Seminario PIRUVATO DH Y CICLO DE KREBS 2024

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HUMANA

CA
BIO UÍMI

- F
QB II
MED -
Q

CÁTEDRA 1
UB
.

A - DPTO

SEMINARIO
PIRUVATO
DESHIDROGENASA
Y CICLO DE KREBS

MATERIA: QUÍMICA BIOLÓGICA II


CÁTEDRA 1
DPTO. BIOQUÍMICA HUMANA
FMED - UBA
DEPARTAMENTO DE BIOQUÍMICA HUMANA
CÁTEDRA 1 - QUÍMICA BIOLÓGICA - CICLO LECTIVO 2024

SEMINARIO
PIRUVATO DESHIDROGENASA
CICLO DE KREBS

OBJETIVOS

● Reconocer las fases de la respiración celular


● Mencionar origen y destino del piruvato en diferentes condiciones metabólicas y diferentes
tejidos
● Describir la reacción catalizada por la piruvato deshidrogenasa (PDH)
● Mencionar las enzimas y los cofactores del complejo de la PDH
● Conocer la regulación de la PDH
● Identificar origen y destino del acetil-CoA en diferentes condiciones metabólicas
● Describir el ciclo de Krebs
● Identificar sustratos, productos e intermediarios del ciclo de Krebs
● Mencionar las enzimas del ciclo de Krebs y sus cofactores
● Reconocer los puntos de control del ciclo de Krebs
● Entender las diferencias entre FAD y NAD+
● Explicar el balance energético del ciclo de Krebs
● Explicar la regulación del ciclo de Krebs según el control por nivel de sustrato y por el nivel
energético
● Conocer los intermediarios del ciclo que forman parte de reacciones anapleróticas o de puntos
de fuga y las reacciones asociadas.
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CÁTEDRA 1 - QUÍMICA BIOLÓGICA - CICLO LECTIVO 2024

INTRODUCCIÓN
El metabolismo oxidativo puede definirse como la utilización de la energía almacenada en
los nutrientes para la generación de ATP. La ingesta de alimentos constituye una necesidad
fisiológica primordial porque cuando comemos ingerimos fuentes de energía. ¿Qué significa esto?
Los alimentos son combustibles, y al quemarlos (u oxidarlos, químicamente hablando) obtenemos
energía que, conservada en forma de ATP, se utiliza para suplir las necesidades energéticas del
organismo.
En todas las células existen sistemas complejos de reacciones químicas estrictamente
reguladas que producen y requieren energía. Todos los procesos que ocurren en nuestras células
son procesos de transformación de energía. Los combustibles metabólicos (glúcidos, lípidos y
proteínas) son moléculas que contienen una gran cantidad de enlaces C-C y C-H, que al romperse
permiten obtener energía. Algunos ejemplos de utilización de energía son el gradiente
electroquímico que permite crear un medio intracelular de composición diferente a la del medio
externo, o el movimiento organizado de grupos de células, entre otros.
Los procesos de transformación involucrados en la utilización de la energía del enlace
químico de los combustibles pueden dividirse en tres fases: 1) obtención de energía a partir de la
oxidación de las moléculas combustibles, 2) conversión de esa energía a una forma biológicamente
útil, que es la que se encuentra en las uniones de alta energía del ATP y 3) utilización de la energía
contenida en las uniones del ATP. Las primeras dos fases son parte del proceso de respiración
celular.
Al hablar de respiración celular, nos referimos a los procesos celulares que, al oxidar los
combustibles biológicos, liberan CO2, consumen O2 y generan ATP. Los procesos que constituyen
la respiración celular pueden dividirse en 3 fases. En la fase 1 se produce la oxidación de los
combustibles metabólicos con transferencia de electrones a las coenzimas aceptoras NAD+ y FAD
que se reducen a NADH y FADH2, respectivamente. En esta fase, la mayoría de los combustibles
metabólicos (glúcidos, ácidos grasos y muchos aminoácidos) convergen en la generación del grupo
acetilo (de 2 carbonos) activado: el acetil-CoA. En la fase 2 ocurre la oxidación completa del grupo
acetilo del acetil-CoA a CO2 (la forma más estable del carbono) en el ciclo de los ácidos
tricarboxílicos o ciclo de Krebs (o ciclo del ácido cítrico) y también aquí la energía se almacena
principalmente como NADH y FADH2. La fase 2 ocurre exclusivamente en las mitocondrias. En la
fase 3, la energía obtenida a partir de la oxidación de los combustibles (en forma de coenzimas
reducidas) es convertida en la energía de las uniones del ATP a través del proceso de fosforilación
oxidativa. Los electrones se transfieren desde el NADH y el FADH2 (las coenzimas se reoxidan) al
O2, a través de la cadena de transporte de electrones. Este proceso genera un potencial
electroquímico en la forma de un gradiente de protones a través de la membrana mitocondrial
interna que puede utilizarse para la síntesis de ATP a partir de ADP y fosfato inorgánico (Pi) (Figura
1).

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Figura 1: Representación esquemática de las fases de la respiración celular

La velocidad de las reacciones involucradas en la oxidación de los combustibles está


coordinada con la velocidad de utilización del ATP, por un mecanismo de retroalimentación
(feedback). Como consecuencia de este mecanismo de regulación, los combustibles que no se van
a utilizar inmediatamente son almacenados en lugar de ser oxidados.
Se denominan vías catabólicas a las reacciones metabólicas a través de las cuales los
combustibles ingeridos o almacenados son degradados para obtener energía. En las reacciones
catabólicas (generalmente reacciones de oxidación) sucede la conversión de moléculas grandes y
complejas en moléculas pequeñas y simples (CO2 y H2O) y la producción de energía. Por el
contrario, las vías metabólicas involucradas en la biosíntesis de macromoléculas se denominan vías
anabólicas y generalmente resultan en la síntesis de moléculas grandes y complejas a partir de
precursores pequeños. A diferencia de las reacciones catabólicas, los procesos anabólicos son
reductivos (reacciones de reducción) y consumen energía.
Los ácidos grasos son el principal combustible metabólico del organismo. Luego de una
ingesta rica en glúcidos (pastas, pan, azúcar, papa, etc.), su exceso se almacena en los residuos
de glucosa del glucógeno. Sin embargo, esta forma de almacenamiento es relativamente limitada,
de manera que el exceso de glúcidos que sobrepasa la capacidad de ser convertido en glucógeno,

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se transforma en triacilglicéridos (“depósitos lipídicos”) que se almacenan en el tejido adiposo.


Obviamente, también el exceso de lípidos de la dieta se almacena de esta forma.
En los períodos de ayuno se liberan ácidos grasos de estos depósitos, circulan por la sangre
unidos a albúmina y se oxidan a acetil-CoA en el músculo, hígado y muchos otros tejidos, por la vía
de la -oxidación. Uno de los principales destinos metabólicos del acetil-CoA es el Ciclo de Krebs.
Todas las células requieren ATP en forma continua. Sin embargo, el aporte de combustibles
para obtener energía no es un proceso continuo. La disponibilidad constante de combustibles a
pesar de la discontinuidad de las ingestas alimenticias y de la variación en la velocidad de su
utilización se denomina homeostasis metabólica y se logra a través de la regulación hormonal de
las vías de almacenamiento y de movilización de combustibles metabólicos, principalmente
mediada por la insulina y sus hormonas contrarregulatorias: el glucagon, la adrenalina y el cortisol.
La glucosa tiene un rol central en la homeostasis metabólica debido a que el cerebro y
algunos otros tejidos no pueden usar ácidos grasos como combustibles. Los niveles sanguíneos de
glucosa en personas sanas se mantienen en alrededor de 70 mg%. Los niveles inadecuados de
insulina o la resistencia de los tejidos a sus efectos ocasionan la hiperglucemia característica de la
Diabetes Mellitus.
El ciclo de Krebs constituye la etapa intermedia del metabolismo. Además de ser la vía final
de oxidación de los combustibles metabólicos, también provee intermediarios para procesos
anabólicos. Este rol central en el metabolismo hace que la comprensión de su funcionamiento y
regulación sea un tema clave para el estudio del metabolismo normal y de su alteración en diferentes
patologías.

PIRUVATO: ¿DE DONDE PROVIENE Y CUÁL ES SU DESTINO METABÓLICO?


El piruvato es el producto final de la glucólisis aeróbica que ocurre en el citosol y también de
la degradación de algunos aminoácidos como alanina, serina y cisteína. El destino del piruvato
depende del tejido en el que se produce y de su estado metabólico. Además de ser sustrato del
complejo de la piruvato deshidrogenasa para generar acetil-CoA, el piruvato puede ser utilizado en
otras vías metabólicas como, por ejemplo: a) transaminación a alanina, b) carboxilación para
generar oxalacetato (sustrato gluconeogénico) y c) reducción a lactato (glucólisis anaeróbica).

