Bioquímica Avena-2
Bioquímica Avena-2
Bioquímica Avena-2
> Água
- Propriedades polares e a leve ionização da água
- alto ponto de fusão e ebulição comparado a outros solventes
> Solvente
• Hidrofílicos – compostos polares que dissolvem na água
• Hidrofóbicos – compostos apolares que não se dissolvem em água
• Anfipáticos – compostos com regiões polares e apolares
> Ionização
2.Qual é a base conjugada em cada um dos pares ácido-base abaixo. Escreva a reação de
equilíbrio.
a) RCOOH, RCOO-
b) H2PO4-, H3PO4
c) RNH2, RNH3+
d) H2CO3, HCO3-
4.O que é um sistema tampão? Explique como funciona? Que fatores determinam a
eficiência de um tampão?
6.O pH do sangue é mantido em uma faixa estreita entre 7,35-7,45. O principal tampão do
sangue é constituído pelo par H2CO3/HCO3- (pKa = 6.1). Embora o pKa de 6,1 pareça
estar fora da faixa de um tampão fisiológico útil, o sistema de tampão ácido
carbônico/bicarbonato é eficaz na manutenção do pH sanguíneo. Por que? Explique como a
taxa de respiração (hiperventilação ou hipoventilação) pode influenciar o pH sanguíneo.
06/03/2024
> Aminoácidos, pKa, PI
PK
- Ácidos fracos: dissociam parcialmente
- Constante de equilíbrio do ácido (relação entre os produtos e os reagentes)
- -log contante de eq
- Ka= conc produtos/ reagentes
- Constante de ionização: porções do am se comportam como ácido
- Pk 1: Carboxila
- Pk 2: Amina
- Pk R: cad lateral
Ponto isoelétrico
- Ph onde a carga do aa é nula
PH do meio
- Abaixo do pka: grupo protonado
Mais H+ no meio
Ácido predomina
- PH= Pka
- Ph =Pka + log [a-]/[ha]
- log [a-]/[ha]= 0
- [a-]=[ha]
Curva da glicina
- 2 Regiões de tamponamento (pouca variação de pH)
- Faixa de tamponamento
- Ultrapassada (acrescenta base na sol): Ph sobe bruscamente
- 8,6-10,6
- Ponto isoelétrico
- Onde a carga do aminoácido é neutra
- Glicina: Media aritmética entre pk1 e pk2
Carga do aminoácido
- Carga neutra 0= PI
- Grupo amino protonado
- Carboxilico desprotonado
Ordem de prioridade
- Pk
- Força do ácido (dificuldade de perder o proton)
Titulação
- Ph inicial prox de 1
- Ácido carboxílico desprotona primeiro
- Mais forte, pk menor
- 2: amino (acido mais fraco, precisa de ph mais alto pra perder)
Glutamato
- 3 regiões de tamponamento
- PI= (pK1+pK2) /2
- PI= carga neutra
Sequência de desprotonação
- Valores de pk
- Quanto menor o pk (mais ácido) mais fácil ele perde próton
- Do menor pro maior
> Peptídeos
Ligações peptídicas
- Reação do grupo carboxila com o amina
- C-OH + H-N
- C-N
- Ligação forte
Exemplos
Tamanhos e funções distintas
- Aspartato - adoçante
- Insulina- hormonal
Norma
- Começa no amino-terminal para o carboxi-terminal
Ph 1: muito acido
- Todos grupos protonados
- Os que tiverem carga negativa estarão neutralizados
Ph = Pi carga neutra
PH < Pi +
PH > Pi -
*Simulador de eletroforese
> Exercícios
1. Desenhe a fórmula geral de um L-aminoácido. Explique por que a glicina não possui
quiralidade. Inclua uma definição do conceito de quiralidade na sua resposta.
- Para todos os aminoácidos comuns, exceto a glicina, o carbono a está ligado a
quatro grupos diferentes: um grupo carboxila, um grupo amino, um grupo R e um
átomo de hidrogênio. Na glicina, o grupo R é outro átomo de hidrogênio. Em todos
os casos, exceto para a glicina, o átomo de carbono alfa é um centro quiral.
- Em decorrência do arranjo tetraédrico dos orbitais de ligação em volta do átomo de
carbono alfa, os quatro grupos diferentes podem ocupar dois arranjos espaciais
únicos e, portanto, os aminoácidos têm dois estereoisômeros possíveis. Uma vez
que elas são imagens especulares não sobreponíveis uma da outra conferindo a
propriedade de quiralidade.
- A quiralidade diz respeito à propriedade do carbono central dos aminoácidos, que,
quando ligado aos 4 grupos, forma uma molécula assimétrica, ou seja, esses grupos
podem estar arranjados de duas maneiras diferentes e não superponíveis
2. Analisando as cadeias laterais (grupo R) dos aminoácidos, liste quais são polares e
apolares. Entre os polares, citar aqueles que, em pH fisiológico (pH~7.4), apresentam o
grupo R com carga negativa (aminoácidos ácidos), carga positiva (aminoácidos básicos) e
carga nula (polares sem carga).
3. Quais tipos de interações intermoleculares fracas estes aminoácidos podem estabelecer
com outros aminoácidos e/ou com a água?
4. Desenhe a curva de titulação (eixo x=adição de OH- e eixo y=pH) da histidina. Indique na
curva os valores de pK dos grupos amino, carboxila e grupo R, o pI e as respectivas regiões
de tamponamento.
