Genetica 1
Genetica 1
Genetica 1
BASICA
Experimentos de Mendel
Principios de segregación independiente y
dominancia
La probabilidad
¿Qué es la genética?
Es la rama de la biología que estudia la herencia
Autopolinización
Descendencia híbrida
Principio de Dominancia:
YY yy
En un organismo
híbrido, un gen
determina la expresión
de una característica
particular y evita la
expresión de la forma Yy Yy
en contraste de esa
característica Yy Yy
Yy Yy
YY Yy Yy yy
EXPLICACÓN DE LOS RESULTADOS
DE MENDEL
El genotipo y el fenotipo
Cuando son:
Homocigóticos
Heterocigóticos
LA PROBABILIDAD
Estudio de la forma en que operan las leyes al azar
El azar se refiere a la posibilidad de que ocurra cierto evento
Yy Yy
Razón genotípica:
25 % homocigótico dominante YY
50 % heterocigótico Yy
25 % homocigótico recesivo yy
Razón fenotípica:
YY Yy Yy yy
75 % semillas amarillas
25 % semillas verdes
Ej 1. En los ratones, el pelaje negro es dominante sobre el pelaje
blanco. Un macho de pelaje blanco se cruza con una hembra
heterocigótica de pelaje negro.
¿Qué razones genotípicas y fenotípicas resultarán probablemente
de este cruce?
Ej 2. Una persona con tipo de sangre AO se casa con una con otro
tipo de sangre BO.
¿Qué tipos de sangre pueden tener los hijos?
Proporción fenotípica:
9/16 lisas-amarillas
3/16 lisas-verdes
3/16 rugosas amarillas
1/16 rugosa-verde
. LA ANTROPOGENÉTICA
- Lord Tennyson.
- Definición de Antropogenética.
- La Antropogenética, la Ética y la Bioestadística.
- Variabilidad de origen genético: Marcadores genéticos.
- Frecuencias alélicas y haplotípicas. Polimorfismo.
Lord Tennyson
Alfred Tennyson, 1º barón Tennyson (agosto 6, 1809-octubre 6, 1892)
fue y sigue siendo uno de los poetas ingleses más populares.
Gran parte de su poesía se basa en temas mitológicos clásicos. Una de
las más famosas obras de Tennyson es Idilios del rey (1885), una serie
de poemas narrativos basado completamente en las historias del rey
Arturo, siguiendo la temática de Sir Thomas Malory sobre el legendario
rey.
Intentó también escribir piezas dramáticas, pero tuvo poco éxito.
Tennyson escribió una serie de frases que se han convertido en lugares
comunes del idioma Inglés, incluyendo: "La naturaleza, rojo en dientes y
garras", "Mejor haber amado y perdido", "No había ninguna razón para
ello, pero lo hicieron y murieron" y " mi fuerza es como la fuerza de diez,
/ porque mi corazón es puro ".
("nature, red in tooth and claw", "better to have loved and lost", "Theirs
not to reason why,/Theirs but to do and die", and "My strength is as the
strength of ten,/Because my heart is pure".)
Es uno de los escritores más citados en lengua inglesa.
Genealogía de Lord Tennyson
La genealogía de Lord Tennyson muestra algunos
aspectos interesantes del estudio de nuestro
patrimonio genético.
En primer lugar, la variabilidad: dentro de una
misma familia que comparte muy probablemente
alguna mutación que afecta al carácter, se observa
una multitud de signos y fenotipos diferentes. Es un
claro ejemplo de interacción entre patrimonio
genético y ambiente.
En segundo lugar, los complejos efectos de las
interacciones entre los genes: lo que para la mayor
parte de sus parientes resultó ser una pesada carga,
al escritor le supuso la genialidad creativa.
En fin, los análisis habrían revelado la verdad, como ocurre habitualmente en multitud de casos.
La Antropogenética
¿Obama ha sido el primer presidente negro de Estados Unidos?
La Antropogenética
Por razones obvias, somos la especie más estudiada. Eso nos convierte en un modelo, sobre el
que se prueban numerosos análisis genéticos y estadísticos, que luego pueden aplicarse a
otras especies. Para, por ejemplo, descubrir dónde se ha pescado una anchoa, decidir si se
pueden establecer cuotas generales de pesca, o bien es preciso aplicarlas por regiones.
Registros demográficos
Acta de matrimonio y árbol genealógico
de una dispensa de consanguinidad
Un aspecto fundamental de la investigación sobre las poblaciones humanas es la imposibilidad de trabajar directamente en el
laboratorio sobre individuos de nuestra especie.
