage des lipoprotéines
•Synthèse des céramides, exportés dans le Golgi
•Source de lipides pour la membrane externe de la mitochondrie

10. Ribosome
Le ribosome est un complexe composé d‘ARN et de protéines
ribosomiques, associé à une membrane (au niveau du RE granuleux) ou
libre dans le cytoplasme. Commun à toutes les cellules
(procaryotes et eucaryotes), le ribosome (et surtout sa composition)
varie en fonction des organismes, même s'il est toujours composé de
deux sous-unitées distinctes.
Les procaryotes possèdent un ribosome de 70S composé des sous-unités 50S
et 30S. Trois ARN ribosomiques sont impliqués dans sa structure (23S, 16S et
5S) ainsi que 55 protéines.
Le ribosome des eucaryotes est appelé 80S, divisé en deux sous-unités 60S et
40S. Quatre ARN (28S, 18S, 5,8S et 5S) constituent sa structure avec plus de 80
protéines.

Fig 09: Structure 3D du ribosome

Fonction du ribosome
La fonction du ribosome est de traduire le code génétique en protéines, par
l'intermédiaire des ARN messagers (ARNm). L'activité enzymatique du
ribosome étant portée par les ARNr,
11. Appareil de Golgi
Appareil de Golgi est constitué d'un empilement de saccules (un peu comme
une pile d'assiettes). Cet empilement, unique dans les cellules animales, mais
multiples dans les cellules végétales. On distingue la face cis de l'appareil de
Golgi, qui se situe en aval du réticulum endoplasmique, et la face trans qui est
tournée vers le cytoplasme.

Fig 10: Structure 3D de

l’Appareil de Golgi

Fonctions de l’Appareil de Golgi

La fonction principale de l'appareil de Golgi est de servir de lieu de transit et
de réservoir pour les protéines et lipides fabriqués dans le réticulum
endoplasmique. Cet appareil fait partie du réseau de membranes internes que
les cellules eucaryotes ont mis en place pour effectuer le transport
des macromolécules.
12. Mitochondries
La mitochondrie est un organite de forme ovoïde, délimitée du
cytoplasme par deux membranes superposées :
une membrane externe où la présence de nombreuses porines (protéines en
forme de canaux) permet le passage de molécules;
une membrane interne, repliée de telle façon à créer de nombreuses
invaginations. C'est sur cette membrane que sont localisées les usines de
la respiration cellulaire.

Fig 11: Structure 3D de l’Appareil de la Mitochondrie

Fonctions de la Mitochondrie
La mitochondrie est le lieu de la respiration cellulaire. Celle-ci est un
ensemble de réactions qui permettent de convertir le glucose en
molécule énergétique, l‘ATP. Ce processus comprend plusieurs étapes,
dont le « cycle de Krebs », un ensemble de réactions métaboliques qui a
lieu dans la matrice de la mitochondrie. L‘enzyme qui produit l'ATP se
trouve dans la membrane interne de la mitochondrie. Pour ces raisons,
la mitochondrie est souvent qualifiée d'usine énergétique de la cellule.

13. Chloroplastes
Sont présents dans les plantes et les Algues. Convertissent l’énergie
lumineuse en énergie chimique utilisée pour fabriquer des sucres à
partir de CO2. sont limités par une membrane externe doublée d’une
membrane interne. Les chloroplastes contiennent également de l’ADN
14.Lysosomes et peroxysomes
Organites intracellulaire qui renferment des enzymes hydrolytiques, ils
sont responsables de la lyse cellulaire c’est-à-dire la dissolution
d’éléments organiques (tissus, cellules, microorganismes) sous l’action
d’agents physiques, chimiques ou enzymatiques.

Fig 11: Structure 3D de lysosome

15. Vacuoles
Les vacuoles sont des compartiments délimités par une membrane,
remplis d'eau et contenant diverses molécules inorganiques et
organiques telles que des enzymes . La vacuole n'a pas de forme ou de
taille particulière, sa structure variant en fonction des besoins de la
cellule
La fonction et l'importance des vacuoles varient selon le type de cellule
dans lesquelles elles sont présentes. En général, ces fonctions sont liées
à des mécanismes de défense (détoxication, protection).

16.Centriole
De nombreuses cellules animales comportent à un de leurs pôles une
paire de centrioles (diplosome). Ce sont des corpuscules cylindriques
formés de tubules groupés par trois.
Généralement situés près du noyau, ils constituent avec le cytoplasme
environnant le centrosome et jouent un rôle essentiel lors de la division
cellulaire. Généralement absents chez les plantes.
Fig 12: cellule animale (organites et fonctions)
Fig 12: cellule végétale (organites et fonctions)