5. Considere os peptídeos Glu-Val-Arg e Arg-Val-Glu
a) Desenhe a estrutura dos peptídeos em pH 1. Indique as ligações peptídicas, o grupo
amino-terminal e o carboxi-terminal. Represente corretamente o estado de ionização dos
grupos funcionais.
b) Calcule o pI. Consulte os valores de pK nas tabelas dos livros.
https://www.fcav.unesp.br/Home/departamentos/tecnologia/luciamariacararetoalves/aula-3---
pratica--curva-de-titulacao-da-glicina.pdf
13/03/2024
Estrutura de proteínas
Degradação de Edman
- Cíclica
- Cadeia: N terminal> C terminal
- Sonda: Usa molécula detectável por técnicas espectrofotométricas
- Se liga ao N do grupo amina terminal, lig forte
- PH ácido
- Quebra ligação peptídica, liberando o primeiro aminoácido da cadeia, ligado à sonda
- Análise sequencial dos aminoácidos
- Sequenciamento
*Limitações: pep de até 50 aa
Espectrometria de massas
- Quebra das ligações em equipamento que detecta massa
- Aa têm massa específica
- Injeta pep com agulha> vaporiza pep.> MS1 (massa completa) > célula de colisão
(quebra molécula)> MS2 (mede massa fragmentos)
> Planaridade
- Ligações pep tem 40% de caráter de dupla ligação
- O=C-N-H
- O e N são eletronegativos: ressonância de elétrons (ambos atraem, e- distribuídos
pelas duas ligações)
- Lig simples C-N: caráter de dupla ligação
- Ligações simples giram, O=C-N-H adquire planaridade
- Restrições nos giros
>Alfa hélice
- Eixo central, distância entre unidades repetitivas
- 3,6 resíduos: uma hélice
- Cadeias laterais (R): voltadas pra fora
Pontes de hidrogênio
- Estabilizam a estrutura
- Intracadeia e paralelas ao eixo
- H da lig peptídica (amina) com O da carbonila (4°aa da mesma cadeia)
Restrições:
- Cadeias laterais muito volumosas ou com mesma carga impedem formação da
hélice
- Prolina limita
*Desnaturação: rompe lig de hidrogênio
> Exercício
1. O que é estrutura primária e como ela pode ser determinada experimentalmente?
É a sequência linear de aminoácidos que compõem a cadeia polipeptídica. Ela pode ser
determinada por
Alfa-hélices são configurações espaciais de cadeias peptídicas, em que ela está enrolada
repetitivamente, ao redor de um eixo longitudinal, formando uma espiral. As cadeias laterais
ficam orientadas para fora da hélice. A estrutura é estabilizada por ligações de hidrogênio
intercadeia, entre o H da lig peptídica (amina) com O da carbonila (4°aa da mesma cadeia).
Já nas folhas-beta as cadeias se sobrepõem, paralela ou antiparalelamente, e suas cadeias
laterais ficam orientadas perpendicularmente à folha, para cima e para baixo. Também são
estabilizadas por pontes de hidrogênio.
18/03
> Função de proteínas
> Fibrosas
Cadeias polipeptídicas arranjadas em longos filamentos ou folhas
Queratina
Ligações de dissulfetos: rigidez
Colágeno
Ligações cruzadas
- Lisina e hidroxilinas
- Ligação forte
*Vit C
Ácido ascórbico participa da produção de hidroxilisina e hidroxiprolina
Hidroxilação
Fibroína
- Folhas beta antiparalelas
- Ricas em alanina e glicina (ch3)
- Lig hidrogenio (fracas > flexibilidade)
- Empacotamento
> Globulares
Uma ou mais cadeias polipeptídicas (mais de uma configura est quaternária)
Padrão de enovelamento
- Todos em alfa, beta, alfa e beta
- Classificar em famílias
Dominios
- Partes da cadeia polipeptídica que possuem uma conformação estável
independente, e que podem se movimentar de forma isolada
Mioglobina e hemoglobina
- Ilustram a dinâmica de proteínas durante a interação reversível com ligantes
- Mio: difração de raio x forma cristais (purificada) > padrão de difração
Mioglobina
- 1 única cadeia polipeptídica (proteína monomérica)
8 alfa-hélices conectados por voltas ou loops.
- 1 grupo Heme (em Vermelho) – grupo que liga O2
Hemoglobina
- Tetrâmero
- 4 cadeias polip
- 2 subunidades
- 4 grupos heme
Desnaturação
- Perda de função
- Estrutura tridimensional é determinada pela estrutura primária (regeneração da
estrutura nativa espontânea)
- Doenças: perda de estrutura funcional (oxidação, ferro, radiação ionizante) >
agregados (placas amilóides)
- Chaperonas
> Função
> Mioglobina
- Monomérica, único grupo heme
- Anel de porfirina
- Fe ligado com ligações de coordenação (4 com nitrogênio, uma reversivel com O,
uma colateral com N)
Ligação com O
- Cadeias laterais
- Histidina: ângulo que permite que Fe=O ligue e desligue
- *Monóxido de carbono: ligação linear irreversível
> Hemoglobina
- Abundante nas hemácias (34% peso total)
- Globular
- Tetramerica
- Cada subunidade: estrutura terc similar a mioglobina
- 2 dímeros associadosfortemente. (alfa1-beta1 e alfa2-beta2) (separados com ureia)
Ligação ao Oxigênio
- Muda conformação
- O se liga ao Fe e o aproxima da histidina*
- Lig em uma única subunidade muda toda molécula
- T>R
Estados T e R
- Interações eletrostáticas mantém no estado T
- mudanças na interface a2/b1 e b2/a1
- Relaxado: histidina corre pro bolsão central
- estreitamento no bolsão central
T no pulmao: ligação altamente eficiente a O
R nos tecidos: libera facilmente o O
Curva intermediária: suposição
Efeito de Cooperatividade
A interação do oxigênio e uma subunidade afeta a conformação das
outras subunidades facilitando a ligação dos outros sítios não ocupados
- Concentração de O2 tem efeito exponencial na captação ou liberação
Proteína alostérica
- Proteínas na qual a ligação em um sítio afeta a conformação e as propriedades de
ligação de um outro sítio de uma mesma proteína
Moduladores = ligantes que interagem com proteínas alostéricas induzindo alterações
conformacionais
- Moduladores Homotrópicos = Ligante e Modulador são iguais
- Moduladores Heterotrópicos = Ligante e Modulador são diferentes
Efeito Bohr
- Contração muscular intensa
- Liberação de ácido latico e Co2
- Co2 forma bicarbonato e H+
- H protona a histidina > interação entre dímeros da Hb se intensifica
- Favorece estado T
- Quanto mais acido mais libera oxigênio
2,3-Bisfosfoglicerato = 2,3-BPG
- Exemplo de modulador alostérico heterotrópico
- BPG está presente em altas concentrações nos eritrócitos
- BPG estabiliza o estado T (desoxi Hb) diminuindo a afinidade pelo oxigênio e
aumentando sua liberação
> Exercícios
1. Defina proteínas fibrosas. Quais características estruturais conferem resistência às
proteínas fibrosas?
