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    21 Staphylocoques SC

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    Ce document décrit les staphylocoques, notamment leur morphologie, leurs caractéristiques culturelles et biochimiques, leur épidémiologie et pouvoir pathogène, ainsi que le diagnostic au laboratoire des infections qu'ils causent.

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    Les Staphylocoques

    Bactériologie – Virologie

    UASZ, 26 avril 2024


    Objectifs pédagogiques
    1°) Citer l’espèce de Staphylocoque la plus
    pathogène
    2°) Décrire la morphologie des staphylocoques
    3°) Décrire les caractères culturaux des
    staphylocoques
    4°) Connaître les principaux caractères
    biochimiques impliqués dans le diagnostic
    5°) Classer les types de pus selon leur
    origine
    6°) Décrire l’étude des pus au laboratoire
    1. Introduction
    / Définition : cocci à Gram positif en amas,
    produisant une catalase.
    / Découverte :
    - En 1880 dans un pus : Louis Pasteur
    - Description (grains en grappe de raisin) et nom
    de staphylocoque : Ogston en 1883
    / Bactérie pyogène + + :
    - Responsable de maladies diverses
    - Sécrétion d’enzymes et de toxines
    2. Caractères bactériologiques
    2.1. Taxonomie
    * Famille des Staphylococcaceae : catalase (+)

    * Genre : Staphylococcus
    * Espèces de staphylocoque : nombreuses
    Trois plus retrouvées chez l’homme : S. aureus (la plus
    pathogène), S. epidermidis, S. saprophyticus
    2.1. Caractères
    morphologiques :
    . Cocci à Gram positif,
    . immobiles,

    . Groupement en amas
    (grappes de raisin ++)
    surtout; parfois isolés,
    en diplocoques en en
    courtes chainettes
    2.2. Caractères culturaux
    . Bactérie non exigeante, pousse
    sur milieux ordinaires
    - Sur bouillon : trouble
    homogène + culot au fond
    - Sur gélose : colonies de taille
    moyenne, lisses, opaques, bords
    réguliers, pigment jaune doré pigment jaune doré de
    ou blanc Staphylococcus aureus
    . Type respiratoire : Aéro-
    anaérobie facultatif (AAF)
    . Culture sur milieu hostile :
    gélose de Chapman : 9g/l de
    Nacl + mannitol
    Plasma de lapin
    2.3. Caractères biochimiques :
    * Fermentation de sucres :
    - le glucose : tous les staphylocoques
    - le mannitol : Staphylococcus aureus (-) (+)
    et S. saprophyticus)
    * Sécrétion de substances : Coagulase
    - Toxines (S. aureus): hémolysines,
    leucocidine, entérotoxine, toxine du Gélose ADN
    syndrome de choc toxique, toxine
    pyrogène, toxines épidermolytiques
    - Enzymes (S. aureus) : coagulase
    libre, coagulase liée, nucléase,
    fibrinolysine, hyaluronidase
    DNase
    2.4. Caractères antigéniques :
    Portés par la paroi bactérienne :
     Protéine A
    - empêche la phagocytose
    - critère taxonomique  S. aureus
     Acides teichoïques, lipoteichoïques
    - nécrose, fièvre
    - thrombopénie
     Glycocalyx, protéines  adhésines
    3. Epidémiologie & Pouvoir pathogène
    3.1. Habitat :
    . Germes répandus dans la nature : eau, sol, air
    . Flore normale (porteurs asymptomatiques) :
    fosses nasales, peau, périnée, aisselles

    3.2. Transmission : interhumaine


    - Directe : manuportage, contacts directs
    - Indirecte : aliments, milieu extérieur
    • infections nombreuses et de gravité inégale

    • deux types de syndromes

    - toxi-infections ou toxémies staphylococciques: dues à


    la production de toxines
    - infections suppuratives: prolifération bactérienne,
    invasion, destruction des tissus de l’hôte
    3.4. Tableaux cliniques variés = Staphylococcies
    * Atteintes cutanéo -muqueuses :
    Infections superficielles ou profondes : folliculites, abcès,
    onyxis, furoncles, phlegmons, sinusites, otites

    * Localisations viscérales :
    - Osseuses : ostéomyélite, ostéite
    - Pleuro-pulmonaires : après virose (grippe)
    - Uro-génitales : pyélonéphrite, abcès du rein
    - Neuroméningées : méningites, abcès cerveau
    - Cardiaques : endocardites
    * Septicémies = Staphylococcémies
    - Liées et entretenues par un foyer infectieux (PE)
    - Complication : thrombophlébite mortelle
    (staphylococcie maligne de la face + +)
    * Autres :
    - Toxi-infections alimentaires: dues aux entérotoxines
    préformées dans l’aliment, entraînant des troubles
    digestifs précoces.
    - Entérocolites aiguës : suite à une antibiothérapie
    avec prolifération de souches de S. aureus résistantes
    et productrices d’entérotoxine
    - Syndrome de choc toxique : par action de la toxine
    staphylococcique
    4. Diagnostic au laboratoire
    4.1. Prélèvements : divers, avant antibiothérapie
    Hémocultures, pus, LCR, urines, biopsies,
    Aliments, eaux, air (milieu hospitalier)