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PIRUVATO DESHIDROGENASA
Como ya hemos dicho, el piruvato se transforma en acetil-CoA por descarboxilación
oxidativa, en una reacción catalizada por un complejo multienzimático denominado piruvato
deshidrogenasa. Esta enzima se localiza exclusivamente en mitocondrias, en altas
concentraciones en tejidos como el músculo cardíaco y el riñón. Es importante mencionar que esta
reacción NO FORMA PARTE DEL CICLO DE KREBS ni de ninguna otra vía metabólica. Cabe
destacar que esta reacción NO ES LA ÚNICA FUENTE DE acetil-CoA para el ciclo de Krebs y su
aporte en la producción de este metabolito depende de cada tejido.
La piruvato deshidrogenasa cataliza la siguiente reacción:

piruvato + NAD+ + CoA → acetil-CoA + CO2 + NADH + H+ Gº’ = -8 kcal/mol

La reacción catalizada por la piruvato deshidrogenasa es altamente exergónica (Gº’


negativo), por este motivo la conversión neta de ácidos grasos a carbohidratos no puede ocurrir
en nuestro organismo.
El complejo piruvato deshidrogenasa posee tres actividades enzimáticas denominadas:
piruvato deshidrogenasa (E1), dihidrolipoil transacetilasa (E2) y dihidrolipoil deshidrogenasa (E3).
Cinco coenzimas o grupos prostéticos participan en la reacción de la piruvato deshidrogenasa:
pirofosfato de tiamina, ácido lipoico, coenzima A, FAD y NAD+. La E1 tiene covalentemente unido
pirofosfato de tiamina, la E2 tiene covalentemente unido ácido lipoico y la E3 tiene covalentemente
unido FAD. En la Figura 2 se indican las estructuras del pirofosfato de tiamina y en la Figura 3 las
del ácido lipoico y su modificación en la reacción catalizada por el complejo de la piruvato
deshidrogenasa.

Figura 2. Estructuras del pirofosfato de tiamina

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Figura 3. Estructuras del ácido lipoico

Mecanismo de la reacción
1) El piruvato interactúa con el pirofosfato de tiamina de la subunidad piruvato deshidrogenasa
(E1) y sufre una descarboxilación convirtiéndose en un grupo hidroxietilo.
2) A continuación, se transfiere el grupo acetilo y 2 electrones al grupo lipoico unido a la
dihidrolipoil transacetilasa (E2) para formar el acetil-tioéster del ácido lipoico en su forma reducida.
3) En el siguiente paso, se transfiere el grupo acetilo desde el ácido lipoico a la coenzima A.
En ambos casos se trata de tioésteres.
4) El ácido lipoico reducido es reoxidado en una reacción catalizada por la dihidrolipoil
deshidrogenasa (E3) que cataliza la transferencia de dos átomos de hidrógeno del ácido lipoico
reducido a la coenzima FAD, su grupo prostético.
5) El último paso consiste en la transferencia de un ion hidruro al NAD+, regenerando la forma
oxidada del FAD. El complejo se encuentra ahora en condiciones de producir la transformación de
una nueva molécula de piruvato.

De la descripción del mecanismo de la reacción se desprende que existe una activa


participación de grupos tioles en el mecanismo catalítico de la enzima y por lo tanto agentes que
oxiden o formen complejos con los grupos tioles serán potentes inhibidores del complejo enzimático.
Por ejemplo, el arsenito.

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Figura 4. Mecanismo general de la reacción catalizada por el complejo PDH

REGULACIÓN DE LA ACTIVIDAD PIRUVATO DESHIDROGENASA


La actividad del complejo de la piruvato deshidrogenada presenta dos tipos de regulación:
1) alostérica: dos de los productos de la reacción, el acetil-CoA y el NADH, la inhiben en forma
alostérica, 2) por modificación covalente: el complejo existe en dos formas: una forma activa
(desfosforilada) y otra forma inactiva (fosforilada). La inactivación del complejo es catalizada por
una proteína quinasa dependiente de ATP-Mg2+ que está fuertemente unida al complejo. La
reactivación del complejo está catalizada por una fosfoproteína fosfatasa que cataliza la
desfosforilación del complejo en forma dependiente de Mg2+ y de Ca2+. Tres residuos diferentes en
la subunidad  de la piruvato deshidrogenasa se fosforilan por la proteína quinasa, pero la
fosforilación de solo uno de ellos está relacionada con la actividad del complejo. La regulación
diferencial de la quinasa y de la fosfatasa es la clave de la regulación de la actividad del complejo.
La formación de acetil-CoA está coordinada con la velocidad de utilización del ATP. Esto es
consecuencia del efecto que tienen en su actividad las variaciones en las concentraciones de ADP,
piruvato, CoA-SH, NAD+, acetil-CoA y Ca2+ intramitocondrial. Todos estos compuestos regulan la
conversión de la enzima a la forma inactiva (fosforilada). La quinasa es inhibida por ADP, cuyos
niveles aumentan cuando aumenta el consumo de ATP. Esta inhibición mantiene a la piruvato
deshidrogenasa en la forma activa, no fosforilada. En algunos tejidos, el aumento de la
concentración de Ca2+ intramitocondrial, que estimula la fosfatasa, contribuye al incremento de la
forma desfosforilada y, por lo tanto, la forma activa. El acetil-CoA y el NADH, productos de la
reacción, inhiben a la forma desfosforilada (activa) de la enzima, y también activan a la quinasa,

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llevando a un desplazamiento del complejo a su forma inactiva. Además, la CoA-SH y el NAD+


inhiben a la quinasa. Por lo tanto, cuando se produce un aumento en las relaciones NADH/NAD+ o
acetil-CoA/CoA-SH (como por ejemplo durante la -oxidación de ácidos grasos), la actividad del
complejo enzimático disminuye marcadamente. Además, el piruvato es un poderoso inhibidor de la
quinasa y, por lo tanto, en presencia de altas concentraciones de piruvato, la quinasa estará inhibida
y el complejo tendrá su máxima actividad. Finalmente, se ha demostrado que la administración de
insulina puede activar a la piruvato deshidrogenasa del tejido adiposo y que las catecolaminas
(como la adrenalina) pueden activar a la enzima del tejido cardíaco. Los mecanismos aún no están
completamente aclarados, pero podría estar involucrada una alteración en la distribución intracelular
de calcio, que afecta a la fosfoproteína fosfatasa. Estos efectos hormonales no están mediados
directamente por alteraciones en los niveles de AMPc dado que tanto la quinasa como la fosfatasa
del complejo son independientes de AMPc (Figura 5).

Figura 5. Regulación de la actividad del complejo PDH

En conclusión, la actividad del complejo enzimático aumenta cuando se requiere un aporte


de acetil-CoA al ciclo de Krebs o cuando aumenta la concentración de sus sustratos, aunque en
ese último caso, el destino final del acetil-CoA no será únicamente el ciclo.

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Acetil-CoA
La mayor parte de las principales vías catabólicas genera la unidad de dos carbonos del
acetil-CoA. El catabolismo de los glúcidos almacenados o ingeridos, a través de la vía glucolítica,
el de los ácidos grasos de cadena larga provenientes de la lipólisis de los triacilglicéridos a través
de la -oxidación, la oxidación de cuerpos cetónicos y de etanol o el catabolismo de ciertos
aminoácidos producto de proteólisis, luego de su transaminación o desaminación y posterior
oxidación proveen precursores para la formación de acetil-CoA:

En la Figura 6 se muestra la estructura de la coenzima A (CoA-SH). Es un nucleótido que se


compone de -mercaptoetilamina, la vitamina ácido pantoténico y un nucleótido de adenina,
adenosina 3’- fosfato 5’-difosfato. Su grupo tiol (-SH) se encuentra reducido y está involucrado en
muchas reacciones de transferencia de grupos acilo en las que la CoA-SH alternativamente
funciona como el aceptor y luego el dador de la función acilo.

Figura 6. Estructura de la coenzima A

En muchas vías metabólicas, los intermediarios son compuestos donde participa la CoA-SH,
por ejemplo, en la -oxidación de ácidos grasos y en la degradación de aminoácidos ramificados.
Como muchos otros nucleótidos, los derivados de la CoA-SH no se transportan libremente a través
de las membranas celulares, sino que lo hacen a través de transportadores o mecanismos
específicos. También es importante señalar que el enlace tioéster del acetil-CoA es un enlace rico

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en energía, y por lo tanto estos compuestos pueden servir como dadores eficientes de grupos acilo
en reacciones de transferencia de acilo.
En la síntesis de acetil-CoA catalizada por la enzima acetato tioquinasa debe utilizarse una
molécula de ATP y la reacción se produce con gasto de 2 enlaces de alta energía:

acetato + CoA-SH + ATP → acetil-CoA + AMP + PPi

Los destinos metabólicos del acetil-CoA generado en las mitocondrias pueden ser:
a) oxidación completa del grupo acetilo en el ciclo de Krebs, con generación de energía.
b) conversión a cuerpos cetónicos (en determinadas situaciones metabólicas, en el ayuno y
exclusivamente en el hígado): acetoacetato y -hidroxibutirato.
c) transferencia de acetilos al citosol y la subsecuente biosíntesis de moléculas complejas como
ácidos grasos de cadena larga y esteroles (en la saciedad).