- Estrutura terciária/quaternária
- Cadeias polipeptídicas arranjadas em longos filamentos ou folhas
- Supertorção, Ligações covalentes entre as cadeias adjacentes (dissulfeto)
- Empacotamento fibras de colágeno, ângulo
- Seda: empacotamento (Ala, gly), entrelaçamento, estabilizada por ligações de
hidrogênio, otimização das lig de van der waals
5. O que o experimento realizado por Christian Anfisen em 1972 prediz sobre a estrutura de
proteínas? Descreva o experimento e as conclusões.
- 1. Num tubo de ensaio adicionaram ureia à enzima RNaseA. A ureia é um agente
desnaturante que promove a destruição da estrutura nativa das proteínas.
- 2. Após verificarem a desnaturação da proteína, o que se manifestou pela perda
total de atividade biológica, retiraram a ureia de modo a restaurarem o ambiente
químico para condições intracelulares normais.
- 3. Observaram então um refolding espontâneo da proteína acompanhado pela
recuperação total da sua atividade enzimática.
- hipótese termodinâmica toda a informação necessária para encontrar o estado
nativo está contida na sequência de aminoácidos que constitui a estrutura
primária da proteína
- estado nativo é o estado termodinamicamente mais estável
- totalidade das interacções entre os aminoácidos que constituem a estrutura
primária que determina a estrutura nativa da proteína
2. O pH sanguíneo nos alvéolos pulmonares é 7,4, enquanto nos tecidos é 7,2. Que
fenômeno deve ocorrer com a hemoglobina nos pulmões e nos tecidos e como essa
alteração no pH influencia a capacidade transportadora de oxigênio da Hemoglobina?
- Quanto mais ácido mais libera oxigênio
- H protona a histidina > interação entre dímeros da Hb se intensifica> favorece
estado T
4. Os crocodilos podem permanecer mais de uma hora submersos, apesar de terem uma
concentração de mioglobina cerca de 100 vezes menor do que a de mamíferos que
mergulham, como as baleias. A hemoglobina de crocodilos apresenta várias diferenças na
estrutura primária quando comparada à humana. O gráfico abaixo foi obtido com
experimentos in vitro usando hemoglobina de crocodilos (círculos) e do homem (quadrados)
em duas situações: na ausência (símbolos vazios) e presença (símbolos cheios) de CO2.
(Obs. O CO2 é produzido nos tecidos durante o metabolismo sendo convertido em H2CO3
pela anidrase carbônica). Proponha uma hipótese para explicar a resistência dos crocodilos
permanecerem submersos por tanto tempo
01/04/2024
> Enzimas
- Catalisadores biológicos poderosos> reações bioquímicas
- São altamente específicas (sítio ativo)
- Várias enzimas são reguladas
• Maioria das enzimas são proteínas
• Atividade catalítica depende da estrutura da proteína ou conformação proteica
• Possuem sítios de ligação específicas – sítio ativo
- Sitio ativo é delimitado por cadeias laterais de aminoácidos que ligam o substrato
com alta especificidade
• Várias enzimas possuem components adicionais ou grupos prostéticos
- Cofatores: íons inorgânicos (Fe2+, Cu2+ Mg2+, Mn2+, Zn2+, K+)
- Coenzimas: moléculas orgânicas ou metalo-orgânicas (ex. Heme)
- REAÇÃO REVERSÍVEL
- Não altera o ponto de equilíbrio da reação (não é 50%)
Estado fundamental: ponto de partida tanto da reação direta quanto da reação reversa
- S⇄P
Estado de transição ⧧ : topo da curva de energia necessária para conversão de Sà P ou
PàS.
