Indice de Repetibilidad

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Universidad Nacional

Autónoma de México

Facultad de Estudios Superiores Cuautitlán

Índice de Repetibilidad
Estimación y aplicaciones del parámetro

Dr. Miguel Ángel Carmona Medero


Dra. en Ed. Elizabeth Aguirre García
Biol. MVZ. Areli Casillo Ibarra

Grupo de Genética 2406


Semestre 2023-1
Material Didáctico

25/04/2023
Hoja 1

Índice de Repetibilidad

Objetivo general

Estimar el índice de repetibilidad de una característica cuantitativa de interés


zootécnico en una población animal, para su aplicación del parámetro en el
juzgamiento de un individuo en particular.

Objetivos específicos

Al finalizar el tema, el alumno será capaz de:

 Obtener el índice de repetibilidad, mediante la relación de la varianza genética y la


varianza ambiental general, sobre la varianza fenotípica.

 Conocer el número de registros que se requieren para juzgar el comportamiento futuro de


un animal.

 Determinar entre un grupo de animales comparados entre sí, cuales tienen el mejor valor
más probable de producción.
 Calcular el valor estimado del genotipo (VEG) de un grupo de animales.

 Estimar el valor reproductivo (VR) de un semental en la unidad de producción pecuaria.

Introducción

Muchas de las características de interés zootécnico en las especies domésticas se manifiestan


varias veces en la vida de un animal. En ovinos, el peso del vellón y otras características de la
lana son medidas anualmente en el momento de la esquila. La producción lechera de una vaca se
puede observar en su primera, segunda, y siguientes lactaciones; así como la persistencia y el
porcentaje de grasa. El peso al destete de terneros, como una característica que refleja la
habilidad materna de una vaca para carne, es registrado en cada uno de los destetes de esa vaca
en particular. Otros caracteres medibles en varios momentos de la vida del animal son la
producción de huevos en las gallinas, la producción de lechones en cerdas o la velocidad de un
caballo de carreras, por citar algunos ejemplos. (Zamudio, 2015)

En este tipo de características se aplica el índice de repetibilidad (IR), el cual constituye otro
parámetro genético de una característica determinada, en una población pecuaria. Al igual que la
heredabilidad, con la cual se encuentra relacionada, la repetibilidad no es una constante biológica
Hoja 2

de un carácter, sino que depende de la composición genética de la población y de las


circunstancias ambientales a las cuales está sometida la misma. (Zamudio, 2015)

Así, cuando se dispone de registros repetidos en la vida de un animal, por ejemplo, en las
hembras: el peso de los becerros al nacimiento, la producción total de leche, la persistencia de la
lactancia; o en los machos: el volumen del eyaculado, la cantidad de espermatozoides con
anomalías, etc., es posible estimar el índice de repetibilidad (IR), también conocido como índice
de constancia o de consistencia (Alba de, 1970), máxime si el criador está interesado en
seleccionar o eliminar una fracción de su población después de una temporada de empadre, dado
que la repetibilidad puede emplearse para estimar la producción futura de una hembra sobre la
base del registro de su comportamiento pasado.

En términos generales, se puede definir el índice de repetibilidad como la correlación entre


medidas repetidas sobre un mismo individuo, o sea, entre medidas realizadas en momentos
diferentes de su vida.

Cualquier característica es el resultado de la acción genética y ambiental, más el efecto de la


interacción genético ambiental; es evidente que tratándose del mismo animal el genotipo actuante
será el mismo en diversa observaciones, no habiendo lugar a segregación o recombinación de
genes. Pero también es dable suponer que un genotipo puede causar diferentes efectos
fenotípicos a distintas edades del individuo, debido, por ejemplo, a que en algunos casos, no
actúan los mismos genes exactamente, o aunque sean los mismos, actúan con diferentes
intensidades en las diferentes etapas de la vida, e incluso pueden cambiar la dirección de acción.
En este tema, se asumirá que la acción del genotipo no cambia entre las diversas observaciones.

Para comprender bien el significado de la repetibilidad es necesario hacer algunos comentarios


sobre la varianza ambiental y su subdivisión:

La variación ambiental es toda aquella de origen no genético. Cuando se efectúa más de una
observación sobre la misma característica y sobre el mismo animal, una parte de la variancia
ambiental es permanente en el sentido de que permanece igual durante la vida del animal,
afectando a todas las observaciones. Otra parte de la variancia ambiental es temporal porque
afecta a las observaciones en forma diferente y con distinta intensidad.

