アクセス権をリクエスト まずはMIMICへのアクセス権をもらう必要があります。以下、その手続きを開設していきますが、こちらも合わせて参照してください。 CITIトレーニング MIMICへのアクセス権をリクエストする前に、CITI programの”Data or Specimens Only Research”というコースを、オンラインで修了しておく必要があります。 まず、こちらのサイトに行き、”affiliation”のところで”Massachusetts Institute of Technology Affiliates”を選びます（”independent learner”ではないのでご注意を）。 “Massachusetts Institute of Technology Affiliates course”→”Human Subjects training category”→
「JX通信社Advent Calendar 2019」10日目の記事です. 昨日は, @rychhrさんの「Pure WebSocketsをサポートしたAWS AppSyncでWebとiOS間のリアルタイムチャットを作ってみた(1)」でした. 改めまして, こんにちは. JX通信社でシニア・エンジニア&データ基盤エンジニアをしています, @shinyorke（しんよーく）と申します. JX通信社では, データ駆動での意思決定および施策実施をより円滑に進めるため, データ基盤の構築・運用を進めながらトライアル的に様々なFrameworkやツールの検証を行っています.*1 このエントリーでは, 私がシュッとPySparkで分散処理をする...前に, 手元で試したときの感想とその知見 のお話を残していきたいと思います. なお, 分散処理そのものの知見・ノウハウではなく, する前にPySparkに
Fifteen years ago, there were only a few skills a software developer would need to know well, and he or she would have a decent shot at 95% of the listed job positions. Those skills were: Object-oriented programming.Scripting languages.JavaScript, and…SQL.SQL was a go-to tool when you needed to get a quick-and-dirty look at some data, and draw preliminary conclusions that might, eventually, lead t
トピック SQL のクエリと、Pandas のメソッドの対応表を作成する。 SQL 勉強中のため、備忘録代わりに箇条書き（殴り書き）で書いていく。 Udemy のこちらのコースで勉強していました。 DBやテーブル自体の更新・操作に関するものはこちらにまとめている。（SQL のクエリだけを書き散らかしているだけ） 順序 記述順序 select from join系(+on) where group by having order by limit 実行順序(※) from join系(+on) where group by select having order by limit (※)追記 @nora1962jp さんからご指摘をいただきましたので、コメント内容を追記します。 実行順序 from join系(+on) where SQLについてなら実行順序はonとwhereの順序はonが先
参考資料 mysqlやsqliteについてはstackoverflowの下記記事参照 http://stackoverflow.com/questions/10065051/python-pandas-and-databases-like-mysql 尚、上記で使っているframe_queryはdeprecatedになっていて、現在ではread_queryを使うらしい。 postgresqlとの接続 psycopg2を使う pip install psycopg2 SELECTする際の適当なサンプルコード import psycopg2 as pg with pg.connect(database='db_name', user='user_name', host='host_name', port=5432) as conn, conn.cursor() as cur: cur.exec
"""Get data from MySQL with pandas library.""" import MySQLdb import pandas.io.sql as psql con = MySQLdb.connect(db='work', user='root', passwd='') # DB接続 sql = """SELECT product_id, product_nm, product_features FROM electronics""" df = psql.read_sql(sql, con) # pandasのDataFrameの形でデータを取り出す con.close()
参考：pandasでRDBの読み書きをする Pandasは、R言語のdata.frameと呼ばれるデータ構造をPythonに移植したもので、 データ解析によく使われるライブラリ。 データ解析にはデータベースが切っても切れない関係であるため、 PandasはSQLと密に連携できるようになっている。 SQLには色々な方言があるのだが、Pythonでそれらの方言を統一的に扱おうとしているのがSQLAlchemyというライブラリ。 そこで、PandasからSQLAlchemyを使ってデータベースから読んだデータをDataFrameに変換するには： import sqlalchemy import pandas as pd # この例ではsqliteを使うが、 engine = sqlalchemy.create_engine('sqlite:///example.db') # 例えば、Postgr
概要 pythonによるデータ分析入門を参考に、MovieLens 1Mを使ってsqlで普段やってるようなこと（joinとかgroup byとかsortとか）をpandasにやらせてみる。 ファイルの読み込み 落としてきたファイルを解凍すると、movies.dat、rating.dat、users.datという3つのファイルが入っているので、read_csvで読み込む。 import pandas as pd movies = pd.read_csv( 'ml-1m/movies.dat', sep='::', header=None, names=['movie_id', 'title', 'genres'] ) ratings = pd.read_csv( 'ml-1m/ratings.dat', sep='::', header=None, names=['user_id', 'mo
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