Énergétique Cellulaire: DR Nguele

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ÉNERGÉTIQUE CELLULAIRE

Dr NGUELE Jean – Calvin, Ph.D.

Copyright Dr NGUELE Jean-Calvin 2022


OBJECTIFS
I- DÉFINIR le métabolisme et présenter le cycle des biomolécules;

II- REPRÉSENTER les différentes étapes de la Respiration cellulaire;

III- RAPPELER les principales réactions du Cycle de Krebs;

IV- DÉTERMINER le Bilan énergétique de la cellule;

V- RECONNAITRE les éléments constitutifs de la Chaine Respiratoire.

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PLAN
I- INTRODUCTION - GÉNÉRALITÉS

II- LES 3 ÉTAPES DE LA RESPIRATION CELLULAIRE

II.1- FORMATION D’ACÉTYL COENZYME A

II.2- LE CYCLE DE KREBS

II.3- LA CHAINE RESPIRATOIRE

III- LE BILAN ÉNERGÉTIQUE

IV- CONCLUSION

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I- INTRODUCTION – GÉNÉRALITÉS: MÉTABOLISME ET
ÉNERGÉTIQUE CELLULAIRE
I-1. Définitions
Le MÉTABOLISME c’est l’ensemble des réactions biochimiques de
l’organisme. Ces réactions sont :

ORGANISÉES en VOIES MÉTABOLIQUES;

INTERCONNECTÉES

Finalement, il existe deux grandes classes de voies métaboliques:

L’ANABOLISME = processus de biosynthèse des molécules;

Le CATABOLISME = processus de dégradation des molécules.

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I-2. Cycle des molécules

CATABOLISME ANABOLISME

ENVIRONNEMENT MACROMOLÉCULES

Energie

n(A. AMINÉS) = PROTÉINES


ALIMENTS
(dégradés en nutriments ) n(OSES) = GLUCIDES

n(AC. GRAS) = LIPIDES


PROTÉINES = A. AMINÉS
n(NUCLÉOTIDES) = AC. NUCLÉIQUE
GLUCIDES = OSES

LIPIDES = AC. GRAS

AC. NUCLÉIQUES = NUCLÉOTIDES

Dégradation oxydative Chaleur


DÉCHETS
CO2 H2O NH3
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I-3. Les Transferts d’Energie

Les transferts d’énergie sont réalisés par des transporteurs


activés.
A- L’ADENOSINE TRIPHOSPHATE (ATP)

C’est la molécule universelle de transport d’énergie.


C’est en quelque sorte «l’unité monétaire internationale de
l’énergie ». Elle est directement utilisable par la cellule.

Il y a deux liaisons riches en énergie. Elles stockent


l’énergie et elles la relarguent par hydrolyse.
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On peut ainsi avoir la réaction suivante:

ATP + H2O ADP + Pi

Energie théorique ΔG° = - 7.3kcal/mol

En pratique in vivo, la cellule récupère 12 kcal/mol grâce à


la force ionique dans la cellule et la concentration des cations
bivalents comme le Mg2+.

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B- NADH,H+ & FADH2

NADH et FADH2 sont des intermédiaires activés qui réalisent le


transport d’électrons riches en énergie.

La NAD+ est la nicotinamide adénine dinucléotide, qui est un dérivé


de la Vitamine PP ou B3).

NAD+ + 2 e- + 2 H+ NADH + H+

La FAD est la flavine adénine dinucléotide.

FAD+ + 2 e- + 2 H+ FADH2

La FADH2 est la riboflavine qui dérive de la vitamine B2.

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C- ORIGINES DES COENZYMES REDUITS: NADH,H+ & FADH2

2 PYRUVATES
GLYCOLYSE 2 ATPs
2 NADH,H+

2 ATPs
KREBS 8 NADH,H+
2 FADH2

ACETYL-CoA
β-OXYDATION FADH2
2 NADH,H+

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I-4. Les Voies de production de l’ATP
La production d’ATP, quand elle est spécifique aux glucides,
c’est la glycolyse. Elle a lieu dans le cytoplasme.
Lorsqu’elle est commune aux 3 métabolismes (lipides, protéines, glucides). C’est
la respiration cellulaire. Elle a lieu dans la mitochondrie.