La variancia ambiental temporal es causada por factores de clima, nutrición, manejo,


enfermedades, etc., que afecten cada registro.

Hoja 3
La repetibilidad es la fracción de la variación total del carácter que es debida al genotipo y al
ambiente permanente.

Índice de Repetibilidad.

El parámetro se define como la relación entre la varianza genética (² g) más la varianza
ambiental general no removible (² eg), sobre la varianza fenotípica total (² F).

2 2
( σ g + σ eg )
IR =
σF
Se puede calcular como la regresión del comportamiento futuro sobre el comportamiento pasado;
también se le puede derivar a partir de un análisis de varianza como una correlación intraclase
entre los registros u observaciones de los caracteres del mismo individuo (Warwick y Legates,
1980).

El análisis de varianza se efectúa con dos fuentes de variación: entre animales y entre registros,
siguiendo el mismo procedimiento que se desarrolló para estimar la heredabilidad, cuando se
tiene en los registros, información de medios hermanos; con la diferencia de que en la estimación
del índice de repetibilidad, la esperanza de cuadrados medios para la fuente de variación entre
animales incluye los siguientes componentes: la varianza del error más el factor K1 que multiplica
la componente de varianza genética más la varianza ambiental general (²g + ² eg), también
conocida ésta última, como varianza ambiental permanente.

Utilizando la herramienta: análisis de datos del programa Excel  y solicitando la opción "Análisis
de datos de un factor" usted podrá, después de llenar la ventana de diálogo, visualizar la salida
del análisis de la varianza. Dependiendo de la información que disponga: igual número de
registros por animal (Diseño balanceado) o diferente número de observaciones en la vida
productiva de cada animal (Diseño no balanceado), será el procedimiento para estimar el factor
K1, tal y como fue explicado en los casos de heredabilidad. Conociendo el valor de K1 y los
valores correspondientes del promedio de los cuadrados en las dos fuentes de variación, se
despejan las ecuaciones normales para obtener el índice de repetibilidad.

Hoja 4
No obstante de que el procedimiento de cómputo sea sumamente sencillo aplicarlo, es importante
que el estudiante, desarrolle sus habilidades y destrezas para que en su caso, explicar el
fundamento en que se basa el desarrollo y el análisis de los datos.

Así el análisis de la varianza estimará:

Fuente Grados
Esperanza del cuadrado
de de Suma de cuadrados Cuadrado medio
medio
varianza libertad

[ ]
2

[ ]
Ti
Entre
A-1 ∑ Ti2
− FC ∑ n.
− FC
σ 2 w + K 1 ( σ 2 g + σ 2 eg )
animales n.
A −1

[ ]
2

[ ]
Ti
Entre
N-A ∑∑ ( x 2 ij) − ∑
2
Ti ∑∑ x2 ij −∑ n. ² w
registros n.
N−A

En donde:

A = Número de animales.

N = Número total de registros considerados.

n. = Número de registros de cada animal.

Ti²/n. = Total de cada animal elevado al cuadrado y dividido entre su número de registros.

FC = Factor de corrección, el cual se obtiene elevando al cuadrado la suma total de todas las
observaciones (Xij)² y dividiendo entre el número total de registros analizados (N).

 (Xij²) = Suma de cuadrados total.

El valor del cuadrado medio de la fuente de variación atribuible a los registros (CM2), representa la
varianza del error (² w), en la esperanza de cuadrados medios.

El valor de la fuente de variación debida a los animales (CM1) representa, en la esperanza de


cuadrados medios, la adición de la varianza del error (² w), a la componente K1 (² g + ² eg),
en donde:
Hoja 5

(² g + ²eg) = La varianza genética más la varianza ambiental general no removible.

² w = La varianza del error que se interpreta como la varianza total menos la covarianza entre
registros repetidos en la vida de un animal y cuyo valor numérico es el que se obtiene al calcular el
cuadrado medio del error (CM2).

K1, = El número de registros por animal (n.), en un diseño balanceado.

