UNIVERSIDAD SAN FRANCISCO

XAVIER DE CHUQUISACA
FACULTAD DE CIENCIAS
QUIMICO FARMACEUTICAS Y
BIOQYIMICAS

MICROBIOLOGIA CLINICA

CÁTEDRA
TEMA N°

ENFERMEDADES
GASTROINTESTINALES: diarreas
agudas, infecciones sistémicas e
intoxicaciones.
 OBJETIVOS
Reconocer los principales
microorganismos asociados a la generación
de enfermedades transmitidas por
alimentos o que afectan al tubo digestivo.

Relacionar conceptos sobre epidemiología y

patogénesis para alcanzar el diagnóstico de estas
infecciones / enfermedades.

Reconocer estrategias para la prevención de

estas infecciones / enfermedades.
Infecciones Gastrointestinales

Definición y Causas:
•Infecciones causadas por bacterias, virus y otros patógenos.
•Mecanismos de transmisión (agua, alimentos contaminados, contacto persona
a persona).
Síntomas Comunes:
•Diarrea, vómitos, fiebre, dolor abdominal.
Importancia del Diagnóstico Rápido:
•Prevención de brotes.
•Tratamiento adecuado y reducción de complicaciones
 INGESTIÓN DE BACTERIAS O
VIRUS
Alimentos contaminados ó ruta Fecal -
Oral

INFECCIÓN INFECCIÓN
SISTEMICA INTOXICACIÓN
LOCAL

Ej.: Salmonella typhi, Gastroenteritis, Ej.: S. aureus,

Enterocolitis Ej.: C. botulinum
Virus de la hepatitis C. perfringens,
A Ej.: Campylobacter spp B. cereus
Rotavirus

Compromiso
DIARREAS
neurológico
 Definición y clasificaciones
Diarrea: aumento de la frecuencia, contenido
líquido, y volumen de las heces

 Evolución: agudas (< 14 días) / crónicas (> 4

sem)
 Etiología:
infecciosas / no infecciosas locales
Endemicidad: asociadas a viajes
 Mecanismo: secretorias, inflamatorias, osmóticas, motoras

 Grupo etario: infantiles / del adulto

 Adquisición: de la comunidad /
nosocomiales
 Importancia a nivel mundial

Entre 1 y 5 millones de muertes en niños

menores de 5 años.

Un número aún mayor de niños que sufren deficiencias

en su desarrollo.
 Importancia
En Bolivia, en niños menores de 5 años,
las infecciones intestinales son:

Se Estima que en Bolivia El 70 % de Las

Diarreas Son Trasmitidas Por Alimentos

La causa más frecuente de muerte

La 2ª causa infecciosa más frecuente de

muerte
Poblaciones en
riesgo  Niños menores de 5 años
 Ancianos
 Individuos desnutridos
 Individuos inmunocomprometidos
 Pacientes con:
 Tratamiento antibiótico
prolongado
 Tratamiento con antiácidos
 Inmunodeficiencias
 Viajeros
 Causas más frecuentes de diarreas agudas
en individuos inmunocompetentes
• BACTERIAS • VIRUS
Infección - Rotavirus,
- Shigella spp. - Norovirus,
- Astrovirus,
- Salmonella spp.
- Adenovirus (40/41)
- E. coli (virotipos) Otros: Coronavirus, Torovirus, Picornabirnavirus
- Campylobacter spp.
- Vibrio cholerae • PARÁSITOS
- Clostridium difficile Cryptosporidium y Giardia pueden causar
diarreas agudas y prolongadas.

Intoxicación • No infecciosas
alimentaria: - Uso de: laxantes, antiácidos con Mg,
- Staphylococcus aureus antagonistas de receptores H2, productos
conteniendo lactosa o sorbitol, entre otras.
- Bacillus cereus
- Clostridium perfringens
- Clostridium botulinum
¿Cuál es la situación en
Bolivia?
El Ministerio de Salud
informa semanalmente:
No casos diarrea / 100.000
habitantes sin discriminar
etiología

En Bolivia, las EDA se presentan en

alrededor del 30% de la población total
de niños menores a 5 años.
produciéndose anualmente mas de
12.000 muertes.
¿Cúal es la situación a nivel
mundial?
Etiología de las diarreas agudas según la
OMS
 Estudios a nivel local
Etiología de las diarreas bacterianas
 Estudios a nivel local
Etiología de las diarreas virales
DIARREAS AGUDAS
BACTERIANAS
 Diarreas secretorias
La diarrea secretora se produce por una mayor secreción de
agua y electrólitos hacia la luz que supera la capacidad de
absorción.
Patógenos bacterianos más
frecuentes:

