Chapitre 2 Prospection Et Échantillonnage (Partie 1)

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Chapitre 2 : Prospection, Echantillonnage et Collecte des

ressources génétiques

1. La prospection
1.1. Définition
La prospection c’est rechercher la plante là où elle se trouve.

1.2. But de la prospection


Le but essentiel d’une prospection est la collecte du matériel vivant rassemblant la plus grande
variabilité possible

1.3. Préparation de la prospection


1.3.1. Choix et constitution de l’équipe de prospection
La composition de l’équipe de prospection dépend en fait de
 la plante à prospecter,
 des individus et de leurs motivations
On est amené donc pour atteindre ces objectifs à faire appel à des spécialistes aptes à assurer
les tâches préalablement définies : botanistes, généticiens, écologistes et phytopathologistes.

1.3.2. Recherche préalable de l’information


L’information préliminaire doit être la plus complète possible, elle touchera les domaines de :
 Botanique : taxonomie et systématique, variabilité écologique, biologique et répartition
 Génétique : polymorphisme, mode de reproduction, diversité chromosomique ;
 Agronomie : formes cultivées, pratiques culturales, stockage ;
 Phytopathologie : parasites, résistance, mode de transmission ;
 Données ethnographiques
 Aspect matériel de la mission : connaissance générale des pays à visiter, zone de
végétations naturelles, zones de cultures, climats, routes …etc.
 Préparation administrative : autorité et personnalités scientifiques à consulter,
formalités d’exportation du matériel, possibilités de transport et d’expédition du
matériel.
 Connaissance de la zone de prospection : Une recherche profonde et actualisée est
nécessaire avant de commencer la prospection.
1.3.3. Projet de prospection
A partir de la distribution du matériel à rechercher qui est en fonction des voies de
communication ou de moyens de transport existant, un itinéraire technique sera établi.
Cet itinéraire consiste à :
Préciser les lieux d’expédition du matériel, l’objectif de la prospection, les moyens de
conservation et de transport des échantillons ;
Prévoir les moyens de transport et avoir une idée sur les itinéraires et chemins
secondaire pour avoir accès plus rapidement aux zones à prospecter ;
Il faut tenir compte de la période des prospections
Définir la durée de la prospection ;

1.4. Déroulement sur le terrain


1.4.1. Phase préliminaire
Une fois dans la zone ou le pays à prospecter avec tous les données collectées et avant d’aller
sur le terrain, il faut :
 Prendre contact avec les autorités compétentes du pays et prévoir d’être accompagné
par un spécialiste délégué par les autorités locales ;
 Chercher les informations nécessaires précises pour l’accomplissement du projet : état
des routes, lieux d’envoi, moyen disponible pour le transport ;
 Apporter le matériel adéquat et précis pour la collecte d’échantillons ;

1.4.2. Phase active


 La recherche de la plante ne se fait pas au hasard, on connaît par les données de la
bibliographie, la zone d’altitude ou les formations végétale
 Le matériel végétatif vivant est recueilli, préparé et conditionné immédiatement et sur
les lieux même de récolte.
 Il est nécessaire de faire des herbiers avec des fleurs et fruits et conserver en milieu
liquide quelques-uns de ces organes reproducteurs.
 Les parasites sont aussi collectés selon les méthodes en usage.
 L’identification du matériel est très importante : les échantillons prélevés portent tous
un numéro : le but de la numérotation est de pouvoir retrouver la provenance du matériel
et pour reconnaître le type du matériel collecté.
 La localisation géographique doit être faite avec le plus grand soin et il est préférable
de mentionner les noms existant sur les cartes de référence.
1.4.3. Bilan de la prospection
Il est important de rédiger un rapport de prospection destiné à faire le bilan de toutes les
observations de terrain pour les utilisateurs du matériel végétal.
Le rapport comprendra nécessairement :
 L’itinéraire suivi avec une carte précisant la situation des points de collecte ;
 La description des conditions géographiques, climatiques, édaphiques, ethniques des
zones prospectées.
 Une liste des échantillons récoltés avec leur point de collecte, le nom vernaculaire
 Des fiches descriptives sont ensuite réalisées pour chaque échantillon.

2. L’échantillonnage
2.1. Définitions
1/ L’échantillonnage : est un moyen de sélectionner un sous-ensemble d’unités dans une
population aux fins de la collecte de l’information sur ces unités

2/ Le recensement : est une enquête effectuée auprès de l’ensemble des individus d’une
population.