CICLO DE KREBS

El destino principal del acetil-CoA es la oxidación completa a CO2 en una serie de reacciones
oxidativas cíclicas, denominadas ciclo de Krebs (en homenaje al investigador que postuló las
características esenciales del ciclo en el año 1937) o de los ácidos tricarboxílicos. Todas las enzimas
del ciclo se localizan en la mitocondria, lo que coincide con la localización del complejo de la piruvato
deshidrogenasa y de las enzimas de la β-oxidación, las dos fuentes principales de acetil-CoA. Una
de las funciones principales del ciclo es la generación de equivalentes de reducción, que se utilizan
para generar energía (ATP), en la secuencia de transporte de electrones y fosforilación oxidativa,
procesos que también ocurren en las mitocondrias.
La oxidación del acetil-CoA ocurre en cuatro reacciones que transfieren electrones a las
coenzimas aceptoras NAD+ o FAD. En otras reacciones del ciclo se rearreglan los enlaces para
facilitar esta transferencia. Inicialmente la porción acetilo del acetil-CoA se combina con el
intermediario de cuatro carbonos, el oxalacetato, para formar citrato (6 carbonos). Un rearreglo
subsecuente de enlaces en el citrato es seguido por dos descarboxilaciones oxidativas. Estas
reacciones transfieren los electrones al NAD+ y liberan 2 carbonos como 2 CO2. En el siguiente
paso, se genera un enlace de alta energía del GTP por un mecanismo de fosforilación a nivel de
sustrato. En la porción remanente del ciclo hay dos reacciones de transferencia electrónica
adicionales y se regenera el oxalacetato. El proceso completo ocurre con la conservación de la
mayor parte de la energía de los enlaces químicos del grupo acetilo dando como productos finales
3 NADH, 1 FADH2 y 1 GTP (Figura 7). Aproximadamente 2/3 del NADH y del FADH2 generados en
todas las vías de oxidación de combustibles provienen de Krebs. La velocidad del ciclo está

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fuertemente coordinada a la velocidad de utilización de ATP a través de la regulación de enzimas


individuales por compuestos relacionados con el ATP, por el estado de reducción del NAD+ y por la
concentración mitocondrial de Ca2+.

Figura 7. Visión general del ciclo de Krebs

OXIDACIÓN DE ACETIL-CoA EN EL CICLO DE KREBS


La primera reacción del ciclo de Krebs involucra la condensación del grupo acetilo con la
función -ceto del ácido dicarboxílico oxalacetato, para formar citrato, un intermediario de 6
carbonos. Esta reacción es catalizada por la enzima citrato sintasa que se localiza en la matriz
mitocondrial. Es una reacción altamente exergónica (Gº’= -9 kcal/mol) que se encuentra
desplazada hacia la formación del citrato, considerablemente desplazada del equilibrio en
condiciones fisiológicas, lo que hace a este paso un candidato ideal para la regulación. Sin embargo,
no se ha demostrado que la enzima tenga reguladores alostéricos en tejidos de mamíferos.

En el siguiente paso, catalizado por la enzima aconitasa, se forma isocitrato por la


transferencia de un grupo hidroxilo a un carbono adyacente, que posee un enlace C-H. Esta

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reacción involucra la generación de un intermediario unido a la enzima, el cis-aconitato. En el


equilibrio existe un 90% de citrato, 3% de cis-aconitato y un 7% de isocitrato. Por lo tanto, en el
equilibrio, predomina el citrato. Aunque la reacción no requiere cofactores, si requiere hierro (Fe2+)
y existe evidencia de que éste estaría involucrado en un centro Fe-S, componente esencial de la
actividad hidratasa de la aconitasa.

La isocitrato deshidrogenasa cataliza la primera reacción de deshidrogenación del ciclo.


El isocitrato se convierte en -cetoglutarato en una reacción de descarboxilación oxidativa. En este
paso del ciclo se produce el primero (de los dos) CO2 y se genera el primero (de los tres) NADH +
H+.

La enzima requiere NAD+ como aceptor de los equivalentes de reducción. Si bien existe otra
actividad de isocitrato deshidrogenasa en el citosol que requiere NADP+, no es ésta la que participa
del ciclo y su función en el citosol es la de proveer equivalentes de reducción para procesos
reductivos citosólicos. El equilibrio de la reacción está muy desplazado hacia la formación de -
cetoglutarato, con un Gº'= -5 kcal/mol. La enzima tiene un peso molecular de 380.000 y está
constituida por 8 subunidades idénticas. Se requiere un metal divalente (Mn2+ o Mg2+) para la
descarboxilación de la posición β del isocitrato. La enzima se activa por ADP y en algunos casos
por AMP y se inhibe por ATP y NADH. Por lo tanto, se inhibe en condiciones de alta disponibilidad
de energía (alta relación ATP/ (ADP + Pi) y NADH/NAD+). En situaciones de baja energía, la
actividad de la enzima se estimula, lo que permite acelerar la generación de energía por el ciclo.
La conversión de −cetoglutarato a succinil-CoA es catalizada por el complejo
multienzimático de la -cetoglutarato deshidrogenasa que está compuesto por 3 actividades
enzimáticas diferentes: -cetoglutarato deshidrogenasa, dihidrolipoil transuccinilasa y dihidrolipoil

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deshidrogenasa. Su peso molecular es de varios millones de daltons y pertenece a una familia de


complejos similares que descarboxilan oxidativamente al -cetoglutarato, al piruvato, al -
cetobutirato y a los -cetoácidos de los aminoácidos de cadena ramificada (valina, leucina e
isoleucina).

-cetoglutarato succinil-CoA

Este complejo es casi idéntico al de la piruvato deshidrogenasa en cuanto al tipo de reacción


que cataliza y a algunas de sus características estructurales. También en este caso, el pirofosfato
de tiamina, el ácido lipoico, la CoA-SH, el FAD y el NAD+ participan del mecanismo catalítico. El
equilibrio está desplazado hacia la formación de succinil-CoA con un Gº’ = -8 kcal/mol. En esta
reacción se genera la segunda molécula de CO2 y el segundo equivalente de reducción del ciclo
(NADH + H+). El otro producto, el succinil-CoA, es un ejemplo de tioéster rico en energía, similar al
acetil-CoA. A diferencia del complejo de la piruvato deshidrogenasa, la actividad de este complejo
no está regulada por fosforilación. Los nucleósidos trifosfato ATP y GTP, NADH y succinil-CoA
inhiben su actividad, mientras que el aumento en la concentración de Ca2+ lo activa. La energía del
enlace tioéster del succinil-CoA se conserva en una reacción de fosforilación a nivel de sustrato en
el siguiente paso del ciclo. La fosforilación a nivel de sustrato consiste en la formación de un nuevo
enlace de fosfato de alta energía en una reacción en la que no participa directamente el oxígeno.
La reacción catalizada por la succinil-CoA sintetasa o succinato tioquinasa convierte el
succinil-CoA en succinato y resulta en la fosforilación del GDP para generar GTP. La reacción es
libremente reversible con un Gº’= -0,7 kcal/mol.

Dada la presencia de la nucleósido difosfato quinasa (NDQ), el grupo -fosfato del GTP
puede generar ATP por transferencia al ADP.
NDQ (Mg2+)
ADP + GTP  ATP + GDP

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El succinato se oxida a fumarato en la reacción catalizada por la succinato


deshidrogenasa. Se transfiere un electrón de cada grupo metileno adyacente del succinato a un
FAD unido a la succinato deshidrogenasa, formándose entonces el doble enlace del fumarato.

Gº’ = 0 kcal/mol

Del FADH2 (forma reducida) unido a la enzima, los electrones pasan a la cadena de
transporte de electrones. La enzima, compuesta por dos subunidades, está fuertemente unida a la
membrana mitocondrial interna. La mayor de las subunidades contiene el sitio de unión del sustrato,
el FAD covalentemente unido a una lisina, varios átomos de hierro no-hémico y de azufre lábiles,
mientras que la subunidad menor contiene hierro no-hémico y azufre lábil. Esta enzima es un
ejemplo típico de una proteína hierro-azufre en la cual el hierro no-hémico sufre un cambio de
valencia durante la remoción de los electrones y de los protones del succinato y la subsecuente
transferencia de estos equivalentes de reducción por el FAD covalentemente unido a la cadena de
transporte de electrones a nivel de la coenzima Q-citocromo b. La succinato deshidrogenasa es
inhibida fuertemente por malonato y oxalacetato y activada por succinato. Dada su similitud
estructural con el succinato, el malonato es un inhibidor competitivo de la enzima.
En el siguiente paso del ciclo, el fumarato se hidrata para formar L-malato, en una reacción
catalizada por la enzima fumarasa. Un grupo OH- y un protón del agua se agregan al doble enlace
del fumarato transformándolo en malato. La fumarasa es estereoespecífica para la forma trans del
sustrato (la forma cis, el maleato o ácido maleico, no es sustrato de esta enzima) y el producto de
la reacción es solamente L-malato (no su isómero, el D-malato). La reacción es libremente reversible
en condiciones fisiológicas.

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La última reacción del ciclo, catalizada por la malato deshidrogenasa, genera el último (de
tres) de los equivalentes de reducción como NADH + H+. El grupo alcohol del malato se oxida a
grupo ceto cediendo sus electrones a la coenzima. En el equilibrio predomina el malato, dado que
para esta reacción el Gº’= + 7,0 kcal/mol. La reacción es por lo tanto fuertemente endergónica en
la dirección de formación de oxalacetato. Sin embargo, las reacciones siguientes catalizada por la
citrato sintasa y otras, permiten la formación del oxalacetato pues mantienen sus niveles muy bajos,
ya que es utilizado en las siguientes reacciones. Además, el NADH + H+ producido se oxida
rápidamente en la cadena de transporte de electrones.

El oxalacetato que es imprescindible para la oxidación del acetil-CoA siempre se regenera:


en cada ciclo, 2 carbonos se incorporan en la forma del grupo acetilo, 2 se eliminan como CO2, y la
unidad de 4 carbonos está presente en el succinato, fumarato, malato y oxalacetato.
Es importante destacar que la secuencia de las últimas reacciones del ciclo de Krebs:
oxidación por formación de un doble enlace, adición de agua al doble enlace y oxidación del alcohol
resultante a cetona, se encuentra en muchas vías metabólicas tales como la oxidación de los ácidos
grasos y de aminoácidos ramificados.