 ECET (E. coli enterotoxigénica)

 ECEP (E. coli enteropatógena)
 ECEAg (E. coli enteroagregativa)
 S. aureus (intoxicación
alimentaria)
 B. cereus (intoxicación alimentaria)
 V.cholerae
 Diarreas inflamatorias o disentéricas
Son aquellas que contienen leucocitos y/o eritrocitos
Agentes etiológicos más frecuentes:
 Shigella flexneri, S. sonnei.
 Salmonella Enteritidis, Salmonella
Thyphimurium
 Campylobacter spp.
 Clostridium difficile
 ECEH (E. coli enterohemorrágica)
 ECEI (E. coli enteroinvasiva)

Salmonella Typhi es agente etiológico de fiebre entérica

 Virotipos de Escherichia coli
Enfermedad Diarrea Mecanismo Sitio de Transmisión
infección
ECET D. del viajero Acuosa Toxina Intestino delgado Agua, alimentos
contaminados
ECEP D. Infantil Acuosa Efecto borrado Intestino delgado Agua, alimentos
contaminados
ECEA D. Infantil Acuosa/Mucosa Efecto borrado Intestino delgado Agua, alimentos
prolongada contaminados
ECAD D. Infantil Acuosa ? Intestino delgado Agua, alimentos
contaminados
ECEH D. hemorrágica, Sanguinolenta Efecto borrado/ Principalmente Carne picada mal
cocida, leche o
Síndrome urémico toxina simil el colon
jugos no
hemolítico en un shiga
pasteurizados,
10% de
agua
los
contaminada,
pacientes
natatorios
infectados
ECEI Disentería Muco- Invasión Colon Agua, alimentos
el único (similar purulenta/ contaminados
invasivo sanguinolenta
a
 ¿Cómo puede surgir un nuevo virotipo?
Por transferencia horizontal de genes

Transposón Isla de patogenicidad Fago Plásmido

ECEAg

ECEAg adquirió el gen de la toxina de Shiga a través de un

fago
 Síndrome urémico hemolítico
(SUH)
En nuestro país el SUH es causado principalmente por cepas de E. coli
enterohemorrágica O157 y E. coli enterohemorrágica O145
(prevalente entre los serotipos no O157).

La incidencia de SUH por Shigella dysenteriae (única portadora de

la
toxina de Shiga en este género) es extremadamente baja.
 Patógenos entéricos invasivos
Sitio de Enfermedad Transmisión
infección
Salmonella Principalmente Huevos crudos, agua
Intestino contaminada,
enteritidis Enterocolitis mascotas, tortugas,
delgado reptiles

Salmonella typhi Sistémica Alimentos o agua

(ingresa ppalmente contaminados con
Fiebre tifoidea heces humanas
por intestino
delgado)
Shigella spp. Principalmente Disentería Alimentos, fomites
colon
Campylobacter Principalmente Enterocolitis Huevos crudos, agua
contaminada
spp. intestino
delgado , (Puede
causar
linfoadenitis)
ECEI Principalmente Disentería Alimentos, agua,
colon fomites
DIARREAS VIRALES
 Rotavirus
• Principal causa de diarrea • Mayor incidencia en meses
en el mundo (afectan por de frío.
igual a países desarrollados
y en vía de desarrollo)
• Síntomas: fiebre, vómitos y
diarrea sin sangre,
deshidratación. Puede estar
acompañada por síntomas
respiratorios, como tos y
resfrío.

• Grupo etario: 6 a 24 meses

Astrovirus

• Segundo en frecuencia dentro de

los agentes productores de diarreas
en lactantes.

• Curso clínico más benigno

Adenovirus entéricos

• Sólo los serotipos 40 y 41

causan gastroenteritis (éstos
no producen enfermedad
respiratoria).

