Práctica 6

APLICACIONES DEL ANÁLISIS DE MARCADORES GENÉTICOS

Determinación de la probabilidad de paternidad

Planteamiento de partida
En un caso de paternidad dudosa se hallan implicados dos presuntos padres, además de la madre y el hijo; se
trata de determinar cual de los dos hombres es, con mayor probabilidad, el verdadero padre del niño. La peritación se
realiza en base a los resultados correspondientes a una serie de marcadores genéticos que se han fenotipado en los
cuatro individuos (M = madre; H = hijo; V1 y V2 = presuntos padres).
Procedimiento
1. Analizar si se puede establecer, o nó, exclusión de paternidad de uno u otro de los dos presuntos padres, indicando,
en su caso, el tipo de exclusión para cada marcador.
1-a) Tipos de exclusión
Exclusión de primer orden: si el presunto padre no presenta el alelo del hijo que no puede haber sido heredado
de la madre (alelo obligatorio)
Exclusión de segundo orden: si el hijo y el presunto padre son homozigotos para alelos diferentes. Aunque es-
ta circunstancia es, aparentemente, una razón de peso para la exclusión, cabe la posibilidad de que estén impli-
cados alelos silenciosos, como el alelo Fy del sistema Duffy o el 0 del AB0.
1-b) Decisión de exclusión
La posibilidad de que produzca una circunstancia excluyente de uno u otro tipo se va analizando marcador a
marcador y la decisión de excluir al presunto padre como padre biológico se toma en base al siguiente criterio:
a) Una sola exclusión de primer orden o dos exclusiones de segundo orden no excluyen la paternidad, y obli-
gan a calcular la probabilidad de paternidad sin tener en cuenta los marcadores excluyentes
b) Un número de exclusiones superior al mencionado en el apartado anterior confirma la exclusión de paterni-
dad
2. Si no se puede excluir la paternidad, hay que calcular la probabilidad de paternidad calculando:
2-a) La probabilidad de paternidad para cada uno de los marcadores individualmente
2-b) La probabilidad global o acumulada por el conjunto de caracteres
3. Aplicar los predicados verbales de Hummel.
Cálculo de la probabilidad de paternidad
1. Para cada uno de los marcadores genéticos (aplicación del Teorema de Bayes)
1
W
Y
1
X
W = Probabilidad de paternidad para el carácter considerado
X = Probabilidad del genotipo del hijo, para el carácter considerado, bajo la hipótesis de que el pre-
sunto padre es realmente el padre biológico. Se calcula multiplicando la probabilidad del alelo (o
haplotipo) materno por la probabilidad del alelo (o haplotipo) paterno:
X = Prob (H / P x M) = Prob (M) x Prob (P)
Y = Probabilidad del genotipo del hijo, para el carácter considerado, suponiendo que el presunto padre
no es su padre biológico. Se calcula multiplicando la probabilidad del alelo (o haplotipo) materno
por la frecuencia poblacional del alelo (o haplotipo) paterno:
Y = Prob (H / M) = Prob (M) x Frec (P)
2. Para la total o acumulada
1
WT  X T  X 1  X 2  ... X n
Y
1 T YT  Y1  Y2  ... Yn
XT
 W (%) PREDICADO VERBAL
W  99,73 Paternidad “prácticamente probada”
99,73  W  99 Paternidad “extremadamente probable”
99  W  95 Paternidad “muy probable”
95  W  90 Paternidad “probable”
90  W  50 Paternidad más probable que no paternidad
50  W  10 No paternidad más probable que paternidad
10  W  5 Paternidad “improbable”
5W 1 Paternidad “muy improbable”
1  W  0,27 Paternidad “extremadamente improbable”
0,27  W Paternidad “prácticamente excluida”
Predicados verbales de Hummel