Las soluciones a este problema son de diferentes tipos:
1. Los registros demográficos. Una característica muy interesante de nuestra especie es la práctica generalizada en
numerosas poblaciones y numerosos periodos históricos de conservar un registro escrito u oral de los acontecimientos vitales
de los individuos. Estos registros han sido una muy importante fuente de datos que mediante métodos estadísticos
específicos ha permitido el estudio en profundidad de numerosos aspectos de la genética de las poblaciones, más difíciles de
abordar en otras especies.
Registros demográficos
Son numerosos los estudiosos que reconstruyen genealogías a partir de archivos demográficos. En algunos casos son
profesionales y en otros aficionados que tan sólo pretenden identificar a sus antepasados. A partir de 86 millones de registros
recogidos de este modo y publicados en Internet, Kaplanis et al, (2018) han conseguido reconstruir genealogías con una gran
cantidad de familiares, incluyendo una con 13 millones de individuos. En la imagen, una genealogía con 6.000 individuos de 7
generaciones.
Acondroplasia: Chnoum-
Hotep, ayudante de cámara
del faraón durante la V
dinastía (c. 2700 a. JC)
Acondroplasia: Sebastián de
Morra en un cuadro de
Velázquez
2. Los registros iconográficos también han sido útiles, por ejemplo para el conocimiento del origen de algunas enfermedades
genéticas.
Iconografía Antropogenética
3. Los estudios comparados. Analizar un determinado carácter en gemelos, en personas sanas y afectadas, en humanos y otros
primates, ha contribuido a menudo a detectar los genes responsables del mismo
Análisis estadísticos
El ADN porta toda la información precisa para la síntesis de las enzimas y otras proteínas necesarias para el organismo. Los
fragmentos de ADN que codifican para un polipéptido (proteína o subunidad de proteína) se denominan genes y se componen de
una serie de exones. Los fragmentos que son eliminados después de la transcripción se denominan intrones. Además, entre un
gen y otro puede haber grandes regiones no codificantes, las regiones intergénicas, en las que se encuentran secuencias
promotoras o reguladoras de la acción de los genes. Un marcador es un fragmento de ADN, que puede tener un sólo nucleótido o
una larga cadena, que será utilizado para comparar individuos o poblaciones y puede encontrarse en una región de ADN
codificante o no codificante.
Frecuencias alélicas y haplotípicas
¿Qué es un alelo?
Todos los individuos portan en su genoma el mismo número de cromosomas y en cada cromosoma a menudo los mismos genes.
En general, la ausencia de algún gen determinará alguna enfermedad genética grave. Sin embargo, la secuencia de ADN de cada
gen no es igual en todos los individuos.
Hay muchos genes en los que individuos de la misma o diferentes poblaciones pueden tener diferentes secuencias, sin que esto
repercuta en la aparición de alguna enfermedad genética. Además, el ADN no codificante es extraordinariamente diferente entre
diferentes individuos, ya que los cambios que experimenta generalmente no afectan a la viabilidad de los individuos.
Se denomina alelo a cada una de las posibles secuencias de un fragmento de ADN, que pueden portar algunos o todos los
individuos de una población. Precisamente la frecuencia de un determinado alelo (frecuencia alélica) es la proporción, en tanto por
uno, en la que aparece dicho alelo en una población. Hay que tener en cuenta para su cálculo que cada individuo porta dos
dotaciones cromosómicas completas (una paterna y una materna) y por tanto todos los genes (salvo los de los cromosomas
sexuales X e Y) por duplicado.
Frecuencias alélicas y haplotípicas
A veces es más informativo considerar simultaneamente dos o más marcadores fuertemente ligados, es decir, ubicados en el
mismo cromosoma a escasa distancia. En esos casos, en lugar de los alelos de cada marcador por separado, pueden estudiarse
las diferentes combinaciones de alelos de todos los marcadores considerados conjuntamente. Dichas combinaciones se
denominan haplotipos y sus frecuencias, logicamente, frecuencias haplotípicas.
En algunos casos, podrán establecerse filogenias de haplotipos.
¿Qué es un
haplotipo?
Frecuencias alélicas y haplotípicas
El análisis de las frecuencias haplotípicas en diferentes poblaciones puede informarnos sobre las principales migraciones humanas
e incluso facilitar su datación.
Al observar el mapa de distribución de los haplotipos del ADN.mt, vemos que en el África sudsahariana predomina el
macrohaplogrupo L. En Asia los macrohaplogrupos M y R (que deriva de N), en Europa R, en Australia N y América, a pesar de su
escasa variabilidad es un puzzle.