2.2. But de l’échantillonnage


En écologie, il est impossible de mettre la main sur l’ensemble des individus d’une population
(par ex ; il est probablement impossible de mesurer la hauteur de tous les arbres d’une forêt de
plusieurs milliers d’hectares, de visiter tous les lacs d’une région de plusieurs milliers de
km2…)
L’échantillonnage, lorsque il est bien fait, permet de mesurer des caractéristiques sur un nombre
restreint d’unités du groupe d’intérêt et d’arriver à une estimation des paramètres à l’étude qui
sera non seulement précise, mais aussi représentative de l’ensemble des unités du groupe

2.3. Mesure de la communauté végétale


Identifier les schémas de répartition des espèces est la première étape à réaliser.
Les mesures porteront sur :

La présence : occurrence d’une espèce en un point de mesure.


La fréquence : nombre (absolu ou relatif) de points de mesure où l’on a observé la présence
d’une espèce.
L’abondance : nombre d’individus d’une espèce en un point de mesure.
Le recouvrement : surface relative couverte par une espèce.
La densité : nombre d’individus d’une espèce par unité de surface.

2.4. Méthodes de mesure de la communauté végétale


2.4.1. Le relevé : inventaire de la présence et/ou du recouvrement des espèces d’une
communauté sur une surface donnée par estimation visuelle

La quantification utilise l’échelle d’abondance-dominance de Braun-Blanquet ou une échelle


linéaire.

A/ Échelle de Braun-Blanquet : Mélange d’abondance et de recouvrement.

+ : individus rares (ou très rares) et recouvrement très faible


1 : individus assez abondants, mais recouvrement faible
2 : individus très abondants, recouvrement au moins 1/20
3 : nombre d'individus quelconque, recouvrement 1/4 à ½
4 : nombre d'individus quelconque, recouvrement 1/2 à ¾
5 : nombre d'individus quelconque, recouvrement plus de 3/4

B/ Échelles “plus linéaires” :

1 : < 10 %
2 : 10 - 25 %
3 : 25 - 50 %
4 : 50 - 75 %
5 : > 75 %

2.4.2. Les quadrats : un quadrat est une surface d’échantillonnage prédéfinie utilisée de
manière répétée pour échantillonner une végétation (Fig.1).
Les quadrats sont généralement carrés, mais peuvent être ronds ou rectangulaires.
La taille des quadrats est dépendante de la végétation étudiée.
Au sein d’un quadrat on peut mesurer l’occurrence, la fréquence, l’abondance ou le
recouvrement des espèces.
L’utilisation de quadrats quadrillés peut permettre de faciliter la mesure de la
fréquence et/ou du recouvrement.
Figure 01 : un quadrat utiliser pour mesurer la communauté végétale
Exemple : Un quadrat de 1 m2 avec 25 sous quadrats de 0,04 m2
Calculez la fréquence, le recouvrement et l’abondance des espèces qui existe dans ce quadrat

Rappel :
La fréquence : nombre de points de mesure où l’on a observé la présence d’une espèce
Le recouvrement : surface relative couverte par une espèce
L’abondance : nombre d’individus d’une espèce en un point de mesure
On prend l’espèce jaune
 La fréquence : il est présent dans 8 points (8 sous quadrats) donc leur fréquence est 8
 Le recouvrement : la surface occupée par l’espèce jaune représente 5% de la surface
total (1m2) (voir tableau)
 L’abondance : Il existe 4 individus de l’espèce jaune
On prend l’espèce verte
 La fréquence : il est présent dans 14 points (14 sous quadrats) donc leur fréquence est
14
 Le recouvrement : la surface occupée par l’espèce jaune représente 15% de la surface
total (1m2) (voir tableau)
 L’abondance : Il existe 5 individus de l’espèce jaune
NB : on fait la même chose pour les espèces bleue et rouge

Fréquence Recouvrement abondance


Espèce verte 14 15% 5
Espèce bleue 18 25% 8
Espèce rouge 09 12% 4
Espèce jaune 08 5% 4

2.4.3. Les transects : les transects sont des lignes utilisées pour définir une échelle linéaire
d’échantillonnage. Différentes méthodes peuvent être utilisées :

A/ Mesure continue (line intercept) : Il s’agit simplement de mesurer le % de ligne occupé


par chacune des espèces interceptées par le transect.
B/ Point-contact (point sampling) : Il s’agit de compter le nombre d’interceptions d’une tige
verticale avec les végétaux à intervalle régulier

C/ Belt transects (Quadrats) : Séquence linéaire de quadrats continus, à intervalle régulier ou


aléatoire. Méthodes identiques aux quadrats classiques.

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