ANTÍGENOS ERITROCITARIOS
Sistema ABO (alelos) Sistema MNSs (haplotipos) Sistema Duffy (alelos)
a b
A1 A2 B 0 MS Ms NS Ns Fy Fy
0,20 0,05 0,08 0,67 0,2702 0,3007 0,0748 0,3544 0,39 0,59
ENZIMAS ERITROCITARIOS (alelos)
6-fosfogluconato deshidrogenasa Esterasa-D Fosfatasa ácida
1 2 1 2 A B C
PGD PGD EsD EsD P P P
0,9779 0,0221 0,88407 0,11593 0,278 0,686 0,036
PROTEÍNAS PLASMÁTICAS (alelos)
Grupo componente específico Fracción C3 del complemento Transferrinas
1 2 F S 1 2
Gc Gc C3 C3 Tf B TF C TF C
0,690 0,308 0,208 0,783 0,004 0,774 0,179
SISTEMA HLA (haplotipos)
A1 B5 A1 B7 A1 B8 A1 B12 A1 B17 A1 B27 A1 B35
0,0101 0,0006 0,0662 0,0038 0,0076 0,0042 0
A2 B5 A2 B8 A2 B12 A2 B17
0,0207 0 0,0466 0,0114
A3 B7 A3 B8
0,0115 0,0046
A29 B8 A29 B12 A29 B27
0 0,0284 0,0026
Frecuencias poblacionales de los marcadores genéticos utilizados
excluido
Antígenos eritrocitatios V1 V2 MADRE HIJO
ABO B B 0 B
MNSs NNss MMSS MMss MNss
Duffy Fy (a- b+) Fy (a+ b-) Fy (a+ b-) Fy (a+ b+)
Enzimas eritrocitarios
6-PGD 6-GPD 1,1 6-GPD 1,1 6-GPD 1,1 6-GPD 1,1
Est-D EsD 1,2 EsD 2,2 EsD 1,1 EsD 1,1
AcP AcP B AcP B AcP A,B AcP B
Proteínas plasmáticas
Gc Gc 1,1 Gc 2,2 Gc 1,1 Gc 1,1
C3 C3 S,S C3 S,S C3 F,F C3 F,S
Tf Tf C1 Tf C1 Tf C1 Tf C1
A1 A29 A1 A29 A2 A29 A1 A2
Sistema HLA
B8 B12 B12 B27 B5 B38 B8 B38
Análisis genético de los presuntos padres, de la madre y del hijo
Compatible, no excluisón, y calculamos la probabilidad de paternidad
 Estimación de las frecuencias alélicas del sistema AB0 y Rh.

Estimación de las frecuencias alélicas del sistema AB0 y Rh bajo el supuesto de equilibrio Hardy-Weinberg.
 RESULTADOS

-Análisis multivariantes (poblaciones-dermatoglifos)

Resumir la información de 4 variables proyectándola en solo dos o tres coordena-

das, para procesarla visualmente y establecer relaciones genéticas más o menos
estrechas.

Diferencias entre hombre y mujeres no son tan diferentes como puede ocurrir con
las poblaciones europeas en general, con respecto a los datos dermatoglifos.

Se puede deber al azar, o las frecuencias entre hombres o mujeres que colocan a
nuestra población un poco fuera del resto de las europeas. Las poblaciones africa-
nas, saharianas, se separan bastante del resto y entre si, típico de las poblaciones
africanas, ya que son las poblaciones más antiguas y han tenido mucho tiempo pa-
ra diferenciarse entre si y entre el resto de las poblaciones. En el resto de pobla-
ciones no vemos agrupaciones muy lógicas, no están tan bien definidas, debido a
que solo hablamos de un solo marcador que no tiene la fuerza suficiente para ca-
racterizar a las poblaciones.

- Sistema ABO:
Grupo poblaciones europeas homogéneo y diferenciado del resto, nuestra clase
está bien integrada en esta zona. Es común en todos los análisis, y hay dos razo-
nes, una genética: hubo mucho flujo entre las poblaciones europeas (buenas co-
municaciones y densidad alta en las poblaciones), la otra, es de tipo técnico: cuan-
do se descubren los marcadores genéticos y se utilizan para analizar las poblacio-
nes, en las primeras en las cuales se emplean son en las europeas, entonces
siempre se seleccionaron marcadores buenos caracterizadores en las poblaciones
europeas, lo que hace que haya una tendencia en que los marcadores que se utili-
zan a nivel mundial den bastante información de las poblaciones europeas. Esta
homogeneidad no es debido solo al flujo genético, si no al sesgo que tiende a ho-
mogenizarlas. Mezclados diferentes poblaciones, y los aborígenes australianos es-
tán un poco marginales, tipo en las poblaciones del océano.

-Sistema Rh:

Poblaciones europeas bien definidas, grupo homogéneo. Poblaciones africanas

bien definidas en este caso también. Nuestra clase hay una posición intermedia,
cerca pero alejada de las poblaciones europeas. Se debe a que cuando se reúnen
todos los datos, aparece una frecuencia mucho mayor de la esperada, que arrastra
a la clase a esa posición un poco extraña. Esta frecuencia se debe a un error
muestreo, una población no muy grande, y la posibilidad es bastante elevada, pero
en este caso, parece ser un error en el procedimiento de escribir los fenotipos en el
Excel. Resto de poblaciones, las de américa están bastante diferenciadas con res-
pecto al resto, típico de las poblaciones de américa, que sufrieron mucho aisla-
miento, y no tienen mucho flujo génico que hace que se diferencien entre si y al
resto, y también por deriva genética, ya que son grupos de pequeño tamaño y es-
tán aislados. Las asiáticas ya no están muy diferenciadas, junto con los mayas, y
estos últimos están más alejados de los americanos y más cercana a los españo-
les, lo que es coherente con la historia.

-Determinación de la probabilidad de paternidad

Exclusión: declaramos la no paternidad, sobre todo si hay más de una exclusión,

ya que la ocurrencia de más de una mutación en las células germinativas sería muy
rara.

Relacionar la probabilidad de la primera hipótesis de que sean padre e hijo con la

segunda hipótesis, de que la relación sea por azar.

Valor de 99,61093 lo que significa que la paternidad es extremadamente probable.