COENZIMAS

Diferencias entre NAD+ y FAD


En la oxidación del succinato a fumarato y en la oxidación del lipoato reducido a lipoato
disulfuro, el FAD es el aceptor de electrones. En las otras oxidaciones esa función la cumple el
NAD+. ¿Por qué? Estas coenzimas tienen diferentes propiedades y cumplen funciones diferentes.
Las diferencias en la estructura química (Figura 8) de las dos coenzimas determinan que
ambas cumplan roles fisiológicos diferentes. El FAD puede aceptar electrones individuales (H•) y
formar un intermediario semi-reducido con un electrón. Por lo tanto, participa en reacciones donde
se transfieren electrones individuales desde dos átomos diferentes tales como los dos C-H
adyacentes en el succinato o los dos grupos SH del ácido dihidrolipoico. El NAD+ se reduce luego
de aceptar un ion hidruro (H-) en reacciones tales como la conversión de un alcohol a cetona.

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La forma radical libre del FAD, con un electrón extra, es muy reactiva y el FADH• puede
perder su electrón por exposición a agua o por iniciación de reacciones en cadena. Sin embargo,
esto no ocurre porque el FADH• permanece unido fuertemente (a veces covalentemente) a la
enzima mientras acepta y transfiere electrones a otro grupo de la enzima. El FADH2 en la succinato
deshidrogenasa está covalentemente unido y no se disocia de la enzima que se encuentra en la
membrana mitocondrial interna donde los electrones del FADH2 son cedidos a la coenzima Q, un
intermediario de la cadena de transporte de electrones. Todas las otras enzimas del ciclo de Krebs
se encuentran en la matriz mitocondrial. A diferencia del FAD, el NAD+ está generalmente libre en
solución, se une a la deshidrogenasa y acepta electrones y luego se libera y difunde. Por lo tanto,
el NAD+ y el NADH funcionan más como sustratos y productos que como coenzimas. Esta
característica le permite al NADH ser un regulador de la función celular. El NADH generado por una
deshidrogenasa puede inhibir a otra si no es reoxidado por la cadena de transporte de electrones.
La regulación del ciclo por la relación NADH/NAD+ es parte del mecanismo que permite coordinar
la oxidación de combustibles con la utilización de ATP.

Figura 8. Diferencias estructurales de las coenzimas del ciclo de Krebs

Coenzima A
La CoA-SH es una coenzima de acilación y participa en reacciones en las que se forma un
enlace tioéster con un grupo acilo (acetil-CoA, succinil-CoA). El carbono carbonílico, el carbono  y
el carbono β del grupo acilo se activan en diferentes tipos de reacciones por la formación del enlace
tioéster con el grupo sulfhidrilo de la coenzima A. La hidrólisis de este enlace tiene un alto valor
negativo de Gº’ (aprox. -13 kcal/mol). El enlace tioéster es mucho menos estable que un enlace

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éster, pues el azufre no comparte sus electrones en estados de resonancia. La energía liberada por
la ruptura del tioéster cumple dos funciones en el ciclo de Krebs: provee la energía para la
generación de GTP y hace que la entrada del acetil-CoA al ciclo sea más favorable
termodinámicamente.
En la condensación de la porción acetilo con oxalacetato para formar citrato, la ruptura del
enlace tioéster del acetil-CoA ocurre con un Gº’= -7,7 kcal/mol. Cuando este valor negativo se
agrega al gran valor positivo para la reacción de la malato deshidrogenasa, se obtiene un valor neto
cercano a 0 para la conversión de malato a citrato. Por lo tanto, la entrada del acetil-CoA al ciclo se
facilita por la ruptura del enlace tioéster.
Dado que el enlace tioéster del acetil-CoA tiene un Gº’ de hidrólisis de -13 kcal/mol, su
formación requiere energía, como ya se mencionó. La energía es aportada por la descarboxilación
oxidativa del piruvato en la reacción catalizada por el complejo de la piruvato deshidrogenasa o de
reacciones de oxidación y ruptura de enlaces C-C de ácidos grasos o aminoácidos.
El acetato también puede convertirse directamente en acetil-CoA utilizando la energía
aportada por ATP, en una reacción catalizada por la acetato tioquinasa, como ya se describió.

BALANCE ENERGÉTICO DEL CICLO DE KREBS


¿Qué transformación neta ocurre en el ciclo? En primer lugar, el grupo acetilo de dos
carbonos del acetil-CoA se oxida generando 2 moléculas de CO2. Una función del ciclo es conservar
la energía de esta oxidación en forma de coenzimas transportadoras de electrones en estado
reducido. El balance global del ciclo muestra que el grupo acetilo funciona como fuente de carbonos
para el CO2 y como fuente de electrones para la transferencia a las coenzimas.

acetil-CoA + 3 NAD+ + FAD + GDP + Pi + 2 H2O → 2 CO2 + CoA-SH + 3 NADH + 3 H+ + FADH2 + GTP

El acetil-CoA es el combustible del ciclo, su oxidación no involucra O2 directamente, y se


lleva a cabo removiendo electrones como hidrógeno o ion hidruro y agregando H2O. Los 4 oxígenos
de los 2 CO2 provienen del grupo carbonilo del acetil-CoA. Las diferentes reacciones del ciclo
involucran el rearreglo de los carbonos y los electrones donados por el grupo acetilo de modo que
los mismos carbonos y electrones no entran y salen del ciclo en una sola vuelta.

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Figura 9. Ciclo de Krebs

El rendimiento completo en compuestos que contienen energía es de 3 NADH, 1 FADH2 y 1


GTP. Las reacciones rédox son catalizadas por 4 deshidrogenasas: isocitrato deshidrogenasa, -
cetoglutarato deshidrogenasa, succinato deshidrogenasa y malato deshidrogenasa. El enlace de
alta energía del GTP se origina en una reacción de fosforilación a nivel de sustrato catalizada
por la succinato tioquinasa o succinil-CoA sintetasa. Los 4 equivalentes de reducción se usan
subsecuentemente para generar energía. Como se discutirá más adelante, la oxidación de cada
mol de NADH + H+ resulta en la formación de 2,5 moles de ATP mientras que la de FADH2 en 1,5.
Por lo tanto, la ganancia neta para la oxidación de cada mol de acetil-CoA en el CAT es de 10 moles
de ATP.
Tres reacciones del ciclo (las catalizadas por la citrato sintasa, la isocitrato deshidrogenasa
y la -cetoglutarato deshidrogenasa) tienen valores muy negativos de Gº’. En condiciones
fisiológicas, estas reacciones son irreversibles debido a sus altos valores (negativos) de Gº’ y
porque las enzimas involucradas catalizan las reacciones inversas muy lentamente. Estas
reacciones realizan la contribución principal al elevado Gº’ negativo del ciclo.

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Aunque el ciclo de Krebs genera directamente solo un ATP por vuelta (en la conversión de
succinil-CoA a succinato), las cuatro reacciones de oxidación en el ciclo proporcionan un gran flujo
de electrones hacia la cadena respiratoria a través de NADH y FADH2 y, por lo tanto, llevan a la
formación de un gran número de moléculas de ATP en la fosforilación oxidativa. Como ya vimos, el
rendimiento energético de la producción de dos moléculas de piruvato a partir de una molécula de
glucosa en la glucólisis es 2 ATP y 2 NADH. En la fosforilación oxidativa, el paso de dos electrones
del NADH al O2 impulsa la formación de aproximadamente 2,5 ATP, y el paso de dos electrones del
FADH2 al O2 produce alrededor de 1,5 ATP. Esta estequiometría nos permite calcular el rendimiento
global de ATP a partir de la oxidación completa de la glucosa. Cuando ambas moléculas de piruvato
se oxidan a 6 CO2 a través del complejo de piruvato deshidrogenasa y el ciclo de Krebs, y los
electrones se transfieren al O2, mediante la fosforilación oxidativa se obtienen hasta 32 ATP por
glucosa. En números redondos, esto representa la conservación de 32 x 7,29 kcal/mol= 233,27
kcal/mol, que representa el 34% del máximo teórico de aproximadamente 678,8 kcal/mol disponible
de la oxidación completa de glucosa. Estos cálculos utilizan la variación de energía libre estándar.
Cuando se corrige por la energía libre real requerida para formar ATP dentro de las células la
eficiencia calculada del proceso está más cerca del 65% (Principios de Bioquímica, Lehninger).

