Chimie_organique_2_stereochimie_poly
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Plan du chapitre
1 Isomérie de constitution 2
1.1 Définition . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 2
1.2 Isomérie de constitution . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 2
1.3 Propriétés des isomères de constitution . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 3
6 Annexes 23
6.1 Déterminer si une molécule est chirale . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 23
6.2 Identifier une relation d’isomérie . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 24
Exercices 25
Travaux dirigés 28
Programme officiel – Premier semestre – Thème C – constitution et transformations de la matière
1 Isomérie de constitution
1.1 Définition
Deux molécules sont isomères si elles ont la même formule brute (et sont différentes).
Molécules isomères
H2
C OH
H3 C OH
et et et
OH
O
H3 C CH3
CH3 OH
OH OH OH CH3
A1 A2 B1 B2
OH OH OH O
CO2 H
C1 C2 D1 D2
Isomérie de constitution
Cl
O
et et et
O
H
Cl
HO HO
E1 E2 F1 F2
CHO CH2 OH
H OH O
HO2 C HO2 C
HO H HO H
NH2 NH2
H OH H OH
H OH H OH
CH2 OH CH2 OH
G1 G2 H1 H2
(leucine) (isoleucine) (glucose) (fructose)
H OH OH OH H OH H OH OH
H
(a) (b) (c) (d) (e) (f)
HO CO2 H HO CO2 H
C C
H NH2
H H NH2
La représentation (ou projection) de Newman consiste à représenter la molécule en regardant dans l’axe
d’une liaison. Un des atomes de cette liaison est éclipsé (caché) par l’autre ; l’atome éclipsé est représenté par
un cercle.
HO CO2 H
C C = •
H NH2
H H
HO
H
H
OH NH2
A B C
H
H H H H
H
C C •
H
H H H H
H
Conformations de l’éthane
H HH H HH H HH
H H H H H H
• • • • • •
H H H
H H H H H
H H H H H
H H
H H H
H H H
θ = 0° θ = 60° θ = 120° θ = 180° θ = 240° θ = 300°
décalée éclipsée décalée éclipsée décalée éclipsée
HO CO2 H CO2 H
HO CO2 H H H
rotation 180°
C C = • −−
−−
−−
−−−−
−−
−−
−−−−
−−
−−* •
H NH2 H ) −−
H H H2 N H H2 N H
H
OH
... et de Cram
HO CO2 H HO
rotation
C C −−
)−−−−
−−−−
−−−−
−*
− C C
H NH2 de 180° H
H H H
Br
HO HO2 C H
•
H3 C H
NH2 H
D E
CH3 Br
HO CH3 HO2 C H
• •
H OH H3 C H
C2 H5 H
F E
12, 5
H
Ep (kJ · mol−1 )
θ
H H
•
H H
H
0, 0
0 60 120 180 240 300 360
θ (°)
Animation de la rotation de l’éthane : https://vchem3d.univ-tlse3.fr/vM_Conformation-ethane.html
• Pour passer d’une conformation décalée à la suivante, la molécule doit passer par une conformation
éclipsée : elle doit franchir une barrière conformationnelle de l’ordre de 10 kJ · mol−1 .
• Cette énergie est faible et peut être récupérée au cours d’un choc avec une autre molécule. À température
ambiante, les molécules passent sans cesse d’une conformation à une autre (plus de 1010 tours par seconde
pour l’éthane).
• Si on pouvait prendre une photographie de toutes les molécules, la très grande majorité serait en confor-
mation décalée.
Identifier les conformations du butane correspondant aux minima et aux maxima de la courbe d’énergie
potentielle. Préciser les conformères. Il faut commencer par identifier autour de quelle liaison se fait la
rotation d’angle θ.
20
15
Ep (kJ · mol−1 )
10
0
0 60 120 180 240 300 360
θ (°)
molécules différentes
HO2 C H
C C
H CO2 H CO2 H CO2 H OH
A B C D
Les deux formes d’une double liaison ne différent que par l’organisation spatiale des groupes autour des
atomes de la double liaison : on parle de stéréoisomèrie de configuration.