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II- LES 3 ÉTAPES DE LA RESPIRATION CELLULAIRE
II-1. Formation de l’Acétyl-CoA
Il peut s’agir de la production directe de l’Acétyl-CoA :

Par β-OXYDATION des acides gras;

Par certains acides aminés.

Il peut aussi s’agir de la production de l’Acétyl-CoA à partir du


pyruvate. Cette production a lieu dans la mitochondrie. C’est la première
étape de la respiration cellulaire proprement dite.

PYRUVATE ACÉTYL CoA


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Le pyruvate (C3) est transformé,
en présence de CoA-SH et d’un complexe enzymatique, en Acétyl-CoA (C2) et
en CO2. Pour se faire, Le NAD+ est transformé en NADH.

Le complexe enzymatique est le complexe du pyruvate déshydrogénase


(PDH). C’est le site de régulation du cycle de Krebs. Cette étape est
exergonique et irréversible.
A- LE COMPLEXE ENZYMATIQUE PDH
Il y a 3 enzymes et 5 coenzymes. La plupart de ces coenzymes dérivent
des vitamines.

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B- MÉCANISME DE DÉSHYDROGÉNATION DU PYRUVATE

La déshydrogénation du pyruvate se déroule en plusieurs étapes


dans un complexe multienzymatique tel que schématisé ci-
dessous:

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La régulation de ce mécanisme est assurée par deux procédés:
Soit ALLOSTÉRIQUE;

Soit COVALENTE par PHOSPHORYLATION.

Les pathologies dans lesquelles les PDH sont impliquées peuvent être soit
métaboliques (ex: carence en thiamine qui entraine le BÉRI-BÉRI avec des
signes essentiellement neurologiques et cardiaques), soit génétiques (ex:
déficits congénitaux dans les cas de myopathies accompagnées ou non
d’encéphalopathie. Maladie mitochondriale à transmission maternelle).
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II-2. Le Cycle de Krebs

Le Cycle de Krebs ou « Cycle des acides tricarboxyliques » possède


plusieurs caractéristiques:

Oxydation complète du groupement Acétyl avec émission de 2 CO2 qui sont


des déchets;

8 étapes dont 4 oxydations, chacune fournit 2 électrons riches en énergie stockés


sous forme de 3 NADH, H+ et 1 FADH2, intermédiaires dans la production d’ATP;

Production d’un GTP;

Il existe 3 étapes irréversibles qui vont être le siège des régulations.

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VUE D’ENSEMBLE DU MÉTABOLISME DES GLUCIDES

LUMIÈRE INTESTINALE

PLASMA

CYTOPLASME

MITOCHONDRIE (MATRICE)

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Dans la matrice mitochondriale,
le Cycle de Krebs se déroule comme suit:

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A- DÉTAILS DES ÉTAPES DU CYCLE DE KREBS

Le Cycle du citrate comprend 8 étapes grâce à 8 activités


enzymatiques différentes (Cf. Cours Métabolisme
Glucides: Glycolyse & Cycle de Krebs).

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B- RÉGULATION DU CYCLE DE KREBS

Cette régulation se fait par l’adaptation aux besoins énergétiques.

Le principal élément de régulation est le Rapport ATP/ADP.

Si ce Rapport est fort, le système est riche en énergie;

La diminution de ce Rapport est la clé qui fait tourner le cycle de Krebs.

Il y a 3 étapes qui sont régulées : E1, E3 et E4. Ce sont des régulations


allostériques.

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C- FONCTIONS ANABOLIQUES DU CYCLE DE KREBS

Le cycle du citrate est comme une source de précurseurs aux


anabolismes.

L’alpha-cétoglutarate peut être utilisé comme précurseur d’acides


aminés et des purines.

Le citrate peut être utilisé comme précurseur des acides gras et des
stéroïdes.