- Formação de reações
- Pico de energia
Energia de ativação (∆G⧧): diferença de energia entre o estados fundamental e o estado de
transição
- Barreira
Variação de energia livre padrão bioquímico (∆G’o): variação de energia livre padrão (em pH
7, 25C, concentração 1M, 1 atm)
Reações na enzima envolvem grupos funcionais das cadeias laterais dos resíduos de
aminoácidos e o substrato
Catálise ácido-base geral: transferência de protons (H+)
Catálise covalente: formação de um intermediário ligado covalentemente na enzima
- Entre radical da proteína e substrato
Catálise por íons metálicos
Catálise ácido-base
- Transferência de protons (H+)
- Entre a enzima e substrato ou intermediários
- Recebe ou doa (atua como ácido ou base)
Catálise covalente
- Formação de um intermediário ligado covalentemente na enzima
*Hidrólise de p-nitrofenilacetato pela Quimotripsina
Formação do intermediário na qual o acetato liga-se covalentemente à enzima
- Em seguida é rompida (acetato é liberado como ácido acético
Etapa rápida
- Muitas moléculas de enzima livres:
- Velocidade aumenta linearmente com o aumento da [S]
Etapa lenta: determinante
- Todas enzimas ligadas ao substrato:
- [ES]=[ETotal]
- Vo=k2[ES]
- Vo = Vmax = k2 ETotal
- Velocidade independe da [S]
Concentrações [] de E, S, ES:
- ENZIMA: a enzima pode existir em duas formas, livre (E) ou complexada ao substrato (ES)
[ETotal]=[E]+[ES]
- SUBSTRATO: Normalmente [S]>>>[ETotal], portanto a quantidade de S ligada à enzima é
insignificante.
[S]=[STotal]
Para baixo consumo de S (menos que 5 %) a quantidade de P formado é muito baixa.
Portanto, etapas reversas a partir
de P podem ser ignoradas (k-2 pode ser ignorado!)
- COMPLEXO ES: Com exceção à fase inicial da reação (estado pré-estacionário, alguns
microsegundos após a mistura de E+S),
a [ES] se mantém constante até que todo o substrato seja consumido (teoria do estado
estacionário).
V de formação de ES = V de quebra de ES.
> Constantes de velocidade
> Exercícios
1. Como as enzimas aceleram a velocidade de reações? Por que o modelo na qual o sítio
ativo é complementar ao substrato não é adequado para explicar o mecanismo de
funcionamento de enzimas?
- Diminuindo a energia de ativação da reação. Proporcionam um ambiente mais
propício, o sítio ativo
- Seria muito lento. Complementar ao est de transição
2. O que são cofatores e coenzimas? Cite um exemplo de um cofactor e de uma coenzima
especificando o papel de cada um no mecanismo de catálise
3. Explique o que vem a ser o fenômeno de “ajuste induzido” e qual a sua importância para
o mecanismo de funcionamento das enzimas?
> Provinha 2
- Saturação hemoglobina em pH
- Saturação em pO2
08/04
Cinética Enzimática – Parte 2
Inibidores e Moduladores Alostéricos
Inibição
- Reversível (competitiva, acompetitiva, mista)
- Irrevers
> Irreversível
- Suicida
- Ligam-se irreversivelmente à enzima
- Organofosforados com acetilcolinesterase
> Reversível
> Competitiva
- Competem pelo mesmo sítio ativo que o substrato
- Similaridade estrutural com o substrato
Ex: intoxicação por metanol: ingestão de etanol (álcool desidrogenase)
> Acompetitiva
- Alfa’ : 1+ [I]/KI’
- Alfa’/Vmax
- Coef da conc de substrato
> Misto
- Liga-se em ambos E ou ES, em um sítio diferente do substrato
-
Ao se ligar ao ES, inibidor diminui [ES]
- Vmax aparente diminui
Liga-se em ambos E e ES reduzindo a ligação do substrato à enzima
- Km aparente aumenta (mista)
4. O gráfico abaixo mostra os dados cinéticos obtidos para a atividade da enzima do vírus
da gripe (neuraminidase) em função da concentração de substrato (ácido siálico) na
presença e ausência de dois medicamentos antivirais.
a) Calcule os valores de Vmax e Km da enzima sem o inibidor e na presença dos inibidores
Tamiflu e Relenza.
- Sem inibidor: Vmax=1 e Km=0,1
- Tamiflu: Vmax=1 e Km=0,2
- Relenza: Vmax=0,5 e Km=0,1
b) Que tipo de inibidor é o Tamiflu (oseltamivir) e o Relenza (zanamivir)? Comente sobre o
mecanismo de atuação dos inibidores indicando o possível local onde eles atuam na
enzima. Explique utilizando o esquema de reação enzimática (E, S, I, ES, ESI, EI, P)
- Tamiflu: competitiva
Esse inibidor se liga na enzima livre, formando o complexo EI
- Relenza: não competitiva
Ele se liga ao complexo ES, formando ESI
c) Como ficaria o gráfico acima para um inibidor do tipo misto? Desenhe o gráfico na
ausência e na presença do inibidor.
10/04
> Separação de proteínas
> Cromatografia
>Líquida
>Exclusão por tamanho
>Troca iônica
>Afinidade
>Em papel
> Eletroforese
>Em papel
>Em Gel
> Exercícios
1. Você quer purificar as proteínas de uma mistura utilizando uma combinação de
cromatografia de filtração em gel (também conhecida como cromatografia de exclusão por
tamanho) e uma cromatografia de troca iônica. As proteínas na mistura têm as seguintes
características:
Proteína A: pI= 4,2; massa molar 40 kDa
Proteína B: pI= 4,2; massa molar 70 kDa
Proteína C: pI= 8,0; massa molar 40 kDa
Descreva o procedimento que você utilizaria para separar essas proteínas, indicando o pH
do tampão a ser utilizado e a ordem de eluição das proteínas.
- Primeiramente eu colocaria a mistura na cromatografia de filtração em gel, para que
se separasse a proteína B, que por ter o maior tamanho de molécula passaria
primeiro.