Enzima Gº (kcal/mol)


citrato sintasa -7,7
aconitasa +1,5
isocitrato deshidrogenasa -5,3
-cetoglutarato deshidrogenasa -8,0
succinato tioquinasa -0,7
succinato deshidrogenasa 0
fumarasa 0
malato deshidrogenasa +7,1

REGULACIÓN DEL CICLO DE KREBS


La oxidación del acetil-CoA y la conservación de la energía en las coenzimas reducidas que
permite la generación de ATP son esenciales en todos los tejidos que contienen mitocondrias. La
velocidad de utilización de ATP es, por lo tanto, la fuerza fisiológica primaria impulsora del ciclo.
Existen dos señales principales de la velocidad de utilización de ATP: a) el estado de fosforilación
de los nucleótidos de adenina, que se refleja en los niveles de ATP y ADP, y b) el estado de
reducción del NAD+, reflejado en la relación NADH/NAD+. Dentro de la célula y aún dentro de la
mitocondria, la suma de la concentración de nucleótidos de adenina (AMP, ADP y ATP) y la de
NAD+ (NAD+ y NADH) son relativamente constantes. Sin embargo, la velocidad de interconversión
de los nucleótidos de adenina y la velocidad de oxidación y reducción de las coenzimas varían

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considerablemente entre distintas situaciones metabólicas. Por lo tanto, un aumento en la utilización


de ATP resultaría en una pequeña disminución en sus niveles y un aumento en la concentración de
ADP. Análogamente, un aumento en la oxidación de NADH por la cadena de transporte provocaría
un aumento en el contenido de NAD+ y una disminución en el de NADH.
Dado que las deshidrogenasas principales son dependientes del aporte continuo de NAD+ y
de FAD, sus actividades están estrictamente controladas por la cadena respiratoria que es
responsable de su oxidación y que está obligatoriamente acoplada a la generación de ATP. De este
modo, la actividad del ciclo es muy dependiente del control respiratorio, que a su vez está afectado
por el aporte de ADP + Pi y de oxígeno. Un agente inhibitorio o una condición metabólica que
interrumpa el aporte de oxígeno, el aporte continuo de ADP o la fuente de equivalentes de reducción,
inhibirán la actividad del ciclo. Este tipo de control se conoce como “control grueso”.
Hay también un número de interacciones mediadas por efectores entre intermediarios,
nucleótidos y las enzimas del ciclo que pueden ejercer un “control fino” de su actividad.
Los conceptos generales con respecto a los mecanismos de regulación que se aplican a
todas las vías metabólicas pueden ser aplicados también en este caso. La regulación de la velocidad
de una vía metabólica ocurre sobre las enzimas que catalizan los pasos limitantes de la velocidad,
o sea los más lentos. Se puede hacer una analogía considerando la velocidad promedio en una
autopista cuando en alguna zona hay un bloqueo que sólo deja libre un carril. En ese caso, el tránsito
en esa zona se hace más lento y esta disminución de la velocidad se transmite hacia el principio de
la autopista. Suponiendo que el lugar del bloqueo constituya la etapa limitante de la velocidad, una
modificación en el mismo, por ejemplo, la apertura de un nuevo carril para el tránsito aumentará
significativamente la velocidad global en la autopista. En forma semejante, la velocidad de toda una
vía metabólica está determinada por la de la reacción más lenta y por lo tanto la regulación de la
actividad de la vía ocurre principalmente a ese nivel.
Otro de los conceptos generales que también se aplica aquí, es que las vías que deben
mantener un nivel constante de un producto final, como el ATP se regulan por un feedback de ese
producto o un metabolito relacionado. En este caso, ATP, ADP, NADH y NAD+ participan en la
regulación por feedback (o retroalimentación).
La regulación del ciclo ocurre principalmente a nivel de dos enzimas: la isocitrato
deshidrogenasa y la -cetoglutarato deshidrogenasa. La capacidad de ambas enzimas es
relativamente baja en condiciones fisiológicas y por lo tanto constituyen los pasos limitantes del
ciclo. La isocitrato deshidrogenasa es una enzima oligomérica (formada por varias subunidades)
que es activada alostéricamente por ADP e inhibida por NADH. En ausencia de ADP exhibe
cooperatividad positiva, es decir que cuando el isocitrato se une a la primera subunidad, las otras
subunidades se convierten a una conformación activa. En presencia de ADP cambia la
conformación de todas las subunidades de modo que el isocitrato se une más rápidamente a la
enzima y el Km aparente cambia a un valor mucho menor. Por lo tanto, a la concentración de
isocitrato encontrada en la matriz mitocondrial, un pequeño cambio en la concentración de ADP

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puede producir un gran cambio en la velocidad del ciclo. Pequeños cambios en la concentración del
producto NADH y del cosustrato NAD+ también afectan la velocidad de la enzima más de lo que lo
harían en una enzima no alostérica.
La -cetoglutarato deshidrogenasa es regulada en forma negativa por los productos de la
reacción: NADH y succinil-CoA.
Ambas enzimas, la isocitrato deshidrogenasa y la -cetoglutarato deshidrogenasa, se
activan por aumento en la concentración de Ca2+ mitocondrial. En el músculo esquelético en
contracción y posiblemente en otros tejidos musculares, la liberación de Ca2+ del retículo
sarcoplásmico y el aumento en la concentración mitocondrial de Ca2+ durante la contracción puede
proveer una activación adicional de estas enzimas en una situación metabólica en la que el ATP se
está hidrolizando rápidamente (contracción muscular).
Ninguna de estas enzimas cataliza la primera reacción del ciclo, y por lo tanto no afectan
directamente la velocidad de entrada del acetil-CoA. En mamíferos, la enzima citrato sintasa es
una enzima simple y no se regula alostéricamente. Cuando la isocitrato deshidrogenasa se activa,
la concentración de citrato disminuye. En el equilibrio en condiciones estándar, la reacción malato-
oxalacetato está francamente inclinada hacia la reducción del oxalacetato a malato. Sin embargo,
los niveles de oxalacetato en condiciones reales son muy bajas (debido a su rápido consumo en la
reacción de la citrato sintasa), y esto favorece la reacción en la dirección de oxidación del malato, a
pesar de ser una reacción endergónica en condiciones estándar. Cuando la relación NADH/NAD+
disminuye, la reacción de oxidación del malato también se favorece.
Además de lo ya mencionado, otros factores están involucrados en la regulación de la
actividad del ciclo de Krebs. Por ejemplo, el aporte de sustratos como las unidades de acetilo que
provienen del piruvato o de ácidos grasos, es un factor crucial para determinar la velocidad del ciclo.
Por lo tanto, la regulación de la piruvato deshidrogenasa tendrá un efecto importante en la velocidad
del ciclo. De modo similar, cualquier mecanismo que regule los procesos de transporte y la β-
oxidación de ácidos grasos será un determinante efectivo de la actividad del ciclo.

En resumen, la velocidad del ciclo de Krebs se puede modificar por dos factores:

Disponibilidad de sustratos: la velocidad del ciclo depende de un equilibrio entre vías que aportan
intermediarios, las vías que consumen dichos intermediarios utilizándolos en vías anabólicas. Existe
un control importante a través de la cadena respiratoria y fosforilación oxidativa con relación al ADP
y utilización del ATP y por lo tanto en relación con las concentraciones de coenzimas oxidadas. En
algunos tejidos como el encéfalo, que depende de la glucosa para formar acetil-CoA, el control
puede ocurrir sobre la PDH.
Nivel energético: el nivel energético se evalúa mediante dos relaciones:
• la relación ATP/ADP: altos niveles de esta relación frenan a la isocitrato deshidrogenasa,
con aumento de isocitrato, que vuelve hacia citrato, el cual sale hacia el citoplasma e inhibe
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la glucólisis. El aumento de ATP aumenta la KM de la citrato sintasa, que pierde afinidad por
el acetil-CoA. También disminuye el grado de regeneración del GDP, frenando a la succinato
tioquinasa y aumentando los niveles de succinil-CoA que inhibe competitivamente a la citrato
sintasa.
• la relación NADH + H+/NAD+: altos niveles de la coenzima reducida frenan a la isocitrato
deshidrogenasa, la -cetoglutarato deshidrogenasa y a la malato deshidrogenasa.

En conclusión, la regulación de la actividad del ciclo le permite a la célula adaptarse a


diferentes situaciones metabólicas. Es decir, en aquellas donde se requiera una gran actividad para
producir la oxidación completa de moléculas combustibles, las enzimas funcionarán con su máxima
capacidad y en aquellas donde el requerimiento sea menor, disminuirá la oxidación del acetil-CoA
que se desviará hacia la formación de triacilglicéridos. De este modo, el organismo logra mantener
la homeostasis calórica a pesar de las variaciones en el aporte de combustibles y en su utilización.

PUNTOS DE FUGA Y REACCIONES ANAPLEROTICAS

El ciclo de Krebs o ciclo de los ácidos tricarboxílicos (CAT) es una vía anfibólica, eso
significa que sirve tanto en procesos catabólicos como anabólicos. Además de su rol en el
catabolismo oxidativo donde los esqueletos carbonados de hidratos de carbono, ácidos grasos y
aminoácidos son convertidos en CO2 y H2O, el ciclo provee precursores para varias vías
biosintéticas. Por ejemplo, el -cetoglutarato y el oxalacetato pueden servir como precursores de
los aminoácidos glutamato y aspartato por simple transaminación. A través del glutamato y del
aspartato, los carbonos del -cetoglutarato y del oxalacetato se utilizan para formar otros
aminoácidos, así como nucleótidos de purinas y pirimidinas. El oxalacetato puede ser también
precursor de la glucosa en la gluconeogénesis. El succinil-CoA es un intermediario central en la
síntesis del anillo de porfirinas de los grupos hemo, transportadores de oxígeno (en hemoglobina y
mioglobina) y de electrones (en los citocromos).
Siendo como se dijo una vía anfibólica, una de las características del ciclo de Krebs es la
existencia de puntos de salida y entrada de intermediarios. En los puntos de salida, denominados
puntos de fuga, algunos de los intermediarios del ciclo pueden “salir” del mismo y actuar como
sustratos de otras reacciones ajenas a éste. Si un intermediario “sale” hacia otra vía en alguno de
los puntos de fuga, es necesario que el nivel de intermediarios se restaure para que el ciclo (y con
ello la obtención de energía) no se detenga. Esto ocurre por las reacciones anapleróticas o de
relleno, a través de las cuales se aportan intermediarios del ciclo, lo que permite compensar la salida
de intermediarios hacia otras vías como la gluconeogénesis o la síntesis de ácidos grasos. Debe
tenerse en cuenta que para que una reacción pueda ser considerada reacción anaplerótica el aporte

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de intermediarios del ciclo no debe ser a expensas del consumo de otros intermediarios. Por
ejemplo, el aporte de succinato por el catabolismo de los cuerpos cetónicos que consume otro
intermediario del ciclo (succinil-CoA) no se considera reacción anaplerótica.