Q1 R1 Q1 R2
deux configurations
C C C C
différentes
Q2 R2 Q2 R1
Q1 R1 Q1 R2
C C C C
Q2 R2 Q2 R1
Dans tous les cas, on doit classer deux ou plus groupes tous liés à un atome (atome central).
• On considère les atomes directement liés à l’atome central sur l’un et l’autre substituant, appelé atomes
de la première sphère (ou du premier rang). S’ils sont différents, on détermine un ordre de priorité entre
eux, qui donnera l’ordre de priorité entre les substituants.
• Si les atomes de la première sphère sont identiques, on considère les atomes de la deuxième sphère, c’est-
à-dire les atomes liés aux atomes de la première sphère. S’il y a une différence entre les atomes de la
deuxième sphère sur le premier substituant et les atomes la deuxième sphère sur le second substituant,
on peut déterminer un ordre de priorité entre les substituants.
• S’il n’y a pas de différence entre les atomes de la deuxième sphère des deux substituants, on considère les
atomes de la troisième sphère, etc, en respectant le principe suivant : on doit considérer tous les atomes
d’une sphère avant de passer à la sphère suivante.
3.3.3 Règle no 1
Un atome de numéro atomique supérieur est prioritaire devant un atome de numéro atomique plus petit.
Règle no 1
H CO2 H
C C
HO2 C H
Entre deux isotopes, celui de plus grande masse atomique est prioritaire : 2 H >1 H.
3.3.4 Règle no 2
À une sphère donnée, on compare les atomes de l’un et l’autre groupe deux à deux par ordre de priorité
décroissante.
Règle no 2
H3 C H3 C CH3
H CH2 CH3 H CH CH3 H C CH3
C C C C C C
H3 C CH3 H3 C CH2 CH2 H3 C CH2 F
Br
3.3.5 Règle no 3
• Si à une sphère donnée, tous les atomes sont de même priorité, on considère la sphère suivante derrière
tous les atomes.
• Si à une sphère donnée, un atome est prioritaire sur les autres, on considère la sphère suivante derrière
cet atome uniquement (chaine prioritaire).
Règle no 3
CH3
H2 C NH2 H3 C
H CH CH2 H CH O CH3
C C C C
H3 C CH CH2 H3 C CH OH
H3 C OH H2 C
CH3
3.3.6 Règle no 4
• À un atome de valence inférieure à 4, on adjoint des voisins fictifs de numéro atomique nul, appelés des
fantômes.
• Dans le cadre des règles de préséance, une liaison double (triple) est traité comme deux (trois) liaisons
simples, en définissant autant d’atomes fictifs, appelés répliques, que nécessaire. Une réplique a le même
numéro atomique que l’atome original. Une réplique est liée à trois fantômes à la sphère suivante.
Règle no 4
CH3 CH3 H3 C H3 C
H CH2 N CH3 H C O H C CH2
⊕
C C C C C C
H3 C CH2 N CH3 H3 C CH OH H3 C C CH3
CH3 H3 C H3 C CH3
1. −F et −OH
5. −C ≡ CH et −CH2 − NH2
La liaison ondulée indique par quel atome le substituant est lié à l’atome central.
O H CH3
C CH3 C C C C CH3
CH2
CH3
M1 N1 O1
H3 C CH3 CH3
HC CH
C CH3 CH Br
C CH
O CH2
HC CH
M2 N2 O2
HO NH2
HO
O
P Q R
Carbone asymétrique
CHO
H OH
HO H
OH
O N
H H OH
∗C
OH
HO2 C CH3 H OH
H CH2 OH
OH OH OH CO2 H OH
H2 N OH
OH O OH
A B C D
OH OH
inversion de deux groupes quelconques ∗C
∗C
CH3 et seulement deux H
HO2 C HO2 C
H CH3
molécules différentes
Identifier la relation d’isomérie entre les deux formes d’un carbone asymétrique
Les deux formes d’un carbone asymétrique ne diffèrent que par l’organisation spatiale des groupes autour
de lui ; il s’agit de stéréoisomérie de configuration.