- Em seguida usaria a cromatografia de troca iônica
15/04
> Lipídeos
- Grupo de compostos quimicamente diverso que apresentam baixa solubilidade em
água e alta solubilidade em solventes orgânicos
- Apolares ou anfipáticos
- Diversidade estrutural,e de função
Funções
- Armazenamento de energia
- Estruturação de membranas
- Hormônios
- Cofatores enzimáticos
- Agentes emulsificantes
- Sinalização Celular
- Transporte de moléculas
> Armazenamento
> Ácidos Graxos (FA)
Principal forma de armazenamento de energia nos organismos de animais e
plantas.
- derivados de hidrocarbonetos
- um ácido carboxílico seguido de uma cadeia carbônica (4-36 carbonos).
Estrutura varia em
A) Número de carbonos
B) Insaturação
Saturação
- A saturação dos ácidos graxos influencia a fluidez de membranas e seu ponto de
fusão
Ponto de fusão
- aumenta com quanto maior o tamanho da cadeia carbônica
- diminui, quanto maior a quantidade de insaturações
Nomenclatura
> Estruturais
Membranas celulares
>Glicerofosfolipídeos
> Esfingolipídeos
> Esteróis
Propriedades:
- Fluidez (permitem difusão lateral e transversal)
- Seletividade
Dinâmica
Fluidez
> Transporte
Lipoproteínas
- Complexos macromoleculares especializados no transporte de moléculas
hidrofóbicas
hidrofóbicos, lipídeos não solubilizam no sangue.
- Lipídeos e proteínas anfipáticas na superfície em contato com o ambiente aquoso,
- Interior hidrofóbico ficam os lipídeos mais apolares
3. Cite as principais classes lipídicas encontradas nas membranas biológicas. Por que
triglicérides não formam membranas?
17/04
> Carboidratos
-Fórmula geral (CH2O)n, n ³ 3; podem conter N, P, S
Funções:
- Fonte de energia (glicose e derivados)
- Armazenamento de energia (amido e glicogênio)
- Estrutura de paredes celulares (celulose)
- Sinalização célula-célula (glicolipídeos, glicoproteínas)
> Monossacarídeos
Possuem cadeias carbônicas lineares sem ramificações ou duplas ligações
Estruturalmente, são poli-hidroxialdeídos ou poli-hidroxicetonas
São sólidos cristalinos solúveis em água. A maioria tem sabor adocicado.
Piranose ou Furanose
- Formas cíclicas da D-glicose e D-frutose
Dissacarídeos e Polissacarídeos
Dissacarídeos são formados pela reação de dois monossacarídeos
O carbono anomérico de um monossacarídeo reage com a OH de outro formando ligação
O-glicosídica
Polissacarídeos (glicanos)
São polímeros contendo várias unidades (>30) monossacarídicas
- Podem ser lineares o ramificados
- Homo ou hetero-polissacarídeos
> Amido
- Polímero de estocagem de glicose nas plantas
- Constituído por estruturas lineares (amilose) e ramificados (amilopectina)
Depositado no citoplasma das células de plantas
como grânulos insolúveis
Amilose: Polímero linear de D-glicose unido por lig glicosídicas 𝛼1-4
- Amilose é linear e helicoidal
Amilopectina: Polímero ramificado de D-glicose unido por lig glicosídicas 𝛼1-4 e 𝛼1-6
- Ramificações na Amilopectina a cada 24-30 unidades de glicose
> Glicogênio
- Polímero de estocagem de glicose em mamíferos
- Estocado principalmente nos músculos esquelético (1-2 % do peso) e fígado (10 % do
peso).
- Estrutura assemelha-se à amilopectina, mas o glicogênio é mais ramificado (ramificações
a cada 8-12 resíduos).
Grânulos de glicogênio
Ramificações no Glicogênio ocorrem a
cada 8-12 unidades de glicose
Resumo
Os açúcares (também chamados de sacarídeos) são compostos que contêm um grupo
aldeído ou cetona e dois ou mais grupos hidroxila
Os monossacarídeos geralmente contêm alguns carbonos quirais e, assim, existem
vários estereoisômeros
Os monossacarídeos formam estruturas cíclicas. O carbono do grupo aldeído ou
cetona é chamado de anomérico.
O grupo aldeído ou cetona participa de reações de redução e de glicação
Dissacarídeos e polissacarídeos são formados por ligações glicosídicas. Estes podem
ou não conter extremidades redutoras (extremidade contendo C anomérico livre)
Polissacarídeos podem ter função de armazenamento, estrutural e de sinalização
> Exercícios
1.Liste diferentes funções biológicas de carboidratos, e dê exemplos de moléculas de
carboidratos que exercem estas funções.
24/04
> Introdução ao metabolismo
> Termodinâmica
- Estudo das formas de energia que afetam a matéria
- Sistemas (moléculas + solutos) X ambiente (sistema - universo)
- Possibilita prever se processos bioquímicos são possíveis
Aplicações: conformação de proteínas arranjos supra-moleculares organização de vias
metabólicas transporte de íons e nutrientes trabalho mecânico
ΔG = ΔH – TΔS
ΔH < 0 e ΔS > 0, processo sempre espontâneo
ΔH > 0 e ΔS < 0, processo não espontâneo
ΔH < 0 e ΔS < 0, espontâneo a T < ΔH/ΔS
ΔH > 0 e ΔS > 0, espontâneo a T > ΔH/ΔS
the essential thing in metabolism is that the organism succeeds in freeing itself from all the
entropy it cannot help producing while alive
> Metabolismo
- Seqüência de reações que resultam na formação de produto
- Altamente regulada
- Anabolismo (biossíntese): construção de macromolécula gasto de energia (ATP)
- Catabolismo: degradação de nutrientes e material celular
geração de energia (ATP)
reaproveitamento de materiais
> ATP
- Ligação entre o anabolismo e o catabolismo (moeda energética)
- Conversão exergônica do ATP em ADP e Pi ou em AMP e PPi > acoplada a
processos endergônicos
Transferência de grupos
- Hidrólise direta do ATP: Fonte de energia em contrações musculares
- Transferência de grupos do ATP para substrato ou enzima: Transfere energia da
quebra do ATP para transformações endergônicas do substrato.