K1 En un diseño en que se tiene diferente número de registros por animal, es un factor de ajuste
de promedios y se calcula como:

K1 =
[ N−
∑ ( n .2)
N ]
( A−1 )

En donde:

N = Número total de observaciones en la estimación del parámetro.

n. = Número de registros en cada animal.

A = Número de animales considerados para estimar el índice de repetibilidad.

Para despejar las ecuaciones normales en la esperanza de cuadrados medios, es necesario


resolver el sistema para conocer el valor de la varianza ambiental general no removible (² g +
²eg), lo cual se logra sustrayendo al cuadrado medio de la fuente de variación entre animales, el
cuadrado medio de la fuente de variación entre registros, y dividiendo el resultado entre el valor de
K1.

( CM1 − CM2)
( σ 2 g+ σ 2 eg ) =
K1

La varianza fenotípica (² F) se obtiene sumando la varianza del error con la varianza obtenida
anteriormente (² g + ² eg).

² F = ² w + (² g + ² eg)
Hoja 6

Finalmente, el índice de repetibilidad se obtiene como:

2 2
( σ g + σ eg )
IR =
σF
El valor que se obtenga en el cálculo del índice de repetibilidad, permite estimar la magnitud de la
eliminación que puede efectuarse en forma segura con base en la información de un solo registro.

Ejemplo

Como ilustración del procedimiento para calcular este parámetro, se utilizarán los datos reportados
por Carmona y Pedrero (1998) relativos a la estimación del índice antero-posterior (IAP) en vacas
Holstein con ubres tipo platiforme.

El índice antero-posterior es la relación que existe entre la producción de leche de los cuartos
delanteros respecto a la producción de los cuartos traseros, y es una expresión de la simetría
en la producción láctea de la ubre; la heredabilidad del índice antero – posterior, varía entre
0.31 a 0.76, según la raza. (Johansson y Rendel, 1971)

Las ubres, pueden clasificarse en tres tipos: platiforme, redondeada y pendular, como se
muestra en la Figura 1.0; el tipo ideal son las de tipo platiforme. (Johansson y Rendel, 1971)

Carmona y Pedrero (1998) determinaron que el valor promedio del IAP en el grupo de vacas
con ubres de tipo platiforme fue de 0.84; en el grupo con ubres tipo redondeada fue de 0.64, y
en el grupo con ubres colgantes fue de 0.68

El índice de repetibilidad en cada grupo fue de 0.45, 0.33 y 0.25, respectivamente.

Para estimar el valor del parámetro relativo al índice de repetibilidad eligieron en un hato, 10
hembras, mediante muestreo aleatorio simple; dado que el número de registros mensuales es
variable en los individuos motivo de estudio, se tiene un diseño no balanceado. El procedimiento
para obtener el parámetro se ilustra con los datos que se presentan en el cuadro 1.0
Hoja 7

Fig. 1.0 Tipos de ubre.


(Fuente: Johansson y Rendel. 1971)

a) Ubre platiforme.

b) Ubre redondeada.

Ubre pendular.
Hoja 8

Ejercicio:

a) Copiar en su libro de Excel® los datos del Cuadro 1 y obtenga el Índice de Repetibilidad.

Cuadro 1.0 Índice antero-posterior de la producción láctea en vacas de raza Holstein con
ubre tipo platiforme.

Vaca mes1 mes2 mes3 mes4 mes5 mes6 mes7 mes8

1 - - 0.563 0.613 1.000 0.538 0.667 1.000

2 - - 0.887 1.222 0.852 0.923 0.724 0.887

3 - - - - 1.128 0.724 0.818 1.128

4 0.220 0.282 0.471 0.563 0.471 0.493 0.493 0.538

5 0.471 0.587 0.587 0.667 0.493 0.587 0.408 0.587

6 1.273 1.174 - 1.273 1.326 0.613 3.000 1.439

7 0.493 0.887 0.449 0.449 0.449 0.639 0.471 0.639

8 0.818 0.818 0.515 1.000 0.563 0.639 0.493 0.667

9 0.923 1.083 0.961 1.041 0.923 1.128 0.961 1.128

10 1.703 2.448 0.923 0.370 0.961 1.000 1.128 1.632


Hoja 9

Una vez tabulados en una hoja de cálculo del programa Excel  y después de recurrir al análisis de
datos y solicitar la opción: análisis de datos de un factor, la salida del programa dará la siguiente
información:

Análisis de varianza de un factor

RESUMEN

Grupos Cuenta Suma Promedio Varianza n.*n.