Si R1 , R2 , R3 et R4 sont quatres substituants tous différents, le carbone est asymétrique et existe sous
deux configurations différentes.
R4 R4
deux configurations
∗C ∗C
R1 R3 différentes R1 R2
R2 R3
OH OH OH
OH OH
A1 A2 A3 A4 A5
OH
H3 C CO2 H
b
CO2 H CO2 H
C C
H3 C H
HO H3 C S OH
c a
b
CO2 H CO2 H
C C
HO H
H3 C HO R CH3
a c
N O
H
H OH
N O
H retournement
H OH « de la crêpe »
Lorsque le groupe de plus petite priorité est vers l’avant, on peut faire le raisonnement habituel puis
inverser la conclusion.
NH2 NH2 H D
HO2 C
CO2 H CO2 H OH
OCH3
E1 E2 F G
Application 16 : représenter les composés suivants avec tous les atomes de carbone de
configuration (R)
OH OH OH CO2 H OH
H2 N OH
OH O OH
A 0
B0
C0
D0
Image spéculaire
On appelle image spéculaire d’un objet, son image par un plan de symétrie, autrement dit l’image de
cet objet par un miroir.
ir
iro
m
OH OH
C C
H3 C H H H3 C
H H
Molécule achirale
Une molécule est achirale si elle est identique à son image spéculaire = si son image spéculaire lui
est parfaitement superposable.
miroir
OH
C =
H3 C H
H
même molécule
OH OH
H J
Molécule chirale
Une molécule est chirale si elle est différent de son image spéculaire = si son image spéculaire ne
lui est pas parfaitement superposable.
miroir
OH
C =
H3 C CO2 H
H
molécules différentes
OH CO2 H OH
H2 N OH
OH O OH
A 0
C 0
D0
Attention ! Il ne faut pas oublier que les molécules existent sous une infinité de conformations :
• une molécule est chirale si elle n’est superposable à son image spéculaire dans aucune conformation ;
• réciproquement, avant de conclure que deux images spéculaires sont différentes, il faut s’assurer qu’elles
ne correspondent pas à deux conformations différentes de la même molécule.
La chiralité est reliée à la symétrie de la molécule. Une molécule est achirale si elle est « assez symétrique »,
en particulier si elle possède un plan ou un centre de symétrie. Attention ! La condition générale est hors
programme, et il existe des molécules achirales qui n’ont ni plan ni centre de symétrie.
Chiralité et symétrie
OH
C
H H3 C
H
miroir
OH OH
C C
H3 C CO2 H HO2 C H3 C
H H
CO2 H OH OH
H2 N
OH
Voir un résumé d’ensemble à l’annexe 6.1 Déterminer si une molécule est chirale.
Une molécule chirale possède un stéréoisomère de configuration, qui est son image spéculaire.
• On appelle énantiomérie la relation de stéréoisomérie de configuration entre une molécule chirale
et son image spéculaire.
• Une molécule chirale et son image spéculaire constituent un couple d’énantiomères.
OH OH
énantiomères
C C
S R
H3 C CO2 H HO2 C H3 C
H H
• Faire une représentation spatiale d’un énantiomère (Cram ou Newman) puis de son image spéculaire.
• Si la cause de chiralité est uniquement la présence d’atomes asymétriques : faire une représentation
spatiale de la molécule puis représenter l’autre énantiomère en inversant la configuration absolue de
chaque atome asymétrique (en échangeant la position de deux groupes sur chaque atome asymétrique).
OH
HO2 C
OH
H OH
CO2 H
NH2
HO
H
OH OH
OH OH
HO CHO
HO CHO
OH OH
Deux énantiomères ont des propriétés physiques identiques, sauf le pouvoir rotatoire : même température
de fusion, d’ébullition, même solubilité dans un solvant donné, etc.
Deux énantiomères ont des propriétés chimiques identiques dans un environnement achiral (même propriétés
acidobasiques ou rédox, même vitesse de réaction).