(Fosforila, pirofosforila, adenil)
- Energia para reações anabólicas (Síntese de sinalizadores, transporte de íons e
moléculas através de membranas, contra gradientes de pot el e conc)
Vantagens:
Permite passos altamente exergônicos
Direcionamento
Controle independente de degradação e síntese
Vantagens:
Direcionamento
Controle de uma enzima determina via prioritária
Evita acúmulo de intermediários
> Compartimentalização
Glicose Pyr (citosol)
Pyr CO2 (mitocôndria)
Síntese Ag (citosol)
Degradação de Ag (mitocôndria)
Vantagens: Controle de intermediários por transporte
Separação de síntese/degradação
Aumento de conc. localizada de intermediários
> Evercícios
1. Co2 em refrigerantes. Contribuições entrópicas e entálpicas do processo
2. O organismo vivo é organizado e contém macromoléculas. Isso quebra as leis da
termodinâmica?
3. Quais os principais tipos de reações bioquímicas? Explique
“Group Transfer”: transferência de grupo
Óxido-redução: reações com perda ou ganho de elétrons
Eliminação/Adição: Forma/elimina C=C, elimina/adiciona H2O, NH3, ROH ou RNH2
Isomerização: Muda a posição de um H e uma dupla ligação.
Rearranjo: Quebram e re-colocam ligações C-C
Quebra C-C / Condensação: Quebra / cria ligações C-C
29/04/24
Via glicolitica- Glicólise
https://edisciplinas.usp.br/pluginfile.php/7713550/mod_page/content/4/Gliconeog%C3%AAn
ese%20e%20regula%C3%A7%C3%A3o.pptx.pdf
- Via glicolítica (duas fases)
- Glicose em piruvato
- 2 moleculas de atp e 2 de nadh
- Regulação
- Atividade em diferentes tecidos
Via metabólica universal em que a glicose é oxidada em duas moléculas de piruvato
- Energia conservada em ATP e NADH
10 enzimas citolíticas
- Citosol
- 10 intermediários (compostos fosforilados com 6 ou 3 C)
> Regulação
3 reações irreversíveis
- Controlam fluxo de carbono e mantêm concentrações de metabólitos constantes
- Outras são reversíveis e participam da neoglicogênese (outro sentido
> Hexoquinase
- Glicose em glicose 6 fosfato
- Regulador alostérico negativo (outro sítio): inibe
- ATP em ADP
permite ajustar a captação de glicose pelo tecido à sua utilização.
Tecidos
- Km=0,1 mM por glicose
- Afinidade alta por glicose
O Km das hexoquinases I, II e III é bem menor que o intervalo de flutação da glicose no
sangue (5-8mM)> enzimas funcionam sempre em velocidade máxima e a velocidade da
reação que catalisam independe do valor da glicemia
- suprimento constante de glicose para as células estritamente dependentes desse
açúcar, como as do cérebro e hemácias.
Hexoquinase 4 (glicoquinase):
- Km= 10 mM (funciona em glicemia alta)
- Fígado: produzir glicose 6 fosfato em glicemia alta (mantem fixando em G6P quando
esta alta e liberando glicose quando esta baixa)
- Aumenta com gli
- Não inibida por G6P
> Fosfofrutoquinase
- Compromisso
- Frutose 6 fosfato em frutose 1,6 fosfato
- Reg alostérica: positiva por AMP e frutose 2,6P
- Negativa por atp e citrato
- Níveis de atp estáveis na célula
*Frutose 2,6 fosfato: na ausência quase não tem
Fosfofrutoquinase 2
- Produz frutose 2,6P a partir de frutose 6P
- Regula a fosfofrutoquinase 1
- frutose 2,6P é degradada novamente em frutose6p
> Hemácias
- Não possuem mitocondrias (nao tem como reoxidar nadh em nad+ exceto na via
-
- Via glicolitica responde atp mas não a insulina
-
> Cérebro
- Neurônios
- Usam glicose ou lactato como fonte de energia
- Economia enzimática
- Só expressa via glicolítica
> Fígado
- Glicoquinase (baixa afinidade por glicose) só produz glicose 6p quando glicemia ta
baixa no sangue
- Insulina ativa ffq2
- Glucagon
- Piruvato quinase inibida alostericamente pela alanina
> Músculo
- Entrada de glicose estimulada por insulina
- Regula niveis glicemicos: pos prandial, musculo tambem fixa em forma de glicogenio
- Glucagon não inibe glicólise no músculo (fuga)
- Piruvato quinase não é inibida por alanina
- Em atividade intensa
* Mapa metabólico
- Vias, regulação, ligação, compartimentalização
- Estrutura química (se quiser) nome
- Foco na regulação
> Exercícios
1)
- Cataliza fosforilação da glicose no tecido extra hepático: Hexoquinase
- Regulador alostérico: G6P
- A enzima presente no fígado é a glicoquinase, ou hexoquinase 4. Ela estimula o
fígado a produzir glicose 6 fosfato em situações de glicemia sérica alta, como no
período pós prandial. Assim, contribui para a função de estabilização de glicose do
órgão, induzindo a fixação de glicose em G6P quando está alta e liberando glicose