• Agente relativamente frecuente

de diarreas en lactantes, que
suelen ser de mayor duración
(10- 14 días) que las causadas por
otros virus.
Norovirus (Calicivirus)
• Son los principales agentes
etiológicos de brotes de
diarreas virales en niños y
adultos.
• Período de incubación
breve (12 horas) y la
enfermedad se
autolimita en 2-3 días.
• En el cuadro predominan
las nauseas y los vómitos
antes que la diarrea
DIAGNÓSTICO DE LAS
DIARREAS
AGUDAS
DIAGNÓSTICO de las DIARREAS AGUDAS
• LA MAYORÍA DE LOS CASOS SON AUTOLIMITADOS Y
CURSAN SIN DIAGNÓSTICO MICROBIOLOGICO

• SIN EMBARGO, EL DIAGNÓSTICO MICROBIOLÓGICO ES

ESPECIALMENTE IMPORTANTE DURANTE BROTES

• EL DIAGNÓSTICO MICROBIOLÓGICO ES NECESARIO

PARA CONOCER LA EPIDEMIOLOGÍA DE LA INFECCIÓN
Y PARA LA IMPLEMENTACIÓN DE MEDIDAS DE
CONTROL (VIGILANCIA EPIDEMIOLÓGICA)
 Etapas del
Diagnóstico de las diarreas

-Anamnesis

-Examen físico

-Estudios microbiológicos
 Anamnesis

• Edad del paciente:

 En lactantes y niños pequeños (entre 6 y
24 meses) son más frecuentes las diarreas
virales.
 En niños mayores de 24 meses son
más frecuentes las diarreas bacterianas
 Anamnesis
• Lugar de residencia (condiciones sanitarias)
• Tiempo de evolución del cuadro clínico
• Características de las deposiciones
• Contactos con sintomatología similar
• Alimentos ingeridos
• Viajes recientes
• Medicación actual o reciente
 Examen físico
Está dirigido a detectar
tempranamente signos de
deshidratación
 Estudios microbiológicos de
las diarreas agudas

Materia fecal

Filtrado ELISA o Aglutinaciónde

(detección de toxinas) partículas
(detección
virus )
Microscopía
Coprocultivo
 Diagnóstico microbiológico de
infecciones virales

Materia fecal

Filtrado ELISA o Aglutinaciónde

(detección de toxinas) partículas
(detección
virus )
Microscopía
Coprocultivo
 Diagnóstico de diarreas virales
• En casos de brotes o para descartar etiología
bacteriana.

• Ensayos comerciales: ELISA o Aglutinación

de partículas en materia fecal para Rotavirus
del grupo A, Astrovirus y Adenovirus
entéricos.
• En centros de referencia (Epidemiología)
1 M.E. con tinción negativa.
2 RT-PCR de materia fecal.
3 Hibridización de ácidos nucleicos.
 Diagnóstico microbiológico
de diarreas bacterianas
Materia fecal

Filtrado ELISA o Aglutinaciónde

(detección de toxinas) partículas
(detección
virus )
Microscopía
Coprocultivo
REALIZACIÓN DE UN
COPROCULTIVO
 DIARREAS SIN SANGRE

Afebril Compromiso sistémico

Buen estado Fiebre > 5 días
Inmunocomprometidos
general Sin Neonatos
compromiso
inmunológico

OBSERVACIÓ COPROCULTIVO
N HEMOCULTIVOS
del paciente

DIARREAS CON
SANGRE
 ¿Cómo se realiza el coprocultivo para
los enteropatógenos más frecuentes?

Muestra
Siembra en
medios sólidos

Enriquecimiento Medios selectivos y diferenciales

en medios líquidos - inhiben la flora acompañante
- diferencian
características
 A partir de colonias aisladas

Antibiograma
Pruebas bioquímicas Serotipificación
 INGESTIÓN DE BACTERIAS O
VIRUS
Alimentos contaminados ó ruta Fecal -
Oral

INFECCIÓN INFECCIÓN
SISTEMICA INTOXICACIÓN
LOCAL

Gastroenteritis, Ej.:
Ej.:
Enterocolitis S. aureus, Ej.:
Salmonella typhi,
Ej.: C. perfringens, C. botulinum
Virus Hepatitis A
Campylobacter spp. B. cereus
Rotavirus

Compromiso
DIARREAS
neurológico
 El género Salmonella causa de
infecciones intestinales y sistémicas

Salmonella enterica serovariedad Typhy (S. Typhi)

puede aislarse de diferentes muestras biológicas.

Recordar: No transmitida por alimentos.

