Enzimas
Enzimas
Enzimas
8. Enzimas
http://puesoccurrences.wordpress.com/2009/07/
Década 50
- 75 enzimas isoladas e cristalizadas.
- Ficou evidenciado carácter proteico.
Actualmente
+ 2000 enzimas são conhecidos.
Enzimas
Biocatalisadores Aumentam a velocidade das reacções
diminuindo a barreira energética de activação (Ea). No entanto, não
alteram o valor de G nem a constante de equilíbrio da reacção.
Adaptado de: GARRETT,R., H., GRISHAM, C. M.,(2001). Principles of Biochemistry With a Human Focus, Brooks Cole.
Propriedades dos Enzimas
São catalisadores biológicos que aceleram as reacções
bioquímicas termodinamicamente possíveis.
São verdadeiros catalisadores – não se consomem nem se
alteram.
São macromoléculas de natureza proteica que catalisam
reacções bioquímicas. São proteínas globulares (estrutura
quaternária).
Apresentam massa molecular muito variável:
Ex: Ribonuclease 13 700 Da; β-Galactidase 520 000 Da
Com excepção de um pequeno grupo de moléculas de RNA
com propriedades catalíticas, chamadas RIBOZIMAS, todas
os enzimas são PROTEÍNAS.
Propriedades dos Enzimas
Especificidade – os enzimas são específicos para
determinados substratos ou grupos de substratos.
1º dígito – classe
2º dígito – subclasse
3º dígito – sub-subclasse
4º dígito – nº de série relacionado com o substrato
Ex.
EC 1.1.3.4 β–D–glucose:oxigénio redutase (glucose oxidase)
Classes dos Enzimas
Adaptado de: NELSON, D., COX, M. (2004). LEHNINGER PRINCIPLES OF BIOCHEMISTRY, W. H. FREEMAN.
Classificação dos Enzimas
1- Oxiredutases
Catalisam a transferência de electrões de um redutor para um
oxidante. Ex: Álcool desidrogenase
EC 1.1.1.1
ADH
CH3CH2OH + NAD+ CH3COH + NADH + H+
Etanol Acetaldeído
2- Transferases
Transferem grupos funcionais de um composto (dador) para outro
(aceitador). Ex: Glucocinase
EC 2.7.1.3
Classificação dos Enzimas
3- Hidrolases
Catalisam a hidrólise de diversas ligações (rompimento da ligação por
entrada de água).
Ex: Carboxipeptidases (Rompem as ligações peptídicas)
4- Liases
Catalisam a ruptura não hidrolítica de uma ligação no substrato.
Quebram ligações: C – C; C – O; C – N
5- Isomerases
Catalisam modificações geométricas ou estruturais no interior de uma
molécula. Ex: Malato isomerase EC 5.2.1.1
Malato Fumarato
6- Ligases ou sintetases
Catalisam a união de duas moléculas com hidrólise simultânea do ATP.
Subclasses dos Enzimas
Subclasses dos Enzimas
Adaptado de: GARRETT,R., H., GRISHAM, C. M.,(2001). Principles of Biochemistry With a Human Focus, Brooks Cole.
Enzimas - Especificidade
Os enzimas são específicos para determinados substratos ou grupos de
substratos.
crentinho.wordpress.com
E+S ES E+P
http://camilalemos.com/wp-content/uploads/2008/12/enzimas-2.jpg
Natureza Proteica dos Enzimas
Os enzimas são proteínas de estrutura globular.
Apresentam estrutura terciária ou quaternária.
Holoenzima
Hexocinase Mg2+
Urease Ni2+
Co-Enzimas
A maioria deriva de vitaminas hidrosolúveis
Podem classificar-se em:
-Transportadores de hidrogénio
-Transportadores de grupos químicos
Transportadores de Hidrogénio
Coenzima Abreviatura Reacção Origem
Catalisada
Nicotinamida NAD+ Oxi-redução Niacina ou vitamina B3
adenina
dinucleótido
Nicotinamida NADP+ Oxi-redução Niacina ou vitamina B3
adenina
dinucleótido fosfato
Estes incluem:
Centros catalíticos: possuem resíduos de aminoácidos que estão
directamente envolvidos no processo de catálise enzimática.
Centros de ligação de S: responsáveis pela ligação do S à molécula
do enzima durante o processo de catálise.
Centros alóstereos: centros distintos do centro activo a que se
ligam modificadores apropriados. Esta ligação provoca alterações de
conformação do centro activo e implica regulação da actividade
enzimática (enzimas alostéreos).
Outros centros específicos: presentes na molécula de enzima e
responsáveis pelas interacções: em complexos multienzimáticos,
enzimas ligados a membranas e co-factores.