Polimorfismos
Los genes que deben seleccionarse son aquellos que presenten variabilidad. Si se tiene en cuenta un gen para el que existe un
único alelo, éste tendrá en todas las poblaciones una frecuencia alélica idéntica de 1 y resultará que todas las poblaciones son
indistinguibles. En realidad, la mayor parte del ADN no presenta variabilidad en el conjunto del patrimonio genético humano e
incluso compartimos al menos el 95% de la secuencia del ADN con nuestros parientes más próximos, los chimpancés (Britten,
2002).
Por ello se estudian preferentemente los polimorfismos. Un polimorfismo es un marcador genético en el que existen al menos dos
alelos, cada uno de los cuales se encuentra con una frecuencia mayor de 0,01 (es decir, el 1%) dentro de la población. Esto
garantiza que existan en las poblaciones varios alelos y varios genotipos posibles, que podrán presentar diferentes frecuencias en
cada una de ellas. A menudo se encuentran más de dos alelos y más de dos fenotipos en un marcador polimórfico.
Por oposición a los marcadores polimórficos, se pueden encontrar marcadores monomórficos, en los que tan sólo se observa un
alelo con una frecuencia significativa (es decir, mayor que 0,01), el cual suele mostrar una frecuencia casi igual o igual a 1.
También existen variantes alélicas raras, que se encuentran con frecuencias menores que 0,01. No es extraño que existan alelos
que sólo aparecen en un continente o una población a frecuencias muy bajas e incluso en una sola familia.
Antígenos eritrocitarios
ABO 9q34.1-34.2 ABO*A1,ABO*A2,ABO*B,ABO*0
Diego DI*A,DI*B
Duffy 1q21-25 FY*A,FY*B,FY
Kell K,k
Kidd 18q11-12 JK*A,JK*B
Lewis 19 LE*LE,LE*Le
Lutheran 19q12-13 LU*A,LU*B
MNSs (2) 4q28-31 MNS*MS,MNS*Ms,MNS*NS,MNS*Ns
P 22q11.2-qter P1*1,P1*2,P1*p
Rh (3) 1p36.2-34 CDE,CDe,CdE,Cde,cDE,cDe,cdE,cde
Secretor FUT2(SE)*Se,FUT2(SE) *se
Proteínas plasmáticas
alfa1-antitripsina 14q32.1 PI*M1,PI*M2,PI*M3,PIS,PIZ
Ceruloplasmina 3q23-25 CP*B,CP*A,CP*C
Componente de
complemento 3 19p13.3-13.2 C3*S,C3*F
Componente específico
de grupo 4q12-13 GC*1F,GC*1S,GC*2
Haptoglobina 16q22.1 HP*1S,HP*1F,HP*2
La mayor parte de los marcadores tradicionales muestran un grado de polimorfismo limitado, con un número pequeño de alelos.
Algunos polimorfismos sanguíneos
GEN UBICACIÓN ALELOS POLIMÓRFICOS
Inmunoglobulinas
GM (3) 14q32.33 GM*1,17 23' 21,28 GM*1,17 23 21,28 GM*1,2,17 23'
21,28 GM*1,2,17 23 21,28 GM*1,3,17 23' 5*,21,28
GM*1,3,17 23 5*,21,28 GM*1,2,3,17 23' 5*,21,28
GM*1,2,3,17 23 5*,21,28 GM*1,3,17 23' 5*
GM*1,3,17 23 5* GM*3 23' 5* GM*3 23 5*
Transferrina 3q21 TF*C1,TF*C2,TF*C3,TF*,TF*D
Enzimas eritrocitarias
Adenilato kinasa 1 9q34.1-34.2 AK1*1,AK1*2
Adenosín deaminasa 20q13.11 ADA*1,ADA*2
Esterasa D 13q14.1-14.2 ESD*1,ESD*2
Fosfatasa ácida 1 2p25 ACP1*A,ACP1*B,ACP1*C
Fosfoglucomutasa 1 1p22.1 PGM1*1,PGM1*2,PGM1*3,PGM1*4
Peptidasa A 18q23 PEPA*1,PEPA*2
Antígenos leucocitarios
HLA-A 6p21.3 A1,A2,A3,A11,A23,A24,A25,A26,A28,A29,A30,A31,
A32,A33,A34,A36,A43
HLA-B 6p21.3 B7,B8,B13,B14,B18,B27,B35,B37,B38,B39,B41,B42,
B44,B45,B46,B47,B48,B49,B50,B51,B52,B53,B54,
B55,B56,
B57,B58,B59,B60,B61,B62,B63,B67,B70,B73,B75
HLA-C 6p21.3 Cw1,Cw2,Cw4,Cw5, Cw6,Cw7,Cw9,Cw10
Aunque hay algunas excepciones, como los genes HLA .