Vaca 1 6 4,381 0,730 0,046 36

Vaca 2 6 5,395 0,899 0,017 36

Vaca 3 4 3,798 0,950 0,044 16

Vaca 4 8 3,531 0,441 0,015 64

Vaca 5 8 4,387 0,548 0,007 64

Vaca 6 7 10,098 1,443 0,543 49

Vaca 7 8 4,476 0,560 0,024 64

Vaca 8 8 5,513 0,689 0,031 64

Vaca 9 8 8,148 1,019 0,008 64

Vaca 10 8 10,165 1,271 0,404 64

N 71 (n.²) 521

K1 7,07
Hoja 10

Acudiendo al resumen, la estimación del factor de ajuste de promedios K1 se obtendrá aplicando


la fórmula correspondiente:

K1 = {71 - ((62 +62+42 +82 +82 +72 +82 +82 +82 +82)  71)} 9
Por lo tanto:

K1 = {71 - (521 71)}  9 = {71 - (7.338)}  9 = 63.661972  9

K1 = 7.07

En la parte correspondiente al análisis de varianza, se obtendrán los componentes de la misma:

ANÁLISIS DE VARIANZA

Origen de las Suma de Grados de Promedio de los


variaciones cuadrados libertad cuadrados

Entre grupos 7,183622697 9 0,7981803

Dentro de los grupos 7,119942881 61 0,1167204

Total 14,30356558 70

Varianza genética más la varianza ambiental general

(σ² g + σ² eg). 0,0963391

Varianza Fenotípica

(σ² F). 0,2130595

Índice de repetbilidad
IR 0,45

Hoja 11

Las cantidades básicas calculadas en el ejemplo numérico fueron:

Paso 1.

Número total de observaciones = 71 registros

Suma total (x) = 59.992

2
(∑ x )
N = 50.690705
Factor de corrección FC =

Suma de cuadrados (Xij²) = 65.05982

Paso 2.

Suma de cuadrados entre animales:

[ ]
2
Ti
∑ n.
=57.864751

Paso 3

Cálculo de las cantidades requeridas para el análisis de la varianza:

Grados de libertad entre animales = 10 - 1 = 9

Grados de libertad entre registros = 71 - 10 = 61

Suma de cuadrados corregida, entre animales (SC1 ) = 57.864751 - FC = 7.174046

Cuadrado medio entre animales (CM1) = 7.174046  9 = 0.797116

Suma de cuadrados del error (SC2 ) = 65.05982 - 57.864751 = 7.195069

Cuadrado medio del error (CM2 ) = 7.1995069  61 = 0.117952

Paso 4.

Estimación de componentes de varianza:


Conjunto (² g + ² eg) = (CM1 - CM2)  K1 = 0.679164  7.073552 = 0.096015

Varianza Fenotípica (² F) = CM2 + 0.096015 = 0.213967

Hoja 12

Índice de Repetibilidad (IR) = 0.45

En la investigación de referencia, la frecuencia relativa de presentación de mastitis fue de 0.10


en las vacas con ubre de tipo platiforme; 0.31 en las de ubre redondeada, y 0.43 en las de tipo
colgante. Todos los animales que padecieron mastitis tenían un IAP menor de 0.80

La variación existente dentro del grupo con ubre de tipo platiforme, así como los valores
relativamente altos, obtenidos tanto para el índice antero-posterior como para el índice de
repetibilidad, permiten la posibilidad de seleccionar vacas que tengan este tipo de ubre, el cual
se considera deseable.

Valores de repetibilidad

El índice de repetibilidad de algunas características de importancia económica reportado por


Wilcox et al (1992) se anotan en el cuadro 2.0:

Cuadro 2.0 Características de importancia económica e Índice de Repetibilidad.