Enzimas Alóstereos
img.blogs.abril.com.br/.../alostericas-nh.png
Características do Centro Activo
Modelo da Chave -Fechadura
home.mira.net/~reynella/debate/lock&key.gif
Características do Centro Activo
Modelo de Encaixe Induzido
www.mun.ca/biology/scarr/F09-20bsmc.jpg
Factores que contribuem para a eficiência
catalítica dos enzimas:
O enzima liga-se ao seu substrato de forma a que este fique muito
próximo dos resíduos aminoacídicos do centro activo, para facilitar o
estabelecimento da ligação covalente. Além disso, a ligação covalente
deve estar sempre bem orientada em relação ao grupo catalítico com
vista à rápida formação do estado de transição.
k1 k2
E+S k-1
ES k-2
E+P
Em Física v0=S/ t
Nas Reações Químicas v0= P/ t Etapa 2
Da Cinética Química sabemos que
para uma reação de primeira ordem: v0= k[R]
v0= k2[ES]
Modelo de Michaelis-Menten
k1 k2
E+S k-1
ES E+P
Adaptado de: GARRETT,R., H., GRISHAM, C. M.,(2001). Principles of Biochemistry With a Human Focus, Brooks Cole.
Modelo de Michaelis-Menten
ESTADO ESTACIONÁRIO - Considera-se que não existe variação da
concentração do intermediário da reacção (complexo ES), apesar da
variação das concentrações de S e P ([S] está a diminuir e [P] a
aumentar).
Velocidade de formação de ES = Velocidade de decomposição de ES
k1 k2
E+S k-1
ES E+P
v0= k2[ES]
vmáx= k2[Et]
Equação de
Michaelis-
Menten
Representação de Michaelis-Menten
Parâmetros cinéticos:
Constante de Michaelis- Menten (KM) – corresponde à [S] quando a
velocidade é igual a Vmáx /2.
Velocidade máxima Vmáx – Corresponde à velocidade máxima da
reacção, quando o E está saturado.
Adaptado de: NELSON, D., COX, M. (2004). LEHNINGER PRINCIPLES OF BIOCHEMISTRY, W. H. FREEMAN.
Parâmetros Cinéticos
Velocidade máxima Vmáx
0.1 0.024
0.2 0.032
0.5 0.041
1.5 0.046
Equação de Michaelis-
Menten
invertida
= +
= x +
Métodos de Linearização
Método de Lineweaver- Burk
[Catecol] (mM) Velocidade inicial (s-1) 1/[Catecol] (mM-1) 1/Velocidade inicial (s)
Adaptado de: GARRETT,R., H., GRISHAM, C. M.,(2001). Principles of Biochemistry With a Human Focus, Brooks Cole.
Métodos de Linearização
Método de Eisenthal – Cornish – Bowden
Método directo
V0
-1
[Catecol] (mM) Velocidade inicial (s )
0.1 0.024
0.2 0.032
0.5 0.041
1.5 0.046
[S]
Cinética Enzimática
Adaptado de: GARRETT,R., H., GRISHAM, C. M.,(2001). Principles of Biochemistry With a Human Focus, Brooks Cole.
Regulação da actividade enzimática
A actividade enzimática está sujeita a regulação
- Irreversível
Inibição
- Reversível:
Competitiva, não competitiva
e anti-competitiva .
Inibidores
1- Inibição Competitiva
O inibidor compete com o substrato pelo centro activo do enzima. A
ligação de inibidores competitivos à molécula de enzima depende do
KM, do Ki (constante de inibição), da concentração de substrato e da
concentração do inibidor.
Adaptado de: NELSON, D., COX, M. (2004). LEHNINGER PRINCIPLES OF BIOCHEMISTRY, W. H. FREEMAN.
Inibidores
1- Inibição Competitiva
O inibidores competitivos aumentam o valor de KM sem afectar o
valor de Vmáx
www.coladaweb.com/.../biologia/enzima5.jpg
Inibidores
2- Inibição Não Competitiva
O inibidores não competitivos diminuem o valor de Vmáx sem afectar
o valor de KM
Adaptado de: GARRETT,R., H., GRISHAM, C. M.,(2001). Principles of Biochemistry With a Human Focus, Brooks Cole.
Inibidores
3- Inibição Anti-Competitiva
O inibidores ligam-se ao complexo ES e nunca ao enzima livre.
A presença de inibidor diminui a concentração do complexo ES activo.
Adaptado de: NELSON, D., COX, M. (2004). LEHNINGER PRINCIPLES OF BIOCHEMISTRY, W. H. FREEMAN.