Algunos polimorfismos de determinación directa
POLIMORFISMO ALELOS
Microsatélites
D3S1358 11, 11.2, 12, 13, 14, 15, 16, 16.2, 17, 18, 19, 20
D5S818 7, 8, 9, 9,2, 10, 11, 12, 13, 14, 15
D7S820 6, 7, 8, 9, 9,1, 9,3, 10, 11, 12, 12,2, 13, 14, 15
D8S1179 7, 8, 9, 10, 11, 11,3, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18
D13S317 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16
D18S51 8, 9, 10, 11, 12, 13, 13.2, 14, 14.2, 15, 15.2, 16, 17, 17.2, 18, 19, 20, 20.2, 21, 22,
23, 24
D21S11 24.2, 25, 25.2, 26, 26.2, 27, 28, 28.2, 29, 29.2, 30, 30.2, 31, 31.2, 32, 32.2, 33,
33.2, 34, 34.2, 35, 35.2, 36, 38
FGA (FIBRA) 17, 18, 18.2, 19, 19.2, 20, 20.2, 21, 21.2, 21.3, 22, 22.2, 22.3, 23, 23.2, 23.3, 24,
24.2, 25, 25.1, 25.2, 26, 26.5, 27, 27.2, 28, 29, 30, 30.2
VWA31 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21
CSF1PO 6, 7, 8, 9, 9.1, 10, 10.3, 11, 12, 13, 14, 15, 16
D16S539 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15
TH01 5, 6, 7, 8, 8.3, 9, 9.3, 10, 11
TPOX 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13
Minisatélites
APOB 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30, 31, 32, 33, 34, 35, 36, 37, 38, 39, 40, 41,
42, 43, 44, 45, 46, 47, 48, 49, 50, 51, 52, 53, 54, 55, 56, 57, 58
D1S80 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30, 31, 32, 33, 34,
35, 36, 37, 38, 39, 40, 41
D17S5 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14
Por el contrario, los marcadores que se estudian directamente sobre el ADN muestran a menudo un gran número de alelos.
Algunos polimorfismos de determinación directa
POLIMORFISMO ALELOS
Inserciones Alu
ACE Inserción, No inserción Aunque hay algunas excepciones, como las inserciones
TPA25 Inserción, No inserción Alu o los SNPs.
PV92 Inserción, No inserción
APO Inserción, No inserción
D1 Inserción, No inserción
FXIIIB Inserción, No inserción
B65 Inserción, No inserción
A25 Inserción, No inserción
Genes HLA
DRB1 DRB1*0101, DRB1*0102, DRB1*0103, DRB1*0104, DRB1*1501, DRB1*1502,
DRB1*1503, DRB1*1601, DRB1*1602, DRB1*1603, DRB1*1605, DRB1*0301,
DRB1*03011, DRB1*0302, DRB1*0304, DRB1*0401, DRB1*0402,
DRB1*0403, DRB1*0404, DRB1*0405, DRB1*0406, DRB1*0407, DRB1*0408,
DRB1*0410, DRB1*0413, DRB1*1101, DRB1*1102, DRB1*1103, DRB1*1104,
DRB1*1106, DRB1*1109, DRB1*1111, DRB1*1112, DRB1*1127, DRB1*1201,
DRB1*1202, DRB1*1301, DRB1*1302, DRB1*1303, DRB1*1305, DRB1*1306,
DRB1*1307, DRB1*1308, DRB1*1315, DRB1*1401, DRB1*1402, DRB1*1404,
DRB1*1405, DRB1*1406, DRB1*1407, DRB1*1408, DRB1*1409, DRB1*1410,
DRB1*0701, DRB1*0801, DRB1*0802, DRB1*0803, DRB1*08032,
DRB1*0804, DRB1*0805, DRB1*0806, DRB1*0811, DRB1*0901,
DRB1*09012, DRB1*1001
DQB1 DQB1*0501, DQB1*0502, DQB1*05031, DQB1*0503, DQB1*06011, DQB1*060
DQB1*0602, DQB1*0603, DQB1*0604, DQB1*0605, DQB1*0607,
DQB1*0609, DQB1*0201, DQB1*0202, DQB1*0301, DQB1*0302,
DQB1*03032, DQB1*0303, DQB1*0304, DQB1*0305, DQB1*0401, DQB1*0402