CO2 H CO2 C2 H5
même rendement
∗ ∗
HO même vitesse HO
+ C2 H5 OH −−
)−−
−−
−−−−
−−
−−
−−−−
−−
−−
−−
−−*
−− + H2 O
CO2 H CO2 C2 H5
∗ ∗
HO HO
En revanche, deux énantiomères ont a priori des propriétés chimiques différentes dans un environnement
chiral : le d-glucose est utilisable par les enzymes du métabolisme, mais pas son énantiomère le l-glucose. De
même, les deux énantiomères de la thalidomide ont des effets biologiques différents : la (R)-thalidomide est
antiémétique et la (S)-thalidomide est tératogène.
O O
H H
N O N O
N N
H H
O O O O
5.3 Diastéréoisomérie
Diastéréoisomérie
• On appelle diastéréoisomérie une relation de stéréoisomérie de configuration qui n’est pas de
l’énantiomérie.
• Deux molécules qui sont stéréoisomères de configuration mais qui ne sont pas énantiomères sont
diastéréoisomères.
CO2 H
diastéréoisomères
HO2 C CO2 H
HO2 C
acide fumarique acide maléique
OH OH OH OH
diastéréoisomères
Deux diastéréoisomères sont des molécules différentes qui n’ont ni les mêmes propriétés physiques ni les
mêmes propriétés chimiques.
O OH OH HO O OH
5 1
2 4 OH −
)−
−−−−
−−−−
−−*
−− 4 2
H
1 3 5 3
HO OH
OH OH OH
HO O OH HO O OH
5 1 5 1
4 2 4 2
3 3
HO OH HO OH
OH OH
anomère α anomère β
Pour un arbre décisionnel complet permettant de déterminer une relation d’isomérie entre deux molécules,
voir l’annexe 6.2 Identifier une relation d’isomérie.
OH Cl
K L
HO
Attention ! certaines doubles liaisons ne peuvent exister que sous une seule configuration : dans un cycle de
moins de 8 atomes, les liaisons du cycle sont du même côté de la double liaison.
Une molécule ayant m doubles liaisons disymétriques et n atomes de carbone asymétriques compte 2m+n
stéréoisomères de configuration au maximum.
H3 C CH3
C C
H H
Br Cl
Nombre de stéréoisomères
Dans le cas général, une molécule comportant deux atomes de carbone asymétriques compte 22 =
4 stéréoisomères de configuration répartis en 2 couples d’énantiomères, les autres relations étant de
diastéréoisomérie.
HO2 C CO2 H
C C
H OH
HO H
6 Annexes
6.1 Déterminer si une molécule est chirale
Par définition une molécule est chirale si elle n’est pas superposable à son image dans un miroir (image
spéculaire). Cela n’est pas forcément aisé à déterminer si la molécule est complexe, d’autant qu’on peut être
gêné par les multiples conformations. Généralement, il est plus facile de montrer qu’une molécule est achirale
(identique à son image spéculaire). Les causes usuelles de chiralité sont :
• la présence d’un ou plusieurs centre(s) asymétrique(s) : carbone le plus souvent, mais aussi silicium, azote
ou phosphore (alors chargés ⊕), etc ;
• la présence d’une structure intrinsèquement chirale : molécule en hélice le plus souvent ;
• les autres cas concernent généralement la chimie des métaux de transition (complexes octaédriques).
Si une molécule ne présente pas de cause usuelle de chiralité, il y a de bonne chance qu’elle soit achirale.
Reste à le montrer ; le plus facile est généralement d’appliquer la règle suivante.
Si une molécule présente un ou plusieurs centres asymétriques, elle peut être ou ne pas être chirale. En effet,
il ne faut jamais oublier qu’il existe les composés meso. On peut retenir la règle générale suivante.
Dans le cas de deux centres asymétriques, il faut s’assurer qu’on n’a pas à faire à un composé meso. Celui-ci
comporte un plan de symétrie et par voie de conséquence, les deux atomes asymétriques portent les mêmes
substituants. Dans le cas de plus de deux centres asymétriques, les choses se compliquent. Cependant, la règle
ci-dessous est tout à fait générale.