    4.2. Etude au Laboratoire comprend :


    - Examen macroscopique
    - Examen microscopique
    - Culture : bouillon, gélose, Chapman
    - Identification : caractères biochimiques
    et antigéniques
    - Sensibilité aux antibiotiques
    Principaux caractères d’identification
    Cocci à Gram positif, immobiles, en amas ++

    Catalase positive, AAF, Glucose +

    Cultive sur milieux ordinaires (aspects)

    Cultive sur milieu de Chapman


    Différenciation des espèces :
    Mannitol, pigment, Coagulase, DNase , Protéine A
    Identification

    Recherche de la protéine A: technique aggluti

    Coagulase
    Milieu de Chapman
    Diagnostic différentiel :

    S. aureus S. epidermidis S.
    saprophyticus

    Chapman (+) (+) (+)

    Glucose (+) (+) (+)

    Mannitol (+) (-) (+)

    Pigment Jaune Blanc -

    Coagulase (+) (-) (-)

    DNase (+) (-) (-)


    4.3. Test de sensibilité : antibiogramme
    * Bactérie sensible aux béta-lactamines : mais
    - Production de pénicillinases : inactivation des
    pénicillines G et V, aminopénicillines, carboxyP.
    et uréidopénicillines
    - Souches méticillino-résistantes : résistance aux
    autres -Lactamines (recherche systématique)
    * Autres antibiotiques actifs : aminosides,
    phénicolés, macrolides, glycopeptides, acide
    fusidique, quinolones
    Résistance aux antibiotiques

    Souche méti-R
    Souche Pénicillinase
    Pus et liquides d’épanchement
    Introduction

     Recherche d’agent responsable d’une collection


    purulente, d’un épanchement liquidien ou d’une
    surinfection

     Produits pathologiques mono ou polymicrobiens


    Indications
     Suppurations profondes

     Suppurations superficielles fermées

     Épanchement dans une cavité stérile


    Classification :
    Collections ouvertes
     Plaies chirurgicales : abdominales

     Plaies médicales

     Plaies traumatiques

     Brûlures

     Escarres
    Collections fermées
    Suppurations des séreuses
    - pleurésie, péritonite
    - péricardite, synovite
    Abcès divers
    - furoncle, anthrax, phlegmon
    - adénites suppurées
    - foie, poumons, reins, cerveau
    Recueil des pus
    et liquides d’épanchement
     Moment
    . Avant toute antibiothérapie
    . Avant la fistulisation spontanée des collections fermées

     Technique
    Selon le type de collection, ouverte ou fermée
    Collections fermées

     Nettoyer la peau avec l’antiseptique

     Ponctionner à la seringue ou inciser

     Aspirer ou écouvillonner
    Collections ouvertes

     Nettoyer la plaie (eau distillée stérile)

     Aspirer le pus

     Écouvillonner la plaie
    Transport – Conservation
     Transport

    - immédiat : délai de 30’


    - milieux de transport : Stuart, Amies
     Conservation

    - humidifier écouvillons
    - idéal : ne pas conserver
    - éviter l’air si recherche anaérobie
    Examen macroscopique
    Pus
    - crémeux, fluide …
    - marron, verdâtre
    - présence de grains : Actinomycètes
    - fétides : anaérobies
    Liquide d’épanchement : séreux ou citrin
    - exsudat : inflammation
    - transsudat : mécanique
    Examen microscopique
     Coloration de Gram

    - flore monomicrobienne
    - flore polymicrobienne

     Autres colorations (au besoin)

    - Ziehl-Neelsen : recherche de BAAR


    - May Grunwald Giemsa : leucocytes
    Examen chimique
    Transsudat (mécanique)

    - taux de protéine < 20g par litre

    - cytologie < 500 cellules par mm3

    Exsudat (inflammation)

    - taux de protéine > 20g par litre

    - cytologie > 500 cellules par mm3


    Culture
     Géloses

    - sang frais + acide nalidixique


    - sang cuit + facteurs de croissance
    - Lowenstein-Jensen
    - Gélose nutritive, Gélose Chapman
     Bouillons

    - cœur cervelle, thioglycolate


    - Rosenow, Schaedler
     Galerie d’identification

    - caractères morphologiques

    - culturaux

    - biochimiques

    - antigéniques
     Antibiogramme
    Interprétation
    Collections fermées

     Foyer profond

    - flore monomicrobienne
    - flore mixte : anaérobies + aérobies

     Foyer superficiel : flore monomicrobienne


    Collections ouvertes

     Flore polymicrobienne

    - faire juste un examen microscopique


    - habituellement on ne cultive pas

     Interprétation : difficile, subjective


    Principales bactéries
    Staphylococcus aureus

    Streptococcus pneumoniae

    Streptococcus sp.

    Pseudomonas aeruginosa

    Enterobacteriaceae

    Bactéries anaérobies

    Actinomycètes

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