Índice de
Características de importancia económica
Repetibilidad

Características reproductivas

Tasa de concepción 0.60

Características productivas en la lactancia

Producción de leche 0.50

Producción de grasa de la leche 0.50

Producción de proteína 0.40

Porcentaje de grasa de la leche 0.75


Índice de
Características de importancia económica
Repetibilidad

Porcentaje de proteína 0.60

Persistencia 0.60

Características corporales

Puntaje promedio por tipo 0.50

Puntaje carácter lechero 0.40

Aplicaciones del Índice de Repetibilidad

El índice de repetibilidad de una característica se aplica principalmente para:

a) Predecir el comportamiento futuro a partir de registros anteriores.

b) Mostrar cuánto se puede ganar en precisión por la repetición de las mediciones.

c) Incluir el valor de parámetro para obtener el valor estimado del genotipo (VEG).

d) Obtener el valor reproductivo (VR) de un semental en la unidad de producción pecuaria.

e) Establecer los límites superiores de heredabilidad en sentido amplio.

a) Predicción del comportamiento futuro

El valor más probable de producción (VMPP) de cada animal puede predecirse con base en el
valor de repetibilidad de la característica, (Lush,1943; Pollak,1984) y en el número de registros por
animal, mediante la fórmula:

VMPP = μ +
n. IR
[
1+ ( n. − 1 ) IR
( Y i − μ)
]
En donde:

µ = Promedio del hato.

ӯi = Promedio del animal i.

Hoja 14

n. = Número de registros por animal.

IR = Índice de repetibilidad de la característica.

b) Ganancia en precisión

Falconer y MacKay. (1996) expresan que conociendo el índice de repetibilidad es posible conocer
el número de registros que se requiere obtener para juzgar el comportamiento futuro de un animal,
dado que el parámetro indica la ganancia en precisión esperada por las mediciones múltiples. Si el
valor es alto, con pocos registros basta, pero si el valor es bajo, las mediciones múltiples pueden
reducir la varianza debida al ambiente especial que aparece en la varianza fenotípica, y la
reducción de ésta representa la ganancia en precisión, incrementándose la estimación de la
varianza genética aditiva.

Con índices de repetibilidad del orden de 0.40 en cualquier variable de interés zootécnico, es
posible eliminar de 10% a 20% de los animales inferiores; esperar registros adicionales antes de
decidir, puede redundar en el incremento de costos de producción (Warwick y Legates, 1992).

Si cada registro adicional es equivalente a cualquiera de los anteriores, en forma individual, el


promedio de n. registros, con fines de selección, será más preciso respecto a la información que
se genera con un solo registro (Warwick y Legates, 1990), calculándose esa precisión (Pr)
mediante la fórmula:

Pr=

n.
1+(n .−1 )IR
Ejemplo:
El índice de repetibilidad del peso al destete, en una unidad de producción bovina de doble
propósito en el Estado de Colima, México, fluctuó entre 0.15 a 0.20; si se supone un valor de 0.16
en el índice de repetibilidad, la precisión de las evaluaciones basadas en dos o tres registros, se
incrementará 30 % y 51 %, respectivamente, sobre las que se basan en la información de un solo
registro.

Hoja 15

Por otra parte, también es necesario determinar si la interacción genotipo-ambiente está


manifestándose en la evaluación de las características de interés económico para el criador de
bovinos; si así fuese, se recomienda aplicar el modelo desarrollado por Bucio (1966) y aplicado a
los animales por Carmona (1980,1994), metodología que será aplicada con detalle en el siguiente
tema del éste curso.

c) Incluir el valor de parámetro para obtener el Valor estimado del genotipo (VEG).

El valor estimado del genotipo (VEG), conociendo el valor de heredabilidad y el índice de


repetibilidad, también puede ser conocido aplicando la fórmula:

VEG = μ +
[
n. h 2
1+ ( n. + 1 ) IR
( Yi − μ)
]
En donde:

 = Promedio del hato.

ӯi = Promedio del animal i.

n. = Número de registros por animal.

IR = Índice de Repetibilidad de la característica.

h² = Índice de Heredabilidad de la característica.

d) Obtener el valor reproductivo (VR) de un semental en la unidad de producción pecuaria.


Para obtener el valor reproductivo de un semental en una unidad de producción pecuaria, la
fórmula es:

VR = μ +
[
2 n . h2
4 + 4 IR ( n .− 1 )
( yi − μ )
]
Hoja 16

En donde:

 = el promedio del hato.

ӯi = el promedio del semental i.

n. = el número de hijas del semental i.