Lorsqu’une molécule est achirale, alors en prendre l’image dans un miroir est géométriquement équivalent à
la retourner de 180° (retournement « de la crêpe »). On en déduit la règle totalement générale suivante.
Problème particulier à considérer dans le cas des cycles à 6 atomes (cyclohexanes et dérivés, pour lequel le
cycle n’est en réalité pas plan. On peut raisonner sur un schéma dans lequel le cycle est représenté comme s’il
était plan, mais en représentant correctement la stéréochimie des atomes asymétriques.
OUI
OUI
OUI
NON
NON
A et B sont OUI
énantiomères
images spéculaires
stéréoisomérie
de configuration
NON
diastéréoisomères
Exercices
Application directe du cours
Exercice 1 : molécules chirales
Parmi les molécules suivantes, quelles sont celles qui sont chirales ? Essayer de donner une réponse sans faire
de schéma lorsque c’est possible.
HO
H
H
OH NH2
A B C
CH3 Br
HO CH3 HO2 C H
• •
H OH H3 C H CH3
C2 H5 H H
C C C
H3 C
H
D E F
CO2 H CO2 H
G1 et G2 H1 et H2
O O
O
J K
Déterminer, dans cet ordre ou non, la configuration du ou des atome(s) de carbone asymétrique(s) de ces
molécules, et la relation stéréochimique entre elles.
NH2 NH2
H5 C2 H H3 C H
• •
H CO2 H H CO2 H
CH3 C2 H5
isoleucine alloisoleucine
H2 N
O NH2
OH HO HO
L M N1 N2 P
Entrainement
Exercice 6 : isomérie de constitution
Dessiner les représentations topologiques de tous les isomères de constitution de formule moléculaire C4 H9 Br.
OH
NH2
2. Les représenter en précisant les configurations absolues des atomes de carbone asymétriques. Indiquer les
relations stéréochimiques entre les stéréoisomères.
Représenter ces deux acides aminés, sachant que le descripteur stéréochimique du carbone asymétrique est
(R) dans la cystéine et (S) dans la méthionine.
Exercice 11 : l’arabinose
On donne ci-contre la représentation plane de l’arabinose.
OH OH
1. Préciser à quelle famille d’aldoses il appartient.
2. Faire une représentation spatiale du d-arabinose, sachant que ses HO
CHO
descripteurs stéréochimiques sont (2S, 3R, 4R).
3. Combien de stéréoisomères de configuration l’arabinose compte-t- OH
il ?
4. Dessiner tous les autres aldoses de la même série ayant le même nombre d’atomes de carbone que l’arabinose.
O O O
O
N⊕ CH3
H5 C6 CH3
•
H
H3 C H
O H
H OH
W X Y Z
Travaux dirigés
Exercice 1 : isomérie des hydrocarbures
1. Un hydrocarbure de formule moléculaire C3 H6 est-il obligatoirement le propène ? Si oui, justifier ; si non,
quel(s) autre(s) composé(s) correspondent-ils à cette formule brute ?
2. Représenter tous les isomères de constitution de formule brute C5 H10 .
3. Pour chacun des couples de composés ci-dessous, préciser s’il y a une relation d’isomérie, et si oui laquelle ?
Nommer chacune des molécules.
OH
A1 B1 C1
OH
A2 B2 C2
F
H OH
•
H CH3
HOC CH3
A B
Exercice 3 : nomenclature
Donner le nom, en nomenclature systématique, des deux composés suivants. Le fluor F et le brome Br sont
des substituants désignés par les termes fluoro- et bromo-. On ne se préoccupera pas de stéréochimie.
H
F CH3
HO2 C •
OH HO
Br OH
C D
HO
OH
E F
O
G H
O
O
Cl H NH2 NH2
H Cl H H3 C
Br Br
H H H3 C H
L1 L2 M1 M2
CH3 CH3
H H H H
CO2 H
• •
H CH3 H3 C H
CO2 H CH3 CH3
P1 P2 Q1 Q2