El citrato, que es el primer producto del ciclo, es también el primer punto de fuga dado que
además de intermediario en el ciclo puede funcionar como fuente de carbonos en otras vías
metabólicas que ocurren en el citosol como la síntesis de ácidos grasos y esteroles. (NOTA: repasar
lo visto en Metabolismo de lípidos 1).

El -cetoglutarato es otro punto de fuga del ciclo de Krebs porque puede condensarse con
amoníaco (o amonio) en presencia de NADH o NADPH y se sintetiza glutamato y NAD+ o NADP+.
Esta reacción ocurre en las mitocondrias, y es catalizada por la enzima glutamato
deshidrogenasa, una de las enzimas más importantes en el metabolismo de aminoácidos.

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El malato constituye otro punto de fuga, pues puede ser transportado al citosol, donde
genera oxalacetato en la reacción catalizada por la enzima malato deshidrogenasa citosólica. El
oxalacetato citosólico es un sustrato gluconeogénico.

El succinil-CoA es un punto de ramificación metabólica, porque este intermediario puede


salir del ciclo, constituyendo un punto de fuga, o entrar al ciclo, a través de una reacción
anaplerótica.

Como punto de fuga, su destino metabólico incluye su condensación con glicina para formar
el δ-aminolevulinato en la reacción catalizada por la δ-aminolevulinato sintasa (ALA-sintasa), que
constituye la reacción inicial de la síntesis de porfirinas. También el succinil-CoA es convertido en
succinato en la vía de utilización de cuerpos cetónicos.

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δ-aminolevulinato sintasa
(ALA-sintasa)

A su vez, el succinil-CoA es producido como consecuencia del catabolismo de ciertos


aminoácidos. La mayor parte de los tejidos, incluidos cerebro, músculo esquelético y corazón
degradan aminoácidos como isoleucina metionina, treonina y valina a succinil-CoA. En el hígado,
el ciclo de Krebs es parte de la vía que convierte dichos aminoácidos en glucosa, y en el músculo
esquelético es parte de la vía que los convierte en glutamina.
También se produce succinil-CoA a partir del catabolismo de los ácidos grasos con número
de carbonos impar, en donde en los pasos finales de su degradación se obtiene propionil-CoA
primero y metilmalonil-CoA después el cual será convertido en succinil-CoA (ver reacciones de la
β-oxidación).
Una de las principales reacciones anapleróticas es la conversión de piruvato y CO2 a
oxalacetato, catalizada por la piruvato carboxilasa. Esta enzima contiene biotina, que en presencia
de ATP y Mg2+ forma un intermediario covalente con el CO2 que se agrega luego como grupo
carboxilo al piruvato, para formar oxalacetato. Las carboxilasas de otras vías metabólicas también
requieren biotina y su mecanismo de acción es similar. El acetil-CoA es un efector alostérico
positivo de la piruvato carboxilasa: cuando el acetil-CoA, combustible del ciclo de Krebs, está
presente en exceso, activa a la piruvato carboxilasa para producir más oxalacetato, permitiendo que
el ciclo use más acetil-CoA en la reacción catalizada por la citrato sintasa. La piruvato carboxilasa
se encuentra en altas concentraciones en el hígado y tejido nervioso, tejidos en los que ocurre un
constante eflujo de intermediarios. En el hígado, es parte de la vía gluconeogénica que permite
convertir alanina y lactato en glucosa.

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La enzima glutamato deshidrogenasa, que ya hemos mencionado (página 23), cataliza


una reacción reversible, por lo que puede convertir el glutamato en α-cetoglutarato, siendo un buen
ejemplo de reacción anaplerótica.

Otra reacción que consume α-cetoglutarato u oxalacetato es la catalizada por la glutamato-


oxalacetato transaminasa (GOT o ASAT). Esta reacción es reversible y en ambos sentidos se
obtiene un producto (oxalacetato o α-cetoglutarato) que pueden entrar al ciclo, sin embargo, no se
la considera una reacción anaplerótica ya que para producir dichos productos utiliza como
sustratos a intermediarios del ciclo. Es decir, si se considera la reacción como se la presenta en el
esquema, consume α-cetoglutarato (que sale del ciclo) y produce oxalacetato (que alimenta al ciclo).

Otra reacción anaplerótica es la catalizada por la enzima málica (diferente de la enzima


malato deshidrogenasa) que convierte el piruvato en malato, consume NADPH y requiere del aporte
de un carbono que proviene de un CO2.

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Sistemas de lanzaderas o mecanismos de oxidación del NADH citosólico

Como ya hemos mencionado, tanto las enzimas del ciclo de Krebs como la cadena de
transporte de electrones se localizan en la mitocondria. También son mitocondriales las enzimas de
la β-oxidación y las de otras vías oxidativas. Ahora bien, en estas vías, cuando se oxidan los
sustratos, se reducen las coenzimas NAD+ y FAD. La cantidad de coenzimas dentro de la
mitocondria y en general dentro de la célula es muy baja, por lo tanto, para que la vía metabólica
pueda continuar funcionando es necesario que se produzca su reoxidación. Las coenzimas se
reoxidan cediendo sus electrones a la cadena de transporte de electrones. Para las vías metabólicas
intramitocondriales esto es bastante sencillo porque las coenzimas se reducen y luego se reoxidan
en la misma organela. Pero ¿qué ocurre con las coenzimas reducidas en el citosol, por ejemplo,
durante la glucólisis?
Un mecanismo de reoxidación del NADH citosólico consiste en el transporte de los
equivalentes de reducción a la mitocondria por las lanzaderas del glicerol-3-fosfato o del malato-
aspartato y finalmente al oxígeno a través de la cadena de transporte de electrones (sistemas de
lanzaderas).
La membrana mitocondrial interna es impermeable al NADH y no existen proteínas que
permitan su transporte. Los equivalentes de reducción (en forma de ion hidruro) se transfieren por
una reacción rédox citosólica a un compuesto que tiene un transportador en la membrana
mitocondrial interna. En ese paso inicial se regenera el NAD+ en el citosol. Los electrones se
transfieren a la cadena de transporte de electrones donde se generan aproximadamente 1,5 moles
de ATP por mol de NADH transportado por la lanzadera del glicerol-3-fosfato y 2,5 moles de ATP
si la lanzadera es la del malato-aspartato.

Lanzadera del glicerol-3-fosfato

Es la lanzadera predominante en el músculo esquelético y en el cerebro. En el citosol, los


electrones se transfieren del NADH a la dihidroxiacetona fosfato formando el glicerol-3-fosfato, en
una reacción catalizada por la glicerol-3-fosfato deshidrogenasa citosólica. El glicerol-3-fosfato
se transporta a la membrana mitocondrial interna donde cede sus electrones a la glicerol-3-fosfato
deshidrogenasa mitocondrial que contiene FAD, la que a su vez los cede a la coenzima Q en la
cadena de transporte de electrones. La dihidroxiacetona fosfato vuelve al citosol.
De esta forma, el único cambio neto que se produce luego de la actividad de esta lanzadera
es el intercambio de un NADH + H+ (coenzima reducida) del citosol por un FADH2 (coenzima
reducida) en la mitocondria, ya que la dihidroxiacetona fosfato que se consumió en la primera
reacción (citosólica) se recupera en la segunda reacción (mitocondrial).

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Lanzadera del malato-aspartato


Es una lanzadera más compleja que la anterior, pero funciona en forma similar. En este caso,
el NAD+ citosólico se regenera por la reducción del oxalacetato a malato catalizada por la enzima
malato deshidrogenasa citosólica. El malato es traslocado por una proteína transportadora
(transporta malato y -cetoglutarato) a la matriz mitocondrial donde se regenera el NADH en una
reacción catalizada por la malato deshidrogenasa mitocondrial. El oxalacetato, que no puede
atravesar la membrana mitocondrial interna es convertido a aspartato en la mitocondria (en una
reacción de transaminación con glutamato).
El aspartato se trasloca (transportador de glutamato-aspartato) hacia el citosol donde es
transaminado nuevamente a oxalacetato. Esta lanzadera es la más activa y funciona en el hígado
y en el corazón. Los tejidos con mitocondrias poseen ambos sistemas de lanzaderas.
En este caso, el único cambio neto que se produce por la actividad de esta lanzadera es el
transporte (indirecto) de un NADH citosólico a la mitocondria, porque los demás intermediarios se
utilizan y se regeneran.