quando esta baixa. Aumenta com a glicemia. Não inibida por G6P como em outros
tecidos
2) Piruvato quinase
- Converte fosfoenolpiruvato em piruvato
- Inibida por atp
- Estimulada por frutose 1,6 fosfato
*Acúmulo de PEP
- Aumento de frutose 2,6 bisfosfatase
- Como a frutose 2,6 bisfosfato é o principal regulador positivo da fosfofrutoquinase,
sua degradação causa inibição da conversão de frutose 6-fosfato em frutose 1,6
bisfosfato e ao estímulo da reação inversa, ou seja, desfosforilação da frutose 1,6
bisfosfato. Assim o fosfoenolpiruvato estimula a gliconeogênese e inibe a via
glicolítica
06/05
> Neoglicogênese, lançadeiras e metabolismo do àlcool
Lançadeiras:
Via glicolítica
- Glicose em piruvato
- 2 moléculas de atp e 2 de nadh
- Oxidação completa: nadh entra na mitocôndria para ser oxidada
Lançadeiras
⟶ Transportam os elétrons de NADH citosólico para a matriz mitocondrial
- Membrana externa permeável (grandes barris) passa nadh, piruvato, atp
- Interna: impermeável (impedir passagem de prótons)
- Sem transportadores para NADH (elétrons entram por lançadeiras)
- Transporte indireto
Membrana interna
- Nad+ (já reduzido- via glicolítica)
- Malato desidrogenase: oxaloacetato⟶malato (oxidando nadh e h+ em nad+)
- Malato (2 elétrons do nad) é transportado pela memb intetrna
Dentro da matriz mitocondrial
- Malato desidrogenase ⟶reação inversa
- malato⟶oxaloacetato (nad+ em nadh + H+)
> Neoglicogênese
- Piruvato (3C, lactato, alanina) é convertido em glicose
- 7 passos reversíveis: mesmas enzimas da glicólise
- 3 irreversíveis
Cérebro e hemáceas consomem 160 g de glicose / dia
- Glicogênio ~8-24 h
- Neoglicogênese: fígado, rim
- Precursores: lactato, aminoácidos e glicerol
Acetil CoA
- Estimula piruvato carboxilase, aumentando vel da neoglicogênese
- Quando célula já possui outros substratos (ácidos graxos) para prod de energia
> Regulação
Pyr ⟶ oxalacetato
Acetil COA
Oxaloacetato ⟶ PEP
Glucagon no fígado
Metabolismo do etanol
Lactato desidrogenase
> Exercícios
1)Descrever atividade da glicólise e da neoglicogênese sob altas relações de atp/adp e
baixas relações, indicando os mecanismos de regulação.
Sob altas concentrações de atp
8/05
Formação de acetil-CoA, ciclo do ácido cítrico
> Oxidação Completa da Glicose
Via glicolítica gastou: 1 glicose, 2 ADP, 2 Pi, 2 NAD+
gerou: 2 ATP, 2 NADH, 2 Pyr
Falta: “Usar” Pyr → Formação de AcCoA e Krebs
Gerar CO2 → Formação de AcCoA e Krebs
“Reciclar” NADH → Transporte de elétrons
Formar ATPs → Fosforilação oxidativa
> Regulação
Ocorre por meio das três etapas irreversíveis e são inibidas pelos produtos da via (NADH e
ATP).
Razão ATP/ADP e NADH/NAD+: baixa indica uma baixa carga energética que age como
estímulo para o ciclo (e a glicólise), enquanto uma alta razão indica uma alta carga
energética que o inibe.
O mais importante ponto de regulação é a reação com isocitrato.
acetil-CoA pelo ciclo de Krebs. A acetil-CoA acumulada forma os corpos cetônicos. O fígado
obtém energia da oxidação de ácidos graxos à acetil-CoA. A glicose é economizada para
ser usada apenas pelo cérebro e hemácias.
> Exercícios
1)
- Citrato sintase: ADP (sinalizador de baixa energia ativa ciclo de krebs), ATP e NADH
inibem
- Isocitrato desidrogenase: Fortemente ativada em ADP e Fortemente inibida por ATP
e NADH
- Alfa cetoglutarato desidrogenase: inibida por ATP e NADH
13/05
> Fosforilação oxidativa
Oxidação completa da glicose
- 6 moléculas de co2
- 2 atp na via glicolítica
- Reoxidar todos Nad e fad→ formar os 38 atps
Ganho de peso
- Relação com
TEORIA QUIMIOSMÓTICA
Teoria de que a energia de oxidação dos elétrons é transformada em energia eletroquímica
pelo gradiente de prótons (ao passo que a membrana mitocondrial interna é impermeável à
prótons, o que gera um acúmulo de cargas no espaço intermembrana), que é então
utilizada para a síntese do ATP.
> Desacopladores
Desacoplador biológico (UCP)
- Proteínas desacopladoras (termogênicas)
- Fazem com que os prótons voltem à matriz sem a formação do ATP,
- dissipando a energia que seria usada nesse processo em forma de calor.
- Hibernação. Em tecido adiposo marrom.
Desacopladores químicos
- O FCCP e o DNP
- Captam o H+ no espaço intermembrana e o liberam na matriz, sem passar pela
ATPase.
- Esses compostos foram usados como remédios para emagrecer, mas causam
danos à saúde por liberarem toxinas (em especial, radicais livres) em excesso.
> Regulação
A transferência de elétrons e a fosforilação oxidativa podem ser bloqueadas por inibidores
específicos.