Salmonella enterica servoraviedades Typhimurium y Enteretidis

son transmitidas por alimentos.
Fiebre Tifoidea
 Listeria monocytogenes
Infecciones locales y sistémicas
• Listeria monocytogenes es una bacteria oportunista.
• Se detecta en las heces de aproximadamente un 5-10% de
la
población sana.
• Puede multiplicarse fuera del huésped aún con bajas exigencias en
cuanto a nutrientes.
• Presenta resistencia a la congelación, secado, acidez y
frío, (producción de biopelículas).

Manifestaciones clínicas:
-Infección no invasiva: diarrea, náuseas,
fiebre, dolor de cabeza, fatiga y mialgia dentro de
las 9 a 32 hs.
 Listeria monocytogenes
• Se debe estudiar en los cuadros de gastroenteritis febril
asociado al consumo de alimentos contaminados o
estudios de portación en investigaciones
epidemiológicos

• La muestra debe obtenerse en el período agudo de la enfermedad y

antes de
iniciar el tratamiento con antimicrobianos

Diagnóstico

- Recolección de la muestra: Heces en fresco o hisopado rectal.

-Coprocultivos utilizando medios de enriquecimiento específicos (caldo UVM
y/o Fraser), previo a la siembra en placas también específicas (medio MOX).
-Los medios habitualmente utilizados para otros enteropatógenos no
favorecen el crecimiento de L. monocytogenes.
-Es obligatoria su investigación en alimentos.
 INGESTIÓN DE BACTERIAS O
VIRUS
Alimentos contaminados ó vía Fecal -
Oral

INFECCIÓN INFECCIÓN Toxoinfecciones

SISTEMICA LOCAL alimentarias

Gastroenteritis, S. aureus,
Ej.:
Enterocolitis C. perfringens, Ej.:
Salmonella typhi,
Ej.: B. cereus C. botulinum
Virus Hepatitis A
Campylobacter spp. S. enteritidis
Rotavirus

Compromiso
DIARREAS
neurológico
 Diagnóstico de las
toxoinfecciones alimentarias
 Las intoxicaciones por S. aureus, B. cereus y C. perfringens:
 Son de rápido comienzo y rápida resolución
 Por lo general NO comprometen la vida del paciente
 El diagnóstico es clínico

 Las intoxicaciones por C. botulinum:

 Comprometen la vida del paciente

 El diagnóstico de las intoxicaciones alimentarias están

enfocadas
para descartar botulismo
 Diagnóstico de botulismo

• Detección de la toxina botulínica en:

- Suero
- Materia fecal
- Alimentos
- Hisopado de heridas

• ¿Qué validez tiene el aislamiento de la bacteria

en un alimento o en materia fecal?
 VIGILANCIA DE LAS ENFERMEDADES TRANSMITIDAS
POR ALIMENTOS (ETA) EN BOLIVIA
INLASA Dirección de Epidemiología, Ministerio de
Salud del Estado

En Bolivia, la vigilancia integral de diarreas se realiza a través del Sistema

Nacional de Información en Salud (SNIS) de la Dirección de Epidemiología del
Ministerio de Salud del Estado Plurinacional de Bolivia, mediante las estrategias
de vigilancia clínica y de laboratorio.
La vigilancia de Síndrome Urémico Hemolític o (SUH) se realiza además a través
de Unidades Centinelas.

Las patologías de notificación inmediata e individual son:

botulismo, SUH, fiebre tifoidea y cólera.
Los brotes de ETA deben comunicarse en forma inmediata por vía telefónica, fax
o e-mail.
 Diarrea causada por
Clostridioides difficile#
Toxina A
Esporas adquiridas
en el ambiente
hospitalario Las esporas
germinan en el Célula vegetativa que Toxina B
intestino del
paciente produce toxinas
Sobrecrecimiento de
C. difficile productor de toxinas

Los
antibióticos
eliminan la
C. difficile endógeno o esporas flora normal Toxinas Pseudomembrana
derivadas del ambiente hospitalario dañan (mucina y restos
enterocitos Diarrea celulares)
No hay diarrea

# En el 2016 cambió la clasificación de Clostridium difficile

denominándose Clostridioides difficile
 C. difficile: dos toxinas principales
•Toxina A (TcdA) y Toxina B (TcdB): son toxinas
glicosil-transferasas tipo A/B que ADP-glicosilan
proteínas llamadas Rho-GTPasas y las inactivan.
•Toxina Binaria: En 10-15% cepas. Es una ADP-
ribosil transferasa tipo A/B. Es un factor de virulencia.