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CUESTIONARIO DE CICLO DE KREBS

1. ¿La malato deshidrogenasa mitocondrial cataliza una reacción en la que, en condiciones


estándar, la concentración de sustratos es mayor que la de productos? ¿Produce un
compuesto de alta energía? ¿Cataliza una reacción anaplerótica? ¿Utiliza NADH como
sustrato?
2. ¿Cuál de las enzimas del ciclo de Krebs cataliza la síntesis de un compuesto de alta energía?
3. Relacione con flechas los intermediarios (de la columna de la izquierda) con sus posibles
productos biosintéticos (columna de la derecha).
-cetoglutarato ninguno
succinil-CoA grupo hemo
cis-aconitato glutamato
piruvato ácidos grasos
citrato oxalacetato
4. Con respecto a la enzima -cetoglutarato deshidrogenasa responda: ¿Cataliza una reacción
en la que, en condiciones estándar, la concentración del producto es menor que la del
sustrato? ¿El producto de la reacción es sustrato de la fumarasa? ¿Cataliza una reacción
anaplerótica? ¿Utiliza pirofosfato de tiamina como cofactor?
5. Con respecto a la lanzadera del glicerol-3-fosfato responda: ¿En qué compartimiento se
reducen la dihidroxiacetona fosfato y el NAD+? ¿En la mitocondria se oxida el FAD y se
reduce el glicerol-3-fosfato?
6. Indique la secuencia de eventos que ocurre en la reacción catalizada por la piruvato
deshidrogenasa, las coenzimas que intervienen y la composición del complejo enzimático.
¿De dónde proviene el sustrato?
7. Nombre los compuestos del ciclo de Krebs que tiene 4C, 5C y 6C.
8. Aunque el O2 no participa directamente en las reacciones del ciclo de Krebs, éste sólo
funciona en condiciones aeróbicas. ¿Por qué?
9. Con respecto a la actividad de enzima -cetoglutarato deshidrogenasa, responda: ¿en qué
dirección ocurrirá la reacción en condiciones estándar? ¿De qué reacción es sustrato el
producto de esta reacción? ¿Cataliza una reacción anaplerótica? ¿Utiliza pirofosfato de
tiamina como cofactor?
10. Describa la lanzadera de malato-aspartato e indique: ¿Cuál es su función? ¿Qué procesos
se producen en el citosol y cuáles en la mitocondria? ¿Cuál es el balance energético?
11. ¿Cuál/es de las enzimas del ciclo de Krebs cataliza la transformación de un sustrato en un
producto con menor número de C?
12. ¿En cuál/es de las reacciones de oxidación del ciclo de Krebs NO se utiliza NAD+ como
sustrato?

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13. Nombre 3 reacciones anapleróticas e indique su función. ¿Por qué no se considera la


reacción catalizada por la glutamato-oxalacetato transaminasa como una reacción
anaplerótica?
14. Explique la regulación de la actividad del complejo de la piruvato deshidrogenasa indicando
el efecto de: a) relación de coenzimas NADH/NAD+, b) relación ATP/ADP, c) niveles de Ca2+,
d) relación CoA-SH/acetil-CoA. Explique el efecto de la fosforilación/desfosforilación en la
actividad del complejo e indique las enzimas que lo catalizan.
15. ¿Qué característica tiene la enzima que cataliza la síntesis de oxalacetato del resto de las
enzimas del ciclo de Krebs?
16. Explique cómo se regula la actividad del ciclo de Krebs e indique las principales reacciones
regulables y los mecanismos de regulación involucrados.
17. Indique el balance energético de la oxidación de 1 mol de acetil-CoA en el ciclo de Krebs.
18. ¿Cuáles son las fuentes de acetil-CoA del ciclo de Krebs? Indique las vías metabólicas
involucradas.
19. Indique 3 compuestos que puedan sintetizarse a partir de intermediarios del ciclo de Krebs
(nombre los compuestos y los intermediarios).
20. ¿Se puede sintetizar glucosa a partir de acetil-CoA? ¿Por qué?

PREGUNTAS ADICIONALES DE CICLO DE KREBS, PUNTOS DE FUGA/REACCIONES


ANAPLERÓTICAS Y LANZADERAS.

1) Con respecto al ciclo de Krebs, responda las siguientes preguntas.


a) ¿Por qué se considera que el ciclo de Krebs es anfibólico?
b) ¿Cuáles son los productos del ciclo de Krebs por cada mol de acetil-CoA oxidado?
c) Indique 2 reacciones anapleróticas nombrando sustratos, productos, enzima y cofactores.

2) Con respecto al complejo de la piruvato deshidrogenasa, responda las siguientes


preguntas.
a) Escriba la reacción enzimática global indicando sustratos, productos, enzimas y cofactores.
¿Dónde ocurre esta reacción enzimática?
b) Explique brevemente como está compuesto el complejo de la piruvato deshidrogenasa, que
reacciones cataliza cada componente y que coenzimas o grupos prostéticos participan.
c) Los alcohólicos pueden presentar déficit de tiamina generando la enfermedad beriberi y la
encefalopatía de Wernicke. ¿Como espera encontrar la actividad enzimática? Justifique su
respuesta.

3) Con respecto al ciclo de Krebs, responda las siguientes preguntas.


a) ¿Qué enzimas catalizan las 3 etapas altamente exergónicas del ciclo?

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b) ¿Qué enzima se encuentra localizada en la membrana mitocondrial interna? ¿Qué coenzima de


oxidorreducción utiliza?
c) ¿Qué grupo prostético requiere la piruvato carboxilasa y que función cumple?

4) Con respecto a las lanzaderas, responda las siguientes preguntas.


a) Explique brevemente cuál es su función.
b) Describa la lanzadera del glicerol-3-fosfato.
c) ¿En qué órganos predomina la lanzadera del malato-aspartato? ¿Cuántos moles de ATP se
generan por el transporte de equivalentes de reducción mediante esta lanzadera? Justifique.

5) El arsénico (As) es una sustancia tóxica, conocida desde la antigüedad. Se sabe que los
compuestos del As (III) pueden reaccionar con los grupos SH de moléculas orgánicas. En
base a esta información indique en el caso de una intoxicación con arsénico, responda las
siguientes preguntas.
a) ¿Cuál podría ser el mecanismo de acción del As a nivel de la reacción de la piruvato
deshidrogenasa? ¿Y su efecto?
b) ¿Cuál sería el mecanismo de acción del As a nivel del ciclo Krebs? ¿Y su efecto?
c) ¿Qué ocurriría con las coenzimas de oxidorreducción y el ATP?

6) Con respecto a los intermediarios del ciclo de Krebs, responda las siguientes preguntas.
a) ¿Cuáles son sustratos gluconeogénicos?
b) ¿Cuáles son sustratos para la síntesis de ácidos grasos?
c) ¿Cuáles pueden convertirse directamente en aminoácidos?

7) ¿Qué entiende por regulación del ciclo de Krebs por nivel de sustrato y regulación por
niveles energéticos?

8) Con relación al ciclo de Krebs, responda las siguientes preguntas.


a) Mencione dos intermediarios que sean a la vez puntos de fuga y productos de una reacción
anaplerótica. Justifique su respuesta.
b) ¿Cuál es la reacción enzimática que puede considerarse una reacción de fosforilación a nivel
de sustrato? ¿Qué enzima la cataliza?
c) ¿Cuáles son los productos de la oxidación de un mol de acetil-CoA en una vuelta del ciclo?

9) Con relación al ciclo de Krebs, responda las siguientes preguntas.


a) ¿Cuáles son las enzimas del ciclo de Krebs que catalizan reacciones de descarboxilación
oxidativa? Indique sustratos, enzimas y productos. Estas enzimas tienen en común dos reguladores,
¿cuáles son y cómo actúan?

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b) Indique dos orígenes de la molécula de acetil-CoA en la mitocondria.


c) Indique dos reacciones anapleróticas.

10) Complete la siguiente tabla indicando sustratos, coenzimas, enzimas, productos y vía a
la que corresponde cada reacción.
Sustratos Enzima Productos Vía metabólica o tipo
de reacción
+
glutamato + NAD(P) reacción anaplerótica
acetil-CoA + CO2
+ NADH + H+
malato
deshidrogenasa
mitocondrial
oxalacetato +
glutamato
glicerol-3-fosfato
deshidrogenasa
citoplasmática
glicerol-3-fosfato
deshidrogenasa
mitocondrial
enzima málica
succinil-CoA +
NADH + H+
malato + NAD+ lanzadera del
malato/aspartato
isocitrato + NAD+

11) ¿Qué reacción del ciclo de Krebs NO produce NADH?


A. La conversión de succinato a fumarato.
B. La reacción donde se sintetiza succinil-CoA.
C. La conversión de malato a oxalacetato.
D. La reacción donde el isocitrato se convierte en -cetoglutarato.

12) Con respecto al ciclo de Krebs, indique la reacción en la cual se genera un tioéster que
es un compuesto de alta energía.
A. -cetoglutarato deshidrogenasa

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B. succinato deshidrogenasa
C. isocitrato deshidrogenasa
D. fumarasa

13) En el ciclo de Krebs, indique qué enzima cataliza una reacción de descarboxilación
oxidativa.
A. -cetoglutarato deshidrogenasa
B. succinato deshidrogenasa
C. succinil-CoA sintetasa
D. malato deshidrogenasa

14) Con respecto a la regulación del complejo de la piruvato deshidrogenasa (PDH), indique
la opción correcta.
A. El acetil-CoA y el NADH son moduladores alostéricos positivos de la piruvato deshidrogenasa
quinasa.
B. La inactivación del complejo es catalizada por una fosfoproteína fosfatasa que promueve la
desfosforilación del complejo.
C. Altas concentraciones de piruvato activan a la piruvato deshidrogenasa quinasa y el complejo
PDH tendrá su máxima actividad.
D. La activación del complejo es catalizada por una proteína quinasa dependiente de ATP.