Inibidores
3- Inibição Anti-Competitiva
O inibidores anti-competitivos diminuem o valor de KM e Vmáx
Adaptado de: GARRETT,R., H., GRISHAM, C. M.,(2001). Principles of Biochemistry With a Human Focus, Brooks Cole.
Enzimas Homólogos
São enzimas que desempenham a mesma função. Dividem-se em
dois grupos: Heteroenzimas e Isoenzimas
1- Heteroenzimas
Enzimas com funções idênticas presentes em diferentes espécies.
Ex: α-amilase suco pancreático humano e α-amilase de uma cultura
bacteriana.
2- Isoenzimas
Enzimas com funções idênticas presentes na mesma espécie.
Ex: Lactato desidrogenase (LDH)- músculo e coração humanos.
Problema 1
Os resultados obtidos num estudo da atividade enzimática da polifenoloxidase são
apresentados na tabela seguinte:
0,1 0,024
0,2 0,032
0,5 0,041
1,5 0,046
KM = 0.1 mM
Vmáx = 0.049 s-1
Problema 2 (exercício 1 série de problemas)
A fosfatase alcalina presente no leite catalisa a libertação de fosfato inorgânico, Pi, a partir
de éteres fosfóricos, segundo a reacção. Com o objectivo de determinar o KM e Vmax do
enzima procedeu-se à realização de estudos cinéticos utilizando um extracto com uma
concentração óptima de enzima. A velocidade da reacção foi seguida por absorção UV/Vis a
680 nm pela libertação de fenol. Os resultados obtidos foram registados no quadro abaixo
indicado. Determine as constantes cinéticas.
Concentração de S (mM)
Tempo de incubação (s)
0,25 0,45 1,00 2,50
0,5
0,4
Absorvância
0,3
0,2
0,1
0
0 30 60 90 120 150 180 210 240 270 300 330
Tempo (s)
Resolução 2
Concentração de S (mM)
Tempo de incubação (s) 0,25 0,45 1,00 2,50
Absorvância (unid. Arbitrarias)
∆
V0 = V0 =
∆
[S] = 0,25 mM [S] = 1,00 mM
A1 = 0,05 t1 = 30 s A1 = 0,13 t1 = 30 s
A2 = 0,11 t2 = 60 s A2 = 0,25 t2 = 60 s
A1 = 0,10 t1 = 30 s A1 = 0,19 t1 = 30 s
A2 = 0,17 t2 = 60 s A2 = 0,33 t2 = 60 s
KM = 0.5 mM
Vmáx = 5.5 x 10-3 s-1
Problema 3
As prostaglandinas são uma classe de eicosanóides derivados dos ácidos
gordos responsáveis pela formação de inflamação, febre e da dor associada a
estas condições.
A produção da prostaglandina PGG2 a partir do ácido araquidónico (ácido
gordo) é catalisada pela enzima prostaglandina endoperóxido sintetase.
O Ibuprofeno é um inibidor desta enzima. Ao inibir a síntese da PGG2, o
Ibuprofeno reduz a febre, inflamação e dor.
Adaptado de: NELSON, D., COX, M. (2004). LEHNINGER PRINCIPLES OF BIOCHEMISTRY, W. H. FREEMAN.
Resolução 3
[S] (mM) Vo (min-1) 1/[S] (mM-1) 1/Vo (min) [S] (mM) Vo (min-1) 1/[S] (mM-1) 1/Vo (min)
KM aumenta
Vmáx = 51.55 min-1
Vmáx mantém-se
KM = 0.59 mM (sem inibidor)
KM = 1.0 mM (com inibidor) Inibição competitiva
Problema 4
Supondo que o estudo cinético deste enzima, na presença de um inibidor, permitiu
obter a representação gráfica indicada na figura, caracterize o tipo de inibição
promovida pela substância. Justifique.
KM diminui
Vmáx diminui
Inibição anti-competitiva
Problema 5 (exercício 2 série de problemas)
2- Num estudo efectuado em insectos, para avaliação do efeito da colina, na reacção
catalisada pela acetilcolinesterase, obtiveram-se os seguintes resultados:
[Acetilcolina], Velocidade inicial (unid. Arbitrárias * 102)
(mM) [Colina] = 0mM [Colina] = 20mM [Colina] = 40mM
0,10 28,5 11,9 7,5
0,15 37,5 15,6 9,9
0,25 50,0 20,9 13,2
0,40 61,5 25,7 16,2
0,70 73,7 30,7 19,4
2.2- Com a presença do inibidor, ou seja, [Colina] = 20mM e [Colina] = 40mM, traçar mais
duas retas e calcular KM e V máx. Comparar o que acontece aos valores das constantes
cinéticas, à medida que aumenta a concentração de inibidor, com os valores sem inibidor.
KM aumenta
Vmáx mantém-se
Inibição competitiva