Le Succinyl-CoA peut être précurseur de la synthèse de porphyrines


(molécules à structure cyclique impliquées dans le transport de l’oxygène et
pouvant jouer le rôle de coenzyme de certaines enzymes), famille de
l’hème.

L’oxaloacétate peut être précurseur de la synthèse de glucose, de


certains acides aminés et de pyrimidines.

Le cycle se vide donc peu à peu, et il faut donc le remplir…


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D- RÉAPPROVISIONNEMENT DU CYCLE DE KREBS
Il y a deux façons de réapprovisionner le cycle.

FORMATION D’OXALOACÉTATE À PARTIR DE PYRUVATE


La formation d’oxaloacétate peut se faire à partir du pyruvate, qui lui provient de la
glycolyse.

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RÉAPPROVISIONNEMENT À PARTIR DES ACIDES AMINÉS

Concernant le réapprovisionnement du cycle à partir des acides


aminés, il y a 4 points d’entrées :

L’oxaloacétate;

L’α-cétoglutarate;

Le succinyl-CoA;

Le fumarate.

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II-3. La Chaine Respiratoire
Les particularités générales de celle-ci sont les suivantes:

C’est le stade ultime du métabolisme des nutriments;

C’est la principale source de production d’ATP;

C’est une séquence de réactions d’oxydoréduction qui réalisent le


transfert des électrons à partir des transporteurs activés (NADH,H+ et
FADH2) vers l’Oxygène moléculaire avec production d’ATP et d’eau.

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A- ORGANISATION GÉNÉRALE DE LA CHAINE

Il y a 4 complexes multienzymatiques numérotés de I à IV qui réalisent


le transport d’électrons. Trois des complexes sont des Pompes à protons.

Les complexes sont reliés par 2 transporteurs mobiles :

L’Ubiquinone ou coenzyme Q ou UQ. C’est un lipide;

Le Cytochrome C qui est une hémoprotéine.

Il existe un 5ème complexe, l’ATP Synthase qui est le Complexe V.

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La chaine se présente donc comme ci-dessous:

ESPACE INTERMEMBRANAIRE
pH = 7

MITOCHONDRIE (MATRICE)
pH = 8 Copyright Dr NGUELE Jean-Calvin 2022
B- MÉCANISME MOLÉCULAIRE DE LA PHOSPHORYLATION
OXYDATIVE
Progressivement, un gradient de concentration de protons va s’établir.
Il y a dix fois plus de protons dans l’espace intermembranaire que
dans la matrice mitochondriale.

Aussi, le pH dans l’espace intermembranaire est de 7, et celui dans la


matrice mitochondriale est de 8.

Le gradient est conservé d’une part par les pompes à protons, et


d’autre part parce que la membrane est imperméable aux protons.

Il y a en plus un gradient de charges électriques. L’espace


intermembranaire est positif alors que la matrice mitochondriale est
négative. Cela s’ajoute au gradient de concentration.
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Au niveau de la chaine respiratoire, à chaque étape,
les électrons perdent de leur énergie :

Cela crée une Force électromotrice. Cette force alimente les pompes à protons;

Cela crée une Force protomotrice qui permet le gradient de protons;

Cela crée un Potentiel de phosphorylation qui permet la synthèse d’ATP.

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C- RENDEMENT ÉNERGETIQUE DE LA PHOSPHORYLATION
OXYDATIVE

Le rendement réel de la phosphorylation oxydative est le


suivant:

NADH, H+ = 2.5 ATP 3

FADH2 = 1.5 ATP 2

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III- BILAN ÉNERGÉTIQUE

En se basant sur le fonctionnement pour un tour de cycle, le


bilan énergétique pour une molécule d’acétyl-CoA
utilisée sera le suivant:

3 NADH, H+ x 2.5 ATP = 7.5 ATP

1 FADH2 x 1.5 ATP = 1.5 ATP

1 GTP x 1 ATP = 1 ATP

TOTAL GLOBAL: 10 ATP

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