15) Indique el compuesto que puede aportar directamente -cetoglutarato al ciclo de Krebs.
A. glutamato
B. glutamina
C. aspartato
D. alanina

16) ¿Cuál de las siguientes enzimas NO cataliza una reacción anaplerótica?


A. glutamato oxalacetato transaminasa
B. enzima málica
C. glutamato deshidrogenasa
D. piruvato carboxilasa

17) Identifique una reacción anaplerótica.


A. La reacción catalizada por la piruvato carboxilasa.
B. La reacción catalizada por la piruvato deshidrogenasa.
C. La lanzadera del glicerol-3-P.
D. La reacción donde se sintetiza un precursor del hemo.

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18) Indique la opción correcta con respecto al transporte de los equivalentes de reducción
del NADH generado en el citosol a la matriz mitocondrial.
A. Entra malato y glutamato y sale aspartato y −cetoglutarato de la mitocondria.
B. Entra malato y -cetoglutarato y sale oxalacetato y glutamato de la mitocondria.
C. Entran solo oxalacetato y malato a la mitocondria.
D. Salen solo aspartato y malato de la mitocondria.

19) La lanzadera del citrato puede considerarse …


A. un punto de fuga.
B. una reacción anaplerótica.
C. un mecanismo de transporte bidireccional entre citoplasma y mitocondria.
D. una reacción para reponer coenzimas reducidas.

20) Indique la opción correcta respecto a la lanzadera del glicerol-3-fosfato.


A. Se oxida el NADH citoplasmático reduciendo a la dihidroxiacetona fosfato (DHAP).
B. Se transfiere NADH del citoplasma a la mitocondria.
C. Se reduce NAD+ oxidando al glicerol-3-fosfato en el citoplasma.
D. Se oxida el NADH citoplasmático oxidando al glicerol-3-fosfato.

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RESPUESTAS
1) a) Porque participa tanto de procesos catabólicos como anabólicos, ya que es la vía final de
degradación de glúcidos, lípidos y aminoácidos y también participa en la síntesis de moléculas
complejas a partir de moléculas simples.
b) 2 moles de CO2, 3 moles de NADH, 1 mol de FADH2, un mol de un nucleósido trifosfato (GTP o
ATP) y un mol de CoA.
c) piruvato carboxilasa
piruvato + HCO3- + ATP → oxalacetato + ADP + Pi
PEP carboxiquinasa
fosfoenolpiruvato + CO2 + GDP → oxalacetato + GTP
enzima málica
piruvato + HCO3- + NAD(P)H → malato + NAD(P)+
glutamato deshidrogenasa
glutamato + NAD(P)+ + H2O → a-cetoglutarato + NH4+ + NAD(P)H + H+

propionil-CoA →→→→→ succinil-CoA (ácidos grasos de número impar de carbonos)

2)

3) a) citrato sintasa, isocitrato deshidrogenasa y -cetoglutarato deshidrogenasa.


b) La succinato deshidrogenasa. FAD.
c) Biotina. Forma un intermediario covalente con el CO2 que se agrega luego como grupo carboxilo
al piruvato, para formar oxalacetato.
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4) a) Su función es transportar NADH a través de la membrana mitocondrial interna porque es


impermeable al NADH y así llegar a la cadena de transporte de electrones.
b) En el citosol, los electrones se transfieren del NADH a la dihidroxiacetona fosfato formando el
glicerol-3-fosfato, en una reacción catalizada por la glicerol-3-fosfato deshidrogenasa citosólica. El
glicerol-3-fosfato se transporta a la membrana mitocondrial interna donde cede sus electrones a la
glicerol-3-fosfato deshidrogenasa mitocondrial que contiene FAD, la que a su vez los cede a la
coenzima Q en la cadena de transporte de electrones. La dihidroxiacetona fosfato vuelve al citosol.
c) En el hígado y en el corazón. 2,5 moles ATP porque genera NADH + H+ intramitocondrial.

5) a) Los compuestos de As III reaccionan con los SH del ácido lipoico del complejo de la PDH
ocasionando su inhibición de tipo no competitiva. El efecto es que el piruvato no puede convertirse
en acetil-CoA.
b) Los compuestos de As III reaccionan con los SH del complejo de la -cetoglutarato
deshidrogenasa, ocasionando su inhibición de tipo no competitiva. El efecto es que no puede
convertirse en succinil-CoA, por esta razón se frena el ciclo de Krebs.
c) No se producen coenzima reducidas que puedan luego acoplarse a la obtención de ATP.

6) a) oxalacetato y malato
b) citrato
c) -cetoglutarato y oxalacetato

7) La regulación por nivel de sustrato hace referencia a la cantidad de sustrato disponible para ser
oxidado en el ciclo de Krebs, esto implica el nivel de acetil-CoA y la enzima regulada en cuestión es
la citrato sintasa. La regulación por niveles energéticos se relaciona con la abundancia relativa de
NADH+H+/NAD+ y de ATP/ADP, cuando estas relaciones son altas, indica que el nivel energético
es alto y por ende el ciclo se frena a nivel de las enzimas isocitrato deshidrogenasa y -cetoglutarato
deshidrogenasa. Si dichas relaciones son bajas significa que el nivel energético de la célula es bajo
y en ese caso las enzimas mencionadas se verán estimuladas alostéricamente.

8) a) -cetoglutarato es el producto de la desaminación oxidativa del glutamato (glutamato


deshidrogenasa) y puede sintetizarse a partir de glutamato por acción de las transaminasas.
malato: es producto de la enzima málica y fuera de la mitocondria puede formar oxalacetato (malato
deshidrogenasa).
succinil-CoA: se usa para la síntesis de porfirinas y es producto de la β-oxidación de ácidos grasos
de cadena impar (propionato).
b) succinil-CoA sintetasa o succinato tioquinasa

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succinil-CoA + GDP + Pi → succinato + CoA + GTP


c) 2CO2 + 3NADH + 3H+ + FADH2 + GTP + CoA-SH

9) a) isocitrato deshidrogenasa: isocitrato + NAD+ → a-cetoglutarato + CO2 + NADH + H+


a-cetoglutarato deshidrogenasa: a-cetoglutarato + CoA + NAD+ → succinil-CoA + NADH + H+
ATP y NADH, son moduladores alostéricos negativos de ambas enzimas.
b) β-oxidación de ácidos grasos, piruvato deshidrogenasa, metabolismo de aminoácidos
ramificados (cetogénicos y/o mixtos) o activación de acetato por la acetato tioquinasa y ATP.
c) enzima málica
piruvato + CO2 + NAD(P)H + H+ → malato + NAD(P)+
glutamato deshidrogenasa
glutamato + NAD(P)+ → a-cetoglutarato + NH4+ + NAD(P)H + H+
(Ácidos grasos de cadena impar) propionil-CoA →→→→→ succinil-CoA
piruvato carboxilasa
piruvato + ATP + HCO3- → oxalacetato + ADP +Pi

10)

11) (Ver figura con las reacciones del ciclo de Krebs en la clase correspondiente.)

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12) La conversión de -cetoglutarato a succinil-CoA es catalizada por el complejo multienzimático


de la -cetoglutarato deshidrogenasa. El succinil-CoA, es un ejemplo de tioéster rico en energía.

13) Ver la reacción catalizada por la -cetoglutarato DH en la clase correspondiente.)

14) (Ver la reacción catalizada por la -cetoglutarato deshidrogenasa en la clase correspondiente.)

15) (Ver figura de regulación de la actividad PDH en la clase correspondiente.)

16) (Ver la reacción catalizada por la glutamato deshidrogenasa en la clase correspondiente.)


piruvato + HCO3- + ATP → oxalacetato + ADP + Pi piruvato carboxilasa
piruvato + HCO3- + NAD(P)H +H → malato + NAD(P)
+ +
enzima málica
glutamato + NAD+ + H2O → α-cetoglutarato + NH4+ + NADH + H+ glutamato deshidrogenasa
Estas 3 reacciones son anapleróticas porque aportan intermediarios en el ciclo de Krebs. En cambio,
la reacción de la glutamato oxalacetato transaminasa no se considera anaplerótica porque para
producir tanto oxalacetato o -cetoglutarato utiliza intermediarios del ciclo de Krebs.
aspartato + -cetoglutarato→ oxalacetato + glutamato

17) (Una de las principales reacciones anapleróticas es la conversión de piruvato y CO 2 a


oxalacetato, catalizada por la piruvato carboxilasa. Ver la reacción en la clase correspondiente.)

18) (Ver figura de la lanzadera de NADH en la clase correspondiente.)

19) La lanzadera del citrato es un mecanismo para sacar citrato desde la mitocondria hacia el
citoplasma. Funciona de manera unidireccional, es decir el citrato solo se mueve desde la
mitocondria hacia el citoplasma. Esto constituye un punto de fuga del intermediario citrato que
ocurre cuando los niveles de ATP aumentan y actúa como modulador alostérico negativo frenando
la reacción de la IDH, con el consecuente aumento de Isocitrato. Dado que la reacción de la
aconitasa es reversible, el isocitrato en exceso se convierte en citrato. Como la citrato sintasa es
irreversible por su elevado ∆G negativo, el único camino posible es la salida del citrato hacia el
citoplasma, clara señal de abundancia energética mitocondrial.

20) (Ver figura de la lanzadera de glicerol-3-P en la clase correspondiente.)

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