IR = Ïndice de Repetibilidad de la característica.

h² = Índice de Heredabilidad de la característica.

Al conocer el valor estimado del genotipo de un semental y una hembra, se pueden promediar
éstos y tener una confianza razonable de que el valor obtenido indicará la producción de sus crías.
Tal predicción no se puede hacer con los valores fenotípicos (Alba de, 1970).

La repetibilidad de acuerdo con el Dairy Herd Improvement (DHI) también se incluye en el cálculo
de la estimación de la habilidad de producción relativa (ERPA).

e) Establecer los límites superiores de heredabilidad (H²) en sentido amplio.

En sentido amplio, la heredabilidad se simboliza como H2 y en sentido estrecho como h2.

En sentido amplio la heredabilidad representa la relación entre la varianza genética (σ 2 G) sobre


la varianza fenotípica (σ2 F)

Los valores de esos parámetros son exclusivos para la población de la cual se generan, dado que
las frecuencias génicas y fenotípicas son específicas en cada unidad de producción.

El índice de repetibilidad sirve como el límite máximo de la heredabilidad en sentido amplio; si


para una característica, en una población, se estima un (IR) bajo, se puede concluir que la
heredabilidad será también baja. Al contrario, una estimación alta de repetibilidad, deja en duda y
no permite inferir que la heredabilidad sea también alta, puesto que no se tiene información de la
progenie.
Hoja 17

Tarea:

 Basándose en la información de un artículo científico, genere mediante números


aleatorios, la información de 10 registros repetidos de una característica de interés
zootécnico en una población de 20 animales; póngalos en una hoja que nombrará
banco de datos.

 En la siguiente hoja obtenga el Índice de Repetibilidad, utilizando un diseño no


balanceado. El número de repeticiones en cada animal, usted lo escoge.

 Obtenga el VMPP de cada una de los 20 animales utilizados en el ejercicio.

 La fecha de entrega de ésta tarea tendrá como límite el viernes 28 de abril a las 8 de la
noche.
Hoja 18

Referencias
Alba de J.: 1970 Reproducción y genética animal. Instituto Interamericano de Ciencias
Agrícolas. Costa Rica: OEA.

Bucio A,L.:1966 Environmental and genotype-environmental components of variability. I


Inbred Lines Heredity; 21:387-397.

Carmona M, MA.: 1980 Adaptación genético ambiental al trópico húmedo en Bos taurus,
Bos indicus, y sus cruzas. (tesis de maestría). México (edo. de México) México: Centro de
Ganadería. Colegio de Posgraduados.

Carmona M, M.A.: 1994 Respuesta a la selección en Apis mellifera evaluando baja


respuesta agresiva y estabilidad genotipo-ambiente (tesis doctorado) México (DF) México:
Facultad de Medicina Veterinaria y Zootecnia. UNAM.

Carmona M, M.A, Pedrero A, J.C.:1998. Repetibilidad del índice antero-posterior en la


produccion láctea y su relación con la frecuencia de mastitis. Memorias del Congreso
Panamericano de Control de Mastitis y Calidad de la Leche. 1998 marzo 23-27; Mérida
(Yucatán) México. Asociación Mexicana de Médicos Veterinarios Especialistas en bovinos,
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Falconer D, S; MacKay, T.: 1996 Introduction to quantitative genetics. 2nd edition.


Longman, London. U.K.
Johansson I, Rendel J.: 1971 Genética y mejora animal. España: Acribia. España.

Lush J, L.: 1943 Animal breeding plans. USA: Iowa State University Press Ames, Iowa..

Pollak, E.J.: 1984 Selection and Breeding Systems. In Extension Goat Handbook. Haenlein,
G.F.W.; D.L. Ace. Editors. Extension Service U.S.D.A. Washington D.C.,U.S.A.

Warwick E. J, Legates J,E.: 1980. Genética y mejoramiento del ganado. 3a ed.


Interamericana-Mc Graw Hill, México.
Wilcox CJ, Webb DW, DeLorenzo MA. Genetic improvement of dairy cattle. Fact Sheet
DS75 of the Dairy Production Guide. USA: Florida Extension Service, 1992.

Zamudio, M,I.: 2015 Informe de Servicio Social, F.E.S. Cuautitlán, UNAM

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