Cepas toxigénicas: son A+/B+, A-/B+

Cepas epidémicas: 027/NAP1/B1 (produce 16 veces más toxina

A y 23 veces más toxina B que las cepas no-epidémicas y porta la
toxina binaria) y 078/NAP7-NAP8/ToxV
 C. difficile: tracto gastrointestinal
Colonización Asintomática.
• 90% infantes < 1 año (fórmula de alimentación)
• 30% infantes < 2 años
• 2-7% adultos
Existen cepas toxigénicas y no-toxigénicas

¿Porqué no causa infección en los portadores asintomáticos?

• El número de C. difficile está limitado por los otros miembros de la flora normal.
• Los enterocitos de los niños <1 año de edad son deficientes en los carbohidratos
que funcionan como receptores de superficie para las toxinas.
• Anticuerpos IgG antitoxinas protectores.
 Factores predisponentes para la infección
por C. difficile intra-hospitalaria
• Edad avanzada: Mayor de 65 años
• Uso de antimicrobianos: Alteración de la flora normal intestinal.
• Hospitalización prolongada: Aumenta entre 7-8% la portación por
semana de hospitalización (directamente relacionada con el contacto con
pacientes colonizados con cepas toxigénicas, llamados extretores
toxigénicos)
• Quimioterapia: actúan como antimicrobianos pero también puede
estar relacionados a la inmunosupresión
• Inhibidores de Bomba de Protones (aumento pH gástrico, favorecen
la
colonización y proliferación en el lumen intestinal) (baja evidencia).
• Cirugía gastrointestinal.
• Enfermedad inflamatoria intestinal (EII), en particular aquellos con
colitis subyacente.
Infección por C. difficile en la
comunidad
Son un problema emergente en los
individuos considerados de bajo
riesgo

• Ausencia de alteración de la flora

normal.
• Pacientes sin hospitalización reciente.
• Inmunocompetentes.
inhibidores de
• Sinterapéutica antimicrobiana o
con bomba de protones reciente.
Métodos para diagnóstico de infección por C. difficile
Ensayo de citotoxicidad Inmunocromatografía (EIA) para
para GDH y toxinas A y B en
la toxina B simultáneo

GDH+/TOX AB- GDH+/TOX AB+

Control Positivo
Detectan las
ELISA para las toxinas A y B toxinas juntas
(no diferencian)
o por separado.

Métodos moleculares: real time PCR (tcdB y otros genes)

 Algoritmo para diagnostico de ICD: utilizando como
prueba de tamizaje GDH
test
rápido inmunocr
omatográfico pa
ra la detección
cualitativa de
glutamato
deshidrogenasa
(GHD) de
Clostridium
difficile en
muestras de
heces humanas

EIA GDH/TOX A/B: enzimoinmunoensayo para glutamato deshidrogenasa y toxinas A/B de C. difficile; CT: cultivo toxigénico; PCR:
real time PCR.
1. Se puede utilizar una prueba de GDH de tamizaje y luego otro método para detectar toxina o utilizar un método de
inmunodifusión que realice las dos pruebas en simultáneo (GDH+TOXAB). [Crobach et al 2016; Guia Europea de Diagnostico de
ICD; Consenso de SADI en publicación y recomendación de SADEBAC.
 Estrategias de prevención de las
enfermedades transmitidas por alimentos

– Provisión de agua potable

– Adecuada eliminación de excretas
– Normas adecuadas de producción
y comercialización de alimentos
– Vacuna contra rotavirus (la infección
por rotavirus no se asocia a
contaminación de agua ni alimentos)
(La vacuna contra el Rotavirus fue incorporada
en junio-2014 al calendario nacional)
 CONCLUSIONES

 Bacterias, virus y parásitos pueden causar

infecciones gastrointestinales.
 La contaminación fecal del agua de bebida y alimentos es
la principal fuente para las infecciones que afectan al
humano.
 La mayoría de las infecciones tiene evolución aguda
en pacientes inmunocompetentes.
 La diarrea y los vómitos son signos relevantes en este
tipo de infecciones.
 El diagnóstico de certeza es directo (identificación del
agente o sus antígenos) a partir de muestras (cultivadas
o no) de materia fecal.