- complexo I, rotetone
- complexo II, malonato
- complexo III, antimicina
- complexo IV, CN (cianeto) e CO (monóxido de carbono)
- ATPsintase, a oligomicina.
> Isquemia
A fermentação aumenta a quantidade de lactato produzido afim de reoxidar o NADH
necessário para esse processo, o que causa acidose do sangue. Não obstante, o constante
uso de glicose causa hipoglicemia local. O quadro descrito é chamado de anóxia/isquemia.
Quando o oxigênio volta, ocorre a reoxigenação/reperfusão, processo que causa um burst
de radicais livres num processo de vazamento de elétrons, causada pela desorganização da
fosforilação oxidativa. Esse processo ocorre quando um oxigênio recebe apenas um elétron
(o natural seria receber quatro) da coenzima Q, originando um elétron
desemparelhado *O2
Esse elétron é transformado em *OH, que é altamente reativo e pode causar danos em
biomoléculas e, consequentemente, doenças.
> Exercícios
1. Descrever a hipótese quimiosmótica, e as evidências experimentais que apoiam essa
hipótese.
2. Descrever como o ADP e Pi citosólicos são transportados para o interior da mitocôndria,
e como o ATP mitocondrial é transportado para o citosol.
3. Considerando que cada NADH gera 3 ATPs e cada FADH2 gera 2 ATPs através da
fosforilação oxidativa, calcule o saldo de ATPs produzidos por um mol glicose oxidada
no músculo (lançadeira de glicerol-fosfato) e no fígado (lançadeira malato-aspartato).
4. Calcule o saldo de ATP produzido por um mol de glicerol (atenção – não é glicose)
oxidado no fígado, sabendo que glicerol é fosforilado a glicerol 3 fosfato às custas de um
ATP, gerando um ADP.
5. O congelamento de tecidos leva à ruptura de suas membranas por efeito mecânico dos
cristais de gelo formados. Qual o efeito do congelamento de uma suspensão de
mitocôndrias sobre a fosforilação oxidativa e transporte de elétrons?
https://drive.google.com/file/d/11hde53Ebv_Lt2IMfWmr9vsv35HiaPKLd/view?usp=drivesdk
> Metabolismo de Glicogênio
▪ Principal polissacarídeo de reserva em animais
▪ Fígado: Regula níveis glicêmicos (cerca de 12-24 horas)
▪ Músculo: Reserva de glicose para atividade intensa
Síntese de Glicogênio –
Glicose 1 P
UDP-glicose
Iniciação
Adição
Ramificação
Remoção
Glicose 1 P
Desramificação
Glicose 6-P
Glicogênio Fosforilase
▪ Forma fosforilada é mais ativa
▪ Insulina ativa desfosforilação
▪ Glicose (6 P) ativa PP1
▪ Glucagon/Adrenalina ↑ fosforilação
▪ Ca2+ e AMP ativam fosforilação
Fosforilase Quinase
Von Gierke
▪ Deficiência de glicose-6-fosfatase
▪ Descrito como causa de falha de crescimento em cães Malteses
▪ Há acumulo de glicogênio estruturalmente conservado no fígado e no rim
▪ Hipoglicemia de jejum, fraqueza
▪ Tratamento: Inibir absorção de glicose hepática
Alimentação contínua
Cori
▪ Deficiência de enzima desramificadora (amilo - 1,6 - glicosidase)
▪ Descrita em pastores alemães
▪ Há acumulo de glicogênio com cadeias curtas no fígado e músculo
▪ Hipoglicemia, fraqueza muscular
▪ Menor gravidade que von Gierke (fosforólise e neoglicogênese conservadas)
▪ Tratamento: Alimentação frequente, rica em proteínas
McArdle
▪ Deficiência de glicogênio fosforilase muscular
▪ Cãibras musculares dolorosas durante esforço físico intenso e inicial
▪ Recuperação após vasodilatação, que aumenta oferta de glicose e lipídeos
▪ Tratamento: Evitar exercícios vigorosos
https://drive.google.com/file/d/11hde53Ebv_Lt2IMfWmr9vsv35HiaPKLd/view?usp=drivesdk
22/05
> Via das Pentoses
- Síntese de ribose 5P → DNA, RNA
- Metabolismo de açúcares com 7, 5 e 4 carbonos
- Redução de NADP+ a NADPH - doador de elétrons para biossíntese
- doa elétrons para defesa contra radicais livres
5/6
> Regulação hormonal do metabolismo energético
Hormônios
- Biomolécula produzida em uma parte do corpo que regula funções a distância
(vários órgãos e tecidos ao mesmo tempo - integração)
- Age em baixas quantidades
- Essencial para organismos multicelulares
- Receptores na célula-alvo (alteração estrutural)
>Insulina
> Biossíntese
- Peptídeo de duas cadeias, sintetizado como proinsulina
- Armazenado em grânulos de secreçã0
- Celulas beta
> Secreção
Células β
- GLUT2
- glicoquinase
- ↑ glicemia = ↑ ATP
- - ATP inibe canais para K+
- - Despolarização
- - Ativação da entrada de Ca2+
- - Secreção de insulina
- - Síntese de insulina
> Adrenalina
(Epinefrina)
- Sintetizado na adrenal
- Precursores: fenilalanina e tirosina
- Primeiro hormônio biossíntético (não-peptídico)
- Usado clinicamente em parada cardíaca,
choque, anafilaxia
Teobromina e Cafeína
- Inibidores da fosfodiesterase
- Aumentam AMPc
- Aumentam efeitos da adrenalina
- Promovem emagrecimento
Modulação do Apetite
Grelina e PYY
> Leptina